Chemical and semisynthetic approaches to study and target deubiquitinases

Chemical Society Reviews

Volumn 45, Issue 15, 2016, Pages 4171-4198

  Gopinath, Pushparathinam ^a   Ohayon, Shimrit ^a   Nawatha, Mickal ^a   Brik, Ashraf ^a  

^a TECHNION ISRAEL INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (Israel)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DEUBIQUITINASE; ENZYME INHIBITOR; PEPTIDE; UBIQUITIN;

ANTAGONISTS AND INHIBITORS; CHEMISTRY; ENZYME SPECIFICITY; HUMAN; METABOLISM; MOLECULAR PROBE; SYNTHESIS; UBIQUITINATION;

CHEMISTRY TECHNIQUES, SYNTHETIC; DEUBIQUITINATING ENZYMES; ENZYME INHIBITORS; HUMANS; MOLECULAR PROBES; PEPTIDES; SUBSTRATE SPECIFICITY; UBIQUITIN; UBIQUITINATION;

EID: 84980350931     PISSN: 03060012     EISSN: 14604744     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c6cs00083e     Document Type: Review

References (197)

1. C. T. Walsh S. Garneau-Tsodikova G. J. Gatto, Jr. Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 7342 7372
2. A. Hershko A. Ciechanover Annu. Rev. Biochem. 1998 67 425 479
3. C. M. Pickart Annu. Rev. Biochem. 2001 70 503 533
4. M. H. Glickman A. Ciechanover Physiol. Rev. 2002 82 373 428
5. A. M. Weissman N. Shabek A. Ciechanover Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2011 12 605 620
6. D. Finley Annu. Rev. Biochem. 2009 78 477 513
7. C. M. Pickart D. Fushman Curr. Opin. Chem. Biol. 2004 8 610 616
8. L. Sun Z. J. Chen Curr. Opin. Cell Biol. 2004 16 119 126
9. K. Haglund I. Dikic EMBO J. 2005 24 3353 3359
10. Y. Kulathu D. Komander Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2012 13 508 523
11. L. Spasser A. Brik Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 6840 6862
12. Y. Kravtsova-Ivantsiv T. Sommer A. Ciechanover Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 192 198
13. K. R. Love A. Catic C. Schlieker H. L. Ploegh Nat. Chem. Biol. 2007 3 697 705
14. F. E. Reyes-Turcu K. D. Wilkinson Chem. Rev. 2009 109 1495 1508
15. D. Komander M. J. Clague S. Urbe Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2009 10 550 563
16. I. E. Wertz K. M. O'Rourke H. Zhou M. Eby L. Aravind S. Seshagiri P. Wu C. Wiesmann R. Baker D. L. Boone A. Ma E. V. Koonin V. M. Dixit Nature 2004 430 694 699
17. F. E. Reyes-Turcu K. H. Ventii K. D. Wilkinson Annu. Rev. Biochem. 2009 78 363 397
18. C. M. Pickart I. A. Rose J. Biol. Chem. 1985 260 7903 7910
19. Z. M. Eletr K. D. Wilkinson Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Res. 2014 1843 114 128
20. W. Zhang T. Sulea L. Tao Q. Cui E. O. Purisima R. Vongsamphanh P. Lachance V. Lytvyn H. Qi Y. Li R. Menard Biochemistry 2011 50 4775 4785
21. Y. Sato A. Yoshikawa A. Yamagata H. Mimura M. Yamashita K. Ookata O. Nureki K. Iwai M. Komada S. Fukai Nature 2008 455 358 362
22. L. Hicke H. L. Schubert C. P. Hill Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2005 6 610 621
23. K. Husnjak I. Dikic Annu. Rev. Biochem. 2012 81 291 322
24. J. H. Hurley S. Lee G. Prag Biochem. J. 2006 399 361 372
25. S. Misaghi P. J. Galardy W. J. N. Meester H. Ovaa H. L. Ploegh R. Gaudet J. Biol. Chem. 2005 280 1512 1520
26. M. W. Popp K. Artavanis-Tsakonas H. L. Ploegh J. Biol. Chem. 2009 284 3593 3602
27. A. C. Faesen M. P. A. Luna-Vargas P. P. Geurink M. Clerici R. Merkx W. J. van Dijk D. S. Hameed F. El Oualid H. Ovaa T. K. Sixma Chem. Biol. 2011 18 1550 1561
28. M. Hu P. Li M. Li W. Li T. Yao J.-W. Wu W. Gu R. E. Cohen Y. Shi Cell 2002 111 1041 1054
29. T. E. Messick N. S. Russell A. J. Iwata K. L. Sarachan R. Shiekhattar J. R. Shanks F. E. Reyes-Turcu K. D. Wilkinson R. Marmorstein J. Biol. Chem. 2008 283 11038 11049
30. T. E. T. Mevissen M. K. Hospenthal P. P. Geurink P. R. Elliott M. Akutsu N. Arnaudo R. Ekkebus Y. Kulathu T. Wauer F. El Oualid S. M. V. Freund H. Ovaa D. Komander Cell 2013 154 169 184
31. S. C. Johnston C. N. Larsen W. J. Cook K. D. Wilkinson C. P. Hill EMBO J. 1997 16 3787 3796
32. Y. Mao F. Senic-Matuglia P. P. Di Fiore S. Polo M. E. Hodsdon P. De Camilli Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 12700 12705
33. G. Nicastro L. Masino V. Esposito R. P. Menon A. De Simone F. Fraternali A. Pastore Biopolymers 2009 91 1203 1214
34. G. Nicastro R. P. Menon L. Masino P. P. Knowles N. Q. McDonald A. Pastore Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 10493 10498
35. V. Maytal-Kivity N. Reis K. Hofmann H. Glickman Michael BMC Biochem. 2002 3 28
36. D. Komander Biochem. Soc. Trans. 2009 37 937 953
37. R. Varadan O. Walker C. Pickart D. Fushman J. Mol. Biol. 2002 324 637 647
38. Y. Ryabov D. Fushman Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2006 63 787 796
39. R. Varadan M. Assfalg A. Haririnia S. Raasi C. Pickart D. Fushman J. Biol. Chem. 2004 279 7055 7063
40. S. Raasi C. M. Pickart J. Biol. Chem. 2003 278 8951 8959
41. S. Raasi R. Varadan D. Fushman C. M. Pickart Nat. Struct. Mol. Biol. 2005 12 708 714
42. Y. Sato A. Yoshikawa H. Mimura M. Yamashita A. Yamagata S. Fukai EMBO J. 2009 28 2461 2468
43. S. Vijay-Kumar C. E. Bugg W. J. Cook J. Mol. Biol. 1987 194 531 544
44. Y. Ryabov D. Fushman J. Am. Chem. Soc. 2007 129 7894 7902
45. S. Virdee Y. Ye D. P. Nguyen D. Komander J. W. Chin Nat. Chem. Biol. 2010 6 750 757
46. D. Komander F. Reyes-Turcu J. D. F. Licchesi P. Odenwaelder K. D. Wilkinson D. Barford EMBO Rep. 2009 10 466 473
47. R. Varadan M. Assfalg S. Raasi C. Pickart D. Fushman Mol. Cell 2005 18 687 698
48. J. D. F. Licchesi J. Mieszczanek T. E. T. Mevissen T. J. Rutherford M. Akutsu S. Virdee F. El Oualid J. W. Chin H. Ovaa M. Bienz D. Komander Nat. Struct. Mol. Biol. 2012 19 62 71
49. S.-C. Sun Nat. Rev. Immunol. 2008 8 501 511
50. A. Borodovsky B. M. Kessler R. Casagrande H. S. Overkleeft K. D. Wilkinson H. L. Ploegh EMBO J. 2001 20 5187 5196
51. R. Verma L. Aravind R. Oania W. H. McDonald J. R. Yates, III E. V. Koonin R. J. Deshaies Science 2002 298 611 615
52. T. Yao L. Song W. Xu G. N. DeMartino L. Florens S. K. Swanson M. P. Washburn R. C. Conaway J. W. Conaway R. E. Cohen Nat. Cell Biol. 2006 8 994 1002
53. I. Garcia-Santisteban G. J. Peters E. Giovannetti J. A. Rodriguez Mol. Cancer 2013 12 91
54. S. M. B. Nijman T. T. Huang A. M. G. Dirac T. R. Brummelkamp R. M. Kerkhoven A. D. D'Andrea R. Bernards Mol. Cell 2005 17 331 339
55. A. Kovalenko C. Chable-Bessia G. Cantarella A. Israel D. Wallach G. Courtois Nature 2003 424 801 805
56. E. G. Lee D. L. Boone S. Chai S. L. Libby M. Chien J. P. Lodolce A. Ma Science 2000 289 2350 2354
57. T. DeVine M.-S. Dai Curr. Pharm. Des. 2013 19 3248 3262
58. M. Li D. Chen A. Shiloh J. Luo A. Y. Nikolaev J. Qin W. Gu Nature 2002 416 648 652
59. L. F. Stevenson A. Sparks N. Allende-Vega D. P. Xirodimas D. P. Lane M. K. Saville EMBO J. 2007 26 976 986
60. H. A. Lindner Virology 2007 362 245 256
61. V. Saridakis Y. Sheng F. Sarkari M. N. Holowaty K. Shire T. Nguyen R. G. Zhang J. Liao W. Lee A. M. Edwards C. H. Arrowsmith L. Frappier Mol. Cell 2005 18 25 36
62. D. M. Maraganote T. G. Lesnick A. Elbaz M.-C. Charrier-Harlin T. Gasser R. Krueger N. Hattori G. D. Mellick A. Quattrone J.-i. Satoh T. Toda J. Wang J. P. A. Ioannidis M. de Andrade W. A. Rocca Ann. Neurol. 2004 55 512 521
63. Y. Liu L. Fallon H. A. Lashuel Z. Liu P. T. Lansbury, Jr. Cell 2002 111 209 218
64. J. Choi A. I. Levey S. T. Weintraub H. D. Rees M. Gearing L.-S. Chin L. Li J. Biol. Chem. 2004 279 13256 13264
65. P. D'Arcy X. Wang S. Linder Pharmacol. Ther. 2015 147 32 54
66. B. Nicholson J. G. Marblestone T. R. Butt M. R. Mattern Future Oncol. 2007 3 191 199
67. S. Hussain Y. Zhang P. J. Galardy Cell Cycle 2009 8 1688 1697
68. R. Pfoh I. K. Lacdao V. Sarldakis Endocr.-Relat. Cancer 2015 22 T35 T54
69. S. V. Todi H. L. Paulson Trends Neurosci. 2011 34 370 382
70. G. Ristic W.-L. Tsou S. V. Todi Front. Mol. Neurosci. 2014 7 1 15
71. B. M. Kessler M. J. Edelmann Cell Biochem. Biophys. 2011 60 21 38
72. D. D. Sahtoe T. K. Sixma Trends Biochem. Sci. 2015 40 456 467
73. W. Reiley M. Zhang X. Wu E. Granger S.-C. Sun Mol. Cell. Biol. 2005 25 3886 3895
74. T. Kobayashi K. C. Masoumi R. Massoumi Oncogene 2015 34 2251 2260
75. K. D. Wilkinson M. J. Cox A. N. Mayer T. Frey Biochemistry 1986 25 6644 6649
76. A. Borodovsky H. Ovaa N. Kolli T. Gan-Erdene K. D. Wilkinson H. L. Ploegh B. M. Kessler Chem. Biol. 2002 9 1149 1159
77. R. B. Merrifield J. Am. Chem. Soc. 1963 85 2149 2154
78. C. P. R. Hackenberger D. Schwarzer Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 10030 10074
79. M. Schnoelzer S. B. H. Kent Science 1992 256 221 225
80. P. E. Dawson T. W. Muir I. Clark-Lewis S. B. H. Kent Science 1994 266 776 779
81. P. E. Dawson Isr. J. Chem. 2011 51 862 867
82. L. R. Malins R. J. Payne Curr. Opin. Chem. Biol. 2014 22 70 78
83. F. Mende O. Seitz Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 1232 1240
84. J. B. Blanco-Canosa P. E. Dawson Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 6851 6855
85. R. Ramage J. Green O. M. Ogunjobi Tetrahedron Lett. 1989 30 2149 2152
86. R. Ramage J. Green T. W. Muir O. M. Ogunjobi S. Love K. Shaw Biochem. J. 1994 299 151 158
87. D. Bang G. I. Makhatadze V. Tereshko A. A. Kossiakoff S. B. Kent Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 3852 3856
88. L. A. Erlich K. S. A. Kumar M. Haj-Yahya P. E. Dawson A. Brik Org. Biomol. Chem. 2010 8 2392 2396
89. F. El Oualid R. Merkx R. Ekkebus D. S. Hameed J. J. Smit A. de Jong H. Hilkmann T. K. Sixma H. Ovaa Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 10149 10153
90. S. N. Bavikar L. Spasser M. Haj-Yahya S. V. Karthikeyan T. Moyal K. S. Ajish Kumar A. Brik Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 758 763
91. R. Ekkebus D. Flierman P. P. Geurink H. Ovaa Curr. Opin. Chem. Biol. 2014 23 63 70
92. H. Ovaa Nat. Rev. Cancer 2007 7 613 620
93. B. F. Cravatt A. T. Wright J. W. Kozarich Annu. Rev. Biochem. 2008 77 383 414
94. C. M. Pickart I. A. Rose J. Biol. Chem. 1986 261 10210 10217
95. A. Hershko I. A. Rose Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1987 84 1829 1833
96. Y. A. Lam W. Xu G. N. DeMartino R. E. Cohen Nature 1997 385 737 740
97. C. Schlieker W. A. Weihofen E. Frijns L. M. Kattenhorn R. Gaudet H. L. Ploegh Mol. Cell 2007 25 677 687
98. A. Borodovsky H. Ovaa W. J. N. Meester E. S. Venanzi M. S. Bogyo B. G. Hekking H. L. Ploegh B. M. Kessler H. S. Overkleeft ChemBioChem 2005 6 287 291
99. K. Routenberg Love R. K. Pandya E. Spooner H. L. Ploegh ACS Chem. Biol. 2009 4 275 287
100. H. Ovaa B. M. Kessler U. Rolen P. J. Galardy H. L. Ploegh M. G. Masucci Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 2253 2258
101. R. Ekkebus S. I. van Kasteren Y. Kulathu A. Scholten I. Berlin P. P. Geurink A. de Jong S. Goerdayal J. Neefjes A. J. R. Heck D. Komander H. Ovaa J. Am. Chem. Soc. 2013 135 2867 2870
102. S. Sommer N. D. Weikart U. Linne H. D. Mootz Bioorg. Med. Chem. 2013 21 2511 2517
103. P. Thirumurugan D. Matosiuk K. Jozwiak Chem. Rev. 2013 113 4905 4979
104. A. de Jong R. Merkx I. Berlin B. Rodenko R. H. M. Wijdeven D. El Atmioui Z. Yalcin C. N. Robson J. J. Neefjes H. Ovaa ChemBioChem 2012 13 2251 2258
105. C. Chatterjee R. K. McGinty J.-P. Pellois T. W. Muir Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 2814 2818
106. C. E. Weller W. Huang C. Chatterjee ChemBioChem 2014 15 1263 1267
107. K. S. Ajish Kumar M. Haj-Yahya D. Olschewski H. A. Lashuel A. Brik Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 8090 8094
108. R. Yang K. K. Pasunooti F. Li X.-W. Liu C.-F. Liu J. Am. Chem. Soc. 2009 131 13592 13593
109. M. Haj-Yahya K. S. Ajish Kumar L. A. Erlich A. Brik Biopolymers 2010 94 504 510
110. K. S. A. Kumar L. Spasser S. Ohayon L. A. Erlich A. Brik Bioconjugate Chem. 2011 22 137 143
111. E. M. Valkevich R. G. Guenette N. A. Sanchez Y.-c. Chen Y. Ge E. R. Strieter J. Am. Chem. Soc. 2012 134 6916 6919
112. K. S. A. Kumar L. Spasser L. A. Erlich S. N. Bavikar A. Brik Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 9126 9131
113. S. Eger M. Scheffner A. Marx M. Rubini J. Am. Chem. Soc. 2010 132 16337 16339
114. L. Yin B. Krantz N. S. Russell S. Deshpande K. D. Wilkinson Biochemistry 2000 39 10001 10010
115. C. Castaneda J. Liu A. Chaturvedi U. Nowicka T. A. Cropp D. Fushman J. Am. Chem. Soc. 2011 133 17855 17868
116. D. Komander C. J. Lord H. Scheel S. Swift K. Hofmann A. Ashworth D. Barford Mol. Cell 2008 29 451 464
117. M. Hu P. Li L. Song P. D. Jeffrey T. A. Chenova K. D. Wilkinson R. E. Cohen Y. Shi EMBO J. 2005 24 3747 3756
118. F. Koyano K. Okatsu H. Kosako Y. Tamura E. Go M. Kimura Y. Kimura H. Tsuchiya H. Yoshihara T. Hirokawa T. Endo E. A. Fon J.-F. Trempe Y. Saeki K. Tanaka N. Matsuda Nature 2014 510 162 166
119. L. A. Kane M. Lazarou A. I. Fogel Y. Li K. Yamano S. A. Sarraf S. Banerjee R. J. Youle J. Cell Biol. 2014 205 143 153
120. A. Kazlauskaite C. Kondapalli R. Gourlay D. G. Campbell M. S. Ritorto K. Hofmann D. R. Alessi A. Knebel M. Trost M. M. K. Muqit Biochem. J. 2014 460 127 139
121. A. Ordureau S. A. Sarraf D. M. Duda J.-M. Heo M. P. Jedrychowski V. O. Sviderskiy J. L. Olszewski J. T. Koerber T. Xie S. A. Beausoleil J. A. Wells S. P. Gygi B. A. Schulman J. W. Harper Mol. Cell 2014 56 360 375
122. T. Wauer K. N. Swatek J. L. Wagstaff C. Gladkova J. N. Pruneda M. A. Michel M. Gersch C. M. Johnson S. M. V. Freund D. Komander EMBO J. 2015 34 307 325
123. S. Bondalapati W. Mansour M. A. Nakasone S. K. Maity M. H. Glickman A. Brik Chem.-Eur. J. 2015 21 7360 7364
124. L. Herhaus I. Dikic EMBO Rep. 2015 16 1071 1083
125. N. S. Russell K. D. Wilkinson Biochemistry 2004 43 4844 4854
126. I. Dikic S. Wakatsuki K. J. Walters Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2009 10 659 671
127. Y. Ye G. Blaser M. H. Horrocks M. J. Ruedas-Rama S. Ibrahim A. A. Zhukov A. Orte D. Klenerman S. E. Jackson D. Komander Nature 2012 492 266 270
128. A. B. Datta G. L. Hura C. Wolberger J. Mol. Biol. 2009 392 1117 1124
129. N. Haj-Yahya M. Haj-Yahya C. A. Castaneda L. Spasser H. P. Hemantha M. Jbara M. Penner A. Ciechanover D. Fushman A. Brik Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 11149 11153
130. M. Haj-Yahya N. Eltarteer S. Ohayon E. Shema E. Kotler M. Oren A. Brik Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 11535 11539
131. H. Pham Grace S. J. B. Rana Ambar E. N. Korkmaz H. Trang Vivian Q. Cui R. Strieter Eric Protein Sci. 2016 25 456 471
132. J. Lopez-Mosqueda I. Dikic Cell 2014 157 767 769
133. E. K. Dixon C. A. Castaneda T. R. Kashyap Y. Wang D. Fushman Bioorg. Med. Chem. 2013 21 3421 3429
134. J. F. McGouran S. R. Gaertner M. Altun H. B. Kramer B. M. Kessler Chem. Biol. 2013 20 1447 1455
135. G. Li Q. Liang P. Gong A. H. Tencer Z. Zhuang Chem. Commun. 2014 50 216 218
136. N. Haj-Yahya H. P. Hemantha R. Meledin S. Bondalapati M. Seenaiah A. Brik Org. Lett. 2014 16 540 543
137. M. P. C. Mulder F. El Oualid J. ter Beek H. Ovaa ChemBioChem 2014 15 946 949
138. J. B. Schaefer D. O. Morgan J. Biol. Chem. 2011 286 45186 45196
139. N. Shabek Y. Herman-Bachinsky S. Buchsbaum O. Lewinson M. Haj-Yahya M. Hejjaoui H. A. Lashuel T. Sommer A. Brik A. Ciechanover Mol. Cell 2012 48 87 97
140. M. Haj-Yahya B. Fauvet Y. Herman-Bachinsky M. Hejjaoui S. N. Bavikar S. V. Karthikeyan A. Ciechanover H. A. Lashuel A. Brik Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013 110 17726 17731
141. R. K. McGinty J. Kim C. Chatterjee R. G. Roeder T. W. Muir Nature 2008 453 812 816
142. M. Hejjaoui M. Haj-Yahya K. S. A. Kumar A. Brik H. A. Lashuel Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 405 409
143. J. Chen Y. Ai J. Wang L. Haracska Z. Zhuang Nat. Chem. Biol. 2010 6 270 272
144. C. Chatterjee R. K. McGinty B. Fierz T. W. Muir Nat. Chem. Biol. 2010 6 267 269
145. H. P. Hemantha S. N. Bavikar Y. Herman-Bachinsky N. Haj-Yahya S. Bondalapati A. Ciechanover A. Brik J. Am. Chem. Soc. 2014 136 2665 2673
146. X. Bi R. Yang X. Feng D. Rhodes C.-F. Liu Org. Biomol. Chem. 2016 14 835 839
147. K. Yang P. Gong P. Gokhale Z. Zhuang ACS Chem. Biol. 2014 9 1685 1691
148. M. Morgan M. Haj-Yahya A. E. Ringel P. Bandi A. Brik C. Wolberger Science 2016 351 725 728
149. J. S. Thrower L. Hoffman M. Rechsteiner C. M. Pickart EMBO J. 2000 19 94 102
150. L. C. Dang F. D. Melandri R. L. Stein Biochemistry 1998 37 1868 1879
151. A. Tirat A. Schilb V. Riou L. Leder B. Gerhartz J. Zimmermann S. Worpenberg U. Eidhoff F. Freuler T. Stettler L. Mayr J. Ottl B. Leuenberger I. Filipuzzi Anal. Biochem. 2005 343 244 255
152. P. P. Geurink F. El Oualid A. Jonker D. S. Hameed H. Ovaa ChemBioChem 2012 13 293 297
153. R. A. Horton E. A. Strachan K. W. Vogel S. M. Riddle Anal. Biochem. 2007 360 138 143
154. B. Nicholson C. A. Leach S. J. Goldenberg D. M. Francis M. P. Kodrasov X. Tian J. Shanks D. E. Sterner A. Bernal M. R. Mattern K. D. Wilkinson T. R. Butt Protein Sci. 2008 17 1035 1043
155. D. Chauhan Z. Tian B. Nicholson K. G. S. Kumar B. Zhou R. Carrasco J. L. McDermott C. A. Leach M. Fulcinniti M. P. Kodrasov J. Weinstock W. D. Kingsbury T. Hideshima P. K. Shah S. Minvielle M. Altun B. M. Kessler R. Orlowski P. Richardson N. Munshi K. C. Anderson Cancer Cell 2012 22 345 358
156. J. Weinstock J. Wu P. Cao W. D. Kingsbury J. L. McDermott M. P. Kodrasov D. M. McKelvey K. G. Suresh Kumar S. J. Goldenberg M. R. Mattern B. Nicholson ACS Med. Chem. Lett. 2012 3 789 792
157. U. Hassiepen U. Eidhoff G. Meder J.-F. Bulber A. Hein U. Bodendorf E. Lorthiois B. Martoglio Anal. Biochem. 2007 371 201 207
158. J. Chen T. S. Dexheimer Y. Ai Q. Liang M. A. Villamil J. Inglese D. J. Maloney A. Jadhav A. Simeonov Z. Zhuang Chem. Biol. 2011 18 1390 1400
159. Q. Liang T. S. Dexheimer P. Zhang A. S. Rosenthal M. A. Villamil C. You Q. Zhang J. Chen C. A. Ott H. Sun D. K. Luci B. Yuan A. Simeonov A. Jadhav H. Xiao Y. Wang D. J. Maloney Z. Zhuang Nat. Chem. Biol. 2014 10 298 304
160. S. J. Orcutt J. Wu M. J. Eddins C. A. Leach J. E. Strickler Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Res. 2012 1823 2079 2086
161. S. Ohayon L. Spasser A. Aharoni A. Brik J. Am. Chem. Soc. 2012 134 3281 3289
162. S. Ohayon M. Refua A. Brik Org. Biomol. Chem. 2015 13 8182 8186
163. S. K. Maity S. Ohayon A. Brik Org. Lett. 2015 17 3438 3441
164. S. J. Goldenberg J. L. McDermott T. R. Butt M. R. Mattern B. Nicholson Biochem. Soc. Trans. 2008 36 828 832
165. C. Ndubaku V. Tsui J. Med. Chem. 2015 58 1581 1595
166. W. Zhang S. S. Sidhu FEBS Lett. 2014 588 356 367
167. M. Kemp Prog. Med. Chem. 2016 55 149 192
168. F. Colland Biochem. Soc. Trans. 2010 38 137 143
169. Y. Liu H. A. Lashuel S. Choi X. Xing A. Case J. Ni L.-A. Yeh G. D. Cuny R. L. Stein P. T. Lansbury Chem. Biol. 2003 10 837 846
170. T. S. Dexheimer A. S. Rosenthal D. K. Luci Q. Liang M. A. Villamil J. Chen H. Sun E. H. Kerns A. Simeonov A. Jadhav Z. Zhuang D. J. Maloney J. Med. Chem. 2014 57 8099 8110
171. S. A. Williams H. L. Maecker D. M. French J.-F. Liu A. Gregg L. B. Silverstein T. C. Cao R. A. D. Carano V. M. Dixit Cell 2011 146 918 930
172. H. Mistry G. Hsieh S. J. Buhrlage M. Huang E. Park G. D. Cuny I. Galinsky R. M. Stone N. S. Gray A. D. D'Andrea K. Parmar Mol. Cancer Ther. 2013 12 2651 2662
173. J. L. Parsons I. I. Dianova S. V. Khoronenkova M. J. Edelmann B. M. Kessler G. L. Dianov Mol. Cell 2011 41 609 615
174. F. Colland E. Formstecher X. Jacq C. Reverdy C. Planquette S. Conrath V. Trouplin J. Bianchi V. N. Aushev J. Camonis A. Calabrese C. Borg-Capra W. Sippl V. Collura G. Boissy J.-C. Rain P. Guedat R. Delansorne L. Daviet Mol. Cancer Ther. 2009 8 2286 2295
175. C. Reverdy S. Conrath R. Lopez C. Planquette C. Atmanene V. Collura J. Harpon V. Battaglia V. Vivat W. Sippl F. Colland Chem. Biol. 2012 19 467 477
176. X. Tian N. S. Isamiddinova R. J. Peroutka S. J. Goldenberg M. R. Mattern B. Nicholson C. Leach Assay Drug Dev. Technol. 2010 9 165 173
177. M. Altun H. B. Kramer L. I. Willems J. L. McDermott C. A. Leach S. J. Goldenberg K. G. Kumar R. Konietzny R. Fischer E. Kogan M. M. Mackeen J. McGouran S. V. Khoronenkova J. L. Parsons G. L. Dianov B. Nicholson B. M. Kessler Chem. Biol. 2011 18 1401 1412
178. B.-H. Lee M. J. Lee S. Park D.-C. Oh S. Elsasser P.-C. Chen C. Gartner N. Dimova J. Hanna S. P. Gygi S. M. Wilson R. W. King D. Finley Nature 2010 467 179 184
179. B. Bingol J. S. Tea L. Phu M. Reichelt C. E. Bakalarski Q. Song O. Foreman D. S. Kirkpatrick M. Sheng Nature 2014 510 370 375
180. W. Yue Z. Chen H. Liu C. Yan M. Chen D. Feng C. Yan H. Wu L. Du Y. Wang J. Liu X. Huang L. Xia L. Liu X. Wang H. Jin J. Wang Z. Song X. Hao Q. Chen Cell Res. 2014 24 482 496
181. X. M. Cotto-Rios M. Bekes J. Chapman B. Ueberheide T. T. Huang Cell Rep. 2012 2 1475 1484
182. Y. Kulathu J. Garcia Francisco E. T. Mevissen Tycho M. Busch N. Arnaudo S. Carroll Kate D. Barford D. Komander Nat. Commun. 2013 4 1569
183. J.-G. Lee K. Baek N. Soetandyo Y. Ye Nat. Commun. 2013 4 1568
184. M. Lo Conte K. S. Carroll J. Biol. Chem. 2013 288 26480 26488
185. S. E. Leonard K. G. Reddie K. S. Carroll ACS Chem. Biol. 2009 4 783 799
186. C. E. Paulsen K. S. Carroll ACS Chem. Biol. 2010 5 47 62
187. S. Ohayon M. Refua A. Hendler A. Aharoni A. Brik Angew. Chem., Int. Ed. 2015 54 599 603
188. R. E. Savage A. N. Tyler X.-S. Miao T. C. K. Chan Drug Metab. Dispos. 2008 36 753 758
189. Y. Zhang L. Zhou L. Rouge A. H. Phillips C. Lam P. Liu W. Sandoval E. Helgason J. M. Murray I. E. Wertz J. E. Corn Nat. Chem. Biol. 2013 9 51 58
190. A. Ernst G. Avvakumov J. Tong Y. Fan Y. Zhao P. Alberts A. Persaud J. R. Walker A.-M. Neculai D. Neculai A. Vorobyov P. Garg L. Beatty P.-K. Chan Y.-C. Juang M.-C. Landry C. Yeh E. Zeqiraj K. Karamboulas A. Allali-Hassani M. Vedadi M. Tyers J. Moffat F. Sicheri L. Pelletier D. Durocher B. Raught D. Rotin J. Yang M. F. Moran S. Dhe-Paganon S. S. Sidhu Science 2013 339 590 595
191. R. Meledin S. M. Mali A. Brik Chem. Rec. 2016 16 509 519
192. S. B. H. Kent Chem. Soc. Rev. 2009 38 338 351
193. T. W. Muir Annu. Rev. Biochem. 2003 72 249 289
194. M. R. Arkin Y. Tang J. A. Wells Chem. Biol. 2014 21 1102 1114
195. G. L. Verdine L. D. Walensky Clin. Cancer Res. 2007 13 7264 7270
196. M. Hochstrasser Nature 2009 458 422 429
197. C. M. Guzzo C. E. Berndsen J. Zhu V. Gupta A. Datta R. A. Greenberg C. Wolberger M. J. Matunis Sci. Signaling 2012 5 ra88