Nucleic acid aptamers in cancer research, diagnosis and therapy

Chemical Society Reviews

Volumn 44, Issue 5, 2015, Pages 1240-1256

  Ma, Haitao ^a   Liu, Jinping ^b   Ali, M Monsur ^c   Mahmood, M Arif Iftakher ^d   Labanieh, Louai ^c   Lu, Mengrou ^c   Iqbal, Samir M ^d   Zhang, Qun ^e,f   Zhao, Weian ^c   Wan, Yuan ^e,f  

^a THE FIRST AFFILIATED HOSPITAL OF SOOCHOW UNIVERSITY   (China)

^b SICHUAN PROVINCIAL PEOPLE'S HOSPITAL   (China)

^c UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^d The University of Texas at Arlington   (United States)

^e PMR Institute   (China)

^f PerMed Biomedical Co Ltd   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTINEOPLASTIC AGENT; APTAMER; BIOLOGICAL MARKER;

CHEMISTRY; DRUG DESIGN; HUMAN; NEOPLASMS;

ANTINEOPLASTIC AGENTS; APTAMERS, NUCLEOTIDE; BIOLOGICAL MARKERS; DRUG DESIGN; HUMANS; NEOPLASMS;

EID: 84923674023     PISSN: 03060012     EISSN: 14604744     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4cs00357h     Document Type: Review

References (296)

1. S. J. Curry, T. Byers and M. Hewitt, Fulfilling the potential for cancer prevention and early detection, National Academies Press, 2003
2. D. Zichi B. Eaton B. Singer L. Gold Curr. Opin. Chem. Biol. 2008 12 78 85
3. P. Chames M. Van Regenmortel E. Weiss D. Baty Br. J. Pharmacol. 2009 157 220 233
4. S. Shigdar L. Qiao S.-F. Zhou D. Xiang T. Wang Y. Li L. Y. Lim L. Kong L. Li W. Duan Cancer Lett. 2013 330 84 95
5. B. J. Hicke A. W. Stephens T. Gould Y.-F. Chang C. K. Lynott J. Heil S. Borkowski C.-S. Hilger G. Cook S. Warren P. G. Schmidt J. Nucl. Med. 2006 47 668 678
6. G. P. Adams R. Schier A. M. McCall H. H. Simmons E. M. Horak R. K. Alpaugh J. D. Marks L. M. Weiner Cancer Res. 2001 61 4750 4755
7. A. Flemming Nat. Rev. Drug Discovery 2014 13 178
8. P. Bouchard R. Hutabarat K. Thompson Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2010 50 237 257
9. A. D. Keefe S. Pai A. Ellington Nat. Rev. Drug Discovery 2010 9 537 550
10. E. N. Brody L. Gold Rev. Mol. Biotechnol. 2000 74 5 13
11. S. D. Jayasena Clin. Chem. 1999 45 1628 1650
12. H. Hong S. Goel Y. Zhang W. Cai Curr. Med. Chem. 2011 18 4195
13. D. Proske M. Blank R. Buhmann A. Resch Appl. Microbiol. Biotechnol. 2005 69 367 374
14. E. J. Cho J.-W. Lee A. D. Ellington Annu. Rev. Anal. Chem. 2009 2 241 264
15. C. Tuerk L. Gold Science 1990 249 505 510
16. A. D. Ellington J. W. Szostak Nature 1990 346 818 822
17. R. Stoltenburg C. Reinemann B. Strehlitz Biomol. Eng. 2007 24 381 403
18. F. Radom P. Jurek M. Mazurek J. Otlewski F. Jeleń Biotechnol. Adv. 2013 31 1260 1274
19. G. Aquino-Jarquin J. D. Toscano-Garibay Int. J. Mol. Sci. 2011 12 9155 9171
20. D. H. Bunka O. Platonova P. G. Stockley Curr. Opin. Pharmacol. 2010 10 557 562
21. G. Mayer Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 2672 2689
22. S. M. Nimjee C. P. Rusconi B. A. Sullenger Annu. Rev. Med. 2005 56 555 583
23. S. Song L. Wang J. Li C. Fan J. Zhao TrAC, Trends Anal. Chem. 2008 27 108 117
24. J. C. Cox P. Rudolph A. D. Ellington Biotechnol. Prog. 1998 14 845 850
25. J. C. Cox A. D. Ellington Bioorg. Med. Chem. 2001 9 2525 2531
26. C. K. O'Sullivan Anal. Bioanal. Chem. 2002 372 44 48
27. J. D. Vaught C. Bock J. Carter T. Fitzwater M. Otis D. Schneider J. Rolando S. Waugh S. K. Wilcox B. E. Eaton J. Am. Chem. Soc. 2010 132 4141 4151
28. P. M. E. Gramlich C. T. Wirges A. Manetto T. Carell Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 8350 8358
29. M. Kimoto R. Yamashige K.-i. Matsunaga S. Yokoyama I. Hirao Nat. Biotechnol. 2013 31 453 457
30. J. Liu Z. Cao Y. Lu Chem. Rev. 2009 109 1948 1998
31. W. Tan H. Wang Y. Chen X. Zhang H. Zhu C. Yang R. Yang C. Liu Trends Biotechnol. 2011 29 634 640
32. G. Zhu M. Ye M. J. Donovan E. Song Z. Zhao W. Tan Chem. Commun. 2012 48 10472 10480
33. W. Tan M. J. Donovan J. Jiang Chem. Rev. 2013 113 2842 2862
34. W. S. Dalton S. H. Friend Science 2006 312 1165 1168
35. R. Aebersold L. Anderson R. Caprioli B. Druker L. Hartwell R. Smith J. Proteome Res. 2005 4 1104 1109
36. N. Rifai M. A. Gillette S. A. Carr Nat. Biotechnol. 2006 24 971 983
37. P. Mallick B. Kuster Nat. Biotechnol. 2010 28 695 709
38. K. K. Jain, The Handbook of Biomarkers, Springer, 2010, pp. 23-72
39. V. Kulasingam E. P. Diamandis Nat. Clin. Pract. Oncol. 2008 5 588 599
40. L. E. Hood G. S. Omenn R. L. Moritz R. Aebersold K. R. Yamamoto M. Amos J. Hunter-Cevera L. Locascio P. Workshop Proteomics 2012 12 2773 2783
41. D. W. Drolet L. Moon-McDermott T. S. Romig Nat. Biotechnol. 1996 14 1021 1025
42. S. Jeong I. Rhee Paeng Sci. World J. 2012 2012 10
43. L. Barthelmebs J. Jonca A. Hayat B. Prieto-Simon J.-L. Marty Food Control 2011 22 737 743
44. G. S. Sittampalam S. D. Kahl W. P. Janzen Curr. Opin. Chem. Biol. 1997 1 384 391
45. P. Ray K. L. Rialon-Guevara E. Veras B. A. Sullenger R. R. White J. Clin. Invest. 2012 122 1734
46. J. O. McNamara E. R. Andrechek Y. Wang K. D. Viles R. E. Rempel E. Gilboa B. A. Sullenger P. H. Giangrande Nat. Biotechnol. 2006 24 1005 1015
47. B. J. Hicke S. R. Watson A. Koenig C. K. Lynott R. F. Bargatze Y.-F. Chang S. Ringquist L. Moon-McDermott S. Jennings T. Fitzwater J. Clin. Invest. 1996 98 2688
48. C.-h. B. Chen G. A. Chernis V. Q. Hoang R. Landgraf Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 9226 9231
49. J. A. Phillips D. Lopez-Colon Z. Zhu Y. Xu W. Tan Anal. Chim. Acta 2008 621 101 108
50. D. Shangguan Y. Li Z. Tang Z. C. Cao H. W. Chen P. Mallikaratchy K. Sefah C. J. Yang W. Tan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 11838 11843
51. Z. Tang D. Shangguan K. Wang H. Shi K. Sefah P. Mallikratchy H. W. Chen Y. Li W. Tan Anal. Chem. 2007 79 4900 4907
52. K. Sefah Z. Tang D. Shangguan H. Chen D. Lopez-Colon Y. Li P. Parekh J. Martin L. Meng J. Phillips Leukemia 2009 23 235 244
53. D. Shangguan L. Meng Z. C. Cao Z. Xiao X. Fang Y. Li D. Cardona R. P. Witek C. Liu W. Tan Anal. Chem. 2008 80 721 728
54. H. W. Chen C. D. Medley K. Sefah D. Shangguan Z. Tang L. Meng J. E. Smith W. Tan ChemMedChem 2008 3 991 1001
55. Z. Zhao L. Xu X. Shi W. Tan X. Fang D. Shangguan Analyst 2009 134 1808 1814
56. T. Kunii S.-i. Ogura M. Mie E. Kobatake Analyst 2011 136 1310 1312
57. L. Cerchia C. L. Esposito A. H. Jacobs B. Tavitian V. de Franciscis PLoS One 2009 4 e7971
58. A. T. Bayrac K. Sefah P. Parekh C. Bayrac B. Gulbakan H. A. Oktem W. Tan ACS Chem. Neurosci. 2011 2 175 181
59. K. Sefah L. Meng D. Lopez-Colon E. Jimenez C. Liu W. Tan PLoS One 2010 5 e14269
60. D. Van Simaeys D. López-Colón K. Sefah R. Sutphen E. Jimenez W. Tan PLoS One 2010 5 e13770
61. K. Ninomiya K. Kaneda S. Kawashima Y. Miyachi C. Ogino N. Shimizu Bioorg. Med. Chem. Lett. 2013 23 1797 1802
62. D. A. Daniels H. Chen B. J. Hicke K. M. Swiderek L. Gold Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 15416 15421
63. P. Mallikaratchy Z. Tang S. Kwame L. Meng D. Shangguan W. Tan Mol. Cell. Proteomics 2007 6 2230 2238
64. M. Blank T. Weinschenk M. Priemer H. Schluesener J. Biol. Chem. 2001 276 16464 16468
65. M. V. Berezovski M. Lechmann M. U. Musheev T. W. Mak S. N. Krylov J. Am. Chem. Soc. 2008 130 9137 9143
66. M. Ye J. Hu M. Peng J. Liu J. Liu H. Liu X. Zhao W. Tan Int. J. Mol. Sci. 2012 13 3341 3353
67. A. Cibiel D. M. Dupont F. Ducongé Pharmaceuticals 2011 4 1216 1235
68. B. J. Hicke C. Marion Y.-F. Chang T. Gould C. K. Lynott D. Parma P. G. Schmidt S. Warren J. Biol. Chem. 2001 276 48644 48654
69. M. N. Ara M. Hyodo N. Ohga K. Hida H. Harashima PLoS One 2012 7 e50174
70. S.-M. Tu, Origin of Cancers, Springer, 2010, pp. 129-136
71. J. Mi Y. Liu Z. N. Rabbani Z. Yang J. H. Urban B. A. Sullenger B. M. Clary Nat. Chem. Biol. 2009 6 22 24
72. S. Li H. Xu H. Ding Y. Huang X. Cao G. Yang J. Li Z. Xie Y. Meng X. Li Q. Zhao B. Shen N. Shao J. Pathol. 2009 218 327 336
73. Y. S. Kim, M. B. Gu, Biosensors Based on Aptamers and Enzymes, 2014, pp. 29-67
74. P. Hensley J. Biomol. Tech. 2013 24 S5
75. L. Gold D. Ayers J. Bertino C. Bock A. Bock E. N. Brody J. Carter A. B. Dalby B. E. Eaton T. Fitzwater PLoS One 2010 5 e15004
76. T. Ramaraj T. Angel E. A. Dratz A. J. Jesaitis B. Mumey Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2012 1824 520 532
77. L. Gold J. J. Walker S. K. Wilcox S. Williams New Biotechnol. 2012 29 543 549
78. R. M. Ostroff W. L. Bigbee W. Franklin L. Gold M. Mehan Y. E. Miller H. I. Pass W. N. Rom J. M. Siegfried A. Stewart PLoS One 2010 5 e15003
79. S. Kraemer J. D. Vaught C. Bock L. Gold E. Katilius T. R. Keeney N. Kim N. A. Saccomano S. K. Wilcox D. Zichi PLoS One 2011 6 e26332
80. S. A. Forbes N. Bindal S. Bamford C. Cole C. Y. Kok D. Beare M. Jia R. Shepherd K. Leung A. Menzies Nucleic Acids Res. 2011 39 D945 D950
81. E. Brody L. Gold M. Mehan R. Ostroff J. Rohloff J. Walker D. Zichi J. Mol. Biol. 2012 422 595 606
82. M. Yu S. Stott M. Toner S. Maheswaran D. A. Haber J. Cell Biol. 2011 192 373 382
83. E. Torres-Chavolla E. C. Alocilja Biosens. Bioelectron. 2009 24 3175 3182
84. A. B. Iliuk L. Hu W. A. Tao Anal. Chem. 2011 83 4440 4452
85. C. L. Hamula J. W. Guthrie H. Zhang X.-F. Li X. C. Le TrAC, Trends Anal. Chem. 2006 25 681 691
86. T. Mairal V. C. Özalp P. L. Sánchez M. Mir I. Katakis C. K. O'Sullivan Anal. Bioanal. Chem. 2008 390 989 1007
87. C. Min H. Shao M. Liong T.-J. Yoon R. Weissleder H. Lee ACS Nano 2012 6 6821 6828
88. S. Bamrungsap T. Chen M. I. Shukoor Z. Chen K. Sefah Y. Chen W. Tan ACS Nano 2012 6 3974 3981
89. C. M. Niemeyer M. Adler R. Wacker Trends Biotechnol. 2005 23 208 216
90. J. Song F. Lv G. Yang L. Liu Q. Yang S. Wang Chem. Commun. 2012 48 7465 7467
91. L. Kashefi-Kheyrabadi M. A. Mehrgardi E. Wiechec A. P. F. Turner A. Tiwari Anal. Chem. 2014 86 4956 4960
92. L. Qu J. Xu X. Tan Z. Liu L. Xu R. Peng ACS Appl. Mater. Interfaces 2014 6 7309 7315
93. H.-S. Lee K. S. Kim C.-J. Kim S. K. Hahn M.-H. Jo Biosens. Bioelectron. 2009 24 1801 1805
94. Y. Chen R. M. Corn J. Am. Chem. Soc. 2013 135 2072 2075
95. E. J. Nam E. J. Kim A. W. Wark S. Rho H. Kim H. J. Lee Analyst 2012 137 2011 2016
96. S. Liu X. Zhang W. Luo Z. Wang X. Guo M. L. Steigerwald X. Fang Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50 2496 2502
97. Y. Wan J. Tan W. Asghar Y.-t. Kim Y. Liu S. M. Iqbal J. Phys. Chem. B 2011 115 13891 13896
98. W. Zhao C. H. Cui S. Bose D. Guo C. Shen W. P. Wong K. Halvorsen O. C. Farokhzad G. S. L. Teo J. A. Phillips D. M. Dorfman R. Karnik J. M. Karp Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012 109 19626 19631
99. J. A. Phillips Y. Xu Z. Xia Z. H. Fan W. Tan Anal. Chem. 2008 81 1033 1039
100. S. Wang Y. Wan Y. Liu Nanoscale 2014 6 12482 12489
101. Y. Wan M. A. I. Mahmood N. Li P. B. Allen Y.-t. Kim R. Bachoo A. D. Ellington S. M. Iqbal Cancer 2012 118 1145 1154
102. W. Han B. A. Allio D. G. Foster M. R. King ACS Nano 2009 4 174 180
103. E. F. Krasik D. A. Hammer Biophys. J. 2004 87 2919 2930
104. W. Chen S. Weng F. Zhang S. Allen X. Li L. Bao R. H. Lam J. A. Macoska S. D. Merajver J. Fu ACS Nano 2012 7 566 575
105. L. Wang W. Asghar U. Demirci Y. Wan Nano Today 2013 8 374 387
106. J. K. Herr J. E. Smith C. D. Medley D. Shangguan W. Tan Anal. Chem. 2006 78 2918 2924
107. J. E. Smith C. D. Medley Z. Tang D. Shangguan C. Lofton W. Tan Anal. Chem. 2007 79 3075 3082
108. J. den Toonder Lab Chip 2011 11 375 377
109. U. A. Gurkan T. Anand H. Tas D. Elkan A. Akay H. O. Keles U. Demirci Lab Chip 2011 11 3979 3989
110. Q. Zheng S. M. Iqbal Y. Wan Biotechnol. Adv. 2013 31 1664 1675
111. S. Li N. Chen Z. Zhang Y. Wang Biomaterials 2013 34 460 469
112. L. Chen X. Liu B. Su J. Li L. Jiang D. Han S. Wang Adv. Mater. 2011 23 4376 4380
113. J. Zhu T. Nguyen R. Pei M. Stojanovic Q. Lin Lab Chip 2012 12 3504 3513
114. Y. Wan Y. Liu P. B. Allen W. Asghar M. A. I. Mahmood J. Tan H. Duhon Y.-t. Kim A. D. Ellington S. M. Iqbal Lab Chip 2012 12 4693 4701
115. S. M. Freier K.-H. Altmann Nucleic Acids Res. 1997 25 4429 4443
116. L. P. Walsh J. K. Anderson M. R. Baker B. Han J.-T. Hsieh Y. Lotan J. A. Cadeddu Urology 2007 70 380 384
117. Z. Zhang N. Chen S. Li M. R. Battig Y. Wang J. Am. Chem. Soc. 2012 134 15716 15719
118. S. Roche L. Tiers M. Provansal M.-T. Piva S. Lehmann Proteome Sci. 2006 4 20
119. N. L. Anderson N. G. Anderson Mol. Cell. Proteomics 2002 1 845 867
120. A. M. Sieuwerts J. Kraan J. Bolt P. van der Spoel F. Elstrodt M. Schutte J. W. M. Martens J.-W. Gratama S. Sleijfer J. A. Foekens J. Natl. Cancer Inst. 2009 101 61 66
121. S. Soundararajan W. Chen E. K. Spicer N. Courtenay-Luck D. J. Fernandes Cancer Res. 2008 68 2358 2365
122. H. K. Lee H. Y. Kwak J. Hur I. A. Kim J. S. Yang M. W. Park J. Yu S. Jeong Cancer Res. 2007 67 9315 9321
123. B. J. Hicke A. W. Stephens T. Gould Y.-F. Chang C. K. Lynott J. Heil S. Borkowski C.-S. Hilger G. Cook S. Warren J. Nucl. Med. 2006 47 668 678
124. Y. Wan Y.-t. Kim N. Li S. K. Cho R. Bachoo A. D. Ellington S. M. Iqbal Cancer Res. 2010 70 9371 9380
125. W. J. Kang J. R. Chae Y. L. Cho J. D. Lee S. Kim Small 2009 5 2519 2522
126. N. Li T. Larson H. H. Nguyen K. V. Sokolov A. D. Ellington Chem. Commun. 2010 46 392 394
127. Z. Cao W. Tan Chem.-Eur. J. 2005 11 4502 4508
128. W. Zhao S. Schafer J. Choi Y. J. Yamanaka M. L. Lombardi S. Bose A. L. Carlson J. A. Phillips W. Teo I. A. Droujinine Nat. Nanotechnol. 2011 6 524 531
129. B. Valeur, Molecular fluorescence: principles and applications, John Wiley & Sons, 2013
130. H. Shi X. He K. Wang X. Wu X. Ye Q. Guo W. Tan Z. Qing X. Yang B. Zhou Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 3900 3905
131. H. Shi Z. Tang Y. Kim H. Nie Y. F. Huang X. He K. Deng K. Wang W. Tan Cancer 2010 23 24
132. P. Gong B. Shi M. Zheng B. Wang P. Zhang D. Hu D. Gao Z. Sheng C. Zheng Y. Ma Biomaterials 2012 33 7810 7817
133. Y. Wang Z. Li D. Hu C.-T. Lin J. Li Y. Lin J. Am. Chem. Soc. 2010 132 9274 9276
134. V. Ntziachristos Annu. Rev. Biomed. Eng. 2006 8 1 33
135. R. Weissleder Nat. Biotechnol. 2001 19 316
136. A. Webb G. C. Kagadis Med. Phys. 2003 30 2267
137. D. López-Colón E. Jiménez M. You B. Gulbakan W. Tan Wiley Interdiscip. Rev.: Nanomed. Nanobiotechnol. 2011 3 328 340
138. F. Opazo M. Levy M. Byrom C. Schäfer C. Geisler T. W. Groemer A. D. Ellington S. O. Rizzoli Nat. Methods 2012 9 938 939
139. K. E. Borbas C. S. Ferreira A. Perkins J. I. Bruce S. Missailidis Bioconjugate Chem. 2007 18 1205 1212
140. A. Z. Wang V. Bagalkot C. C. Vasilliou F. Gu F. Alexis L. Zhang M. Shaikh K. Yuet M. J. Cima R. Langer P. W. Kantoff N. H. Bander S. Jon O. C. Farokhzad ChemMedChem 2008 3 1311 1315
141. E. K. Lim B. Kim Y. Choi Y. Ro E. J. Cho J. H. Lee S. H. Ryu J. S. Suh S. Haam Y. M. Huh J. Biomed. Mater. Res., Part A 2013
142. D. Kim Y. Y. Jeong S. Jon ACS Nano 2010 4 3689 3696
143. D. W. Hwang H. Y. Ko J. H. Lee H. Kang S. H. Ryu I. C. Song D. S. Lee S. Kim J. Nucl. Med. 2010 51 98 105
144. P. Guo Nat. Nanotechnol. 2010 5 833 842
145. M. A. Valencia-Sanchez J. Liu G. J. Hannon R. Parker Genes Dev. 2006 20 515 524
146. C. L. Esposito D. Passaro I. Longobardo G. Condorelli P. Marotta A. Affuso V. de Franciscis L. Cerchia PLoS One 2011 6 e24071
147. F. Roth A. C. De La Fuente J. L. Vella A. Zoso L. Inverardi P. Serafini Cancer Res. 2012 72 1373 1383
148. Z. Zhang M. A. Eckert M. M. Ali L. Liu D.-K. Kang E. Chang E. J. Pone L. S. Sender D. A. Fruman W. Zhao ChemBioChem 2014 15 1268 1273
149. N. Li H. H. Nguyen M. Byrom A. D. Ellington PLoS One 2011 6 e20299
150. Y. Wan D. Tamuly P. Allen Y.-t. Kim R. Bachoo A. Ellington S. Iqbal Biomed. Microdevices 2013 15 635 643
151. M. Famulok M. Blind G. Mayer Chem. Biol. 2001 8 931 939
152. S. Jeong, H. K. Lee and M. Y. Kim, Gene Therapy of Cancer, Springer, 2009, pp. 363-377
153. P. J. Bates J. B. Kahlon S. D. Thomas J. O. Trent D. M. Miller J. Biol. Chem. 1999 274 26369 26377
154. S. Sayyed H. Hägele O. Kulkarni K. Endlich S. Segerer D. Eulberg S. Klussmann H.-J. Anders Diabetologia 2009 52 2445 2454
155. W. A. Pieken D. B. Olsen F. Benseler H. Aurup F. Eckstein Science 1991 253 314 317
156. L. Beigelman J. Matulic-Adamic P. Haeberli N. Usman B. Dong R. H. Silverman S. Khamnei P. F. Torrence Nucleic Acids Res. 1995 23 3989 3994
157. A. D. Keefe S. T. Cload Curr. Opin. Chem. Biol. 2008 12 448 456
158. C. Wilson A. D. Keefe Curr. Opin. Chem. Biol. 2006 10 607 614
159. P. E. Burmeister S. D. Lewis R. F. Silva J. R. Preiss L. R. Horwitz P. S. Pendergrast T. G. McCauley J. C. Kurz D. M. Epstein C. Wilson Chem. Biol. 2005 12 25 33
160. J. M. Healy S. D. Lewis M. Kurz R. M. Boomer K. M. Thompson C. Wilson T. G. McCauley Pharm. Res. 2004 21 2234 2246
161. M. C. Willis B. Collins T. Zhang L. S. Green D. P. Sebesta C. Bell E. Kellogg S. C. Gill A. Magallanez S. Knauer Bioconjugate Chem. 1998 9 573 582
162. A. Beyerle M. Irmler J. Beckers T. Kissel T. Stoeger Mol. Pharmaceutics 2010 7 727 737
163. A. M. Krieg Oncogene 2008 27 161 167
164. S. P. Henry G. Beattie G. Yeh A. Chappel P. Giclas A. Mortari M. A. Jagels D. J. Kornbrust A. A. Levin Int. Immunopharmacol. 2002 2 1657 1666
165. J. P. Sheehan H.-C. Lan Blood 1998 92 1617 1625
166. D. K. Monteith M. J. Horner N. A. Gillett M. Butler R. Geary T. Burckin T. Ushiro-Watanabe A. A. Levin Toxicol. Pathol. 1999 27 307 317
167. D. Peer J. M. Karp S. Hong O. C. Farokhzad R. Margalit R. Langer Nat. Nanotechnol. 2007 2 751 760
168. G. Zhu L. Meng M. Ye L. Yang K. Sefah M. B. O'Donoghue Y. Chen X. Xiong J. Huang E. Song W. Tan Chem.-Asian J. 2012 7 1630 1636
169. T. C. Chu K. Y. Twu A. D. Ellington M. Levy Nucleic Acids Res. 2006 34 e73
170. Y.-F. Huang D. Shangguan H. Liu J. A. Phillips X. Zhang Y. Chen W. Tan ChemBioChem 2009 10 862 868
171. J. P. Dassie X.-y. Liu G. S. Thomas R. M. Whitaker K. W. Thiel K. R. Stockdale D. K. Meyerholz A. P. McCaffrey J. O. McNamara P. H. Giangrande Nat. Biotechnol. 2009 27 839 846
172. V. Bagalkot O. C. Farokhzad R. Langer S. Jon Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 8149 8152
173. G. Zhu J. Zheng E. Song M. Donovan K. Zhang C. Liu W. Tan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013 110 7998 8003
174. Z. Zhang M. M. Ali M. A. Eckert D.-K. Kang Y. Y. Chen L. S. Sender D. A. Fruman W. Zhao Biomaterials 2013 34 9728 9735
175. T. C. Chu J. W. Marks L. A. Lavery S. Faulkner M. G. Rosenblum A. D. Ellington M. Levy Cancer Res. 2006 66 5989 5992
176. C.-h. B. Chen K. R. Dellamaggiore C. P. Ouellette C. D. Sedano M. Lizadjohry G. A. Chernis M. Gonzales F. E. Baltasar A. L. Fan R. Myerowitz E. F. Neufeld Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 15908 15913
177. P. Mallikaratchy Z. Tang W. Tan ChemMedChem 2008 3 425 428
178. Y.-A. Shieh S.-J. Yang M.-F. Wei M.-J. Shieh ACS Nano 2010 4 1433 1442
179. Y.-F. Huang K. Sefah S. Bamrungsap H.-T. Chang W. Tan Langmuir 2008 24 11860 11865
180. Y.-F. Huang H.-T. Chang W. Tan Anal. Chem. 2008 80 567 572
181. S. A. Khan R. Kanchanapally Z. Fan L. Beqa A. K. Singh D. Senapati P. C. Ray Chem. Commun. 2012 48 6711 6713
182. J. Wang K. Sefah M. B. Altman T. Chen M. You Z. Zhao C. Z. Huang W. Tan Chem.-Asian J. 2013 8 2417 2422
183. F. Torney B. G. Trewyn V. S.-Y. Lin K. Wang Nat. Nanotechnol. 2007 2 295 300
184. L. Zhang A. F. Radovic-Moreno F. Alexis F. X. Gu P. A. Basto V. Bagalkot S. Jon R. S. Langer O. C. Farokhzad ChemMedChem 2007 2 1268 1271
185. H. Kang M. B. O'Donoghue H. Liu W. Tan Chem. Commun. 2010 46 249 251
186. A. P. Mann R. C. Bhavane A. Somasunderam B. L. Montalvo-Ortiz K. B. Ghaghada D. Volk R. Nieves-Alicea K. S. Suh M. Ferrari A. Annapragada Oncotarget 2011 2 298
187. I.-H. Lee S. An M. K. Yu H.-K. Kwon S.-H. Im S. Jon J. Controlled Release 2011 155 435 441
188. N. Zhao H. G. Bagaria M. S. Wong Y. Zu J. Nanobiotechnol. 2011 9 2 10.1186/1477-3155-9-2
189. V. Bagalkot X. Gao ACS Nano 2011 5 8131 8139
190. Y. Wu K. Sefah H. Liu R. Wang W. Tan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 5 10
191. S. M. Taghdisi P. Lavaee M. Ramezani K. Abnous Eur. J. Pharm. Biopharm. 2011 77 200 206
192. Y.-L. Luo Y.-S. Shiao Y.-F. Huang ACS Nano 2011 5 7796 7804
193. M. K. Yu D. Kim I. H. Lee J. S. So Y. Y. Jeong S. Jon Small 2011 7 2241 2249
194. K. Park S. Lee E. Kang K. Kim K. Choi I. C. Kwon Adv. Funct. Mater. 2009 19 1553 1566
195. T. Chen M. I. Shukoor R. Wang Z. Zhao Q. Yuan S. Bamrungsap X. Xiong W. Tan ACS Nano 2011 5 7866 7873
196. V. Bagalkot L. Zhang E. Levy-Nissenbaum S. Jon P. W. Kantoff R. Langer O. C. Farokhzad Nano Lett. 2007 7 3065 3070
197. W.-H. Chen X.-D. Xu H.-Z. Jia Q. Lei G.-F. Luo S.-X. Cheng R.-X. Zhuo X.-Z. Zhang Biomaterials 2013 34 8798 8807
198. G. Bao S. Mitragotri S. Tong Annu. Rev. Biomed. Eng. 2013 15 253 282
199. M. M. Ali F. Li Z. Zhang K. Zhang D.-K. Kang J. A. Ankrum X. C. Le W. Zhao Chem. Soc. Rev. 2014 43 3324 3341
200. Z. Xiao D. Shangguan Z. Cao X. Fang W. Tan Chem.-Eur. J. 2008 14 1769 1775
201. K. Cho X. Wang S. Nie D. M. Shin Clin. Cancer Res. 2008 14 1310 1316
202. Z. Xiao E. Levy-Nissenbaum F. Alexis A. Lupták B. A. Teply J. M. Chan J. Shi E. Digga J. Cheng R. Langer ACS Nano 2012 6 696 704
203. K. A. Gelmon E. A. Eisenhauer A. L. Harris M. J. Ratain P. Workman J. Natl. Cancer Inst. 1999 91 1281 1287
204. Y.-W. Cheung J. Kwok A. W. L. Law R. M. Watt M. Kotaka J. A. Tanner Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013 110 15967 15972
205. Y. J. Lee I. S. Kim S.-A. Park Y. Kim J. E. Lee D.-Y. Noh K.-T. Kim S. H. Ryu P.-G. Suh Mol. Ther. 2013 21 1004 1013
206. V. J. Ruigrok M. Levisson J. Hekelaar H. Smidt B. W. Dijkstra J. Van Der Oost Int. J. Mol. Sci. 2012 13 10537 10552
207. D. R. Davies A. D. Gelinas C. Zhang J. C. Rohloff J. D. Carter D. O'Connell S. M. Waugh S. K. Wolk W. S. Mayfield A. B. Burgin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012 109 19971 19976
208. I. R. Krauss A. Merlino A. Randazzo E. Novellino L. Mazzarella F. Sica Nucleic Acids Res. 2012 40 8119 8128
209. R.-H. Huang D. H. Fremont J. L. Diener R. G. Schaub J. E. Sadler Structure 2009 17 1476 1484
210. S. B. Long M. B. Long R. R. White B. A. Sullenger RNA 2008 14 2504 2512
211. D.-B. Huang D. Vu L. A. Cassiday J. M. Zimmerman L. J. Maher G. Ghosh Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 9268 9273
212. I. Lebars P. Legrand A. Aimé N. Pinaud S. Fribourg C. Di Primo Nucleic Acids Res. 2008 36 7146 7156
213. M. A. Convery S. Rowsell N. J. Storehouse A. D. Ellington I. Hirao J. B. Murray D. S. Peabody S. E. Phillips P. G. Stockley Nat. Struct. Mol. Biol. 1998 5 133 139
214. C. Baugh D. Grate C. Wilson J. Mol. Biol. 2000 301 117 128
215. I. Vidovic S. Nottrott K. Hartmuth R. Lührmann R. Ficner Mol. Cell 2000 6 1331 1342
216. C. Levinthal J. Chim. Phys. Phys.-Chim. Biol. 1968 65 44 45
217. B. Kuhlman G. Dantas G. C. Ireton G. Varani B. L. Stoddard D. Baker Science 2003 302 1364 1368
218. L. S. Green C. Bell N. Janjic Biotechniques 2001 30 1094 1100
219. S. Fredriksson M. Gullberg J. Jarvius C. Olsson K. Pietras S. M. Gústafsdóttir A. Östman U. Landegren Nat. Biotechnol. 2002 20 473 477
220. D. C. Altieri Nat. Rev. Cancer 2008 8 61 70
221. V. Thiviyanathan D. G. Gorenstein Proteomics: Clin. Appl. 2012 6 563 573
222. J. C. Cox A. Hayhurst J. Hesselberth T. S. Bayer G. Georgiou A. D. Ellington Nucleic Acids Res. 2002 30 e108
223. D. Eulberg K. Buchner C. Maasch S. Klussmann Nucleic Acids Res. 2005 33 e45
224. M. A. Guide, www.idtdna.com/pages/docs/default-source/technical-reports/ultramer-oligonucleotide -technical-bulletin.pdf?sfvrsn=4
225. B. Zimmermann I. Bilusic C. Lorenz R. Schroeder Methods 2010 52 125 132
226. H. Y. Ko J. H. Lee H. Kang S. H. Ryu I. C. Song D. S. Lee S. Kim J. Nucl. Med. 2010 51 98 105
227. C. P. Rusconi J. D. Roberts G. A. Pitoc S. M. Nimjee R. R. White G. Quick E. Scardino W. P. Fay B. A. Sullenger Nat. Biotechnol. 2004 22 1423 1428
228. J. L. Vinkenborg N. Karnowski M. Famulok Nat. Chem. Biol. 2011 7 519 527
229. H.-A. Ho M. Leclerc J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1384 1387
230. Y. Niu P. Wang Y. Zhao A. Fan Analyst 2013 138 1475 1482
231. X. Li L. Sun A. Ge Y. Guo Chem. Commun. 2011 47 947 949
232. Y. Li H. J. Lee R. M. Corn Anal. Chem. 2007 79 1082 1088
233. H. Cho B. R. Baker S. Wachsmann-Hogiu C. V. Pagba T. A. Laurence S. M. Lane L. P. Lee J. B. H. Tok Nano Lett. 2008 8 4386 4390
234. L. Zhang P. Cui B. Zhang F. Gao Chem.-Eur. J. 2013 19 9242 9250
235. H. Chang L. Tang Y. Wang J. Jiang J. Li Anal. Chem. 2010 82 2341 2346
236. A. Liang J. Li C. Jiang Z. Jiang Bioprocess Biosyst. Eng. 2010 33 1087 1094
237. J. Zheng W. Feng L. Lin F. Zhang G. Cheng P. He Y. Fang Biosens. Bioelectron. 2007 23 341 347
238. M. Mir A. T. A. Jenkins I. Katakis Electrochem. Commun. 2008 10 1533 1536
239. Y. Xu L. Yang X. Ye P. He Y. Fang Electroanalysis 2006 18 1449 1456
240. A. Duzgun A. Maroto T. Mairal C. O'Sullivan F. X. Rius Analyst 2010 135 1037 1041
241. J. Zhao F. Lin Y. Yi Y. Huang H. Li Y. Zhang S. Yao Analyst 2012 137 3488 3495
242. A. Numnuam K. Y. Chumbimuni-Torres Y. Xiang R. Bash P. Thavarungkul P. Kanatharana E. Pretsch J. Wang E. Bakker Anal. Chem. 2008 80 707 712
243. J. Wang Y. Shan W.-W. Zhao J.-J. Xu H.-Y. Chen Anal. Chem. 2011 83 4004 4011
244. M. D. Schlensog T. M. A. Gronewold M. Tewes M. Famulok E. Quandt Sens. Actuators, B 2004 101 308 315
245. P. He L. Liu W. Qiao S. Zhang Chem. Commun. 2014 50 1481 1484
246. Y. Miyachi C. Ogino T. Amino A. Kondo J. Biosci. Bioeng. 2011 112 511 514
247. A. P. Mann A. Somasunderam R. Nieves-Alicea X. Li A. Hu A. K. Sood M. Ferrari D. G. Gorenstein T. Tanaka PLoS One 2010 5 e13050
248. R. D. Jenison S. D. Jennings D. W. Walker R. F. Bargatze D. Parma Antisense Nucleic Acid Drug Dev. 1998 8 265 279
249. D. O'Connell A. Koenig S. Jennings B. Hicke H.-L. Han T. Fitzwater Y.-F. Chang N. Varki D. Parma A. Varki Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996 93 5883 5887
250. S. Jeong T.-Y. Eom S.-J. Kim S.-W. Lee J. Yu Biochem. Biophys. Res. Commun. 2001 281 237 243
251. M. G. Theis A. Knorre B. Kellersch J. Moelleken F. Wieland W. Kolanus M. Famulok Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 11221 11226
252. S. Shigdar J. Lin Y. Yu M. Pastuovic M. Wei W. Duan Cancer Sci. 2011 102 991 998
253. S. Santulli-Marotto S. K. Nair C. Rusconi B. Sullenger E. Gilboa Cancer Res. 2003 63 7483 7489
254. L. Cerchia F. Ducongé C. Pestourie J. Boulay Y. Aissouni K. Gombert B. Tavitian V. de Franciscis D. Libri PLoS Biol. 2005 3 e123
255. S. D. Bell J. M. Denu J. E. Dixon A. D. Ellington J. Biol. Chem. 1998 273 14309 14314
256. S. E. Lupold B. J. Hicke Y. Lin D. S. Coffey Cancer Res. 2002 62 4029 4033
257. L. Cerchia C. L. Esposito S. Camorani A. Rienzo L. Stasio L. Insabato A. Affuso V. de Franciscis Mol. Ther. 2012 20 2291 2303
258. M. Y. Kim S. Jeong Nucleic Acid Ther. 2011 21 173 178
259. B. C. Chi-hong G. A. Chernis V. Q. Hoang R. Landgraf Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 9226 9231
260. Y. Liu C.-T. Kuan J. Mi X. Zhang B. M. Clary D. D. Bigner B. A. Sullenger Biol. Chem. 2009 390 137 144
261. D. Shangguan Z. Cao L. Meng P. Mallikaratchy K. Sefah H. Wang Y. Li W. Tan J. Proteome Res. 2008 7 2133 2139
262. M. Kimoto K. Sakamoto M. Shirouzu I. Hirao S. Yokoyama FEBS Lett. 1998 441 322 326
263. S. P. Ohuchi T. Ohtsu Y. Nakamura Biochimie 2006 88 897 904
264. Y. J. Lee S.-W. Lee Biochem. Biophys. Res. Commun. 2012 417 521 527
265. D. Jellinek C. Lynott D. Rifkin N. Janjić Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1993 90 11227 11231
266. L. S. Green D. Jellinek C. Bell L. A. Beebe B. D. Feistner S. C. Gill F. M. Jucker N. Janjić Chem. Biol. 1995 2 683 695
267. L. S. Green D. Jellinek R. Jenison A. Östman C.-H. Heldin N. Janjic Biochemistry 1996 35 14413 14424
268. N. C. Pagratis C. Bell Y.-F. Chang S. Jennings T. Fitzwater D. Jellinek C. Dang Nat. Biotechnol. 1997 15 68 73
269. J. Charlton J. Sennello D. Smith Chem. Biol. 1997 4 809 816
270. L. L. Lebruska L. J. Maher Biochemistry 1999 38 3168 3174
271. M. Blind W. Kolanus M. Famulok Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 3606 3610
272. J. Mi X. Zhang P. H. Giangrande J. O. McNamara Ii S. M. Nimjee S. Sarraf-Yazdi B. A. Sullenger B. M. Clary Biochem. Biophys. Res. Commun. 2005 338 956 963
273. S. Leva A. Lichte J. Burmeister P. Muhn B. Jahnke D. Fesser J. Erfurth P. Burgstaller S. Klussmann Chem. Biol. 2002 9 351 359
274. R. E. Martell J. R. Nevins B. A. Sullenger Mol. Ther. 2002 6 30 34
275. D. A. Daniels A. K. Sohal S. Rees R. Grisshammer Anal. Biochem. 2002 305 214 226
276. R. R. White J. A. Roy K. D. Viles B. A. Sullenger C. D. Kontos Angiogenesis 2008 11 395 401
277. R. R. White S. Shan C. P. Rusconi G. Shetty M. W. Dewhirst C. D. Kontos B. A. Sullenger Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 5028 5033
278. C. M. Blake B. A. Sullenger D. A. Lawrence Y. M. Fortenberry Oligonucleotides 2009 19 117 128
279. K. U. Bilik E. Ergüven S. Klussmann F. Jarosch P. Y. Wielinga T. A. Lutz T. Riediger NeuroReport 2007 18 1855 1859
280. C. Ferreira C. Matthews S. Missailidis Tumor Biol. 2006 27 289 301
281. S. Helmling C. Maasch D. Eulberg K. Buchner W. Schröder C. Lange S. Vonhoff B. Wlotzka M. H. Tschöp S. Rosewicz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 13174 13179
282. J. O. McNamara D. Kolonias F. Pastor R. S. Mittler L. Chen P. H. Giangrande B. Sullenger E. Gilboa J. Clin. Invest. 2008 118 376 386
283. C. M. Dollins S. Nair D. Boczkowski J. Lee J. M. Layzer E. Gilboa B. A. Sullenger Chem. Biol. 2008 15 675 682
284. N. Bardeesy J. Pelletier Nucleic Acids Res. 1998 26 1784 1792
285. H. K. Lee Y. S. Choi Y. A. Park S. Jeong Cancer Res. 2006 66 10560 10566
286. J. Bala A. Bhaskar A. Varshney A. K. Singh S. Dey P. Yadava RNA Biol. 2011 8 101 111
287. L. J. Talbot Z. Mi S. D. Bhattacharya V. Kim H. Guo P. C. Kuo Surgery 2011 150 224 230
288. J. Ruckman L. S. Green J. Beeson S. Waugh W. L. Gillette D. D. Henninger L. Claesson-Welsh N. Janjic J. Biol. Chem. 1998 273 20556 20567
289. D. Proske S. Gilch F. Wopfner H. M. Schätzl E.-L. Winnacker M. Famulok ChemBioChem 2002 3 717 725
290. C. M. Smith J. A. Steitz Mol. Cell. Biol. 1998 18 6897 6909
291. R. S. Geary T. A. Watanabe L. Truong S. Freier E. A. Lesnik N. B. Sioufi H. Sasmor M. Manoharan A. A. Levin J. Pharmacol. Exp. Ther. 2001 296 890 897
292. H. T. Mufhandu E. S. Gray M. C. Madiga N. Tumba K. B. Alexandre T. Khoza C. K. Wibmer P. L. Moore L. Morris M. Khati J. Virol. 2012 86 4989 4999
293. C. F. Bennett M.-Y. Chiang H. Chan J. Shoemaker C. K. Mirabelli Mol. Pharmacol. 1992 41 1023 1033
294. H. Šípová T. Špringer D. Rejman O. Šimák M. Petrová P. Novák Š. Rosenbergová O. Páv R. Liboska I. Barvík Nucleic Acids Res. 2014 gku125
295. Y. Lin D. Nieuwlandt A. Magallanez B. Feistner S. D. Jayasena Nucleic Acids Res. 1996 24 3407 3414
296. F. M. Veronese G. Pasut Drug Discovery Today 2005 10 1451 1458