A mechanistic perspective on the chemistry of DNA repair glycosylases

Chemical Reviews

Volumn 103, Issue 7, 2003, Pages 2729-2759

  Stivers, James T ^a   Jiang, Yu Lin ^a  

^a JOHNS HOPKINS UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GENETIC MUTATIONS;

BINDING ENERGY; CELLS; CHEMICAL BONDS; CHEMOTHERAPY; ENZYMES; ISOTOPES;

DNA;

DNA; DNA GLYCOSYLTRANSFERASE; GLYCOSIDASE; GLYCOSIDE;

ANIMAL; BASE PAIRING; CHEMISTRY; DNA REPAIR; HUMAN; HYDROLYSIS; METABOLISM; PHYSIOLOGY; REVIEW;

ANIMALS; BASE PAIRING; DNA; DNA GLYCOSYLASES; DNA REPAIR; GLYCOSIDES; HUMANS; HYDROLYSIS; N-GLYCOSYL HYDROLASES;

EID: 0042342532     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr010219b     Document Type: Review

References (196)

1. Seeberg, E.; Eide, L.; Bjoras, M. Trends Biochem. Sci. 1995, 20, 391.
2. Mol, C. D.; Parikh, S. S.; Putnam, C. D.; Lo, T. P.; Tainer, J. A. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1999, 28, 101.
3. Lindahl, T.; Andersson, A. Biochemistry 1972, 11, 3618.
4. Cuniasse, P.; Fazakerley, G. V.; Guschlbauer, W.; Kaplan, B. E.; Sowers, L. C. J. Mol. Biol. 1990, 213, 303.
5. Lindahl, T. Mutat. Res. 1990, 238, 305.
6. Barzilay, G.; Mol, C. D.; Robson, C. N.; Walker, L. J.; Cunningham, R. P.; Tainer, J. A.; Hickson, I. D. Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 561.
7. Mol, C. D.; Izumi, T.; Mitra, S.; Tainer, J. A. Nature 2000, 403, 451.
8. Kubota, Y.; Nash, R. A.; Klungland, A.; Schar, P.; Barnes, D. E.; Lindahl, T. EMBO J. 1996, 15, 6662.
9. Mullen, G. P.; Wilson, S. H. Biochemistry 1997, 36, 4713.
10. Sun, B.; Latham, K. A.; Dodson, M. L.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1995, 270, 19501.
11. Piersen, C. E.; McCullough, A. K.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 2000, 459, 43.
12. Klungland, A.; Lindahl, T. EMBO J. 1997, 16, 3341.
13. Pascuooi, B.; Stucki, M.; Jonsson, Z. O.; Dogliotti, E.; Hubscher, U. J. Biol. Chem. 1999, 274, 33696.
14. Parikh, S. S.; Mol, C. D.; Hosfield, D. J.; Tainer, J. A. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 37.
15. Lloyd, R. S. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 1999, 62, 155.
16. David, S. S.; Williams, S. D. Chem. Rev. 1998, 98, 1221.
17. Wyatt, M. D.; Allan, J. M.; Lau, A. Y.; Ellenberger, T. E.; Samson, L. D. Bioessays 1999, 21, 668.
18. Lindahl, T.; Wood, R. D. Science 1999, 286, 1897.
19. Gogos, A.; Jantz, D.; Senturker, S.; Richardson, D.; Dizdaroglu, M.; Clarke, N. D. Proteins 2000, 40, 98.
20. Aravind, L.; Walker, D. R.; Koonin, E. V. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 1223.
21. Oivanen, M.; Hovinen, J.; Lehikoinen, P.; Lonnberg, H. Trends Org. Chem. 1993, 4, 397.
22. Wolfenden, R.; Snider, M. J. Acc. Chem. Res. 2001, 34, 938.
23. Shapiro, R.; Danzig, M. Biochemistry 1972, 11, 23.
24. Shapiro, R.; Kang, S. Biochemistry 1969, 8, 1806-10.
25. Zoltewicz, J. A.; Clark, F. D.; Sharpless, T. W.; Grahe, G. J. Am. Chem. Soc. 1970, 92, 1741.
26. Chernikov, A. V.; Usacheva, A. M.; Bruskov, V. I. Biochemistry (Moscow) 1996, 61, 35.
27. Noll, D. M.; Gogos, A.; Granek, J. A.; Clarke, N. D. Biochemistry 1999, 38, 6374.
28. Waters, T. R.; Swarm, P. F. J. Biol. Chem. 1998, 273, 20007.
29. Norman, D. P. G.; Chung, S. J.; Verdine, G. L. Biochemistry 2003, 42, 1564.
30. Asaeda, A.; Ide, H.; Asagoshi, K.; Matsuyama, S.; Tano, K.; Murakami, A.; Takamori, Y.; Kubo, K. Biochemistry 2000, 39, 1959.
31. Riazuddin, S.; Lindahl, T. Biochemistry 1978, 17, 2110.
32. Fujii, T.; Saito, T.; Nakasaka, T. Chem Pharm. Bull. 1989, 37, 2601.
33. Poulter, C. D.; Frederick, G. D. Tetrahedron Lett 1975, 26, 2171.
34. Fujii, T.; Itaya, T. Heterocycles 1998, 48, 1673.
35. Briggs, A. J.; Evans, C. M.; Glenn, R.; Kirby, A. J. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1983, 11, 1637.
36. Sinnott, M. L. Adv. Phys. Org. Chem. 1988, 24, 113.
37. Gorenstein, D. G. Chem. Rev. 1987, 87, 1047.
38. In The Anomeric Effect and Associated Stereoelctronic Effects; Thatcher, G. R. J., Ed.; American Chemical Society: Washington, DC, 1993; Vol. 539.
39. Sinnott, M. L. In The Anomeric Effect and Associated Stereoelectronic Effects; Thatcher, G. R. J., Ed.; American Chemical Society: Washington, DC, 1993; Vol. 539.
40. Zhu, J., Bennet, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 3887.
41. Banait, N. S.; Jencks, W. P. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 7951.
42. Foloppe, N.; MacKerell, A. D. J. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 6669.
43. Jencks, W. P. Adv. Enzymol Relat. Areas Mol. Biol. 1975, 43, 219.
44. Vasella, A.; Davies, G. J.; Bohm, M. Curr. Opin. Struct. Biol. 2002, 6, 619.
45. Fedorov, A.; Shi, W.; Kicska, G.; Fedorov, E.; Tyler, P. C.; Furneaux, R. H.; Hanson, J. C.; Gainsford, G. J.; Larese, J. Z.; Schramm, V. L.; Almo, S. C. Biochemistry 2001, 40, 853.
46. Forcasiu, D.; Horsley, J. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 4906.
47. Hehre, W. J. Acc. Chem. Res. 1975, 8, 369.
48. Sunko, D. E.; Szele, I.; Hehre, W. J. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 5000.
49. Ashwell, M., Guo, X., Sinnott, M. L. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10158.
50. Schramm, V. L. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 5, 556.
51. Banait, N. S.; Jencks, W. P. J. Am. Chem. Soc., 1991; 113, 7951.
52. Huang, X. C., Surry, C., Hiebert, T., Bennet, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10614.
53. Guthrie, R. D.; Jencks, W. P. Accs. Chem. Res. 1989, 22, 343.
54. Schramm, V. L.; Shi, W. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 657.
55. Schramm, V. L. Methods Enzymol. 1999, 305, 301.
56. Berti, P. J. Methods Enzymol. 1999, 308, 355.
57. Parkin, D. W.; Leung, H. B.; Schramm, V. L. J. Biol. Chem. 1984, 259, 9411.
58. Mentch, F.; Parkin, D. W.; Schramm, V. L. Biochemistry 1987, 26, 921.
59. Berti, P. J.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 12069.
60. Prior, J. J.; Santi, D. V. J. Biol. Chem. 1984, 259, 2429.
61. Schaleger, L. L.; Long, F. A. Adv. Phys. Org. Chem. 1963, 1, 1.
62. Bruice, T. C.; Benkovic, S. J. Biochemistry 2000, 39, 6267.
63. Lindahl, T.; Nyberg, B. Biochemistry 1974, 13, 3405.
64. Berg, O. G.; Winter, R. B.; von Hippel, P. H. Biochemistry 1981, 20, 6929.
65. Von Hippel, P. H.; Berg, O. G. J. Biol. Chem. 1989, 264, 675.
66. Selzer, T.; Albeck, S.; Schreiber, G. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 537.
67. Stivers, J. T.; Pankiewicz, K. W.; Watanabe, K. A. Biochemistry 1999, 38, 952.
68. Drohat, A. C.; Jagadeesh, J.; Ferguson, E.; Stivers, J. T. Biochemistry 1999, 38, 11866.
69. Cappelli, E.; Hazra, T.; Hill, J. W.; Slupphaug, G.; Bogliolo, M.; Frosina, G. Carcinogenesis 2001, 22, 387.
70. Stanford, N. P.; Szezelkun, M. D.; Marko, J. F.; Halford, S. E. EMBO J. 2000, 19, 6546.
71. Ishiwata, K.; Oikawa, A. Biochim. Biophys. Acta 1982, 698, 15.
72. Hildebrandt, E. R.; Cozzarelll, N. R. Cell 1995, 81, 331.
73. Jeltsch, A.; Wenz, C.; Stahl, F.; Pingoud, A. EMBO J. 1996, 15, 5104.
74. Jeltsch, A.; Pingoud, A. Biochemistry 1998, 37, 2160.
75. Wong, I.; Lundquist, A. J.; Bernards, A. S.; Mosbaugh, D. W. J. Biol. Chem. 2002, 20, 20.
76. Jiang, Y. L.; Stivers, J. T. Biochemistry 2002, 41, 11236.
77. Bennett, S. E.; Sanderson, R. J.; Mosbaugh, D. W. Biochemistry 1995, 34, 6109.
78. Purmal, A. A.; Lampman, G. W.; Pourmal, E. I.; Melamede, R. J.; Wallace, S. S.; Kow, Y. W. J. Biol. Chem. 1994, 269, 22046.
79. Higley, M.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1993, 294, 109.
80. Lloyd, R. S. Methods Mol. Biol. 2001, 160, 3.
81. Francis, A. W.; David, S. S. Biochemistry 2003, 42, 801.
82. Friedberg, E. C. DNA Repair; W. H. Freeman: New York, 1985.
83. Nilsen, H.; Rosewell, I.; Robins, P.; Skjelbred, C. F.; Andersen, S.; Slupphaug, G.; Daly, G.; Krokan, H. E.; Lindahl, T.; Barnes, D. E. Mol. Cell. 2000, 5, 1059.
84. Slupphaug, G.; Mol, C. D.; Kavli, B.; Arvai, A. S.; Krokan, H. E.; Tainer, J. A. Nature 1998, 384, 87.
85. Klimasauskas, S.; Kumar, S.; Roberts, R. J.; Cheng, X. Cell 1994, 76, 357.
86. Gueron, M.; Leroy, J.-L. Methods Enzymol, 1995, 261, 383.
87. Gueron, M.; Kochoyan, M.; Leroy, J. L. Nature 1987, 328, 89.
88. Moe, J. G.; Russu, I. M. Biochemistry 1992, 31, 8421.
89. Moe, J. G.; Russu, I. M. Nucleic Acids Res. 1990, 18, 821.
90. Dornberger, U.; Leijon, M.; Fritzsche. H. J. Biol. Chem. 1999, 274, 6957.
91. Banavali, N. K.; MacKerell, A. D., Jr. J. Mol. Biol. 2002, 319, 141.
92. Ramstein, J.; Lavery, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 7231.
93. Fuxreiter, M.; Luo, N.; Jedlovszky, P.; Simon, I.; Osman, R. J. Mol. Biol. 2002, 323, 823.
94. Seibert, E.; Ross, J. B.; Osman, R. Biochemistry 2002, 41, 10976-84.
95. Van Aalten, D. M.; Erlanson, D. A.; Verdine, G. L.; Joshua-Tor, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 11809.
96. Parikh, S. S.; Walcher, G.; Jones, G. D.; Slupphaug, G.; Krokan, H. E.; Blackburn, G. M.; Tainer, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 5083.
97. Vassylyev, D. G.; Kashiwagi, T.; Mikami, Y.; Ariyoshi, M.; Iwai, S.; Ohtsuka, E.; Morikawa, K. Cell 1995, 83, 773.
98. Bruner, S. D.; Norman, D. P.; Verdine, G. L. Nature 2000, 403, 859.
99. Barrett, T. E.; Scharer, O. D.; Sawa, R.; Brown, T.; Jiricny, J.; Verdine, G. L.; Pearl, L. H. EMBO J. 1999, 18, 6599.
100. Fromme, J. C.; Verdine, G. L. Nat, Struct. Biol. 2002, 9, 544.
101. Chen, L.; Haushalter, K. A.; Lieber, C. M.; Verdine, G. L. Chem. Biol. 2002, 9, 345.
102. Jiang, Y. L.; Kwon, K.; Stivers, J. T. J. Biol. Chem. 2001, 276, 42347.
103. Handa, P.; Roy, S.; Varshney, U. J. Biol. Chem. 2001, 276, 17324.
104. Huang, N.; Banavali, N. K.; MacKerell, A. D., Jr. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 68.
105. Jiang, Y. L.; Song, F.; Stivers, J. T. Biochemistry 2002, 41, 11248.
106. Abner, C. W.; Lau, A. Y.; Ellenberger, T.; Bloom, L. B. J. Biol. Chem. 2001, 276, 13379.
107. Connor, E. E.; Wyatt, M. D. Chem. Biol. 2002, 9, 1033.
108. Kavli, B.; Slupphaug, G.; Mol, C. D.; Arvai, A. S.; Peterson, S. B.; Tainer, J. A.; Krokan, H. E. EMBO J. 1996, 15, 3442.
109. Labahn, J.; Scharer, O. D.; Long, A.; Ezaz-Nikpay, K.; Verdine, G. L.; Ellenberger, T. E. Cell 1996, 86, 321.
110. Berdal, K. G.; Johansen, R. F.; Seeberg, E. EMBO J. 1998, 17, 363.
111. Werner, R. M.; Jiang, Y. L.; Gordley, R. G.; Jagadeesh, G. J.; Ladner, J. E.; Xiao, G.; Tordova, M.; Gilliland, G. L.; Stivers, J. T. Biochemistry 2000, 39, 12585.
112. Drohat, A. C.; Stivers, J. T. Biochemistry 2000, 39, 11865.
113. Stivers, J. T. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 3837.
114. Allan, B. W.; Beechem, J. M.; Lindstrom, W. M.; Reich, N. O. J. Biol. Chem. 1998, 273, 2368.
115. Allan, B. W.; Reich, N. O. Biochemistry 1996, 35, 14757.
116. Nordlund, T. M.; Andersson, S.; Nilsson, L.; Rigler, R.; Graslund, A.; McLaughlin, L. W. Biochemistry 1989, 25, 9095.
117. Nordlund, T. M.; Xu, D.; Evans, K. O. Biochemistry 1993, 32, 12090.
118. Xu, D.; Evans, K. O.; Nordlund, T. M. Biochemistry 1994, 33, 9592.
119. Parikh, S. S.; Mol, C. D.; Slupphaug, G.; Bharati, S.; Krokan, H. E.; Tainer, J. A. EMBO. J. 1998, 17, 5214.
120. McCullough, A. K.; Scharer, O.; Verdine, G. L.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1996, 271, 32147.
121. McCullough, A. K.; Dodson, M. L.; Scharer, O. D.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1997, 272, 27210.
122. Michaels, M. L.; Miller, J. H. J Bacterial 1992, 174, 6821.
123. Michaels, M. L.; Cruz, C.; Grollman, A. P.; Miller, J. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 59, 7022.
124. Michaels, M. L.; Tchou, J.; Grollman, A. P.; Miller, J. H. Biochemistry 1992, 31, 10964.
125. Grollman, A. P. Struct. Funct., Proc. Conversation Discip. Biomol. Stereodyn., 7th 1992, 1, 165.
126. Guan, Y.; Manuel, R. C.; Arvai, A. S.; Parikh, S. S.; Mol, C. D.; Miller, J. H.; Lloyd, S.; Tainer, J. A. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 1058.
127. Abeygunawardana, C.; Weber, D. J.; Gittis, A. G.; Frick, D. N.; Lin, J.; Miller, A. F.; Bessman, M. J.; Mildvan, A. S. Biochemistry 1995, 34, 14997.
128. Volk, D. E.; House, P. G.; Thiviyanathan, V.; Luxon, B. A.; Zhang, S.; Lloyd, R. S.; Gorenstein, D. G. Biochemistry 2000, 39, 7331.
129. Bernards, A. S.; Miller, J. K.; Bao, K. K.; Wong, I. J. Biol. Chem. 2002, 8, 6.
130. Wong, I.; Bernards, A. S.; Miller, J. K.; Wirz, J. A. J. Biol. Chem. 2003, 278, 2411.
131. Werner, R. M.; Stivers, J. T. Biochemistry 2000, 39, 14054.
132. G illes, A.-M.; Cristea, I.; Palibroda, N.; Hilden, I.; Jensen, K. F.; Sarfati, R. S.; Namane, A.; Ughetto-Monfrin, J.; Barzu, O. Anal. Biochemistry 1995, 34, 197.
133. Chen, X.-Y.; Berti, P. J.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 6527.
134. Drohat, A. C.; Xiao, G.; Tordova, M.; Jagadeesh, J.; Pankiewicz, K. W.; Watanabe, K. A.; Gilliland, G. L.; Stivers, J. T. Biochemistry 1999, 38, 11876.
135. Drohat, A. C.; Stivers, J. T. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1840.
136. Shan, S. O.; Loh, S.; Herschlag, D. Science 1996, 272, 97.
137. Shan, S. O.; Herschlag, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 14474.
138. Lodi, P. J.; Knowles, J. R. Biochemistry 1991, 30, 6948.
139. Jiang, Y. L.; Drohat, A. C.; Ichikawa, Y.; Stivers, J. T. Biochemistry 2002, 41, 7116.
140. Jiang, Y. L.; Drohat, A. C.; Ichikawa, Y.; Stivers, J. T. J. Biol. Chem. 2002, 277, 15385.
141. Waters, T. R.; Gallinari, P.; Jiricny, J.; Swann, P. F. J. Biol. Chem. 1999, 274, 67.
142. Sartori, A. A.; Fitz-Gibbon, S.; Yang, H.; Miller, J. H.; Jiricny, J. EMBO J. 2002, 21, 3182.
143. Berti, P. J.; Tanaka, K. S. E. Adv. Phys. Org. Chem. 2002, 36, 239.
144. Dinner, A. R.; Blackburn, G. M.; Karplus, M. Nature 2001, 413, 752.
145. Jiang, Y. L.; Ichikawa, Y.; Song, F.; Stivers, J. T. Biochemistry 2003, 42, 1922.
146. Jiang, Y. L.; Stivers, J. T. Biochemistry 2001, 40, 7710.
147. Furuta, M.; Schrader, J. O.; Schrader, H. S.; Kokjohn, T. A.; Nyaga, S.; McCullough, A. K.; Lloyd, R. S.; Burbank, D. E.; Landstein, D.; Lane, L.; Van Etten, J. L. Appl. Environ. Microbiol. 1997, 63, 1551.
148. Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1998, 408, 159.
149. Dodson, M. L.; Schrock, R. D., 3rd; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284.
150. Schrock, R. D., 3rd; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880.
151. Mazumder, A., Gerlt, J. A., Rabow, L., Absalon, M. J., Stubbe, J.; Bolton, P. H J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8029.
152. Fuxreiter, M.; Warshel, A.; Osman, R. Biochemistry 1999, 38, 9577.
153. Grollman, A. P. Kankyo Hen'igen Kenkyu; 1995; Vol. 16.
154. Gilboa, R.; Zharkov, D. O.; Golan, G.; Fernandes, A. S.; Gerchman, S. E.; Matz, E.; Kycia, J. H.; Grollman, A. P.; Shoham, G. J. Biol. Chem. 2002, 277, 19811.
155. Serre, L.; Pereira de Jesus, K.; Boiteux, S.; Zelwer, C.; Castaing, B. EMBO J. 2002, 21, 2854.
156. Mazzella, L. J., Parkin, D. W., Tyler, P. C., Furneaux, R. H.; Schramm, V. L J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2111.
157. Wright, P. M.; Yu, J.; Cillo, J.; Lu, A. L. J. Biol. Chem. 1999, 274, 29011.
158. Nash, H. M.; Bruner, S. D.; Scharer, O. D.; Kawate, T.; Addona, T. A.; Spooner, E.; Lane, W. S.; Verdine, G. L. Curr. Biol. 1996, 6, 968.
159. Hollis, T.; Ichikawa, Y.; Ellenberger, T. EMBO J. 2000, 19, 758.
160. Deng, L.; Schaerer, O. D.; Verdine, G. L. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7865.
161. Scharer, O. D.; Nash, H. M.; Jiricny, J.; Laval, J.; Verdine, G. L. J. Biol. Chem. 1998, 273, 8592.
162. Chepanoske, C. L.; Porello, S. L.; Fujiwara, T.; Sugiyama, H.; David, S. S. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 3197.
163. Chmiel, N. H.; Golinelli, M. P.; Francis, A. W.; David, S. S. Nucleic Acids Res. 2001, 29, 553.
164. Horenstein, B. A.; Schramm, V. L. Biochemistry 1993, 32, 9917-9925.
165. Cunningham, R. P.; Ahern, H.; Xing, D.; Thayer, M. M.; Tainer, J. A. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1994, 726, 215.
166. Zharkov, D. O.; Rieger, R. A.; Iden, C. R.; Grollman, A. P. J. Biol. Chem. 1997, 272, 5335.
167. Sidorkina, O. M.; Laval, J. J. Biol. Chem. 2000, 275, 9924.
168. Zharkov, D. O.; Golan, G.; Gilboa, R.; Fernandas, A. S.; Gerchman, S. E.; Kycia, J. H.; Rieger, R. A.; Grollman, A. P.; Shoham, G. EMBO J. 2002, 21, 789.
169. Harris, T. K.; Turner, G. J. IUBMB Life 2002, 53, 85.
170. Stivers, J. T.; Abeygunawardana, C.; Mildvan, A. S.; Hajipour, G.; Whitman, C. P. Biochemistry 1998, 35, 814.
171. Chen, X.-Y.; Berti, P. J.; Schramm, V. L. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 6527.
172. Lindahl, T. Annu. Rev. Biochem. 1982, 51, 61.
173. Gallivan, J. P.; Dougherty, D. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 9459.
174. Biot, C.; Buisine, E.; Kwasigroch, J. M.; Wintjens, R.; Rooman, M. J. Biot. Chem. 2002, 277, 40816.
175. Lau, A. Y.; Wyatt, M. D.; Glassner, B. J.; Samson, L. D.; Ellenberger, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 13473.
176. Ishida, T.; Doi, M.; Ueda, H.; Inoue, M.; Scheldrick, G. M. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 2286.
177. Drohat, A. C.; Kwon, K.; Krosky, D. J.; Stivers, J. T. Nat. Struct. Biol. 2002, 9, 659.
178. Cao, C.; Kwon, K.; Jiang, Y. L.; Stivers, J. T. J. Biol. Chem. 2003, 278, 19442.
179. Bujnicki, J. M.; Rychlewski, L. DNA Repair (Amsterdam) 2002, 1, 391.
180. Makino, K.; Ichikawa, Y. Tetrahedron Lett. 1998, 39, 8245.
181. Zechel, D. L.; Withers, S. G. Acc. Chem. Res. 2000, 33, 11.
182. Horenstein, B. A.; Zabinski, R. P.; Schramm, V. L. Tetrahedron Lett. 1993, 34, 7213.
183. Jiang, Y. L.; Ichikawa, Y.; Stivers, J. T. Biochemistry 2002, 41, 7116.
184. Petersen-Mahrt, S. K.; Harris, R. S.; Neuberger, M. S. Nature 2002, 418, 99.
185. Tinkelenberg, B. A.; Hansbury, M. J.; Ladner, R. D. Cancer Res 2002, 62, 4909.
186. Chen, R.; Wang, H.; Mansky, L. M. J. Gen. Virol. 2002, 83, 2339.
187. Frosina, G. Eur. J. Biochem. 2000, 267, 2135.
188. Loeb, L. A.; Christians, F. C. Mutat. Res. 1996, 350, 279.
189. Smith, M. L.; Seo, Y. R. Mutagenesis 2002, 17, 149.
190. Limp-Foster, M.; Kelley, M. R. Environ. Mol. Mutagen 2000, 35, 71.
191. Parkin, D. W.; Leung, H. B.; Schramm, V. L. J. Biol. Chem. 1984, 259, 9411.
192. Mentch, F.; Parkin, D. W.; Schramm, V. L. Biochemistry 1987, 26, 921.
193. Kampf, G.; Kapinos, L. E.; Griesser, R.; Lippert, B.; Sigel, H. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2002, 2, 1320.
194. Jang, Y. H.; Goddard, W. A., III.; Noyes, K. T.; Sowers, L. C.; Hwang, S.; Chung, D. S. Chem. Res. Toxicol. 2002, 15, 1023.
195. Jaworski, S.; Schoellhorn, H.; Eisenmann, P.; Thewalt, U.; Lippert, B. Inorg. Chim. Acta 1988, 153, 31.
196. Bellamy, S. R.; Baldwin, G. S. Nucleic Acids Res. 2001, 29, 3857.