Fast time scale dynamics of protein backbones: NMR relaxation methods, applications, and functional consequences

Chemical Reviews

Volumn 106, Issue 5, 2006, Pages 1624-1671

  Jarymowycz, Virginia A ^a   Stone, Martin J ^a  

^a INDIANA UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHEMICAL RELAXATION; MOLECULAR DYNAMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE;

NUCLEAR MAGNETIC RELAXATION; PROTEIN BACKBONE; TIME SCALE DYNAMICS;

PROTEINS;

ENZYME; LIGAND; PROTEIN;

CHEMICAL MODEL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ENZYME ACTIVE SITE; KINETICS; METHODOLOGY; MUTATION; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; REVIEW; THERMODYNAMICS;

CATALYTIC DOMAIN; ENZYMES; KINETICS; LIGANDS; MODELS, CHEMICAL; MODELS, MOLECULAR; MUTATION; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; PROTEINS; THERMODYNAMICS;

EID: 33646911358     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr040421p     Document Type: Review

References (497)

1. Palmer, A. G. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2001, 30, 129-155.
2. Palmer, A. G., III Curr. Opin. Biotechnol. 1993, 4, 385-391.
3. Peng, J. W.; Wagner, G. Methods Enzymol. 1994, 239, 563-596.
4. Dayie, K. T.; Wagner, G.; Lefevre, J. F. Annu. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 243-282.
5. Daragan, V. A.; Mayo, K. H. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 1997, 31, 63-105.
6. Palmer, A. G. Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 732-737.
7. Fischer, M. W. F.; Majumdar, A.; Zuiderweg, E. R. P. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 1998, 33, 207-272.
8. Kay, L. E. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 513-517.
9. Kay, L. E. Biochem. Cell Biol. 1998, 76, 145-152.
10. Ishima, R.; Torchia, D. A. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 740-743.
11. Spyracopoulos, L.; Sykes, B. D. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 555-559.
12. Stone, M. J. Acc. Chem. Res. 2001, 34, 379-388.
13. Kern, D.; Zuiderweg, E. R. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 748-757.
14. Palmer, A. G., III. Chem. Rev. 2004, 104, 3623-3640.
15. Fischer, E. Ber. Dtsch. Chem. Ges. 1894, 27, 2985-2993.
16. Lemieux, R. U.; Spohr, U. Adv. Carbohydr. Chem. Biochem. 1994, 50, 1-20.
17. Creighton, T. E. Proteins: Structures and Molecular Properties; W. H. Freeman: New York, 1993; pp 139-169.
18. Fersht, A. Structure and Mechanism in Protein Science; W. H. Freeman: New York, 1999; pp 324-348.
19. Luque, I.; Freire, E. Methods Enzymol. 1998, 295, 100-127.
20. Freire, E. Methods Mol. Biol. 2001, 168, 37-68.
21. Williams, D. H.; Cox, J. P. L.; Doig, A. J.; Gardner, M.; Gerhard, U.; Kaye, P. T.; Lal, A. R.; Nicholls, I. A.; Salter, C. J.; Mitchell, R. C. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 7020-7030.
22. Searle, M. S.; Williams, D. H. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10690-10697.
23. Forman-Kay, J. D. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 1086-1087.
24. Creighton, T. E. Proteins: Structures and Molecular Properties; W. H. Freeman: New York, 1993; p 291.
25. Fersht, A. Structure and Mechanism in Protein Science; W. H. Freeman: New York, 1999; p 509.
26. Shortle, D.; Ackerman, M. S. Science 2001, 293, 487-489.
27. Shi, Z.; Olson, C. A.; Rose, G. D.; Baldwin, R. L.; Kallenbach, N. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 9190-9195.
28. Fitzkee, N. C.; Rose, G. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 12497-12502.
29. Kohn, J. E.; Millen, I. S.; Jacob, J.; Zagrovic, B.; Dillon, T. M.; Cingel, N.; Dothager, R. S.; Seifert, S.; Thiyagarajan, P.; Sosnick, T. R.; Hasan, M. Z.; Pande, V. S.; Ruczinski, I.; Doniach, S.; Plaxco, K. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 12491-12496.
30. Karush, F. J. Am. Chem. Soc. 1950, 72, 2705-2713.
31. Koshland, D. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1950, 44, 98-104.
32. van Holde, K. E.; Johnson, W. C.; Ho, P. S. Principles of Physical Biochemistry; Prentice Hall: Englewood Cliffs, NJ, 1998; pp 613-621.
33. Cooper, A.; Dryden, D. T. Eur. Biophys. J. 1984, 11, 103-109.
34. Bruice, T. C.; Benkovic, S. J. Biochemistry 2000, 39, 6267-6274.
35. Wand, A. J. Science 2001, 293, U1.
36. Wand, A. J. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 926-931.
37. Bruice, T. C. Acc. Chem. Res. 2002, 35, 139-148.
38. Knapp, M. J.; Klinman, J. P. Eur. J. Biochem. 2002, 269, 3113-3121.
39. Kohen, A.; Klinman, J. P. Chem. Biol. 1999, 6, R191-R198.
40. Kohen, A.; Cannio, R.; Bartolucci, S.; Klinman, J. P. Nature 1999, 399, 496-499.
41. Kohen, A.; Jonsson, T.; Klinman, J. P. Biochemistry 1997, 36, 2603-2611.
42. Antoniou, D.; Schwartz, S. D. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 5553-5558.
43. Knapp, M. J.; Rickert, K.; Klinman, J. P. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 3865-3874.
44. Balabin, I. A.; Onuchic, J. N. Science 2000, 290, 114-117.
45. Lipari, G.; Szabo, A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4546-4559.
46. Lipari, G.; Szabo, A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4559-4570.
47. Kay, L. E.; Torchia, D. A.; Bax, A. Biochemistry 1989, 28, 8972-8979.
48. Cavanagh, J.; Fairbrother, W. J.; Palmer, A. G., III; Skelton, N. J. Protein NMR Spectroscopy Principles and Practice; Academic Press: San Diego, CA, 1996.
49. Peng, J. W.; Wagner, G. J. Magn. Reson. 1992, 98, 308-332.
50. Peng, J. W.; Wagner, G. Biochemistry 1992, 31, 8571-8586.
51. Farrow, N. A.; Zhang, O.; Forman-Kay, J. D.; Kay, L. E. Biochemistry 1995, 34, 868-878.
52. Farrow, N. A.; Zhang, O.; Szabo, A.; Torchia, D. A.; Kay, L. E. J. Biomol. NMR 1995, 6, 153-162.
53. Ishima, R.; Nagayama, K. J. Magn. Reson. Ser. B 1995, 108, 73-76.
54. Lefevre, J. F.; Dayie, K. T.; Peng, J. W.; Wagner, G. Biochemistry 1996, 35, 2674-2686.
55. Peng, J. W.; Wagner, G. Biochemistry 1995, 34, 16733-16752.
56. Vis, H.; Vorgias, C. E.; Wilson, K. S.; Kaptein, R.; Boelens, R. J. Biomol. NMR 1998, 11, 265-277.
57. Tugarinov, V.; Liang, Z.; Shapiro, Y. E.; Freed, J. H.; Meirovitch, E. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3055-3063.
58. Jin, D.; Andrec, M.; Montelione, G. T.; Levy, R. M. J. Biomol. NMR 1998, 12, 471-492.
59. Lee, A. L.; Wand, A. J. J. Biomol. NMR 1999, 13, 101-112.
60. Clore, G. M.; Driscoll, P. C.; Wingfield, P. T.; Gronenborn, A. M. Biochemistry 1990, 29, 7387-7401.
61. Clore, G. M.; Szabo, A.; Bax, A.; Kay, L. E.; Driscoll, P. C.; Gronenborn, A. M. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 4989-4991.
62. Mandel, A. M.; Akke, M.; Palmer, A. G., III. J. Mol. Biol. 1995, 246, 144-163.
63. Stone, M. J.; Fairbrother, W. J.; Palmer, A. G., III; Reizer, J.; Saier, M. H., Jr.; Wright, P. E. Biochemistry 1992, 31, 4394-4406.
64. Barbato, G.; Ikura, M.; Kay, L. E.; Pastor, R. W.; Bax, A. Biochemistry 1992, 31, 5269-5278.
65. Kloiber, K.; Weiskirchen, R.; Krautler, B.; Bister, K.; Konrat, R. J. Mol. Biol. 1999, 292, 893-908.
66. Eliezer, D.; Chung, J.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Biochemistry 2000, 39, 2894-2901.
67. Farrow, N. A.; Muhandiram, R.; Singer, A. U.; Pascal, S. M.; Kay, C. M.; Gish, G.; Shoelson, S. E.; Pawson, T.; Forman-Kay, J. D.; Kay, L. E. Biochemistry 1994, 33, 5984-6003.
68. Kay, L. E. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1995, 63, 277-299.
69. Tjandra, N.; Szabo, A.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6986-6991.
70. Kroenke, C. D.; Loria, J. P.; Lee, L. K.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7905-7915.
71. Viles, J. H.; Duggan, B. M.; Zaborowski, E.; Schwarzinger, S.; Huntley, J. J.; Kroon, G. J.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. J. Biomol. NMR 2001. 21, 1-9.
72. Seewald, M. J.; Pichumani, K.; Stowell, C.; Tibbals, B. V.; Regan, L.; Stone, M. J. Protein Sci. 2000, 9, 1177-1193.
73. Tjandra, N.; Feller, S. E.; Pastor, R. W.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 12562-12566.
74. Palmer, A. G.; Rance, M.; Wright, P. E. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4371-4380.
75. Palmer, A. G.; Kroenke, C. D.; Loria, J. P. Methods Enzymol. 2001, 339, 204-238.
76. Akke, M. Curr. Opin. Struct. Biol. 2002, 12, 642-647.
77. Wang, C. Y.; Palmer, A. G. Magn. Reson. Chem. 2003, 41, 866-876.
78. Schurr, J. M.; Babcock, H. P.; Fujimoto, B. S. J. Magn. Reson. Ser. B 1994, 105, 211-224.
79. Lee, L. K.; Rance, M.; Chazin, W. J.; Palmer, A. G. J. Biomol. NMR 1997, 9, 287-298.
80. Blackledge, M.; Cordier, F.; Dosset, P.; Marion, D. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4538-4539.
81. Bruschweiler, R.; Liao, X. B.; Wright, P. E. Science 1995, 268, 886-889.
82. Fushman, D.; Xu, R.; Cowburn, D. Biochemistry 1999, 38, 10225-10230.
83. Dosset, P.; Hus, J. C.; Blackledge, M.; Marion, D. J. Biomol. NMR 2000, 16, 23-28.
84. Walker, O.; Varadan, R.; Fushman, D. J. Magn. Reson. 2004, 168, 336-345.
85. Fushman, D.; Varadan, R.; Assfalg, M.; Walker, O. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spec. 2004, 44, 189-214.
86. Osborne, M. J.; Wright, P. E. J. Biomol. NMR 2001, 19, 209-230.
87. d'Auvergne, E. J.; Gooley, P. R. J. Biomol. NMR 2003, 25, 25-39.
88. Jin, D. Q.; Figueirido, F.; Montelione, G. T.; Levy, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 6923-6924.
89. Andrec, M.; Montelione, G. T.; Levy, R. M. J. Magn. Reson. 1999, 139, 408-421.
90. Case, D. A. Acc. Chem. Res. 2002, 35, 325-331.
91. Akke, M.; Bruschweiler, R.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9832-9833.
92. Li, Z.; Raychaudhuri, S.; Wand, A. J. Protein Sci. 1996, 5, 2647-2650.
93. Yang, D.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1996, 263, 369-382.
94. Cavanagh, J.; Akke, M. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 11-13.
95. Wang, T.; Cai S.; Zuiderweg, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8639-8643.
96. Creighton, T. E. Proteins: Structures and Molecular Properties; W. H. Freeman: New York, 1993; pp 296-303.
97. Spolar, R. S.; Record, M. T. Science 1994, 263, 777-784.
98. Gomez, J.; Hilser, V. J.; Xie, D.; Freire, E. Proteins 1995, 22, 404-412.
99. Privalov, P. L.; Makhatadze, G. I. J. Mol. Biol. 1990, 213, 385-391.
100. Yang, D.; Mok, Y. K.; Forman-Kay, J. D.; Farrow, N. A.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 1997, 272, 790-804.
101. Evenas, J.; Forsen, S.; Malmendal, A.; Akke, M. J. Mol. Biol. 1999, 289, 603-617.
102. Mandel, A. M.; Akke, M.; Palmer, A. G., III. Biochemistry 1996, 35, 16009-16023.
103. Vugmeyster, L.; Trott, O.; McKnight, C. J.; Raleigh, D. P.; Palmer, A. G., III. J. Mol. Biol. 2002, 320, 841-854.
104. Massi, F.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11158-11159.
105. Zhang, W. X.; Smithgall, T. E.; Gmeiner, W. H. Biochemistry 1998, 37, 7119-7126.
106. Lu, J.; Lin, C. L.; Tang, C.; Ponder, J. W.; Kao, J. L.; Cistola, D. P.; Li, E. J. Mol. Biol. 2000, 300, 619-632.
107. Gizachew, D.; Oswald, R. E. Biochemistry 2001, 40, 14368-14375.
108. Mercier, P.; Spyracopoulos, L.; Sykes, B. D. Biochemistry 2001, 40, 10063-10077.
109. Franzoni, L.; Lucke, C.; Perez, C.; Cavazzini, D.; Rademacher, M.; Ludwig, C.; Spisni, A.; Rossi, G. L.; Ruterjans, H. J. Biol. Chem. 2002, 277, 21983-21997.
110. Ramboarina, S.; Srividya, N.; Atkinson, R. A.; Morellet, N.; Roques, B. P.; Lefevre, J. F.; Mely, Y.; Kieffer, B. J. Mol. Biol. 2002, 316, 611-627.
111. Kovrigin, E. L.; Cole, R.; Loria, J. P. Biochemistry 2003, 42, 5279-5291.
112. Hodsdon, M. E.; Cistola, D. P. Biochemistry 1997, 36, 2278-2290.
113. Sasaki, M.; Ogata, K.; Hatanaka, H.; Nishimura, Y. J. Biochem. (Tokyo) 2000, 127, 945-953.
114. Rischel, C.; Madsen, J. C.; Andersen, K. V.; Poulsen, F. M. Biochemistry 1994, 33, 13997-14002.
115. Fushman, D.; Weisemann, R.; Thuring, H.; Ruterjans, H. J. Biomol. NMR 1994, 4, 61-78.
116. Cheng, J. W.; Lepre, C. A.; Moore, J. M. Biochemistry 1994, 33, 4093-4100.
117. Olejniczak, E. T.; Zhou, M. M.; Fesik, S. W. Biochemistry 1997, 36, 4118-4124.
118. Loh, A. P.; Guo, W.; Nicholson, L. K.; Oswald, R. E. Biochemistry 1999, 38, 12547-12557.
119. Yao, X.; Soden, C.; Summers, M. F.; Beckett, D. Protein Sci. 1999, 8, 307-317.
120. Huntley, J. J. A.; Scrofani, S. D. B.; Osborne, M. J.; Wright, P. E.; Dyson, H. J. Biochemistry 2000, 39, 13356-13364.
121. Chi, Y.; Kumar, T. K.; Chiu, I. M.; Yu, C. J. Biol. Chem. 2000, 275, 39444-39450.
122. Sahu, S. C.; Bhuyan, A. K.; Udgaonkar, J. B.; Hosur, R. V. J. Biomol. NMR 2000, 18, 107-118.
123. Stivers, J. T.; Abeygunawardana, C.; Mildvan, A. S. Biochemistry 1996, 35, 16036-16047.
124. Yuan, P.; Marshall, V. P.; Petzold, G. L.; Poorman, R. A.; Stockman, B. J. J. Biomol. NMR 1999, 15, 55-64.
125. Wang, C.; Pawley, N. H.; Nicholson, L. K. J. Mol. Biol. 2001, 313, 873-887.
126. Mine, S.; Tate, S.; Ueda, T.; Kainosho, M.; Imoto, T. J. Mol. Biol. 1999, 286, 1547-1565.
127. Mine, S.; Ueda, T.; Hashimoto, Y.; Imoto, T. Protein Sci. 2000, 9, 1669-1684.
128. Fayos, R.; Melacini, G.; Newlon, M. G.; Burns, L.; Scott, J. D.; Jennings, P. A. J. Biol. Chem. 2003, 278, 18581-18587.
129. Yu, L.; Zhu, C. X.; Tse-Dinh, Y. C.; Fesik, S. W. Biochemistry 1996, 35, 9661-9666.
130. Zidek, L.; Novotny, M. V.; Stone, M. J. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 1118-1121.
131. Zhu, L.; Hu, J.; Lin, D.; Whitson, R.; Itakura, K.; Chen, Y. Biochemistry 2001, 40, 9142-9150.
132. Yun, S. G.; Jang, D. S.; Kim, D. H.; Choi, K. Y.; Lee, H. C. Biochemistry 2001, 40, 3967-3973.
133. Henzl, M. T.; Wycoff, W. G.; Larson, J. D.; Likos, J. J. Protein Sci. 2002, 11, 158-173.
134. Arumugam, S.; Gao, G. H.; Patton, B. L.; Semenchenko, V.; Brew, K.; Van Doren, S. R. J. Mol. Biol. 2003, 327, 719-734.
135. Krizova, H.; Zidek, L.; Stone, M. J.; Novotny, M. V.; Sklenar, V. J. Biomol. NMR 2004, 28, 369-394.
136. Akke, M.; Skelton, N. J.; Kordel, J.; Palmer, A. G., III; Chazin, W. J. Biochemistry 1993, 32, 9832-9844.
137. Maler, L.; Blankenship, J.; Rance, M.; Chazin, W. J. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 245-250.
138. Spyracopoulos, L.; Gagne, S. M.; Li, M. X.; Sykes, B. D. Biochemistry 1998, 37, 18032-18044.
139. Mittermaier, A.; Varani, L.; Muhandiram, D. R.; Kay, L. E.; Varani, G. J. Mol. Biol. 1999, 294, 967-979.
140. Cave, J. W.; Kremer, W.; Wemmer, D. E. Protein Sci. 2000, 9, 2354-2365.
141. McIntosh, P. B.; Taylor, I. A.; Frenkiel, T. A.; Smerdon, S. J.; Lane, A. N. J. Biomol. NMR 2000, 16, 183-196.
142. Davis, J. H.; Agard, D. A. Biochemistry 1998, 37, 7696-7707.
143. de Lorimier, R.; Hellinga, H. W.; Spicer, L. D. Protein Sci. 1996, 5, 2552-2565.
144. Mittermaier, A.; Kay, L. E. Protein Sci. 2004, 13, 1088-1099.
145. Beeser, S. A.; Goldenberg, D. P.; Oas, T. G. J. Mol. Biol. 1997, 269, 154-164.
146. Hanson, W. M.; Beeser, S. A.; Oas, T. G.; Goldenberg, D. P. J. Mol. Biol. 2003, 333, 425-441.
147. Stone, M. J.; Gupta, S.; Snyder, N.; Regan, L. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 185-186.
148. Mayer, K. L.; Earley, M. R.; Gupta, S.; Pichumani, K.; Regan, L.; Stone, M. J. Nat. Struct. Biol. 2003, 10, 962-965.
149. Kranz, J. K.; Hall, K. B. J. Mol. Biol. 1999, 285, 215-231.
150. Showalter, S. A.; Hall, K. B. J. Mol. Biol. 2004, 335, 465-480.
151. Cai, M. L.; Gong, Y. X.; Wen, L.; Krishnamoorthi, R. Biochemistry 2002, 41, 9572-9579.
152. Adams, P. D.; Loh, A. P.; Oswald, R. E. Biochemistry 2004, 43, 9968-9977.
153. Spyracopoulos, L.; Lavigne, P.; Crump, M. P.; Gagne, S. M.; Kay, C. M.; Sykes, B. D. Biochemistry 2001, 40, 12541-12551.
154. Pawley, N. H.; Koide, S.; Nicholson, L. K. J. Mol. Biol. 2002, 324, 991-1002.
155. Lee, A. L.; Sharp, K. A.; Kranz, J. K.; Song, X. J.; Wand, A. J. Biochemistry 2002, 41, 13814-13825.
156. Idiyatullin, D.; Nesmelova, I.; Daragan, V. A.; Mayo, K. H. J. Mol. Biol. 2003, 325, 149-162.
157. Sareth, S.; Li, H.; Yamada, H.; Woodward, G. K.; Akasaka, K. FEBS Lett. 2000, 470, 11-14.
158. Stone, M. J.; Chandrasekhar, K.; Holmgren, A.; Wright, P. E.; Dyson, H. J. Biochemistry 1993, 32, 426-435.
159. Hrovat, A.; Blumel, M.; Lohr, F.; Mayhew, S. G.; Ruterjans, H. J. Biomol. NMR 1997, 10, 53-62.
160. Kelley, J. J., III; Caputo, T. M.; Eaton, S. F.; Lane, T. M.; Bushweller, J. H. Biochemistry 1997, 36, 5029-5044.
161. Dangi, B.; Blankman, J. I.; Miller, C. J.; Volkman, B. F.; Guiles, R. D. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 8201-8208.
162. Sari, N.; Holden, M. J.; Mayhew, M. P.; Vilker, V. L.; Coxon, B. Biochemistry 1999, 38, 9862-9871.
163. Fetrow, J. S.; Baxter, S. M. Biochemistry 1999, 38, 4480-4492.
164. Bertini, I.; Bryant, D. A.; Ciurli, S.; Dikiy, A.; Fernandez, C. O.; Luchinat, C.; Safarov, N.; Vila, A. J.; Zhao, J. J. Biol. Chem. 2001, 276, 47217-47226.
165. Kasimova, M. R.; Kristensen, S. M.; Howe, P. W.; Christensen, T.; Matthiesen, F.; Petersen, J.; Sorensen, H. H.; Led, J. J. J. Mol. Biol. 2002, 318, 679-695.
166. Hu, H.; Clarkson, M. W.; Hermans, J.; Lee, A. L. Biochemistry 2003, 42, 13856-13868.
167. Ye, J. Q.; Mayer, K. L.; Stone, M. J. J. Biomol. NMR 1999, 15, 115-124.
168. Ye, J.; Mayer, K. L.; Mayer, M. R.; Stone, M. J. Biochemistry 2001, 40, 7820-7831.
169. Mayer, K. L.; Stone, M. J. Proteins 2003, 50, 184-191.
170. Kordel, J.; Skelton, N. J.; Akke, M.; Palmer, A. G., III; Chazin, W. J. Biochemistry 1992, 31, 4856-4866.
171. MacDougall, J. R.; Matrisian, L. M. Cancer Metastasis Rev. 1995, 14, 351-362.
172. Cawston, T. E. Pharmacol. Ther. 1996, 70, 163-182.
173. Mulder, F. A. A.; Hon, B.; Muhandiram, D. R.; Dahlquist, F. W.; Kay, L. E. Biochemistry 2000, 39, 12614-12622.
174. Goehlert, V. A.; Krupinska, E.; Regan, L.; Stone, M. J. Protein Sci. 2004, 13, 3322-3330.
175. Smith, C. K.; Withka, J. M.; Regan, L. Biochemistry 1994, 33, 5510-5517.
176. Lin, R.; Bagrodia, S.; Cerione, R.; Manor, D. Curr. Biol. 1997, 7, 794-797.
177. Li, H.; Yamada, H.; Akasaka, K. Biochemistry 1998, 37, 1167-1173.
178. Li, H.; Yamada, H.; Akasaka, K. Biophys. J. 1999, 77, 2801-2812.
179. Akasaka, K.; Li, H.; Yamada, H.; Li, R. H.; Thoresen, T.; Woodward, C. K. Protein Sci. 1999, 8, 1946-1953.
180. Osborne, M. J.; Schnell, J.; Benkovic, S. J.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Biochemistry 2001, 40, 9846-9859.
181. Radkiewicz, J. L.; Brooks, C. L. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 225-231.
182. Pan, H.; Lee, J. C.; Hilser, V. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 12020-12025.
183. Schnell, J. R.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2004, 33, 119-140.
184. Mace, J. E.; Wilk, B. J.; Agard, D. A. J. Mol. Biol. 1995, 251, 116-134.
185. Japelj, B.; Waltho, J. P.; Jerala, R. Proteins 2004, 54, 500-512.
186. Lockless, S. W.; Ranganathan, R. Science 1999, 286, 295-299.
187. Fuentes, E. J.; Der, C. J.; Lee, A. L. J. Mol. Biol. 2004, 335, 1105-1115.
188. Zeng, L.; Fischer, M. W. F.; Zuiderweg, E. R. P. J. Biomol. NMR 1996, 7, 157-162.
189. Fischer, M. W. F.; Zeng, L.; Pang, Y. X.; Hu, W. D.; Majumdar, A.; Zuiderweg, E. R. P. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 12629-12642.
190. Fischer, M. W.; Zeng, L.; Majumdar, A.; Zuiderweg, E. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 8016-8019.
191. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Annu. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 369-395.
192. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Methods Enzymol. 2001, 339, 258-270.
193. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Adv. Protein Chem. 2002, 62, 311-340.
194. Philippopoulos, M.; Lim, C. J. Mol. Biol. 1995, 254, 771-792.
195. Fushman, D.; Cahill, S.; Cowburn, D. J. Mol. Biol. 1997, 266, 173-194.
196. Chatfield, D. C.; Szabo, A.; Brooks, B. R. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5301-5311.
197. Horita, D. A.; Zhang, W. X.; Smithgall, T. E.; Gmeiner, W. H.; Byrd, R. A. Protein Sci. 2000, 9, 95-103.
198. Pfeiffer, S.; Fushman, D.; Cowburn, D. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3021-3036.
199. Philippopoulos, M.; Mandel, A. M.; Palmer, A. G., III; Lim, C. Proteins 1997, 28, 481-493.
200. Smith, L. J.; Mark, A. E.; Dobson, C. M.; Vangunsteren, W. F. Biochemistry 1995, 34, 10918-10931.
201. Stocker, U.; van Gunsteren, W. F. Proteins 2000, 40, 145-153.
202. Abragam, A. Principles of Nuclear Magnetism; Clarendon Press: Oxford, U.K., 1961.
203. Sklenar, V.; Torchia, D.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1987, 73, 375-379.
204. Wang, C.; Karpowich, N.; Hunt, J. F.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Mol. Biol. 2004, 342, 525-537.
205. Findlow, S. C.; Winsor, C.; Simpson, T. J.; Crosby, J.; Crump, M. P. Biochemistry 2003, 42, 8423-8433.
206. Hoshino, M., Hagihara, Y.; Nishii, L; Yamazaki, T.; Kato, H.; Goto, Y. J. Mol. Biol. 2000, 304, 927-939.
207. Lu, J.; Cistola, D. P.; Li, E. J. Mol. Biol. 2003, 330, 799-812.
208. Lu, J.; Lin, C. L.; Tang, C.; Ponder, J. W.; Kao, J. L.; Cistola, D. P.; Li, E. J. Mol. Biol. 1999, 286, 1179-1195.
209. Lucke, C.; Fushman, D.; Ludwig, C.; Hamilton, J. A.; Sacchettini, J. C.; Ruterjans, H. Mol. Cell. Biochem. 1999, 192, 109-121.
210. Gutierrez-Gonzalez, L. H.; Ludwig, C.; Hohoff, C.; Rademacher, M.; Hanhoff, T.; Ruterjans, H.; Spener, F.; Lucke, C. Biochem. J. 2002, 364, 725-737.
211. Constantine, K. L.; Friedrichs, M. S.; Wittekind, M.; Jamil, H.; Chu, C. H.; Parker, R. A.; Goldfarb, V.; Mueller, L.; Farmer, B. T. Biochemistry 1998, 37, 7965-7980.
212. Cheng, J. W.; Lepre, C. A.; Chambers, S. P.; Fulghum, J. R.; Thomson, J. A.; Moore, J. M. Biochemistry 1993, 32, 9000-9010.
213. Li, Q.; Khosla, C.; Puglisi, J. D.; Liu, C. W. Biochemistry 2003, 42, 4648-4657.
214. McFeeters, R. L.; Oswald, R. E. Biochemistry 2002, 41, 10472-10481.
215. Mispelter, J.; Lefevre, C.; Adjadj, E.; Quiniou, E.; Favaudon, V. J. Biomol. NMR 1995, 5, 233-244.
216. Izadi-Pruneyre, N.; Quiniou, E.; Blouquit, Y.; Perez, J.; Minard, P.; Desmadril, M.; Mispelter, J.; Adjadj, E. Protein Sci. 2001, 10, 2228-2240.
217. Peto, H.; Stott, K.; Sunde, M.; Broadhurst, R. W. J. Struct. Biol. 2004, 148, 214-225.
218. Crump, M. P.; Spyracopoulos, L.; Lavigne, P.; Kim, K. S.; Clark-Lewis, I.; Sykes, B. D. Protein Sci. 1999, 8, 2041-2054.
219. Mizoue, L. S.; Bazan, J. F.; Johnson, E. C.; Handel, T. M. Biochemistry 1999, 38, 1402-1414.
220. Fairbrother, W. J.; Liu, J.; Pisacane, P. I.; Sliwkowski, M. X.; Palmer, A. G. J. Mol. Biol. 1998, 279, 1149-1161.
221. Zink, T.; Ross, A.; Luers, K.; Cieslar, C.; Rudolph, R.; Holak, T. A. Biochemistry 1994, 33, 8453-8463.
222. Scian, M.; Marin, M.; Bellanda, M.; Tou, L.; Alexander, J. M.; Rosenblatt, M.; Chorev, M.; Peggion, E.; Mammi, S. Biopolymers 2005.
223. Chill, J. H.; Quadt, S. R.; Anglister, J. Biochemistry 2004, 43, 10127-10137.
224. Feng, Y.; Klein, B. K.; McWherter, C. A. J. Mol. Biol. 1996 259, 524-541.
225. Redfield, C.; Boyd, J.; Smith, L. J.; Smith, R. A.; Dobson, C. M. Biochemistry 1992, 31, 10431-10437.
226. Grasberger, B. L.; Gronerborn, A. M.; Clore, G. M. J. Mol. Biol. 1993, 230, 364-372.
227. Yao, S.; Smith, D. K.; Hinds, M. G.; Zhang, J. G.; Nicola, N. A.; Norton, R. S. Protein Sci. 2000, 9, 671-682.
228. Purvis, D. H.; Mabbutt, B. C. Biochemistry 1997, 36, 10146-10154.
229. Kim, S.; Jao, S.; Laurence, J. S.; Liwang, P. J. Biochemistry 2001, 40, 10782-10791.
230. Muhlhahn, P.; Bernhagen, J.; Czisch, M.; Georgescu, J.; Renner, C.; Ross, A.; Bucala, R.; Holak, T. A. Protein Sci. 1996, 5, 2095-2103.
231. Barthe, P.; Chiche, L.; Declerck, N.; Delsuc, M. A.; Lefevre, J. F.; Malliavin, T.; Mispelter, J.; Stern, M. H.; Lhoste, J. M.; Roumestand, C. J. Biomol. NMR 1999, 15, 271-288.
232. Stoll, R.; Renner, C.; Buettner, R.; Voelter, W.; Bosserhoff, A. K.; Holak, T. A. Protein Sci. 2003, 12, 510-519.
233. Rajarathnam, K.; Li, Y. L.; Rohrer, T.; Gentz, R. J. Biol. Chem. 2001, 276, 4909-4916.
234. Daragan, V. A.; Ilyina, E. E.; Fields, C. G.; Fields, G. B.; Mayo, K. H. Protein Sci. 1997, 6, 355-363.
235. Keeler, C.; Dannies, P. S.; Hodsdon, M. E. J. Mol. Biol. 2003, 328, 1105-1121.
236. Li, Y. C.; Montelione, G. T. Biochemistry 1995, 34, 2408-2423.
237. Deep, S.; Walker, K. P., III; Shu, Z.; Hinck, A. P. Biochemistry 2003, 42, 10126-10139.
238. Liwang, A. C.; Cao, J. J.; Zheng, H.; Lu, Z. H.; Peiper, S. C.; Liwang, P. J. Biochemistry 1999, 38, 442-453.
239. Wyss, D. F.; Dayie, K. T.; Wagner, G. Protein Sci. 1997, 6, 534-542.
240. Sorensen, M. D.; Bjorn, S.; Norris, K.; Olsen, O.; Petersen, L.; James, T. L.; Led, J. J. Biochemistry 1997, 36, 10439-10450.
241. Smallridge, R. S.; Whiteman, P.; Werner, J. M.; Campbell, I. D.; Handford, P. A.; Downing, A. K. J. Biol. Chem. 2003, 278, 12199-12206.
242. Yuan, X.; Werner, J. M.; Lack, J.; Knott, V.; Handford, P. A.; Campbell, I. D.; Downing, A. K. J. Mol. Biol. 2002, 316, 113-125.
243. Werner, J. M.; Knott, V.; Handford, P. A.; Campbell, I. D.; Downing, A. K. J. Mol. Biol. 2000, 296, 1065-1078.
244. Yuan, X.; Werner, J. M.; Knott, V.; Handford, P. A.; Campbell, I. D.; Downing, K. Protein Sci. 1998, 7, 2127-2135.
245. Fan F.; Mayo, K. H. J. Biol. Chem. 1995, 270, 24693-24701.
246. Phan, I. Q. H.; Boyd, J.; Campbell, I. D. J. Biomol. NMR 1996, 8, 369-378.
247. Carr, P. A.; Erickson, H. P.; Palmer, A. G., III. Structure 1997, 5, 949-959.
248. Thormann, T.; Soroka, V.; Nielbo, S.; Berezin, V.; Bock, E.; Poulsen, F. M. Biochemistry 2004, 43, 10364-10369.
249. Zajicek, J.; Chang, Y.; Castellino, F. J. J. Mol. Biol. 2000, 301, 333-347.
250. Marti, D. N.; Schaller, J.; Llinas, M. Biochemistry 1999, 38, 15741-15755.
251. Meekhof, A. E.; Freund, S. M. V. J. Mol. Biol. 1999, 286, 579-592.
252. Hansen, A. P.; Petros, A. M.; Meadows, R. P.; Fesik, S. W. Biochemistry 1994, 33, 15418-15424.
253. Constantine, K. L.; Friedrichs, M. S.; Goldfarb, V.; Jeffrey, P. D.; Sheriff, S.; Mueller, L. Proteins 1993, 15, 290-311.
254. Kroon, G. J.; Mo, H.; Martinez-Yamout, M. A.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Protein Sci. 2003, 12, 1386-1394.
255. O'Leary, J. M.; Bromek, K.; Black, G. M.; Uhrinova, S.; Schmitz, C.; Wang, X.; Krych, M.; Atkinson, J. P.; Uhrin, D.; Barlow, P. N. Protein Sci. 2004, 13, 1238-1250.
256. Renisio, J. G.; Perez, J.; Czisch, M.; Guenneugues, M.; Bornet, O.; Frenken, L.; Cambillau, C.; Darbon, H. Proteins 2002, 47, 546-555.
257. Wu, H.; Blackledge, M.; Maciejewski, M. W.; Mullen, G. P.; King, S. M. Biochemistry 2003, 42, 57-71.
258. Barchi, J. J., Jr.; Grasberger, B.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. Protein Sci. 1994, 3, 15-21.
259. Frank, M. K.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Protein Sci. 1995, 4, 2605-2615.
260. Tillett, M. L.; Blackledge, M. J.; Derrick, J. P.; Lian, L. Y.; Norwood, T. J. Protein Sci. 2000, 9, 1210-1216.
261. Idiyatullin, D.; Daragan, V. A.; Mayo, K. H. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 2602-2609.
262. Hall, J. B.; Fushman, D. J. Biomol. NMR 2003, 27, 261-275.
263. Johansson, M. U.; Nilsson, H.; Evenas, J.; Forsen, S.; Drakenberg, T.; Bjorck, L.; Wikstrom, M. J. Mol. Biol. 2002, 316, 1083-1099.
264. Wikstrom, M.; Forsen, S.; Drakenberg, T. Eur. J. Biochem. 1996, 235, 543-548.
265. Zdunek, J.; Martinez, G. V.; Schleucher, J.; Lycksell, P. O.; Yin, Y.; Nilsson, S.; Shen, Y.; Olivecrona, G.; Wijmenga, S. Biochemistry 2003, 42, 1872-1889.
266. Orekhov, V. Y.; Pervushin, K. V.; Korzhnev, D. M.; Arseniev, A. S. J. Biomol. NMR 1995, 6, 113-122.
267. Orekhov, V. Y.; Pervushin, K. V.; Arseniev, A. S. Eur. J. Biochem. 1994, 219, 887-896.
268. Orekhov, V. Y.; Korzhnev, D. M.; Diercks, T.; Kessler, H.; Arseniev, A. S. J. Biomol. NMR 1999, 14, 345-356.
269. Yushmanov, V. E.; Mandal, P. K.; Liu, Z.; Tang, P.; Xu, Y. Biochemistry 2003, 42, 3989-3995.
270. Yushmanov, V. E.; Xu, Y.; Tang, P. Biochemistry 2003, 42, 13058-13065.
271. Bader, R.; Bettio, A.; Beck-Sickinger, A. G.; Zerbe, O. J. Mol. Biol. 2001, 305, 307-329.
272. Bader, R.; Rytz, G.; Lerch, M.; Beck-Sickinger, A. G.; Zerbe, O. Biochemistry 2002, 41, 8031-8042.
273. Yan, C. H.; Digate, R. J.; Guiles, R. D. Biopolymers 1999, 49, 55-70.
274. Metcalfe, E. E.; Zamoon, J.; Thomas, D. D.; Veglia, G. Biophys. J. 2004, 87, 1205-1214.
275. Farrow, N. A.; Zhang, O.; Forman-Kay, J. D.; Kay, L. E. Biochemistry 1997, 36, 2390-2402.
276. Temiz, N. A.; Meirovitch, E.; Bahar, I. Proteins 2004, 57, 468-480.
277. Shapiro, Y. E.; Sinev, M. A.; Sineva, E. V.; Tugarinov, V.; Meirovitch, E. Biochemistry 2000, 39, 6634-6644.
278. Shapiro, Y. E.; Kahana, E.; Tugarinov, V.; Liang, Z.; Freed, J. H.; Meirovitch, E. Biochemistry 2002, 41, 6271-6281.
279. Tugarinov, V.; Shapiro, Y. E.; Liang, Z. C.; Freed, J. H.; Meirovitch, E. J. Mol. Biol. 2002, 315, 155-170.
280. Ikegami, T.; Okada, T.; Ohki, I.; Hirayama, J.; Mizuno, T.; Shirakawa, M. Biochemistry 2001, 40, 375-386.
281. Walma, T.; Spronk, C. A.; Tessari, M.; Aelen, J.; Schepens, J.; Hendriks, W.; Vuister, G. W. J. Mol. Biol. 2002,316, 1101-1110.
282. Finerty, P. J., Jr.; Mittermaier, A. K.; Muhandiram, R.; Kay, L. E.; Forman-Kay, J. D. Biochemistry 2005, 44, 694-703.
283. Hansson, H.; Mattsson, P. T.; Allard, P.; Haapaniemi, P.; Vihinen, M.; Smith, C. I. E.; Hard, T. Biochemistry 1998, 37, 2912-2924.
284. McEvoy, M. M.; Muhandiram, D. R.; Kay, L. E.; Dablquist, F. W. Biochemistry 1996, 35, 5633-5640.
285. Zhou, H.; Lowry, D. F.; Swanson, R. V.; Simon, M. I.; Dahlquist, F. W. Biochemistry 1995, 34, 13858-13870.
286. Ran, X.; Miao, H. H.; Sheu, F. S.; Yang, D. Biochemistry 2003, 42, 5143-5150.
287. Guignard, L.; Padilla, A.; Mispelter, J.; Yang, Y. S.; Stern, M. H.; Lhoste, J. M.; Roumestand, C. J. Biomol. NMR 2000, 17, 215-230.
288. Renner, C.; Baumgartner, R.; Noegel, A. A.; Holak, T. A. J. Mol. Biol. 1998, 283, 221-229.
289. Clubb, R. T.; Omichinski, J. G.; Sakaguchi, K.; Appella, E.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. Protein Sci. 1995, 4, 855-862.
290. Dutta, K.; Shi, H.; Cruz-Chu, E. R.; Kami, K.; Ghose, R. Biochemistry 2004, 43, 8094-8106.
291. Kristensen, S. M.; Siegal, G.; Sankar, A.; Driscoll, P. C. J. Mol. Biol. 2000, 299, 771-788.
292. Tochio, H.; Hung, F.; Li, M.; Bredt, D. S.; Zhang, M. J. J. Mol. Biol. 2000, 295, 225-237.
293. Auguin, D.; Barthe, P.; Auge-Senegas, M. T.; Stern, M. H.; Noguchi, M.; Roumestand, C. J. Biomol. NMR 2004, 28, 137-155.
294. Akerud, T.; Thulin, E.; Van Etten, R. L.; Akke, M. J. Mol. Biol. 2002, 322, 137-152.
295. Hong, E.; Shin, J.; Kim, H. I.; Lee, S. T.; Lee, W. J. Biol. Chem. 2004, 279, 29700-29708.
296. Abu-Abed, M.; Millet, O.; MacLennan, D. H.; Ikura, M. Biochem. J. 2004, 379, 235-242.
297. Chen, C.; Feng, Y.; Short, J. H.; Wand, A. J. Arch. Biochem. Biophys. 1993, 306, 510-514.
298. Gryk, M. R.; Abseher, R.; Simon, B.; Nilges, M.; Oschkinat, H. J. Mol. Biol. 1998, 280, 879-896.
299. Volkman, B. F.; Lipson, D.; Wemmer, D. E.; Kern, D. Science 2001, 291, 2429-2433.
300. Tada, M.; Kobashigawa, Y.; Mizuguchi, M.; Miura, K.; Kouno, T.; Kumaki, Y.; Demura, M.; Nitta, K.; Kawano, K. Biochemistry 2002, 41, 13807-13813.
301. Kalverda, A. P.; Ubbink, M.; Gilardi, G.; Wijmenga, S. S.; Crawford, A.; Jeuken, L. J. C.; Canters, G. W. Biochemistry 1999, 38, 12690-12697.
302. Malmendal, A.; Carlstrom, G.; Hambraeus, C.; Drakenberg, T.; Forsen, S.; Akke, M. Biochemistry 1998, 37, 2586-2595.
303. Theret, I.; Cox, J. A.; Mispelter, J.; Craescu, C. T. Protein Sci. 2001, 10, 1393-1402.
304. Theret, I.; Baladi, S.; Cox, J. A.; Gallay, J.; Sakamoto, H.; Craescu, C. T. Biochemistry 2001, 40, 13888-13897.
305. Malmendal, A.; Evenas, J.; Forsen, S.; Akke, M. J. Mol. Biol. 1999, 293, 883-899.
306. Lee, A. L.; Kinnear, S. A.; Wand, A. J. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 72-77.
307. Wang, T.; Frederick, K. K.; Igumenova, T. I.; Wand, A. J.; Zuiderweg, E. R. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 828-829.
308. Larsson, G.; Schleucher, J.; Onions, J.; Hermann, S.; Grundstrom, T.; Wijmenga, S. S. Biophys. J. 2005, 89, 1214-1226.
309. Venkitaramani, D. V.; Fulton, D. B.; Andreotti, A. H.; Johansen, K. M.; Johansen, J. Protein Sci. 2005, 14, 1894-1901.
310. Konrat, R.; Krautler, B.; Weiskirchen, R.; Bister, K. J. Biol. Chem. 1998, 273, 23233-23240.
311. Bertini, I.; Luchinat, C.; Niikura, Y.; Presenti, C. Proteins 2000, 41, 75-85.
312. Potter, B. M.; Feng, L. S.; Parasuram, P.; Matskevich, V. A.; Wilson, J. A.; Andrews, G. K.; Laity, J. H. J. Biol. Chem. 2005, 280, 28529-28540.
313. Oz, G.; Zangger, K.; Armitage, I. M. Biochemistry 2001, 40, 11433-11441.
314. Moncrieffe, M. C.; Juranic, N.; Kemple, M. D.; Potter, J. D.; Macura, S.; Prendergast, F. G. J. Mol. Biol. 2000, 297, 147-163.
315. Inman, K. G.; Baldisseri, D. M.; Miller, K. E.; Weber, D. J. Biochemistry 2001, 40, 3439-3448.
316. Rabah, G.; Popescu, R.; Cox, J. A.; Engelborghs, Y.; Craescu, C. T. FEBS J. 2005, 272, 2022-2036.
317. Gagne, S. M.; Tsuda, S.; Spyracopoulos, L.; Kay, L. E.; Sykes, B. D. J. Mol. Biol. 1998, 278, 667-686.
318. Paakkonen, K.; Annila, A.; Sorsa, T.; Pollesello, P.; Tilgmann, C.; Kilpelainen, I.; Karisola, P.; Ulmanen, I.; Drakenberg, T. J. Biol. Chem. 1998, 273, 15633-15638.
319. Blumenschein, T. M.; Gillis, T. E.; Tibbits, G. F.; Sykes, B. D. Biochemistry 2004, 43, 4955-4963.
320. Bhattacharya, S.; Falzone, C. J.; Lecomte, J. T. J. Biochemistry 1999, 38, 2577-2589.
321. Schwarzinger, S.; Wright, P. E.; Dyson, H. J. Biochemistry 2002, 41, 12681-12686.
322. Yao, J.; Chung, J.; Eliezer, D.; Wright, P. E.; Dyson, H. J. Biochemistry 2001, 40, 3561-3571.
323. Thompson, G. S.; Leung, Y. C.; Ferguson, S. J.; Radford, S. E.; Redfield, C. Protein Sci. 2000, 9, 846-858.
324. Kelly, G. P.; Muskett, F. W.; Whitford, D. Eur. J. Biochem. 1997, 245, 349-354.
325. Dangi, B.; Sarma, S.; Yan, C. H.; Banville, D. L.; Guiles, R. D. Biochemistry 1998, 37, 8289-8302.
326. Bartalesi, I.; Bertini, I.; Rosato, A. Biochemistry 2003, 42, 739-745.
327. Tsan, P.; Hus, J. C.; Caffrey, M.; Marion, D.; Blackledge, M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5603-5612.
328. Cordier, F.; Caffrey, M.; Brutscher, B.; Cusanovich, M. A.; Marion, D.; Blackledge, M. J. Mol. Biol. 1998, 281, 341-361.
329. Reincke, B.; Perez, C.; Pristovsek, P.; Lucke, C.; Ludwig, C.; Lohr, F.; Rogov, V. V.; Ludwig, B.; Ruterjans, H. Biochemistry 2001, 40, 12312-12320.
330. Assfalg, M.; Banci, L.; Bertini, I.; Ciofi-Baffoni, S.; Barker, P. D. Biochemistry 2001, 40, 12761-12771.
331. Russell, B. S.; Zhong, L.; Bigotti, M. G.; Cutruzzola, F.; Bren, K. L. J. Biol. Inorg. Chem. 2003, 8, 156-166.
332. Flynn, P. F.; Bieber Urbauer, R. J.; Zhang, H.; Lee, A. L.; Wand, A. J. Biochemistry 2001, 40, 6559-6569.
333. Liu, W.; Flynn, P. F.; Fuentes, E. J.; Kranz, J. K.; McCormick, M.; Wand, A. J. Biochemistry 2001, 40, 14744-14753.
334. Zhang, P.; Dayie, K. T.; Wagner, G. J. Mol. Biol. 1997, 272, 443-455.
335. Volkman, B. F.; Alam, S. L.; Satterlee, J. D.; Markley, J. L. Biochemistry 1998, 37, 10906-10919.
336. Ma, L.; Hass, M. A.; Vierick, N.; Kristensen, S. M.; Ulstrup, J.; Led, J. J. Biochemistry 2003, 42, 320-330.
337. Bai, Y.; Chung, J.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Protein Sci. 2001, 10, 1056-1066.
338. Barth, P.; Savarin, P.; Gilquin, B.; Lagoutte, B.; Ochsenbein, F. Biochemistry 2002, 41, 13902-13914.
339. Lamosa, P.; Turner, D. L.; Ventura, R.; Maycock, C.; Santos, H. Eur. J. Biochem. 2003, 270, 4606-4614.
340. Jimenez, B.; Piccioli, M.; Moratal, J. M.; Donaire, A. Biochemistry 2003, 42, 10396-10405.
341. Leone, M.; Di, L. P.; Ohlenschlager, O.; Pedone, E. M.; Bartolucci, S.; Rossi, M.; Di, B. B.; Pedone, C.; Saviano, M.; Isernia, C.; Fattorusso, R. Biochemistry 2004, 43, 6043-6058.
342. Daughdrill, G. W.; Vise, P. D.; Zhou, H.; Yang, X.; Yu, W. F.; Tasayco, M. L.; Lowry, D. F. J. Biomol. Struct. Dyn. 2004, 21, 663-670.
343. Dangi, B.; Dobrodumov, A. V.; Louis, J. M.; Gronenborn, A. M. Biochemistry 2002, 41, 9376-9388.
344. Huang, K.; Ghose, R.; Flanagan, J. M.; Prestegard, J. H. Biochemistry 1999, 38, 10567-10577.
345. Landry, S. J.; Steede, N. K.; Maskos, K. Biochemistry 1997, 36, 10975-10986.
346. Yoshida, T.; Oka, S.; Uchiyama, S.; Nakano, H.; Kawasaki, T.; Ohkubo, T.; Kobayashi, Y. Biochemistry 2003, 42, 4101-4107.
347. McGuire, A. M.; Matsuo, H.; Wagner, G. J. Biomol. NMR 1998, 12, 73-88.
348. Schneider, D. M.; Dellwo, M. J.; Wand, A. J. Biochemistry 1992, 31, 3645-3652.
349. Brutscher, B.; Bruschweiler, R.; Ernst, R. R. Biochemistry 1997, 36, 13043-13053.
350. Chang, S. L.; Tjandra, N. J. Magn. Reson. 2005, 174, 43-53.
351. Kitahara, R.; Yokoyama, S.; Akasaka, K. J. Mol. Biol. 2005, 347, 277-285.
352. Mccoy, M. A.; Senior, M. M.; Gesell, J. J.; Ramanathan, L.; Wyss, D. F. J. Mol. Biol. 2001, 305, 1099-1110.
353. Nicholson, L. K.; Yamazaki, T.; Torchia, D. A.; Grzesiek, S.; Bax, A.; Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Wingfield, P. T.; Lam, P. Y. S.; Jadhav, P. K.; Hodge, C. N.; Domaille, P. J.; Chang, C. H. Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 274-280.
354. Freedherg, D. I.; Wang, Y. X.; Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Wingfield, P. T.; Kiso, Y.; Torchia, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7916-7923.
355. Freedberg, D. I.; Ishima, R.; Jacob, J.; Wang, Y. X.; Kustanovich, I.; Louis, J. M.; Torchia, D. A. Protein Sci. 2002, 11, 221-232.
356. Katoh, E.; Louis, J. M.; Yamazaki, T.; Gronenborn, A. M.; Torchia, D. A.; Ishima, R. Protein Sci. 2003, 12, 1376-1385.
357. Feng, Y.; Likos, J. J.; Zhu, L.; Woodward, H.; Munie, G.; McDonald, J. J.; Stevens, A. M.; Howard, C. P.; De Crescenzo, G. A.; Welsch, D.; Shieh, H. S.; Stallings, W. C. Biochim. Biophys. Acta 2002, 1598, 10-23.
358. Briknarova, K.; Grishaev, A.; Banyai, L.; Tordai, H.; Patthy, L.; Llinas, M. Struct. Fold. Design 1999, 7, 1235-1245.
359. Remerowski, M. L.; Pepermans, H. A.; Hilbers, C. W.; Van De Ven, F. J. Eur. J. Biochem. 1996, 235, 629-640.
360. Buevich, A. V.; Shinde, U. P.; Inouye, M.; Baum, J. J. Biomol. NMR 2001, 20, 233-249.
361. Buevich, A. V.; Baum, J. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8671-8672.
362. Huang, Y. T.; Liaw, Y. C.; Gorbatyuk, V. Y.; Huang, T. H. J. Mol. Biol. 2001, 307, 1075-1090.
363. van Mierlo, C. P.; Darby, N. J.; Keeler, J.; Neuhaus, D.; Creighton, T. E. J. Mol. Biol. 1993, 229, 1125-1146.
364. Smith, P. E.; van Schaik, R. C.; Szyperski, T.; Wuthrich, K.; van Gunsteren, W. F. J. Mol. Biol. 1995, 246, 356-365.
365. Beeser, S. A.; Oas, T. G.; Goldenberg, D. P. J. Mol. Biol. 1998, 284, 1581-1596.
366. Barbar, E.; Hare, M.; Daragan, V.; Barany, G.; Woodward, G. Biochemistry 1998, 37, 7822-7833.
367. Shaw, G. L.; Davis, B.; Keeler, J.; Fersht, A. R. Biochemistry 1995, 34, 2225-2233.
368. Liu, J.; Prakash, O.; Cai, M.; Gong, Y.; Huang, Y.; Wen, L.; Wen, J. J.; Huang, J. K.; Krishnamoorthi, R. Biochemistry 1999, 35, 1516-1524.
369. Cai, M.; Huang, Y.; Prakash, O.; Wen, L.; Dunkelbarger, S. P.; Huang, J. K.; Liu, J.; Krishnamoorthi, R. Biochemistry 1996, 35, 4784-4794.
370. Song, J.; Markley, J. L. Biochemistry 2003, 42, 5186-5194.
371. Gonzalez, C.; Neira, J. L.; Ventura, S.; Bronsoms, S.; Rico, M.; Aviles, F. X. Proteins 2003, 50, 410-422.
372. Szenthe, B.; Gaspari, Z.; Nagy, A.; Perczel, A.; Graf, L. Biochemistry 2004, 43, 3376-3384.
373. Gao, G.; Semenchenko, V.; Arumugam, S.; Van, D., Sr. J. Mol. Biol. 2000, 301, 537-552.
374. Perez-Canadillas, J. M.; Guenneugues, M.; Campos-Olivas, R.; Santoro, J.; Martinez, D. P.; Gavilanes, J. G.; Rico, M.; Bruix, M. J. Biomol. NMR 2002, 24, 301-316.
375. Pang, Y.; Buck, M.; Zuiderweg, E. R. Biochemistry 2002, 41, 2655-2666.
376. Cole, R.; Loria, J. P. Biochemistry 2002, 41, 6072-6081.
377. Alexandrescu, A. T.; Rathgeb-Szabo, K.; Rumpel, K.; Jahnke, W.; Schulthess, T.; Kammerer, R. A. Protein Sci. 1998, 7, 389-402.
378. Powers, R.; Clore, G. M.; Stahl, S. J.; Wingfield, P. T.; Gronenborn, A. Biochemistry 1992, 31, 9150-9157.
379. Mueller, G. A.; Pari, K.; Derose, E. F.; Kirby, T. W.; London, R. E. Biochemistry 2004, 43, 9332-9342.
380. Yamasaki, K.; Saito, M.; Oobatake, M.; Kanaya, S. Biochemistry 1995, 34, 6587-6601.
381. Butterwick, J. A.; Patrick, L. J.; Astrof, N. S.; Kroenke, C. D.; Cole, R.; Rance, M.; Palmer, A. G., III. J. Mol. Biol. 2004, 339, 855-871.
382. Laurents, D.; Perez-Canadillas, J. M.; Santoro, J.; Rico, M.; Schell, D.; Pace, C. N.; Bruix, M. Proteins 2001, 44, 200-211.
383. Fushman, D.; Ohlenschlager, O.; Ruterjans, H. J. Biomol. Struct. Dyn. 1994, 11, 1377-1402.
384. Engelke, J.; Ruterjans, H. J. Biomol. NMR 1997, 9, 63-78.
385. Alexandrescu, A. T.; Shortle, D. J. Mol. Biol. 1994, 242, 527-546.
386. Alexandrescu, A. T.; Jahnke, W.; Wiltscheck, R.; Blommers, M. J. J. Mol. Biol. 1996, 260, 570-587.
387. Sinclair, J. F.; Shortle, D. Protein Sci. 1999, 8, 991-1000.
388. Luginbuhl, P.; Pervushin, K. V.; Iwai, H.; Wuthrich, K. Biochemistry 1997, 36, 7305-7312.
389. Habazettl, J.; Myers, L. C.; Yuan, F.; Verdine, G. L.; Wagner, G. Biochemistry 1996, 35, 9335-9348.
390. Folmer, R. H.; Nilges, M.; Papavoine, C. H.; Harmsen, B. J.; Konings, R. N.; Hilbers, C. W. Biochemistry 1997, 36, 9120-9135.
391. Mackay, J. P.; Shaw, G. L.; King, G. F. Biochemistry 1996, 35, 4867-4877.
392. Feng, W. Q.; Tejero, R.; Zimmerman, D. E.; Inouye, M.; Montelione, G. T. Biochemistry 1998, 37, 10881-10896.
393. Yan, J.; Liu, Y.; Lukasik, S. M.; Speck, N. A.; Bushweller, J. H. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 901-906.
394. Matsuo, H.; Sugeta, H.; Shirakawa, M.; Kyogoku, Y. J. Mol. Struct. 1996, 379, 143-150.
395. Clubb, R. T.; Mizuuchi, M.; Huth, J. R.; Omichinski, J. G.; Savilahti, H.; Mizuuchi, K.; Clore, G. M.; Gronenborn, A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 1146-1150.
396. Wikstrom, A.; Berglund, H.; Hambraeus, C.; van den Berg, S.; Hard, T. J. Mol. Biol. 1999, 289, 963-979.
397. van Heijenoort, C.; Penin, F.; Guittet, E. Biochemistry 1998, 37, 5060-5073.
398. Braddock, D. T.; Louis, J. M.; Baber, J. L.; Levens, D.; Clore, G. M. Nature 2002, 415, 1051-1056.
399. Bracken, C.; Carr, P. A.; Cavanagh, J.; Palmer, A. G. J. Mol. Biol. 1999, 285, 2133-2146.
400. Jin, C. W.; Marsden, I.; Chen, X. Q.; Liao, X. B. Biochemistry 1998, 37, 6179-6187.
401. Berglund, H.; Kovacs, H.; Dahlmanwright, K.; Gustafsson, J. A.; Hard, T. Biochemistry 1992, 31, 12001-12011.
402. Damberger, F. F.; Pelton, J. G.; Liu, C.; Cho, H.; Harrison, C. J.; Nelson, H. C.; Wemmer, D. E. J. Mol. Biol. 1995, 254, 704-719.
403. Katahira, M.; Miyanoiri, Y.; Enokizono, Y.; Matsuda, G.; Nagata, T.; Ishikawa, F.; Uesugi, S. J. Mol. Biol. 2001, 311, 973-988.
404. Barber, J. L.; Levens, D.; Libutti, D.; Tjandra, N. Biochemistry 2000, 39, 6022-6032.
405. Broadhurst, R. W.; Hardman, C. H.; Thomas, J. O.; Laue, E. D. Biochemistry 1995, 34, 16608-16617.
406. Zhang, X.; Xu, Y.; Zhang, J.; Wu, J.; Shi, Y. Biochemistry 2005, 44, 8117-8125.
407. Gao, Y.; Kaluarachchi, K.; Giedroc, D. P. Protein Sci. 1998, 7, 2265-2280.
408. Miyanoiri, Y.; Kobayashi, H.; Imai, T.; Watanabe, M.; Nagata, T.; Uesugi, S.; Okano, H.; Katahira, M. J. Biol. Chem. 2003, 278, 41309-41315.
409. Poznanski, J.; Bolewska, K.; Zhukov, I.; Wierzchowski, K. L. Biochemistry 2003, 42, 13438-13448.
410. Kahsai, M. A.; Martin, E.; Edmondson, S. P.; Shriver, J. W. Biochemistry 2005, 44, 13500-13509.
411. Bhattacharya, S.; Botuyan, M. V.; Hsu, F.; Shan, X.; Arunkumar, A. I.; Arrowsmith, C. H.; Edwards, A. M.; Chazin, W. J. Protein Sci. 2002, 11, 2316-2325.
412. Cary, P. D.; Read, C. M.; Davis, B.; Driscoll, P. C.; Crane-Robinson, C. Protein Sci. 2001, 10, 83-98.
413. Kahsai, M. A.; Vogler, B.; Clark, A. T.; Edmondson, S. P.; Shriver, J. W. Biochemistry 2005, 44, 2822-2832.
414. Biyani, K.; Kahsai, M. A.; Clark, A. T.; Armstrong, T. L.; Edmondson, S. P.; Shriver, J. W. Biochemistry 2005, 44, 14217-14230.
415. Maguire, M. L.; Guler-Gane, G.; Nietlispach, D.; Raine, A. R.; Zorn, A. M.; Standart, N.; Broadhurst, R. W. J. Mol. Biol. 2005, 348, 265-279.
416. Jia, X.; Lee, L. K.; Light, J.; Palmer, A. G.; Assa-Munt, N. J. Mol. Biol. 1999, 292, 1083-1093.
417. Fieber, W.; Schneider, M. L.; Matt, T.; Krautler, B.; Konrat, R.; Bister, K. J. Mol. Biol. 2001, 307, 1395-1410.
418. Walters, K. J.; Dayie, K. T.; Reece, R. J.; Ptashne, M.; Wagner, G. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 744-750.
419. Zheng, Z.; Czaplicki, J.; Jardetzky, O. Biochemistry 1995, 34, 5212-5223.
420. Lu, J.; Hall, K. B. Biochemistry 1997, 36, 10393-10405.
421. Fausti, S.; Weiler, S.; Cuniberto, C.; Hwang, K. J.; No, K. T.; Gruschus, J. M.; Perico, A.; Nirenberg, M.; Ferretti, J. A. Biochemistry 2001, 40, 12004-12012.
422. Laity, J. H.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 11932-11935.
423. Ikegami, T.; Kuraoka, I.; Saijo, M.; Kodo, N.; Kyogoku, Y.; Morikawa, K.; Tanaka, K.; Shirakawa, M. J. Biochem. 1999, 125, 495-506.
424. Buchko, G. W.; Daughdrill, G. W.; de Lorimier, R.; Rao, B. K.; Isern, N. G.; Lingbeck, J. M.; Taylor, J. S.; Wold, M. S.; Gochin, M.; Spicer, L. D.; Lowry, D. F.; Kennedy, M. A. Biochemistry 1999, 38, 15116-15128.
425. Kloks, C. P.; Tessari, M.; Vuister, G. W.; Hilbers, C. W. Biochemistry 2004, 43, 10237-10246.
426. Guo, X.; Li, Y.; Peng, K.; Hu, Y.; Li, C.; Xia, B.; Jin, C. J. Biol. Chem. 2005, 280, 39601-39608.
427. Eletsky, A.; Kienhofer, A.; Hilvert, D.; Pervushin, K. Biochemistry 2005, 44, 6788-6799.
428. Banci, L.; Bertini, I.; Cramaro, F.; Del Conte, R.; Rosato, A.; Viezzoli, M. S. Biochemistry 2000, 39, 9108-9118.
429. Prompers, J. J.; van Noorloos, B.; Mannesse, M. L. M.; Groenewegen, A.; Egmond, M. R.; Verheij, H. M.; Hilbers, C. W.; Pepermans, H. A. M. Biochemistry 1999, 38, 5982-5994.
430. Zhao, Q.; Abeygunawardana, C.; Mildvan, A. S. Biochemistry 1996, 35, 1525-1532.
431. Yun, S.; Jang, D. S.; Choi, G.; Kim, K. S.; Choi, K. Y.; Lee, H. C. J. Biol. Chem. 2002, 277, 23414-23419.
432. Epstein, D. M.; Benkovic, S. J.; Wright, P. E. Biochemistry 1995, 34, 11037-11048.
433. Pitcher, W. H.; Derose, E. F.; Mueller, G. A.; Howell, E. E.; London, R. E. Biochemistry 2003, 42, 11150-11160.
434. Krishnan, V. V.; Thornton, K. H.; Thelen, M. P.; Cosman, M. Biochemistry 2001, 40, 13158-13166.
435. Maciejewski, M. W.; Liu, D. J.; Prasad, R.; Wilson, S. H.; Mullen, G. P. J. Mol. Biol. 2000, 296, 229-253.
436. McCallum, S. A.; Hitcbens, T. K.; Torborg, C.; Rule, G. S. Biochemistry 2000, 39, 7343-7356.
437. Liu, D. J.; Wang, Y. S.; Gesell, J. J.; Wyss, D. F. J. Mol. Biol. 2001, 314, 543-561.
438. Guilhaudis, L.; Simorre, J. P.; Blackledge, M.; Neuburger, M.; Bourguignon, J.; Douce, R.; Marion, D.; Gans, P. Biochemistry 1999, 38, 8334-8346.
439. Buck, M.; Boyd, J.; Redfield, C.; MacKenzie, D. A.; Jeenes, D. J.; Archer, D. B.; Dobson, C. M. Biochemistry 1995, 34, 4041-4055.
440. Buck, M.; Schwalbe, H.; Dobson, C. M. J. Mol. Biol. 1996, 257, 669-683.
441. Johnson, R. J.; Christodoulou, J.; Dumoulin, M. Caddy, G. L.; Alcocer, M. J.; Murtagh, G. J.; Kumita, J. R.; Larsson, G.; Robinson, C. V.; Archer, D. B.; Luisi, B.; Dobson, C. M. J. Mol. Biol. 2005, 352, 823-836.
442. Gorbatyuk, V. Y.; Tsai, C. K.; Chang, C. F.; Huang, T. H. J. Biol. Chem. 2004, 279, 5772-5780.
443. Wang, G. P.; Cahill, S. M.; Liu, X. H.; Girvin, M. E.; Grubmeyer, C. Biochemistry 1999, 38, 284-295.
444. Uhrinova, S.; Uhrin, D.; Nairn, J.; Price, N. C.; Fothergill-Gilmore, L. A.; Barlow, P. N. J. Mol. Biol. 2001, 306, 275-290.
445. Pan, B.; Maciejewski, M. W.; Marintchev, A.; Mullen, G. P. J. Mol. Biol. 2001, 310, 1089-1107.
446. Banci, L.; Bertini, I.; Cantini, F.; D'Onofrio, M.; Viezzoli, M. S. Protein Sci. 2002, 11, 2479-2492.
447. Shipp, E. L.; Cantini, F.; Bertini, I.; Valentine, J. S.; Banci, L. Biochemistry 2003, 42, 1890-1899.
448. Scheuermann, T. H.; Keeler, C.; Hodsdon, M. E. Biochemistry 2004, 43, 12198-12209.
449. Connelly, G. P.; Withers, S. G.; McIntosh, L. P. Protein Sci. 2000, 9, 512-524.
450. Hill, R. B.; Bracken, C.; DeGrado, W. F.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 11610-11619.
451. Walsh, S. T. R.; Lee, A. L.; DeGrado, W. F.; Wand, A. J. Biochemistry 2001, 40, 9560-9569.
452. Markus, M. A.; Dayie, K. T.; Matsudaira, P.; Wagner, G. Biochemistry 1996, 35, 1722-1732.
453. Campos-Olivas, R.; Horr, I.; Bormann, C.; Jung, G.; Gronenborn, A. M. J. Mol. Biol. 2001, 308, 765-782.
454. Idiyatullin, D.; Krushelnitsky, A.; Nesmelova, I.; Blanco, F.; Daragan, V. A.; Serrano, L.; Mayo, K. H. Protein Sci. 2000, 9, 2118-2127.
455. Mayo, K. H.; Daragan, V. A.; Idiyatullin, D.; Nesmelova, I. J. Magn. Reson. 2000, 146, 188-195.
456. Lane, A. N.; Hays, L. M.; Tsvetkova, N.; Feeney, R. E.; Crowe, L. M.; Crowe, J. H. Biophys. J. 2000, 78, 3195-3207.
457. Daley, M. E.; Spyracopoulos, L.; Jia, Z.; Davies, P. L.; Sykes, B. D. Biochemistry 2002, 41, 5515-5525.
458. Graether, S. P.; Gagne, S. M.; Spyracopoulos, L.; Jia, Z.; Davies, P. L.; Sykes, B. D. J. Mol. Biol. 2003, 327, 1155-1168.
459. Raussens, V.; Slupsky, C. M.; Ryan, R. O.; Sykes, B. D. J. Biol. Chem. 2002, 277, 29172-29180.
460. Wong, K. B.; Fersht, A. R.; Freund, S. M. V. J. Mol. Biol. 1997, 268, 494-511.
461. Sahu, S. C.; Bhuyan, A. K.; Majumdar, A.; Udgaonkar, J. B. Proteins 2000, 41, 460-474.
462. Ramirez-Alvarado, M.; Daragan, V. A.; Serrano, L.; Mayo, K. H. Protein Sci. 1998, 7, 720-729.
463. Lee, C. S.; Kumar, T. K.; Lian, L. Y.; Cheng, J. W.; Yu, C. Biochemistry 1998, 37, 155-164.
464. Favier, A.; Brutscher, B.; Blackledge, M.; Galinier, A.; Deutscher, J.; Penin, F.; Marion, D. J. Mol. Biol. 2002, 317, 131-144.
465. Wolf-Watz, M.; Grundstrom, T.; Hard, T. Biochemistry 2001, 40, 11423-11432.
466. Griswold, I. J.; Dahlquist, F. W. Biophys. Chem. 2002, 101-102, 359-373.
467. Macdonald, C. J.; Tozawa, K.; Collins, E. S.; Penfold, C. N.; James, R.; Kleanthous, C.; Clayden, N. J.; Moore, G. R. J. Biomol. NMR 2004, 30, 81-96.
468. Goldenberg, D. P.; Koehn, R. E.; Gilbert, D. E.; Wagner, G. Protein Sci. 2001, 10, 538-550.
469. Fan, J. S.; Zhang, Q.; Tochio, H.; Zhang, M. J. Biomol. NMR 2002, 23, 103-114.
470. Ilangovan, U.; Ding, W.; Zhong, Y.; Wilson, C. L.; Groppe, J. C.; Trbovich, J. T.; Zuniga, J.; Demeler, B.; Tang, Q.; Gao, G.; Mulder, K. M.; Hinck, A. P. J. Mol. Biol. 2005, 352, 338-354.
471. Seifert, M. H.; Georgescu, J.; Ksiazek, D.; Smialowski, P.; Rehm, T.; Steipe, B.; Holak, T. A. Biochemistry 2003, 42, 2500-2512.
472. Rothemund, S.; Liou, Y. C.; Davies, P. L.; Sonnichsen, F. D. Biochemistry 1997, 36, 13791-13801.
473. Jaroniec, C. P.; Kaufman, J. D.; Stahl, S. J.; Viard, M.; Blumenthal, R.; Wingfield, P. T.; Bax, A. Biochemistry 2005, 44, 16167-16180.
474. Cornilescu, C. C.; Bouamr, F.; Carter, C.; Tjandra, N. Protein Sci. 2003, 12, 973-981.
475. Bouamr, F.; Cornilescu, C. C.; Goff, S. P.; Tjandra, N.; Carter, C. A. J. Biol. Chem. 2005, 280, 6792-6801.
476. Beglova, N.; North, C. L.; Blacklow, S. C. Biochemistry 2001, 40, 2808-2815.
477. Kurniawan, N. D.; Aliabadizadeh, K.; Brereton, I. M.; Kroon, P. A.; Smith, R. J. Mol. Biol. 2001, 311, 341-356.
478. Papavoine, C. H.; Remerowski, M. L.; Horstink, L. M.; Konings, R. N.; Hilbers, C. W.; Van De Ven, F. J. Biochemistry 1997, 36, 4015-4026.
479. Williams, K. A.; Farrow, N. A.; Deber, C. M.; Kay, L. E. Biochemistry 1996, 35, 5145-5157.
480. Barthe, P.; Declerck, N.; Delsuc, M. A.; Lefevre, J. F.; Roumestand, C. J. Chim. Phys. Phys. Chim. Biol. 1999, 96, 1585-1594.
481. Kemple, M. D.; Buckley, P.; Yuan, P.; Prendergast, F. G. Biochemistry 1997, 36, 1678-1688.
482. Sung, Y. H.; Shin, J.; Chang, H. J.; Cho, J. M.; Lee, W. J. Biol. Chem. 2001, 276, 19624-19630.
483. Gitti, R. K.; Wright, N. T.; Margolis, J. W.; Varney, K. M.; Weber, D. J.; Margolis, F. L. Biochemistry 2005, 44, 9673-9679.
484. Campbell, A. P.; Spyracopoulos, L.; Irvin, R. T.; Sykes, B. D. J. Biomol. NMR 2000, 17, 239-255.
485. Campbell, A. P.; Spyracopoulos, L.; Wong, W. Y.; Irvin, R. T.; Sykes, B. D. Biochemistry 2003, 42, 11334-11346.
486. Suh, J. Y.; Spyracopoulos, L.; Keizer, D. W.; Irvin, R. T.; Sykes, B. D. Biochemistry 2001, 40, 3985-3995.
487. Berjanskii, M.; Riley, M.; Van Doren, S. R. J. Mol. Biol. 2002, 321, 503-516.
488. Viles, J. H.; Donne, D.; Kroon, G.; Prusiner, S. B.; Cohen, F. E.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Biochemistry 2001, 40, 2743-2753.
489. McDonnell, J. M.; Fushman, D.; Cahill, S. M.; Zhou, W. J.; Wolven, A.; Wilson, C. B.; Nelle, T. D.; Resh, M. D.; Wills, J.; Cowburn, D. J. Mol. Biol. 1998, 279, 921-928.
490. Williams, C.; Galyov, E. E.; Bagby, S. Biochemistry 2004, 43, 11998-12008.
491. Feher, V. A.; Zapf, J. W.; Hoch, J. A.; Whiteley, J. M.; McIntosh, L. P.; Rance, M.; Skelton, N. J.; Dahlquist, F. W.; Cavanagh, J. Biochemistry 1997, 36, 10015-10025.
492. Allard, P.; Haerd, T. J. Magn. Reson. 1997, 126, 48-57.
493. Prieto, J. H.; Sampoli Benitez, B. A.; Melacini, G.; Johnson, D. A.; Wood, M. J.; Komives, E. A. Biochemistry 2005, 44, 1225-1233.
494. Guenneugues, M.; Gilquin, B.; Wolff, N.; Menez, A.; Zinn-Justin, S. J. Biomol. NMR 1999, 14, 47-66.
495. Botuyan, M. V.; Mer, G.; Yi, G. S.; Koth, C. M.; Case, D. A.; Edwards, A. M.; Chazin, W. J.; Arrowsmith, C. H. J. Mol. Biol. 2001, 312, 177-186.
496. Grey, M. J.; Tang, Y.; Alexov, E.; McKnight, C. J.; Raleigh, D. P.; Palmer, A. G., III. J. Mol. Biol. 2006, 355, 1078-1094.
497. Korzhnev, D. M.; Bocharov, E. V.; Zhuravlyova, A. V.; Orekhov, V. Y.; Ovchinnikova, T. V.; Billeter, M.; Arseniev, A. S. FEBS Lett. 2001, 495, 52-55.