MicroRNA: Function, detection, and bioanalysis

Chemical Reviews

Volumn 113, Issue 8, 2013, Pages 6207-6233

  Dong, Haifeng ^a   Lei, Jianping ^b   Ding, Lin ^b   Wen, Yongqiang ^a   Ju, Huangxian ^b   Zhang, Xueji ^a  

^a UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY BEIJING   (China)

^b NANJING UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CROSS-HYBRIDIZATION; INTERGENIC REGIONS; MOLECULAR LEVELS; POST-TRANSCRIPTIONAL; REGULATORY PATHWAY; RELIABLE DETECTION; RNA POLYMERASE II; SELECTIVE DETECTION;

GENE EXPRESSION; PROBES; VIRUSES;

RNA;

MICRORNA; NANOPARTICLE; RNA BINDING PROTEIN;

CELL DIFFERENTIATION; CHEMICAL ANALYSIS; CHEMISTRY; FRACTIONATION; GENE EXPRESSION PROFILING; GENETICS; HUMAN; IMMUNE SYSTEM; METABOLISM; METHODOLOGY; MOLECULAR BIOLOGY; NEOPLASM; NORTHERN BLOTTING; ONCOGENE; PHYSIOLOGY; REVIEW;

BLOTTING, NORTHERN; CELL DIFFERENTIATION; CHEMICAL FRACTIONATION; CHEMISTRY TECHNIQUES, ANALYTICAL; GENE EXPRESSION PROFILING; HUMANS; IMMUNE SYSTEM; MICRORNAS; MOLECULAR BIOLOGY; NANOPARTICLES; NEOPLASMS; ONCOGENES; RNA-BINDING PROTEINS;

EID: 84883856321     PISSN: 00092665     EISSN: 15206890     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr300362f     Document Type: Review

References (369)

1. Bartel, D. P. Cell 2004, 116, 281
2. He, L.; Hannon, G. J. Nat. Rev. Genet. 2004, 5, 522
3. Lee, Y.; Kim, M.; Han, J.; Yeom, K. H.; Lee, S.; Baek, S. H. EMBO J. 2004, 23, 4051
4. Gregory, R. I.; Yan, K. P.; Amuthan, G.; Chendrimada, T.; Doratotaj, B.; Cooch, N.; Shiekhattar, R. Nature 2004, 432, 235
5. Lee, Y.; Ahn, C.; Han, J.; Choi, H.; Kim, J.; Yim, J. Nature 2003, 425, 415
6. Bohnsack, M. T.; Czaplinski, K.; Gorlich, D. RNA 2004, 10, 185
7. Hammond, S. M.; Bernstein, E.; Beach, D.; Hannon, G. J. Nature 2000, 404, 293
8. Bartel, D. P. Cell 2009, 136, 215
9. Suzuki, H. I.; Miyazono, K. J. Biochem. 2011, 149, 15
10. Olsen, P. H.; Ambros, V. Dev. Biol. 1999, 216, 671
11. Liu, J.; Valencia-Sanchez, M. A.; Hannon, G. J.; Parker, R. Nat. Cell Biol. 2005, 7, 719
12. Griffiths-Jones, S. Nucleic Acids Res. 2008, 36, e154
13. Brennecke, J.; Hipfner, D. R.; Stark, A.; Russell, R. B.; Cohen, S. M. Cell 2003, 113, 25
14. Dostie, J.; Mourelatos, Z.; Yang, M.; Sharma, A.; Dreyfuss, G. RNA 2003, 9, 180
15. Wang, Y. L.; Keys, D. N.; Au-Young, J. K.; Chen, C. F. J. Cell. Physiol. 2009, 218, 251
16. Xu, P.; Vernooy, S. Y.; Guo, M.; Hay, B. A. Curr. Biol. 2003, 13, 790
17. Ambros, V. Cell 2003, 113, 673
18. Chen, C. Z.; Li, L.; Lodish, H. F.; Bartel, D. P. Science 2004, 303, 83
19. Cho, W. C. Biochim. Biophys. Acta 2010, 1805, 209
20. Ruan, K.; Fang, X. G.; Ouyang, G. L. Cancer Lett. 2009, 285, 116
21. Kocerha, J.; Kauppinen, S.; Wahlestedt, C. NeuroMol. Med. 2009, 11, 162
22. Pandey, A. K. Cell. Physiol. Biochem. 2009, 23, 221
23. Saal, S.; Harvey, S. J. Curr. Opin. Nephrol. Hypertens. 2009, 18, 317
24. Chen, X. M. World J. Gastroenterol. 2009, 15, 1665
25. Feng, M. J.; Shi, F.; Qiu, C.; Peng, W. K. Inter. Immunopharmacol. 2012, 13, 347
26. Tsitsiou, E.; Lindsay, M. A. Curr. Opin. Pharmacol. 2009, 9, 514
27. Johnson, S. M.; Grosshans, H.; Shingara, J.; Byrom, M.; Jarvis, R.; Cheng, A.; Labourier, E.; Reinert, K. L.; Brown, D.; Slack, F. J. Cell 2005, 120, 635
28. Stahlhut-Espinosa, C. E.; Slack, F. J. J. Biol. Med. 2006, 79, 131
29. Kosaka, N.; Iguchi, H.; Ochiya, T. Cancer Sci. 2010, 101, 208
30. Grosshans, H.; Filipowicz, W. Nature 2008, 451, 414
31. Gupta, A.; Gartner, J. J.; Sethupathy, P.; Hatzigeorgiou, A. G.; Fraser, N. W. Nature 2006, 442, 82
32. Garzon, R.; Marcucci, G.; Croce, C. M. Nat. Rev. Drug Discovery 2010, 9, 775
33. ISI Web of Knowledge: http://www.isiknowledge.com.
34. Kyle, A.; Cissell, S. S.; Sapna, K. Anal. Chem. 2007, 1, 4755
35. Qavi, A. J.; Kindt, J. T.; Bailey, R. C. Anal. Bioanal. Chem. 2010, 398, 2535
36. Lim, L. P. Genes Dev. 2003, 17, 991
37. Hutvágner, G.; Zamore, P. D. Science 2002, 297, 2056
38. Bushati, N.; Cohen, S. M. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2007, 23, 175
39. Martinez, J.; Tuschl, T. Genes Dev. 2004, 18, 975
40. Lim, L. P.; Lau, N. C.; Garrett-Engele, P.; Grimson, A.; Schelter, J. M.; Castle, J.; Bartel, D. P.; Linsley, P. S.; Johnson, J. M. Nature 2005, 433, 769
41. Bagga, S.; Bracht, J.; Hunter, S.; Massirer, K.; Holtz, J.; Eachus, R.; Pasquinelli, A. E. Cell 2005, 122, 553
42. Sen, G. L.; Blau, H. M. Nat. Cell Biol. 2005, 7, 633
43. Lee, Y. S.; Dutta, A. Annu. Rev. Pathol. 2009, 4, 199
44. Di Leva, G.; Croce, C. M. Trends Mol. Med. 2010, 16, 257
45. Vasudevan, S.; Tong, Y.; Steitz, J. A. Science 2007, 318, 1931
46. Jopling, C. L.; Yi, M.; Lancaster, A. M.; Lemon, S. M.; Sarnow, P. Science 2005, 309, 1577
47. Tay, Y.; Zhang, J.; Thomson, A. M.; Lim, B.; Rigoutsos, I. Nature 2008, 455, 1124
48. Lewis, B. P.; Shih, I. H.; Jones-Rhoades, M. W.; Bartel, D. P.; Burge, C. B. Cell 2003, 115, 787
49. Ryan, B. M.; Robles, A. I.; Harris, C. C. Nat. Rev. Cancer 2010, 10, 389
50. Liu, N.; Olson, E. N. Dev. Cell 2010, 18, 510
51. Alvarez-Saavedra, E.; Horvitz, H. R. Curr. Biol. 2010, 20, 367
52. Brenner, J. L.; Jasiewicz, K. L.; Fahley, A. F.; Kemp, B. J.; Abbott, A. L. Curr. Biol. 2010, 20, 1321
53. Ambros, V. Curr. Biol. 2010, 20, R598
54. Pritchard, C. C.; Cheng, H. H.; Tewari, M. Nat. Rev. Genet. 2012, 13, 358
55. Small, E. M.; Olson, E. N. Nature 2011, 469, 336
56. O'Connell, R. M.; Rao, D. S.; Chaudhuri, A. A.; Baltimore, D. Nat. Rev. Immunol. 2010, 10, 111
57. Lodish, H. F.; Zhou, B.; Liu, G.; Chen, C. Z. Nat. Rev. Immunol. 2008, 8, 120
58. Baltimore, D.; Boldin, M. P.; O'Connell, R. M.; Rao, D. S.; Taganov, K. D. Nat. Immunol. 2008, 9, 839
59. Poy, M. N.; Eliasson, L.; Krutzfeldt, J.; Kuwajima, S.; Ma, X.; MacDonald, P. E.; Pfeffer, S.; Tuschl, T.; Rajewsky, N.; Rorsman, P.; Stoffel, M. Nature 2004, 432, 226
60. Greco, S. J.; Rameshwar, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 15484
61. Cheng, H.-Y. M.; Papp, J. W.; Varlamova, O.; Dziema, H.; Russell, B.; Curfman, J. P.; Nakazawa, T.; Shimizu, K.; Okamura, H.; Impey, S.; Obrietan, K. Neuron 2007, 54, 813
62. Leung, A. K.; Sharp, P. A. Mol. Cell 2010, 40, 205
63. Bueno, M. J.; Malumbres, M. Biochim. Biophys. Acta 2011, 1812, 592
64. Lee, R. C.; Feinbaum, R. L.; Ambros, V. Cell 1993, 75, 843
65. Reinhart, B. J.; Slack, F. J.; Basson, M.; Pasquinelli, A. E.; Bettinger, J. C.; Rougvie, A. E.; Horvitz, H. R.; Ruvkun, G. Nature 2000, 403, 901
66. Förstemann, K.; Tomari, Y.; Du, T.; Vagin, V. V.; Denli, A. M.; Bratu, D. P.; Klattenhoff, C.; Theurkauf, W. E.; Zamore, P. D. PLoS Biol. 2005, 3, e236
67. Ketting, R. F.; Fischer, S. E. J.; Bernstein, E.; Sijen, T.; Hannon, G. J.; Plasterk, R. H. A. Genes Dev. 2001, 15, 2654
68. Hatfield, S. D.; Shcherbata, H. R.; Fischer, K. A.; Nakahara, K.; Carthew, R. W.; Ruohola-Baker, H. Nature 2005, 435, 974
69. Giraldez, A. J.; Mishima, Y.; Rihel, J.; Grocock, R. J.; Van Dongen, S.; Inoue, K.; Enright, A. J.; Schier, A. F. Science 2006, 312, 75
70. Choi, W.-Y.; Giraldez, A. J.; Schier, A. F. Science 2007, 318, 271
71. Pauli, A.; Rinn, J. L.; Schier, A. F. Nat. Rev. Genet. 2011, 12, 136
72. Gao, F.-B. Neural Dev. 2010, 5, 25
73. Yoo, A. S.; Staahl, B. T.; Chen, L.; Crabtree, G. R. Nature 2009, 460, 642
74. Yang, B.; Lin, H.; Xiao, J.; Lu, Y.; Luo, X.; Li, B.; Zhang, Y.; Xu, C.; Bai, Y.; Wang, H.; Chen, G.; Wang, Z. Nat. Med. 2007, 13, 486
75. Luo, X.; Lin, H.; Pan, Z.; Xiao, J.; Zhang, Y.; Lu, Y.; Yang, B.; Wang, Z. Biol. Chem. 2008, 283, 20045
76. Thum, T.; Gross, C.; Fiedler, J.; Fischer, T.; Kissler, S.; Bussen, M.; Galuppo, P.; Just, S.; Rottbauer, W.; Frantz, S.; Castoldi, M.; Soutschek, J.; Koteliansky, V.; Rosenwald, A.; Basson, M. A.; Licht, J. D.; Pena, J. T. R.; Rouhanifard, S. H.; Muckenthaler, M. U.; Tuschl, T.; Martin, G. R.; Bauersachs, J.; Engelhardt, S. Nature 2008, 456, 980
77. van Rooij, E.; Sutherland, L. B.; Thatcher, J. E.; DiMaio, J. M.; Naseem, R. H.; Marshall, W. S.; Hill, J. A.; Olson, E. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 13027
78. van Rooij, E.; Sutherland, L. B.; Qi, X.; Richardson, J. A.; Hill, J.; Olson, E. N. Science 2007, 316, 575
79. Care, A.; Catalucci, D.; Felicetti, F.; Bonci, D.; Addario, A.; Gallo, P.; Bang, M.-L.; Segnalini, P.; Gu, Y.; Dalton, N. D.; Elia, L.; Latronico, M. V. G.; Hoydal, M.; Autore, C.; Russo, M. A.; Dorn, G. W.; Ellingsen, O.; Ruiz-Lozano, P.; Peterson, K. L.; Croce, C. M.; Peschle, C.; Condorelli, G. Nat. Med. 2007, 13, 613
80. Najafi-Shoushtari, S. H.; Kristo, F.; Li, Y.; Shioda, T.; Cohen, D. E.; Gerszten, R. E.; Naar, A. M. Science 2010, 328, 1566
81. Zhao, Y.; Ransom, J. F.; Li, A.; Vedantham, V.; von Drehle, M.; Muth, A. N.; Tsuchihashi, T.; McManus, M. T.; Schwartz, R. J.; Srivastava, D. Cell 2007, 129, 303
82. Zhao, G.; Yu, D.; Weiss, M. J. Curr. Opin. Hematol. 2010, 17, 155
83. Li, C.; Feng, Y.; Coukos, G.; Zhang, L. AAPS J. 2009, 11, 747
84. Tang, F.; Kaneda, M.; O'Carroll, D.; Hajkova, P.; Barton, S. C.; Sun, Y. A.; Lee, C.; Tarakhovsky, A.; Lao, K. Q.; Surani, M. A. Genes Dev. 2007, 21, 644
85. Melton, C.; Judson, R. L.; Blelloch, R. Nature 2010, 463, 621
86. Johnson, C. D.; Esquela-Kerscher, A.; Stefani, G.; Byrom, N.; Kelnar, K.; Ovcharenko, D.; Wilson, M.; Wang, X. W.; Shelton, J.; Shingara, J.; Chin, L.; Brown, D.; Slack, F. J. Cancer Res. 2007, 67, 7713
87. Rybak, A.; Fuchs, H.; Hadian, K.; Smirnova, L.; Wulczyn, E. A.; Michel, G.; Nitsch, R.; Krappmann, D.; Wulczyn, F. G. Nat. Cell Biol. 2009, 11, 1411
88. Xu, N.; Papagiannakopoulos, T.; Pan, G. J.; Thomson, J. A.; Kosik, K. S. Cell 2009, 137, 647
89. Yu, F.; Yao, H.; Zhu, P. C.; Zhang, X. Q.; Pan, Q. H.; Gong, C.; Huang, Y. J.; Hu, X. Q.; Su, F. X.; Lieberman, J.; Song, E. Cell 2007, 131, 1109
90. Petrocca, F.; Lieberman, J. Adv. Immunol. 2009, 102, 227
91. Cobb, B. S.; Hertweck, A.; Smith, J.; O'Connor, E.; Graf, D.; Cook, T.; Smale, S. T.; Sakaguchi, S.; Livesey, F. J.; Fisher, A. G.; Merkenschlager, M. J. Exp. Med. 2006, 203, 2519
92. O'Connell, R. M.; Taganov, K. D.; Boldin, M. P.; Cheng, G. H.; Baltimore, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 1604
93. Taganov, K. D.; Boldin, M. P.; Chang, K. J.; Baltimore, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 12481
94. Brown, B. D.; Gentner, B.; Cantore, A.; Colleoni, S.; Amendola, M.; Zingale, A.; Baccarini, A.; Lazzari, G.; Galli, C.; Naldini, L. Nat. Biotechnol. 2007, 25, 1457
95. O'Connell, R. M.; Chaudhuri, A. A.; Rao, D. S.; Baltimore, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 7113
96. Thai, T.-H.; Calado, D. P.; Casola, S.; Ansel, K. M.; Xiao, C.; Xue, Y.; Murphy, A.; Frendewey, D.; Valenzuela, D.; Kutok, J. L.; Schmidt-Supprian, M.; Rajewsky, N.; Yancopoulos, G.; Rao, A.; Rajewsky, K. Science 2007, 316, 604
97. Rodriguez, A.; Vigorito, E.; Clare, S.; Warren, M. V.; Couttet, P.; Soond, D. R.; van Dongen, S.; Grocock, R. J.; Das, P. P.; Miska, E. A.; Vetrie, D.; Okkenhaug, K.; Enright, A. J.; Dougan, G.; Turner, M.; Bradley, A. Science 2007, 316, 608
98. Xiao, C.; Calado, D. P.; Galler, G.; Thai, T.-H.; Patterson, H. C.; Wang, J.; Rajewsky, N.; Bender, T. P.; Rajewsky, K. Cell 2007, 131, 146
99. Li, Q.-J.; Chau, J.; Ebert, P. J. R.; Sylvester, G.; Min, H.; Liu, G.; Braich, R.; Manoharan, M.; Soutschek, J.; Skare, P.; Klein, L. O.; Davis, M. M.; Chen, C.-Z. Cell 2007, 129, 147
100. Yin, J. Q.; Zhao, R. C.; Morris, K. V. Trends Biotechnol. 2008, 26, 70
101. Stenvang, J.; Silahtaroglu, A. N.; Lindow, M.; Elmen, J.; Kauppinen, S. Semin. Cancer Biol. 2008, 18, 89
102. Calin, G. A.; Dumitru, C. D.; Shimizu, M.; Bichi, R.; Zupo, S.; Noch, E.; Aldler, H.; Rattan, S.; Keating, M.; Rai, K.; Rassenti, L.; Kipps, T.; Negrini, M.; Bullrich, F.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 15524
103. Cimmino, A.; Calin, G. A.; Fabbri, M.; Iorio, M. V.; Ferracin, M.; Shimizu, M.; Wojcik, S. E.; Aqeilan, R. I.; Zupo, S.; Dono, M.; Rassenti, L.; Alder, H.; Volinia, S.; Liu, C.-G.; Kipps, T. J.; Negrini, M.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 13944
104. Lu, J.; Getz, G.; Miska, E. A.; Alvarez-Saavedra, E.; Lamb, J.; Peck, D.; Sweet-Cordero, A.; Ebert, B. L.; Mak, R. H.; Ferrando, A. A.; Downing, J. R.; Jacks, T.; Horvitz, H. R.; Golub, T. R. Nature 2005, 435, 834
105. Porkka, K. P.; Pfeiffer, M. J.; Waltering, K. K.; Vessella, R. L.; Tammela, T. L. J.; Visakorpi, T. Cancer Res. 2007, 67, 6130
106. Volinia, S.; Calin, G. A.; Liu, C.-G.; Ambs, S.; Cimmino, A.; Petrocca, F.; Visone, R.; Iorio, M.; Roldo, C.; Ferracin, M.; Prueitt, R. L.; Yanaihara, N.; Lanza, G.; Scarpa, A.; Vecchione, A.; Negrini, M.; Harris, C. C.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 2257
107. Mitchell, P. S.; Parkin, R. K.; Kroh, E. M.; Fritz, B. R.; Wyman, S. K.; Pogosova-Agadjanyan, E. L.; Peterson, A.; Noteboom, J.; O'Briant, K. C.; Allen, A.; Lin, D. W.; Urban, N.; Drescher, C. W.; Knudsen, B. S.; Stirewalt, D. L.; Gentleman, R.; Vessella, R. L.; Nelson, P. S.; Martin, D. B.; Tewari, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 10513
108. Kumar, M. S.; Lu, J.; Mercer, K. L.; Golub, T. R.; Jacks, T. Nat. Genet. 2007, 39, 673
109. Costinean, S.; Zanesi, N.; Pekarsky, Y.; Tili, E.; Volinia, S.; Heerema, N.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 7024
110. Kluiver, J.; Poppema, S.; de Jong, D.; Blokzijl, T.; Harms, G.; Jacobs, S.; Kroesen, B. J.; van den Berg, A. J. Pathol. 2005, 207, 243
111. Kluiver, J.; Haralambieva, E.; de Jong, D.; Blokzijl, T.; Jacobs, S.; Kroesen, B. J.; Poppema, S.; van den Berg, A. Genes, Chromosomes Cancer 2006, 45, 147
112. Eis, P. S.; Tam, W.; Sun, L.; Chadburn, A.; Li, Z.; Gomez, M. F.; Lund, E.; Dahlberg, J. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 3627
113. He, L.; Thomson, J. M.; Hemann, M. T.; Hernando-Monge, E.; Mu, D.; Goodson, S.; Powers, S.; Cordon-Cardo, C.; Lowe, S. W.; Hannon, G. J.; Hammond, S. M. Nature 2005, 435, 828
114. Hatley, M. E.; Patrick, D. M.; Garcia, M. R.; Richardson, J. A.; Bassel-Duby, R.; van Rooij, E.; Olson, E. N. Cancer Cell 2010, 18, 282
115. He, L.; He, X.; Lim, L. P.; de Stanchina, E.; Xuan, Z.; Liang, Y.; Xue, W.; Zender, L.; Magnus, J.; Ridzon, D.; Jackson, A. L.; Linsley, P. S.; Chen, C.; Lowe, S. W.; Cleary, M. A.; Hannon, G. J. Nature 2007, 447, 1130
116. Kumar, M. S.; Erkeland, S. J.; Pester, R. E.; Chen, C. Y.; Ebert, M. S.; Sharp, P. A.; Jacks, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 3903
117. Farazi, T. A.; Spitzer, J. I.; Morozov, P.; Tuschl, T. J. Pathol. 2011, 223, 102
118. Xiao, J.; Luo, X.; Lin, H.; Zhang, Y.; Lu, Y.; Wang, N.; Yang, B.; Wang, Z. J. Biol. Chem. 2007, 282, 12363
119. Fiore, R.; Siegel, G.; Schratt, G. Biochim. Biophys. Acta, Gen. Subj. 2008, 1779, 471
120. Baker, M. Nat. Methods 2010, 7, 687
121. Chapin, S. C.; Appleyard, D. C.; Pregibon, D. C.; Doyle, P. S. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 2289
122. Liang, Y.; Ridzon, D.; Wong, L.; Chen, C. BMC Genomics 2007, 8, 166
123. Ibberson, D.; Benes, V.; Muckenthaler, M.; Castoldi, M. BMC Biotechnol. 2009, 9, 102
124. Xi, Y.; Nakajima, G.; Gavin, E.; Morris, C. G.; Kudo, K.; Hayashi, K.; Ju, J. RNA 2007, 13, 1668
125. Arroyo, J. D.; Chevillet, J. R.; Kroh, E. M.; Ruf, I. K.; Pritchard, C. C.; Gibson, D. F.; Mitchell, P. S.; Bennett, C. F.; Pogosova-Agadjanyan, E. L.; Stirewalt, D. L.; Tait, J. F.; Tewari, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 5003
126. McDonald, J. S.; Milosevic, D.; Reddi, H. V.; Grebe, S. K.; Algeciras-Schimnich, A. Clin. Chem. 2011, 57, 833
127. Beuvink, I.; Kolb, F. A.; Budach, W.; Garnier, A.; Lange, J.; Natt, F.; Dengler, U.; Hall, J.; Filipowicz, W.; Weiler, J. Nucleic Acids Res. 2007, 35, e52
128. Castoldi, M.; Benes, V.; Hentze, M. W.; Muckenthaler, M. U. Methods 2007, 43, 146
129. Kroh, E. M.; Parkin, R. K.; Mitchell, P. S.; Tewari, M. Methods 2010, 50, 298
130. Lagos-Quintana, M.; Rauhut, R.; Lendeckel, W.; Tuschl, T. Science 2001, 294, 853
131. Berezikov, E.; Cuppen, E.; Plasterk, R. H. A. Nat. Genet. 2006, 38, S2
132. Ruby, J. G.; Jan, C.; Player, C.; Axtell, M. J.; Lee, W.; Nusbaum, C.; Ge, H.; Bartel, D. P. Cell 2006, 127, 1193
133. Wu, Y.-Q.; Chen, D.-J.; He, H.-B.; Chen, D.-S.; Chen, L.-L.; Chen, H.-C.; Liu, Z.-F. PLoS One 2012, 7, e30988
134. Koscianska, E.; Starega-Roslan, J.; Krzyzosiak, W. J. PLoS One 2011, 6, e28548
135. Dangwal, S.; Bang, C.; Thum, T. Cardiovasc. Res. 2012, 93, 545
136. Wark, A. W.; Lee, H. J.; Corn, R. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 644
137. Tang, X.; Gal, J.; Zhuang, X.; Wang, W.; Zhu, H.; Tang, G. RNA 2007, 13, 1803
138. Ramkissoon, S. H.; Mainwaring, L. A.; Sloand, E. M.; Young, N. S.; Kajigaya, S. Mol. Cell. Probes 2006, 20, 1
139. Koscianska, E.; Starega-Roslan, J.; Sznajder, L.; Olejniczak, M.; Galka-Marciniak, P.; Krzyzosiak, W. BMC Mol. Biol. 2011, 12, 14
140. Pall, G. S.; Codony-Servat, C.; Byrne, J.; Ritchie, L.; Hamilton, A. Nucleic Acids Res. 2007, 35, e60
141. Pall, G. S.; Hamilton, A. J. Nat. Protoc. 2008, 3, 1077
142. Kim, S. W.; Li, Z.; Moore, P. S.; Monaghan, A. P.; Chang, Y.; Nichols, M.; John, B. Nucleic Acids Res. 2010, 38, e9
143. Várallyay, é.; Burgyán, J.; Havelda, Z. Methods 2007, 43, 140
144. Varallyay, E.; Burgyan, J.; Havelda, Z. Nat. Protoc. 2008, 3, 190
145. Válóczi, A.; Hornyik, C.; Varga, N.; Burgyán, J.; Kauppinen, S.; Havelda, Z. Nucleic Acids Res. 2004, 32, e175
146. Li, W.; Ruan, K. Anal. Bioanal. Chem. 2009, 394, 1117
147. Lee, J. M.; Jung, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 12487
148. Liu, C.-G.; Calin, G. A.; Meloon, B.; Gamliel, N.; Sevignani, C.; Ferracin, M.; Dumitru, C. D.; Shimizu, M.; Zupo, S.; Dono, M.; Alder, H.; Bullrich, F.; Negrini, M.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 9740
149. Thomson, J. M.; Parker, J.; Perou, C. M.; Hammond, S. M. Nat. Methods 2004, 1, 47
150. Castoldi, M.; Schmidt, S.; Benes, V.; Noerholm, M.; Kulozik, A. E.; Hentze, M. W.; Muckenthaler, M. U. RNA 2006, 12, 913
151. Wang, H.; Ach, R. A.; Curry, B. RNA 2007, 13, 151
152. Krichevsky, A. M.; King, K. S.; Donahue, C. P.; Khrapko, K.; Kosik, K. S. RNA 2003, 9, 1274
153. Nelson, P. T.; Baldwin, D. A.; Scearce, L. M.; Oberholtzer, J. C.; Tobias, J. W.; Mourelatos, Z. Nat. Methods 2004, 1, 155
154. Neely, L. A.; Patel, S.; Garver, J.; Gallo, M.; Hackett, M.; McLaughlin, S.; Nadel, M.; Harris, J.; Gullans, S.; Rooke, J. Nat. Methods 2006, 3, 41
155. Sato, F.; Tsuchiya, S.; Terasawa, K.; Tsujimoto, G. PLoS One 2009, 4, e5540
156. Duan, D.; Zheng, K. X.; Shen, Y.; Cao, R.; Jiang, L.; Lu, Z.; Yan, X.; Li, J. Nucleic Acids Res. 2011, 39, e154
157. Git, A.; Dvinge, H.; Salmon-Divon, M.; Osborne, M.; Kutter, C.; Hadfield, J.; Bertone, P.; Caldas, C. RNA 2010, 16, 991
158. Lee, J. M.; Cho, H.; Jung, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 8662
159. Qavi, A. J.; Bailey, R. C. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 4608
160. Shen, Y.; Zheng, K. X.; Duan, D. M.; Jiang, L.; Li, J. Anal. Chem. 2012, 84, 6361
161. Jinek, M.; Doudna, J. A. Nature 2009, 457, 405
162. Aravin, A.; Tuschl, T. FEBS Lett. 2005, 579, 5830
163. Gaur, A.; Jewell, D. A.; Liang, Y.; Ridzon, D.; Moore, J. H.; Chen, C.; Ambros, V. R.; Israel, M. A. Cancer Res. 2007, 67, 2456
164. van Rooij, E. Circ. Res. 2011, 108, 219
165. Reichenstein, I.; Aizenberg, N.; Goshen, M.; Bentwich, Z.; Avni, Y. S. J. Virol. Methods 2010, 163, 323
166. Ro, S.; Park, C.; Jin, J.; Sanders, K. M.; Yan, W. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006, 351, 756
167. Kumar, P.; Johnston, B. H.; Kazakov, S. A. RNA 2011, 17, 365
168. Chen, C.; Ridzon, D. A.; Broomer, A. J.; Zhou, Z.; Lee, D. H.; Nguyen, J. T.; Barbisin, M.; Xu, N. L.; Mahuvakar, V. R.; Andersen, M. R.; Lao, K. Q.; Livak, K. J.; Guegler, K. J. Nucleic Acids Res. 2005, 33, e179
169. Raymond, C. K.; Roberts, B. S.; Garrett-Engele, P.; Lim, L. P.; Johnson, J. M. RNA 2005, 11, 1737
170. Wu, H.; Ye, C.; Ramirez, D.; Manjunath, N. PLoS One 2009, 4, e7566
171. Yang, H.; Schmuke, J. J.; Flagg, L. M.; Roberts, J. K.; Allen, E. M.; Ivashuta, S.; Gilbertson, L. A.; Armstrong, T. A.; Christian, A. T. Plant Biotechnol. J. 2009, 7, 621
172. Wan, G.; Lim, Q. E.; Too, H. P. RNA 2010, 16, 1436
173. Sharbati-Tehrani, S.; Kutz-Lohroff, B.; Bergbauer, R.; Scholven, J.; Einspanier, R. BMC Mol. Biol. 2008, 9, 34
174. Wang, X. RNA 2009, 15, 716
175. Mestdagh, P.; Van Vlierberghe, P.; De Weer, A.; Muth, D.; Westermann, F.; Speleman, F.; Vandesompele, J. Genome Biol. 2009, 10, R64
176. Arefian, E.; Kiani, J.; Soleimani, M.; Shariati, S. A.; Aghaee-Bakhtiari, S. H.; Atashi, A.; Gheisari, Y.; Ahmadbeigi, N.; Banaei-Moghaddam, A. M.; Naderi, M.; Namvarasl, N.; Good, L.; Faridani, O. R. Nucleic Acids Res. 2011, 39, e80
177. Lu, Z.; Duan, D.; Cao, R.; Zhang, L.; Zheng, K.; Li, J. Chem. Commun. 2011, 47, 7452
178. Zhang, J.; Li, Z.; Wang, H.; Wang, Y.; Jia, H.; Yan, J. Chem. Commun. 2011, 47, 9465
179. Crew, E.; Rahman, S.; Razzak-Jaffar, A.; Mott, D.; Kamundi, M.; Yu, G.; Tchah, N.; Lee, J.; Bellavia, M.; Zhong, C. J. Anal. Chem. 2012, 84, 26
180. Yin, H. S.; Zhou, Y. L.; Chen, C. X.; Zhu, L. S.; Ai, S. Y. Analyst 2012, 137, 1389
181. Wanunu, M.; Dadosh, T.; Ray, V.; Jin, J. M.; McReynolds, L.; Drndić, M. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 807
182. Fan, Y.; Chen, X. T.; Trigg, A. D.; Tung, C. H.; Kong, J. M.; Gao, Z. Q. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 5437
183. Gao, Z. Q.; Yang, Z. C. Anal. Chem. 2006, 78, 1470
184. Peng, Y. F.; Gao, Z. Q. Anal. Chem. 2011, 83, 820
185. Zhang, Y. L.; Li, Z. P.; Cheng, Y. Q.; Lv, X. C. Chem. Commun. 2009, 3172
186. Alhasan, A. H.; Kim, D. Y.; Daniel, W. L.; Watson, E.; Meeks, J. J.; Thaxton, C. S.; Mirkin, C. A. Anal. Chem. 2012, 84, 4153
187. Yang, S. W.; Vosch, T. Anal. Chem. 2011, 83, 6935
188. Liu, Y. Q.; Zhang, M.; Yin, B. C.; Ye, B. C. Anal. Chem. 2012, 84, 5165
189. Wang, H. N.; Vo-Dinh, T. Small 2011, 7, 3067
190. Baigude, H.; Ahsanullah, Li, Z. H.; Zhou, Y.; Rana, T. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 5880
191. Li, Y.; Zhang, C. Y. Anal. Chem. 2012, 84, 5097
192. Siva, A. C.; Nelson, L. J.; Fleischer, C. L.; Majlessi, M.; Becker, M. M.; Vessella, R. L.; Reynolds, M. A. Mol. Cancer 2009, 8, 17
193. Yao, B.; Li, Y.; Huang, H.; Sun, C. H.; Wang, Z.; Fan, Y.; Chang, Q.; Li, S. L.; Xi, J. Z. RNA 2009, 15, 1787
194. Davies, B. P.; Arenz, C. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 5550
195. Cui, L.; Lin, X. Y.; Lin, N. H.; Song, Y. L.; Zhu, Z.; Chen, X.; Yang, C. J. Chem. Commun. 2012, 48, 194
196. Yin, B. C.; Liu, Y. Q.; Ye, B. C. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 5064
197. Hartig, J. S.; Grüne, I.; Najafi-Shoushtari, S. H.; Famulok, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 722
198. Yan, J. L.; Li, Z. P.; Liu, C. H.; Cheng, Y. Q. Chem. Commun. 2010, 46, 2432
199. Li, J.; Yao, B.; Huang, H.; Wang, Z.; Sun, C. H.; Fan, Y.; Chang, Q.; Li, S. L.; Wang, X.; Xi, J. Z. Anal. Chem. 2009, 81, 5446
200. Harcourt, E. M.; Kool, E. T. Nucleic Acids Res. 2012, 40, e65
201. Zhou, Y. T.; Huang, Q.; Gao, J. M.; Lu, J. X.; Shen, X. Z.; Fan, C. H. Nucleic Acids Res. 2010, 38, e156
202. Jonstrup, S. P.; Koch, J.; Kjems, J. RNA 2006, 12, 1747
203. Cheng, Y. Q.; Zhang, X.; Li, Z. P.; Jiao, X. X.; Wang, Y. C.; Zhang, Y. L. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 3268
204. Mashimo, Y.; Mie, M.; Suzuki, S.; Kobatake, E. Anal. Bioanal. Chem. 2011, 401, 221
205. Chapin, S. C.; Doyle, P. S. Anal. Chem. 2011, 83, 7179
206. Dong, H. F.; Zhang, J.; Ju, H. X.; Lu, H. T.; Wang, S. Y.; Jin, S.; Hao, K. H.; Du, H. W.; Zhang, X. J. Anal. Chem. 2012, 84, 4587
207. Jia, H. X.; Li, Z. P.; Liu, C. H.; Cheng, Y. Q. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5498
208. Bi, S.; Zhang, J. L.; Hao, S. Y.; Ding, C. F.; Zhang, S. S. Anal. Chem. 2011, 83, 3696
209. Yu, H. P.; Hsiao, Y. L.; Pan, H. Y.; Huang, C. H.; Hou, S. Y. Anal. Biochem. 2011, 419, 228
210. Zhang, Y.; Zhang, C. Y. Anal. Chem. 2012, 84, 224
211. Jørgensen, S.; Baker, A.; Møller, S.; Nielsen, B. S. Methods 2010, 52, 375
212. Ostergaard, M. E.; Hrdlicka, P. J. Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 5771
213. Yin, H. S.; Zhou, Y. L.; Zhang, H. X.; Meng, X. M.; Ai, S. Y. Biosens. Bioelectron. 2012, 33, 247
214. Ma, C. B.; Yeung, E. S.; Qi, S. D.; Han, R. Anal. Bioanal. Chem. 2012, 402, 2217
215. Baker, M. B.; Bao, G.; Searles, C. D. Nucleic Acids Res. 2012, 40, e13
216. Søe, M. J.; Møller, T.; Dufva, M.; Holmstrøm, K. J. Histochem. Cytochem. 2011, 59, 661
217. Nasheri, N.; Cheng, J.; Singaravelu, R.; Wu, P.; McDermott, M. T.; Pezacki, J. P. Anal. Biochem. 2011, 412, 165
218. Šípová, H.; Zhang, S. L.; Dudley, A. M.; Galas, D.; Wang, K.; Homola, J. Anal. Chem. 2010, 82, 10110
219. Fang, S. P.; Lee, H. J.; Wark, A. W.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14044
220. Zhou, W. J.; Chen, Y. L.; Corn, R. M. Anal. Chem. 2011, 83, 3897
221. Driskell, J. D.; Seto, A. G.; Jones, L. P.; Jokela, S.; Dluhy, R. A.; Zhao, Y. P.; Tripp, R. A. Biosens. Bioelectron. 2008, 24, 917
222. Driskell, J. D.; Tripp, R. A. Chem. Commun. 2010, 46, 3298
223. Xu, F. G.; Dong, C. Q.; Xie, C.; Ren, J. C. Chem.-Eur. J. 2010, 16, 1010
224. Chang, P. L.; Chang, Y. S.; Chen, J. H.; Chen, S. J.; Chen, H. C. Anal. Chem. 2008, 80, 8554
225. Jiang, R. M.; Chang, Y. S.; Chen, S. J.; Chen, J. H.; Chen, H. C.; Chang, P. L. J. Chromatogr., A 2011, 1218, 2604
226. Khan, N.; Cheng, J.; Pezacki, J. P.; Berezovski, M. V. Anal. Chem. 2011, 83, 6196
227. Dodgson, B. J.; Mazouchi, A.; Wegman, D. W.; Gradinaru, C. C.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2012, 84, 5470
228. Persat, A.; Chivukula, R. R.; Mendell, J. T.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2010, 82, 9631
229. Persat, A.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2011, 83, 2310
230. Gao, Z. Q.; Yu, Y. H. Sens. Actuators, B 2007, 121, 552
231. Gao, Z. Q. Analyst 2012, 137, 1674
232. Gao, Z. Q.; Peng, Y. F. Biosens. Bioelectron. 2011, 26, 3768
233. Gao, Z. Q.; Yu, Y. H. Biosens. Bioelectron. 2007, 22, 933
234. Wang, J. X.; Yi, X. Y.; Tang, H. L.; Han, H. X.; Wu, M. H.; Zhou, F. M. Anal. Chem. 2012, 84, 6400
235. Pöhlmann, C.; Sprinzl, M. Anal. Chem. 2010, 82, 4434
236. Qavi, A. J.; Kindt, J. T.; Gleeson, M. A.; Bailey, R. C. Anal. Chem. 2011, 83, 5949
237. Zhang, G. J.; Chua, J. H.; Chee, R.-E.; Agarwal, A.; Wong, S. M. Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 2504
238. Dorvel, B. R.; Reddy, B., Jr.; Go, J.; Guevara, C. D.; Salm, E.; Alam, M. A.; Bashir, R. ACS Nano 2012, 6, 6150
239. Ogawa, A. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010, 20, 6056
240. Li, J. S.; Schachermeyer, S.; Wang, Y.; Yin, Y. D.; Zhong, W. W. Anal. Chem. 2009, 81, 9723
241. Shingara, J.; Keiger, K.; Shelton, J.; Laosinchai-Wolf, W.; Powers, P.; Conrad, R.; Brown, D.; Labourier, E. RNA 2005, 11, 1461
242. Sharbati-Tehrani, S.; Kutz-Lohroff, B.; Ramona, B.; Jutta, S.; Ralf, E. Mol. Biol. 2008, 9, 1471
243. Wu, Z. S.; Wang, C. Q.; Xian, R.; Liu, X.; Ye, S.; Yang, X. Q.; Zhang, G. H.; Xu, X. C.; Zhu, T.; Wu, Q. BMC Cancer 2012, 12, 51
244. Gibcus, J. H.; Tan, L. P.; Harms, G.; Schakel, R. N.; Jong, D. D.; Blokzijl, T.; Möller, P.; Poppema, S.; Kroesen, B. J.; Berg, V. D. A. Neoplasia 2009, 11, 167
245. Varkonyi-Gasic, E.; Hellens, R. P. Methods Mol. Biol. 2010, 631, 109
246. Lee, E. J.; Baek, M.; Gusev, Y.; Brackett, D. J.; Nuovo, G. J.; Schmittgen, T. D. RNA 2008, 14, 35
247. Wyman, S. K.; Parkin, R. K.; Mitchell, P. S.; Fritz, B. R.; Briant, K.; Godwin, A. K.; Urban, N.; Drescher, C. W.; Knudsen, B. S.; Tewari, M. PLoS One 2009, 4, 5311
248. Marti, E.; Pantano, L.; Banez-Coronel, M.; Llorens, F.; Minones-Moyano, E.; Porta, S.; Sumoy, L.; Ferrer, I.; Estivill, X. Nucleic Acids Res. 2010, 38, e7219
249. Griffiths-Jones, S. Methods Mol. Biol. 2006, 342, 129
250. Chen, J.; Lozach, J.; Garcia, E. W.; Barnes, B.; Luo, S. J.; Mikoulitch, I.; Zhou, L. X.; Schroth, G.; Fan, J. B. Nucleic Acids Res. 2008, 36, e87
251. Siegrist, F.; Singer, T.; Certa, U. Biol. Proced. Online 2009, 11, 113
252. Castoldi, M.; Schmidt, S.; Benes, V.; Hentze, M. W.; Muckenthaler, M. U. Nat. Protoc. 2008, 3, 321
253. Schneider, M.; Andersen, D. C.; Silahtaroglu, A.; Lyngbæk, S.; Kauppinen, S.; Hansen, J. L.; Sheikh, S. P. J. Mol. Histol. 2011, 42, 289
254. Vargas, D. Y.; Raj, A.; Marras, S. A.; Kramer, F. R.; Tyagi, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 17008
255. Raj, A.; Peskin, C. S.; Tranchina, D.; Vargas, D. Y.; Tyagi, S. PLoS Biol. 2006, 4, 309
256. Raap, A. K.; Van de Corput, M. P.; Vervenne, R. A.; Van Gijlswijk, R. P. M; Tanke, H. J.; Wiegant, J. Hum. Mol. Genet. 1995, 4, 529
257. Darnell, D. K.; Stanislaw, S.; Kaur, S.; Antin, P. B. RNA 2010, 16, 632
258. Thompson, R. C.; Deo, M.; Turner, D. L. Methods 2007, 43, 153
259. Levsky, J. M.; Shenoy, S. M.; Pezo, R. C.; Singer, R. H. Science 2002, 297, 836
260. Raj, A.; Vanden, B. P.; Rifkin, S. A.; Van, O. A.; Tyagi, S. Nat. Methods 2008, 5, 877
261. Politz, R.; J., C.; Zhang, F.; Pederson, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 18957
262. Kloosterman, W. P.; Wienholds, E.; De, B. E.; Kauppinen, S.; Plasterk, R. H. Nat. Methods 2006, 3, 27
263. Wienholds, E.; Kloosterman, W. P.; Miska, E.; Alvarez-Saavedra, E.; Berezikov, E.; De, B. E.; Horvitz, H. R.; Kauppinen, S.; Plasterk, R. H. Science 2005, 309, 310
264. Planell-Saguer, M. D.; Rodicio, M. C.; Mourelatos, Z. Nat. Protoc. 2010, 5, 1061
265. Nuovo, G. J. Methods 2008, 44, 39
266. Nuovo, G. J. PCR In Situ Hybridization: Protocols and Applications; Lippincott, Williams and Wilkins, Raven Press: New York, 1996.
267. Deo, M.; Yu, J. Y.; Chung, K. H.; Tippens, M.; Turner, D. L. Dev. Dyn. 2006, 235, 2538
268. Langer, P. R.; Waldrop, A. A.; Ward, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1981, 78, 6633
269. Femino, A. M.; Fay, F. S.; Fogarty, K.; Singer, R. H. Science 1998, 280, 585
270. Kislauskis, E. H.; Li, Z.; Singer, R. H.; Taneja, K. L. J. Cell Biol. 1993, 123, 165
271. Lu, J.; Tsourkas, A. Nucleic Acids Res. 2009, 37, e100
272. Zhang, J.; Fu, Y.; Mei, Y. P.; Jiang, F.; Lakowicz, J. R. Anal. Chem. 2010, 82, 4464
273. Gambhir, S. S.; Barrio, J. R.; Herschman, H. R. Nucl. Med. Biol. 1999, 26, 481
274. Blasberg, R. G. Nucl. Med. Biol. 2003, 30, 879
275. Wang, X.; Rosol, M.; Ge, S. Blood 2003, 102, 3478
276. Kim, K. I.; Chung, J. K.; Kang, J. H. Clin. Cancer Res. 2005, 11, 123
277. Brasier, A. R.; Tate, J. E.; Habener, J. F. Biotechniques 1989, 7, 1116
278. Gould, S. J.; Subramani, S. Anal. Biochem. 1988, 175, 5
279. Tannous, B. A.; Kim, D. E.; Fernandez, J. L. Mol. Ther. 2005, 11, 435
280. Ottobrini, L.; Ciana, P.; Biserni, A. Mol. Cell. Endocrinol. 2006, 246, 69
281. Doubrovin, M.; Serganova, I.; Mayer-Kuckuk, P. Bioconjugate Chem. 2004, 15, 1376
282. Kim, S.; Hwang, D. W.; Lee, D. S. FEBS J. 2009, 276, 2165
283. Lee, Y.; Jeon, K.; Lee, J. T.; Kim, S.; Kim, V. N. EMBO J. 2002, 21, 4663
284. Lee, J. Y.; Kim, S.; Hwang, D. W. J. Nucl. Med. 2008, 49, 285
285. Ko, M. H.; Kim, S.; Hwang, D. W. FEBS J. 2008, 275, 2605
286. Davies, B. P.; Arenz, C. Bioorg. Med. Chem. 2008, 16, 49
287. Kim, H. J.; Kim, Y. H.; Lee, D. S.; Chung, J. K.; Kim, S. J. Nucl. Med. 2008, 49, 1686
288. Thomson, J. M.; Newman, M.; Parker, J. S. Genes Dev. 2006, 20, 2202
289. Cao, X.; Yeo, G.; Muotri, A. R.; Kuwabara, T.; Gag, F. H. Annu. Rev. Neurosci. 2006, 229, 77
290. Ambros, V. Nature 2004, 431, 350
291. Yan, X.; Chao, T.; Tu, K.; Zhang, Y.; Xie, L.; Gong, Y.; Yuan, J.; Qiang, B.; Peng, X. FEBS Lett. 2007, 581, 1587
292. Ko, H. Y.; Lee, D. S.; Kim, S. FEBS J. 2009, 276, 4854
293. Corsten, M. F.; Miranda, R.; Kasmieh, R.; Krichevsky, A. M.; Weissleder, R.; Shah, K. Cancer Res. 2007, 67, 8994
294. Wessels, J. T.; Yamauchi, K.; Hoffman, R. M.; Wouters, F. S. Cytometry, Part A. 2010, 77, 667
295. Kato, Y.; Miyaki, S.; Yokoyama, S.; Omori, S.; Inoue, A. Int. J. Biochem. Cell. Biol. 2009, 41, 2225
296. Kato, Y.; Sawata, S.; Inoue, A. J. Biochem. 2010, 147, 63
297. Brown, B. D.; Venneri, M. A.; Zingale, A.; Sergi, L.; Naldini, L. Nat. Med. 2006, 12, 585
298. You, X. Y.; Zhang, Z. P.; Fan, J. Y.; Cui, Z. Q.; Zhang, X. E. PLOS One 2012, 7, e36157
299. Tyaji, S.; Kramer, F. R. Nat. Biotechnol. 1996, 14, 303
300. Salvatore, A. E.; Marras, F. R.; Sanjay, T. Nucleic Acids Res. 2002, 30, e122
301. Marras, S. A. Methods Mol. Biol. 2006, 335, 3
302. Wang, W.; Cui, Z. Q.; Han, H.; Zhang, Z. P.; Wei, H. P.; Zhou, Y. F.; Chen, Z.; Zhang, X. E. Nucleic Acids Res. 2008, 36, e4913
303. Wu, J. C.; Zou, Y.; Li, C. Y.; Sicking, W.; Piantanida, I.; Yi, T.; Schmuck, C. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 1958
304. Sokol, D.; Zhang, X. L.; Lu, P.; Gewirtz, A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 95, 11538
305. Kang, W. J.; Cho, Y. L.; Chae, J. R.; Lee, J. D.; Choi, K. J.; Kim, S. Biomaterials 2011, 32, 1915
306. Hwang, do W.; Song, I. C.; Lee, D. S.; Kim, S. Small 2010, 6, 81
307. Dong, H. F.; Ding, L.; Yan, F.; Ji, H. X.; Ju, H. X. Biomaterials 2011, 322, 3875
308. Dong, H. F.; Lei, J. P.; Ju, H. X.; Zhi, F.; Wang, H..; Guo, W.; Zhu, Z.; Yan, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2012, 51, 4607
309. Jun, Y. W.; Lee, J. H.; Cheon, J. W. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 5122
310. Fox, M. D.; Raichle, M. E. Nat. Rev. Neurosci. 2007, 8, 700
311. Kang, J. H.; Chung, J. K. J. Nucl. Med. 2008, 49, 164
312. Lee, J. H.; Lee, K. S.; Moon, H.; Lee, Y. H.; Park, T. G.; Cheon, J. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 4174
313. Rutman, A. M.; Kuo, M. D. Eur. J. Radiol. 2009, 70, 232
314. Zinn, P. O.; Majadan, B.; Sathyan, P.; Singh, S. K.; Majumder, S.; Jolesz, F. A.; Colen, R. R. PLoS One 2011, 6, 25451
315. Weber, J. A.; Baxter, D. H.; Zhang, S.; Huang, D. Y.; Huang, K. H.; Lee, M. J.; Galas, D. J.; Wang, K. Clin. Chem. 2010, 56, 1733
316. Wang, K.; Zhang, S.; Marzolf, B.; Troisch, P.; Brightman, A.; Hu, Z. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 4402
317. Zhang, Y. J.; Liu, D. Q.; Chen, X.; Li, J.; Li, L. M.; Bian, Z.; Sun, F.; Lu, J. W.; Yin, Y.; Cai, X.; Sun, Q.; Wang, K. H.; Ba, Y.; Wang, Q.; Wang, D. J.; Yang, J. W.; Liu, P. S.; Xu, T.; Yan, Q.; Zhang, J. F.; Zen, K.; Zhang, C. Y. Mol. Cell 2010, 39, 133
318. Skog, J.; Würdinger, T.; van Rijn, S.; Meijer, D. H.; Gainche, L.; Sena-Esteves, M.; Curry, W. T.; Carter, B. S., Jr.; Krichevsky, A. M.; Breakefield, X. O. Nat. Cell Biol. 2008, 10, 1470
319. Wang, K.; Zhang, S. L.; Jessica, W.; David, B.; Galas, D. J. Nucleic Acids Res. 2010, 38, e7248
320. Chen, X.; Ba, Y.; Ma, L.; Ma, L. J.; Cai, X.; Yin, Y.; Wang, J. H.; Guo, J. G.; Zhang, Y. J.; Chen, J. N.; Guo, X.; Li, Q. B.; Li, X. Y.; Wang, W. J.; Zhang, Y.; Wang, J.; Jiang, X. Y.; Xiang, Y.; Xu, C.; Zheng, P. P.; Zhang, J. B.; Li, R. Q.; Zhang, H. J.; Shang, X. B.; Gong, T.; Ning, G.; Wang, J.; Zen, K.; Zhang, J. F.; Zhang, C. Y. Cell Res. 2008, 18, 997
321. Kosaka, N.; Iguchi, H.; Ochiya, T. Cancer Sci. 2010, 101, 2087
322. Zampetaki1, A.; Willeit, P.; Drozdov, I.; Kiechl, S.; Mayr1, M. Cardiovasc. Res. 2012, 93, 555
323. Thery, C.; Zitvogel, L.; Amigorena, S. Nat. Rev. Immunol. 2002, 2, 569
324. Camussi, G.; Deregibus, M. C.; Bruno, S.; Cantaluppi, V.; Biancone, L. Kidney. Int. 2010, 78, 838
325. Thery, C.; Boussac, M.; Veron, P.; Ricciardi-Castagnoli, P.; Raposo, G.; Garin, J.; Amigorena, S. J. Immunol. 2001, 166, 7309
326. Ratajczak, J.; Wysoczynski, M.; Hayek, F.; Janowska-Wieczorek, A.; Ratajczak, M. Z. Leukemia 2006, 20, 1487
327. Pigati, L.; Yaddanapudi, S. C.; Iyengar, R.; Kim, D. J.; Hearn, S. A.; Danforth, D.; Hastings, M. L.; Duelli, D. M. PLoS One 2010, 5, 13515
328. Valadi, H. Nat. Cell Biol. 2007, 9, 654
329. Hunter, M. P.; Ismail, N.; Zhang, X.; Aguda, B. D.; Lee, E. J.; Yu, L.; Xiao, T.; Schafer, J.; Lee, M. L.; Schmittgen, T. D.; Nana-Sinkam, S. P.; Jarjoura, D.; Marsh, C. B. PLoS One 2008, 3, 3694
330. Yuan, A.; Farber, E. L.; Rapoport, A. L.; Tejada, D.; Deniskin, R.; Akhmedov, N. B.; Debora, B. F. PLoS One 2009, 4, e4722
331. Prokopi, M.; Pula, G.; Mayr, U.; Devue, C.; Gallagher, J.; Xiao, Q.; Boulanger, C. M.; Westwood, N.; Urbich, C.; Willeit, J.; Steiner, M.; Breuss, J.; Xu, Q.; Kiechl, S.; Mayr, M. Blood 2009, 114, 723
332. Pula, G.; Perera, S.; Prokopi, M.; Sidibe, A.; Boulanger, C. M.; Mayr, M. Proteomics: Clin. Appl. 2008, 2, 882
333. Beyer, C.; Pisetsky, D. S. Nat. Rev. Rheumatol. 2010, 6, 21
334. Aaron, F.; Orozco; Dorothy, E. L. Cytometry, Part A 2010, 77, 502
335. Esquela-Kerscher, A.; Slack, F. J. Nat. Rev. Cancer 2006, 6, 259
336. Zernecke, A.; Bidzhekov, K.; Noels, H.; Shagdarsuren, E.; Gan, L.; Denecke, B.; Hristov, M.; Köppel, T.; Jahantigh, M. N.; Lutgens, E.; Wang, S.; Olson, E. N.; Schober, A.; Weber, C. Sci. Signaling 2009, 2, 81
337. Miyanishi, M.; Tada, K.; Koike, M.; Uchiyama, Y.; Kitamura, T.; Nagata, S. Nature 2007, 450, 435
338. Vickers, K. C.; Palmisano, B. T.; Shoucri, B. M.; Shamburek, R. D.; Remaley, A. T. Nat. Cell Biol. 2011, 13, 423
339. Turchinovich, A.; Weiz, L.; Langheinz, A.; Burwinke, B. Nucleic Acids
340. Lawrie, C. H.; Gal, S.; Dunlop, H. M.; Pushkaran, B.; Liggins, A. P.; Pulford, K.; Banham, A. H.; Pezzella, F.; Boultwood, J.; Wainscoat, J. S.; Hatton, C. S.; Harris, A. L. Br. J. Hamaetol. 2008, 141, 672
341. Taylor, D. D.; Gercel-Taylor, C. Gynecol. Oncol. 2008, 110, 13
342. Resnick, K. E.; Alder, H.; Hagan, J. P.; Richardson, D. L.; Croce, C. M.; Cohn, D. E. Gynecol. Oncol. 2009, 112, 55
343. Häusler, S. F. M.; Keller, A.; Chandran, P. A.; Ziegler, K.; Zipp, K.; Heuer, S.; Krockenberger, M.; Engel, J. B.; Hönig, A.; Scheffler, M.; Dietl, J.; Wischhusen, J. Br. J. Cancer 2010, 103, 693
344. Tsujiura, M.; Ichikawa, D.; Komatsu, S. Br. J. Cancer 2010, 102, 1174
345. Zhou, H.; Guo, J. M.; Lou, Y. R.; Zhang, X. J.; Zhong, F. D.; Jiang, Z.; Cheng, J.; Xiao, B. X. J. Mol. Med. 2010, 88, 709
346. Heegaard, N. H. H.; Schetter, A. J.; Welsh, J. A.; Yoneda, M.; Bowman, E. D.; Harris, C. C. Int. J. Cancer 2012, 130, 1378
347. Bianchi, F.; Nicassio, F.; Marzi, M.; Belloni, E.; Dall'Olio, V.; Bernard, L.; Pelosi, G.; Maisonneuve, P.; Veronesi, G.; Di Fiore, P. P. EMBO Mol. Med. 2011, 3, 495
348. Roth, C.; Kasimir-Bauer, S.; Pantel, K.; Schwarzenbach, H. Mol. Oncol. 2011, 5, 281
349. Ng, E. K.; Chong, W. W.; Jin, H. Gut 2009, 58, 1375
350. Cheng, H. Y.; Zhang, L. N.; Cogdell, D. E.; Zheng, H.; Schetter, A. J.; Nykter, M.; Harris, C. C.; Chen, K. X.; Hamilton, S. R.; Zhang, W. PLoS One 2011, 6, 17745
351. Heneghan, H. M.; Miller, N.; Lowery, A. J.; Sweeney, K. J.; Newell, J.; Kerin, M. J. Ann. Surg. 2010, 251, 499
352. Zhu, W.; Qin, W.; Atasoy, U.; Sauter, E. R. BMC Res. Notes 2009, 2, 89
353. Yamamoto, Y.; Kosaka, N.; Tanaka, M. Biomarkers 2009, 14, 529
354. Gui, J. H.; Tian, Y. P; Wen, X. Y.; Zhang, W. H.; Zhang, P. J.; Gao, J.; Run, W.; Tian, L. Y.; Jia, X. W.; Gao, Y. H. Clin. Sci. 2011, 120, 183
355. Zhou, S. L.; Wang, L. D. World J. Gastroenterol. 2010, 16, 2348
356. Ho, A. S.; Huang, X.; Cao, H. Transl. Oncol. 2010, 3, 109
357. Tzimagiorgis, G.; Michailidou, E. Z.; Kritis, A.; Markopoulos, A. K.; Kouidou, S. Cancer Epidemiol. 2011, 35, 580
358. Kim, D. J.; Linnstaedt, S.; Palma, J.; Park, J. C.; Ntrivalas, E.; Kwak-Kim, J. Y. H.; Gilman-Sachs, A.; Beaman, K.; Hastings, M. L.; Martin, J. N.; Duelli, D. M. J. Mol. Diagn. 2012, 14, 71
359. Schmittgen, T. D.; Lee, E. J.; Jiang, J. M.; Sarkar, A.; Yang, L. Q.; Elton, T. S.; Chen, C. F. Methods 2008, 44, 31
360. Asaga, S.; Kuo, C.; Nguyen, T.; Terpenning, M.; Giuliano, A. E.; Hoon, D. S. B. Clin. Chem. 2011, 57, 84
361. Leidinger, P.; Keller, A.; Borries, A.; Reichrath, J.; Rass, K.; Jager, S. U.; Lenhof, H. P.; Meese, E. BMC Cancer 2010, 10, 262
362. Lodes, M. J.; Caraballo, M.; Suciu, D.; Munro, S.; Kumar, A.; Anderson, B. PLoS One 2009, 4, e6229
363. Wang, H. J.; Meng, K.; Chen, W. J.; Feng, D.; Jia, Y. H.; Xie, L. X. Shock 2012, 37, 263
364. Nuovo, G. J.; Lee, E. J.; Lawler, S.; Godlewski, J.; Schmittgen, T. D. Biotechniques 2009, 46, 115
365. Wang, G.; Dong, X. Y.; Hu, J. Y.; Tian, W. H.; Yu, C. J.; Wang, Y.; Wu, X. B. Sci. China: Life Sci. 2011, 54, 418
366. Baigude, H.; McCarroll, J.; Yang, C. S.; Swain, P. M.; Rana, T. M. ACS Chem. Biol. 2007, 2, 237
367. Su, J.; Baigude, H.; McCarroll, J.; Rana, T. M. Nucleic Acids Res. 2011, 39, e38
368. Babara, I. A.; Chengb, C. J.; Boothd, C. J.; Liang, X. P.; Weidhaase, J. B.; Saltzmanc, W. M.; Slacka, F. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, e1695
369. Chan, H. M.; Chan, L. S.; Wong, R. N. S.; Li, H. W. Anal. Chem. 2010, 82, 6911