Long noncoding RNAs: Emerging stars in gene regulation, epigenetics and human disease

ChemMedChem

Volumn 9, Issue 9, 2014, Pages 1932-1956

  Bhan, Arunoday ^a   Mandal, Subhrangsu S ^a  

^a UNIVERSITY OF TEXAS AT ARLINGTON   (United States)

Author keywords

drugs targets; epigenetics; gene regulation; human diseases; long noncoding RNA; noncoding RNA

Indexed keywords

DNA; LONG UNTRANSLATED RNA;

CELL FATE; CELL FUNCTION; CENTRAL NERVOUS SYSTEM; DNA DAMAGE; EPIGENETICS; GENE CONTROL; GENE EXPRESSION REGULATION; IMMUNE SYSTEM; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; REVIEW; STEM CELL; X CHROMOSOME INACTIVATION; DISEASES; GENETIC EPIGENESIS; GENETICS; HUMAN; PHYSIOLOGY;

DISEASE; EPIGENESIS, GENETIC; GENE EXPRESSION REGULATION; HUMANS; RNA, LONG NONCODING;

EID: 85027942151     PISSN: 18607179     EISSN: 18607187     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cmdc.201300534     Document Type: Review

References (286)

1. E. S. Lander, L. M. Linton, B. Birren, C. Nusbaum, M. C. Zody, J. Baldwin, K. Devon, K. Dewar, M. Doyle, W. FitzHugh, R. Funke, D. Gage, K. Harris, A. Heaford, J. Howland, L. Kann, J. Lehoczky, R. LeVine, P. McEwan, K. McKernan, et al., Nature 2001, 409, 860-921
2. J. S. Mattick, Science 2005, 309, 1527-1528
3. J. S. Mattick, I. V. Makunin, Hum. Mol. Genet. 2006, 15, R 17 -R 29.
4. International Human Genome Sequencing Consortium, Nature 2004, 431, 931-945
5. E. Pennisi, Science 2012, 337, 1159-1161.
6. E. Birney, J. A. Stamatoyannopoulos, A. Dutta, R. Guigo, T. R. Gingeras, E. H. Margulies, Z. Weng, M. Snyder, E. T. Dermitzakis, R. E. Thurman, M. S. Kuehn, C. M. Taylor, S. Neph, C. M. Koch, S. Asthana, A. Malhotra, I. Adzhubei, J. A. Greenbaum, R. M. Andrews, P. Flicek, et al., Nature 2007, 447, 799-816
7. D. J. Thomas, K. R. Rosenbloom, H. Clawson, A. S. Hinrichs, H. Trumbower, B. J. Raney, D. Karolchik, G. P. Barber, R. A. Harte, J. Hillman-Jackson, R. M. Kuhn, B. L. Rhead, K. E. Smith, A. Thakkapallayil, A. S. Zweig, D. Haussler, W. J. Kent, Nucleic Acids Res. 2007, 35, D 663 -D 667
8. ENCODE Project Consortium, B. E. Bernstein, E. Birney, I. Dunham, E. D. Green, C. Gunter, M. Snyder, Nature 2012, 489, 57-74.
9. C. Wahlestedt, Nat. Rev. Drug Discovery 2013, 12, 433-446.
10. J. T. Mendell, E. N. Olson, Cell 2012, 148, 1172-1187
11. S. Blackshaw, S. Harpavat, J. Trimarchi, L. Cai, H. Huang, W. P. Kuo, G. Weber, K. Lee, R. E. Fraioli, S. H. Cho, R. Yung, E. Asch, L. Ohno-Machado, W. H. Wong, C. L. Cepko, PLoS Biol. 2004, 2, e 247.
12. M. Esteller, Nat. Rev. Genet. 2011, 12, 861-874.
13. A. A. Aravin, R. Sachidanandam, A. Girard, K. Fejes-Toth, G. J. Hannon, Science 2007, 316, 744-747
14. T. Watanabe, S. Tomizawa, K. Mitsuya, Y. Totoki, Y. Yamamoto, S. Kuramochi-Miyagawa, N. Iida, Y. Hoki, P. J. Murphy, A. Toyoda, K. Gotoh, H. Hiura, T. Arima, A. Fujiyama, T. Sado, T. Shibata, T. Nakano, H. Lin, K. Ichiyanagi, P. D. Soloway, H. Sasaki, Science 2011, 332, 848-852
15. Y. Dorsett, T. Tuschl, Nat. Rev. Drug Discovery 2004, 3, 318-329
16. L. He, J. M. Thomson, M. T. Hemann, E. Hernando-Monge, D. Mu, S. Goodson, S. Powers, C. Cordon-Cardo, S. W. Lowe, G. J. Hannon, S. M. Hammond, Nature 2005, 435, 828-833
17. J. S. Mattick, PLoS Genet. 2009, 5, e 1000459
18. R. J. Taft, E. A. Glazov, N. Cloonan, C. Simons, S. Stephen, G. J. Faulkner, T. Lassmann, A. R. Forrest, S. M. Grimmond, K. Schroder, K. Irvine, T. Arakawa, M. Nakamura, A. Kubosaki, K. Hayashida, C. Kawazu, M. Murata, H. Nishiyori, S. Fukuda, J. Kawai, et al., Nat. Genet. 2009, 41, 572-578
19. H. Wu, J. R. Neilson, P. Kumar, M. Manocha, P. Shankar, P. A. Sharp, N. Manjunath, PLoS One 2007, 2, e 1020.
20. J. C. Castle, C. D. Armour, M. Lower, D. Haynor, M. Biery, H. Bouzek, R. Chen, S. Jackson, J. M. Johnson, C. A. Rohl, C. K. Raymond, PLoS One 2010, 5, e 11779
21. P. Kapranov, J. Cheng, S. Dike, D. A. Nix, R. Duttagupta, A. T. Willingham, P. F. Stadler, J. Hertel, J. Hackermuller, I. L. Hofacker, I. Bell, E. Cheung, J. Drenkow, E. Dumais, S. Patel, G. Helt, M. Ganesh, S. Ghosh, A. Piccolboni, V. Sementchenko, H. Tammana, T. R. Gingeras, Science 2007, 316, 1484-1488
22. P. Preker, J. Nielsen, S. Kammler, S. Lykke-Andersen, M. S. Christensen, C. K. Mapendano, M. H. Schierup, T. H. Jensen, Science 2008, 322, 1851-1854
23. A. C. Seila, J. M. Calabrese, S. S. Levine, G. W. Yeo, P. B. Rahl, R. A. Flynn, R. A. Young, P. A. Sharp, Science 2008, 322, 1849-1851
24. A. C. Seila, L. J. Core, J. T. Lis, P. A. Sharp, Cell Cycle 2009, 8, 2557-2564.
25. P. Mestdagh, E. Fredlund, F. Pattyn, A. Rihani, T. Van Maerken, J. Vermeulen, C. Kumps, B. Menten, K. De Preter, A. Schramm, J. Schulte, R. Noguera, G. Schleiermacher, I. Janoueix-Lerosey, G. Laureys, R. Powel, D. Nittner, J. C. Marine, M. Ringner, F. Speleman, J. Vandesompele, Oncogene 2010, 29, 3583-3592
26. J. Sana, S. Hankeova, M. Svoboda, I. Kiss, R. Vyzula, O. Slaby, Oncology 2012, 82, 114-118.
27. J. Wang, B. A. Lucas, L. E. Maquat, Genome Biol. 2013, 14, 117.
28. G. Curtale, F. Citarella, Int. J. Mol. Sci. 2013, 14, 17347-17377
29. R. Johnson, Neurobiol. Dis. 2012, 46, 245-254.
30. N. Brockdorff, A. Ashworth, G. F. Kay, V. M. McCabe, D. P. Norris, P. J. Cooper, S. Swift, S. Rastan, Cell 1992, 71, 515-526
31. C. J. Brown, A. Ballabio, J. L. Rupert, R. G. Lafreniere, M. Grompe, R. Tonlorenzi, H. F. Willard, Nature 1991, 349, 38-44.
32. M. de Napoles, J. E. Mermoud, R. Wakao, Y. A. Tang, M. Endoh, R. Appanah, T. B. Nesterova, J. Silva, A. P. Otte, M. Vidal, H. Koseki, N. Brockdorff, Dev. Cell 2004, 7, 663-676
33. J. C. Chow, Z. Yen, S. M. Ziesche, C. J. Brown, Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2005, 6, 69-92.
34. C. I. Brannan, E. C. Dees, R. S. Ingram, S. M. Tilghman, Mol. Cell. Biol. 1990, 10, 28-36
35. F. Court, M. Baniol, H. Hagege, J. S. Petit, M.-N. Lelay-Taha, F. Carbonell, M. Weber, G. Cathala, T. Forne, Nucleic Acids Res. 2011, 39, 5893-5906.
36. T. R. Mercer, M. E. Dinger, J. S. Mattick, Nat. Rev. Genet. 2009, 10, 155-159.
37. P. Khaitovich, J. Kelso, H. Franz, J. Visagie, T. Giger, S. Joerchel, E. Petzold, R. E. Green, M. Lachmann, S. Paabo, PLoS Genet. 2006, 2, e 171.
38. K. Struhl, Nat. Struct. Mol. Biol. 2007, 14, 103-105.
39. M. B. Clark, J. S. Mattick, Semin. Cell Dev. Biol. 2011, 22, 366-376
40. M. E. Dinger, P. P. Amaral, T. R. Mercer, K. C. Pang, S. J. Bruce, B. B. Gardiner, M. E. Askarian-Amiri, K. Ru, G. Solda, C. Simons, S. M. Sunkin, M. L. Crowe, S. M. Grimmond, A. C. Perkins, J. S. Mattick, Genome Res. 2008, 18, 1433-1445
41. W. Q. Hu, B. B. Yuan, J. Flygare, H. F. Lodish, Genes Dev. 2011, 25, 2573-2578
42. T. Hung, H. Y. Chang, RNA Biol. 2010, 7, 582-585
43. T. R. Mercer, J. S. Mattick, Nat. Struct. Mol. Biol. 2013, 20, 300-307
44. K. C. Wang, H. Y. Chang, Mol. Cell 2011, 43, 904-914
45. K. C. Wang, Y. W. Yang, B. Liu, A. Sanyal, R. Corces-Zimmerman, Y. Chen, B. R. Lajoie, A. Protacio, R. A. Flynn, R. A. Gupta, J. Wysocka, M. Lei, J. Dekker, J. A. Helms, H. Y. Chang, Nature 2011, 472, 120-124.
46. S. Rainier, L. A. Johnson, C. J. Dobry, A. J. Ping, P. E. Grundy, A. P. Feinberg, Nature 1993, 362, 747-749.
47. L. Ma, V. B. Bajic, Z. Zhang, RNA Biol. 2013, 10, 925-933.
48. R. Lyle, D. Watanabe, D. te Vruchte, W. Lerchner, O. W. Smrzka, A. Wutz, J. Schageman, L. Hahner, C. Davies, D. P. Barlow, Nat. Genet. 2000, 25, 19-21.
49. K. L. Yap, S. Li, A. M. Muñoz-Cabello, S. Raguz, L. Zeng, S. Mujtaba, J. Gil, M. J. Walsh, M.-M. Zhou, Mol. Cell 2010, 38, 662-674.
50. S. Swiezewski, F. Liu, A. Magusin, C. Dean, Nature 2009, 462, 799-802.
51. L. Quagliata, M. S. Matter, S. Piscuoglio, L. Arabi, C. Ruiz, A. Procino, M. Kovac, F. Moretti, Z. Makowska, T. Boldanova, J. B. Andersen, M. Hammerle, L. Tornillo, M. H. Heim, S. Diederichs, C. Cillo, L. M. Terracciano, Hepatology 2013
52. D. Kim, J. Song, J. Han, Y. Kim, C. H. Chun, E. J. Jin, Cell. Signalling 2013, 25, 2878-2887.
53. H. Yu, J. Lindsay, Z. P. Feng, S. Frankenberg, Y. Hu, D. Carone, G. Shaw, A. J. Pask, R. O'Neill, A. T. Papenfuss, M. B. Renfree, BMC Genomics 2012, 13, 251.
54. J. B. Heo, S. Sung, Science 2011, 331, 76-79.
55. M. Lin, E. Pedrosa, A. Shah, A. Hrabovsky, S. Maqbool, D. Zheng, H. M. Lachman, PLoS One 2011, 6, e 23356
56. X. Zhang, Z. Lian, C. Padden, M. B. Gerstein, J. Rozowsky, M. Snyder, T. R. Gingeras, P. Kapranov, S. M. Weissman, P. E. Newburger, Blood 2009, 113, 2526-2534.
57. L. Li, T. Feng, Y. Lian, G. Zhang, A. Garen, X. Song, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 12956-12961.
58. S. Maenner, M. Blaud, L. Fouillen, A. Savoye, V. Marchand, A. Dubois, S. Sanglier-Cianferani, A. Van Dorsselaer, P. Clerc, P. Avner, A. Visvikis, C. Branlant, PLoS Biol. 2010, 8, e 1000276.
59. I. J. Matouk, N. DeGroot, S. Mezan, S. Ayesh, R. Abu-lail, A. Hochberg, E. Galun, PLoS One 2007, 2, e 845
60. D. Barsyte-Lovejoy, S. K. Lau, P. C. Boutros, F. Khosravi, I. Jurisica, I. L. Andrulis, M. S. Tsao, L. Z. Penn, Cancer Res. 2006, 66, 5330-5337.
61. K. Hashimoto, E. Ishida, S. Matsumoto, N. Shibusawa, S. Okada, T. Monden, T. Satoh, M. Yamada, M. Mori, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009, 390, 1260-1265.
62. B. Herquel, K. Ouararhni, I. Martianov, S. Le Gras, T. Ye, C. Keime, T. Lerouge, B. Jost, F. Cammas, R. Losson, I. Davidson, Nat. Struct. Mol. Biol. 2013, 20, 339-346.
63. D. B. Pontier, J. Gribnau, Hum. Genet. 2011, 130, 223-236.
64. R. R. Pandey, T. Mondal, F. Mohammad, S. Enroth, L. Redrup, J. Komorowski, T. Nagano, D. Mancini-DiNardo, C. Kanduri, Mol. Cell 2008, 32, 232-246.
65. B. D. Strahl, C. D. Allis, Nature 2000, 403, 41-45.
66. S. Kaneko, J. Son, S. S. Shen, D. Reinberg, R. Bonasio, Nat. Struct. Mol. Biol. 2013, 20, 1258-1264
67. R. Margueron, D. Reinberg, Nature 2011, 469, 343-349.
68. F. Mohammad, T. Mondal, C. Kanduri, Epigenetics 2009, 4, 277-286.
69. T. Hung, Y. Wang, M. F. Lin, A. K. Koegel, Y. Kotake, G. D. Grant, H. M. Horlings, N. Shah, C. Umbricht, P. Wang, B. Kong, A. Langerod, A. L. Borresen-Dale, S. K. Kim, M. van de Vijver, S. Sukumar, M. L. Whitfield, M. Kellis, Y. Xiong, D. J. Wong, H. Y. Chang, Nat. Genet. 2011, 43, 621-629.
70. K. Plath, S. Mlynarczyk-Evans, D. A. Nusinow, B. Panning, Annu. Rev. Genet. 2002, 36, 233-278.
71. D. D. Luan, T. H. Eickbush, Mol. Cell. Biol. 1995, 15, 3882-3891.
72. X. Song, X. Wang, S. Arai, R. Kurokawa, Methods Mol. Biol. 2012, 809, 609-622.
73. M. C. Good, J. G. Zalatan, W. A. Lim, Science 2011, 332, 680-686.
74. M.-C. Tsai, O. Manor, Y. Wan, N. Mosammaparast, J. K. Wang, F. Lan, Y. Shi, E. Segal, H. Y. Chang, Science 2010, 329, 689-693.
75. K. Collins, Mech. Ageing Dev. 2008, 129, 91-98.
76. Y. Kotake, T. Nakagawa, K. Kitagawa, S. Suzuki, N. Liu, M. Kitagawa, Y. Xiong, Oncogene 2011, 30, 1956-1962.
77. A. Batagov, A. Yarmishyn, P. Jenjaroenpun, J. Tan, Y. Nishida, I. Kurochkin, BMC Syst. Biol. 2013, 7 (Suppl. 3), S 11.
78. Y. He, B. Vogelstein, V. E. Velculescu, N. Papadopoulos, K. W. Kinzler, Science 2008, 322, 1855-1857.
79. E. G. Berghoff, M. F. Clark, S. Chen, I. Cajigas, D. E. Leib, J. D. Kohtz, Development 2013, 140, 4407-4416.
80. H. Kobayashi, E. Yanagisawa, A. Sakashita, N. Sugawara, S. Kumakura, H. Ogawa, H. Akutsu, K. Hata, K. Nakabayashi, T. Kono, Epigenetics 2013, 8, 635-645.
81. S. Massone, E. Ciarlo, S. Vella, M. Nizzari, T. Florio, C. Russo, R. Cancedda, A. Pagano, Biochim. Biophys. Acta Mol. Cell Res. 2012, 1823, 1170-1177.
82. T. R. Mercer, M. E. Dinger, S. M. Sunkin, M. F. Mehler, J. S. Mattick, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 716-721.
83. A. M. Khalil, M. A. Faghihi, F. Modarresi, S. P. Brothers, C. Wahlestedt, PLoS One 2008, 3, e 1486.
84. P. G. Maass, A. Rump, H. Schulz, S. Stricker, L. Schulze, K. Platzer, A. Aydin, S. Tinschert, M. B. Goldring, F. C. Luft, S. Bahring, J. Clin. Invest. 2012, 122, 3990-4002.
85. A. M. Khalil, M. Guttman, M. Huarte, M. Garber, A. Raj, D. R. Morales, K. Thomas, A. Presser, B. E. Bernstein, A. van Oudenaarden, A. Regev, E. S. Lander, J. L. Rinn, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 11667-11672.
86. C.-T. Ong, V. G. Corces, Dev. Cell 2008, 15, 489-490.
87. K. I. Ansari, S. S. Mandal, FEBS J. 2010, 277, 1790-1804
88. K. I. Ansari, B. P. Mishra, S. S. Mandal, Biochim. Biophys. Acta Gene Regul. Mech. 2008, 1779, 66-73
89. K. I. Ansari, B. P. Mishra, S. S. Mandal, Front. Biosci. 2009, 14, 3483-3495.
90. A. Bhan, I. Hussain, K. I. Ansari, S. Kasiri, A. Bashyal, S. S. Mandal, J. Mol. Biol. 2013, 425, 3707-3722.
91. J. L. Rinn, M. Kertesz, J. K. Wang, S. L. Squazzo, X. Xu, S. A. Brugmann, L. H. Goodnough, J. A. Helms, P. J. Farnham, E. Segal, H. Y. Chang, Cell 2007, 129, 1311-1323.
92. R. A. Gupta, N. Shah, K. C. Wang, J. Kim, H. M. Horlings, D. J. Wong, M. C. Tsai, T. Hung, P. Argani, J. L. Rinn, Y. Wang, P. Brzoska, B. Kong, R. Li, R. B. West, M. J. van de Vijver, S. Sukumar, H. Y. Chang, Nature 2010, 464, 1071-1076.
93. L. Wu, P. Murat, D. Matak-Vinkovic, A. Murrell, S. Balasubramanian, Biochemistry 2013, 52, 9519-9527.
94. C. Davidovich, L. Zheng, K. J. Goodrich, T. R. Cech, Nat. Struct. Mol. Biol. 2013, 20, 1250-1257.
95. E. Pasmant, A. Sabbagh, M. Vidaud, I. Bieche, FASEB J. 2011, 25, 444-448
96. L. Folkersen, T. Kyriakou, A. Goel, J. Peden, A. Malarstig, G. Paulsson-Berne, A. Hamsten, W. Hugh, A. Franco-Cereceda, A. Gabrielsen, P. Eriksson, PLoS One 2009, 4, e 7677.
97. F. Aguilo, M. M. Zhou, M. J. Walsh, Cancer Res. 2011, 71, 5365-5369.
98. W. Yu, D. Gius, P. Onyango, K. Muldoon-Jacobs, J. Karp, A. P. Feinberg, H. Cui, Nature 2008, 451, 202-206.
99. C. Schneider, R. M. King, L. Philipson, Cell 1988, 54, 787-793.
100. T. Kino, D. E. Hurt, T. Ichijo, N. Nader, G. P. Chrousos, Sci. Signal. 2010, 3, ra 8.
101. D. Mancini-DiNardo, S. J. S. Steele, J. M. Levorse, R. S. Ingram, S. M. Tilghman, Genes Dev. 2006, 20, 1268-1282
102. J. A. Ross, P. T. Schmidt, J. P. Perentesis, S. M. Davies, Cancer 1999, 85, 1389-1394
103. L. S. Wilkinson, W. Davies, A. R. Isles, Nat. Rev. Neurosci. 2007, 8, 832-843.
104. T. Nagano, J. A. Mitchell, L. A. Sanz, F. M. Pauler, A. C. Ferguson-Smith, R. Feil, P. Fraser, Science 2008, 322, 1717-1720.
105. M. L. Barr, E. G. Bertram, Nature 1949, 163, 676.
106. S. Kaneko, G. Li, J. Son, C. F. Xu, R. Margueron, T. A. Neubert, D. Reinberg, Genes Dev. 2010, 24, 2615-2620.
107. J. T. Lee, L. S. Davidow, D. Warshawsky, Nat. Genet. 1999, 21, 400-404.
108. K. Inoue, T. Kohda, M. Sugimoto, T. Sado, N. Ogonuki, S. Matoba, H. Shiura, R. Ikeda, K. Mochida, T. Fujii, K. Sawai, A. P. Otte, X. C. Tian, X. Yang, F. Ishino, K. Abe, A. Ogura, Science 2010, 330, 496-499.
109. K. C. Wang, J. A. Helms, H. Y. Chang, Trends Cell Biol. 2009, 19, 268-275.
110. M. Guttman, I. Amit, M. Garber, C. French, M. F. Lin, D. Feldser, M. Huarte, O. Zuk, B. W. Carey, J. P. Cassady, M. N. Cabili, R. Jaenisch, T. S. Mikkelsen, T. Jacks, N. Hacohen, B. E. Bernstein, M. Kellis, A. Regev, J. L. Rinn, E. S. Lander, Nature 2009, 458, 223-227.
111. M. Huarte, M. Guttman, D. Feldser, M. Garber, M. J. Koziol, D. Kenzelmann-Broz, A. M. Khalil, O. Zuk, I. Amit, M. Rabani, L. D. Attardi, A. Regev, E. S. Lander, T. Jacks, J. L. Rinn, Cell 2010, 142, 409-419.
112. K. Abdelmohsen, A. Panda, M. J. Kang, J. Xu, R. Selimyan, J. H. Yoon, J. L. Martindale, S. De, W. H. Wood III, K. G. Becker, M. Gorospe, Aging Cell 2013, 12, 890-900.
113. S. Loewer, M. N. Cabili, M. Guttman, Y. H. Loh, K. Thomas, I. H. Park, M. Garber, M. Curran, T. Onder, S. Agarwal, P. D. Manos, S. Datta, E. S. Lander, T. M. Schlaeger, G. Q. Daley, J. L. Rinn, Nat. Genet. 2010, 42, 1113-1117.
114. T. L. Young, T. Matsuda, C. L. Cepko, Curr. Biol. 2005, 15, 501-512.
115. A. M. Bond, M. J. Vangompel, E. A. Sametsky, M. F. Clark, J. C. Savage, J. F. Disterhoft, J. D. Kohtz, Nat. Neurosci. 2009, 12, 1020-1027.
116. T. R. Mercer, I. A. Qureshi, S. Gokhan, M. E. Dinger, G. Li, J. S. Mattick, M. F. Mehler, BMC Neurosci. 2010, 11, 14
117. H. Sunwoo, M. E. Dinger, J. E. Wilusz, P. P. Amaral, J. S. Mattick, D. L. Spector, Genome Res. 2009, 19, 347-359
118. L. L. Chen, G. G. Carmichael, Mol. Cell 2009, 35, 467-478.
119. A. T. Willingham, A. P. Orth, S. Batalov, E. C. Peters, B. G. Wen, P. Aza-Blanc, J. B. Hogenesch, P. G. Schultz, Science 2005, 309, 1570-1573.
120. M. Mourtada-Maarabouni, A. M. Hasan, F. Farzaneh, G. T. Williams, Mol. Pharmacol. 2010, 78, 19-28
121. M. Mourtada-Maarabouni, V. L. Hedge, L. Kirkham, F. Farzaneh, G. T. Williams, J. Cell Sci. 2008, 121, 939-946.
122. J. Fantes, N. K. Ragge, S. A. Lynch, N. I. McGill, J. R. Collin, P. N. Howard-Peebles, C. Hayward, A. J. Vivian, K. Williamson, V. van Heyningen, D. R. FitzPatrick, Nat. Genet. 2003, 33, 461-463.
123. P. P. Amaral, C. Neyt, S. J. Wilkins, M. E. Askarian-Amiri, S. M. Sunkin, A. C. Perkins, J. S. Mattick, RNA 2009, 15, 2013-2027.
124. C. Fenoglio, E. Ridolfi, D. Galimberti, E. Scarpini, Int. J. Mol. Sci. 2013, 14, 20427-20442.
125. S. Tochitani, Y. Hayashizaki, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008, 372, 691-696.
126. A. V. Kondrashov, M. Kiefmann, K. Ebnet, T. Khanam, R. S. Muddashetty, J. Brosius, J. Mol. Biol. 2005, 353, 88-103.
127. J. Kremerskothen, D. Zopf, P. Walter, J.-G. Cheng, M. Nettermann, U. Niewerth, R. J. Maraia, J. Brosius, Neurosci. Lett. 1998, 245, 123-126.
128. D. Lin, T. V. Pestova, C. U. Hellen, H. Tiedge, Mol. Cell. Biol. 2008, 28, 3008-3019.
129. P. J. French, T. V. Bliss, V. O'Connor, Neuroscience 2001, 108, 207-215.
130. D. Bernard, K. V. Prasanth, V. Tripathi, S. Colasse, T. Nakamura, Z. Xuan, M. Q. Zhang, F. Sedel, L. Jourdren, F. Coulpier, A. Triller, D. L. Spector, A. Bessis, EMBO J. 2010, 29, 3082-3093.
131. S. K. Michelhaugh, L. Lipovich, J. Blythe, H. Jia, G. Kapatos, M. J. Bannon, J. Neurochem. 2011, 116, 459-466.
132. R. J. Sims III, S. S. Mandal, D. Reinberg, Curr. Opin. Cell Biol. 2004, 16, 263-271
133. B. S. Chen, S. S. Mandal, M. Hampsey, Biochemistry 2004, 43, 12741-12749.
134. J. Houseley, L. Rubbi, M. Grunstein, D. Tollervey, M. Vogelauer, Mol. Cell 2008, 32, 685-695.
135. M. Pinskaya, S. Gourvennec, A. Morillon, EMBO J. 2009, 28, 1697-1707.
136. S. Malik, G. Durairaj, S. R. Bhaumik, Mol. Cell. Biol. 2013, 33, 3549-3567.
137. M. Ishibashi, R. Kogo, K. Shibata, G. Sawada, Y. Takahashi, J. Kurashige, S. Akiyoshi, S. Sasaki, T. Iwaya, T. Sudo, K. Sugimachi, K. Mimori, G. Wakabayashi, M. Mori, Oncol. Rep. 2013, 29, 946-950
138. Y. J. Geng, S. L. Xie, Q. Li, J. Ma, G. Y. Wang, J. Int. Med. Res. 2011, 39, 2119-2128
139. Z. Yang, L. Zhou, L. M. Wu, M. C. Lai, H. Y. Xie, F. Zhang, S. S. Zheng, Ann. Surg. Oncol. 2011, 18, 1243-1250.
140. K. Kim, I. Jutooru, G. Chadalapaka, G. Johnson, J. Frank, R. Burghardt, S. Kim, S. Safe, Oncogene 2012, 32, 1616-1625.
141. T. Nakagawa, H. Endo, M. Yokoyama, J. Abe, K. Tamai, N. Tanaka, I. Sato, S. Takahashi, T. Kondo, K. Satoh, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2013, 436, 319-324
142. Y. Zhuang, X. Wang, H. T. Nguyen, Y. Zhuo, X. Cui, C. Fewell, E. K. Flemington, B. Shan, J. Hematol. Oncol. 2013, 6, 35.
143. R. Kogo, T. Shimamura, K. Mimori, K. Kawahara, S. Imoto, T. Sudo, F. Tanaka, K. Shibata, A. Suzuki, S. Komune, S. Miyano, M. Mori, Cancer Res. 2011, 71, 6320-6326.
144. T. Niinuma, H. Suzuki, M. Nojima, K. Nosho, H. Yamamoto, H. Takamaru, E. Yamamoto, R. Maruyama, T. Nobuoka, Y. Miyazaki, T. Nishida, T. Bamba, T. Kanda, Y. Ajioka, T. Taguchi, S. Okahara, H. Takahashi, Y. Nishida, M. Hosokawa, T. Hasegawa, T. Tokino, K. Hirata, K. Imai, M. Toyota, Y. Shinomura, Cancer Res. 2012, 72, 1126-1136.
145. X. B. Lv, G. Y. Lian, H. R. Wang, E. Song, H. Yao, M. H. Wang, PLoS One 2013, 8, e 63516.
146. M. M. Milhem, T. Knutson, S. Yang, D. Zhu, X. Wang, K. K. Leslie, X. Meng, J. Cancer Sci. Ther. 2011, Suppl. 5, 004.
147. L. Lu, G. Zhu, C. Zhang, Q. Deng, D. Katsaros, S. Mayne, H. Risch, L. Mu, E. Canuto, G. Gregori, C. Benedetto, H. Yu, Breast Cancer Res. Treat. 2012, 136, 875-883.
148. K. I. Ansari, I. Hussain, S. Kasiri, S. S. Mandal, J. Mol. Endocrinol. 2012, 48, 61-75
149. K. I. Ansari, I. Hussain, B. Shrestha, S. Kasiri, S. S. Mandal, J. Mol. Biol. 2011, 411, 334-349
150. K. I. Ansari, S. Kasiri, I. Hussain, S. S. Mandal, FEBS J. 2009, 276, 7400-7411
151. K. I. Ansari, B. Shrestha, I. Hussain, S. Kasiri, S. S. Mandal, Biochemistry 2011, 50, 3517-3527.
152. K. Kim, I. Jutooru, G. Chadalapaka, G. Johnson, J. Frank, R. Burghardt, S. Kim, S. Safe, Oncogene 2013, 32, 1616-1625.
153. L. Cui, X. Y. Xie, H. Wang, X. L. Chen, S. L. Liu, L. N. Hu, Journal of Sichuan University, Medical Science Edition 2013, 44, 57-59
154. D. Li, J. Feng, T. Wu, Y. Wang, Y. Sun, J. Ren, M. Liu, Am. J. Pathol. 2013, 182, 64-70
155. Y. Nie, X. Liu, S. Qu, E. Song, H. Zou, C. Gong, Cancer Sci. 2013, 104, 458-464.
156. M. S. Cunnington, M. S. Koref, B. M. Mayosi, J. Burn, B. Keavney, PLoS Genet. 2010, 6, e 1000899.
157. L. M. Holdt, F. Beutner, M. Scholz, S. Gielen, G. Gäbel, H. Bergert, G. Schuler, J. Thiery, D. Teupser, Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 2010, 30, 620-627.
158. A. S. Schaefer, G. M. Richter, B. Groessner-Schreiber, B. Noack, M. Nothnagel, N. E. El Mokhtari, B. G. Loos, S. Jepsen, S. Schreiber, PLoS Genet. 2009, 5, e 1000378.
159. P. Ji, S. Diederichs, W. Wang, S. Boing, R. Metzger, P. M. Schneider, N. Tidow, B. Brandt, H. Buerger, E. Bulk, M. Thomas, W. E. Berdel, H. Serve, C. Muller-Tidow, Oncogene 2003, 22, 8031-8041.
160. C. H. Li, Y. Chen, Int. J. Biochem. Cell Biol. 2013, 45, 1895-1910.
161. K. Tano, R. Mizuno, T. Okada, R. Rakwal, J. Shibato, Y. Masuo, K. Ijiri, N. Akimitsu, FEBS Lett. 2010, 584, 4575-4580.
162. T. Gutschner, M. Hämmerle, M. Eißmann, J. Hsu, Y. Kim, G. Hung, A. Revenko, G. Arun, M. Stentrup, M. Groß, M. Zörnig, A. R. MacLeod, D. L. Spector, S. Diederichs, Cancer Res. 2013, 73, 1180-1189.
163. M.-c. Lai, Z. Yang, L. Zhou, Q.-q. Zhu, H.-y. Xie, F. Zhang, L.-m. Wu, L.-m. Chen, S.-s. Zheng, Med. Oncol. 2012, 29, 1810-1816
164. C. Xu, M. Yang, J. Tian, X. Wang, Z. Li, Int. J. Oncol. 2011, 39, 169-175
165. L. Ying, Q. Chen, Y. Wang, Z. Zhou, Y. Huang, F. Qiu, Mol. BioSyst. 2012, 8, 2289-2294.
166. F. Guo, Y. Li, Y. Liu, J. Wang, G. Li, Acta Biochim. Biophys. Sin. 2010, 42, 224-229.
167. Y. Han, Y. Liu, L. Nie, Y. Gui, Z. Cai, Urology 2013, 81, 209.e1- 209.e7.
168. M. Mourtada-Maarabouni, M. R. Pickard, V. L. Hedge, F. Farzaneh, G. T. Williams, Oncogene 2009, 28, 195-208.
169. S. Schoeftner, M. A. Blasco, Nat. Cell Biol. 2008, 10, 228-236
170. C. M. Azzalin, P. Reichenbach, L. Khoriauli, E. Giulotto, J. Lingner, Science 2007, 318, 798-801.
171. Z. Deng, J. Norseen, A. Wiedmer, H. Riethman, P. M. Lieberman, Mol. Cell 2009, 35, 403-413
172. S. Schoeftner, M. A. Blasco, Semin. Cell Dev. Biol. 2010, 21, 186-193
173. S. Redon, P. Reichenbach, J. Lingner, Nucleic Acids Res. 2010, 38, 5797-5806
174. I. L. de Silanes, M. Stagno d'Alcontres, M. A. Blasco, Nat. Commun. 2010, 1, 33.
175. T. de Lange, Genes Dev. 2005, 19, 2100-2110.
176. V. Pachnis, C. I. Brannan, S. M. Tilghman, EMBO J. 1988, 7, 673-681
177. F. Poirier, C. T. Chan, P. M. Timmons, E. J. Robertson, M. J. Evans, P. W. Rigby, Development 1991, 113, 1105-1114
178. V. Pachnis, A. Belayew, S. M. Tilghman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1984, 81, 5523-5527.
179. T. Yoshimizu, A. Miroglio, M.-A. Ripoche, A. Gabory, M. Vernucci, A. Riccio, S. Colnot, C. Godard, B. Terris, H. Jammes, L. Dandolo, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 12417-12422
180. G. Smits, A. J. Mungall, S. Griffiths-Jones, P. Smith, D. Beury, L. Matthews, J. Rogers, A. J. Pask, G. Shaw, J. L. VandeBerg, J. R. McCarrey, M. B. Renfree, W. Reik, I. Dunham, Nat. Genet. 2008, 40, 971-976
181. A. Gabory, H. Jammes, L. Dandolo, BioEssays 2010, 32, 473-480.
182. X. Cai, B. R. Cullen, RNA 2007, 13, 313-316.
183. M. L. Glassman, N. de Groot, A. Hochberg, Cancer Genet. Cytogenet. 1996, 89, 69-73.
184. S. Lottin, E. Adriaenssens, T. Dupressoir, N. Berteaux, C. Montpellier, J. Coll, T. Dugimont, J. J. Curgy, Carcinogenesis 2002, 23, 1885-1895
185. M. Kondo, H. Suzuki, R. Ueda, H. Osada, K. Takagi, T. Takahashi, Oncogene 1995, 10, 1193-1198
186. S. Douc-Rasy, M. Barrois, S. Fogel, J. C. Ahomadegbe, D. Stéhelin, J. Coll, G. Riou, Oncogene 1996, 12, 423-430
187. K. Hibi, H. Nakamura, A. Hirai, Y. Fujikake, Y. Kasai, S. Akiyama, K. Ito, H. Takagi, Cancer Res. 1996, 56, 480-482
188. I. Ariel, M. Sughayer, Y. Fellig, G. Pizov, S. Ayesh, D. Podeh, B. A. Libdeh, C. Levy, T. Birman, M. L. Tykocinski, N. de Groot, A. Hochberg, Mol. Pathol. 2000, 53, 320-323.
189. N. Berteaux, S. Lottin, D. Monté, S. Pinte, B. Quatannens, J. Coll, H. Hondermarck, J.-J. Curgy, T. Dugimont, E. Adriaenssens, J. Biol. Chem. 2005, 280, 29625-29636.
190. S. Takeuchi, W.-K. Hofmann, K. Tsukasaki, N. Takeuchi, T. Ikezoe, M. Matsushita, Y. Uehara, H. P. Koeffler, Br. J. Haematol. 2007, 137, 380-381.
191. K. Hashimoto, C. Azuma, Y. Tokugawa, T. Nobunaga, T. A. Aki, Y. Matsui, T. Yanagida, H. Izumi, F. Saji, Y. Murata, Hum. Pathol. 1997, 28, 862-865.
192. N. Miyoshi, H. Wagatsuma, S. Wakana, T. Shiroishi, M. Nomura, K. Aisaka, T. Kohda, M. A. Surani, T. Kaneko-Ishino, F. Ishino, Genes Cells 2000, 5, 211-220.
193. R. Gejman, D. L. Batista, Y. Zhong, Y. Zhou, X. Zhang, B. Swearingen, C. A. Stratakis, E. T. Hedley-Whyte, A. Klibanski, J. Clin. Endocrinol. Metab. 2008, 93, 4119-4125.
194. Y. Zhou, Y. Zhong, Y. Wang, X. Zhang, D. L. Batista, R. Gejman, P. J. Ansell, J. Zhao, C. Weng, A. Klibanski, J. Biol. Chem. 2007, 282, 24731-24742.
195. E. C. Hsiao, L. G. Koniaris, T. Zimmers-Koniaris, S. M. Sebald, T. V. Huynh, S.-J. Lee, Mol. Cell. Biol. 2000, 20, 3742-3751.
196. X. Zhang, R. Gejman, A. Mahta, Y. Zhong, K. A. Rice, Y. Zhou, P. Cheunsuchon, D. N. Louis, A. Klibanski, Cancer Res. 2010, 70, 2350-2358.
197. C. Kanduri, Semin. Cell Dev. Biol. 2011, 22, 343-350.
198. K. Mitsuya, M. Meguro, M. P. Lee, M. Katoh, T. C. Schulz, H. Kugoh, M. A. Yoshida, N. Niikawa, A. P. Feinberg, M. Oshimura, Hum. Mol. Genet. 1999, 8, 1209-1217.
199. R. Weksberg, A. C. Smith, J. Squire, P. Sadowski, Hum. Mol. Genet. 2003, 12 (Suppl. 1), R 61 -R 68.
200. N. M. Lindor, M. L. McMaster, C. J. Lindor, M. H. Greene, J. Natl. Cancer Inst. Monogr. 2008, 2008, 3-93
201. M. R. DeBaun, M. A. Tucker, J. Pediatr. 1998, 132, 398-400.
202. N. J. Smilinich, C. D. Day, G. V. Fitzpatrick, G. M. Caldwell, A. C. Lossie, P. R. Cooper, A. C. Smallwood, J. A. Joyce, P. N. Schofield, W. Reik, R. D. Nicholls, R. Weksberg, D. J. Driscoll, E. R. Maher, T. B. Shows, M. J. Higgins, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 8064-8069.
203. S. Nakano, K. Murakami, M. Meguro, H. Soejima, K. Higashimoto, T. Urano, H. Kugoh, T. Mukai, M. Ikeguchi, M. Oshimura, Cancer Sci. 2006, 97, 1147-1154.
204. J. R. Prensner, M. K. Iyer, O. A. Balbin, S. M. Dhanasekaran, Q. Cao, J. C. Brenner, B. Laxman, I. A. Asangani, C. S. Grasso, H. D. Kominsky, X. Cao, X. Jing, X. Wang, J. Siddiqui, J. T. Wei, D. Robinson, H. K. Iyer, N. Palanisamy, C. A. Maher, A. M. Chinnaiyan, Nat. Biotechnol. 2011, 29, 742-749.
205. K. Panzitt, M. M. O. Tschernatsch, C. Guelly, T. Moustafa, M. Stradner, H. M. Strohmaier, C. R. Buck, H. Denk, R. Schroeder, M. Trauner, K. Zatloukal, Gastroenterology 2007, 132, 330-342.
206. I. J. Matouk, I. Abbasi, A. Hochberg, E. Galun, H. Dweik, M. Akkawi, Eur. J. Gastroenterol. Hepatol. 2009, 21, 688-692.
207. V. Srikantan, Z. Zou, G. Petrovics, L. Xu, M. Augustus, L. Davis, J. R. Livezey, T. Connell, I. A. Sesterhenn, K. Yoshino, G. S. Buzard, F. K. Mostofi, D. G. McLeod, J. W. Moul, S. Srivastava, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 12216-12221.
208. G. Petrovics, W. Zhang, M. Makarem, J. P. Street, R. Connelly, L. Sun, I. A. Sesterhenn, V. Srikantan, J. W. Moul, S. Srivastava, Oncogene 2004, 23, 605-611
209. X. Fu, L. Ravindranath, N. Tran, G. Petrovics, S. Srivastava, DNA Cell Biol. 2006, 25, 135-141.
210. M. E. Askarian-Amiri, J. Crawford, J. D. French, C. E. Smart, M. A. Smith, M. B. Clark, K. Ru, T. R. Mercer, E. R. Thompson, S. R. Lakhani, A. C. Vargas, I. G. Campbell, M. A. Brown, M. E. Dinger, J. S. Mattick, RNA 2011, 17, 878-891.
211. Y. Liu, M. Corcoran, O. Rasool, G. Ivanova, R. Ibbotson, D. Grander, A. Iyengar, A. Baranova, V. Kashuba, M. Merup, X. Wu, A. Gardiner, R. Mullenbach, A. Poltaraus, A. L. Hultstrom, G. Juliusson, R. Chapman, M. Tiller, F. Cotter, G. Gahrton, N. Yankovsky, E. Zabarovsky, S. Einhorn, D. Oscier, Oncogene 1997, 15, 2463-2473
212. S. Wolf, D. Mertens, C. Schaffner, C. Korz, H. Döhner, S. Stilgenbauer, P. Lichter, Hum. Mol. Genet. 2001, 10, 1275-1285.
213. Y. Liu, L. Szekely, D. Grander, S. Soderhall, G. Juliusson, G. Gahrton, S. Linder, S. Einhorn, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90, 8697-8701
214. A. G. Brown, F. M. Ross, E. M. Dunne, C. M. Steel, E. M. Weir-Thompson, Nat. Genet. 1993, 3, 67-72.
215. M. Lerner, M. Harada, J. Lovén, J. Castro, Z. Davis, D. Oscier, M. Henriksson, O. Sangfelt, D. Grandér, M. M. Corcoran, Exp. Cell Res. 2009, 315, 2941-2952.
216. J. M. Silva, N. J. Boczek, M. W. Berres, X. Ma, D. I. Smith, RNA Biol. 2011, 8, 496-505.
217. J. Jendrzejewski, H. He, H. S. Radomska, W. Li, J. Tomsic, S. Liyanarachchi, R. V. Davuluri, R. Nagy, A. de La Chapelle, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2012, 109, 8646-8651.
218. X.-S. Wang, Z. Zhang, H.-C. Wang, J.-L. Cai, Q.-W. Xu, M.-Q. Li, Y.-C. Chen, X.-P. Qian, T.-J. Lu, L.-Z. Yu, Y. Zhang, D.-Q. Xin, Y.-Q. Na, W.-F. Chen, Clin. Cancer Res. 2006, 12, 4851-4858.
219. F. Wang, X. Li, X. Xie, L. Zhao, W. Chen, FEBS Lett. 2008, 582, 1919-1927.
220. W. P. Tsang, T. W. L. Wong, A. H. H. Cheung, C. N. N. Co, T. T. Kwok, RNA 2007, 13, 890-898.
221. H. He, R. Nagy, S. Liyanarachchi, H. Jiao, W. Li, S. Suster, J. Kere, A. de La Chapelle, Cancer Res. 2009, 69, 625-631.
222. G. A. Calin, C.-g. Liu, M. Ferracin, T. Hyslop, R. Spizzo, C. Sevignani, M. Fabbri, A. Cimmino, E. J. Lee, S. E. Wojcik, M. Shimizu, E. Tili, S. Rossi, C. Taccioli, F. Pichiorri, X. Liu, S. Zupo, V. Herlea, L. Gramantieri, G. Lanza, H. Alder, L. Rassenti, S. Volinia, T. D. Schmittgen, T. J. Kipps, M. Negrini, C. M. Croce, Cancer Cell 2007, 12, 215-229.
223. B. S. Emanuel, G. Balaban, J. P. Boyd, A. Grossman, M. Negishi, A. Parmiter, M. C. Glick, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1985, 82, 3736-3740.
224. C. Braconi, N. Valeri, T. Kogure, P. Gasparini, N. Huang, G. J. Nuovo, L. Terracciano, C. M. Croce, T. Patel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2011, 108, 786-791.
225. I. A. Qureshi, J. S. Mattick, M. F. Mehler, Brain Res. 2010, 1338, 20-35.
226. R. B. Maccioni, J. P. Muñoz, L. Barbeito, Arch. Med. Res. 2001, 32, 367-381.
227. M. A. Faghihi, F. Modarresi, A. M. Khalil, D. E. Wood, B. G. Sahagan, T. E. Morgan, C. E. Finch, G. St Laurent III, P. J. Kenny, C. Wahlestedt, Nat. Med. 2008, 14, 723-730
228. E. Mus, P. R. Hof, H. Tiedge, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 10679-10684.
229. M. E. MacDonald, C. M. Ambrose, M. P. Duyao, R. H. Myers, C. Lin, L. Srinidhi, G. Barnes, S. A. Taylor, M. James, N. Groot, H. MacFarlane, B. Jenkins, M. A. Anderson, N. S. Wexler, J. F. Gusella, G. P. Bates, S. Baxendale, H. Hummerich, S. Kirby, M. North, S. Youngman, R. Mott, G. Zehetner, Z. Sedlacek, A. Poustka, A.-M. Frischauf, H. Lehrach, A. J. Buckler, D. Church, L. Doucette-Stamm, M. C. O'Donovan, L. Riba-Ramirez, M. Shah, V. P. Stanton, S. A. Strobel, K. M. Draths, J. L. Wales, P. Dervan, D. E. Housman, M. Altherr, R. Shiang, L. Thompson, T. Fielder, J. J. Wasmuth, D. Tagle, J. Valdes, L. Elmer, M. Allard, L. Castilla, M. Swaroop, K. Blanchard, F. S. Collins, R. Snell, T. Holloway, K. Gillespie, N. Datson, D. Shaw, P. S. Harper, Cell 1993, 72, 971-983.
230. C. Zuccato, M. Tartari, A. Crotti, D. Goffredo, M. Valenza, L. Conti, T. Cataudella, B. R. Leavitt, M. R. Hayden, T. Timmusk, D. Rigamonti, E. Cattaneo, Nat. Genet. 2003, 35, 76-83.
231. D. S. Johnson, A. Mortazavi, R. M. Myers, B. Wold, Science 2007, 316, 1497-1502.
232. R. Johnson, N. Richter, R. Jauch, P. M. Gaughwin, C. Zuccato, E. Cattaneo, L. W. Stanton, Physiol. Genomics 2010, 41, 269-274.
233. R. Johnson, N. Buckley, NeuroMol. Med. 2009, 11, 183-199.
234. R. S. Daughters, D. L. Tuttle, W. Gao, Y. Ikeda, M. L. Moseley, T. J. Ebner, M. S. Swanson, L. P. Ranum, PLoS Genet. 2009, 5, e 1000600
235. J. W. Day, L. J. Schut, M. L. Moseley, A. C. Durand, L. P. Ranum, Neurology 2000, 55, 649-657.
236. J. K. Millar, J. C. Wilson-Annan, S. Anderson, S. Christie, M. S. Taylor, C. A. M. Semple, R. S. Devon, D. M. S. Clair, W. J. Muir, D. H. R. Blackwood, D. J. Porteous, Hum. Mol. Genet. 2000, 9, 1415-1423.
237. G. Barry, J. A. Briggs, D. P. Vanichkina, E. M. Poth, N. J. Beveridge, V. S. Ratnu, S. P. Nayler, K. Nones, J. Hu, T. W. Bredy, S. Nakagawa, F. Rigo, R. J. Taft, M. J. Cairns, S. Blackshaw, E. J. Wolvetang, J. S. Mattick, Mol. Psychiatry 2014, DOI:.
238. H. Tsuiji, R. Yoshimoto, Y. Hasegawa, M. Furuno, M. Yoshida, S. Nakagawa, Genes Cells 2011, 16, 479-490.
239. S. B. Cassidy, J. Med. Genet. 1997, 34, 917-923.
240. S. J. Chamberlain, C. I. Brannan, Genomics 2001, 73, 316-322
241. K. A. Johnstone, A. J. DuBose, C. R. Futtner, M. D. Elmore, C. I. Brannan, J. L. Resnick, Hum. Mol. Genet. 2006, 15, 393-404
242. J. H. Knoll, R. D. Nicholls, R. E. Magenis, J. M. Graham, Jr., M. Lalande, S. A. Latt, Am. J. Med. Genet. 1989, 32, 285-290.
243. E. Le Meur, F. Watrin, M. Landers, R. Sturny, M. Lalande, F. Muscatelli, Dev. Biol. 2005, 286, 587-600.
244. P. Vitali, H. Royo, V. Marty, M.-L. Bortolin-Cavaillé, J. Cavaillé, J. Cell Sci. 2010, 123, 70-83.
245. K. C. Pang, M. E. Dinger, T. R. Mercer, L. Malquori, S. M. Grimmond, W. Chen, J. S. Mattick, J. Immunol. 2009, 182, 7738-7748.
246. N. Zhang, K. Hopkins, Y.-W. He, J. Immunol. 2008, 181, 5368-5373.
247. C. Xiao, L. Srinivasan, D. P. Calado, H. C. Patterson, B. Zhang, J. Wang, J. M. Henderson, J. L. Kutok, K. Rajewsky, Nat. Immunol. 2008, 9, 405-414.
248. C. Z. Chen, L. Li, H. F. Lodish, D. P. Bartel, Science 2004, 303, 83-86.
249. S. Vigneau, P. S. Rohrlich, M. Brahic, J. F. Bureau, J. Virol. 2003, 77, 5632-5638.
250. M. van Dijk, H. K. Thulluru, J. Mulders, O. J. Michel, A. Poutsma, S. Windhorst, G. Kleiverda, D. Sie, A. M. Lachmeijer, C. B. Oudejans, J. Clin. Invest. 2012, 122, 4003-4011.
251. D. S. Cabianca, V. Casa, B. Bodega, A. Xynos, E. Ginelli, Y. Tanaka, D. Gabellini, Cell 2012, 149, 819-831.
252. K. I. Ansari, S. Kasiri, S. S. Mandal, Oncogene 2013, 32, 3359-3370
253. K. I. Ansari, S. Kasiri, B. P. Mishra, S. S. Mandal, Br. J. Cancer 2012, 107, 315-324
254. E. Fidalgo da Silva, S. S. Mandal, L. J. Reha-Krantz, J. Biol. Chem. 2002, 277, 40640-40649.
255. W. Qi, H. Chan, L. Teng, L. Li, S. Chuai, R. Zhang, J. Zeng, M. Li, H. Fan, Y. Lin, J. Gu, O. Ardayfio, J.-H. Zhang, X. Yan, J. Fang, Y. Mi, M. Zhang, T. Zhou, G. Feng, Z. Chen, G. Li, T. Yang, K. Zhao, X. Liu, Z. Yu, C. X. Lu, P. Atadja, E. Li, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2012, 109, 21360-21365
256. J. Wang, F. Lu, Q. Ren, H. Sun, Z. Xu, R. Lan, Y. Liu, D. Ward, J. Quan, T. Ye, H. Zhang, Cancer Res. 2011, 71, 7238-7249
257. K. Podar, G. Tonon, M. Sattler, Y.-T. Tai, S. LeGouill, H. Yasui, K. Ishitsuka, S. Kumar, R. Kumar, L. N. Pandite, T. Hideshima, D. Chauhan, K. C. Anderson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006, 103, 19478-19483.
258. F. Crea, L. Fornaro, G. Bocci, L. Sun, W. L. Farrar, A. Falcone, R. Danesi, Cancer Metastasis Rev. 2012, 31, 753-761
259. S. Garapaty-Rao, C. Nasveschuk, A. Gagnon, E. Y. Chan, P. Sandy, J. Busby, S. Balasubramanian, R. Campbell, F. Zhao, L. Bergeron, J. E. Audia, B. K.
260. M. T. McCabe, H. M. Ott, G. Ganji, S. Korenchuk, C. Thompson, G. S. VanAller, Y. Liu, A. P. Graves, A. D. Pietra, E. Diaz, L. V. LaFrance, M. Mellinger, C. Duquenne, X. R. Tian, R. G. Kruger, C. F. McHugh, M. Brandt, W. H. Miller, D. Dhanak, S. K. Verma, P. J. Tummino, C. L. Creasy, Nature 2012, 492, 108
261. K. I. Ansari, J. D. Grant, S. Kasiri, G. Woldemariam, B. Shrestha, S. S. Mandal, J. Inorg. Biochem. 2009, 103, 818-826
262. K. I. Ansari, J. D. Grant, G. A. Woldemariam, S. Kasiri, S. S. Mandal, Org. Biomol. Chem. 2009, 7, 926-932
263. K. I. Ansari, S. Kasiri, J. D. Grant, S. S. Mandal, J. Biomol. Screening 2011, 16, 26-35
264. J. C. Culhane, D. Wang, P. M. Yen, P. A. Cole, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 3164-3176.
265. N. Hauptman, D. Glavac, Radiol. Oncol. 2013, 47, 311-318.
266. I. Iacobucci, M. Sazzini, P. Garagnani, A. Ferrari, A. Boattini, A. Lonetti, C. Papayannidis, V. Mantovani, E. Marasco, E. Ottaviani, S. Soverini, D. Girelli, D. Luiselli, M. Vignetti, M. Baccarani, G. Martinelli, Leuk. Res. 2011, 35, 1052-1059
267. J. Healy, H. Bélanger, P. Beaulieu, M. Larivière, D. Labuda, D. Sinnett, Blood 2007, 109, 683-692.
268. I. J. Matouk, S. Mezan, A. Mizrahi, P. Ohana, R. Abu-lail, Y. Fellig, N. deGroot, E. Galun, A. Hochberg, Biochim. Biophys. Acta Mol. Cell Res. 2010, 1803, 443-451.
269. R. R. Pandey, M. Ceribelli, P. B. Singh, J. Ericsson, R. Mantovani, C. Kanduri, J. Biol. Chem. 2004, 279, 52685-52693.
270. Y. Han, Y. Liu, Y. Gui, Z. Cai, J. Surg. Oncol. 2013, 107, 555-559.
271. H. Zhang, S. P. Gao, C. De Geyter, Int. J. Oncol. 2009, 34, 1135-1138.
272. A. Cayre, F. Rossignol, E. Clottes, F. Penault-Llorca, Breast Cancer Res. 2003, 5, R 223 -R 230
273. C. A. Thrash-Bingham, K. D. Tartof, J. Natl. Cancer Inst. 1999, 91, 143-151.
274. D. Khaitan, M. E. Dinger, J. Mazar, J. Crawford, M. A. Smith, J. S. Mattick, R. J. Perera, Cancer Res. 2011, 71, 3852-3862.
275. L. He, Sci. Signal. 2010, 3, pe 39
276. L. Poliseno, L. Salmena, J. Zhang, B. Carver, W. J. Haveman, P. P. Pandolfi, Nature 2010, 465, 1033-1038
277. Y. J. Ioffe, K. B. Chiappinelli, D. G. Mutch, I. Zighelboim, P. J. Goodfellow, Gynecol. Oncol. 2012, 124, 340-346.
278. L. B. Ferreira, A. Palumbo, K. D. de Mello, C. Sternberg, M. Caetano, F. L. de Oliveira, A. F. Neves, L. E. Nasciutti, L. R. Goulart, E. R. P. Gimba, BMC Cancer 2012, 12, 507.
279. R. Parenti, S. Paratore, A. Torrisi, S. Cavallaro, Eur. J. Neurosci. 2007, 26, 2444-2457.
280. D. W. Chung, D. D. Rudnicki, L. Yu, R. L. Margolis, Hum. Mol. Genet. 2011, 20, 3467-3477.
281. C. M. Clemson, J. N. Hutchinson, S. A. Sara, A. W. Ensminger, A. H. Fox, A. Chess, J. B. Lawrence, Mol. Cell 2009, 33, 717-726.
282. C. Scheele, N. Petrovic, M. A. Faghihi, T. Lassmann, K. Fredriksson, O. Rooyackers, C. Wahlestedt, L. Good, J. A. Timmons, BMC Genomics 2007, 8, 74.
283. P. D. Ladd, L. E. Smith, N. A. Rabaia, J. M. Moore, S. A. Georges, R. S. Hansen, R. J. Hagerman, F. Tassone, S. J. Tapscott, G. N. Filippova, Hum. Mol. Genet. 2007, 16, 3174-3187.
284. O. Zolk, T. F. Solbach, T. Eschenhagen, A. Weidemann, M. F. Fromm, Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008, 376, 315-320.
285. V. R. Paralkar, M. J. Weiss, Genes Dev. 2011, 25, 2555-2558.
286. T. Annilo, K. Kepp, M. Laan, BMC Mol. Biol. 2009, 10, 81.