Heme Protein Assemblies

Chemical Reviews

Volumn 104, Issue 2, 2004, Pages 617-649

  Reedy, Charles J ^a   Gibney, Brian R ^a  

^a Och Spine at New York Presbyterian Hospitals   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOENERGETICS; BIOLOGICAL SYSTEMS;

BIOCHEMISTRY; BIOSYNTHESIS; CRYSTAL STRUCTURE; ELECTROCHEMISTRY; HYDROPHOBICITY; MAGNETISM; MUTAGENESIS; OXIDATION;

PROTEINS;

HEMOPROTEIN; PEPTIDE; PORPHYRIN;

ANIMAL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; HUMAN; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN FOLDING; REVIEW; STRUCTURE ACTIVITY RELATION;

ANIMALS; HEMEPROTEINS; HUMANS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR STRUCTURE; PEPTIDES; PORPHYRINS; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN FOLDING; STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP;

EID: 1542274547     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr0206115     Document Type: Review

References (390)

1. Chapman, S. K.; Daff, S.; Munro, A. W. Struct. Bond. 1997, 88, 39.
2. Dawson, J. H. Science 1988, 240, 433.
3. Paoli, M.; Marles-Wright, J.; Smith, A. DNA Cell Biol. 2002, 21, 271.
4. Martin, A. C.; Orengo, C. A.; Hutchinson, E. G.; Jones, S.; Karmirantzou, M.; Laskowski, R. A.; Mitchell, J. B.; Taroni, C.; Thornton, J. M. Struct. Fold. Des. 1998, 6, 875.
5. Scott, R. A.; Mauk, A. G. Cytochrome c - A multidisciplinary approach; University Science Books: Sausalito, CA, 1996.
6. Gray, H. B.; Winkler, J. R. Annu. Rev. Biochem. 1996, 65, 537.
7. Dunford, H. B. Heme peroxidases; John Wiley: New York, 1999.
8. Ortiz de Montellano, P. R. Cytochrome P450: structure, mechanism, and biochemistry; Plenum Press: New York, 1995.
9. Harrison, P.; Huehns, E. R. Nature 1979, 279, 476.
10. Chan, M. K. J. Porphyrins Phthalocyanines 2000, 4, 358.
11. Rodgers, K. R. Curr. Opin. Chem. Biol. 1999, 3, 158.
12. Chan, M. K. Curr. Opin. Chem. Biol. 2001, 5, 216.
13. Antonini, E.; Brunori, M. Hemoglobin and Myoglobin in their Reactions with Ligands; North-Holland: Amsterdam, 1971.
14. Privalle, C. T.; Crivello, J. F.; Jefcoate, C. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 702.
15. Pikuleva, I.; Waterman, M. Mol. Asp. Med. 1999, 20, 43.
16. Yoshikawa, S. Adv. Protein Chem. 2002, 60, 341.
17. Narula, J.; Pandey, P.; Arbustini, E.; Haider, N.; Narula, N.; Kolodgie, F. D.; Dal Bello, B.; Semigran, M. J.; Bielsa-Masdeu, A.; Dec, G. W.; Israels, S.; Ballester, M.; Virmani, R.; Saxena, S.; Kharbanda, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 8144.
18. Kendrew, J. C.; Bodo, G.; Dintzis, H. M.; Parrish, R. G.; Wyckoff, H. W. ; Phillips, D. C. Nature 1958, 181, 662.
19. Takano, T. Refinement of Myoglobin and Cytochrome c; Clarendon Press: New York, 1984.
20. Mitchell, P. Nature 1961, 191, 144.
21. Bai, Y. W.; Sosnick, T. R.; Mayne, L.; Englander, S. W. Science 1995, 269, 192
22. Telford, J. R.; Wittung-Stafshede, P.; Gray, H. B.; Winkler, J. R. Acc. Chem. Res. 1998, 31, 755.
23. Pauling, L.; Itano, H. A.; Singer, S. J.; Wells, I. C. Science 1949, 110, 543.
24. Ibers, J. A.; Holm, R. H. Science 1980, 209, 223.
25. Karlin, K. D. Science 1993, 261, 701.
26. Kadish, K. M.; Bottomley, L. A. Inorg. Chem. 1980, 19, 832.
27. Kadish, K. M.; Dsouza, F.; Villard, A.; Autret, M.; Vancaemel-becke, E.; Bianco, P.; Antonini, A.; Tagliatesta, P. Inorg. Chem. 1994, 33, 5169.
28. Kadish, K. M.; Autret, M.; Ou, Z. P.; Tagliatesta, P.; Boschi, T.; Fares, V. Inorg. Chem. 1997, 36, 204.
29. Cheesman, M. R.; Walker, F. A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7373.
30. Nesset, M. J. M.; Shokhirev, N. V.; Enemark, P. D.; Jacobson, S. E.; Walker, F. A. Inorg. Chem. 1996, 35, 5188.
31. Raitsimring, A. M.; Borbat, P.; Shokhireva, T. K.; Walker, F. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 5235.
32. Bertini, I.; Luchinat, C.; Parigi, G.; Walker, F. A. J. Biol. Inorg. Chem. 1999, 4, 515.
33. Scheidt, W. R.; Cheng, B.; Safo, M. K.; Cukiernik, F.; Marchon, J. C.; Debrunner, P. G. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4420.
34. Scheidt, W. R.; Ellison, M. K. Acc. Chem. Res. 1999, 32, 350.
35. Collman, J. P.; Reed, C. A. J. Am. Chem. Soc. 1973, 95, 2048.
36. Collman, J. P.; Gagne, R. R.; Halbert, T. R.; Marchon, J. C.; Reed, C. A. J. Am. Chem. Soc. 1973, 95, 7868.
37. Benson, D. R.; Hart, B. R.; Zhu, X.; Doughty, M. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 8502.
38. Collman, J. P.; Rapta, M.; Broring, M.; Raptova, L.; Schwenninger, R.; Boitrel, B.; Fu, L.; L'Her, M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 227, 1387.
39. Collman, J. P.; Fudickar, W.; Shiryaeva, I. M. Inorg. Chem. 2003, 42, 3384.
40. Jackson, D. A.; Berg, P.; Symons, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1972, 69, 2904.
41. Saiki, R. K.; Gelfand, D. H.; Stoffel, S.; Scharf, S. J.; Higuchi, R.; Horn, G. T.; Mullis, K. B.; Erlich, H. A. Science 1988, 239, 487.
42. Mullis, K. B. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 1209.
43. Stellwagen, E. Nature 1978, 275, 73.
44. Varadarajan, R.; Zewert, T. E.; Gray, H. B.; Boxer, S. G. Science 1989, 243, 69.
45. Lu, Y.; Berry, S. M.; Pfister, T. D. Chem. Rev. 2001, 101, 3047.
46. Watanabe, Y. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 208.
47. McRee, D. E.; Jensen, G. M.; Fitzgerald, M. M.; Siegel, H. A.; Goodin, D. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 12847.
48. Sigman, J. A.; Kim, H. K.; Zhao, X. A.; Carey, J. R.; Lu, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 3629.
49. Farinas, E. T.; Schwaneberg, U.; Glieder, A.; Arnold, F. H. Adv. Synth. Catal. 2001, 343, 601.
50. Cirino, P. C.; Arnold, F. H. Curr. Opin. Chem. Biol. 2002, 6, 130.
51. Smith, J. M. Nature 1970, 225, 563.
52. Richardson, J. S.; Richardson, D. C.; Erickson, B. W. Biophys. J. 1984, 45, A25.
53. DeGrado, W. F.; Summa, C. M.; Pavone, V.; Nastri, F.; Lombardi, A. Annu. Rev. Biochem. 1999, 68, 779.
54. Baltzer, L.; Nilsson, H.; Nilsson, J. Chem. Rev. 2001, 101, 3153.
55. Moffet, D. A.; Hecht, M. H. Chem. Rev. 2001, 101, 3191.
56. Choma, C. T.; Lear, J. D.; Nelson, M. J.; Dutton, P. L.; Robertson, D. E.; DeGrado, W. F. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 856.
57. Hodges, R. S.; Saund, A. K.; Chong, P. C. S.; St. Pierre, S. A.; Reid, R. E. J. Biol. Chem. 1981, 256, 1214.
58. Marqusee, S.; Robbins, V. H.; Baldwin, R. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 5286.
59. Hecht, M. H.; Richardson, J. S.; Richardson, D. C.; Ogden, R. C. Science 1990, 249, 884.
60. Harbury, P. B.; Zhang, T.; Kim, P. S.; Alber, T. Science 1993, 262, 1401.
61. Munson, M.; O'Brien, R.; Sturtevant, J. M.; Regan, L. Protein Sci. 1994, 3, 2015.
62. Bryson, J. W.; Betz, S. F.; Lu, H. S.; Suich, D. J.; Zhou, H. X. X.; O'Neil, K. T.; DeGrado, W. F. Science 1995, 270, 935.
63. Desjarlais, J. R.; Handel, T. M. Protein Sci. 1995, 4, 2006.
64. Dolphin, G. T.; Brive, L.; Johansson, G.; Baltzer, L. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11297.
65. Dahiyat, B. I.; Mayo, S. L. Science 1997, 278, 82.
66. Kortemme, T.; Ramirez-Alvarado, M.; Serrano, L. Science 1998, 281, 253.
67. Gibney, B. R.; Rabanal, F.; Skalicky, J. J.; Wand, A. J.; Dutton, P. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 4952.
68. Silverman, J. A.; Balakrishnan, R.; Harbury, P. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 3092.
69. Hill, R. B.; Raleigh, D. P.; Lombardi, A.; DeGrado, W. F. Acc. Chem. Res. 2000, 33, 745.
70. Gibney, B. R.; Mulholland, S. E.; Rabanal, F.; Dutton, P. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 15041.
71. Scott, M. P.; Biggins, J. Protein Sci. 1997, 6, 340.
72. Coldren, C. D.; Hellinga, H. W.; Caradonna, J. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 6635.
73. Robertson, D. E.; Farid, R. S.; Moser, C. C.; Urbauer, J. L.; Mulholland, S. E.; Pidikiti, R.; Lear, J. D.; Wand, A. J.; DeGrado, W. F.; Dutton, P. L. Nature 1994, 368, 425.
74. Regan, L.; Clarke, N. D. Biochemistry 1990, 29, 10878.
75. Hellinga, H. W. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10055.
76. Schnepf, R.; Horth, P.; Bill, E.; Wieghardt, K.; Hildebrandt, P.; Haehnel, W. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2186.
77. Daugherty, R. G.; Wasowicz, T.; Gibney, B. R.; DeRose, V. J. Inorg. Chem. 2002, 41, 2623.
78. Suzuki, K.; Hiroaki, H.; Kohda, D.; Nakamura, H.; Tanaka, T. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 13008.
79. Dieckmann, G. R.; McRorie, D. K.; Tierney, D. L.; Utschig, L. M.; Singer, C. P.; O'Halloran, T. V.; Penner-Hahn, J. E.; DeGrado, W. F.; Pecoraro, V. L. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 6195.
80. Farrer, B. T.; McClure, C. F.; Penner-Hahn, J. E.; Pecoraro, V. L. Inorg. Chem. 2000, 39, 5422.
81. Kovacic, R. T.; Welch, J. T.; Franklin, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 6656.
82. Ghadiri, M. R.; Gase, M. A. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1993, 32, 1594.
83. Rabanal, F.; DeGrado, W. F.; Dutton, P. L. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 473.
84. Sharp, R. E.; Moser, C. C.; Rabanal, F.; Dutton, P. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 10465.
85. Mutz, M. W.; Case, M. A.; Wishart, J. F.; Ghadiri, M. R.; McLendon, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 858.
86. Kornilova, A. Y.; Wishart, J. F.; Xiao, W. Z.; Lasey, R. C.; Fedorova, A.; Shin, Y. K.; Ogawa, M. Y. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 7999.
87. Laplaza, C. E.; Holm, R. H. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 10255.
88. Musgrave, K. B.; Laplaza, C. E.; Holm, R. H.; Hedman, B.; Hodgson, K. O. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 3083.
89. Fedorova, A.; Chaudhari, A.; Ogawa, M. Y. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 357.
90. Farrer, B. T.; Pecoraro, V. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 3760.
91. Shifman, J. M.; Moser, C. C.; Kalsbeck, W. A.; Bocian, D. F.; Dutton, P. L. Biochemistry 1998, 37, 16815.
92. Moffet, D. A.; Certain, L. K.; Smith, A. J.; Kessel, A. J.; Beckwith, K. A.; Hecht, M. H. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 7612.
93. Bolon, D. N.; Mayo, S. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 14274.
94. Anderson, L. K.; Caspersson, M.; Baltzer, L. Chem. Eur. J. 2002, 8, 3687.
95. Kennedy, M. L.; Gibney, B. R. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 485.
96. Xing, G.; DeRose, V. J. Curr. Opin. Chem. Biol. 2001, 5, 196.
97. Lu, Y.; Valentine, J. S. Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 495.
98. Holm, R. H.; Kennepohl, P.; Solomon, E. I. Chem. Rev. 1996 96, 2239.
99. Braisted, A. C.; Wells, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 5688.
100. Mulholland, S. E.; Gibney, B. R.; Rabanal, F.; Dutton, P. L. Biochemistry 1999, 38, 10442.
101. Cochran, A. G.; Skelton, N. J.; Starovasnik, M. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 5578.
102. Chin, J. W.; Schepartz, A. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2929.
103. Gibney, B. R.; Dutton, P. L. Adv. Inorg. Chem. 2001, 51, 409.
104. Lombardi, A.; Nastri, F.; Pavone, V. Chem. Rev. 2001, 101, 3165.
105. Teichmann, L. Z. Ration. Med. 1853, 3, 375.
106. McMunn, C. A. J. Physiol. 1886, 5, xxiv.
107. Keilin, D. Proc. R. Soc. London, B 1925, 98, 312.
108. Berry, E. A.; Trumpower, B. L. Anal. Biochem. 1987, 161, 1.
109. Sono, M.; Roach, M. P.; Coulter, E. D.; Dawson, J. H. Chem. Rev. 1996, 96, 2841.
110. Ferguson-Miller, S.; Babcock, G. T. Chem. Rev. 1996, 96, 2889.
111. Fischer, H.; Zeile, K. Justus Liebigs Ann. Chem. 1929, 468, 98.
112. Sellers, V. M.; Wu, C. K.; Dailey, T. A.; Dailey, H. A. Biochemistry 2001, 40, 9821.
113. Wu, C. K.; Dailey, H. A.; Rose, J. P.; Burden, A.; Sellers, V. M.; Wang, B. C. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 156.
114. O'Brian, M. R.; Thony-Meyer, L. Adv. Microb. Physiol. 2002, 46, 257.
115. Mogi, T.; Saiki, K.; Anraku, Y. Mol. Microbiol. 1994, 14, 391.
116. Brown, K. R.; Allan, B. A.; Do, P.; Hegg, E. L. Biochemistry 2002, 41, 10906.
117. Hargrove, M. S.; Barrick, D.; Olson, J. S. Biochemistry 1996, 35, 11293.
118. Hargrove, M. S.; Olson, J. S. Biochemistry 1996, 35, 11310.
119. Hargrove, M. S.; Wilkinson, A. J.; Olson, J. S. Biochemistry 1996, 35, 11300.
120. Breslow, E.; Koehler, R. J. Biol. Chem. 1965, 240, 2266.
121. Breslow, E.; Koehler, R.; Girotti, A. W. J. Biol. Chem. 1967, 242, 4149.
122. Moore, G. R.; Pettigrew, G. W. Cytochromes c: Evolutionary, Structural and Physiochemical Aspects; Springer-Verlag: New York, 1990.
123. Drygas, M. E.; Lambowitz, A. M.; Nargang, F. E. J. Biol. Chem. 1989, 264, 17897.
124. Sano, S.; Tanaka, K. J. Biol. Chem. 1964, 1964, 3109.
125. Barker, P. D.; Nerou, E. P.; Cheesman, M. R.; Thomson, A. J.; deOliveira, P.; Hill, H. A. O. Biochemistry 1996, 35, 13618.
126. Tomlinson, E. J.; Ferguson, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 5156.
127. Arnesano, F.; Banci, L.; Bertini, I.; Ciofi-Baffoni, S.; Woodyear, T. D. ; Johnson, C. M.; Barker, P. D. Biochemistry 2000, 39, 1499.
128. Martinez, S. E.; Huang, D.; Ponomarev, M.; Cramer, W. A.; Smith, J. L. Protein Sci. 1996, 5, 1081.
129. Vainshtein, B. K.; Melikadamyan, W. R.; Barynin, V. V.; Vagin, A. A.; Grebenko, A. I.; Borisov, V. V.; Bartels, K. S.; Fita, I.; Rossmann, M. G. J. Mol. Biol. 1986, 188, 49.
130. Williams, P. A.; Fulop, V.; Garman, E. F.; Saunders: N. F. W.; Ferguson, S. J.; Hajdu, J. Nature 1997, 389, 406.
131. Igarashi, N.; Moriyama, H.; Fujiwara, T.; Fukumori, Y.; Tanaka, N. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 276.
132. Crane, B. R.; Siegel, L. M.; Getzoff, E. D. Science 1995, 270, 59.
133. Lemberg, R.; Falk, J. E. Biochem. J. 1951, 49, 674.
134. Page, C. C.; Moser, C. C.; Chen, X. X.; Dutton, P. L. Nature 1999, 402, 47.
135. Devreese, B.; Costa, C.; Demol, H.; Papaefthymiou, V.; Moura, I.; Moura, J. J. R.; VanBeeumen, J. Eur. J. Biochem. 1997, 248, 445.
136. Matias, P. M.; Morais, J.; Coelho, A. V.; Meijers, R.; Gonzalez, A.; Thompson, A. W.; Sieker, L.; LeGall, J.; Carrondo, M. A. J. Biol. Inorg. Chem. 1997, 2, 507.
137. Abreu, I. A.; Lourenco, A. I.; Xavier, A. V.; LeGall, J.; Coelho, A. V.; Matias, P. M.; Pinto, D. M.; Carrondo, M. A.; Teixeira, M.; Saraiva, L. M. J. Biol. Inorg. Chem. 2003, 8, 360.
138. Perutz, M. F.; Rossmann, M. G.; Cullis, A. F.; Muirhead, H.; Will, G.; North, A. C. T. Nature 1960, 185, 416.
139. Fulop, V.; Moir, J. W. B.; Ferguson, S. J.; Hajdu, J. Cell 1995, 87, 369.
140. Houseman, A. L. P.; Doan, P. E.; Goodin, D. B.; Hoffman, B. M. Biochemistry 1993, 32, 4430.
141. Deisenhofer, J.; Epp, O.; Sinning, I.; Michel, H. J. Mol. Biol. 1995, 246, 429.
142. Munro, A. W.; Leys, D. G.; McLean, K. J.; Marshall, K. R.; Ost, T. W. B. ; Daff, S.; Miles, C. S.; Chapman, S. K.; Lysek, D. A.; Moser, C. C.; Page, C. C.; Dutton, P. L. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 250.
143. Crane, B. R.; Siegel, L. M.; Getzoff, E. D. Biochemistry 1997, 36, 12120.
144. Han, S. W.; Madden, J. F.; Siegel, L. M.; Spiro, T. G. Biochemistry 1989, 28, 5477.
145. Enemark, J. H.; Cosper, M. M. Met. Ions Biol. Syst. 2002, 39, 621.
146. Kniemeyer, O.; Heider, J. J. Biol. Chem. 2001, 276, 21381.
147. Iwata, S.; Ostermeier, C.; Ludwig, B.; Michel, H. Nature 1995, 376, 660.
148. Tsukihara, T.; Aoyama, H.; Yamashita, E.; Tomizaki, T.; Yamaguchi, H.; Shinzawaitoh, K.; Nakashima, R.; Yaono, R.; Yoshikawa, S. Science 1995, 269, 1069.
149. Babcock, G. T.; Wikström, M. Nature 1992, 356, 301.
150. Adelroth, P.; Gennis, R. B.; Brzezinski, P. Biochemistry 1998, 37, 2470.
151. Michel, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 12819.
152. Paula, S.; Sucheta, A.; Szundi, I.; Einarsdöttir, O. Biochemistry 1999, 38, 3025.
153. Namslauer, A.; Branden, M.; Brzezinski, P. Biochemistry 2002, 41, 10369.
154. Tomson, F. L.; Morgan, J. E.; Gu, G. P.; Barquera, B.; Vygodina, T. V.; Gennis, R. B. Biochemistry 2003, 42, 1711.
155. Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 235.
156. Iverson, T. M.; Arciero, D. M.; Hsu, B. T.; Logan, M. S. P.; Hooper, A. B.; Rees, D. C. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 1005.
157. Karlin, S.; Zhu, Z. Y.; Karlin, K. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 14225.
158. Karlin, S.; Zhu, Z. Y.; Karlin, K. D. Biochemistry 1998, 37, 17726.
159. Durley, R. C. E.; Mathews, F. S. Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 1996, 52, 65.
160. Aragao, D.; Frazao, C.; Sieker, L.; Sheldrick, G. M.; LeGall, J.; Carrondo, M. A. Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2003, 59, 644.
161. Dickerson, R. E.; Takano, T.; Eisenberg, D.; Kallai, O. B.; Samson, L.; Cooper, A.; Margoliash, E. J. Biol. Chem. 1971, 246, 1511.
162. Lanzilotta, W. N.; Schuller, D. J.; Thorsteinsson, M. V.; Kerby, R. L.; Roberts, G. P.; Poulos, T. L. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 876.
163. Einsle, O.; Messerschmidt, A.; Stach, P.; Bourenkov, G. P.; Bartunik, H. D.; Huber, R.; Kroneck, P. M. H. Nature 1999, 400, 476.
164. Leys, D.; Backers, K.; Meyer, T. E.; Hagen, W. R.; Cusanovich, M. A.; Van Beeumen, J. J. J. Biol. Chem. 2000, 275, 16050.
165. Arnoux, P.; Haser, R.; Izadi, N.; Lecroisey, A.; Delepierre, M.; Wandersman, C.; Czjzek, M. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 516.
166. Perutz, M. F.; Pulsinelli, P.; Ranney, H. M. Nature New Biol. 1972, 237, 259.
167. Andrews, S. C.; Arosio, P.; Bottke, W.; Briat, J. F.; Vondarl, M.; Harrison, P. M.; Laulhere, J. P.; Levi, S.; Lobreaux, S.; Yewdall, S. J. J. Inorg. Biochem. 1992, 47, 161.
168. Poulos, T. L.; Finzel, B. C.; Howard, A. J. J. Mol. Biol. 1987, 195, 687.
169. Kotsonis, P.; Frohlich, L. G.; Raman, C. S.; Li, H. Y.; Berg, M.; Gerwig, R.; Groehn, V.; Kang, Y. H.; Al-Masoudi, N.; Taghavi-Moghadam, S.; Mohr, D.; Munch, U.; Schnabel, J.; Martasek, P.; Masters, B. S. S.; Strobel, H.; Poulos, T.; Matter, H.; Pfleiderer, W.; Schmidt, H. H. H. W. J. Biol. Chem. 2001, 276, 49133.
170. Karmirantzou, M.; Thornton, J. M. Computational approaches to protein ligand interactions: protein - heme complexes; Munksgaard: Copenhagen, 1998.
171. Liu, D. H.; Williamson, D. A.; Kennedy, M. L.; Williams, T. D.; Morton, M. M.; Benson, D. R. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 11798.
172. Mathews, F. S.; Bethge, P. H.; Czerwinski, E. W. J. Biol. Chem. 1979, 254, 1699.
173. Weber, P. C.; Bartsch, R. G.; Cusanovich, M. A.; Hamlin, R. C.; Howard, A.; Jordan, S. R.; Kamen, M. D.; Meyer, T. E.; Weatherford, D. W.; Xuong, N. H. ; Salemme, F. R. Nature 1980, 286, 302.
174. Weber, P. C.; Salemme, F. R.; Mathews, F. S.; Bethge, P. H. J. Biol. Chem. 1981, 256, 7702.
175. Hayashi, T.; Hitomi, Y.; Suzuki, A.; Takimura, T.; Ogoshi, H. Chem. Lett. 1995, 911.
176. Gajhede, M.; Schuller, D. J.; Henriksen, A.; Smith, A. T.; Poulos, T. L. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 1032.
177. Poulos, T. L. Adv. Inorg. Biochem. 1988, 7, 1.
178. Orengo, C. A.; Michie, A. D.; Jones, S.; Jones, D. T.; Swindells, M. B.; Thornton, J. M. Structure 1997, 5, 1093.
179. Gardner, P. R.; Gardner, A. M.; Martin, L. A.; Salzman, A. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 10378.
180. Louie, G. V.; Brayer, G. D. J. Mol. Biol. 1990, 274, 527.
181. Breslow, R. Chem. Soc. Rev. 1972, 1, 553.
182. Breslow, R. Acc. Chem. Res. 1980, 13, 170.
183. Dumont, M. E.; Corin, A. F.; Campbell, G. A. Biochemistry 1994, 33, 7368.
184. Frolow, F.; Kalb, A. J.; Yariv, J. Nat. Struct. Biol. 1994, 1, 453.
185. Cobessi, D.; Huang, L. S.; Ban, M.; Pon, N. G.; Daldal, F.; Berry, E. A. Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2002, 58, 29.
186. Yankovskaya, V.; Horsefield, R.; Tornroth, S.; Luna-Chavez, C.; Miyoshi, H.; Leger, C.; Byrne, B.; Cecchini, G.; Iwata, S. Science 2003, 299, 700.
187. Beinert, H.; Holm, R. H.; Münck, E. Science 1997, 277, 653.
188. Izadi, N.; Henry, Y.; Haladjian, J.; Goldberg, M. E.; Wandersman, C.; Delepierre, M.; Lecroisey, A. Biochemistry 1997, 36, 7050.
189. Metzger, S. U.; Cramer, W. A.; Whitmarsh, J. Biochim. Biophys. Acta 1997, 1319, 233.
190. Winkler, J. R.; Wittung-Stafshede, P.; Leckner, J.; Malmström, B. G.; Gray, H. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 4246.
191. Moore, G. R.; Williams, R. J. P. FEBS Lett. 1977, 79, 229.
192. Gunner, M. R.; Alexov, E.; Torres, E.; Lipovaca, S. J. Biol. Inorg. Chem. 1997, 2, 126.
193. Zhou, H. X. J. Biol. Inorg. Chem. 1997, 2, 109.
194. Vanderkooi, G.; Stotz, E. J. Biol. Chem. 1966, 247, 3316.
195. Vanderkooi, G.; Stotz, E. J. Biol. Chem. 1966, 241, 2260.
196. Walker, F. A.; Lo, M. W.; Ree, M. T. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 5552.
197. Caughey, W. S.; Fujimoto, W. Y.; Johnson, B. P. Biochemistry 1966, 5, 3830.
198. Pearson, R. G. J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 3533.
199. Tezcan, F. A.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 13383.
200. Harbury, H. A.; Loach, P. A. J. Biol. Chem. 1960, 235, 3640.
201. Harbury, H. A.; Cronin, J. R.; Fanger, M. W.; Hettinge, T. P.; Murphy, A. J.; Myer, Y. P.; Vinograd, S. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1965, 54, 1658.
202. Santucci, R.; Reinhard, H.; Brunori, M. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 8536.
203. Battistuzzi, G.; Borsari, M.; Cowan, J. A.; Ranieri, A.; Sola, M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 5315.
204. Blair, D. F.; Ellis, W. R.; Wang, H.; Gray, H. B.; Chan, S. I. J. Biol. Chem. 1986, 267, 1524.
205. Antonini, E.; Wyman, J.; Brunori, M.; Taylor, J. F.; Rossi-Fanelli, A.; Caputo, A. J. Biol. Chem. 1964, 239, 907.
206. Collins, M. J.; Arciero, D. M.; Hooper, A. B. J. Biol. Chem. 1993, 268, 14655.
207. Roncel, M.; Ortega, J. M.; Losada, M. Eur. J. Biochem. 2001, 268, 4961.
208. Schichman, S. A.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 7794.
209. Bertrand, P.; Mbarki, O.; Asso, M.; Blanchard, L.; Guerlesquin, F.; Tegoni, M. Biochemistry 1995, 34, 11071.
210. Dikiy, A.; Carpentier, W.; Vandenberghe, I.; Borsari, M.; Safarov, N.; Dikaya, E.; Van Beeumen, J.; Ciurli, S. Biochemistry 2002, 41, 14689.
211. Watt, G. D.; Frankel, R. B.; Papaefthymiou, G. C.; Spartalian, K.; Stiefel, E. I. Biochemistry 1986, 25, 4330.
212. Andersen, J. F.; Ding, X. D.; Balfour, C.; Shokhireva, T. K.; Champagne, D. E.; Walker, F. A.; Montfort, W. R. Biochemistry 2000, 39, 10118.
213. Presta, A.; Weber-Main, A. M.; Stankovich, M. T.; Stuehr, D. J. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 9460.
214. Reid, L. S.; Taniguchi, V. T.; Gray, H. B.; Mauk, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 7516.
215. Meyer, T. E.; Cheddar, G.; Bartsch, R. G.; Getzoff, E. D.; Cusanovich, M. A.; Tollin, G. Biochemistry 1986, 25, 1383.
216. Barker, P. D.; Butler, J. L.; de Oliveira, P.; Hill, H. A. O.; Hunt, N. I. Inorg. Chim. Acta 1996, 252, 71.
217. Springs, S. L.; Bass, S. E.; McLendon, G. L. Biochemistry 2000, 39, 6075.
218. Kassner, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1972, 69, 2263.
219. Kassner, R. J. J. Am. Chem. Soc. 1973, 95, 2674.
220. Edholm, O.; Nordlander, P.; Chen, W.; Ohlsson, P. I.; Smith, M. L.; Paul, J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2000, 268, 683.
221. Mao, J. J.; Hauser, K.; Gunner, M. R. Biochemistry 2003, 42, 9829.
222. Kannt, A.; Lancaster, C. R. D.; Michel, H. Biophys. J. 1998, 74, 708.
223. Pereira, M. M.; Gomes, C. M.; Teixeira, M. FEBS Lett. 2002, 522, 14.
224. Churg, A. K.; Warshel, A. Biochemistry 1986, 25, 1675.
225. Warshel, A.; Papazyan, A.; Muegge, I. J. Biol. Inorg. Chem. 1997, 2, 143.
226. Gunner, M. R.; Alexov, E. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1458, 63.
227. Yang, Y.; Beck, B. W.; Shenoy, V. S.; Ichiye, T. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 7439.
228. Stephens, P. J.; Jollie, D. R.; Warshel, A. Chem. Rev. 1996, 96, 2491.
229. Beratan, D. N.; Onuchic, J. N.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Science 1992, 258, 1740.
230. Millett, F.; Miller, M. A.; Geren, L.; Durham, B. J. Bioenerg. Biomembr. 1995, 27, 341.
231. Moser, C. C.; Keske, J. M.; Warncke, K.; Farid, R. S.; Dutton, P. L. Nature 1992, 355, 796.
232. Weiss, J. J. Nature 1964, 202, 83.
233. Aron, J.; Baldwin, D. A.; Marques, H. M.; Pratt, J. M.; Adams, P. A. J. Inorg. Biochem. 1986, 27, 227.
234. Othman, S.; Lelirzin, A.; Desbois, A. Biochemistry 1993, 32, 9781.
235. Munro, O. Q.; Marques, H. M. Inorg. Chem. 1996, 35, 3752.
236. Carraway, A. D.; McCollum, M. G.; Peterson, J. Inorg. Chem. 1996, 35, 6885.
237. Casella, L.; De Gioia, L.; Silvestri, G. F.; Monzani, E.; Redaelli, C.; Roncone, R.; Santagostini, L. J. Inorg. Biochem. 2000, 79, 31.
238. Ippoliti, R.; Picciau, A.; Santucci, R.; Antonini, G.; Brunori, M.; Ranghino, G. Biochem. J. 1997, 328, 833.
239. Low, D. W.; Yang, G.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 4094.
240. Low, D. W.; Gray, H. B.; Duus, J. O. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 1.
241. Mondelli, R.; Scaglioni, L.; Mazzini, S.; Bolis, G.; Ranghino, G. Magn. Reson. Chem. 2000, 38, 229.
242. Elöve, G. A.; Bhuyan, A. K.; Roder, H. Biochemistry 1994, 33, 6925.
243. Warme, P. K.; Hager, L. P. Biochemistry 1970, 9, 1599.
244. Heijden, A. V. D.; Peer, H. G.; Vandenoo, A. H. Chem. Commun. 1971, 369.
245. Casella, L.; Gullotti, M.; Degioia, L.; Monzani, E.; Chillemi, F. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1991, 2945.
246. Casella, L.; Gullotti, M.; Degioia, L.; Bartesaghi, R.; Chillemi, F. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1993, 2233.
247. Casella, L.; Monzani, E.; Fantucci, P.; Gullotti, M.; DeGioia, L.; Strini, A.; Chillemi, F. Inorg. Chem. 1996, 35, 439.
248. Franceschi, F.; Gullotti, M.; Monzani, E.; Casella, L.; Papaefthymiou, V. Chem. Commun. 1996, 1645.
249. Monzani, E.; Casella, L.; Gullotti, M.; Panigada, N.; Franceschi, F.; Papaefthymiou, V. J. Mol. Catal. 1997, 117, 199.
250. Monzani, E.; Linati, L.; Casella, L.; De Gioia, L.; Favretto, M.; Gullotti, M.; Chillemi, F. Inorg. Chim. Acta 1998, 273, 339.
251. Blauer, G. Nature 1961, 189, 396.
252. Blauer, G.; Ehrenberg, A. Acta Chem. Scand. 1963, 17, 8.
253. Blauer, G. Biochim. Biophys. Acta 1964, 79, 547.
254. Blauer, G.; Yonath, A. Arch. Biochem. Biophys. 1967, 121, 587.
255. Tohjo, M.; Shibata, K. Arch. Biochem. Biophys. 1963, 103, 401.
256. Englander, S. W.; Sosnick, T. R.; Mayne, L. C.; Shtilerman, M.; Qi, P. X.; Bai, Y. W. Acc. Chem. Res. 1998, 31, 737.
257. Telford, J. R.; Tezcan, F. A.; Gray, H. B.; Winkler, J. R. Biochemistry 1999, 38, 1944.
258. Leutzinger, Y.; Beychok, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1981, 78, 780.
259. Ghadiri, M. R.; Soares, C.; Choi, C. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 825.
260. Gochin, M.; Khorosheva, V.; Case, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11018.
261. Williamson, D. A.; Benson, D. R. Chem. Commun. 1998, 961.
262. Nakanishi, K.; Berova, N.; Woody, R. W. Circular dichroism: Principles and applications; VCH: New York, 1994.
263. Liu, D. H.; Lee, K. H.; Benson, D. R. Chem. Commun. 1999, 1205.
264. Arnold, P. A.; Benson, D. R.; Brink, D. J.; Hendrich, M. P.; Jas, G. S.; Kennedy, M. L.; Petasis, D. T.; Wang, M. X. Inorg. Chem. 1997, 36, 5306.
265. Nastri, F.; Lombardi, A.; Morelli, G.; Maglio, O.; D'Auria, G.; Pedone, C.; Pavone, V. Chem. Eur. J. 1997, 3, 340.
266. D'Auria, G.; Maglio, O.; Nastri, F.; Lombardi, A.; Mazzeo, M.; Morelli, G.; Paolillo, L.; Pedone, C.; Pavone, V. Chem. Eur. J. 1997, 3, 350.
267. Lombardi, A.; Nastri, F.; Sanseverino, M.; Maglio, O.; Pedone, C.; Pavone, V. Inorg. Chim. Acta 1998, 276, 301.
268. Lombardi, A.; Nastri, F.; Maglio, O.; Marasco, D.; Coletta, M.; Pavone, V. J. Inorg. Biochem. 2001, 86, 318.
269. Geier, G. R.; Sasaki, T. Tetrahedron Lett. 1997, 38, 3821.
270. Geier, G. R.; Lybrand, T. P.; Sasaki, T. Tetrahedron 1999, 55, 1871.
271. Karpishin, T. B.; Vannelli, T. A.; Glover, K. J. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 9063.
272. Sasaki, T.; Kaiser, E. T. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 380.
273. Sasaki, T.; Kaiser, E. T. Biopolymers 1990, 29, 79.
274. Åkerfeldt, K. S.; Kim, R. M.; Camac, D.; Groves, J. T.; Lear, J. D.; DeGrado, W. F. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 9656.
275. Huffman, D. L.; Rosenblatt, M. M.; Suslick, K. S. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6183.
276. Rosenblatt, M. M.; Huffman, D. L.; Wang, X. T.; Remmer, H. A.; Suslick, K. S. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 12394.
277. Arnold, P. A.; Shelton, W. R.; Benson, D. R. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3181.
278. Sakamoto, S.; Sakurai, S.; Ueno, A.; Mihara, H. Chem. Commun. 1997, 1221.
279. Mutter, M.; Altmann, E.; Altmann, K. H.; Hersperger, R.; Koziej, P.; Nebel, K.; Tuchscherer, G.; Vuilleumier, S.; Gremlich, H. U.; Muller, K. Helv. Chim. Acta 1988, 71, 835.
280. Feng, Y. Q.; Sligar, S. G.; Wand, A. J. Nat. Struct. Biol. 1994, 1, 30.
281. Fuentes, E. J.; Wand, A. J. Biochemistry 1998, 37, 3687.
282. Adachi, S.; Nagano, S.; Watanabe, Y.; Ishimori, K.; Morishima, T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1991, 180, 138.
283. Adachi, S.; Nagano, S.; Ishimori, K.; Watanabe, Y.; Morishima, I.; Egawa, T.; Kitagawa, T.; Makino, R. Biochemistry 1993, 32, 241.
284. Egeberg, K. D.; Springer, B. A.; Martinis, S. A.; Sligar, S. G.; Morikis, D.; Champion, P. M. Biochemistry 1990, 29, 9783.
285. Hildebrand, D. P.; Burk, D. L.; Maurus, R.; Ferrer, J. C.; Brayer, G. D. ; Mauk, A. G. Biochemistry 1995, 34, 1997.
286. Barrick, D. Biochemistry 1994, 33, 6546.
287. Pond, A. E.; Roach, M. P.; Thomas, M. R.; Boxer, S. G.; Dawson, J. H. Inorg. Chem. 2000, 39, 6061.
288. Dou, Y.; Admiraal, S. J.; Ikedasaito, M.; Krzywda, S.; Wilkinson, A. J.; Li, T. S.; Olson, J. S.; Prince, R. C.; Pickering, I. J.; George, G. N. J. Biol. Chem. 1995, 270, 15993.
289. Lloyd, E.; Hildebrand, D. P.; Tu, K. M.; Mauk, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 6434.
290. Qin, J.; Lamar, G. N.; Dou, Y.; Admiraal, S. J.; Ikedasaito, M. J. Biol. Chem. 1994, 269, 1083.
291. Matsui, T.; Ozaki, S.; Liong, E.; Phillips, G. N.; Watanabe, Y. J. Biol. Chem. 1999, 274, 2838.
292. Sigman, J. A.; Kwok, B. C.; Lu, Y. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 8192.
293. Hayashi, T.; Dejima, H.; Matsuo, T.; Sato, H.; Murata, D.; Hisaeda, Y. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11226.
294. Banner, D. W.; Kokkinidis, M.; Tsernoglou, D. J. Mol. Biol. 1987, 196, 657.
295. Predki, P. F.; Regan, L. Biochemistry 1995, 34, 9834.
296. Wilson, J. R.; Caruana, D. J.; Gilardi, G. Chem. Commun. 2003, 356.
297. Gibney, B. R.; Huang, S. S.; Skalicky, J. J.; Fuentes, E. J.; Wand, A. J.; Dutton, P. L. Biochemistry, 2001, 40, 10550.
298. Struthers, M. D.: Cheng, R. P.; Imperiali, B. Science 1996, 271, 342.
299. Dahiyat, B. I.; Mayo, S. L. Science 1997, 278, 82.
300. Walsh, S. T. R.; Cheng, H.; Bryson, J. W.; Roder, H.; DeGrado, W. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 5486.
301. Hill, R. B.; DeGrado, W. F. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 1138.
302. Skalicky, J. J.; Gibney, B. R.; Rabanal, P.; Urbauer, R. J. B.; Dutton, P. L.; Wand, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 4941.
303. Willis, M. A.; Bishop, B.; Regan, L.; Brunger, A. T. Structure 2002, 8, 1319.
304. Huang, S. S.; Gibney, B. R.; Stayrook, S. E.; Dutton, P. L.; Lewis, M. J. Mol. Biol. 2003, 326, 1219.
305. Wei, Y.; Kim, S.; Fela, D.; Baum, J.; Hecht, M. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2003, 100, 13270.
306. Dai, Q.-H.; Tommos, C.; Fuentes, E. J.; Blomberg, M. R. A.; Dutton, P. L.; Wand. A. J. J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 10952.
307. Gibney, B. R.; Rabanal, F.; Skalicky, J. J.; Wand, A. J.; Dutton, P. L. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 2323-2324.
308. Munson, M.; Balasubramanian, S.; Fleming, K. G.; Nagi, A. D.; O'Brien, R. O.; Sturtevant, J. M.; Regan, L. Protein Science 1996, 5, 1584.
309. Bryson, J. W.; Desjarlais, J. M.; Handel, T. M.; DeGrado, W. F. Protein Sci., 1998, 7, 1404.
310. Huang, S. S.; Köder, R. L.; Lewis, M.; Wand, A. J.; Dutton, P. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., submitted.
311. Ho, S. P.; DeGrado, W. F. J. Am. Chem. Soc. 1987, 209, 6751.
312. Rau, H. K.; Haehnel, W. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 468.
313. Fahnenschmidt, M.: Bittl, R.; Schlodder, E.; Haehnel, W.: Lubitz, W. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 4082.
314. Sakamoto, S.; Ueno, A.; Mihara, H. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1998, 2395.
315. Obataya, I.; Kotaki, T.; Sakamoto, S.; Ueno, A.; Mihara, H. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2000, 10, 2719.
316. Isogai, Y.; Ota, M.; Fujisawa, T.; Izuno, H.; Mukai, M.; Nakamura, H.; Iizuka, T.; Nishikawa, K. Biochemistry 1999, 38, 7431.
317. Isogai, Y.; Ishii, A.; Ishida, M.; Mukai, M.; Ota, M.; Nishikawa, K.; Iizuka, T. Proc. Indian Acad. Sci. Chem. Sci. 2000,112, 215.
318. Tomizaki, K.; Nishino, H.; Kato, T.; Miike, A.; Nishino, N. Chem. Lett. 2000, 648.
319. Sakamoto, S.; Obataya, I.; Ueno, A.; Mihara, H. Chem. Commun. 1999, 1111.
320. Sakamoto, S.; Obataya, I.; Ueno, A.; Mihara, H. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1999, 2059.
321. Kamtekar, S.; Schiffer, J. M.; Xiong, H. Y.; Babik, J. M.; Hecht, M. H. Science 1993, 262, 1680.
322. Rosenbaum, D. M.; Roy, S.; Hecht, M. H. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9509.
323. Wei, Y. N.; Liu, T.; Sazinsky, S. L.; Moffet, D. A.; Pelczer, I.; Hecht, M. H. Protein Sci. 2003, 12, 92.
324. Rojas, N. R. L.; Kamtekar, S.; Simons, C. T.; Mclean, J. E.; Vogel, K. M.; Spiro, T. G.; Farid, R. S.; Hecht, M. H. Protein Sci. 1997, 6, 2512.
325. Moffet, D. A.; Case, M. A.; House, J. C.; Vogel, K.; Williams, R. D.; Spiro, T. G.; McLendon, G. L.; Hecht, M. H. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2109.
326. Moffet, D. A.; Foley, J.; Hecht, M. H. Biophys. Chem. 2003, 105, 231.
327. Rau, H. K.; DeJonge, N.; Haehnel, W. Angew. Chem., Int. Ed. 2000, 39, 250.
328. Berry, E. A.; Guergova-Kuras, M.; Huang, L. S.; Crofts, A. R. Annu. Rev. Biochem. 2000, 69, 1005.
329. Gao, X. G.; Wen, X. L.; Yu, C. A.; Esser, L.; Tsao, S.; Quinn, B.; Zhang, L.; Yu, L.; Xia, D. Biochemistry 2002, 41, 11692.
330. DeGrado, W. F.; Wasserman, Z. R.; Lear, J. D. Science 1989, 243, 622.
331. Kalsbeck, W. A.; Robertson, D. E.; Pandey, R. K.; Smith, K. M.; Dutton, P. L.; Bocian, D. F. Biochemistry 1996, 35, 3429.
332. Reedy, C. J.; Kennedy, M. L.; Gibney, B. R. Chem. Commun. 2003, 570.
333. Gibney, B. R.; Isogai, Y.; Rabanal, F.; Reddy, K. S.; Grosset, A. M.; Moser, C. C.; Dutton, P. L. Biochemistry 2000, 39, 11041.
334. Sharp, R. E.; Diers, J. R.; Bocian, D. F.; Dutton, P. L. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7103.
335. Xu, Z. J.; Farid, R. S. Protein Sci. 2001, 10, 236.
336. Iakovleva, O.; Reiner, M.; Rau, H.; Haehnel, W.; Parak, F. Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 655.
337. Fahnenschmidt, M.; Rau, H. K.; Bittl, R.; Haehnel, W.; Lubitz, W. Chem. Eur. J. 1999, 5, 2327.
338. Rau, H. K.; Snigula, H.; Struck, A.; Robert, B.; Scheer, H.; Haehnel, W. Eur. J. Biochem. 2001, 268, 3284.
339. Ushiyama, M.; Arisaka, F.; Yamamura, T. Chem. Lett. 1999, 127.
340. Ushiyama, M.; Yoshino, A.; Yamamura, T.; Shida, Y.; Arisaka, F. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1999, 72, 1351.
341. Takeuchi, Y.; Watanabe, H.; Kashiwada, A.; Nagata, M.; Ohtsuka, T.; Nishino, N.; Kawai, H.; Nagamura, T.; Kurono, Y.; Oku, N.; Nango, M. Chem. Lett. 2002, 848.
342. Gibney, B. R.; Rabanal, F.; Reddy, K. S.; Dutton, P. L. Biochemistry 1998, 37, 4635.
343. Cristian, L.; Piotrowiak, P.; Farid, R. S. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11814.
344. Mihara, H.; Tomizaki, K.; Fujimoto, T.; Sakamoto, S.; Aoyagi, H.; Nishino, N. Chem. Lett. 1996, 187.
345. Tomizaki, K. Y.; Nishino, H.; Arai, T.; Kato, T.; Nishino, N. Chem. Lett. 2003, 32, 6.
346. Gibney, B. R.; Johansson, J. S.; Rabanal, F.; Skalicky, J. J.; Wand, A. J.; Dutton, P. L. Biochemistry 1997, 36, 2798.
347. Rau, H. K.; DeJonge, N.; Haehnel, W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 11526.
348. Tomizaki, K. Y.; Murata, T.; Kaneko, K.; Miike, A.; Nishino, N. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 2000, 5, 1067.
349. Gibney, B. R.; Dutton, P. L. Protein Sci. 1999, 8, 1888.
350. Privett, H. K.; Reedy, C. J.; Kennedy, M. L.; Gibney, B. R. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6828.
351. Huffman, D. L.; Suslick, K. S. Inorg. Chem. 2000, 39, 5418.
352. Kennedy, M. L.; Silchenko, S.; Houndonougbo, N.; Gibney, B. R.; Dutton, P. L.; Rodgers, K. R.; Benson, D. R. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4635.
353. Shifman, J. M.; Gibney, B. R.; Sharp, R. E.; Dutton, P. L. Biochemistry 2000, 39, 14813.
354. Lecomte, J. T. J.; Scott, N. L.; Vu, B. C.; Falzone, C. J. Biochemistry 2001, 40, 6541.
355. Raphael, A. L.; Gray, H. B. Proteins: Struct, Funct. Genet. 1989, 6, 338.
356. Gunner, M. R.; Honig, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 9151.
357. Ohnishi, T. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1364, 186.
358. Dutton, P. L.; Jackson, J. B. Eur. J. Biochem. 1972, 30, 495.
359. Lee, K. H.; Kennedy, M. L.; Buchalova, M.; Benson, D. R. Tetrahedron 2000, 56, 9725.
360. Tsuchida, E.; Honda, K.; Hasegawa, E. Biochim. Biophys. Acta 1975, 393, 483.
361. Tsuchida, E.; Hasegawa, E.; Honda, K. Biochim. Biophys. Acta 1976, 427, 520.
362. Keilin, D.; Mann, T. Proc. R. Soc. London, B 1937, 122B, 119.
363. Orf, H. W.; Dolphin, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1971, 74, 2646.
364. Cunningham, I. D.; Bachelor, J. L.; Pratt, J. M. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1991, 1839.
365. Ricoux, R.; Boucher, J. L.; Mansuy, D.; Mahy, J. P. Eur. J. Biochem. 2001, 268, 3783.
366. Colonna, S.; Gaggero, N.; Carrea, G.; Pasta, P. Tetrahedron Lett. 1994, 35, 9103.
367. Ricoux, R.; Boucher, J. L.; Mandon, D.; Frapart, Y. M.; Henry, Y.; Mansuy, D.; Mahy, J. P. Eur. J. Biochem. 2003, 270, 47.
368. Adams, P. A.; Adams, C. J. Inorg. Biochem. 1988, 34, 177.
369. Veeger, C. J. Inorg. Biochem. 2002, 91, 35.
370. Baldwin, D. A.; Marques, H. M.; Pratt, J. M. FEBS Lett. 1985, 183, 309.
371. Nastri, F.; Lombardi, A.; Morelli, G.; Pedone, C.; Pavone, V.; Chottard, G.; Battioni, P.; Mansuy, D. J. Biol. Inorg. Chem. 1998, 3, 671.
372. Geier, G. R.; Sasaki, T. Tetrahedron 1999, 55, 1859.
373. Adams, P. A. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1990, 1407.
374. Cunningham, I. D.; Snare, G. R. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1992, 2019.
375. Primus, J. L.; Grunenwald, S.; Hagedoorn, P. L.; Albrecht-Gary, A. M.; Mandon, D.; Veeger, C. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 1214.
376. Cunningham, I. D.; Bachelor, J. L.; Pratt, J. M. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1994, 1347.
377. Adams, P. A.; Goold, R. D. Chem. Commun. 1990, 97.
378. Low, D. W.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 117.
379. Osman, A. M.; Koerts, J.; Boersma, M. G.; Boeren, S.; Veeger, C.; Rietjens, I. M. C. M. Eur. J. Biochem. 1996, 240, 232.
380. Benner, S. A. Nature 2003, 421, 118.
381. Mehl, R. A.; Anderson, J. C.; Santoro, S. W.; Wang, L.; Martin, A. B.; King, D. S.; Horn, D. M.; Schultz, P. G. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 935.
382. Hofmann, R. M.; Muir, T. W. Curr. Opin. Biotechnol. 2002, 13, 297.
383. Dawson, P. E.; Kent, S. B. H. Annu. Rev. Biochem. 2000, 69, 923.
384. Gademann, K.; Hane, A.; Rueping, M.; Jaun, B.; Seebach, D. Angew. Chem., Int. Ed. 2003, 42, 1534.
385. Raguse, T. L.; Lai, J. R.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 5592.
386. Koradi, R.; Billeter, M.; Wüthrich, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 51.
387. Roberts, S. A.; Weichsel, A.; Qiu, Y.; Shelnutt, J. A.; Walker, F. A.; Montfort, W. R. Biochemistry 2001, 40, 11327.
388. Gong, W. M.; Hao, B.; Mansy, S. S.; Gonzalez, G.; Gilles-Gonzalez, M. A. ; Chan, M. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 15177.
389. Mashino, T.; Nakamura, S.; Hirobe, M. Tetrahedron Lett. 1990, 31, 3163.
390. Isogai, Y.; Ishii, A.; Fujisawa, T.; Ota, M.; Nishikawa, K. Biochemistry 2000, 39, 5683.