SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Canadian Journal of Chemistry

Volumn 87, Issue 7, 2009, Pages 850-863

Glycosidic bond cleavage in deoxynucleotides - A density functional study1

(2) Millen, Andrea L a Wetmore, Stacey D a

a UNIVERSITY OF LETHBRIDGE (Canada)

Author keywords

Density functional theory (DFT); DNA; Glycosidic bond cleavage; Hydrogen bond; Solvation

Indexed keywords

A-DENSITY; AQUEOUS ENVIRONMENT; BOND CLEAVAGES; DENSITY FUNCTIONAL THEORY (DFT); GASPHASE; GLYCOSIDIC BOND CLEAVAGE; HIGH ENERGY PROCESS; HYDROGEN BONDING INTERACTIONS; HYDROGEN BONDINGS; NUCLEOBASES; PURINE NUCLEOTIDES; REACTION ENERGETICS; REACTION ENERGY; REACTION EXOTHERMICITY; SMALL MOLECULES;

BINDING SITES; DNA; GENES; HYDROGEN; HYDROGEN BONDS; NUCLEIC ACIDS; NUCLEOPHILES; NUCLEOTIDES; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; SOLVATION;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EID: 68349121682 PISSN: 00084042 EISSN: None Source Type: Journal
DOI: 10.1139/V09-024 Document Type: Article

Times cited : (24)

References (125)

1
- 68349120769
- This article is part of a Special Issue dedicated to Professor T. Ziegler.
- This Article is Part of a Special Issue Dedicated to Professor T. Ziegler

2
- 0004146045
- Wiley Inc.: New York, USA
- Voet, D.; Voet, J. G.; Pratt, C. W. Fundamentals of biochemistry, Upgrade Edition; Wiley Inc.: New York, USA, 2002.
- (2002) Fundamentals of Biochemistry, Upgrade Edition
- Voet, D.¹ Voet, J.G.² Pratt, C.W.³

3
- 0015493356
- doi:10.1021/bi00751a005. PMID:5009434
- Shapiro, R.; Danzig, M. Biochemistry 1972, 11, 23 doi:10.1021/ bi00751a005. PMID:5009434.
- (1972) Biochemistry , vol.11 , pp. 23
- Shapiro, R.¹ Danzig, M.²

4
- 0014514426
- doi:10.1021/bi00833a004. PMID:5785205
- Shapiro, R.; Kang, S. Biochemistry 1969, 8, 1806. doi:10.1021/ bi00833a004. PMID:5785205.
- (1969) Biochemistry , vol.8 , pp. 1806
- Shapiro, R.¹ Kang, S.²

5
- 0010640015
- doi:10.1021/ja01000a044
- Piszkiewicz, D.; Bruice, T. C. J. Am. Chem. Soc. 1967, 89, 6237 doi:10.1021/ja01000a044.
- (1967) J. Am. Chem. Soc. , vol.89 , pp. 6237
- Piszkiewicz, D.¹ Bruice, T.C.²

6
- 1842272047
- doi:10.1021/ja01023a032
- Piszkiewicz, D.; Bruice, T. C. J. Am. Chem. Soc. 1968, 90, 5844 doi:10.1021/ja01023a032.
- (1968) J. Am. Chem. Soc. , vol.90 , pp. 5844
- Piszkiewicz, D.¹ Bruice, T.C.²

7
- 0014408877
- doi:10.1021/ja01010a038. PMID:5644189
- Piszkiewicz, D.; Bruice, T. C. J. Am. Chem. Soc. 1968, 90, 2156. doi:10.1021/ja01010a038. PMID:5644189.
- (1968) J. Am. Chem. Soc. , vol.90 , pp. 2156
- Piszkiewicz, D.¹ Bruice, T.C.²

8
- 0016383208
- doi:10.1021/ja00827a047. PMID:4414318
- Cadet, J.; Teoule, R. J. Am. Chem. Soc. 1974, 96, 6517. doi:10.1021/ja00827a047. PMID:4414318.
- (1974) J. Am. Chem. Soc. , vol.96 , pp. 6517
- Cadet, J.¹ Teoule, R.²

9
- 0021327233
- PMID:6546573
- Prior, J. J.; Santi, D. V. J. Biol. Chem. 1984, 259, 2429. PMID:6546573.
- (1984) J. Biol. Chem. , vol.259 , pp. 2429
- Prior, J.J.¹ Santi, D.V.²

10
- 0014961477
- doi:10.1021/ja00709a055. PMID:5418456
- Zoltewicz, J. A.; Clark, D. F.; Sharpless, T. W.; Grahe, G. J. Am. Chem. Soc. 1970, 92, 1741. doi:10.1021/ja00709a055. PMID:5418456.
- (1970) J. Am. Chem. Soc. , vol.92 , pp. 1741
- Zoltewicz, J.A.¹ Clark, D.F.² Sharpless, T.W.³ Grahe, G.⁴

11
- 0005958936
- Chernikov, A. V.; Usacheva, A. M.; Bruskov, V. I. Biochemistry 1996, 61, 35.
- (1996) Biochemistry , vol.61 , pp. 35
- Chernikov, A.V.¹ Usacheva, A.M.² Bruskov, V.I.³

12
- 0041472499
- doi:10.1021/ar0200495. PMID: 12924955
- Schramm, V. L. Acc. Chem. Res. 2003, 36, 588. doi:10.1021/ar0200495. PMID: 12924955.
- (2003) Acc. Chem. Res. , vol.36 , pp. 588
- Schramm, V.L.¹

13
- 0348111556
- doi:10.1016/j.sbi.2003.10.002. PMID:14675552
- Versees, W.; Steyaert, J. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 731. doi:10.1016/j.sbi.2003.10.002. PMID:14675552.
- (2003) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.13 , pp. 731
- Versees, W.¹ Steyaert, J.²

14
- 9744244983
- doi:10.1016/j.abb.2004.08.035. PMID:15581562
- Schramm, V. L. Arch. Biochem. Biophys. 2005, 433, 13. doi:10.1016/j.abb.2004.08.035. PMID:15581562.
- (2005) Arch. Biochem. Biophys , vol.433 , pp. 13
- Schramm, V.L.¹

15
- 33644635257
- doi:10.1021/cr0404611. PMID:16464017
- Berti, P. J.; McCann, J. A. B. Chem. Rev. 2006, 106, 506. doi:10.1021/cr0404611. PMID:16464017.
- (2006) Chem. Rev. , vol.106 , pp. 506
- Berti, P.J.¹ McCann, J.A.B.²

16
- 0042342532
- doi:10.1021/cr010219b. PMID:12848584
- Stivers, J. T.; Jiang, Y. L. Chem. Rev. 2003, 103, 2729. doi:10.1021/cr010219b. PMID:12848584.
- (2003) Chem. Rev. , vol.103 , pp. 2729
- Stivers, J.T.¹ Jiang, Y.L.²

17
- 23444460570
- PMID:16027052
- Hunt, C.; Gillani, N.; Farone, A.; Rezaei, M.; Kline, P. C. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1751, 140 PMID:16027052.
- (2005) Biochim. Biophys. Acta , vol.1751 , pp. 140
- Hunt, C.¹ Gillani, N.² Farone, A.³ Rezaei, M.⁴ Kline, P.C.⁵

18
- 0242592081
- doi:10.1021/bi0347914. PMID:14596604
- Vandemeulebroucke, A.; Versees, W.; De Vos, S.; Van Holsbeke, E.; Steyaert, J. Biochemistry 2003, 42, 12902. doi:10.1021/bi0347914. PMID:14596604.
- (2003) Biochemistry , vol.42 , pp. 12902
- Vandemeulebroucke, A.¹ Versees, W.² De Vos, S.³ Van Holsbeke, E.⁴ Steyaert, J.⁵

19
- 33646190292
- doi:10.1016/j.jmb.2006.03.026
- Versees, W.; Barlow, J.; Steyaert, J. J. Mol. Biol. 2006, 359, 331 doi:10.1016/j.jmb.2006.03.026.
- (2006) Mol. Biol. , vol.359 , pp. 331
- Versees, W.¹ Barlow, J.² Steyaert, J.J.³

20
- 29144515477
- doi:10.1016/j.phytochem.2005.10.006. PMID:16300810
- Bates, C.; Kendrick, Z.; McDonald, N.; Kline, P. C. Phytochemistry 2006, 67, 5 doi:10.1016/j.phytochem.2005.10.006. PMID:16300810.
- (2006) Phytochemistry , vol.67 , pp. 5
- Bates, C.¹ Kendrick, Z.² McDonald, N.³ Kline, P.C.⁴

21
- 0026341458
- doi:10.1021/bi00108a026. PMID:1931998
- Horenstein, B. A.; Parkin, D. W.; Estupinan, B.; Schramm, V. L. Biochemistry 1991, 30, 10788 doi:10.1021/bi00108a026. PMID:1931998.
- (1991) Biochemistry , vol.30 , pp. 10788
- Horenstein, B.A.¹ Parkin, D.W.² Estupinan, B.³ Schramm, V.L.⁴

22
- 0025741769
- doi:10.1021/bi00232a032. PMID:2021651
- Parkin, D. W.; Mentch, F.; Banks, G. A.; Horenstein, B. A.; Schramm, V. L. Biochemistry 1991, 30, 4586 doi:10.1021/bi00232a032. PMID:2021651.
- (1991) Biochemistry , vol.30 , pp. 4586
- Parkin, D.W.¹ Mentch, F.² Banks, G.A.³ Horenstein, B.A.⁴ Schramm, V.L.⁵

23
- 0023129244
- doi:10.1021/bi00377a037. PMID:3552038
- Mentch, F.; Parkin, D. W.; Schramm, V. L. Biochemistry 1987, 26, 921 doi:10.1021/bi00377a037. PMID:3552038.
- (1987) Biochemistry , vol.26 , pp. 921
- Mentch, F.¹ Parkin, D.W.² Schramm, V.L.³

24
- 0023127914
- doi:10.1021/bi00377a036. PMID:3552037
- Parkin, D. W.; Schramm, V. L. Biochemistry 1987, 26, 913. doi:10.1021/bi00377a036. PMID:3552037.
- (1987) Biochemistry , vol.26 , pp. 913
- Parkin, D.W.¹ Schramm, V.L.²

25
- 31044447929
- doi:10.1021/bi0511991. PMID:16411753
- Muzzolini, L.; Versees, W.; Tornaghi, P.; Van Holsbeke, E.; Steyaert, J.; Degano, M. Biochemistry 2006, 45, 773 doi:10.1021/bi0511991. PMID:16411753.
- (2006) Biochemistry , vol.45 , pp. 773
- Muzzolini, L.¹ Versees, W.² Tornaghi, P.³ Van Holsbeke, E.⁴ Steyaert, J.⁵ Degano, M.⁶

26
- 17344381987
- Leaving group activation by aromatic stacking: An alternative to general acid catalysis
- DOI 10.1016/j.jmb.2004.02.049, PII S0022283604002293
- Versées, W.; Loverix, S.; Vandemeulebroucke, A.; Geerlings, P.; Steyaert, J. J. Mol. Biol. 2004, 338, 1. doi:10.1016/j.jmb.2004.02.049. (Pubitemid 38429781)
- (2004) Journal of Molecular Biology , vol.338 , Issue.1 , pp. 1-6
- Versees, W.¹ Loverix, S.² Vandemeulebroucke, A.³ Geerlings, P.⁴ Steyaert, J.⁵

27
- 19644382751
- doi:10.1021/bi047394h. PMID:15909995
- Mazumder-Shivakumar, D.; Bruice, T. C. Biochemistry 2005, 44, 7805 doi:10.1021/bi047394h. PMID:15909995.
- (2005) Biochemistry , vol.44 , pp. 7805
- Mazumder-Shivakumar, D.¹ Bruice, T.C.²

28
- 0037065294
- doi:10.1021/ja021088e. PMID:12465969
- Mazumder, D.; Bruice, T. C. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14591. doi:10.1021/ja021088e. PMID:12465969.
- (2002) J. Am. Chem. Soc. , vol.124 , pp. 14591
- Mazumder, D.¹ Bruice, T.C.²

29
- 17644382347
- Substrate-assisted leaving group activation in enzyme-catalyzed N-glycosidic bond cleavage
- DOI 10.1074/jbc.M413231200
- Loverix, S.; Geerlings, P.; McNaughton, M.; Augustyns, K.; Vandemeulebroucke, A.; Steyaert, J.; Versees, W. J. Biol. Chem. 2005, 280, 14799 doi:10.1074/jbc.M413231200. (Pubitemid 40562828)
- (2005) Journal of Biological Chemistry , vol.280 , Issue.15 , pp. 14799-14802
- Loverix, S.¹ Geerlings, P.² McNaughton, M.³ Augustyms, K.⁴ Vandemeulebroucke, A.⁵ Steyaert, J.⁶ Versees, W.⁷

30
- 33645285871
- doi:10.1002/qua.20785
- Loverix, S.; Versees, W.; Steyaert, J.; Geerlings, P. Int. J. Quantum Chem. 2006, 106, 565. doi:10.1002/qua.20785.
- (2006) Int. J. Quantum Chem. , vol.106 , pp. 565
- Loverix, S.¹ Versees, W.² Steyaert, J.³ Geerlings, P.⁴

31
- 34250201455
- doi:10.1021/ja0673711. PMID:17497857
- McCann, J. A. B.; Berti, P. J. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 7055. doi:10.1021/ja0673711. PMID:17497857.
- (2007) J. Am. Chem. Soc. , vol.129 , pp. 7055
- McCann, J.A.B.¹ Berti, P.J.²

32
- 0034088859
- Ricin A-chain: Kinetic isotope effects and transition state structure with stem-loop RNA
- DOI 10.1021/ja992750i
- Chen, X.-Y.; Berti, P. J.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1609 doi:10.1021/ja992750i. (Pubitemid 30134205)
- (2000) Journal of the American Chemical Society , vol.122 , Issue.8 , pp. 1609-1617
- Chen, X.-Y.¹ Berti, P.J.² Schramm, V.L.³

33
- 0039303524
- Transition-state analysis for depurination of DNA by ricin A-chain
- DOI 10.1021/ja992751a
- Chen, X.-Y.; Berti, P. J.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 6527 doi:10.1021/ja992751a. (Pubitemid 30489970)
- (2000) Journal of the American Chemical Society , vol.122 , Issue.28 , pp. 6527-6534
- Chen, X.-Y.¹ Berti, P.J.² Schramm, V.L.³

34
- 2142662114
- doi: 10.102l/bi0498499. PMID:15109250
- Roday, S.; Amukele, T.; Tyler, G. B. P. C.; Furneaux, R. H.; Schramm, V. L. Biochemistry 2004, 43, 4923. doi: 10.102l/bi0498499. PMID:15109250.
- (2004) Biochemistry , vol.43 , pp. 4923
- Roday, S.¹ Amukele, T.² Tyler, G.B.P.C.³ Furneaux, R.H.⁴ Schramm, V.L.⁵

35
- 0034090941
- NMR evidence for an unusually low N1 pK(a) for uracil bound to uracil DNA glycosylase: Implications for catalysis [20]
- DOI 10.1021/ja993254x
- Drohat, A. C.; Stivers, J. T. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1840 doi:10.1021/ja993254x. (Pubitemid 30134246)
- (2000) Journal of the American Chemical Society , vol.122 , Issue.8 , pp. 1840-1841
- Drohat, A.C.¹ Stivers, J.T.²

36
- 0033554424
- doi:10.1021/bi9910878. PMID:10508389
- Drohat, A. C.; Jagadeesh, J.; Ferguson, E.; Stivers, J. T. Biochemistry 1999, 38, 11866 doi:10.1021/bi9910878. PMID:10508389.
- (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 11866
- Drohat, A.C.¹ Jagadeesh, J.² Ferguson, E.³ Stivers, J.T.⁴

37
- 0033554395
- doi:10.1021/bi9910880. PMID:10508390
- Drohat, A. C; Xiao, G.; Tordova, M.; Jagadeesh, J.; Pankiewicz, K. W.; Watanabe, K. A.; Gilliland, G. L.; Stivers, J. T. Biochemistry 1999, 38, 11876 doi:10.1021/bi9910880. PMID:10508390.
- (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 11876
- Drohat, A.C.¹ Xiao, G.² Tordova, M.³ Jagadeesh, J.⁴ Pankiewicz, K.W.⁵ Watanabe, K.A.⁶ Gilliland, G.L.⁷ Stivers, J.T.⁸

38
- 0028959237
- doi:10.1038/373487a0. PMID:7845459
- Sawa, R.; McAuley-Hecht, K.; Brown, T.; Pearl, L. Nature 1995, 373, 487. doi:10.1038/373487a0. PMID:7845459.
- (1995) Nature , vol.373 , pp. 487
- Sawa, R.¹ McAuley-Hecht, K.² Brown, T.³ Pearl, L.⁴

39
- 0345270445
- doi:10.1021/bi027014x. PMID:12590578
- Jiang, Y. L.; Ichikawa, Y.; Song, F.; Stivers, J. T. Biochemistry 2003, 42, 1922 doi:10.1021/bi027014x. PMID:12590578.
- (2003) Biochemistry , vol.42 , pp. 1922
- Jiang, Y.L.¹ Ichikawa, Y.² Song, F.³ Stivers, J.T.⁴

40
- 0037013320
- doi:10.1074/jbc. M200634200
- Jiang, Y. L.; Drohat, A. C.; Ichikawa, Y.; Stivers, J. T. J. Biol. Chem. 2002, 277, 15385 doi:10.1074/jbc. M200634200.
- (2002) Biol. Chem , vol.277 , pp. 15385
- Jiang, Y.L.¹ Drohat, A.C.² Ichikawa, Y.³ Stivers, J.T.J.⁴

41
- 0037018940
- doi:10.1021/bi025694y. PMID:12033946
- Jiang, Y. L.; Ichikawa, Y.; Stivers, J. T. Biochemistry 2002, 41, 7116 doi:10.1021/bi025694y. PMID:12033946.
- (2002) Biochemistry , vol.41 , pp. 7116
- Jiang, Y.L.¹ Ichikawa, Y.² Stivers, J.T.³

42
- 0035954406
- doi:10.1021/bi010622c. PMID:11412125
- Jiang, Y. L.; Stivers, J. T. Biochemistry 2001, 40, 7710 doi:10.1021/bi010622c. PMID:11412125.
- (2001) Biochemistry , vol.40 , pp. 7710
- Jiang, Y.L.¹ Stivers, J.T.²

43
- 0033787170
- doi:10.1021/bi001437m. PMID:11052677
- Dong, J.; Drohat, A. C.; Stivers, J. T.; Pankiewicz, K. W.; Carey, P. R. Biochemistry 2000, 39, 13241 doi:10.1021/bi001437m. PMID:11052677.
- (2000) Biochemistry , vol.39 , pp. 13241
- Dong, J.¹ Drohat, A.C.² Stivers, J.T.³ Pankiewicz, K.W.⁴ Carey, P.R.⁵

44
- 0034601807
- doi:10.1021/bi000922e. PMID:11009598
- Drohat, A. C.; Stivers, J. T. Biochemistry 2000, 39, 11865 doi:10.1021/bi000922e. PMID:11009598.
- (2000) Biochemistry , vol.39 , pp. 11865
- Drohat, A.C.¹ Stivers, J.T.²

45
- 0034700259
- doi:10.1021/bi0018178. PMID:11087352
- Werner, R. M.; Stivers, J. T. Biochemistry 2000, 39, 14054 doi:10.1021/bi0018178. PMID:11087352.
- (2000) Biochemistry , vol.39 , pp. 14054
- Werner, R.M.¹ Stivers, J.T.²

46
- 0033551258
- doi:10.1021/bi982986j. PMID:10200172
- Shroyer, M. J. N.; Bennett, S. E.; Putnam, C. D.; Tainer, J. A.; Mosbaugh, D. W. Biochemistry 1999, 38, 4834. doi:10.1021/bi982986j. PMID:10200172.
- (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 4834
- Shroyer, M.J.N.¹ Bennett, S.E.² Putnam, C.D.³ Tainer, J.A.⁴ Mosbaugh, D.W.⁵

47
- 0242286685
- doi:10.1021/bi035372+. PMID:14580190
- Bianchet, M. A.; Seiple, L. A.; Jiang, Y. L.; Ichikawa, Y.; Amzel, L. M.; Stivers, J. T. Biochemistry 2003, 42, 12455 doi:10.1021/bi035372+. PMID:14580190.
- (2003) Biochemistry , vol.42 , pp. 12455
- Bianchet, M.A.¹ Seiple, L.A.² Jiang, Y.L.³ Ichikawa, Y.⁴ Amzel, L.M.⁵ Stivers, J.T.⁶

48
- 0034734380
- doi:10.1016/S0921-8777(00)00026-4. PMID:10946228
- Parikh, S. S.; Putnam, C. D.; Tainer, J. A. Mutat. Res. DNA Repair 2000, 460, 183 doi:10.1016/S0921-8777(00)00026-4. PMID:10946228.
- (2000) Mutat. Res. DNA Repair , vol.460 , pp. 183
- Parikh, S.S.¹ Putnam, C.D.² Tainer, J.A.³

49
- 0034700259
- doi:10.1021/bi0018178. PMID:11087352
- Werner, R. M.; Stivers, J. T. Biochemistry 2000, 39, 14054 doi:10.1021/bi0018178. PMID:11087352.
- (2000) Biochemistry , vol.39 , pp. 14054
- Werner, R.M.¹ Stivers, J.T.²

50
- 0034625082
- doi:10.1073/pnas.97.10.5083. PMID:10805771
- Parikh, S. S.; Walcher, G.; Jones, G. D.; Slupphaug, G.; Krokan, H. E.; Blackburn, G. M.; Tainer, J. A. Proc. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 5083. doi:10.1073/pnas.97.10.5083. PMID:10805771.
- (2000) Proc. Nati. Acad. Sci. U.S.A. , vol.97 , pp. 5083
- Parikh, S.S.¹ Walcher, G.² Jones, G.D.³ Slupphaug, G.⁴ Krokan, H.E.⁵ Blackburn, G.M.⁶ Tainer, J.A.⁷

51
- 33751236524
- doi:10.1021/bi061061y. PMID:17105188
- Ma, A.; Hu, J.; Karplus, M.; Dinner, A. R. Biochemistry 2006, 45, 13687 doi:10.1021/bi061061y. PMID:17105188.
- (2006) Biochemistry , vol.45 , pp. 13687
- Ma, A.¹ Hu, J.² Karplus, M.³ Dinner, A.R.⁴

52
- 0035909316
- doi: 10.1038/35099587. PMID:11607036
- Dinner, A. R.; Blackburn, G. M.; Karplus, M. Nature 2001, 413, 752 doi: 10.1038/35099587. PMID:11607036.
- (2001) Nature , vol.413 , pp. 752
- Dinner, A.R.¹ Blackburn, G.M.² Karplus, M.³

53
- 0034183512
- doi:10.1016/S0097-8485(99)00073-X. PMID:10816003
- Osman, R.; Fuxreiter, M.; Luo, N. Comput. Chem. 2000, 24, 331 doi:10.1016/S0097-8485(99)00073-X. PMID:10816003.
- (2000) Comput. Chem , vol.24 , pp. 331
- Osman, R.¹ Fuxreiter, M.² Luo, N.³

54
- 0033587492
- doi:10.1021/bi990262h. PMID:10413495
- Luo, N.; Mehler, E.; Osman, R. Biochemistry 1999, 38, 9209. doi:10.1021/bi990262h. PMID:10413495.
- (1999) Biochemistry , vol.38 , pp. 9209
- Luo, N.¹ Mehler, E.² Osman, R.³

55
- 42649085059
- doi:10.1021/ja711363s. PMID:18393424
- McCann, J. A. B.; Berti, P. J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 5789 doi:10.1021/ja711363s. PMID:18393424.
- (2008) J. Am. Chem. Soc. , vol.130 , pp. 5789
- McCann, J.A.B.¹ Berti, P.J.²

56
- 33845733787
- doi:10.1016/j.dnarep.2006.08.006. PMID:16996809
- Eutsey, R.; Wang, G.; Maier, R. J. DNA Repair (Amst.) 2007, 6, 19 doi:10.1016/j.dnarep.2006.08.006. PMID:16996809.
- (2007) DNA Repair (Amst.) , vol.6 , pp. 19
- Eutsey, R.¹ Wang, G.² Maier, R.J.³

57
- 33744484774
- doi:10.2741/2033. PMID:16720376
- Lu, A. L.; Bai, H. B.; Shi, G. L.; Chang, D. Y. Front. Biosci. 2006, 11, 3062 doi:10.2741/2033. PMID: 16720376.
- (2006) Front. Biosci. , vol.11 , pp. 3062
- Lu, A.L.¹ Bai, H.B.² Shi, G.L.³ Chang, D.Y.⁴

58
- 27444434257
- doi: 10.1021/bi050976u. PMID:16245934
- Livingston, A. L.; Kundu, S.; Pozzi, M. H.; Anderson, D. W.; David, S. S. Biochemistry 2005, 44, 14179 doi: 10.1021/bi050976u. PMID:16245934.
- (2005) Biochemistry , vol.44 , pp. 14179
- Livingston, A.L.¹ Kundu, S.² Pozzi, M.H.³ Anderson, D.W.⁴ David, S.S.⁵

59
- 7944228647
- doi:10.1016/j.dnarep.2004.08.004. PMID:15533841
- Pope, M. A.; David, S. S. DNA Repair (Amst.) 2005, 4, 91 doi:10.1016/j.dnarep.2004.08.004. PMID: 15533841.
- (2005) DNA Repair (Amst.) , vol.4 , pp. 91
- Pope, M.A.¹ David, S.S.²

60
- 1342304229
- doi:10.1038/nature02306. PMID:14961129
- Fromme, J. C.; Banerjee, A.; Huang, S. J.; Verdine, G. L. Nature 2004, 427, 652 doi:10.1038/nature02306. PMID:14961129.
- (2004) Nature , vol.427 , pp. 652
- Fromme, J.C.¹ Banerjee, A.² Huang, S.J.³ Verdine, G.L.⁴

61
- 8744274358
- doi:10.1074/jbc. M403944200
- Manuel, R. C.; Hitomi, K.; Arvai, A. S.; House, P. G.; Kurtz, A. J.; Dodson, M. L.; McCullough, A. K.; Tainer, J. A.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 2004, 279, 46930 doi:10.1074/jbc. M403944200.
- (2004) J. Biol. Chem. , vol.279 , pp. 46930
- Manuel, R.C.¹ Hitomi, K.² Arvai, A.S.³ House, P.G.⁴ Kurtz, A.J.⁵ Dodson, M.L.⁶ McCullough, A.K.⁷ Tainer, J.A.⁸ Lloyd, R.S.⁹

62
- 0034610354
- doi:10.1021/bi001538k. PMID:11101292
- Zharkov, D. O.; Gilboa, R.; Yagil, I; Kycia, J. H.; Gerchman, S. E.; Shoham, C.; Grollman, A. P. Biochemistry 2000, 39, 14768. doi:10.1021/bi001538k. PMID:11101292.
- (2000) Biochemistry , vol.39 , pp. 14768
- Zharkov, D.O.¹ Gilboa, R.² Yagil, I.³ Kycia, J.H.⁴ Gerchman, S.E.⁵ Shoham C⁶ Grollman, A.P.⁷

63
- 34347264416
- doi:10.1021/ja0716453. PMID:17536801
- Hamm, M. L.; Gill, T. J.; Nicolson, S. C.; Summers, M. R. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 7724 doi:10.1021/ja0716453. PMID:17536801.
- (2007) J. Am. Chem. Soc. , vol.129 , pp. 7724
- Hamm, M.L.¹ Gill, T.J.² Nicolson, S.C.³ Summers, M.R.⁴

64
- 33847293432
- doi:10.1016/j.dnarep.2006.10.022. PMID:17126083
- Sidorenko, V. S.; Nevinsky, G. A.; Zharkov, D. O. DNA Repair (Amst.) 2007, 6, 317 doi:10.1016/j.dnarep.2006.10.022. PMID:17126083.
- (2007) DNA Repair (Amst.) , vol.6 , pp. 317
- Sidorenko, V.S.¹ Nevinsky, G.A.² Zharkov, D.O.³

65
- 33845640485
- Interactions of human 8-oxoguanine DNA glycosylase with single- and double-stranded DNAs
- DOI 10.1134/S002689330606015X
- Kirpota, O. O.; Zharkov, D. O.; Buneva, V. N.; Nevinsky, G. A. Mol. Biol. 2006, 40, 952 doi:10.1134/S002689330606015X. (Pubitemid 44951277)
- (2006) Molecular Biology , vol.40 , Issue.6 , pp. 952-960
- Kirpota, O.O.¹ Zharkov, D.O.² Buneva, V.N.³ Nevinsky, G.A.⁴

66
- 22444442634
- doi:10.1093/nar/gki694. PMID:16024742
- Kuznetsov, N. A.; Koval, V. V.; Zharkov, D. O.; Nevinsky, G. A.; Douglas, K. T.; Fedorova, O. S. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 3919. doi:10.1093/nar/ gki694. PMID: 16024742.
- (2005) Nucleic Acids Res. , vol.33 , pp. 3919
- Kuznetsov, N.A.¹ Koval, V.V.² Zharkov, D.O.³ Nevinsky, G.A.⁴ Douglas, K.T.⁵ Fedorova, O.S.⁶

67
- 34247862129
- Structural characterization of human 8-oxoguanine DNA glycosylase variants bearing active site mutations
- DOI 10.1074/jbc.M608989200
- Radom, C. T.; Banerjee, A.; Verdine, G. L. J. Biol. Chem. 2007, 282, 9182 doi:10.1074/jbc.M608989200. (Pubitemid 47093467)
- (2007) Journal of Biological Chemistry , vol.282 , Issue.12 , pp. 9182-9184
- Radom, C.T.¹ Banerjee, A.² Verdine, G.L.³

68
- 15844379169
- doi:10.1038/nature03458. PMID:15800616
- Banerjee, A.; Yang, W.; Karplus, M.; Verdine, G. L. Nature 2005, 434, 612 doi:10.1038/nature03458. PMID:15800616.
- (2005) Nature , vol.434 , pp. 612
- Banerjee, A.¹ Yang, W.² Karplus, M.³ Verdine, G.L.⁴

69
- 10644221354
- doi:10.1016/j.chembiol.2004.09.014. PMID:15610848
- Chung, S. J.; Verdine, G. L. Chem. Biol. 2004, 11, 1643 doi:10.1016/j.chembiol.2004.09.014. PMID:15610848.
- (2004) Chem. Biol. , vol.11 , pp. 1643
- Chung, S.J.¹ Verdine, G.L.²

70
- 0346319010
- doi:10.1038/nsb902. PMID:12592398
- Fromme, J. C.; Bruner, S. D.; Yang, W.; Karplus, M.; Verdine, G. L. Nat. Struct. Biol. 2003, 10, 204 doi:10.1038/nsb902. PMID:12592398.
- (2003) Nat. Struct. Biol. , vol.10 , pp. 204
- Fromme, J.C.¹ Bruner, S.D.² Yang, W.³ Karplus, M.⁴ Verdine, G.L.⁵

71
- 0037452513
- doi:10.1021/bi026823d. PMID:12578369
- Norman, D. P. G.; Chung, S. J.; Verdine, G. L. Biochemistry 2003, 42, 1564 doi:10.1021/bi026823d. PMID:12578369.
- (2003) Biochemistry , vol.42 , pp. 1564
- Norman, D.P.G.¹ Chung, S.J.² Verdine, G.L.³

72
- 0034708226
- doi:10.1038/35002510. PMID:10706276
- Bruner, S. D.; Norman, D. P. G.; Verdine, G. L. Nature 2000, 403, 859. doi:10.1038/35002510. PMID:10706276.
- (2000) Nature , vol.403 , pp. 859
- Bruner, S.D.¹ Norman, D.P.G.² Verdine, G.L.³

73
- 34347331176
- doi:10.1021/jp071581i. PMID:17508740
- Calvaresi, M.; Bottoni, A.; Garavelli, M. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 6557 doi:10.1021/jp071581i. PMID:17508740.
- (2007) J. Phys. Chem. B , vol.111 , pp. 6557
- Calvaresi, M.¹ Bottoni, A.² Garavelli, M.³

74
- 14844345843
- doi:10.1021/jp045686m. PMID:16833496
- Schyman, P.; Danielsson, J.; Pinak, M.; Laaksonen, A. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 1713 doi:10.1021/jp045686m. PMID:16833496.
- (2005) J. Phys. Chem. A , vol.109 , pp. 1713
- Schyman, P.¹ Danielsson, J.² Pinak, M.³ Laaksonen, A.⁴

75
- 18244376096
- Quantum chemical study on base excision mechanism of 8-oxoguanine DNA glycosylase: Substrate-assisted catalysis of the N-glycosidic linkage cleavage reaction
- DOI 10.1273/cbij.4.73
- Osakabe, T.; Fujii, Y.; Hata, M.; Tsuda, M.; Neya, S.; Hoshino, T. Chem-Bio Infomatics J. 2004, 4, 73. doi:10.1273/cbij.4.73. (Pubitemid 40632061)
- (2004) Chem-Bio Informatics Journal , vol.4 , Issue.3 , pp. 73-92
- Osakabe, T.¹ Fujii, Y.² Hata, M.³ Tsuda, M.⁴ Neya, S.⁵ Hoshino, T.⁶

76
- 33746677481
- doi:10.1016/j.dnarep.2006.05.042. PMID:16857432
- Amara, P.; Serre, L. DNA Repair (Amst.) 2006, 5, 947 doi:10.1016/j. dnarep.2006.05.042. PMID:16857432.
- (2006) DNA Repair (Amst.) , vol.5 , pp. 947
- Amara, P.¹ Serre, L.²

77
- 27644527003
- doi:10.1016/j.biochi.2005.05.011. PMID:15979229
- Rogacheva, M. V.; Saparbaev, M. K.; Afanasov, I. M.; Kuznetsova, S. A. Biochimie 2005, 87, 1079 doi:10.1016/j.biochi.2005.05.011. PMID:15979229.
- (2005) Biochimie , vol.87 , pp. 1079
- Rogacheva, M.V.¹ Saparbaev, M.K.² Afanasov, I.M.³ Kuznetsova, S.A.⁴

78
- 0142187125
- doi:10.1016/S1568-7864(03)00084-3. PMID:12893082
- Zharkov, D. O.; Shoham, G.; Grollman, A. P. DNA Repair (Amst.) 2003, 2, 839 doi:10.1016/S1568-7864(03)00084-3. PMID:12893082.
- (2003) DNA Repair (Amst.) , vol.2 , pp. 839
- Zharkov, D.O.¹ Shoham, G.² Grollman, A.P.³

79
- 0142187125
- doi:10.1016/S1568-7864(03) 00084-3. PMID:12893082
- Zharkov, D. O.; Shoham, G.; Grollman, A. P. DNA Repair (Amst.) 2003, 2, 839 doi:10.1016/S1568-7864(03) 00084-3. PMID:12893082.
- (2003) DNA Repair (Amst.) , vol.2 , pp. 839
- Zharkov, D.O.¹ Shoham, G.² Grollman, A.P.³

80
- 0031239573
- doi:10.1016/S1074-5521(97)90225-8. PMID:9331411
- Nash, H. M.; Lu, R. Z.; Lane, W. S.; Verdine, G. L. Chem. Biol. 1997, 4, 693 doi:10.1016/S1074-5521(97)90225-8. PMID:9331411.
- (1997) Chem. Biol. , vol.4 , pp. 693
- Nash, H.M.¹ Lu, R.Z.² Lane, W.S.³ Verdine, G.L.⁴

81
- 0030991774
- doi:10.1021/bi963005a. PMID:9125531
- Rabow, L. E.; Kow, Y. W. Biochemistry 1997, 36, 5084. doi:10.1021/bi963005a. PMID:9125531.
- (1997) Biochemistry , vol.36 , pp. 5084
- Rabow, L.E.¹ Kow, Y.W.²

82
- 27244433288
- doi:10.1093/nar/gki879. PMID:16243784
- De Jésus, K. P.; Serre, L.; Zelwer, C.; Castaing, B. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 5936 doi:10.1093/nar/gki879. PMID:16243784.
- (2005) Nucleic Acids Res. , vol.33 , pp. 5936
- De Jésus, K.P.¹ Serre, L.² Zelwer, C.³ Castaing, B.⁴

83
- 0346435086
- DNA Lesion Recognition by the Bacterial Repair Enzyme MutM
- DOI 10.1074/jbc.M307768200
- Fromme, J. C.; Verdine, G. L. J. Biol. Chem. 2003, 278, 51543 doi:10.1074/jbc.M307768200. (Pubitemid 38020397)
- (2003) Journal of Biological Chemistry , vol.278 , Issue.51 , pp. 51543-51548
- Fromme, J.C.¹ Verdine, G.L.²

84
- 0036294464
- PMID:12055620
- Fromme, J. C; Verdine, G. L. Nat. Struct. Biol. 2002, 9, 544 PMID:12055620.
- (2002) Nat. Struct. Biol. , vol.9 , pp. 544
- Fromme, J.C.¹ Verdine, G.L.²

85
- 0037205477
- Structure of formamidopyrimidine-DNA glycosylase covalently complexed to DNA
- DOI 10.1074/jbc.M202058200
- Gilboa, R.; Zharkov, D. O.; Golan, G.; Fernandes, A. S.; Gerchman, S. E.; Matz, E.; Kycia, J. H.; Grollman, A. P.; Shoham, G. J. Biol. Chem. 2002, 277, 19811 doi:10.1074/jbc.M202058200. (Pubitemid 34967498)
- (2002) Journal of Biological Chemistry , vol.277 , Issue.22 , pp. 19811-19816
- Gilboa, R.¹ Zharkov, D.O.² Golan, G.³ Fernandes, A.S.⁴ Gerchman, S.E.⁵ Matz, E.⁶ Kycia, J.H.⁷ Grollman, A.P.⁸ Shoham, G.⁹

86
- 0034254724
- doi:10.1093/emboj/19.15.3857. PMID:10921868
- Sugahara, M.; Mikawa, T.; Kumasaka, T.; Yamamoto, M.; Kato, R.; Fukuyama, K.; Inoue, Y.; Kuramitsu, S. EMBO J. 2000, 19, 3857. doi:10.1093/emboj/19.15. 3857. PMID:10921868.
- (2000) EMBO J. , vol.19 , pp. 3857
- Sugahara, M.¹ Mikawa, T.² Kumasaka, T.³ Yamamoto, M.⁴ Kato, R.⁵ Fukuyama, K.⁶ Inoue, Y.⁷ Kuramitsu, S.⁸

87
- 33745020081
- doi:10.1021/bi052383p. PMID:16752923
- Harbut, M. B.; Meador, M.; Dodson, M. L.; Lloyd, R. S. Biochemistry 2006, 45, 7341 doi:10.1021/bi052383p. PMID:16752923.
- (2006) Biochemistry , vol.45 , pp. 7341
- Harbut, M.B.¹ Meador, M.² Dodson, M.L.³ Lloyd, R.S.⁴

88
- 1042301371
- Zaika, E. I.; Perlow, R. A.; Matz, E.; Broyde, S.; Gilboa, R.; Grollman, A. P.; Zharkov, D. O. J. Biol. Chem. 2004, 279, 4849
- (2004) Biol. Chem , vol.279 , pp. 4849
- Zaika, E.I.¹ Perlow, R.A.² Matz, E.³ Broyde, S.⁴ Gilboa, R.⁵ Grollman, A.P.⁶ Zharkov, D.O.J.⁷

89
- 2342487278
- doi:10.1093/nar/gkh237. PMID:14769949
- Koval, V. V.; Kuznetsov, N. A.; Zharkov, D. O.; Ishchenko, A. A.; Douglas, K. T.; Nevinsky, G. A.; Fedorova, O. S. Nucleic Acids Res. 2004, 32, 926 doi:10.1093/nar/gkh237. PMID:14769949.
- (2004) Nucleic Acids Res. , vol.32 , pp. 926
- Koval, V.V.¹ Kuznetsov, N.A.² Zharkov, D.O.³ Ishchenko, A.A.⁴ Douglas, K.T.⁵ Nevinsky, G.A.⁶ Fedorova, O.S.⁷

90
- 0345448159
- PMID:14637251
- Zharkov, D. O.; Ishchenko, A. A.; Douglas, K. T.; Nevinsky, G. A. Mutat. Res. 2003, 531, 141 PMID:14637251.
- (2003) Mutat. Res. , vol.531 , pp. 141
- Zharkov, D.O.¹ Ishchenko, A.A.² Douglas, K.T.³ Nevinsky, G.A.⁴

91
- 0037129958
- doi:10.1021/bi0121297. PMID:12056884
- Ishchenko, A. A.; Vasilenko, N. L.; Sinitsina, O. L; Yamkovoy, V. L.; Fedorova, O. S.; Douglas, K. T.; Nevinsky, G. A. Biochemistry 2002, 41, 7540. doi:10.1021/bi0121297. PMID:12056884.
- (2002) Biochemistry , vol.41 , pp. 7540
- Ishchenko, A.A.¹ Vasilenko, N.L.² Sinitsina, O.L.³ Yamkovoy, V.L.⁴ Fedorova, O.S.⁵ Douglas, K.T.⁶ Nevinsky, G.A.⁷

92
- 33748508626
- doi: 10.1021/bi060380m. PMID:16953574
- Song, K.; Hornak, V.; Santos, C. D.; Grollman, A. P.; Simmerling, C. Biochemistry 2006, 45, 10886 doi: 10.1021/bi060380m. PMID:16953574.
- (2006) Biochemistry , vol.45 , pp. 10886
- Song, K.¹ Hornak, V.² Santos, C.D.³ Grollman, A.P.⁴ Simmerling, C.⁵

93
- 11144256241
- doi:10.1021/bi048747f. PMID:15610004
- Perlow-Poehnelt, R. A.; Zharkov, D. O.; Grollman, A. P.; Broyde, S. Biochemistry 2004, 43, 16092 doi:10.1021/bi048747f. PMID:15610004.
- (2004) Biochemistry , vol.43 , pp. 16092
- Perlow-Poehnelt, R.A.¹ Zharkov, D.O.² Grollman, A.P.³ Broyde, S.⁴

94
- 3342891076
- doi:10.1110/ps.04772404. PMID:15273302
- Amara, P.; Serre, L.; Castaing, B.; Thomas, A. Protein Sci. 2004, 13, 2009. doi:10.1110/ps.04772404. PMID:15273302.
- (2004) Protein Sci. , vol.13 , pp. 2009
- Amara, P.¹ Serre, L.² Castaing, B.³ Thomas, A.⁴

95
- 31544456090
- doi: 10.1021/jp051277u. PMID:16405318
- Nunez, S.; Wing, C.; Antoniou, D.; Schramm, V. L.; Schwartz, S. D. J. Phys. Chem. A. 2006, 110, 463 doi: 10.1021/jp051277u. PMID:16405318.
- (2006) J. Phys. Chem. A. , vol.110 , pp. 463
- Nunez, S.¹ Wing, C.² Antoniou, D.³ Schramm, V.L.⁴ Schwartz, S.D.⁵

96
- 0347989420
- doi:10.1016/j.bbrc.2003.11.179. PMID:14706628
- Canduri, F.; dos Santos, D. M.; Silva, R. G.; Mendes, M. A.; Basso, L. A.; Palma, M. S.; de Azevedo, W. F.; Santos, D. S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004, 313, 907 doi:10.1016/j.bbrc.2003.11.179. PMID:14706628.
- (2004) Biochem. Biophys. Res. Commun. , vol.313 , pp. 907
- Canduri, F.¹ Dos Santos, D.M.² Silva, R.G.³ Mendes, M.A.⁴ Basso, L.A.⁵ Palma, M.S.⁶ De Azevedo, W.F.⁷ Santos, D.S.⁸

97
- 1042299983
- doi:10.1021/bi0359123. PMID:14769022
- Lewandowicz, A.; Schramm, V. L. Biochemistry 2004, 43, 1458 doi:10.1021/bi0359123. PMID:14769022.
- (2004) Biochemistry , vol.43 , pp. 1458
- Lewandowicz, A.¹ Schramm, V.L.²

98
- 0038522525
- doi:10.1021/bi0343830. PMID:12755607
- Lewandowicz, A.; Shi, W. X.; Evans, G. B.; Tyler, P. C; Furneaux, R. H.; Basso, L. A.; Santos, D. S.; Almo, S. C.; Schramm, V. L. Biochemistry 2003, 42, 6057 doi:10.1021/bi0343830. PMID:12755607.
- (2003) Biochemistry , vol.42 , pp. 6057
- Lewandowicz, A.¹ Shi, W.X.² Evans, G.B.³ Tyler, P.C.⁴ Furneaux, R.H.⁵ Basso, L.A.⁶ Santos, D.S.⁷ Almo, S.C.⁸ Schramm, V.L.⁹

99
- 0027729453
- doi:10.1021/bi00211a033. PMID:8241176
- Kline, P. C.; Schramm, V. L. Biochemistry 1993, 32, 13212 doi:10.1021/bi00211a033. PMID:8241176.
- (1993) Biochemistry , vol.32 , pp. 13212
- Kline, P.C.¹ Schramm, V.L.²

100
- 0028932756
- doi: 10.1021/bi00004a008. PMID:7827065
- Kline, P. C.; Schramm, V. L. Biochemistry 1995, 34, 1153. doi: 10.1021/bi00004a008. PMID:7827065.
- (1995) Biochemistry , vol.34 , pp. 1153
- Kline, P.C.¹ Schramm, V.L.²

101
- 33645005493
- doi:10.1016/j.jsb.2005.11.014. PMID:16469506
- Gao, X.-F.; Huang, X.-R.; Sun, C.-C. J. Struct. Biol. 2006, 154, 20 doi:10.1016/j.jsb.2005.11.014. PMID:16469506.
- (2006) J. Struct. Biol. , vol.154 , pp. 20
- Gao, X.-F.¹ Huang, X.-R.² Sun, C.-C.³

102
- 10844296687
- doi:10.1021/bi048167i. PMID:15595853
- Deng, H.; Cahill, S. M.; Abad, J. L.; Lewandowicz, A.; Callender, R. H.; Schramm, V. L.; Jones, R. A. Biochemistry 2004, 43, 15966 doi:10.1021/bi048167i. PMID:15595853.
- (2004) Biochemistry , vol.43 , pp. 15966
- Deng, H.¹ Cahill, S.M.² Abad, J.L.³ Lewandowicz, A.⁴ Callender, R.H.⁵ Schramm, V.L.⁶ Jones, R.A.⁷

103
- 10044273966
- doi:10.1021/ja0457563. PMID:15571394
- Nunez, S.; Antoniou, D.; Schramm, V. L.; Schwartz, S. D. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 15720. doi:10.1021/ja0457563. PMID:15571394.
- (2004) J. Am. Chem. Soc. , vol.126 , pp. 15720
- Nunez, S.¹ Antoniou, D.² Schramm, V.L.³ Schwartz, S.D.⁴

104
- 33745383208
- doi:10.1021/ja0570281. PMID:16771490
- Deng, H.; Murkin, A. S.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 7765 doi:10.1021/ja0570281. PMID:16771490.
- (2006) J. Am. Chem. Soc. , vol.128 , pp. 7765
- Deng, H.¹ Murkin, A.S.² Schramm, V.L.³

105
- 3543083466
- doi:10.1021/ja049296p. PMID:15291536
- Deng, H.; Lewandowicz, A.; Schramm, V. L.; Callender, R. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 9516. doi:10.1021/ja049296p. PMID:15291536.
- (2004) J. Am. Chem. Soc. , vol.126 , pp. 9516
- Deng, H.¹ Lewandowicz, A.² Schramm, V.L.³ Callender, R.⁴

106
- 33646533314
- PMID:16631420
- Wielgus-Kutrowska, B.; Bzowska, A. Biochim. Biophys. Acta 2006, 1764, 887 PMID:16631420.
- (2006) Biochim. Biophys. Acta , vol.1764 , pp. 887
- Wielgus-Kutrowska, B.¹ Bzowska, A.²

107
- 2242437134
- doi:10.1021/bi026636f. PMID:12463747
- Kicska, G. A.; Tyler, P. C; Evans, G. B.; Furneaux, R. H.; Shi, W. X.; Fedorov, A.; Lewandowicz, A.; Cahill, S. M.; Almo, S. C; Schramm, V. L. Biochemistry 2002, 41, 14489 doi:10.1021/bi026636f. PMID:12463747.
- (2002) Biochemistry , vol.41 , pp. 14489
- Kicska, G.A.¹ Tyler, P.C.² Evans, G.B.³ Furneaux, R.H.⁴ Shi, W.X.⁵ Fedorov, A.⁶ Lewandowicz, A.⁷ Cahill, S.M.⁸ Almo, S.C.⁹ Schramm, V.L.¹⁰

108
- 0035969964
- doi: 10.1021/bi002499f. PMID:11170405
- Fedorov, A.; Shi, W.; Kicska, G.; Fedorov, E.; Tyler, P. C.; Furneaux, R. H.; Hanson, J. C.; Gainsford, G. J.; Larese, J. Z.; Schramm, V. L.; Almo, S. C. Biochemistry 2001, 40, 853 doi: 10.1021/ bi002499f. PMID: 11170405.
- (2001) Biochemistry , vol.40 , pp. 853
- Fedorov, A.¹ Shi, W.² Kicska, G.³ Fedorov, E.⁴ Tyler, P.C.⁵ Furneaux, R.H.⁶ Hanson, J.C.⁷ Gainsford, G.J.⁸ Larese, J.Z.⁹ Schramm, V.L.¹⁰ Almo, S.C.¹¹

109
- 0030760959
- doi:10.1021/bi961970v. PMID:9305963
- Erion, M. D.; Stoeckler, J. D.; Guida, W. C; Walter, R. L.; Ealick, S. E. Biochemistry 1997, 36, 11735. doi:10.1021/bi961970v. PMID:9305963.
- (1997) Biochemistry , vol.36 , pp. 11735
- Erion, M.D.¹ Stoeckler, J.D.² Guida, W.C.³ Walter, R.L.⁴ Ealick, S.E.⁵

110
- 1542366683
- doi:10.1021/ja039260h. PMID:14982453
- Birck, M. R.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 2447 doi:10.1021/ja039260h. PMID:14982453.
- (2004) J. Am. Chem. Soc. , vol.126 , pp. 2447
- Birck, M.R.¹ Schramm, V.L.²

111
- 3042734708
- doi:10.1021/ja0492642. PMID:15174854
- Birck, M. R.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6882. doi:10.1021/ja0492642. PMID:15174854.
- (2004) J. Am. Chem. Soc. , vol.126 , pp. 6882
- Birck, M.R.¹ Schramm, V.L.²

112
- 0347093512
- doi:10.1021/bi034793o. PMID:14717594
- Mendieta, J.; Martin-Santamaria, S.; Priego, E.-M.; Balzarini, M.-J.; Camarasa, M.-J.; Perez-Perez, M.-J.; Gago, F. Biochemistry 2004, 43, 405. doi:10.1021/bi034793o. PMID:14717594.
- (2004) Biochemistry , vol.43 , pp. 405
- Mendieta, J.¹ Martin-Santamaria, S.² Priego, E.-M.³ Balzarini, M.-J.⁴ Camarasa, M.-J.⁵ Perez-Perez, M.-J.⁶ Gago, F.⁷

113
- 34248204233
- doi:10.1021/jp063841m. PMID:17388517
- Millen, A. L.; Archibald, L. A. B.; Hunter, K. C.; Wetmore, S. D. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 3800. doi:10.1021/jp063841m. PMID:17388517.
- (2007) J. Phys. Chem. B , vol.111 , pp. 3800
- Millen, A.L.¹ Archibald, L.A.B.² Hunter, K.C.³ Wetmore, S.D.⁴

114
- 84961976154
- Modeling electron transfer in biochemistry: A quantum chemical study of charge separation in Rhodobacter sphaeroides and photosystem II
- DOI 10.1021/ja9805268
- Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M.; Babcock, G. T. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 8812 doi:10.1021/ja9805268. (Pubitemid 28442920)
- (1998) Journal of the American Chemical Society , vol.120 , Issue.34 , pp. 8812-8824
- Blomberg, M.R.A.¹ Siegbahn, P.E.M.² Babcock, G.T.³

115
- 0001363007
- doi:10.1021/cr980390w. PMID:11749242
- Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A. Chem. Rev. 2000, 100, 421 doi:10.1021/cr980390w. PMID:11749242.
- (2000) Chem. Rev. , vol.100 , pp. 421
- Siegbahn, P.E.M.¹ Blomberg, M.R.A.²

116
- 0035807631
- A quantum chemical approach to the study of reaction mechanisms of redox-active metalloenzymes
- DOI 10.1021/jp010305f
- Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 9375 doi:10.1021/jp010305f. (Pubitemid 35338661)
- (2001) Journal of Physical Chemistry B , vol.105 , Issue.39 , pp. 9375-9386
- Blomberg, M.R.A.¹ Siegbahn, P.E.M.²

117
- 0038305457
- doi: 10.1021/cr020436s. PMID:12797836
- Himo, F.; Siegbahn, P. E. M. Chem. Rev. 2003, 103, 2421 doi: 10.1021/cr020436s. PMID:12797836.
- (2003) Chem. Rev. , vol.103 , pp. 2421
- Himo, F.¹ Siegbahn, P.E.M.²

118
- 4143050236
- doi:10.1021/ja049186i. PMID:15315438
- Cho, K. B.; Gauld, J. W. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 10267 doi:10.1021/ja049186i. PMID:15315438.
- (2004) J. Am. Chem. Soc. , vol.126 , pp. 10267
- Cho, K.B.¹ Gauld, J.W.²

119
- 30544431835
- doi:10.1021/jp054864o. PMID:16375351
- Cho, K. B.; Gauld, J. W. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 23706. doi:10.1021/jp054864o. PMID:16375351.
- (2005) J. Phys. Chem. B , vol.109 , pp. 23706
- Cho, K.B.¹ Gauld, J.W.²

120
- 0038626673
- Revisions D.02. Gaussian, Inc.: Wallingford, Conn., USA
- Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millani, J. M.; Iyengar, S. S.; Tornasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Ratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revisions D.02. Gaussian, Inc.: Wallingford, Conn., USA., 2004.
- (2004) Gaussian 03
- Frisch, M.J.¹ Trucks, G.W.² Schlegel, H.B.³ Scuseria, G.E.⁴ Robb, M.A.⁵ Cheeseman, J.R.⁶ Montgomery Jr., J.A.⁷ Vreven, T.⁸ Kudin, K.N.⁹ Burant, J.C.¹⁰ Millani, J.M.¹¹ Iyengar, S.S.¹² Tornasi, J.¹³ Barone, V.¹⁴ Mennucci, B.¹⁵ Cossi, M.¹⁶ Scalmani, G.¹⁷ Rega, N.¹⁸ Petersson, G.A.¹⁹ Nakatsuji, H.²⁰ more..

121
- 0346947348
- doi:10.1021/jp035496w
- Di Laudo, M.; Whittleton, S. R.; Wetmore, S. D. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 10406. doi:10.1021/jp035496w.
- (2003) J. Phys. Chem. A , vol.107 , pp. 10406
- Di Laudo, M.¹ Whittleton, S.R.² Wetmore, S.D.³

122
- 4944248669
- doi:10.1021/jp048318r
- Whittleton, S. R.; Hunter, K. C.; Wetmore, S. D. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 7709. doi:10.1021/jp048318r.
- (2004) J. Phys. Chem. A , vol.108 , pp. 7709
- Whittleton, S.R.¹ Hunter, K.C.² Wetmore, S.D.³

123
- 27744502063
- doi:10.1021/jp0527709. PMID:16866407
- Hunter, K. C.; Rutledge, L. R.; Wetmore, S. D. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 9554. doi:10.1021/jp0527709. PMID:16866407.
- (2005) J. Phys. Chem. A , vol.109 , pp. 9554
- Hunter, K.C.¹ Rutledge, L.R.² Wetmore, S.D.³

124
- 23144459575
- doi:10.1021/jp0509919. PMID:16833978
- McConnell, T. L.; Wheaton, C. A.; Hunter, K. C; Wetmore, S. D. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 6351. doi:10.1021/jp0509919. PMID:16833978.
- (2005) J. Phys. Chem. A , vol.109 , pp. 6351
- McConnell, T.L.¹ Wheaton, C.A.² Hunter, K.C.³ Wetmore, S.D.⁴

125
- 84962383061
- doi:10.1021/jp066641j. PMID:17302396
- Hunter, K. C.; Wetmore, S. D. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 1933. doi:10.1021/jp066641j. PMID:17302396.
- (2007) J. Phys. Chem. A , vol.111 , pp. 1933
- Hunter, K.C.¹ Wetmore, S.D.²

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.