Introducing protein intrinsic disorder

Chemical Reviews

Volumn 114, Issue 13, 2014, Pages 6561-6588

  Habchi, Johnny ^a,b   Tompa, Peter ^c,d   Longhi, Sonia ^a,b   Uversky, Vladimir N ^e,f  

^a AIX MARSEILLE UNIVERSITY   (France)

^b CNRS   (France)

^c VRIJE UNIVERSITEIT BRUSSEL   (Belgium)

^d INSTITUTE OF EXPERIMENTAL MEDICINE   (Hungary)

^e UNIVERSITY OF SOUTH FLORIDA   (United States)

^f INSTITUTE FOR BIOLOGICAL INSTRUMENTATION   (Russian Federation)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTEINS;

AMINO ACID PROPENSITIES; CUMULATIVE DISTRIBUTION FUNCTION; DISORDERED REGIONS; LIVING CELL; PROTEIN INTRINSIC DISORDERS; SEQUENCE FEATURES;

AMINO ACIDS;

INTRINSICALLY DISORDERED PROTEIN;

BIOLOGY; CELL FUNCTION; CHEMISTRY; DISEASES; HUMAN; STRUCTURE ACTIVITY RELATION;

CELL PHYSIOLOGICAL PHENOMENA; COMPUTATIONAL BIOLOGY; DISEASE; HUMANS; INTRINSICALLY DISORDERED PROTEINS; STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP;

EID: 84903957091     PISSN: 00092665     EISSN: 15206890     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr400514h     Document Type: Review

References (333)

1. Fisher, E. Ber. Dtsch. Chem. Ges. 1894, 27, 2985
2. Koshland, D. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1958, 44, 98
3. Kendrew, J. C.; Bodo, G.; Dintzis, H. M.; Parrish, R. G.; Wyckoff, H.; Phillips, D. C. Nature 1958, 181, 662
4. Berman, H. M. Acta Crystallogr., Sect. A 2008, 64, 88
5. Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 235
6. Li, X.; Obradovic, Z.; Brown, C. J.; Garner, E. C.; Dunker, A. K. Genome Inf. 2000, 11, 172
7. Chouard, T. Nature 2011, 471, 151
8. Romero, P.; Obradovic, Z.; Kissinger, C. R.; Villafranca, J. E.; Garner, E.; Guilliot, S.; Dunker, A. K. Pacific Symposium on Biocomputing 98; Altman, R. B.; Dunker, A. K.; Hunter, L.; Klein, T. E., Eds.; World Scientific Publishing Co.: London, 1998; p 437.
9. Wright, P. E.; Dyson, H. J. J. Mol. Biol. 1999, 293, 321
10. Dunker, A. K.; Babu, M. M.; Barbar, E.; Blackledge, M.; Bondos, S. E.; Dosztányi, Z.; Dyson, H. J.; Forman-Kay, J.; Fuxreiter, M.; Gsponer, J.; Han, K.-H.; Jones, D. T.; Longhi, S.; Metallo, S. J.; Nishikawa, K.; Nussinov, R.; Obradovic, Z.; Pappu, R. V.; Rost, B.; Selenko, P.; Subramaniam, V.; Sussman, J. L.; Tompa, P.; Uversky, V. N. Intrinsically Disord. Proteins 2013, 1, e24157
11. Tompa, P. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 527
12. Uversky, V. N. Eur. J. Biochem. 2002, 269, 2
13. Uversky, V. N. Protein Sci. 2002, 11, 739
14. Uversky, V. N. J. Biomed. Biotechnol. 2010, 2010, 568068
15. Uversky, V. N.; Gillespie, J. R.; Fink, A. L. Proteins 2000, 41, 415
16. Dunker, A. K.; Lawson, J. D.; Brown, C. J.; Williams, R. M.; Romero, P.; Oh, J. S.; Oldfield, C. J.; Campen, A. M.; Ratliff, C. M.; Hipps, K. W.; Ausio, J.; Nissen, M. S.; Reeves, R.; Kang, C.; Kissinger, C. R.; Bailey, R. W.; Griswold, M. D.; Chiu, W.; Garner, E. C.; Obradovic, Z. J. Mol. Graphics Modell. 2001, 19, 26
17. Dunker, A. K.; Oldfield, C. J.; Meng, J.; Romero, P.; Yang, J. Y.; Chen, J. W.; Vacic, V.; Obradovic, Z.; Uversky, V. N. BMC Genomics 2008, 9 (Suppl. 2) S1
18. Campen, A.; Williams, R. M.; Brown, C. J.; Meng, J.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Protein Pept. Lett. 2008, 15, 956
19. Williams, R. M.; Obradovi, Z.; Mathura, V.; Braun, W.; Garner, E. C.; Young, J.; Takayama, S.; Brown, C. J.; Dunker, A. K. Pacific Symposium on Biocomputing 2001; World Scientific Publishing Co.: London, 2001; p 89.
20. Oldfield, C. J.; Cheng, Y.; Cortese, M. S.; Brown, C. J.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Biochemistry 2005, 44, 1989
21. Csizmok, V.; Szollosi, E.; Friedrich, P.; Tompa, P. Mol. Cell. Proteomics 2006, 5, 265
22. Romero, P.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. FEBS Lett. 1999, 462, 363
23. Romero, P.; Obradovic, Z.; Li, X.; Garner, E. C.; Brown, C. J.; Dunker, A. K. Proteins 2001, 42, 38
24. Lise, S.; Jones, D. T. Proteins 2005, 58, 144
25. Longhi, S. Methods Mol. Biol. 2010, 609, 307
26. Ferron, F.; Longhi, S.; Canard, B.; Karlin, D. Proteins 2006, 65, 1
27. Lieutaud, P.; Ferron, F.; Habchi, J.; Canard, B.; Longhi, S. Advances in Protein and Peptide Sciences; Dunn, B., Ed.; Bentham Science Publishers (eBook): Sharjah, UAE, 2013; p 441.
28. Bourhis, J. M.; Canard, B.; Longhi, S. Curr. Protein Pept. Sci. 2007, 8, 135
29. Uversky, V. N.; Radivojac, P.; Iakoucheva, L. M.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. Methods Mol. Biol. 2007, 408, 69
30. Prilusky, J.; Felder, C. E.; Zeev-Ben-Mordehai, T.; Rydberg, E. H.; Man, O.; Beckmann, J. S.; Silman, I.; Sussman, J. L. Bioinformatics 2005, 21, 3435
31. Coeytaux, K.; Poupon, A. Bioinformatics 2005, 21, 1891
32. Linding, R.; Russell, R. B.; Neduva, V.; Gibson, T. J. Nucleic Acids Res. 2003, 31, 3701
33. Sickmeier, M.; Hamilton, J. A.; LeGall, T.; Vacic, V.; Cortese, M. S.; Tantos, A.; Szabo, B.; Tompa, P.; Chen, J.; Uversky, V. N.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. Nucleic Acids Res. 2007, 35, D786
34. Fukuchi, S.; Sakamoto, S.; Nobe, Y.; Murakami, S. D.; Amemiya, T.; Hosoda, K.; Koike, R.; Hiroaki, H.; Ota, M. Nucleic Acids Res. 2012, 40, D507
35. Di Domenico, T.; Walsh, I.; Martin, A. J.; Tosatto, S. C. Bioinformatics 2012, 28, 2080
36. Linding, R.; Jensen, L. J.; Diella, F.; Bork, P.; Gibson, T. J.; Russell, R. B. Structure (Oxford, U. K.) 2003, 11, 1453
37. Ward, J. J.; McGuffin, L. J.; Bryson, K.; Buxton, B. F.; Jones, D. T. Bioinformatics 2004, 20, 2138
38. Yang, Z. R.; Thomson, R.; McNeil, P.; Esnouf, R. M. Bioinformatics 2005, 21, 3369
39. Garbuzynskiy, S. O.; Lobanov, M. Y.; Galzitskaya, O. V. Protein Sci. 2004, 13, 2871
40. Dosztanyi, Z.; Csizmok, V.; Tompa, P.; Simon, I. Bioinformatics 2005, 21, 3433
41. Dosztanyi, Z.; Csizmok, V.; Tompa, P.; Simon, I. J. Mol. Biol. 2005, 347, 827
42. Tompa, P. Structure and Function of Intrinsically Disordered Proteins; CRC Press, Taylor & Francis Group: Boca Raton, FL, 2010.
43. Callebaut, I.; Labesse, G.; Durand, P.; Poupon, A.; Canard, L.; Chomilier, J.; Henrissat, B.; Mornon, J. P. Cell. Mol. Life Sci. 1997, 53, 621
44. Xue, B.; Oldfield, C. J.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. FEBS Lett. 2009, 583, 1469
45. Mohan, A.; Sullivan, W. J., Jr.; Radivojac, P.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. Mol. Biosyst. 2008, 4, 328
46. Huang, F.; Oldfield, C.; Meng, J.; Hsu, W. L.; Xue, B.; Uversky, V. N.; Romero, P.; Dunker, A. K. Pacific Symposium on Biocomputing, 17th; World Scientific Publishing Co.: London, 2012; p 128.
47. Xue, B.; Dunbrack, R. L.; Williams, R. W.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. Biochim. Biophys. Acta 2010, 1804, 996
48. Lieutaud, P.; Canard, B.; Longhi, S. BMC Genomics 2008, 9, S25
49. Blocquel, D.; Habchi, J.; Gruet, A.; Blangy, S.; Longhi, S. Mol. Biosyst. 2012, 8, 392
50. Kosol, S.; Contreras-Martos, S.; Cedeno, C.; Tompa, P. Molecules 2013, 18, 10802
51. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Chem. Rev. 2004, 104, 3607
52. Bermel, W.; Bertini, I.; Chill, J.; Felli, I. C.; Haba, N.; Kumar, M. V. V.; Pierattelli, R. ChemBioChem. 2012, 13, 2425
53. Receveur-Bréchot, V.; Bourhis, J. M.; Uversky, V. N.; Canard, B.; Longhi, S. Proteins 2006, 62, 24
54. Eliezer, D. Curr. Opin. Struct. Biol. 2009, 19, 23
55. Meier, S.; Blackledge, M.; Grzesiek, S. J. Chem. Phys. 2008, 128, 052204
56. Camilloni, C.; De Simone, A.; Vranken, W. F.; Vendruscolo, M. Biochemistry 2012, 51, 2224
57. Jensen, M. R.; Salmon, L.; Nodet, G.; Blackledge, M. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1270
58. Gely, S.; Lowry, D. F.; Bernard, C.; Ringkjobing-Jensen, M.; Blackledge, M.; Costanzo, S.; Darbon, H.; Daughdrill, G. W.; Longhi, S. J. Mol. Recognit. 2010, 23, 435
59. Jensen, M. R.; Markwick, P. R.; Meier, S.; Griesinger, C.; Zweckstetter, M.; Grzesiek, S.; Bernado, P.; Blackledge, M. Structure 2009, 17, 1169
60. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Adv. Protein Chem. 2002, 62, 311
61. Salmon, L.; Nodet, G.; Ozenne, V.; Yin, G.; Jensen, M. R.; Zweckstetter, M.; Blackledge, M. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 8407
62. Jensen, M. R.; Communie, G.; Ribeiro, E. A., Jr.; Martinez, N.; Desfosses, A.; Salmon, L.; Mollica, L.; Gabel, F.; Jamin, M.; Longhi, S.; Ruigrok, R. W.; Blackledge, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 9839
63. Allison, J. R.; Varnai, P.; Dobson, C. M.; Vendruscolo, M. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 18314
64. Fisher, C. K.; Stultz, C. M. Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 426
65. Belle, V.; Rouger, S.; Costanzo, S.; Longhi, S.; Fournel, A. Instrumental Analysis of Intrinsically Disordered Proteins: Assessing Structure and Conformation; Uversky, V. N.; Longhi, S., Eds.; John Wiley & Sons: Hoboken, NJ, 2010.
66. Habchi, J.; Martinho, M.; Gruet, A.; Guigliarelli, B.; Longhi, S.; Belle, V. Methods Mol. Biol. 2012, 895, 361
67. Drescher, M. Top. Curr. Chem. 2012, 321, 91
68. Lorenzi, M.; Puppo, C.; Lebrun, R.; Lignon, S.; Roubaud, V.; Martinho, M.; Mileo, E.; Tordo, P.; Marque, S. R.; Gontero, B.; Guigliarelli, B.; Belle, V. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 9108
69. Mileo, E.; Etienne, E.; Martinho, M.; Lebrun, R.; Roubaud, V.; Tordo, P.; Gontero, B.; Guigliarelli, B.; Marque, S. R.; Belle, V. Bioconjugate Chem. 2013, 24, 1110
70. Wang, J.; Verkhivker, G. M. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 188101
71. Chu, X.; Gan, L.; Wang, E.; Wang, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, E2342
72. Wang, J.; Xu, L.; Wang, E. Biophys. J. 2007, 92, L109
73. Wang, Y.; Chu, X.; Longhi, S.; Roche, P.; Wang, E.; Wang, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110 (40) E3743 10.1073/pnas.1308381110
74. Bernado, P.; Svergun, D. Instrumental Analysis of Intrinsically Disordered Proteins: Assessing Structure and Conformation; Uversky, V. N.; Longhi, S., Eds.; John Wiley & Sons: Hoboken, NJ, 2010; p 451.
75. Ando, T.; Kodera, N. Methods Mol. Biol. 2012, 896, 57
76. Miyagi, A.; Tsunaka, Y.; Uchihashi, T.; Mayanagi, K.; Hirose, S.; Morikawa, K.; Ando, T. ChemPhysChem 2008, 9, 1859
77. Sandal, M.; Valle, F.; Tessari, I.; Mammi, S.; Bergantino, E.; Musiani, F.; Brucale, M.; Bubacco, L.; Samori, B. PLoS Biol. 2008, 6, e6
78. Ferreon, A. C.; Moran, C. R.; Gambin, Y.; Deniz, A. A. Methods Enzymol. 2010, 472, 179
79. Ferreon, A. C.; Ferreon, J. C.; Wright, P. E.; Deniz, A. A. Nature 2013, 498, 390
80. Milles, S.; Koehler, C.; Gambin, Y.; Deniz, A. A.; Lemke, E. A. Mol. Biosyst. 2012, 8, 2531
81. Ando, T.; Uchihashi, T.; Kodera, N. Annu. Rev. Biophys. 2013, 42, 393
82. Dunker, A. K.; Obradovic, Z. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 805
83. Greenblatt, J.; Li, J. J. Biol. Chem. 1982, 257, 362
84. Lisse, T.; Bartels, D.; Kalbitzer, H. R.; Jaenicke, R. Biol. Chem. 1996, 377, 555
85. Kriwacki, R. W.; Wu, J.; Siuzdak, G.; Wright, P. E. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 5320
86. Kriwacki, R. W.; Wu, J.; Tennant, L.; Wright, P. E.; Siuzdak, G. J. Chromatogr., A 1997, 777, 23
87. Fontana, A.; Polverino de Laureto, P.; Spolaore, B.; Frare, E.; Zambonin, M. Instrumental Analysis of Intrinsically Disordered Proteins: Assessing Structure and Conformation; Uversky, V.; Longhi, S., Eds.; John Wiley & Sons: Hoboken, NJ, 2010; p 569.
88. Hernandez, M. A.; Avila, J.; Andreu, J. M. Eur. J. Biochem. 1986, 154, 41
89. Weinreb, P. H.; Zhen, W.; Poon, A. W.; Conway, K. A.; Lansbury, P. T., Jr. Biochemistry 1996, 35, 13709
90. Etoh, Y.; Simon, M.; Green, H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1986, 136, 51
91. Lynch, W. P.; Riseman, V. M.; Bretscher, A. J. Biol. Chem. 1987, 262, 7429
92. Livernois, A. M.; Hnatchuk, D. J.; Findlater, E. E.; Graether, S. P. Anal. Biochem. 2009, 392, 70
93. Kalthoff, C. J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2003, 786, 247
94. Cortese, M. S.; Baird, J. P.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. J. Proteome Res. 2005, 4, 1610
95. Uversky, V. N.; Longhi, S. Instrumental Analysis of Intrinsically Disordered Proteins; John Wiley & Sons: Hoboken, NJ, 2010.
96. Ellis, R. J. Trends Biochem. Sci. 2001, 26, 597
97. Minton, A. P. Biophys. J. 2005, 88, 971
98. Bolen, D. W.; Baskakov, I. V. J. Mol. Biol. 2001, 310, 955
99. Munishkina, L. A.; Cooper, E. M.; Uversky, V. N.; Fink, A. L. J. Mol. Recognit. 2004, 17, 456
100. Breydo, L.; Reddy, K. D.; Piai, A.; Felli, I. C.; Pierattelli, R.; Uversky, V. N. Biochim. Biophys. Acta 2014, 1844, 346
101. Szasz, C. S.; Alexa, A.; Toth, K.; Rakacs, M.; Langowski, J.; Tompa, P. Biochemistry 2011, 50, 5834
102. Asher, G.; Tsvetkov, P.; Kahana, C.; Shaul, Y. Genes Dev. 2005, 19, 316
103. Sheaff, R. J.; Singer, J. D.; Swanger, J.; Smitherman, M.; Roberts, J. M.; Clurman, B. E. Mol. Cell 2000, 5, 403
104. Inomata, K.; Ohno, A.; Tochio, H.; Isogai, S.; Tenno, T.; Nakase, I.; Takeuchi, T.; Futaki, S.; Ito, Y.; Hiroaki, H.; Shirakawa, M. Nature 2009, 458, 106
105. Bodart, J. F.; Wieruszeski, J. M.; Amniai, L.; Leroy, A.; Landrieu, I.; Rousseau-Lescuyer, A.; Vilain, J. P.; Lippens, G. J. Magn. Reson. 2008, 192, 252
106. Binolfi, A.; Theillet, F. X.; Selenko, P. Biochem. Soc. Trans. 2012, 40, 950
107. Waudby, C. A.; Camilloni, C.; Fitzpatrick, A. W.; Cabrita, L. D.; Dobson, C. M.; Vendruscolo, M.; Christodoulou, J. PLoS One 2013, 8, e72286
108. McNulty, B. C.; Young, G. B.; Pielak, G. J. J. Mol. Biol. 2006, 355, 893
109. Belle, A.; Tanay, A.; Bitincka, L.; Shamir, R.; OShea, E. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 13004
110. Tompa, P.; Prilusky, J.; Silman, I.; Sussman, J. L. Proteins 2008, 71, 903
111. Prakash, S.; Tian, L.; Ratliff, K. S.; Lehotzky, R. E.; Matouschek, A. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 830
112. Erales, J.; Coffino, P. Biochim. Biophys. Acta 2014, 1843, 216
113. Hegyi, H.; Tompa, P. PLoS Comput. Biol. 2008, 4, e1000017
114. Gsponer, J.; Futschik, M. E.; Teichmann, S. A.; Babu, M. M. Science 2008, 322, 1365
115. Vavouri, T.; Semple, J. I.; Garcia-Verdugo, R.; Lehner, B. Cell 2009, 138, 198
116. Babu, M. M.; van der Lee, R.; de Groot, N. S.; Gsponer, J. Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 432
117. Suskiewicz, M. J.; Sussman, J. L.; Silman, I.; Shaul, Y. Protein Sci. 2011, 20, 1285
118. Simister, P. C.; Schaper, F.; OReilly, N.; McGowan, S.; Feller, S. M. PLoS Biol. 2011, 9, e1000591
119. Uversky, V. N.; Oldfield, C. J.; Dunker, A. K. J. Mol. Recognit. 2005, 18, 343
120. Uversky, V. N. Biochim. Biophys. Acta 2013, 1834, 932
121. Obradovic, Z.; Peng, K.; Vucetic, S.; Radivojac, P.; Brown, C. J.; Dunker, A. K. Proteins 2003, 53 (Suppl. 6) 566
122. Le Gall, T.; Romero, P. R.; Cortese, M. S.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. J. Biomol. Struct. Dyn. 2007, 24, 325
123. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2005, 6, 197
124. Mao, A. H.; Crick, S. L.; Vitalis, A.; Chicoine, C. L.; Pappu, R. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 8183
125. Das, R. K.; Pappu, R. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 13392
126. Tcherkasskaya, O.; Uversky, V. N. Protein Pept. Lett. 2003, 10, 239
127. Marsh, J. A.; Forman-Kay, J. D. Biophys. J. 2010, 98, 2383
128. Meng, W.; Lyle, N.; Luan, B.; Raleigh, D. P.; Pappu, R. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 2123
129. Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Biochim. Biophys. Acta 2010, 1804, 1231
130. Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Anal. Chem. 2012, 84, 2096
131. Fasman, G. D. Circular Dichroism and Conformational Analysis of Biomolecules; Plenum Press: New York, 1996.
132. Li, P.; Banjade, S.; Cheng, H. C.; Kim, S.; Chen, B.; Guo, L.; Llaguno, M.; Hollingsworth, J. V.; King, D. S.; Banani, S. F.; Russo, P. S.; Jiang, Q. X.; Nixon, B. T.; Rosen, M. K. Nature 2012, 483, 336
133. Tompa, P. Intrinsically Disord. Proteins 2013, 1, e24068
134. Bernado, P.; Bertoncini, C. W.; Griesinger, C.; Zweckstetter, M.; Blackledge, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17968
135. Bernado, P.; Mylonas, E.; Petoukhov, M. V.; Blackledge, M.; Svergun, D. I. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 5656
136. Schneider, R.; Huang, J. R.; Yao, M.; Communie, G.; Ozenne, V.; Mollica, L.; Salmon, L.; Jensen, M. R.; Blackledge, M. Mol. Biosyst. 2012, 8, 58
137. Huang, J. R.; Grzesiek, S. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 694
138. Ozenne, V.; Bauer, F.; Salmon, L.; Huang, J. R.; Jensen, M. R.; Segard, S.; Bernado, P.; Charavay, C.; Blackledge, M. Bioinformatics 2012, 28, 1463
139. Bernado, P.; Svergun, D. I. Mol. Biosyst. 2012, 8, 151
140. Feldman, H. J.; Hogue, C. W. Proteins 2000, 39, 112
141. Feldman, H. J.; Hogue, C. W. Proteins 2002, 46, 8
142. Eyal, E.; Najmanovich, R.; McConkey, B. J.; Edelman, M.; Sobolev, V. J. Comput. Chem. 2004, 25, 712
143. Canutescu, A. A.; Shelenkov, A. A.; Dunbrack, R. L., Jr. Protein Sci. 2003, 12, 2001
144. Svergun, D. I.; Baraberato, C.; Koch, M. H. J. Appl. Crystallogr. 1995, 28, 768
145. Shen, Y.; Bax, A. J. Biomol. NMR 2007, 38, 289
146. Daughdrill, G. W.; Kashtanov, S.; Stancik, A.; Hill, S. E.; Helms, G.; Muschol, M.; Receveur-Brechot, V.; Ytreberg, F. M. Mol. Biosyst. 2012, 8, 308
147. Schwalbe, M.; Ozenne, V.; Bibow, S.; Jaremko, M.; Jaremko, L.; Gajda, M.; Jensen, M. R.; Biernat, J.; Becker, S.; Mandelkow, E.; Zweckstetter, M.; Blackledge, M. Structure 2014, 22, 238
148. Varadi, M.; Kosol, S.; Lebrun, P.; Valentini, E.; Blackledge, M.; Dunker, A. K.; Felli, I. C.; Forman-Kay, J. D.; Kriwacki, R. W.; Pierattelli, R.; Sussman, J.; Svergun, D. I.; Uversky, V. N.; Vendruscolo, M.; Wishart, D.; Wright, P. E.; Tompa, P. Nucleic Acids Res. 2014, 42, D326
149. Tompa, P. Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 419
150. Tran, H. T.; Mao, A.; Pappu, R. V. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 7380
151. Szollosi, E.; Bokor, M.; Bodor, A.; Perczel, A.; Klement, E.; Medzihradszky, K. F.; Tompa, K.; Tompa, P. J. Proteome Res. 2008, 7, 2291
152. Müller-Späth, S.; Soranno, A.; Hirschfeld, V.; Hofmann, H.; Rüegger, S.; Reymond, L.; Nettels, D.; Schuler, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 14609
153. Soranno, A.; Buchli, B.; Nettels, D.; Cheng, R. R.; Muller-Spath, S.; Pfeil, S. H.; Hoffmann, A.; Lipman, E. A.; Makarov, D. E.; Schuler, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 17800
154. Brocca, S.; Samalikova, M.; Uversky, V. N.; Lotti, M.; Vanoni, M.; Alberghina, L.; Grandori, R. Proteins 2009, 76, 731
155. Li, J.; Uversky, V. N.; Fink, A. L. Biochemistry 2001, 40, 11604
156. Uversky, V. N.; Li, J.; Souillac, P.; Jakes, R.; Goedert, M.; Fink, A. L. J. Biol. Chem. 2002, 25, 25
157. Guo, J. T.; Jaromczyk, J. W.; Xu, Y. Proteins 2007, 67, 548
158. Zhang, Y.; Stec, B.; Godzik, A. Structure 2007, 15, 1141
159. Hazy, E.; Tompa, P. ChemPhysChem 2009, 10, 1415
160. Uversky, V. N. Biochim. Biophys. Acta 2011, 1814, 693
161. Dunker, A. K.; Brown, C. J.; Lawson, J. D.; Iakoucheva, L. M.; Obradovic, Z. Biochemistry 2002, 41, 6573
162. Mukhopadhyay, R.; Hoh, J. H. FEBS Lett. 2001, 505, 374
163. Patel, S. S.; Belmont, B. J.; Sante, J. M.; Rexach, M. F. Cell 2007, 129, 83
164. Kriwacki, R. W.; Hengst, L.; Tennant, L.; Reed, S. I.; Wright, P. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 11504
165. Russo, A. A.; Jeffrey, P. D.; Patten, A. K.; Massague, J.; Pavletich, N. P. Nature 1996, 382, 325
166. Daughdrill, G. W.; Chadsey, M. S.; Karlinsey, J. E.; Hughes, K. T.; Dahlquist, F. W. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 285
167. Peti, W.; Nairn, A. C.; Page, R. FEBS J. 2013, 280, 596
168. Peti, W.; Nairn, A. C.; Page, R. Curr. Phys. Chem. 2012, 2, 107
169. Tompa, P.; Szasz, C.; Buday, L. Trends Biochem. Sci. 2005, 30, 484
170. Lu, Y.; Bennick, A. Arch. Oral Biol. 1998, 43, 717
171. Kalmar, L.; Homola, D.; Varga, G.; Tompa, P. Bone 2012, 51, 528
172. Toth-Petroczy, A.; Oldfield, C. J.; Simon, I.; Takagi, Y.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N.; Fuxreiter, M. PLoS Comput. Biol. 2008, 4, e1000243
173. Cortese, M. S.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Prog. Biophys. Mol. Biol. 2008, 98, 85
174. Balazs, A.; Csizmok, V.; Buday, L.; Rakacs, M.; Kiss, R.; Bokor, M.; Udupa, R.; Tompa, K.; Tompa, P. FEBS J. 2009, 276, 3744
175. Dosztanyi, Z.; Chen, J.; Dunker, A. K.; Simon, I.; Tompa, P. J. Proteome Res. 2006, 5, 2985
176. Haynes, C.; Oldfield, C. J.; Ji, F.; Klitgord, N.; Cusick, M. E.; Radivojac, P.; Uversky, V. N.; Vidal, M.; Iakoucheva, L. M. PLoS Comput. Biol. 2006, 2, e100
177. Dunker, A. K.; Cortese, M. S.; Romero, P.; Iakoucheva, L. M.; Uversky, V. N. FEBS J. 2005, 272, 5129
178. Barbar, E. Biochemistry 2008, 47, 503
179. Iakoucheva, L. M.; Radivojac, P.; Brown, C. J.; OConnor, T. R.; Sikes, J. G.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. Nucleic Acids Res. 2004, 32, 1037
180. Radivojac, P.; Vacic, V.; Haynes, C.; Cocklin, R. R.; Mohan, A.; Heyen, J. W.; Goebl, M. G.; Iakoucheva, L. M. Proteins 2010, 78, 365
181. Tompa, P.; Csermely, P. FASEB J. 2004, 18, 1169
182. Kim, T. D.; Paik, S. R.; Yang, C. H. Biochemistry 2002, 41, 13782
183. Bhattacharyya, J.; Das, K. P. J. Biol. Chem. 1999, 274, 15505
184. Chakrabortee, S.; Boschetti, C.; Walton, L. J.; Sarkar, S.; Rubinsztein, D. C.; Tunnacliffe, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 18073
185. Kovacs, D.; Kalmar, E.; Torok, Z.; Tompa, P. Plant Physiol. 2008, 147, 381
186. Andley, U. P.; Mathur, S.; Griest, T. A.; Petrash, J. M. J. Biol. Chem. 1996, 271, 31973
187. Pasta, S. Y.; Raman, B.; Ramakrishna, T.; Rao, Ch. M. J. Biol. Chem. 2002, 277, 45821
188. Santner, A. A.; Croy, C. H.; Vasanwala, F. H.; Uversky, V. N.; Van, Y. Y.; Dunker, A. K. Biochemistry 2012, 51, 7250
189. Reichmann, D.; Xu, Y.; Cremers, C. M.; Ilbert, M.; Mittelman, R.; Fitzgerald, M. C.; Jakob, U. Cell 2012, 148, 947
190. Neduva, V.; Linding, R.; Su-Angrand, I.; Stark, A.; Masi, F. D.; Gibson, T. J.; Lewis, J.; Serrano, L.; Russell, R. B. PLoS Biol. 2005, 3, e405
191. Fuxreiter, M.; Tompa, P.; Simon, I. Bioinformatics 2007, 23, 950
192. Oldfield, C. J.; Cheng, Y.; Cortese, M. S.; Romero, P.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Biochemistry 2005, 44, 12454
193. Neduva, V.; Russell, R. B. FEBS Lett. 2005, 579, 3342
194. Fuxreiter, M.; Simon, I.; Friedrich, P.; Tompa, P. J. Mol. Biol. 2004, 338, 1015
195. Lee, S. H.; Kim, D. H.; Han, J. J.; Cha, E. J.; Lim, J. E.; Cho, Y. J.; Lee, C.; Han, K. H. Curr. Protein Pept. Sci. 2012, 13, 34
196. Fuxreiter, M. Mol. Biosyst. 2012, 8, 168
197. Mohan, A.; Oldfield, C. J.; Radivojac, P.; Vacic, V.; Cortese, M. S.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. J. Mol. Biol. 2006, 362, 1043
198. Vacic, V.; Oldfield, C. J.; Mohan, A.; Radivojac, P.; Cortese, M. S.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. J. Proteome Res. 2007, 6, 2351
199. Puntervoll, P.; Linding, R.; Gemund, C.; Chabanis-Davidson, S.; Mattingsdal, M.; Cameron, S.; Martin, D. M.; Ausiello, G.; Brannetti, B.; Costantini, A.; Ferre, F.; Maselli, V.; Via, A.; Cesareni, G.; Diella, F.; Superti-Furga, G.; Wyrwicz, L.; Ramu, C.; McGuigan, C.; Gudavalli, R.; Letunic, I.; Bork, P.; Rychlewski, L.; Kuster, B.; Helmer-Citterich, M.; Hunter, W. N.; Aasland, R.; Gibson, T. J. Nucleic Acids Res. 2003, 31, 3625
200. Davey, N. E.; Shields, D. C.; Edwards, R. J. Nucleic Acids Res. 2006, 34, 3546
201. Fuxreiter, M.; Tompa, P. Fuzziness: Structural Disorder in Protein Complexes; Springer Science + Business Media, LLC Landes Bioscience: New York, 2012.
202. Dyson, H. J.; Wright, P. E. Curr. Opin. Struct. Biol. 2002, 12, 54
203. Tompa, P.; Fuxreiter, M.; Oldfield, C. J.; Simon, I.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. Bioessays 2009, 31, 328
204. Chen, J. W.; Romero, P.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. J. Proteome Res. 2006, 5, 888
205. Chen, J. W.; Romero, P.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. J. Proteome Res. 2006, 5, 879
206. Xue, B.; Brown, C. J.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. Biochim. Biophys. Acta 2013, 1834, 725
207. Dosztanyi, Z.; Meszaros, B.; Simon, I. Bioinformatics 2009, 25, 2745
208. Cilia, E.; Pancsa, R.; Tompa, P.; Lenaerts, T.; Vranken, W. F. Nat. Commun. 2013, 4, 2741
209. Meszaros, B.; Simon, I.; Dosztanyi, Z. PLoS Comput. Biol. 2009, 5, e1000376
210. Hammes, G. G.; Chang, Y. C.; Oas, T. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 13737
211. Wang, Y.; Tang, C.; Wang, E.; Wang, J. PLoS Comput. Biol. 2012, 8, e1002471
212. Wright, P. E.; Dyson, H. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 2009, 19, 31
213. Oldfield, C. J.; Meng, J.; Yang, J. Y.; Yang, M. Q.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. BMC Genomics 2008, 9 (Suppl. 1) S1
214. Pancsa, R.; Fuxreiter, M. IUBMB Life 2012, 64, 513
215. Tsai, C. D.; Ma, B.; Kumar, S.; Wolfson, H.; Nussinov, R. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2001, 36, 399
216. Tsai, C. J.; Ma, B.; Sham, Y. Y.; Kumar, S.; Nussinov, R. Proteins 2001, 44, 418
217. Fersht, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 17327
218. Fersht, A. R.; Sato, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 7976
219. Kiefhaber, T.; Bachmann, A.; Jensen, K. S. Curr. Opin. Struct. Biol. 2012, 22, 21
220. Rogers, J. M.; Steward, A.; Clarke, J. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 1415
221. Shammas, S. L.; Travis, A. J.; Clarke, J. J. Phys. Chem. B 2013, 117, 13346
222. Giri, R.; Morrone, A.; Toto, A.; Brunori, M.; Gianni, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 14942
223. Huang, Y.; Liu, Z. J. Mol. Biol. 2009, 393, 1143
224. Shoemaker, B. A.; Portman, J. J.; Wolynes, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 8868
225. Csizmok, V.; Bokor, M.; Banki, P.; Klement, E.; Medzihradszky, K. F.; Friedrich, P.; Tompa, K.; Tompa, P. Biochemistry 2005, 44, 3955
226. Espinoza-Fonseca, L. M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009, 382, 479
227. Radhakrishnan, I.; Perez-Alvarado, G. C.; Parker, D.; Dyson, H. J.; Montminy, M. R.; Wright, P. E. Cell 1997, 91, 741
228. Sugase, K.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Nature 2007, 447, 1021
229. Savvides, S. N.; Raghunathan, S.; Futterer, K.; Kozlov, A. G.; Lohman, T. M.; Waksman, G. Protein Sci. 2004, 13, 1942
230. Sigalov, A. B.; Zhuravleva, A. V.; Orekhov, V. Y. Biochimie 2007, 89, 419
231. Sigalov, A. B.; Kim, W. M.; Saline, M.; Stern, L. J. Biochemistry 2008, 47, 12942
232. Communie, G.; Habchi, J.; Yabukarski, F.; Blocquel, D.; Schneider, R.; Tarbouriech, N.; Papageorgiou, N.; Ruigrok, R. W.; Jamin, M.; Jensen, M. R.; Longhi, S.; Blackledge, M. PLoS Pathog. 2013, 9, e1003631
233. Tompa, P.; Fuxreiter, M. Trends Biochem. Sci. 2008, 33, 2
234. Meszaros, B.; Tompa, P.; Simon, I.; Dosztanyi, Z. J. Mol. Biol. 2007, 372, 549
235. Lo Conte, L.; Chothia, C.; Janin, J. J. Mol. Biol. 1999, 285, 2177
236. Shammas, S. L.; Rogers, J. M.; Hill, S. A.; Clarke, J. Biophys. J. 2012, 103, 2203
237. Huang, Y.; Liu, Z. Chem. - Eur. J. 2013, 19, 4462
238. Wong, E. T.; Na, D.; Gsponer, J. PLoS Comput. Biol. 2013, 9, e1003192
239. Brown, C. J.; Johnson, A. K.; Dunker, A. K.; Daughdrill, G. W. Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 441
240. Davey, N. E.; Cowan, J. L.; Shields, D. C.; Gibson, T. J.; Coldwell, M. J.; Edwards, R. J. Nucleic Acids Res. 2012, 40, 10628
241. Espinoza-Fonseca, L. M. Mol. Biosyst. 2012, 8, 237
242. Fuxreiter, M.; Tompa, P. Trends Biochem. Sci. 2009, 34, 3
243. Polverini, E.; Rangaraj, G.; Libich, D. S.; Boggs, J. M.; Harauz, G. Biochemistry 2008, 47, 267
244. Walsh, C. T.; Garneau-Tsodikova, S.; Gatto, G. J., Jr. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 7342
245. Witze, E. S.; Old, W. M.; Resing, K. A.; Ahn, N. G. Nat. Methods 2007, 4, 798
246. Yang, X. J. Oncogene 2005, 24, 1653
247. Faradonbeh, M. Z.; Gharechahi, J.; Mollamohammadi, S.; Pakzad, M.; Taei, A.; Rassouli, H.; Baharvand, H.; Salekdeh, G. H. Mol. Biosyst. 2012, 8, 1833
248. Mersfelder, E. L.; Parthun, M. R. Nucleic Acids Res. 2006, 34, 2653
249. Xie, H.; Vucetic, S.; Iakoucheva, L. M.; Oldfield, C. J.; Dunker, A. K.; Obradovic, Z.; Uversky, V. N. J. Proteome Res. 2007, 6, 1917
250. Dunker, A. K.; Brown, C. J.; Obradovic, Z. Adv. Protein Chem. 2002, 62, 25
251. Xie, H.; Vucetic, S.; Iakoucheva, L. M.; Oldfield, C. J.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N.; Obradovic, Z. J. Proteome Res. 2007, 6, 1882
252. Uversky, V. N. Curr. Pharm. Des. 2013, 19, 4191
253. Sambrook, J. Nature 1977, 268, 101
254. Black, D. L. Annu. Rev. Biochem. 2003, 72, 291
255. Boue, S.; Letunic, I.; Bork, P. Bioessays 2003, 25, 1031
256. Ast, G. Nat. Rev. Genet. 2004, 5, 773
257. Kelemen, O.; Convertini, P.; Zhang, Z.; Wen, Y.; Shen, M.; Falaleeva, M.; Stamm, S. Gene 2013, 514, 1
258. Stamm, S.; Ben-Ari, S.; Rafalska, I.; Tang, Y.; Zhang, Z.; Toiber, D.; Thanaraj, T. A.; Soreq, H. Gene 2005, 344, 1
259. Brett, D.; Hanke, J.; Lehmann, G.; Haase, S.; Delbruck, S.; Krueger, S.; Reich, J.; Bork, P. FEBS Lett. 2000, 474, 83
260. Johnson, J. M.; Castle, J.; Garrett-Engele, P.; Kan, Z.; Loerch, P. M.; Armour, C. D.; Santos, R.; Schadt, E. E.; Stoughton, R.; Shoemaker, D. D. Science 2003, 302, 2141
261. Graveley, B. R. Trends Genet. 2001, 17, 100
262. Minneman, K. P. Mol. Interventions 2001, 1, 108
263. Thai, T. H.; Kearney, J. F. J. Immunol. 2004, 173, 4009
264. Thai, T. H.; Kearney, J. F. Adv. Immunol. 2005, 86, 113
265. Scheper, W.; Zwart, R.; Baas, F. Neurogenetics 2004, 5, 223
266. Romero, P. R.; Zaidi, S.; Fang, Y. Y.; Uversky, V. N.; Radivojac, P.; Oldfield, C. J.; Cortese, M. S.; Sickmeier, M.; LeGall, T.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 8390
267. Buljan, M.; Chalancon, G.; Dunker, A. K.; Bateman, A.; Balaji, S.; Fuxreiter, M.; Babu, M. M. Curr. Opin. Struct. Biol. 2013, 23, 443
268. Liu, S.; Cheng, C. Wiley Interdiscip. Rev.: RNA 2013, 4, 547
269. Skotheim, R. I.; Nees, M. Int. J. Biochem. Cell Biol. 2007, 39, 1432
270. Fu, R. H.; Liu, S. P.; Huang, S. J.; Chen, H. J.; Chen, P. R.; Lin, Y. H.; Ho, Y. C.; Chang, W. L.; Tsai, C. H.; Shyu, W. C.; Lin, S. Z. Cell Transplant. 2013, 22, 653
271. Niblock, M.; Gallo, J. M. Biochem. Soc. Trans. 2012, 40, 677
272. Mills, J. D.; Janitz, M. Neurobiol. Aging 2012, 33, 1012.e11
273. Lara-Pezzi, E.; Gomez-Salinero, J.; Gatto, A.; Garcia-Pavia, P. J. Cardiovasc. Transl. Res. 2013, 6, 945
274. Venables, J. P.; Burn, J. Nucleic Acids Res. 2006, 34, e103
275. Hastings, M. L.; Resta, N.; Traum, D.; Stella, A.; Guanti, G.; Krainer, A. R. Nat. Struct. Mol. Biol. 2005, 12, 54
276. Orban, T. I.; Olah, E. Mol. Pathol. 2003, 56, 191
277. Uversky, V. N. Front. Biosci., Landmark Ed. 2009, 14, 5188
278. Koshland, D. E., Jr.; Nemethy, G.; Filmer, D. Biochemistry 1966, 5, 365
279. Monod, J.; Wyman, J.; Changeux, J. P. J. Mol. Biol. 1965, 12, 88
280. Hilser, V. J.; Thompson, E. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 8311
281. Hilser, V. J.; Wrabl, J. O.; Motlagh, H. N. Annu. Rev. Biophys. 2012, 41, 585
282. Garcia-Pino, A.; Balasubramanian, S.; Wyns, L.; Gazit, E.; De Greve, H.; Magnuson, R. D.; Charlier, D.; van Nuland, N. A.; Loris, R. Cell 2010, 142, 101
283. Motlagh, H. N.; Hilser, V. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 4134
284. Follis, A. V.; Chipuk, J. E.; Fisher, J. C.; Yun, M. K.; Grace, C. R.; Nourse, A.; Baran, K.; Ou, L.; Min, L.; White, S. W.; Green, D. R.; Kriwacki, R. W. Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 163
285. Gruet, A.; Dosnon, M.; Vassena, A.; Lombard, V.; Gerlier, D.; Bignon, C.; Longhi, S. J. Mol. Biol. 2013, 425, 3495
286. Tompa, P. Bioessays 2003, 25, 847
287. Kato, M.; Han, T. W.; Xie, S.; Shi, K.; Du, X.; Wu, L. C.; Mirzaei, H.; Goldsmith, E. J.; Longgood, J.; Pei, J.; Grishin, N. V.; Frantz, D. E.; Schneider, J. W.; Chen, S.; Li, L.; Sawaya, M. R.; Eisenberg, D.; Tycko, R.; McKnight, S. L. Cell 2012, 149, 753
288. Beck, R.; Deek, J.; Safinya, C. R. Biochem. Soc. Trans. 2012, 40, 1027
289. Ward, J. J.; Sodhi, J. S.; McGuffin, L. J.; Buxton, B. F.; Jones, D. T. J. Mol. Biol. 2004, 337, 635
290. Schad, E.; Tompa, P.; Hegyi, H. Genome Biol. 2011, 12, R120
291. Tompa, P.; Dosztanyi, Z.; Simon, I. J. Proteome Res. 2006, 5, 1996
292. Burra, P. V.; Kalmar, L.; Tompa, P. PLoS One 2010, 5, e12069
293. Pancsa, R.; Tompa, P. PLoS One 2012, 7, e34687
294. Davey, N. E.; Trave, G.; Gibson, T. J. Trends Biochem. Sci. 2011, 36, 159
295. Tokuriki, N.; Oldfield, C. J.; Uversky, V. N.; Berezovsky, I. N.; Tawfik, D. S. Trends Biochem. Sci. 2009, 34, 53
296. Jordan, I. K.; Sutter, B. A.; McClure, M. A. Mol. Biol. Evol. 2000, 17, 75
297. Narechania, A.; Terai, M.; Burk, R. D. J. Gen. Virol. 2005, 86, 1307
298. Rancurel, C.; Khosravi, M.; Dunker, K. A.; Romero, P. R.; Karlin, D. J. Virol. 2009, 83, 10719
299. Bourhis, J. M.; Canard, B.; Longhi, S. Virology 2006, 344, 94
300. Longhi, S. Protein Pept. Lett. 2010, 17, 930
301. Longhi, S.; Oglesbee, M. Protein Pept. Lett. 2010, 17, 961
302. Habchi, J.; Longhi, S. Mol. Biosyst. 2012, 8, 69
303. Karlin, D.; Longhi, S.; Receveur, V.; Canard, B. Virology 2002, 296, 251
304. Longhi, S.; Receveur-Brechot, V.; Karlin, D.; Johansson, K.; Darbon, H.; Bhella, D.; Yeo, R.; Finet, S.; Canard, B. J. Biol. Chem. 2003, 278, 18638
305. Karlin, D.; Ferron, F.; Canard, B.; Longhi, S. J. Gen. Virol. 2003, 84, 3239
306. Xue, B.; Williams, R. W.; Oldfield, C. J.; Goh, G. K.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. Protein Pept. Lett. 2010, 17, 932
307. Uversky, V. N.; Longhi, S. Flexible Viruses: Structural Disorder in Viral Proteins; Uversky, V. N.; Longhi, S., Eds.; John Wiley & Sons: Hoboken, NJ, 2012.
308. Alves, C.; Cunha, C. Future Virol. 2012, 7, 1183
309. Xue, B.; Dunker, A. K.; Uversky, V. N. J. Biomol. Struct. Dyn. 2012, 30, 137
310. Galea, C. A.; High, A. A.; Obenauer, J. C.; Mishra, A.; Park, C. G.; Punta, M.; Schlessinger, A.; Ma, J.; Rost, B.; Slaughter, C. A.; Kriwacki, R. W. J. Proteome Res. 2009, 8, 211
311. Tompa, P. Trends Biochem. Sci. 2012, 37, 509
312. Dunker, A. K.; Obradovic, Z.; Romero, P.; Garner, E. C.; Brown, C. J. Genome Inf. 2000, 11, 161
313. Galea, C. A.; Wang, Y.; Sivakolundu, S. G.; Kriwacki, R. W. Biochemistry 2008, 47, 7598
314. Huber, A. H.; Stewart, D. B.; Laurents, D. V.; Nelson, W. J.; Weis, W. I. J. Biol. Chem. 2001, 276, 12301
315. Paunola, E.; Mattila, P. K.; Lappalainen, P. FEBS Lett. 2002, 513, 92
316. Iakoucheva, L. M.; Brown, C. J.; Lawson, J. D.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. J. Mol. Biol. 2002, 323, 573
317. Brown, C. J.; Takayama, S.; Campen, A. M.; Vise, P.; Marshall, T. W.; Oldfield, C. J.; Williams, C. J.; Dunker, A. K. J. Mol. Evol. 2002, 55, 104
318. Bellay, J.; Han, S.; Michaut, M.; Kim, T.; Costanzo, M.; Andrews, B. J.; Boone, C.; Bader, G. D.; Myers, C. L.; Kim, P. M. Genome Biol. 2011, 12, R14
319. Tokuriki, N.; Tawfik, D. S. Science 2009, 324, 203
320. Tokuriki, N.; Stricher, F.; Serrano, L.; Tawfik, D. S. PLoS Comput. Biol. 2008, 4, e1000002
321. Olson, K. E.; Narayanaswami, P.; Vise, P. D.; Lowry, D. F.; Wold, M. S.; Daughdrill, G. W. J. Biomol. Struct. Dyn. 2005, 23, 113
322. Chen, S. C.; Chen, F. C.; Li, W. H. Mol. Biol. Evol. 2010, 27, 2548
323. Uversky, V. N.; Oldfield, C. J.; Dunker, A. K. Annu. Rev. Biophys. 2008, 37, 215
324. Uversky, V. N. Curr. Alzheimer Res. 2008, 5, 260
325. Ribeiro-Silva, C.; Gilberto, S.; Gomes, R. A.; Mateus, L.; Monteiro, E.; Barroso, E.; Coelho, A. V.; da Costa, G. A.; Freire, A. P.; Cordeiro, C. Amyloid 2011, 18, 191
326. Chiti, F.; Dobson, C. M. Annu. Rev. Biochem. 2006, 75, 333
327. Uversky, V. N.; Oldfield, C. J.; Midic, U.; Xie, H.; Xue, B.; Vucetic, S.; Iakoucheva, L. M.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. BMC Genomics 2009, 10 (Suppl. 1) S7
328. Cheng, Y.; Legall, T.; Oldfield, C. J.; Mueller, J. P.; Van, Y. Y.; Romero, P.; Cortese, M. S.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Trends Biotechnol. 2006, 24, 435
329. Vassilev, L. T. Cell Cycle 2004, 3, 419
330. Vassilev, L. T.; Vu, B. T.; Graves, B.; Carvajal, D.; Podlaski, F.; Filipovic, Z.; Kong, N.; Kammlott, U.; Lukacs, C.; Klein, C.; Fotouhi, N.; Liu, E. A. Science 2004, 303, 844
331. Metallo, S. J. Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 481
332. Sung, Y. H.; Eliezer, D. J. Mol. Biol. 2007, 372, 689
333. Uversky, V. N. Cell. Mol. Life Sci. 2003, 60, 1852