Development of second generation epigenetic agents

MedChemComm

Volumn 3, Issue 2, 2012, Pages 135-161

  Jones, Philip ^a  

^a UNIVERSITY OF TEXAS MD ANDERSON CANCER CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CLASS I HISTONE DEACETYLASE INHIBITOR; CLASS II HISTONE DEACETYLASE INHIBITOR; CLASS III HISTONE DEACETYLASE INHIBITOR; CUDC 101; ENZYME INHIBITOR; ERLOTINIB; HISTONE ACETYLTRANSFERASE; HISTONE ACETYLTRANSFERASE INHIBITOR; HISTONE DEACETYLASE; HISTONE DEACETYLASE 1 INHIBITOR; HISTONE DEACETYLASE 2 INHIBITOR; HISTONE DEACETYLASE 3 INHIBITOR; HISTONE DEACETYLASE 4 INHIBITOR; HISTONE DEACETYLASE 6 INHIBITOR; HISTONE DEACETYLASE 8 INHIBITOR; HISTONE DEACETYLASE INHIBITOR; HISTONE DEMETHYLASE INHIBITOR; HISTONE LYSINE METHYLTRANSFERASE; HISTONE LYSINE METHYLTRANSFERASE INHIBITOR; HISTONE METHYLTRANSFERASE; HISTONE METHYLTRANSFERASE INHIBITOR; ISOTHIAZOLONE DERIVATIVE; JMJ DEMETHYLASE INHIBITOR; LYSINE SPECIFIC DEMETHYLASE 1 INHIBITOR; PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASE; PROTEIN ARGININE METHYLTRANSFERASE INHIBITOR; ROMIDEPSIN; SB 939; UNCLASSIFIED DRUG; UNINDEXED DRUG; VORINOSTAT;

ADENOMA; ANTINEOPLASTIC ACTIVITY; ANTIPROLIFERATIVE ACTIVITY; APOPTOSIS; CANCER INHIBITION; CHROMATIN; COLON CANCER; COMPETITIVE INHIBITION; COVALENT HISTONE MODIFICATION; DEACETYLATION; DEGENERATIVE DISEASE; DNA METHYLATION; DNA PACKAGING; DRUG BINDING SITE; DRUG DISTRIBUTION; DRUG POTENCY; DRUG SCREENING; DRUG SELECTIVITY; DRUG STRUCTURE; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME INHIBITION; EPIGENETICS; GENE EXPRESSION; HETEROCHROMATIN; HIGH THROUGHPUT SCREENING; HISTONE ACETYLATION; HISTONE METHYLATION; HISTONE MODIFICATION; HUMAN; LEUKEMIA; NONHUMAN; NUCLEOSOME; PARKINSON DISEASE; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN PROCESSING; REVIEW; STRUCTURE ACTIVITY RELATION; TRANSCRIPTION REGULATION;

EID: 84857292701     PISSN: 20402503     EISSN: 20402511     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1md00199j     Document Type: Review

References (204)

1. K. Luger A. W. Mader R. K. Richmond D. F. Sargent T. J. Richmond Nature 1997 389 251 260
2. R. D. Kornberg Y. Lorch Cell 1999 98 285 294
3. C. A. Davey D. F. Sargent K. Luger A. W. Maeder T. J. Richmond J. Mol. Biol. 2002 319 1097 1113
4. P. A. Jones S. B. Baylin Cell 2007 128 683 692
5. T. Kouzarides Cell 2007 128 693 705
6. M. Esteller Nat. Rev. Genet. 2007 8 286 298
7. Y. Zhang D. Reinberg Genes Dev. 2001 15 2343 2360
8. S. L. Berger T. Kouzarides R. Shiekhattar A. Shilatifard Genes Dev. 2009 23 781 783
9. C. B. Wilson E. Rowell M. Sekimata Nat. Rev. Immunol. 2009 9 91 105
10. N. Tsankova W. Renthal A. Kumar E. J. Nestler Nat. Rev. Neurosci. 2007 8 355 367
11. G. G. Wang C. D. Allis P. Chi Trends Mol. Med. 2007 13 363 372
12. A. Portela M. Esteller Nat. Biotechnol. 2010 28 1057 1068
13. S. Khorasanizadeh Cell 2004 116 259 272
14. M. S. Cosgrove J. D. Boeke C. Wolberger Nat. Struct. Mol. Biol. 2004 11 1037 1043
15. A. J. Bannister T. Kouzarides Cell Res. 2011 21 381 395
16. M. M. Suzuki A. Bird Nat. Rev. Genet. 2008 9 465 476
17. M. Tahiliani K. P. Koh Y. Shen W. A. Pastor H. Bandukwala Y. Brudno S. Agarwal L. M. Iyer D. R. Liu L. Aravind A. Rao Science 2009 324 930 935
18. K. A. Gelato W. Fischle Biol. Chem. 2008 389 353 363
19. B. D. Strahl C. D. Allis Nature 2000 403 41 45
20. T. Jenuwein C. D. Allis Science 2001 293 1074 1080
21. B. M. Turner Cell 2002 111 285 291
22. P. Chi C. D. Allis G. G. Wang Nat. Rev. Cancer 2010 10 457 469
23. B. Li M. Carey J. L. Workman Cell 2007 128 707 719
24. S. D Taverna H. Li A. J. Ruthenburg C. D. Allis D. J. Patel Nat. Struct. Mol. Biol. 2007 14 1025 1040
25. C. Martin Y. Zhang Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2005 6 838 849
26. C. D. Allis S. L. Berger J. Cote S. Dent T. Jenuwien T. Kouzarides L. Pillus D. Reinberg Y. Shi R. Shiekhattar A. Shilatifard J. Workman Y. Zhang Cell 2007 131 633 636
27. A. J. M. de Ruijter A. H. van Gennip H. N. Caron S. Kemp A. B. P. van Kuilenburg Biochem. J. 2003 370 737 749
28. S. Michan D. Sinclair Biochem. J. 2007 404 1 13
29. P. A. Marks T. Miller V. M. Richon Curr. Opin. Pharmacol. 2003 3 344 351
30. W. S. Xu R. B. Parmigiani P. A. Marks Oncogene 2007 26 5541 5552
31. M. Paris M. Porcelloni M. Binaschi D. Fattori J. Med. Chem. 2008 51 1505 1529
32. J. E. Bolden M. J. Peart R. W. Johnstone Nat. Rev. Drug Discovery 2006 5 769 784
33. C. A. Blum J. L. Ellis C. Loh P. Y. Ng R. B. Perni R. L. Stein J. Med. Chem. 2011 54 417 432
34. L. Guarente N. Engl. J. Med. 2011 364 2235 2244
35. Y. Cen Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2010 1804 1635 1644
36. J. Schemies U. Uciechowska W. Sippl M. Jung Med. Res. Rev. 2010 30 861 889
37. P. A. Konstantinopoulos M. V. Karamouzis A. G. Papavassiliou Expert Opin. Invest. Drugs 2007 16 569 571
38. P. Jones C. Steinkühler Curr. Pharm. Des. 2008 14 545 561
39. C. M. Marson Anti-Cancer Agents Med. Chem. 2009 9 661 692
40. P. Jones, in Epigenetic Targets in Drug Discovery, Methods and Principles in Medicinal Chemistry, ed., W. Sippl, and, M. Jung, Wiley-VCH, Weinheim, 2009, vol. 42, ch. 9, pp. 185-223
41. A. J. Tervo S. Kyrylenko P. Niskanen A. Salminen J. Leppaenen T. H. Nyronen T. Jarvinen A. Poso J. Med. Chem. 2004 47 6292 6298
42. http://clinicaltrials.gov/ct2/results?term=histone+deacetylase
43. X. Cai H.-X. Zhai J. Wang J. Forrester H. Qu L. Yin C.-J. Lai R. Bao C. Qian J. Med. Chem. 2010 53 2000 2009
44. J. Arts P. King A. Marien W. Floren A. Belien L. Janssen I. Pilatte B. Roux L. Decrane R. Gilissen I. Hickson V. Vreys E. Cox K. Bol W. Talloen I. Goris L. Andries M. Du Gardin M. Janicot M. Page K. von Emelson P. Angibaud Clin. Cancer Res. 2009 15 6841 6851
45. D. Moffat S. Patel F. Day A. Belfield A. Donald M. Rowlands J. Wibawa D. Brotherton L. Stimson V. Clark J. Owen L. Bawden G. Box E. Bone P. Mortenson A. Hardcastle S. van Meurs S. Eccles F. Raynaud W. Aherne J. Med. Chem. 2010 53 8663 8678
46. V. Novotny-Diermayr K. Sangthongpitag C. Yong Hu X. Wu N. Sausgruber P. Yeo G. Greicius S. Pettersson A. L. Liang Y. K. Loh Z. Bonday K. C. Goh H. Hentze S. Hart H. Wang K. Ethirajulu J. M. Wood Mol. Cancer Ther. 2010 9 642 652
47. J. E. Bradner N. West M. L. Grachan E. F. Greenberg S. J. Haggarty T. Warnow R. Mazitschek Nat. Chem. Biol. 2010 6 238 243
48. S. Balasubramanian E. Verner J. J. Buggy Cancer Lett. 2009 280 211 221
49. Y. Itoh T. Suzuki N. Miyata Curr. Pharm. Des. 2008 14 529 544
50. M. M. Kemp Q. Wang J. H. Fuller N. West N. M. Martinez E. M. Morse M. Weiwer S. L. Schreiber J. E. Bradner A. N. Koehler Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011 21 4164 4169
51. O. Kinzel L. Llauger-Bufi G. Pescatore M. Rowley C. Schultz-Fademrecht E. Monteagudo M. Fonsi O. Gonzalez Paz F. Fiore C. Steinkuhler P. Jones J. Med. Chem. 2009 52 3453 3456
52. C. A. Hassig K. T. Symons X. Guo P.-M. Nguyen T. Annable P. L. Wash J. E. Payne D. A. Jenkins C. Bonnefous C. Trotter Y. Wang J. V. Anzola E. L. Milkova T. Z. Hoffman S. J. Dozier B. M. Wiley A. Saven J. W. Malecha R. L. Davis J. Muhammad A. K. Shiau S. A. Noble T. S. Rao N. D. Smith J. H. Hager Mol. Cancer Ther. 2008 7 1054 1065
53. O. M. Moradei T. C. Mallais S. Frechette I. Paquin P. E. Tessier S. M. Leit M. Fournel C. Bonfils M.-C. Trachy-Bourget J. Liu T. P. Yan A.-H. Lu J. Rahil J. Wang S. Lefebvre Z. Li A. F. Vaisburg J. M. Besterman J. Med. Chem. 2007 50 5543 5546
54. D. J. Witter P. Harrington K. J. Wilson M. Chenard J. C. Fleming B. Haines A. M. Kral J. P. Secrist T. A. Miller Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 726 731
55. J. L. Methot P. K. Chakravarty M. Chenard J. Close J. C. Cruz W. K. Dahlberg J. Fleming C. L. Hamblett J. E. Hamill P. Harrington A. Harsch R. Heidebrecht B. Hughes J. Jung C. M. Kenific A. M. Kral P. T. Meinke R. E. Middleton N. Ozerova D. L. Sloman M. G. Stanton A. A. Szewczak S. Tyagarajan D. J. Witter J. P. Secrist T. A. Miller Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 973 978
56. J. L. Methot C. L. Hamblett D. M. Mampreian J. Jung A. Harsch A. A. Szewczak W. K. Dahlberg R. E. Middleton B. Hughes J. C. Fleming H. Wang A. M. Kral N. Ozerova J. C. Cruz B. Haines M. Chenard C. M. Kenific J. P. Secrist T. A. Miller Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 6104 6109
57. J. C. Bressi A. J. Jennings R. Skene Y. Wu R. Melkus R. De Jong S. O'Connell C. E. Grimshaw M. Navre A. R. Gangloff Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010 20 3142 3145
58. Y. Chen R. He Y. Chen M. A. D'Annibale B. Langley A. P. Kozikowski ChemMedChem 2009 4 842 852
59. J. M. Ontoria S. Altamura A. Di Marco F. Ferrigno R. Laufer E. Muraglia M. C. Palumbi M. Rowley R. Scarpelli C. Schultz-Fademrecht S. Serafini C. Steinkuhler P. Jones J. Med. Chem. 2009 52 6782 6789
60. S. J. Haggarty K. M. Koeller J. C. Wong C. M. Grozinger S. L. Schreiber Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 4389 4394
61. K. V. Butler J. Kalin C. Brochier G. Vistoli B. Langley A. P. Kozikowski J. Am. Chem. Soc. 2010 132 10842 10846
62. D. V. Smil S. Manku Y. A. Chantigny S. Leit A. Wahhab T. P. Yan M. Fournel C. Maroun Z. Li A.-M. Lemieux A. Nicolescu J. Rahil S. Lefebvre A. Panetta J. M. Besterman R. Déziel Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 19 688 692
63. L. Auzzas A. Larsson R. Matera A. Baraldi B. Deschenes-Simard G. Giannini W. Cabri G. Battistuzzi G. Gallo A. Ciacci L. Vesci C. Pisano S. Hanessian J. Med. Chem. 2010 53 8387 8399
64. S. Balasubramanian J. Ramos W. Luo M. Sirisawad E. Verner J. J. Buggy Leukemia 2008 22 1026 1034
65. L. Whitehead M. R. Dobler B. Radetich Y. Zhu P. W. Atadja T. Claiborne J. E. Grob A. McRiner M. R. Pancost A. Patnaik W. Shao M. Shultz R. Tichkule R. A. Tommasi B. Vash P. Wang T. Stams Bioorg. Med. Chem. 2011 19 4626 4634
66. W. Tang T. Luo E. F. Greenberg J. E. Bradner S. L. Schreiber Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011 21 2601 2605
67. S. Lain J. J. Hollick J. Campbell O. D. Staples M. Higgins M. Aoubala A. McCarthy V. Appleyard K. E. Murray L. Baker A. Thompson J. Mathers S. J. Holland M. J. R. Stark G. Pass J. Woods D. P. Lane N. J. Westwood Cancer Cell 2008 13 454 463
68. T. F. Outeiro E. Kontopoulos S. M. Altmann I. Kufareva K. E. Strathearn A. M. Amore C. B. Volk M. M. Maxwell J.-C. Rochet P. J. McLean A. B. Young R. Abagyan M. B. Feany B. T. Hyman A. G. Kazantsev Science 2007 317 516 519
69. R. Luthi-Carter D. M. Taylor J. Pallos E. Lambert A. Amore A. Parker H. Moffitt D. L. Smith H. Runne O. Gokce A. Kuhn Z. Xiang M. M. Maxwell S. A. Reeves G. P. Bates C. Neri L. M. Thompson J. L. Marsh A. G. Kazantsev Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 7927 7932
70. D. M. Taylor U. Balabadra Z. Xiang B. Woodman S. Meade A. Amore M. M. Maxwell S. Reeves G. P. Bates R. Luthi-Carter A. S. L. Philip A. G. Kazantsev ACS Chem. Biol. 2011 6 540 546
71. T. Suzuki T. Asaba E. Imai H. Tsumoto H. Nakagawa N. Miyata Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 19 5670 5672
72. B. M. Hirsch C. A. Gallo Z. Du Z. Wang W. Zheng Med. Chem. Commun. 2010 1 233 238
73. C. M. Grozinger E. D. Chao H. E. Blackwell D. Moazed S. L. Schreiber J. Biol. Chem. 2001 276 38837 38843
74. H. Ota E. Tokunaga K. Chang M. Hikasa K. Iijima M. Eto K. Kozaki M. Akishita Y. Ouchi M. Kaneki Oncogene 2006 25 176 185
75. A. Mai S. Massa S. Lavu R. Pezzi S. Simeoni R. Ragno F. R. Mariotti F. Chiani G. Camilloni D. A. Sinclair J. Med. Chem. 2005 48 7789 7795
76. E. Lara A. Mai V. Calvanese L. Altucci P. Lopez-Nieva M. L. Martinez-Chantar M. Varela-Rey D. Rotili A. Nebbioso S. Ropero G. Montoya J. Oyarzabal S. Velasco M. Serrano M. Witt A. Villar-Garea A. Inhof J. M. Mato M. Esteller M. F. Fraga Oncogene 2008 28 781 791
77. A. Bedalov T. Gatbonton W. P. Irvine D. E. Gottschling J. A. Simon Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 15113 15118
78. M. Hirao J. Posakony M. Nelson H. Hruby M. Jung J. A. Simon A. Bedalov J. Biol. Chem. 2003 278 52773 52782
79. J. Posakony M. Hirao S. Stevens J. A. Simon A. Bedalov J. Med. Chem. 2004 47 2635 2644
80. R. C. Neugebauer U. Uchiechowska R. Meier H. Hruby V. Valkov E. Verdin W. Sippl M. Jung J. Med. Chem. 2008 51 1203 1213
81. B. Heltweg T. Gatbonton A. D. Schuler J. Posakony H. Li S. Goehle R. Kollipara R. A. DePinho Y. Gu J. A. Simon A. Bedalov Cancer Res. 2006 66 4368 4377
82. U. Uciechowska J. Schemies R. C. Neugebauer E.-M. Huda M. L. Schmitt R. Meier E. Verdin M. Jung W. Sippl ChemMedChem 2008 3 1965 1976
83. F. Medda R. J. M. Russell M. Higgins A. R. McCarthy J. Campbell A. M. Z. Slawin D. P. Lane S. Lain N. J. J. Westwood J. Med. Chem. 2009 52 2673 2682
84. V. M. Nayagam X. Wang Y. C. Tan A. Poulsen K. C. Goh T. Ng H. Wang H. Y. Song B. Ni M. Entzeroth W. Stünkel J. Biomol. Screening 2006 11 959 967
85. A. D. Napper J. Hixon T. McDonagh K. Keavey J.-F. Pons J. Barker W. T. Yau P. Amouzegh A. Flegg E. Hamelin R. J. Thomas M. Kates S. Jones M. A. Navia J. O. Saunders P. S. DiStefano R. Curtis J. Med. Chem. 2005 48 8045 8054
86. T. Suzuki K. Imai H. Nakagawa N. Miyata ChemMedChem 2006 1 1059 1062
87. J. Trapp A. Jochum R. Meier L. Saunders B. Marshall C. Kunick E. Verdin P. Goekjian W. Sippl M. Jung J. Med. Chem. 2006 49 7307 7316
88. A. J. Tervo T. Suuronen S. Kyrylenko E. Kuusisto P. H. Kiviranta A. Salminen J. Leppaenen A. Poso J. Med. Chem. 2006 49 7239 7241
89. P. H. Kiviranta J. Leppänen V. M. Rinne T. Suuronen O. Kyrylenko S. Kyrylenko E. Kuusisto A. J. Tervo T. Järvinen A. Salminen A. Poso E. A. A. Wallén Bioorg Bioorg. Med. Chem. Lett. 2007 17 2448 2451
90. P. H. Kiviranta J. Leppänen S. Kyrylenko H. S. Salo M. Lahtela-Kakkonen A. J. Tervo C. Wittekindt T. Suuronen E. Kuusisto T. Järvinen A. Salminen A. Poso E. A. A. Wallén J. Med. Chem. 2006 49 7907 7911
91. T. Huhtiniemi T. Suuronen V. M. Rinne C. Wittekindt M. Lahtela-Kakkonen E. Jarho E. A. A. Wallen A. Salminen A. Poso J. Leppanen J. Med. Chem. 2008 51 4377 4380
92. B. D. Sanders B. Jackson M. Brent A. M. Taylor W. Dang S. L. Berger S. L. Schreiber K. Howitz R. Marmorstein Bioorg. Med. Chem. 2009 17 7031 7041
93. M. Gutierrez E. H. Andrianasolo W. K. Shin D. E. Goeger A. Yokochi J. Schemies M. Jung D. France S. Cornell-Kennon E. Lee G. H. William J. Org. Chem. 2009 74 5267 5275
94. C. Gey S. Kyrylenko L. Hennig L.-H.D. Nguyen A. Büttner H. D. Pham A. Giannis Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 5219 5222
95. W. K. Oh K. B Cho T. T. Hien T. H. Kim H. S. Kim T. T. Dao H. K. Han S.-M. Kwon S.-G. Ahn J.-H. Yoon T. H. Kim Y. G. Kim K. W. Kang Mol. Pharmacol. 2010 78 855 864
96. M. von Wantoch Rekowski A. Giannis Biochim. Biophys. Acta, Gene Regul. Mech. 2010 1799 760 767
97. M. R. Parthun Oncogene 2007 26 5319 5328
98. S. C. Hodawadekar R. Marmorstein Oncogene 2007 26 5528 5540
99. X.-J. Yang E. Seto Oncogene 2007 26 5310 5318
100. F. J. Dekker H. J. Haisma Drug Discovery Today 2009 14 942 948
101. O. D. Lau T. K. Kundu R. E. Soccio S. Ait-Si-Ali E. M. Khalil A. Vassilev A. P. Wolffe Y. Nakatani P. A. Cole Mol. Cell 2000 5 589 595
102. V. Sagar W. Zheng P. R. Thompson P. A. Cole Bioorg. Med. Chem. 2004 12 3383 3390
103. F. H. A. Kwie M. Briet D. Soupaya P. Hoffmann M. Maturano F. Rodriguez C. Blonski C. Lherbet C. Baudoin-Dehoux Chem. Biol. Drug Des. 2011 77 86 92
104. P. R. Thompson H. Kurooka Y. Nakatani P. A. Cole J. Biol. Chem. 2001 276 33721 33729
105. O. D. Lau A. D. Courtney A. Vassilev L. A. Marzilli R. J. Cotter Y. Nakatani P. A. Cole J. Biol. Chem. 2000 275 21953 21959
106. X. Liu L. Wang K. Zhao P. R. Thompson Y. Hwang R. Marmorstein P. A. Cole Nature 2008 451 846 850
107. Y. Zheng K. Balasubramanyam M. Cebrat D. Buck F. Guidez A. Zelent R. M. Alani P. A. Cole J. Am. Chem. Soc. 2005 127 17182 17183
108. F. Guidez L. Howell M. Isalan M. Cebrat R. M. Alani S. Ivins I. Hormaeche M. J. McConnell S. Pierce P. A. Cole J. Licht A. Zelent Mol. Cell. Biol. 2005 25 5552 5566
109. P. A. Cole Nat. Chem. Biol. 2008 4 590 597
110. J. Wu N. Xie Z. Wu Y. Zhang Y. G. Zheng Bioorg. Med. Chem. 2009 17 1381 1386
111. L. Stimson M. G. Rowlands Y. M. Newbatt N. F. Smith F. I. Raynaud P. Rogers V. Bavetsias S. Gorsuch M. Jarman A. Bannister T. Kouzarides E. McDonald P. Workman G. W. Aherne Mol. Cancer Ther. 2005 4 1521 1532
112. S. Gorsuch V. Bavetsias M. G. Rowlands G. W. Aherne P. Workman M. Jarman E. McDonald Bioorg. Med. Chem. 2009 17 467 474
113. S. D. Furdas S. Shekfeh E.-M. Bissinger J. M. Wagner S. Schlimme V. Valkov M. Hendzel M. Jung W. Sippl Bioorg. Med. Chem. 2011 19 3678 3689
114. F. J. Dekker M. Ghizzoni N. van der Meer R. Wisastra H. J. Rosalina Bioorg. Med. Chem. 2009 17 460 466
115. K. Balasubramanyam R. A. Varier M. Altaf V. Swaminathan N. B. Siddappa U. Ranga T. K. Kundu J. Biol. Chem. 2004 279 51163 51171
116. K. Balasubramanyam M. Altaf R. A. Varier V. Swaminathan A. Ravindran P. P. Sadhale T. K. Kundu J. Biol. Chem. 2004 279 33716 33726
117. K. Mantelingu B. A. Ashok Reddy V. Swaminathan A. H. Kishore N. B. Siddappa G. V. P. Kumar G. Nagashankar N. Natesh S. Roy P. P. Sadhale U. Ranga C. Narayana T. K. Kundu Chem. Biol. 2007 14 6 645 657
118. K. Balasubramanyam V. Swaminathan A. Ranganathan T. K. Kundu J. Biol. Chem. 2003 278 19134 19140
119. J. A. Souto M. Conte R. Alvarez A. Nebbioso V. Carafa L. Altucci A. R. de Lera ChemMedChem 2008 3 1435 1442
120. R. Costi R. Di Santo M. Artico G. Miele P. Valentini E. Novellino A. Cereseto J. Med. Chem. 2007 50 1973 1977
121. A. Mai D. Cheng M. T. Bedford S. Valente A. Nebbioso A. Perrone G. Brosch G. Sbardella F. De Bellis M. Miceli L. Altucci J. Med. Chem. 2008 51 2279 2290
122. K. C. Ravindra B. R. Selvi M. Arif B. A. A. Reddy G. R. Thanuja S. Agrawal S. K. Pradhan N. Nagashayana D. Dasgupta T. K. Kundu J. Biol. Chem. 2009 284 24453 24464
123. G. Sbardella S. Castellano C. Vicidomini D. Rotili A. Nebbioso M. Miceli L. Altucci A. Mai Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 2788 2792
124. E. D. Eliseeva V. Valkov M. Jung M. O. Jung Mol. Cancer Ther. 2007 6 2391 2398
125. M. Biel A. Kretsovali E. Karatzali J. Papamatheakis A. Giannis Angew. Chem., Int. Ed. 2004 43 3974 3976
126. A. Mai D. Rotili D. Tarantino P. Ornaghi F. Tosi C. Vicidomini G. Sbardella A. Nebbioso M. Miceli L. Altucci P. Filetici J. Med. Chem. 2006 49 6897 6907
127. A. Mai D. Rotili D. Tarantino A. Nebbioso S. Castellano G. Sbardella M. Tini L. Altucci Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 19 1132 1135
128. J. Wu J. Wang M. Li Y. Yang B. Wang Y. G. Zheng Bioorg. Chem. 2011 39 53 58
129. E. M. Bowers G. Yan C. Mukherjee A. Orry L. Wang M. A. Holbert N. T. Crump C. A. Hazzalin G. Liszczak H. Yuan C. Larocca S. A. Saldanha R. Abagyan Y. Sun D. J. Meyers R. Marmorstein L. C. Mahadevan R. M. Alani P. A. Cole Chem. Biol. 2010 17 471 482
130. F. Chimenti B. Bizzarri E. Maccioni D. Secci A. Bolasco P. Chimenti R. Fioravanti A. Granese S. Carradori F. Tosi Federica P. Ballario S. Vernarecci P. Filetici J. Med. Chem. 2009 52 530 536
131. R. A. Copeland M. E. Solomon V. M. Richon Nat. Rev. Drug Discovery 2009 8 724 732
132. M. Albert K. Helin Semin. Cell Dev. Biol. 2010 21 209 220
133. E.-M. Bissinger R. Heinke W. Sippl M. Jung Med. Chem. Commun. 2010 1 114 124
134. V. Campagna-Slater M. Wai Mok K. T. Nguyen M. Feher R. Najmanovich M. Schapira J. Chem. Inf. Model. 2011 51 612 623
135. V. M. Richon D. Johnston C. J. Sneeringer L. Jin C. R. Majer K. Elliston L. F. Jerva M. Porter Scott R. A. Copeland Chem. Biol. Drug Des. 2011 78 199 210
136. X. Zhang Z. Yang S. I. Khan J. R. Horton H. Tamaru E. U. Selker X. Cheng Mol. Cell 2003 12 177 185
137. M. Vedel F. Lawrence M. Robert-Gero E. Lederer Biochem. Biophys. Res. Commun. 1978 85 371 376
138. R. I. Glazer K. D. Hartman M. C. Knode M. M. Richard P. K. Chiang C. K. H. Tseng V. E. Marquez Biochem. Biophys. Res. Commun. 1986 135 688 694
139. J. Tan X. Yang L. Zhuang X. Jiang W. Chen P. L. Lee R. K. M. Karuturi P. B. O. Tan E. T. Liu Q. Yu Genes Dev. 2007 21 1050 1063
140. T. B. Miranda C. C. Cortez C. B. Yoo G. Liang M. Abe T. K. Kelly V. E. Marquez P. A. Jones Mol. Cancer Ther. 2009 8 1579 1588
141. P. K. Chiang Pharmacol. Ther. 1998 77 115 134
142. S. Mori K. Iwase N. Iwanami Y. Tanaka H. Kagechika T. Hirano Bioorg. Med. Chem. 2010 18 8158 8166
143. D. Greiner T. Bonaldi R. Eskeland E. Roemer A. Imhof Nat. Chem. Biol. 2005 1 143 145
144. C. R. Isham J. D. Tibodeau W. Jin R. Xu M. M. Timm K. C. Bible Blood 2007 109 2579 2588
145. E. Iwasa Y. Hamashima S. Fujishiro E. Higuchi A. Ito M. Yoshida M. Sodeoka J. Am. Chem. Soc. 2010 132 4078 4079
146. M. Cory D. W. Henry D. L. Taylor K. J. Koskela Chem.-Biol. Interact. 1974 9 253 9
147. S. Kubicek R. J. O'Sullivan E. M. August E. R. Hickey Q. Zhang M. L. Teodoro S. Rea K. Mechtler J. A. Kowalski C. A. Homon T. A. Kelly T. Jenuwein Mol. Cell 2007 25 473 481
148. F. Liu X. Chen A. Allali-Hassani A. M. Quinn T. J. Wigle G. A. Wasney A. Dong G. Senisterra I. Chau A. Siarheyeva J. L. Norris D. B. Kireev A. Jadhav J. M. Herold W. P. Janzen C. H. Arrowsmith S. V. Frye P. J. Brown A. Simeonov M. Vedadi J. Jin J. Med. Chem. 2010 53 5844 5857
149. F. Liu X. Chen A. Allali-Hassani A. M. Quinn G. A. Wasney A. Dong D. Barsyte I. Kozieradzki G. Senisterra I. Chau A. Siarheyeva D. B. Kireev A. Jadhav J. M. Herold S. V. Frye C. H. Arrowsmith P. J. Brown A. Simeonov M. Vedadi J. Jin J. Med. Chem. 2009 52 7950 7953
150. Y. Chang X. Zhang J. R. Horton A. K. Upadhyay A. Spannhoff J. Liu J. P. Snyder M. T. Bedford X. Cheng Nat. Struct. Mol. Biol. 2009 16 312 317
151. Y. Chang T. Ganesh J. R. Horton A. Spannhoff J. Liu A. Sun X. Zhang M. T. Bedford Y. Shinkai J. P. Snyder X. Cheng J. Mol. Biol. 2010 400 1 7
152. M. Vedadi D. Barsyte-Lovejoy F. Liu S. Rival-Gervier A. Allali-Hassani V. Labrie T. J. Wigle P. A. DiMaggio G. A. Wasney A. Siarheyeva A. Dong W. Tempel S.-C. Wang X. Chen I. Chau T. J Mangano X. Huang C. D Simpson S. G Pattenden J. L Norris D. B. Kireev A. Tripathy A. Edwards B. L Roth W. P. Janzen B. A. Garcia A. Petronis J. Ellis P. J. Brown S. V. Frye C. H. Arrowsmith J. Jin Nat. Chem. Biol. 2011 7 566 574
153. S. R. Daigle E. J. Olhava C. A. Therkelsen C. R. Majer C. J. Sneeringer J. Song L. D. Johnston M. Porter Scott J. J. Smith Y. Xiao L. Jin K. W. Kuntz R. Chesworth M. P. Moyer K. M. Bernt J.-C. Tseng A. L. Kung S. A. Armstrong R. A. Copeland V. M. Richon R. M. Pollock Cancer Cell 2011 20 53 65
154. T. M. Lakowski P. Hart C. A. Ahern N. I. Martin A. Frankel ACS Chem. Biol. 2010 5 1053 1063
155. D. Cheng N. Yadav R. W. King M. S. Swanson E. J. Weinstein M. T. Bedford J. Biol. Chem. 2004 279 23892 23899
156. R. Ragno S. Simeoni S. Castellano C. Vicidomini A. Mai A. Caroli A. Tramontano C. Bonaccini P. Trojer I. Bauer G. Brosch G. Sbardella J. Med. Chem. 2007 50 1241 1253
157. Y. Feng M. Mingyong B. Wang Y. G. Zheng J. Med. Chem. 2010 53 6028 6039
158. S. Castellano C. Milite R. Ragno S. Simeoni A. Mai V. Limongelli E. Novellino I. Bauer G. Brosch A. Spannhoff D. Cheng M. T. Bedford G. Sbardella ChemMedChem 2010 5 398 414
159. B. R. Selvi K. Batta A. H. Kishore K. Mantelingu R. A. Varier K. Balasubramanyam S. K. Pradhan D. Dasgupta S. Sriram S. Agrawal T. K. Kundu J. Biol. Chem. 2009 285 7143 7152
160. A. Mai S. Valente D. Cheng A. Perrone R. Ragno S. Simeoni G. Sbardella G. Brosch A. Nebbioso M. Conte L. Altucci M. T. Bedford ChemMedChem 2007 2 987 991
161. D. Cheng S. Valente S. Castellano G. Sbardella R. Di Santo R. Costi M. T. Bedford A. Mai J. Med. Chem. 2011 54 4928 4932
162. A. V. Purandare Z. Chen T. Huynh S. Pang J. Geng W. Vaccaro M. A. Poss J. O'Connell K. Nowak L. Jayaraman Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008 18 4438 4441
163. M. Allan S. Manku E. Therrien N. Nguyen S. Styhler M.-F. Robert A.-C. Goulet A. J. Petschner G. Rahil A. R. MacLeod R. Deziel J. M. Besterman H. Nguyen A. Wahhab Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 19 1218 1223
164. T. Huynh Z. Chen S. Pang J. Geng T. Bandiera S. Bindi P. Vianello F. Roletto S. Thieffine A. Galvani W. Vaccaro M. A. Poss G. L. Trainor M. V. Lorenzi M. Gottardis L. Jayaraman A. V. Purandare Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 19 2924 2927
165. E. Therrien G. Larouche S. Manku M. Allan N. Nguyen S. Styhler M.-F. Robert A.-C. Goulet J. M. Besterman H. Nguyen A. Wahhab Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 19 6725 6732
166. H. Wan T. Huynh S. Pang J. Geng W. Vaccaro M. A. Poss G. L. Trainor M. V. Lorenzi M. Gottardis L. Jayaraman A. V. Purandare Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 19 5063 5066
167. J. S. Sack S. Thieffine T. Bandiera M. Fasolini G. J. Duke L. Jayaraman K. F. Kish H. E. Klei A. V. Purandare P. Rosettani S. Troiani D. Xie J. A. Dianlin Biochem. J. 2011 436 331 339
168. A. Spannhoff R. Heinke I. Bauer P. Trojer E. Metzger R. Gust R. Schuele G. Brosch W. Sippl M. Jung J. Med. Chem. 2007 50 2319 2325
169. A. Spannhoff R. Machmur R. Heinke P. Trojer I. Bauer G. Brosch R. Schuele W. Hanefeld W. Sippl M. Jung Bioorg. Med. Chem. Lett. 2007 17 4150 4153
170. R. Heinke A. Spannhoff R. Meier P. Trojer I. Bauer M. Jung W. Sippl ChemMedChem 2009 4 69 77
171. E.-M. Bissinger R. Heinke A. Spannhoff A. Eberlin E. Metzger V. Cura P. Hassenboehler J. Cavarelli R. Schuele M. T. Bedford W. Sippl M. Jung Bioorg. Med. Chem. 2011 19 3717 3731
172. M. Pedersen K. Helin Trends Cell Biol. 2010 20 662 671
173. B. Lohse J. L. Kristensen L. H. Kristensen K. Agger K. Helin M. Gajhede R. P. Clausen Bioorg. Med. Chem. 2011 19 3625 3636
174. A. Spannhoff A.-T. Hauser R. Heinke W. Sippl M. Jung ChemMedChem 2009 4 1568 1582
175. H. Hou H. Yu Curr. Opin. Struct. Biol. 2010 20 739 748
176. B. C. Smith J. M. Denu Biochim. Biophys. Acta, Gene Regul. Mech. 2009 1789 45 57
177. M. Gyu Lee C. Wynder D. M. Schmidt D. G. McCafferty R. Shiekhattar Chem. Biol. 2006 13 6 563 567
178. D. M. Z. Schmidt D. G. McCafferty Biochemistry 2007 46 4408 4416
179. M. Yang J. C. Culhane L. M. Szewczuk P. Jalili H. L. Ball M. Machius P. A. Cole H. Yu Biochemistry 2007 46 8058 8065
180. S. Mimasu T. Sengoku S. Fukuzawa T. Umehara S. Yokoyama Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008 366 15 22
181. C. Binda S. Valente M. Romanenghi S. Pilotto R. Cirilli A. Karytinos G. Ciossani O. A. Botrugno F. Forneris M. Tardugno D. E. Edmondson S. Minucci A. Mattevi A. Mai J. Am. Chem. Soc. 2010 132 6827 6833
182. R. Ueda T. Suzuki K. Mino H. Tsumoto H. Nakagawa M. Hasegawa R. Sasaki T. Mizukami N. Miyata J. Am. Chem. Soc. 2009 131 17536 17537
183. H. Benelkebir C. Hodgkinson P. J. Duriez A. L. Hayden R. A. Bulleid S. J. Crabb G. Packham A. Ganesan Bioorg. Med. Chem. 2011 19 3709 3716
184. S. Mimasu N. Umezawa S. Sato T. Higuchi T. Umehara S. Yokoyama Biochemistry 2010 49 6494 6503
185. E. Metzger M. Wissmann N. Yin J. M. Müller R. Schneider A. H. F. M. Peters T. Günther R. Buettner R. Schüle Nature 2005 437 436 439
186. J. C. Culhane D. Wang P. M. Yen P. A. Cole J. Am. Chem. Soc. 2010 132 3164 3176
187. L. M. Szewczuk J. C. Culhane M. Yang A. Majumdar H. Yu P. A. Cole Biochemistry 2007 46 6892 6902
188. M. Yang J. C. Culhane L. M. Szewczuk C. B. Gocke C. A. Brautigam D. R. Tomchick M. Machius P. A. Cole H. Yu Nat. Struct. Mol. Biol. 2007 14 535 539
189. Y. Huang E. Greene T. M. Stewart A. C. Goodwin S. B. Baylin P. M. Woster R. A. Casero, Jr Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 8023 8028
190. S. K. Sharma Y. Wu N. Steinbergs M. L. Crowley A. S. Hanson R. A. Casero Jr P. M. Woster J. Med. Chem. 2010 53 5197 5212
191. Y. Huang T. M. Stewart Y. Wu S. B. Baylin L. J. Marton B. Perkins R. J. Jones P. M. Woster R. A. Casero, Jr Clin. Cancer Res. 2009 15 7217 7228
192. P. A. C. Cloos J. Christensen K. Agger A. Maiolica J. Rappsilber T. Antal K. H. Hansen K. Helin Nature 2006 442 307 311
193. Z. Chen J. Zang J. Kappler X. Hong F. Crawford Q. Wang F. Lan C. Jiang J. Whetstine S. Dai K. Hansen Y. Shi G. Zhang Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 10818 10823
194. N. R. Rose S. S. Ng J. Mecinovic B. M. R. Lienard S. H. Bello Z. Sun M. A. McDonough U. Oppermann C. J. Schofield J. Med. Chem. 2008 51 7053 7056
195. S. S. Ng K. L. Kavanagh M. A. McDonough D. Butler E. S. Pilka B. M. R. Lienard J. E. Bray P. Savitsky O. Gileadi F. von Delft N. R. Rose J. Offer J. C. Scheinost T. Borowski M. Sundstrom C. J. Schofield U. Oppermann Nature 2007 448 87 91
196. N. R. Rose E. C. Y. Woon G. L. Kingham O. N. F. King J. Mecinovic I. J. Clifton S. S. Ng J. Talib-Hardy U. Oppermann M. A. McDonough C. J. Schofield J. Med. Chem. 2010 53 1810 1818
197. S. Hamada T.-D. Kim T. Suzuki Y. Itoh H. Tsumoto H. Nakagawa R. Janknecht N. Miyata Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009 19 2852 2855
198. S. Hamada T. Suzuki K. Mino K. Koseki F. Oehme I. Flamme H. Ozasa Y. Itoh D. Ogasawara H. Komaarashi A. Kato H. Tsumoto H. Nakagawa M. Hasegawa R. Sasaki T. Mizukami N. Miyata J. Med. Chem. 2010 53 5629 5638
199. K.-H. Chang O. N. F. King A. Tumber E. C. Y. Woon T. D. Heightman M. A. McDonough C. J. Schofield N. R. Rose ChemMedChem 2011 6 759 764
200. M. Sakurai N. R. Rose L. Schultz A. M. Quinn A. Jadhav S. S. Ng U. Oppermann C. J. Schofield A. Simeonov Mol. BioSyst. 2010 6 357 364
201. O. N. F. King X. S. Li M. Sakurai A. Kawamura N. R. Rose S. S. Ng A. M. Quinn G. Rai B. T. Mott P. Beswick R. J. Klose U. Oppermann A. Jadhav T. D. Heightman D. J. Maloney C. J. Schofield A. Simeonov PLoS One 2010 5 e15535
202. D. Rotili M. Altun A. Kawamura A. Wolf R. Fischer I. K. H. Leung M. M. MacKeen Y. Tian P. J. Ratcliffe A. Mai B. M. Kessler Chem. Biol. 2011 18 642 654
203. X. Luo Y. Liu S. Kubicek J. Myllyharju A. Tumber S. Ng K. H. Che J. Podoll T. D. Heightman U. Oppermann S. L. Schreiber X. Wang J. Am. Chem. Soc. 2011 133 9451 9456
204. R. Sekirnik N. R. Rose A. Thalhammer P. T. Seden J. Mecinović C. J. Schofield Chem. Commun. 2009 6376 6378