Biochemical diversity of 2-oxoglutarate-dependent oxygenases

RSC Metallobiology

Volumn 2015-January, Issue 3, 2015, Pages 1-58

  Hausinger, Robert P ^a,b  

^a Michigan State University ^*  (United States)

^b Michigan State University   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

1 AMINOCYCLOPROPANE 1 CARBOXYLATE OXIDASE; 2 OXOGLUTARATE DEPENDENT OXYGENASE; 2 OXOGLUTARIC ACID; 4 HYDROXYPHENYLPYRUVATE DIOXYGENASE; ALKALOID; AMINO ACID; BETA LACTAM ANTIBIOTIC; DIOXYGENASE; DNA; FLAVONOID; GIBBERELLIN; HERBICIDE; HISTONE DEMETHYLASE; HYDROXYMANDELATE SYNTHASE; ISOPENICILLIN N SYNTHETASE; NUCLEIC ACID BASE; NUCLEOSIDE DERIVATIVE; OXYGENASE; PHOSPHONIC ACID DERIVATIVE; RIBOSOME PROTEIN; RNA; SULFATE; TERPENOID DERIVATIVE; UNCLASSIFIED DRUG;

ANTIBIOTIC BIOSYNTHESIS; BIOCHEMICAL DIVERSITY; BIOCHEMISTRY; BIOSYNTHESIS; CATALYSIS; DEGRADATION; DEMETHYLATION; DNA ALKYLATION; DNA MODIFICATION; DRUG SYNTHESIS; ENZYME ACTIVITY; HUMAN; LIPID METABOLISM; NONHUMAN; NONRIBOSOMAL PEPTIDE SYNTHESIS; OXYGEN SENSING; PLANT METABOLISM; PROTEIN FUNCTION; PROTEIN STRUCTURE;

EID: 84950237624     PISSN: 2045547X     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1039/9781782621959-00001     Document Type: Chapter

References (381)

1. R. P. Hausinger Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2004 39 21 68
2. V. M. Purpero G. R. Moran J. Biol. Inorg. Chem. 2007 12 587 601
3. C. Loenarz C. J. Schofield Nat. Chem. Biol. 2008 4 152 156
4. J. M. Simmons T. A. Müller R. P. Hausinger Dalton Trans. 2008 38 5132 5142
5. C. Loenarz C. J. Schofield TIBS 2010 36 7 18
6. I. J. Clifton M. A. McDonough D. Ehrismann N. J. Kershaw N. Granatino C. J. Schofield J. Inorg. Biochem. 2006 100 644 669
7. M. A. McDonough C. Loenarz R. Chowdhury I. J. Clifton C. J. Schofield Curr. Opin. Struct. Biol. 2010 20 1 14
8. W. Aik M. A. McDonough A. Thalhammer R. Chowdhury C. J. Schofield Curr. Opin. Struct. Biol. 2012 22 1 10
9. D. A. Proshlyakov and R. P. Hausinger, in Iron-containing Enzymes: Versatile Catalysts of Hydroxylation Reactions in Nature, ed., D. Kumar, and, S. P. de Visser, Royal Society of Chemistry, Cambridge, U.K., 2011, pp. 67-87
10. P. K. Grzyska E. H. Appelman R. P. Hausinger D. A. Proshlyakov Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010 107 3982 3987
11. R. W. Welford J. M. Kirkpatrick L. A. McNeill M. Puri N. J. Oldham C. J. Schofield FEBS Lett. 2005 579 5170 5174
12. A. G. Prescott M. D. Lloyd Nat. Prod. Rep. 2000 17 367 383
13. J. J. Hutton, Jr. A. L. Trappel S. Udenfriend Biochem. Biophys. Res. Commun. 1966 24 179 184
14. R. E. Rhoads S. Udenfriend Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1968 60 1473 1478
15. J. Risteli K. Tryggvason K. I. Kivirikko Eur. J. Biochem. 1977 73 485 492
16. U. Puistola T. M. Turpeenniemi-Hujanen R. Myllylä K. Kivirikko Biochim. Biophys. Acta 1980 611 40 50
17. H. M. Hanauske-Abel V. Günzler J. Theor. Biol. 1982 94 421 455
18. K. I. Kivirikko T. Pihlajaniemi Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol. Biol. 1998 72 325 398
19. K. L. Gorres R. T. Raines Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2010 45 106 124
20. M. A. Culpepper E. E. Scott J. Limburgn Biochemistry 2010 49 124 133
21. M. K. Koski R. Hieta C. Böllner K. I. Kivirikko J. Myllyharju R. K. Wierenga J. Biol. Chem. 2007 282 37112 37123
22. M. K. Koski R. Hieta M. Hirsilä A. Rönkä J. Myllyharju R. K. Wierenga J. Biol. Chem. 2009 284 25290 25301
23. P. Jaakkola D. R. Mole Y.-M. Tian M. I. Wilson J. Gielbert S. J. Gaskell A. von Kriegsheim H. F. Hebestreit M. Mukherji C. J. Schofield P. H. Maxwell C. W. Pugh P. J. Ratcliffe Science 2001 292 468 472
24. M. Ivan K. Kondo H. Yang W. Kim J. Valiando M. Ohh A. Salic J. M. Asara W. S. Lane W. G. Kaelin, Jr. Science 2001 292 464 467
25. W.-C. Hon M. I. Wilson K. Harlos T. D. W. Claridge C. J. Schofield C. W. Pugh P. H. Maxwell P. J. Ratcliffe D. I. Stuart E. Y. Jones Nature 2002 417 975 978
26. J.-H. Min H. Yang M. Ivan F. Gertler W. G. Kaelin, Jr. N. P. Pavletich Science 2002 296 1886 1889
27. M. A. McDonough V. Li E. Flashman R. Chowdhury C. Mohr B. M. R. Liénard J. Zondlo N. J. Oldham I. J. Clifton J. Lewis L. A. McNeill R. J. M. Kurzeja K. S. Hewitson E. Yang S. Jordan R. S. Syed C. J. Schofield Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006 103 9814 9819
28. R. Chowdhury M. A. McDonough J. Mecinovíc C. Loenarz E. Flashman K. S. Hewitson C. Domene C. J. Schofield Structure 2009 17 981 989
29. D. Lando D. J. Peet D. A. Whelan J. J. Gorman M. L. Whitelaw Science 2002 295 858 861
30. L. A. McNeill K. S. Hewitson T. D. Claridge J. F. Seibel L. E. Horsfall C. J. Schofield Biochem. J. 2002 367 571 575
31. S. A. Dames M. Martinez-Yamout R. N. De Guzman H. J. Dyson P. E. Wright Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002 99 5271 5276
32. S. J. Freedman Z.-Y. J. Sun F. Poy A. L. Kung D. M. Livingston G. Wagner M. J. Eck Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002 99 5367 5372
33. C. E. Dann, III R. K. Bruick J. Deisenhofer Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002 99 15351 15356
34. C. Lee S. J. Kim D. G. Jeong S. M. Lee S. E. Ryu J. Biol. Chem. 2003 278 7558 7563
35. J. M. Elkins K. S. Hewitson L. A. McNeill J. F. Seibel I. Schlemminger C. W. Pugh P. J. Ratcliffe C. J. Schofield J. Biol. Chem. 2003 278 1802 1806
36. C. J. Schofield P. J. Ratcliffe Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2004 5 343 354
37. C. E. Dann, III R. K. Bruick Biochem. Biophys. Res. Commun. 2005 338 639 647
38. N. S. Kenneth S. Rocha Biochem. J. 2008 414 19 29
39. W. Ge A. Wolf T. Feng C.-h. Ho R. Sekirnik A. Zayer N. Granatino M. E. Cockman C. Loenarz N. D. Loik A. P. Hardy T. D. W. Claridge R. B. Hamed R. Chowdhury L. Gong C. V. Robinson D. C. Trudgian M. Jiang M. M. Mackeen J. S. Mccullagh Y. Gordiyenko A. Thalhammer A. Yamamoto M. Yang P. Liu-Yi Z. Zhang M. Schmidt-Zachmann B. M. Kessler P. J. Ratcliffe G. M. Preston M. L. Coleman C. J. Schofield Nat. Chem. Biol. 2013 8 960 962
40. L. van Staalduinen S. K. Novakowski Z. Jia J. Mol. Biol. 2014 426 1898 1910
41. R. Chowdhury R. Sekirnik N. C. Brisset T. Krojer C.-h. Ho S. S. Ng I. J. Clifton W. Ge N. J. Kershaw G. C. Fox J. R. C. Muniz M. Vollmar C. Phillips E. S. Pilka K. L. Kavanagh F. von Delft U. Oppermann M. A. McDonough A. J. Doherty C. J. Schofield Nature 2014 510 422 426
42. H. S. Kim H. L. Kim K. H. Kim D. J. Kim S. J. Lee J. Y. Yoon H. J. Yoon H. Y. Lee S. B. Park S.-J. Kim J. Y. Lee S. W. Suh Nucleic Acids Res. 2010 38 2099 2110
43. R. S. Singleton P. Liu-Yi F. Formenti W. Ge R. Sekirnik R. Fischer J. Adam P. J. Pollard A. Wolf A. Thalhammer C. Loenarz E. Flashman A. Yamamoto M. L. Coleman B. M. Kessler P. Wappner C. J. Schofield P. J. Ratcliffe M. E. Cockman Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014 111 4031 4036
44. C. Loenarz R. Sekirnik A. Thalhammer W. Ge E. Spivakovsky M. M. Mackeen M. A. McDonough M. E. Cockman B. M. Kessler P. J. Ratcliffe A. Wolf C. J. Schofield Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014 111 4019 4024
45. M. J. Katz J. M. Acevedo C. Loenarz D. Galagovsky P. Liu-Yi M. Pérez-Pepe A. Thalhammer R. Sekirnik W. Ge M. Melani M. G. Thomas S. Simonetta G. L. Boccaccio C. J. Schofield M. E. Cockman P. J. Ratcliffe P. Wappner Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014 111 4025 4030
46. C. J. Webby A. Wolf N. Gromak M. Dreger H. Kramer B. Kessler M. L. Nielsen C. Schmitz D. S. Butler J. R. Yates, III C. M. Delahunty P. Hahn A. Lengeling M. Mann N. J. Proudfoot C. J. Schofield A. Böttger Science 2009 325 90 93
47. M. Mantri N. D. Loik R. B. Hamed T. D. W. Claridge J. S. O. McCullagh C. J. Schofield ChemBioChem 2011 12 531 534
48. B. Chang Y. Chen Y. Zhao R. K. Bruick Science 2007 318 444 447
49. W. Liu Q. Ma K.-B. Wong W. Li K. Ohgi J. Zhang A. K. Aggarwal M. G. Rosenfeld Cell 2013 155 1581 1595
50. M. Mantri T. Krojer E. A. Bagg C. J. Webby D. S. Butler G. Kochan K. L. Kavanagh U. Oppermann M. A. McDonough C. J. Schofield J. Mol. Biol. 2010 401 211 222
51. X. Hong J. Zang J. White C. Wang C. H. Pan R. Zhao R. C. Murphy S. Dai P. Henson J. W. Kappler J. Hagman G. Zhang Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010 107 14568 14572
52. T. Feng A. Yamamoto S. E. Wilkins E. Sokolova L. A. Yates M. Münzel P. Singh R. J. Hopkinson R. Fischer M. E. Cockman J. Shelley D. C. Trudgian J. Schödel J. S. O. McCullagh W. Ge B. M. Kessler R. J. Gilbert L. Y. Frolova E. Alkalaeva P. J. Ratcliffe C. J. Schofield J. E. Coleman Mol. Cell 2014 53 1 10
53. J. Stenflo E. Holme S. Lindstedt N. Chandramouli L. H. T. Huang J. P. Tam R. B. Merrifield Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989 86 444 447
54. R. S. Gronke W. J. VanDusen V. M. Garsky J. W. Jacobs M. K. Sardana A. M. Stern P. A. Friedman Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989 86 3609 3613
55. J. E. Dinchuk R. J. Focht J. A. Kelley N. L. Henderson N. I. Zolotarjova R. Wynn N. T. Neff J. Link R. M. Huber T. C. Burn M. J. Rupar M. R. Cunningham B. H. Selling J. Ma A. A. Stern G. F. Hollis R. B. Stein P. A. Friedman Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002 277 12970 12977
56. N. Ince S. M. de la Monte J. R. Wands Cancer Res. 2000 60 1261 1266
57. A. Ökesli L. E. Cooper E. J. Fogle W. van der Donk J. Am. Chem. Soc. 2011 133 13753 13760
58. M. L. Coleman M. A. McDonough K. S. Hewitson C. Coles J. Mecinovic M. Edelmann K. M. Cook M. E. Cockman D. E. Lancaster B. M. Kessler R. J. Oldham N. J. Ratcliffe C. J. Schofield J. Biol. Chem. 2007 282 24027 24038
59. A. P. Hardy I. Prokes L. Kelly I. D. Campbell C. J. Schofield J. Mol. Biol. 2009 392 994 1006
60. M. Yang W. Ge R. Chowdhury T. D. W. Claridge H. B. Kramer B. Schmierer M. A. McDonough L. Gong B. M. Kessler P. J. Ratcliffe M. L. Coleman C. J. Schofield J. Biol. Chem. 2011 286 7648 7660
61. M. Yang R. Chowdhury W. Ge R. B. Hamed M. A. McDonough T. D. W. Claridge B. M. Kessler M. E. Cockman P. J. Ratcliffe C. J. Schofield FEBS J. 2011 278 1086 1097
62. K. Janke U. Brockmeier K. Kuhlmann M. Eisenacher J. Nolde H. E. Meyer H. Mairbäurl E. Metzen J. Cell Sci. 2013 126 2629 2640
63. H. H. Qi P. P. Ongusaha J. Myllyharju D. Cheng O. Pakkanen Y. Shi S. W. Lee J. Peng Y. Shi Nature (London) 2008 455 421 424
64. A. Liu R. Y. N. Ho L. Que, Jr. M. J. Ryle B. S. Phinney R. P. Hausinger J. Am. Chem. Soc. 2001 123 5126 5127
65. R. Y. N. Ho M. P. Mehn E. L. Hegg A. Liu M. A. Ryle R. P. Hausinger L. Que, Jr. J. Am. Chem. Soc. 2001 123 5022 5029
66. M. J. Ryle A. Liu R. B. Muthukumaran R. Y. N. Ho K. D. Koehntop J. McCracken L. Que, Jr. R. P. Hausinger Biochemistry 2003 42 1854 1862
67. M. J. Ryle K. D. Koehntop A. Liu L. Que, Jr. R. P. Hausinger Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003 100 3790 3795
68. K. D. Koehntop S. Marimanikkuppam M. J. Ryle R. P. Hausinger L. Que, Jr. J. Biol. Inorg. Chem. 2006 11 63 72
69. M. J. Ryle R. P. Hausinger Curr. Opin. Chem. Biol. 2002 6 193 201
70. Y. Ge B. G. Lawhorn M. Elnaggar S. K. Sze T. P. Begley F. W. McLafferty Protein Sci. 2003 12 2320 2326
71. M. Mantri C. J. Webby N. D. Loik R. B. Hamed M. L. Nielsen M. A. McDonough J. S. O. McCullagh A. Böttger C. J. Schofield A. Wolf MedChemComm 2012 3 80 85
72. Y.-H. Chen L. M. Comeaux S. J. Eyles M. J. Knapp Chem. Commun. 2008 4768 4770
73. T. F. Henshaw M. Feig R. P. Hausinger J. Inorg. Biochem. 2004 98 856 861
74. O. Sundheim C. B. Vågbø M. Bjørås M. M. L. Sousa V. Talstad P. A. Aas F. Drabløs H. E. Krokan J. A. Tainer G. Slupphaug EMBO J. 2006 25 3389 3397
75. E. R. Farquhar K. D. Koehntop J. P. Emerson L. Que, Jr. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2005 338 230 239
76. M. Mantri Z. Zhang M. A. McDonough C. J. Schofield FEBS J. 2012 279 1563 1575
77. T. Jenuwein C. D. Allis Science 2001 293 1074 1080
78. Y.-I. Tsukada J. Fang H. Erdjument-Bromage M. E. Warren C. H. Borchers P. Tempst Y. Zhang Nature 2006 439 811 816
79. K. Yamane C. Toumazou Y.-I. Tsukada H. Erdjument-Bromage P. Tempst J. Wong Y. Zhang Cell 2006 125 1 13
80. J. R. Whetstine A. Nottke F. Lan M. Huart S. Smolikov Z. Chen E. Spooner E. Li G. Zhang M. Colaiacovo Y. Shi Cell 2006 125 467 481
81. R. J. Klose K. Yamane Y. Bae D. Zhang H. Erdjument-Bromage P. Tempst J. Wong Y. Zhang Nature 2006 442 312 316
82. P. A. C. Cloos J. Christensen K. Agger A. Maiolica J. Rappsilber T. Antal K. H. Hansen K. Helin Nature 2006 442 307 311
83. Z. Chen J. Zang J. R. Whetstine X. Hong F. Davrazou T. G. Kutateladze M. Simpson Q. Mao C.-H. Pan S. Dai J. Hagman K. Hansen Y. Shi G. Zhang Cell 2006 125 691 702
84. J.-F. Couture E. Collazo P. A. Ortiz-Tello J. S. Brunzelle R. C. Trievel Nat. Struct. Mol. Biol. 2007 14 689 695
85. S. S. Ng K. L. Kavanagh M. A. McDonough D. Butler E. S. Pilka B. M. R. Lienard J. E. Bray P. Savitsky O. Gileadi F. von Delft N. R. Rose J. Offer J. C. Scheinost T. Borowski M. Sundstrom C. J. Schofield U. Oppermann Nature 2007 448 87 91
86. Z. Chen J. Zang J. Kappler X. Hong F. Crawford Q. Wang F. Lan C. Jiang J. R. Whetstine S. Dai K. Hansen Y. Shi G. Zhang Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007 104 10818 10823
87. J. R. Horton A. Upadhyay H. H. Qi Y. Shi C. Xiaodong Nat. Struct. Mol. Biol. 2010 17 38 43
88. W. W. Yue V. Hozjan W. Ge C. Loenarz C. D. O. Cooper C. J. Schofield K. L. Kavanagh U. Oppermann M. A. McDonough FEBS Lett. 2010 584 825 830
89. Z. Cheng P. Cheung A. J. Kuo E. T. Yukl C. M. Wilmot O. Gozani D. J. Patel Genes Dev. 2014 28 1758 1771
90. C. Johansson A. Tumber K. Che P. Cain R. Nowak C. Gileadi U. Oppermann Epigenomics 2014 6 89 120
91. C. C. Thinnes K. S. England A. Kawamura R. Chowdhury C. J. Schofield R. J. Hopkinson Biochim. Biophys. Acta 2014 1839 1416 1432
92. N. Mosammaparast Y. Shi Annu. Rev. Biochem 2010 79 155 179
93. M.-M. Li A. Nilsen Y. Shi M. Fusser Y.-H. Ding Y. Fu B. Liu Y. Niu Y.-S. Wu C.-M. Huang M. Olofsson K.-X. Jin Y. Lv X.-Z. Xu C. He M.-Q. Dong J. M. R. Danielsen A. Klungland Y.-G. Yang Nat. Commun. 2013 4 1832
94. L. G. Bjørnstad T. J. Meza M. Otterlei S. M. Olafsrud L. A. Meza-Zepeda P. Ø. Falnes PLoS One 2012 7 e49045
95. S. C. Trewick T. F. Henshaw R. P. Hausinger T. Lindahl B. Sedgwick Nature 2002 419 174 178
96. P. Ø. Falnes R. F. Johansen E. Seeberg Nature 2002 419 178 182
97. P. A. Aas M. Otterlei P. Ø. Falnes C. B. Vågbø F. Skorpen M. Akbari O. Sundheim M. Bjøras G. Slupphaug E. Seeberg H. E. Krokan Nature 2003 421 859 863
98. J. C. Delaney J. M. Essigmann Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004 101 14051 14056
99. P. Koivisto P. Robins T. Lindahl B. Sedgwick J. Biol. Chem. 2004 279 40470 40474
100. D. Li J. C. Delaney C. M. Page X. Yang A. S. Chen C. Wong C. L. Drennan J. M. Essigmann J. Am. Chem. Soc. 2012 134 8896 8901
101. D. Li B. I. Fedeles N. Shrivastav J. C. Delaney X. Yang C. Wong C. L. Drennan J. M. Essigmann Chem. Res. Toxicol. 2013 26 1182 1187
102. B. Yu W. C. Edstrom Y. Hamuro P. C. Weber B. R. Gibney J. F. Hunt Nature 2006 439 879 884
103. C.-G. Yang C. Yi E. M. Duguid C. T. Sullivan X. Jian P. A. Rice C. He Nature 2008 452 961 965
104. B. Yu J. F. Hunt Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009 106 14315 14320
105. P. J. Holland T. Hollis PLoS One 2010 5 e8680
106. C. Yi G. Jia G. Hou Q. Dai W. Zhang G. Zheng X. Jian C.-G. Yang Q. Cui C. He Nature 2010 468 330 333
107. E. Van den Born A. Bekkelund M. N. Moen M. V. Omelchenko A. Klungland P. Ø. Falnes Nucleic Acids Res. 2009 37 7124 7136
108. E. van den Born M. V. Omelchenko A. Bekkelund V. Leihne E. V. Koonin V. V. Dolja P. Ø. Falnes Nucleic Acids Res. 2008 36 5451 5456
109. M. A. Kurowski A. S. Bhagwat G. Papaj J. M. Bujnicki BMC Genomics 2003 4 48
110. L. Sanchez-Pulido M. A. Andrade-Navarro BMC Biochem. 2007 8 23
111. D. Mielecki D. L. Zugaj A. Muszewska J. Piwowarski A. Chojnacka M. Mielecki J. Nieminuszczy M. Grynberg E. Grzesiuk PLoS One 2012 7 e30588
112. T. Duncan S. C. Trewick P. Koivisto P. A. Bates T. Lindahl B. Sedgwick Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002 99 16660 16665
113. J. Ringvoll L. M. Nordstrand C. B. Vågbø V. Talstad K. Reite P. A. Aas K. H. Lauritzen N. B. Liabakk A. Bjork R. W. Doughty P. Ø. Falnes H. E. Krokan A. Klungland EMBO J. 2006 25 2189 2198
114. L. Lu C. Yi X. Jian G. Zheng C. He Nucleic Acids Res. 2010 38 4415 4425
115. C. Yi B. Chen B. Qi W. Zhang G. Jia C. J. Li A. R. Diner C.-G. Yang C. He Nat. Struct. Mol. Biol. 2012 19 671 676
116. V. T. Monsen O. Sundheim P. A. Aas M. P. Westbye M. M. L. Sousa G. Slupphaug H. E. Krokan Nucleic Acids Res. 2010 38 6447 6455
117. M. P. Westbye E. Feyzi P. A. Aas C. B. Vågbø V. A. Talstad B. Kavli L. Hagen O. Sundheim M. Akbari N.-B. Liabakk G. Slupphaug M. Otterlei H. E. Krokan J. Biol. Chem. 2008 283 25046 25056
118. R. Ougland D. Lando I. Jonson J. A. Dahl M. N. Moen L. M. Nordstrand T. Rognes J. T. Lee A. Klungland T. Kouzarides E. Larsen Stem Cells 2012 30 2672 2682
119. T. A. Müller K. Meek R. P. Hausinger DNA Repair 2010 9 58 65
120. T. A. Müller M. M. Andrzejak R. P. Hausinger Biochem. J. 2013 452 509 518
121. G. Zheng J. A. Dahl Y. Niu P. Fedorcsak C.-H. Huang C. J. Li C. B. Vågbø Y. Shi W.-L. Wang S.-H. Song Z. Lu R. P. G. Bosmans Q. Dai Y.-J. Hao X. Yang W.-M. Zhao W.-M. Tong X.-J. Wang F. Bogdan K. Furu Y. Fu G. Jia X. Zhao J. Liu H. E. Krokan A. Klungland Y.-G. Yang C. He Mol. Cell 2013 49 18 29
122. J.-M. Fustin M. Doi Y. Yamaguchi H. Hida S. Nishimura M. Yoshida T. Isagawa M. S. Morioka H. Kakeya I. Manabe H. Okamura Cell 2013 155 793 806
123. W. Aik J. S. Scotti H. Choi L. Gong M. Demetriades C. J. Schofield M. A. McDonough Nucleic Acids Res. 2014 42 4741 4754
124. C. Feng Y. Liu G. Wang Z. Deng Q. Zhang W. Wu Y. Tong C. cheng Z. Chen J. Biol. Chem. 2014 289 11571 11583
125. W. Chen L. Zhang G. Zheng Y. Fu Q. Ji F. Liu H. Chen C. He FEBS Lett. 2014 588 892 898
126. G. Wang Q. He C. Feng Y. Liu Z. Deng Z. Qi W. Wu P. Mei Z. Chen J. Biol. Chem. 289 27924 27936
127. J. Fischer L. Koch C. Emmerling J. Vierkotten T. Peters J. C. Brüning U. Rüther Nature 2009 458 894 898
128. T. Gerken C. A. Girard Y. C. Tung C. J. Webby V. Saudek K. S. Hewitson G. S. Yeo M. A. McDonough S. Cunliffe L. A. McNeill J. Galvanovskis P. Rorsman P. Robins X. Prieur A. P. Coll M. Ma Z. Jovanovic I. S. Farooqi B. Sedgwick I. Barroso T. Lindahl C. P. Ponting F. M. Ashcroft S. O'Rahilly C. J. Schofield Science 2007 318 1469 1472
129. G. Jia C.-G. Yang S. Yang X. Jian C. Yi Z. Zhou C. He FEBS Lett. 2008 582 3313 3319
130. G. Jia Y. Fu X. Zhao Q. Dai G. Zheng Y. Yang C. Yi T. Lindahl Y.-G. Yang C. He Nat. Chem. Biol. 2011 7 885 887
131. Y. Fu G. Jia X. Pang R. N. Wang X.-J. Wang C. J. Li S. Smemo Q. Dai K. A. Bailey M. A. Nobrega K.-L. Han Q. Cui C. He Nat. Commun. 2013 4 1798
132. Z. Han T. Niu J. Chang X. Lei M. Zhao Q. Wang W. Cheng J. Wang Y. Feng J. Chai Nature 2010 464 1205 1209
133. W. Aik M. Demetriades M. K. K. Hamdan E. A. L. Bagg K. K. Yeoh C. Lejeune Z. Zhang M. A. McDonough C. J. Schofield J. Med. Chem. 2013 56 3680 3688
134. D. Fu J. A. N. Brophy C. T. Y. Chan K. A. Atmore U. Begley R. S. Paules P. C. Dedon T. J. Begley L. D. Samson Mol. Cell. Biol. 2010 30 2449 2459
135. Y. Fu Q. Dai W. Zhang J. Ren T. Pan C. He Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 8885 8888
136. E. van den Born C. B. Vågbø L. Songe-Møller V. Leihne G. F. Lien G. Leszczynska A. Malkiewicz H. E. Krokan F. Kirpekar A. Klungland P. Ø. Falnes Nat. Commun. 2011 2 10.1038/ncomms1173
137. C. Pastore I. Topalidou F. Forouhar A. C. Yan M. Levy J. F. Hunt J. Biol. Chem. 2012 287 2130 2143
138. D. Zdzalik C. B. Vågbø F. Kirpekar E. Davydova A. Puscian A. M. Maciejewska H. E. Krokan A. Klungland B. Tudek E. van den Born P. Ø. Falnes PLoS One 2014 9 e98729
139. V. De Crécy-Lagard C. Brochier-Armanet J. Ubronavicius B. Fernandez G. Phillips B. Lyons A. Noma S. Alvarez L. Droogmans J. Armengaud H. Grosjean Mol. Biol. Evol. 2010 27 2062 2077
140. M. Kato Y. Araiso A. Noma A. Nagao T. Suzuki R. Ishitani O. Nureki Nucleic Acids Res. 2010 39 1576 1585
141. M. Tahiliani K. P. Koh Y. Shen W. A. Pastor H. Bandukwala Y. Brudno S. Agarwal L. M. Iyer D. R. Liu L. Aravind A. Rao Science 2009 324 930 935
142. S. Ito A. C. D'Alessio O. V. Taranova K. Hong L. C. Sowers Y. Zhang Nature 2010 466 1129 1133
143. T. Pfaffeneder B. Hackner M. Truß M. Münzel M. Müller C. A. Deiml C. Hagemeier T. Carell Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 7008 7012
144. S. Ito L. Shen Q. Dai S. C. Wu L. B. Collins J. A. Swenberg C. He Y. Zhang Science 2011 333 1300 1303
145. Y.-F. He B.-Z. Li Z. Li P. Liu Y. Wang Q. Tang J. Ding Y. Jia Z. Chen L. Li Y. Sun X. Li Q. Dai C.-X. Song K. Zhang C. He G.-L. Xu Science 2011 333 1303 1307
146. L. Zhang W. Chen L. M. Iyer J. Hu G. Wang Y. Fu M. Yu Q. Dai L. Aravind C. He J. Am. Chem. Soc. 2014 136 4801 4804
147. T. Pfaffeneder F. Spada M. Wagner C. Brandmayr S. K. Laube D. Eisen M. Truss J. Steinbacher B. Hackner O. Kotljarova D. Schuermann S. Michalakis O. Kosmatchev S. Schiesser B. Steigenberger N. Raddaoui G. Kashiwazaki U. Müller C. G. Spruijt M. Vermeulen H. Leonhardt P. Schär M. Müller T. Carell Nat. Chem. Biol. 2014 10 574 581
148. C.-H. Song C. He TIBS 2013 38 480 484
149. C. J. Mariani A. Vasanthakumar J. Madzo A. Yesilkanal T. Bhagat Y. Yu S. Bhattacharyya R. H. Wenger S. L. Cohn J. Nanduri A. Verma N. R. Prabhakar L. A. Godley Cell Rep. 2014 7 1 10
150. S. Schiesser B. Hackner T. Pfaffendeder M. Müller C. Hagemeier M. Truss T. Carell Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 6516 6520
151. L. Hu Z. Li J. Cheng Q. Rao W. Gong M. Liu Y. G. Shi J. Zhu P. Wang Y. Xu Cell 2013 155 1545 1555
152. H. Hashimoto J. E. Pais X. Zhang L. Saleh Z.-Q. Fu N. Dai I. R. Corrèa, Jr. Y. Zheng X. Cheng Nature 2014 506 391 395
153. Y.-C. Huang A. Rao Trends Genet. 2014 30 464 474
154. L. Shen C.-X. Song C. He Y. Zhang Annu. Rev. Biochem. 2014 83 585 614
155. P. Borst R. Sabatini Annu. Rev. Microbiol. 2008 62 235 251
156. J. H. Gommers-Ampt F. Van Leeuwen A. L. de Beer J. F. Vliegenthart M. Dizdaroglu J. A. Kowalak P. F. Crain P. Borst Cell 1993 75 1129 1136
157. J. H. Gommers-Ampt A. J. Teixeira G. van de Werken W. J. van Dijk P. Borst Nucleic Acids Res. 1993 21 2039 2043
158. F. van Leeuwen R. Kieft M. Cross P. Borst Mol. Cell. Biol. 1998 18 5643 5651
159. M. Cross R. Kieft R. Sabatini M. Wilm M. de Kort G. A. van der Marel J. H. van Boom F. van Leeuwen P. Borst EMBO J. 1999 18 6573 6581
160. M. Cross R. Kieft R. Sabatini A. Dirks-Mulder I. Chaves P. Borst Mol. Microbiol. 2002 46 37 47
161. Z. Yu P. A. Genest B. Ter Riet K. Sweeney C. DiPaolo R. Kieft E. Christodoulou A. Perrakis J. M. Simmons R. P. Hausinger H. G. Van Luenen D. J. Rigden R. Sabatini P. Borst Nucleic Acids Res. 2007 35 2107 2115
162. L. M. Iyer D. Zhang R. F. de Souza P. J. Pukkila A. Rao L. Aravind Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014 111 1676 1683
163. R. Kieft V. Brand D. K. Ekanayake K. Sweeney C. DiPaolo W. S. Reznikoff R. Sabatini Mol. Biochem. Parasitol. 2007 156 24 31
164. L. J. Cliffe G. Hirsch J. Wang D. Ekanayake W. Bullard M. Hu Y. Wang R. Sabatini J. Biol. Chem. 2012 287 19886 19895
165. F. M. Vaz R. J. A. Wanders Biochem. J. 2002 361 417 429
166. J. D. Hulse S. R. Ellis L. M. Henderson J. Biol. Chem. 1978 253 1654 1659
167. F. M. Vaz R. Ofman K. Westinga J. W. Back R. J. A. Wanders J. Biol. Chem. 2001 276 33512 33517
168. G. Lindstedt S. Lindstedt B. Olander M. Tofft Biochim. Biophys. Acta 1968 158 503 505
169. G. Lindstedt S. Lindstedt I. Nordin Biochemistry 1977 16 2181 2188
170. A. Kondo J. S. Blanchard S. Englard Arch. Biochem. Biophys. 1981 212 338 346
171. A. M. Rydzik I. K. H. Leung G. T. Kochan N. D. Loik L. Henry M. A. McDonough T. D. W. Claridge C. J. Schofield Organic and Biomolecular Chemistry 2014 12 6354 6358
172. K. Tars J. Rumnieks A. Zeltins A. Kazaks S. Kotelovica A. Leonciks J. Saripo A. Viksna J. Kuka E. Liepinsh M. Dambrova Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010 398 634 639
173. I. K. H. Leung T. J. Krojer G. T. Kochan L. Henry F. von Delft T. D. W. Claridge U. Oppermann M. A. McDonough C. J. Schofield Chem. Biol. 2010 17 1316 1324
174. P. A. Watkins A. E. Howard S. J. Mihalik Biochim. Biophys. Acta 1994 1214 288 294
175. S. J. Mihalik A. M. Rainville P. A. Watkins Eur. J. Biochem. 1995 232 545 551
176. K. Croes P. P. Van Veldhoven G. P. Mannaerts M. Casteels FEBS Lett. 1997 407 197 200
177. K. Croes M. Casteels S. Asselberghs P. Herdewijn G. P. Mannaerts P. P. Van Veldhoven FEBS Lett. 1997 412 643 645
178. N. M. Verhoeven D. S. M. Schor H. J. ten Brink R. J. A. Wanders C. Jakobs Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997 237 33 36
179. R. J. A. Wanders J. Komen S. Ferdinandusse Biochim. Biophys. Acta 2011 1811 498 507
180. G. A. Jansen R. Ofman S. Denis S. Ferdinandusse E. M. Hogenhout C. Jakobs R. J. A. Wanders J. Lipid Res. 1999 40 2244 2254
181. M. Mukherji W. Chien N. J. Kershaw I. J. Clifton C. J. Schofield A. S. Wierzbicki M. D. Lloyd Hum. Mol. Genet. 2001 10 1971 1982
182. M. A. McDonough K. L. Kavanagh D. Butler T. Searls U. Oppermann C. J. Schofield J. Biol. Chem. 2005 280 41101 41110
183. N. González-Silva I. López-Lara R. Reyes-Lamothe A. M. Taylor D. Sumpton J. Thomas-Oates O. Geiger Biochemistry 2011 50 6396 6408
184. H. S. Gibbons S. Lin R. J. Cotter C. R. H. Raetz J. Biol. Chem. 2000 275 32940 32949
185. H. S. Gibbons C. M. Reynolds Z. Guan C. R. H. Raetz Biochemistry 2008 47 2814 2825
186. H. S. Chung C. R. H. Raetz Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011 108 510 515
187. Y. Kawai E. Ono M. Mizutani Plant J. 2014 78 328 343
188. B. A. Bohm, Introduction to Flavonoids, Harwood Academic Publishers, Amsterdam, The Netherlands, 1998
189. L. Le Marchand Biomed. Pharmacother. 2002 56 296 301
190. L. Britsch Arch. Biochem. Biophys. 1990 282 152 160
191. L. Britsch H. Grisebach Eur. J. Biochem. 1986 156 569 577
192. R. C. Wilmouth J. J. Turnbull R. W. D. Welford I. J. Clifton A. G. Prescott C. J. Schofield Structure 2002 10 93 103
193. F. Wellman R. Lukacin T. Moriguchi L. Britsch E. Schiltz U. Matern Eur. J. Biochem. 2002 269 4134 4142
194. K. Saito M. Kobayashi Z. Gong Y. Tanaka M. Yamazaki Plant J. 1999 17 181 189
195. R. W. D. Welford I. J. Clifton J. J. Turnbull S. C. Wilson C. J. Schofield Org. Biomol. Chem. 2005 3 3117 3126
196. M. Frey K. Huber W. J. Park D. Sicker P. Lindberg R. B. Meeley C. R. Simmons N. Yalpani A. Gierl Phytochemistry 2003 62 371 376
197. M. Frey K. Schullehner R. Dick A. Feiesselmann A. Gierl Phytochemistry 2009 70 1645 1651
198. D. Anzellotti R. K. Ibrahim Arch. Biochem. Biophys. 2000 382 161 172
199. D. Anzellotti R. K. Ibrahim BMC Plant Biol. 2004 4 20
200. A. Berim D. R. Gang J. Biol. Chem. 2013 288 1795 1805
201. A.-X. Cheng X.-J. Han Y.-F. Wu H.-X. Lou Int. J. Mol. Sci. 2014 15 1080 1095
202. P. Hedden S. G. Thomas Biochem. J. 2012 444 11 25
203. T. Lange A. Schweimer D. A. Ward P. Hedden J. E. Graebe Planta 1994 195 98 107
204. T. Lange Planta 1994 195 108 115
205. T. Lange P. Hedden J. E. Graebe Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994 91 8552 8556
206. J. L. Ward P. Gaskin R. G. S. Brown G. S. Jackson P. Hedden A. L. Phillips C. L. Willis M. H. Beale J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2002 1 232 241
207. J. Williams A. L. Phillips P. Gaskin P. Hedden Plant Physiol. 1998 117 559 563
208. S. G. Thomas A. L. Phillips P. Hedden Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999 96 4698 4703
209. P. Hedden A. L. Phillips Trends Plant Sci. 2000 5 523 528
210. A. Bhattacharya S. Kourmpetli D. A. Ward S. G. Thomas F. Gong S. J. Powers E. Carrera B. Taylor F. N. de Caceres Gonzalez B. Tudzynski A. L. Phillips M. R. Davey P. Hedden Plant Physiol. 2012 160 837 845
211. T. Hashimoto Y. Yamada Eur. J. Biochem. 1987 164 277 285
212. T. Hashimoto J. Matsuda Y. Yamada FEBS Lett. 1993 329 35 39
213. E. De Carolis F. Chan J. Balsevich V. De Luca Plant Physiol. 1990 94 1323 1329
214. E. De Carolis V. De Luca J. Biol. Chem. 1993 268 5504 5511
215. J. M. Hagel P. J. Facchini Nat. Chem. Biol. 2010 6 273 275
216. S. C. Farrow P. J. Facchini J. Biol. Chem. 2013 288 28997 29012
217. J. Havermann D. Vogel B. Loll U. Keller Chem. Biol. 2014 21 146 155
218. H. Nakanishi H. Yamaguchi T. Sasakuma N. K. Nishizawa S. Mori Plant Mol. Biol. 2000 44 199 207
219. K. Kai M. Mizutani N. Kawamura R. Yamamoto M. Tamai H. Yamaguchi K. Sakata B.-I. Shimizum Plant J. 2008 55 989 999
220. S. Matsumoto M. Mizutani K. Sakata B.-I. Shimizu Phytochemistry 2012 74 49 57
221. G. Vialart A. Hehn A. Olry K. Ito C. Krieger R. Larbat C. Paris B. Shimizu Y. Sugimoto M. Mizutani F. Bourgaud Plant J. 2012 70 460 470
222. N. Agerbirk C. E. Olsen Phytochemistry 2012 77 16 45
223. D. J. Kliebenstein V. M. Lambrix M. Reichelt J. Gershenzon T. Mitchell-Olds Plant Cell 2001 13 681 693
224. Z. Zhao Y. Zhang X. Liu X. Zhang S. Liu X. Yu Y. Ren X. Zheng K. Zhou L. Jiang X. Guo Y. Gai C. Wu H. Zhai H. Wang J. Wan Dev. Cell 2013 27 113 122
225. K. Zhang R. Halitschke C. Yin C.-J. Liu S.-S. Gan Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013 110 14807 14812
226. J. E. Baldwin R. A. Field C. C. Lawrence K. D. Merritt C. J. Schofield Tetrahedron Lett. 1993 34 7489 7492
227. C. C. Lawrence W. J. Sobey R. A. Field J. E. Baldwin C. J. Schofield Biochem. J. 1996 313 185 191
228. T. Shibasaki H. Mori S. Chiba A. Ozaki Appl. Environ. Microbiol. 1999 65 4028 4031
229. L. Petersen R. Olewinski P. Salmon N. Conners Appl. Microbiol. Biotechnol. 2003 62 263 267
230. R. Hara K. Kino Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009 379 882 886
231. R. Hara N. Uchiumi K. Kino J. Biotechnol. 2014 172 55 58
232. H. Mori T. Shibasaki Y. Uozaki K. Ochiai A. Ozaki Appl. Environ. Microbiol. 1996 62 1903 1907
233. H. Mori T. Shibasaki K. Yano A. Ozaki J. Bacteriol. 1997 179 5677 5683
234. I. J. Clifton L.-C. Hsueh J. E. Baldwin K. Harlos C. J. Schofield Eur. J. Biochem. 2001 268 6625 6636
235. M. Strieker F. Kopp C. Mahlert L.-O. Essen M. A. Marahiel ACS Chem. Biol. 2007 2 187 196
236. M. Strieker L.-O. Essen C. T. Walsh M. A. Marahiel ChemBioChem 2008 9 374 376
237. G. M. Singh P. D. Fortin A. Koglin C. T. Walsh Biochemistry 2008 47 11310 11320
238. X. Yin T. M. Zabriskie ChemBioChem 2004 5 1274 1277
239. V. Helmetag S. A. Samel M. G. Thomas M. A. Marahiel L.-O. Essen FEBS J. 2009 276 3669 3682
240. B. Haltli Y. Tan N. A. Magarvey M. Wagenaar X. Yin M. Greenstein J. A. Hucul T. M. Zabriskie Chem. Biol. 2005 12 1163 1168
241. C. Haefelè C. Bonfils Y. Sauvaire Phytochemistry 1997 44 563 566
242. S. V. Smirnov T. Kodera N. N. Samonova V. A. Kotlyarova N. Y. Rushkevich A. D. Kivero P. M. Sokolov M. Hibi J. Ogawa B. Shimizu Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010 88 719 726
243. M. Hibi T. Kawashima T. Kodera S. V. Smirnov P. M. Sokolov M. Sugiyama S. Shimizu K. Yokozeki J. Ogawa Appl. Environ. Microbiol. 2011 77 6926 6930
244. S. V. Smirnov P. M. Sokolov V. A. Kotlyarova N. N. Samsonova T. Kodera M. Sugiyama T. Torii M. Hibi S. Shimizu K. Yokozeki J. Ogawa MicrobiologyOpen 2013 2 471 478
245. S. V. Smirnov P. M. Sokolov M. Kodera M. Sugiyama M. Hibi S. Shimizu K. Yokozeki J. Ogawa FEMS Microbiol. Lett. 2012 331 97 104
246. M. Hibi T. Kawashima P. M. Sokolov S. V. Smirnov M. Kodera M. Sugiyama S. Shimizu K. Yokozeki J. Ogawa Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013 97 2467 2472
247. H.-M. Qin T. Miyakawa M. Z. Jia A. Nakamura J. Ohtsuka Y.-L. Xue T. Kawashima T. Kasahara M. Hibi J. Ogawa M. Tanokura PLoS One 2013 8 e63996
248. H.-M Qin T Miyakawa A Nakamura M Hibi J Ogawa M Tanokura Biochem. Biophys. Res. Commun. 2014 450 1458 1461
249. E. J. Drake A. M. Gulick J. Mol. Biol. 2008 384 193 205
250. J. Bursy A. J. Pierik N. Pica E. Bremer J. Biol. Chem. 2007 282 31147 31155
251. N. Widderich A. Höppner M. Pittlekow J. Heider S. H. J. Smits E. Bremer PLoS One 2014 9 e93809
252. K. Reuter M. Pittelkow J. Bursy A. Heine T. Craan E. Bremer PLoS One 2010 5 e10647
253. N. Widderich M. Pittlekow A. Höppner D. Mulnaes W. Buckel H. Gohlke S. H. J. Smits E. Bremer J. Mol. Biol. 2014 426 586 600
254. H. Fukuda T. Ogawa M. Tazaki K. Nagahama T. Fujii S. Tanase Y. Morino Biochem. Biophys. Res. Commun. 1992 188 483 489
255. D. Meng L. Shen R. Yang X. Zhang J. Sheng Biochim. Biophys. Acta 2014 1840 120 128
256. J.-P. Wang L.-X. Wu F. Xu J. Lv H.-J. Jin S.-F. Chen Bioresour. Technol. 2010 101 6404 6409
257. F. Guerrero V. Carbonell M. Cossu D. Correddu P. R. Jones PLoS One 2012 7 e50470
258. J. Ungerer L. Tao M. Davis M. Ghirardi P.-C. Maness J. Yu Energy Environ. Sci. 2012 5 8998 9006
259. M. T. Abbott E. K. Schandl R. F. Lee T. S. Parker R. J. Midgett Biochim. Biophys. Acta 1967 132 525 528
260. E. Holme G. Lindstedt S. Lindstedt M. Tofft Biochim. Biophys. Acta 1970 212 50 57
261. E. Holme G. Lindstedt S. Lindstedt M. Tofft J. Biol. Chem. 1971 246 3314 3319
262. C. K. Liu C. A. Hsu M. T. Abbott Arch. Biochem. Biophys. 1973 159 180 187
263. B. J. Warn-Cramer L. A. Macrander M. T. Abbott J. Biol. Chem. 1983 258 10551 10557
264. L. D. Thornburg M.-T. Lai J. S. Wishnok J. Stubbe Biochemistry 1993 32 14023 14033
265. J. W. Neidigh A. Darwanto A. A. Williams N. R. Wall L. C. Sowers Chem. Res. Toxicol. 2009 22 885 893
266. A. Cultrone C. Scazzocchio M. Rochet G. Montero-Morán C. Drevet R. Fernández-Martín Mol. Microbiol. 2005 57 276 290
267. G. M. Montero-Moràn M. Li E. Rendóm-Huerta F. Jourdan D. J. Lowe A. W. Stumpff-Kane M. Feig C. Scazzocchio R. P. Hausinger Biochemistry 2007 46 5293 5304
268. M. Li T. A. Müller B. A. Fraser R. P. Hausinger Arch. Biochem. Biophys. 2008 470 44 53
269. L. Bankel G. Lindstedt S. Lindstedt J. Biol. Chem. 1972 247 6128 6134
270. L. M. Wondrack C. A. Hsu M. T. Abbott J. Biol. Chem. 1978 253 6511 6515
271. J. Stubbe J. Biol. Chem. 1985 260 9972 9975
272. Z. Yang X. Chi M. Funabashi S. Baba K. Nonaka P. Pahari J. Unrine J. M. Jacobsen G. I. Elliott J. Rohr S. G. Van Lanen J. Biol. Chem. 2011 286 7885 7892
273. C. Zhao T. Huang W. Chen Z. Deng Appl. Environ. Microbiol. 2010 76 7343 7347
274. R. P. Hausinger, F. Fukumori, D. A. Hogan, T. M. Sassanella, Y. Kamagata, H. Takami and R. E. Saari, in Microbial Diversity and Genetics of Biodegradation, ed., K. Horikoshi, M. Fukuda, and, T. Kudo, Japan Scientific Press, Tokyo, 1997, pp. 35-51
275. F. Fukumori R. P. Hausinger J. Bacteriol. 1993 175 2083 2086
276. F. Fukumori R. P. Hausinger J. Biol. Chem. 1993 268 24311 24317
277. E. L. Hegg A. K. Whiting R. E. Saari J. McCracken R. P. Hausinger L. Que, Jr. Biochemistry 1999 38 16714 16726
278. S. L. Griffin J. A. Godbey T. J. Oman S. K. Embrey A. Karnoup K. Kuppannan B. W. Barnett G. Lin N. V. J. Harpham A. N. Juba B. W. Schafer R. M. Cicchillo J. Agric. Food Chem. 2013 61 6589 6596
279. K. Nickel M. J.-F. Suter H.-P. E. Kohler J. Bacteriol. 1997 179 6674 6679
280. T. A. Müller M. I. Zavodszky M. Feig L. A. Kuhn R. P. Hausinger Protein Sci. 2006 15 1356 1368
281. J. M. Bollinger, Jr. J. C. Price L. M. Hoffart E. W. Barr C. Krebs Eur. J. Inorg. Chem. 2005 4245 4254
282. E. Eichhorn J. R. van der Ploeg M. A. Kertesz T. Leisinger J. Biol. Chem. 1997 272 23031 23036
283. J. M. Elkins M. J. Ryle I. J. Clifton J. C. Dunning Hotopp J. S. Lloyd N. I. Burzlaff J. E. Baldwin R. P. Hausinger P. L. Roach Biochemistry 2002 41 5185 5192
284. J. R. O'Brien D. J. Schuller V. S. Yang B. D. Dillard W. N. Lanzilotta Biochemistry 2003 42 5547 5554
285. S. H. Knauer O. Hartl-Spiegelhauer S. Schwarzinger P. Hänzelmann H. Dobbek FEBS J. 2012 279 816 831
286. M. J. Ryle R. Padmakumar R. P. Hausinger Biochemistry 1999 38 15278 15286
287. R. B. Muthakumaran P. K. Grzyska R. P. Hausinger J. McCracken Biochemistry 2007 46 5951 5959
288. J. C. Price E. W. Barr B. Tirupati J. M. Bollinger, Jr. C. Krebs Biochemistry 2003 42 7497 7508
289. P. J. Riggs-Gelasco J. C. Price R. B. Guyer J. H. Brehm E. W. Barr J. M. Bollinger, Jr. C. Krebs J. Am. Chem. Soc. 2004 126 8108 8109
290. D. A. Proshlyakov T. F. Henshaw G. R. Monterosso M. J. Ryle R. P. Hausinger J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1022 1023
291. P. K. Grzyska M. J. Ryle G. R. Monterosso J. Liu D. P. Ballou R. P. Hausinger Biochemistry 2005 44 3845 3855
292. D. A. Hogan T. A. Auchtung R. P. Hausinger J. Bacteriol. 1999 181 5876 5879
293. A. Kahnert M. A. Kertesz J. Biol. Chem. 2000 275 31661 31667
294. K. M. Sogi Z. J. Gartner M. A. Breidenbach M. J. Appel M. W. Schelle C. R. Bertozzi PLoS One 2013 8 e65080
295. I. Müller A. Kahnert T. Pape G. M. Sheldrick W. Meyer-Klaucke T. Dierks M. Kertesz I. Usòn Biochemistry 2004 43 3075 3088
296. I. Müller C. Stückl J. Wakeley M. Kertesz I. Usòn J. Biol. Chem. 2004 280 5716 5723
297. F. R. McSorley P. B. Wyatt A. Martinez E. F. DeLong B. Hove-Jensen D. L. Zechel J. Am. Chem. Soc. 2012 134 8364 8367
298. B. T. Circello A. C. Eliot J.-H. Lee W. A. van der Donk W. W. Metcalf Chem. Biol. 2010 17 402 411
299. M. A. DeSieno W. van der Donk H. Zhao Chem. Commun. 2011 47 10025 10027
300. M. Watanabe N. Sumida S. Murakami H. Anzai C. J. Thompson Y. Tateno T. Murakami Appl. Environ. Microbiol. 1999 65 1036 1044
301. D. J. Bougioukou S. Mukherjee W. A. van der Donk Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013 110 10952 10957
302. A. K. White W. W. Metcalf J. Biol. Chem. 2002 277 38262 38271
303. N. J. Kershaw M. E. C. Caines M. C. Sleeman C. J. Schofield Chem. Commun. 2005 4251 4263
304. R. W. Busby M. D.-T. Chang R. C. Busby J. Wimp C. A. Townsend J. Biol. Chem. 1995 270 4262 4269
305. E. G. Pavel J. Zhou R. W. Busby M. Gunsior C. A. Townsend E. I. Solomon J. Am. Chem. Soc. 1998 120 743 753
306. J. Zhou W. L. Kelly B. O. Bachmann M. Gunsior C. A. Townsend E. I. Solomon J. Am. Chem. Soc. 2001 123 7388 7398
307. Z. Zhang J. Ren D. K. Stammers J. E. Baldwin K. Harlos C. J. Schofield Nat. Struct. Biol. 2000 7 127 133
308. Z. Zhang J.-s. Ren K. Harlos C. H. McKinnon I. J. Clifton C. J. Schofield FEBS Lett. 2002 517 7 12
309. S. Kovacevic B. J. Weigel M. B. Tobin T. D. Ingolia J. R. Miller J. Bacteriol. 1989 171 754 760
310. J. E. Dotzlaf W.-K. Yeh J. Biol. Chem. 1989 264 10219 10227
311. B. J. Baker J. E. Dotzlaf W.-K. Yeh J. Biol. Chem. 1991 266 5087 5093
312. J. E. Dotzlaf W.-K. Yeh J. Bacteriol. 1987 169 1611 1618
313. J. E. Baldwin R. M. Adlington J. B. Coates M. J. C. Crabbe N. P. Crouch J. W. Keeping G. C. Knight C. J. Schofield H.-H. Ting C. A. Vallejo M. Thorniley E. P. Abraham Biochem. J. 1987 245 831 841
314. K. Valegård A. C. Terwisscha van Scheltinga M. D. Lloyd T. Hara S. Ramaswamy A. Perrakis A. Thompson W.-J. Lee J. E. Baldwin C. J. Schofield J. Hajdu I. Andersson Nature (London) 1998 394 805 809
315. M. D. Lloyd H.-J. Lee K. Harlos Z.-H. Zhang J. E. Baldwin C. J. Schofield J. M. Charnock C. D. Garner T. Hara A. C. Terwisscha Van Scheltinga K. Valegård J. A. C. Viklund J. Hajdu I. Andersson A. Danielsson R. Bhikhabhai J. Mol. Biol. 1999 287 943 960
316. H. J. Lee M. D. Lloyde I. J. Clifton J. E. Baldwin C. J. Schofield J. Mol. Biol. 2001 308 937 948
317. H.-J. Lee M. D. Lloyd I. J. Clifton K. Harlos A. Dubus J. Baldwin E., J.-M. Frere C. J. Schofield J. Biol. Chem. 2001 276 18290 18295
318. K. Valegård A. C. Terwisscha van Scheltinga A. Dubus G. Ranghino L. M. Öster J. Hajdu I. Andersson Nat. Struct. Mol. Biol. 2004 11 95 101
319. L. M. Öster A. C. Terwisscha van Scheltinga K. Valegård A. M. Hose A. Dubus J. Hajdu I. Andersson J. Mol. Biol. 2004 343 157 171
320. H. Tarhonskaya A. Szöllössi I. K. H. Leung J. T. Bush L. Henry R. Chowdhury A. Iqbal T. D. W. Claridge C. J. Schofield E. Flashman Biochemistry 2014 53 2483 2493
321. M. D. Lloyd S. J. Lipscomb K. S. Hewitson C. M. H. Hensgens J. E. Baldwin C. J. Schofield J. Biol. Chem. 2004 297 1540 1546
322. X. Xiao S. Wolfe A. L. Demain Biochem. J. 1991 280 471 474
323. R. M. Phelan C. A. Townsend J. Am. Chem. Soc. 2013 135 7496 7502
324. I. J. Clifton L. X. Doan M. C. Sleeman M. Topf H. Suzuki R. C. Wilmouth C. J. Schofield J. Biol. Chem. 2003 278 20843 20850
325. W.-c Chang Y. Guo C. Wang S. E. Butch A. C. Rosenzweig A. K. Boal C. Krebs J. M. Bollinger, Jr. Science 2014 343 1140 1144
326. Z. You S. Omura H. Ikeda D. E. Cane J. Am. Chem. Soc. 2006 126 6566 6567
327. Z. You S. Omura H. Ikeda D. E. Cane G. Jogl J. Biol. Chem. 2007 282 36552 36560
328. M.-J. Seo D. Zhu S. Endo H. Ikeda D. E. Cane Biochemistry 2011 50 1739 1754
329. Y. Ono A. Minami M. Noike Y. Higuchi T. Toyoumasu T. Sassa N. Kato T. Diari J. Am. Chem. Soc. 2011 133 2548 2555
330. M. Daum H.-J. Schnell S. Herrman A. Günther R. Murillo R. Müller P. Bisel M. Müller A. Bechthold ChemBioChem 2010 11 1383 1391
331. C. Dürr H.-J. Schnell A. Luzhetskyy R. Murillo M. Weber K. Wetzel A. Vente A. Bechthold Chem. Biol. 2006 13 365 377
332. F. H. Vaillancourt J. Yin C. T. Walsh Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005 102 10111 10116
333. F. H. Vaillancourt D. A. Vosburg C. T. Walsh ChemBioChem 2006 7 748 752
334. M. L. Matthews W.-c. Chang A. P. Layne L. A. Miles C. Krebs J. M. Bollinger, Jr. Nat. Chem. Biol. 2014 10 299 315
335. L. C. Blasiak F. H. Vaillancourt C. T. Walsh C. L. Drennan Nature 2006 440 368 371
336. M. M. Matthews C. Krest E. W. Barr F. Vaillancourt C. T. Walsh M. Green C. Krebs J. M. Bollinger, Jr. Biochemistry 2009 48 4331 4343
337. M. L. Matthews C. S. Neumann L. A. Miles T. L. Grove S. J. Booker C. Krebs C. T. Walsh J. M. Bollinger, Jr. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009 106 17723 17728
338. M. R. Fullone A. Paiardini R. Miele S. Marsango D. C. Gross S. Omura E. Ros-Herrera M. C. Bonaccorsi di Patt A. Laganà S. Pacarella I. Grgurina FEBS J. 2012 279 4269 4282
339. D. P. Galonić E. W. Barr C. T. Walsh J. M. Bollinger, Jr. C. Krebs Nat. Chem. Biol. 2007 3 113 116
340. D. G. Fujimori E. W. Barr M. L. Matthews G. M. Koch J. R. Yonce C. T. Walsh J. M. Bollinger, Jr. C. Krebs P. J. Riggs-Gelasco J. Am. Chem. Soc. 2007 129 13408 13409
341. C. Wong D. G. Fujimori C. T. Walsh C. L. Drennan J. Am. Chem. Soc. 2009 131 4872 4879
342. D. P. Galonić F. H. Vaillancourt C. T. Walsh J. Am. Chem. Soc. 2006 128 3900 3901
343. F. H. Vaillancourt E. Yeh D. A. Vosburg S. E. O'Conner C. T. Walsh Nature 2005 436 1191 1194
344. C. S. Neumann C. T. Walsh J. Am. Chem. Soc. 2008 130 14022 14023
345. L. Gu B. Wang A. Kulkarni T. W. Geders R. V. Grindberg L. Gerwick K. Håkansson P. Wipf J. L. Smith W. H. Gerwick D. H. Sherman Nature 2009 459 731 735
346. D. Khare B. Wang L. Gu J. Razelun D. H. Sherman W. H. Gerwick K. Håkansson J. L. Smith Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010 107 14099 14104
347. W. Jiang J. R. Heemstra, Jr. R. R. Forseth C. S. Neumann S. Manaviazar F. C. Schroeder K. J. Hale C. T. Walsh Biochemistry 2011 50 6063 6072
348. S. M. Pratter J. Ivkovic R. Birner-Gruenberger R. Breinbauer K. Zangger G. D. Straganz ChemBioChem 2014 15 567 574
349. S. M. Pratter K. M. Light E. I. Solomon G. D. Straganz Biochemistry 2014 136 9385 9395
350. U. Galm E. Wendt-Pienkowski L. Wang X.-X. Huang C. Unsin M. Tao J. M. Coughlin B. Shen J. Nat. Prod. 2011 74 526 536
351. A. S. Eustáquio J. E. Janso A. S. Ratnayake C. J. O'Donnell F. E. Koehn Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014 111 E3376 E3385
352. M. Tao L. Wang E. Wendt-Pienkowski N. Zhang D. Yang U. Galm J. M. Coughlin Z. Xu B. Shen Mol. Biosyst. 2010 6 349 356
353. J.-A. Seo R. H. Proctor R. D. Plattner Fungal Genet. Biol. 2001 34 155 165
354. Y. Ding R. S. Bojja L. Du Appl. Environ. Microbiol. 2004 70 1931 1934
355. N. Steffan A. Grundmann S. Afiyatullov H. Ruan S.-M. Li Org. Biomol. Chem. 2009 7 4082 4087
356. R. Mazmouz F. Chapuis-Hugon V. Pichon A. Méjean O. Ploux ChemBioChem 2011 12 858 862
357. K. H. Almabruk S. Asamizu A. Chang S. G. Varghese T. Mahmud ChemBioChem 2012 13 2209 2211
358. P. L. Roach I. J. Clifton V. Fülöp K. Harlos G. J. Barton J. Hajdu K. Andersson C. J. Schofield J. E. Baldwin Nature (London) 1995 375 700 704
359. P. L. Roach I. J. Clifton C. M. H. Hensgens N. Shibata C. J. Schofield J. Hajdu J. E. Baldwin Nature (London) 1997 387 827 830
360. N. I. Burzlaff P. J. Rutledge I. J. Clifton C. M. H. Hensgens M. Pickford R. M. Adlington P. L. Roach J. E. Baldwin Nature 1999 401 721 724
361. P. John Physiol. Plant. 1997 100 583 592
362. D. R. Dilley Z. Wang D. K. Dadirjan-Kalbach F. Ververidis R. Beaudry K. Padmanabhan AoB Plants 2013 5 plt031
363. A. M. Rocklin D. L. Tierney V. Kofman N. M. W. Brunhuber B. M. Hoffman R. E. Christoffersen N. O. Reich J. D. Lipscomb L. Que, Jr. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999 96 7905 7090
364. D. L. Tierney A. M. Rocklin J. D. Lipscomb L. Que, Jr. B. Hoffman J. Am. Chem. Soc. 2005 127 7005 7013
365. A. M. Rocklin K. Kato H.-w. Liu L. Que, Jr. J. D. Lipscomb J. Biol. Inorg. Chem. 2004 9 171 182
366. J. Zhou A. M. Rocklin J. D. Lipscomb L. Que, Jr. E. I. Solomon J. Am. Chem. Soc. 2002 124 4602 4609
367. J. N. Barlow Z. Zhang P. John J. E. Baldwin C. J. Schofield Biochemistry 1997 36 3563 3569
368. Z. Zhang J. N. Barlow J. E. Baldwin C. J. Schofield Biochemistry 1997 36 15999 16007
369. Z. Zhang J.-S. Ren I. J. Clifton C. J. Schofield Chem. Biol. 2004 11 1383 1394
370. L. Brisson N. El Bakkali-Taheri M. Giorgi A. Fadel J. Kaizer M. Réglier T. Tron E. H. Ajandouz A. J. Simaan J. Biol. Inorg. Chem. 2012 17 939 949
371. P. He G. R. Moran Curr. Opin. Chem. Biol. 2009 13 443 450
372. D. D. Shah J. A. Conrad G. R. Moran Biochemistry 2013 52 6097 6107
373. M. Gunsior J. Ravel G. L. Challis C. A. Townsend Biochemistry 2004 43 663 674
374. K. Johnson-Winters V. M. Purpero M. Kavana G. R. Moran Biochemistry 2005 44 7189 7199
375. P. He J. A. Conrad G. R. Moran Biochemistry 2010 49 1998 2007
376. J. Brownlee P. He G. R. Moran D. H. T. Harrison Biochemistry 2008 47 20002 22013
377. L. Serre A. Sailland D. Sy P. Boudec A. Rolland E. Pebay-Peyroula C. Cohen-Addad Structure 1999 7 977 988
378. J. Pan M. Bharwaj J. R. Faulkner P. Nagabhyru N. D. Charlton R. M. Higashi A.-F. Miller C. A. Young R. B. Grossman C. L. Schardl Phytochemistry 2014 98 60 68
379. J. S. Scotti I. K. H. Leung M. A. Bentley J. Paps H. B. Kramer J. Lee W. Aik H. Choi S. M. Paulsen L. A. H. Bowman N. D. Loik S. Horita C.-h. Ho N. J. Kershaw C. M. Tang T. D. W. Claridge G. M. Preston M. A. McDonough C. J. Schofield Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014 111 13331 13336
380. B.-I. Shimizu Front. Plant Sci. 2014 5 549
381. M. L. Hillig X. Liu Nature Chem. Biol. 2014 10 921 923