Contribution of backbone dynamics to entropy changes occurring on oxidation of cytochrome b5. Can redox linked changes in hydrogen bond networks modulate reduction potentials?

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 102, Issue 42, 1998, Pages 8201-8208

  Dangi, Bindi ^a   Blankman, Jeffrey I ^c   Miller, Cary J ^c,e   Volkman, Brian F ^d   Guiles, R D ^a,b  

^a UNIVERSITY OF MARYLAND SCHOOL OF PHARMACY   (United States)

^b Maryland Biotechnology Institutes   (United States)

^c UNIVERSITY OF MARYLAND   (United States)

^d UNIVERSITY OF WISCONSIN MADISON   (United States)

^e I Stat Corporation   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001174286     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp981050h     Document Type: Article

References (49)

1. Mathews, F. S. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1985, 45, 1.
2. Walker, F. A.; Huynh, B.-H.; Scheidt, W. R.; Osvath, S. R. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 5288.
3. Babcock, G. T.; Widger, W. R.; Cramer, W. A.; Oertling, W. A.; Metz, J. G. Biochemistry 1985, 24, 3638.
4. 5; Mathews, S., Czerwinski, E. W., Argos, P., Ed.; Academic Press: New York, 1979; Vol. VII, pp 107-147.
5. Langen, R.; Brayer, G. D.; Berghuis, A. M.; McLendon, G.; Sherman, F.; Warshel, A. J. Mol. Biol. 1992, 224, 589.
6. Zhou, H.-X. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 10362.
7. Cutler, R. L.; Davies, A. M.; Creighton, S.; Warshel, A.; Moore, G. R.; Smith, M.; Mauk, A. G. Biochemistry 1989, 28, 3188.
8. Funk, W. D.; Lo, T. P.; Mauk, M. R.; Brayer, G. D.; MacGillivray-Ross, T. A.; Mauk, A. G. Biochemistry 1990, 29, 5500.
9. Sarma, S.; Dangi, B.; Yan, C.-H.; DiGate, R. J.; Banville, D.; Guiles, R. D. Biochemistry 1997, 36, 5645.
10. Sarma, S.; Banville, D.; DiGate, R. J.; Miller, C.; Guiles, R. D. Biochemistry 1997, 36, 5658.
11. Quinn, R.; Mercer-Smith, J.; Burstyn, J. N.; Valentine, J. S. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 4136.
12. Terrettaz, S.; Cheng, J.; Miller, C.; Guilles, R. D. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7857.
13. Cheng, J.; Terrettaz, S.; Blankman, J. I.; Miller, C. J.; Dungi, B.; Guiles, R. D. Isr. J. Chem. 1997, 37, 2.
14. Palmer, A. G. Curr. Opin. Biotechnol. 1993, 4, 385.
15. Dangi, B.; Sarma, S.; Yan, C.; Banville, D. L.; DiGate, R. J.; Guiles, R. D. Biochemistry, in press.
16. Englander, J. J.; Englander, S. W.; Louie, G.; Roder, H.; Tran, T.; Wand, A. J. Protein Hydrogen Exchange, Dynamics and Energetic; Adenine Press: Guilderland, NY, 1988; Vol. 1, p 107.
17. Akke, M.; Brüschweiler, R.; Palmer, A. G. I. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9832.
18. Becka, A. M.; Miller, C. J. J. Phys. Chem. 1992, 96, 2657.
19. Terrettaz, S.; Becka, A. M., Traub, M. J., Fettinger, J. C.; Miller, C. J. J. Phys. Chem. 1995, 99, 11216.
20. Mori, S.; Abeygunawardana, C.; Johnson, M. O. N.; van Zijl, P. C. M. J. Magn. Reson., Ser. B 1995, 108, 94.
21. Delaglio, F.; Grzesiek, S.; Vuister, G. W.; Zhu, G.; Pfeifer, J.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1995, 6, 277.
22. Tjandra, N.; Feller, S. E.; Pastor, R. W.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 12562.
23. Brüschweiller, R.; Liao, X.; Wright, P. E. Science 1995, 268, 886.
24. Banci, L.; Bertini, I.; Ferroni, F.; Rosato, A. Eur. J. Biochem. 1997, 249, 2270.
25. Guiles, R. D.; Basus, V. J.; Sarma, S.; Malpure, S.; Fox, K. M.; Kuntz, I. D.; Waskell, L. Biochemistry 1993, 32, 8329.
26. Sarma, S.; Banville, D.; DiGate, R. J.; Guiles, R. D. J. Biomol. NMR 1996, 8, 171.
27. Guiles, R. D.; Basus, V. J.; Kuntz, I. D.; Waskell, L. Biochemistry 1992, 31, 11365.
28. Palmer, A. G.; Williams, J.; McDermott, A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 13293.
29. Bertini, I.; Luchinat, C.; Vasavada, K. V. J. Magn. Reson. 1990, 89, 243.
30. Vasavada, K. V.; Rao, B. D. N. J. Magn. Reson. 1989, 81, 275.
31. Bertini, I.; Galas, O.; Luchinat, C.; Parigi, G. J. Magn. Reson. Ser. A 1995, 113, 151.
32. Yamazaki, T.; Lee, W.; Arrowsmith, C. H.; Muhandiram, D. R.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11655.
33. Lipari, G.; Szabo, A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4546.
34. Lipari, G.; Szabo, A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4559.
35. Abragam, A. The Principles of Nuclear Magnetism; Clarendon Press: Oxford, 1961, pp 264-349.
36. Mandel, A. M.; Akke, M.; Palmer, A. G. J. Mol. Biol. 1995, 246, 144.
37. Tjandra, N.; Kuboniwa, H.; Ren, H.; Bax, A. Eur. J. Biochem. 1995, 230, 1014.
38. Hoshino, M.; Ozawa, K.; Seki, H.; Ford, P. C. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 9568.
39. Blankman, J. I.; Miller, C. J.; Guiles, R. D. J. Am. Chem. Soc., submitted for publication.
40. Springer, B. A.; Sligar, S., G. Proc. Natl. Acad. Sci. 1987, 84, 8961.
41. Marcus, R. A.; Sutin, N. Biochim. Biophys. Acta 1985, 811, 265.
42. Rodgers, K. K.; Pochapsky, T. C.; Sliger, S. G. Science 1988, 240, 1657.
43. Englander, S. W.; Sosnick, T. R.; Englander, J. J.; Mayne, L. Curr. Opin. Struct. Biol. 1996, 6, 18.
44. Bertini, L.; Luchinat, C. NMR of Paramagnetic Molecules in Biological Systems; Benjamin/Cummings: Menlo Park, CA, 1986; p 77.
45. Storch, E. M.; Daggett, V. Biochemistry 1995, 34, 9682.
46. Veitch, N. C.; Whitford, D.; Williams, R. J. P. FEBS Lett. 1990, 269, 297.
47. Kelly, G. P.; Muskett, F. W.; Whitford, D. Eur. J. Biochem. 1997, 349.
48. Yang, D.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 263, 369.
49. Goodin, D. B.; McRee, D. E. Biochemistry 1993, 32, 3313.