High throughput screening for protein kinase inhibitors

Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening

Volumn 8, Issue 2, 2005, Pages 181-195

  Wesche, Holger ^a   Xiao, Shou Hua ^a   Young, Steve W ^a  

^a AMGEN INC   (United States)

Author keywords

High Throughput Screening; Kinase

Indexed keywords

2 (2 CHLORO 4 IODOANILINO) N CYCLOPROPYLMETHOXY 3,4 DIFLUOROBENZAMIDE; 2,4 DIMETHYL 5 (2 OXO 1H INDOL 3 YLMETHYLENE) 3 PYRROLEPROPIONIC ACID; 4 [6 METHOXY 7 [3 (1 PIPERIDINYL)PROPOXY] 4 QUINAZOLINYL] 1 PIPERAZINECARBOXYLIC ACID (4 ISOPROPOXYPHENYL)AMIDE; 6 (4 HYDROXYPHENYL) 4 (ALPHA METHYLBENZYLAMINO) 7H PYRROLO[2,3 D]PYRIMIDINE; 7 HYDROXYSTAUROSPORINE; BIR0796; BRYOSTATIN 1; CANERTINIB; CEP 1347; CEP 701; ERLOTINIB; EVEROLIMUS; FLAVOPIRIDOL; GEFITINIB; IMATINIB; INDISULAM; LAPATINIB; MIDOSTAURIN; N [5 (5 TERT BUTYL 2 OXAZOLYLMETHYLTHIO) 2 THIAZOLYL]ISONIPECOTAMIDE; PELITINIB; PROTEIN KINASE INHIBITOR; RAPAMYCIN; ROSCOVITINE; RUBOXISTAURIN; SCIO 469; SORAFENIB; TEMSIROLIMUS; UNCLASSIFIED DRUG; UNINDEXED DRUG; VANDETANIB; VATALANIB;

CHRONIC MYELOID LEUKEMIA; CLINICAL TRIAL; DRUG ACTIVITY; DRUG INHIBITION; DRUG MECHANISM; DRUG SCREENING; DRUG STRUCTURE; DRUG SYNTHESIS; DRUG TARGETING; ENZYME ACTIVITY; ENZYME INHIBITION; HIGH THROUGHPUT SCREENING; HUMAN; LUNG NON SMALL CELL CANCER; PRIORITY JOURNAL; REVIEW; SIGNAL TRANSDUCTION; STRUCTURE ACTIVITY RELATION;

ANIMALS; AVIAN SARCOMA VIRUSES; BINDING SITES; DRUG DESIGN; HUMANS; LEUKEMIA, MYELOID, CHRONIC; LUNG NEOPLASMS; MASS SCREENING; PEPTIDE LIBRARY; PROTEIN KINASE INHIBITORS; PROTEIN KINASES; SIGNAL TRANSDUCTION;

EID: 15344346733     PISSN: 13862073     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/1386207053258514     Document Type: Review

References (97)

1. Cohen, P. Nat. Rev. Drug Discov., 2002, 1, 309.
2. Manning, G.; Whyte, D. B.; Martinez, R.; Hunter, T.; Sudarsanam, S. Science, 2002, 298, 1912.
3. Berg, J. M.; Tymoczko, J. L.; Stryer, L. Biochemistry. 5 ed.; W. H. Freeman and Company: New York, 2002; Vol. p.
4. Sawyers, C. L. Genes Dev., 2003, 17, 2998.
5. Orchard, S. Curr. Opin. Drug Discov. Devel., 2002, 5, 713.
6. Dancey, J.; Sausville, E. A. Nat. Rev. Drug Discov., 2003, 2, 296.
7. Huse, M.; Kuriyan, J. Cell 2002, 109, 275.
8. Knighton, D. R.; Zheng, J. H.; Ten Eyck, L. F.; Ashford, V. A.; Xuong, N. H.; Taylor, S. S.; Sowadski, J. M. Science, 1991, 253, 407.
9. Pargellis, C.; Tong, L.; Churchill, L.; Cirillo, P. F.; Gilmore, T.; Graham, A. G.; Grob, P. M.; Hickey, E. R.; Moss, N.; Pav, S.; Regan, J. Nat. Struct. Biol., 2002, 9, 268.
10. Wang, Z.; Canagarajah, B. J.; Boehm, J. C.; Kassisa, S.; Cobb, M. H.; Young, P. R.; Abdel-Meguid, S.; Adams, J. L.; Goldsmith, E. J. Structure, 1998, 6, 1117.
11. Dinarello, C. A. Blood, 1996, 87, 2095.
12. Cohen, S. B.; Rubbert, A. Rheumatology (Oxford), 2003, 42 Suppl 2, ii36.
13. Martin, M.; Bol, G. F.; Eriksson, A.; Resch, K.; Brigelius-Flohe, R. Eur. J. Immunol., 1994, 24, 1566.
14. Cao, Z.; Henzel, W. J.; Gao, X. Science, 1996, 271, 1128.
15. Muzio, M.; Ni, J.; Feng, P.; Dixit, V. M. Science, 1997, 278, 1612.
16. Wesche, H.; Gao, X.; Li, X.; Kirschning, C. J.; Stark, G. R.; Cao, Z. J. Biol. Chem., 1999, 274, 19403.
17. Li, S.; Strelow, A.; Fontana, E. J.; Wesche, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2002, 99, 5567.
18. Zandi, E.; Rothwarf, D. M.; Delhase, M.; Hayakawa, M.; Karin, M. Cell, 1997, 91, 243.
19. Mercuric, F.; Zhu, H.; Murray, B. W.; Shevchenko, A.; Bennett, B. L.; Li, J.; Young, D. B.; Barbosa, M.; Mann, M.; Manning, A.; Rao, A. Science, 1997, 278, 860.
20. Regnier, C. H.; Song, H. Y.; Gao, X.; Goeddel, D. V.; Cao, Z.; Rothe, M. Cell, 1997, 90, 373.
21. Woronicz, J. D.; Gao, X.; Cao, Z.; Rothe, M.; Goeddel, D. V. Science, 1997, 278, 866.
22. Martin, M. U.; Wesche, H. Biochim. Biophys. Acta, 2002, 1592, 265.
23. Kobayashi, K.; Hernandez, L. D.; Galan, J. E.; Janeway, C. A. Jr.; Medzhitov, R.; Flavell, R. A. Cell, 2002, 110, 191.
24. Kanakaraj, P.; Schafer, P. H.; Cavender, D. E.; Wu, Y., Ngo, K.; Grealish, P. F.; Wadsworth, S. A.; Peterson, P. A.; Siekierka, J. J.; Harris, C. A.; Fung-Leung, W. P. J. Exp. Med., 1998, 187, 2073.
25. Thomas, J. A.; Allen, J. L.; Tsen, M.; Dubnicoff, T.; Danao, J.; Liao, X. C.; Cao, Z.; Wasserman, S. A. J. Immunol., 1999, 163, 978.
26. Li, X.; Commane, M.; Burns, C.; Vithalani, K.; Cao, Z.; Stark, G. R. Mol. Cell Biol., 1999, 19, 4643.
27. Yamin, T. T.; Miller, D. K. J. Biol. Chem., 1997, 272, 21540.
28. Suzuki, N.; Suzuki, S.; Duncan, G. S.; Millar, D. G.; Wada, T.; Mirtsos, C.; Takada, H.; Wakeham, A.; Itie, A.; Li, S.; Penninger, J. M.; Wesche, H.; Ohashi, P. S.; Mak, T. W.; Yeh, W. C. Nature, 2002, 416, 750.
29. Medvedev, A. E.; Lentschat, A.; Kuhns, D. B.; Blanco, J. C.; Salkowski, C.; Zhang, S.; Arditi, M.; Gallin, J. I.; Vogel, S. N. J. Exp. Med., 2003, 198, 521.
30. Picard, C.; Puel, A.; Bonnet, M.; Ku, C. L.; Bustamante, J.; Yang, K.; Soudais, C.; Dupuis, S.; Feinberg, J.; Fieschi, C.; Elbim, C.; Hitchcock, R.; Lammas, D.; Davies, G.; Al-Ghonaium, A.; Al-Rayes, H.; Al-Jumaah, S.; Al-Hajjar, S.; Al-Mohsen, I. Z.; Frayha, H. H.; Rucker, R.; Hawn, T. R.; Aderem, A.; Tufenkeji, H.; Haraguchi, S.; Day, N. K.; Good, R. A.; Gougerot-Pocidalo, M. A.; Ozinsky, A.; Casanova, J. L. Science, 2003, 299, 2076.
31. Dajee, M.; Lazarov, M.; Zhang, J. Y.; Cai, T.; Green, C. L.; Russell, A. J.; Marinkovich, M. P.; Tao, S.; Lin, Q.; Kubo, Y.; Khavari, P. A. Nature, 2003, 421, 639.
32. Burke, J. R.; Pattoli, M. A.; Gregor, K. R.; Brassil, P. J.; MacMaster, J. F.; McIntyre, K. W.; Yang, X.; Iotzova, V. S.; Clarke, W.; Strnad, J.; Qiu, Y.; Zusi, F. C. J. Biol. Chem., 2003, 278, 1450.
33. Zheng, J.; Knighton, D. R.; ten Eyck, L. F.; Karlsson, R.; Xuong, N.; Taylor, S. S.; Sowadski, J. M. Biochemistry, 1993, 32, 2154.
34. Madhusudan; Trafny, E. A.; Xuong, N. H.; Adams, J. A.; Ten Eyck, L. F.; Taylor, S. S.; Sowadski, J. M. Protein Sci., 1994, 3, 176.
35. Davies, S. P.; Reddy, H.; Caivano, M.; Cohen, P. Biochem. J., 2000, 351, 95.
36. Cohen, M. H.; Williams, G.; Johnson, J. R.; Duan, J.; Gobburu, J.; Rahman, A.; Benson, K.; Leighton, J.; Kim, S. K.; Wood, R.; Rothmann, M.; Chen, G.; U, K. M.; Staten, A. M.; Pazdur, R. Clin. Cancer Res., 2002, 8, 935.
37. Nagar, B.; Hantschel, O.; Young, M. A.; Scheffzek, K.; Veach, D.; Bornmann, W.; Clarkson, B.; Superti-Furga, G.; Kuriyan, J. Cell, 2003, 112, 859.
38. Sawyers, C. L. Cancer Cell. 2002, 1, 13.
39. Zimmermann, J.; Caravatti, G.; Mett, H.; Meyer, T.; Muller, M.; Lydon, N. B.; Fabbro, D. Arch. Pharm. (Weinheim), 1996, 329, 371.
40. Druker, B. J.; Lydon, N. B. J. Clin. Invest., 2000, 105, 3.
41. Druker, B. J.; Tamura, S.; Buchdunger, E.; Ohno, S.; Segal, G. M.; Fanning, S.; Zimmermann, J.; Lydon, N. B. Nat. Med., 1996, 2, 561.
42. Schindler, T.; Bornmann, W.; Pellicena, P.; Miller, W. T.; Clarkson, B.; Kuriyan, J. Science, 2000, 289, 1938.
43. Dagher, R.; Cohen, M.; Williams, G.; Rothmann, M.; Gobburu, J.; Robbie, G.; Rahman, A.; Chen, G.; Staten, A.; Griebel, D.; Pazdur, R. Clin. Cancer Res., 2002, 8, 3034.
44. Cohen, M. H.; Williams, G. A.; Sridhara, R.; Chen, G.; Pazdur, R. Oncologist, 2003, 8, 303.
45. Wakeling, A. E.; Guy, S. P.; Woodburn, J. R.; Ashton, S. E.; Curry, B. J.; Barker, A. J.; Gibson, K. H. Cancer Res., 2002, 62, 5749.
46. Pao, W.; Miller, V. A.; Kris, M. G. Semin Cancer Biol., 2004, 14, 33.
47. Yarden, Y. Eur. J. Cancer, 2001, 37 Suppl 4, S3.
48. Eyers, P. A.; Craxton, M.; Morrice, N.; Cohen, P.; Goedert, M. Chem. Biol., 1998, 5, 321.
49. Tong, L.; Pav, S.; White, D. M.; Rogers, S.; Crane, K. M.; Cywin, C. L.; Brown, M. L.; Pargellis, C. A. Nat. Struct. Biol., 1997, 4, 311.
50. Gum, R. J.; McLaughlin, M. M.; Kumar, S.; Wang, Z.; Bower, M. J.; Lee, J. C.; Adams, J. L.; Livi, G. P.; Goldsmith, E. J.; Young, P. R. J. Biol. Chem., 1998, 273, 15605.
51. Alessi, D. R.; Cuenda, A.; Cohen, P.; Dudley, D. T.; Saltiel, A. R. J. Biol. Chem., 1995, 270, 27489.
52. Favata, M. F.; Horiuchi, K. Y.; Manos, E. J.; Dauleno, A. J.; Stradley, D. A.; Feeser, W. S.; Van Dyk, D. E.; Pitts, W. J.; Earl, R. A.; Hobbs, F.; Copeland, R. A.; Magolda, R. L.; Scherle, P. A.; Trzaskos, J. M. J. Biol. Chem., 1998, 273, 18623.
53. Blum, G.; Gazit, A.; Levitzki, A. Biochemistry, 2000, 39, 15705.
54. Songyang, Z.; Blechner, S.; Hoagland, N.; Hoekstra, M. F.; Piwnica-Worms, H.; Cantley, L. C. Curr. Biol., 1994, 4, 973.
55. Songyang, Z.; Cantley, L. C. Methods Mol. Biol., 1998, 87, 87.
56. Songyang, Z.; Lu, K. P.; Kwon, Y. T.; Tsai, L. H.; Filhol, O.; Cochet, C.; Brickey, D. A.; Soderling, T. R.; Bartleson, C.; Graves, D. J.; DeMaggio, A. J.; Hoekstra, M. F.; Blenis, J.; Hunter, T.; Cantley, L. C. Mol. Cell Biol., 1996, 16, 6486.
57. Lizcano, J. M.; Deak, M.; Morrice, N.; Kieloch, A.; Hastie, C. J.; Dong, L.; Schutkowski, M.; Reimer, U.; Alessi, D. R. J. Biol. Chem., 2002, 277, 27839.
58. Deng, S. J.; Liu, W.; Simmons, C. A.; Moore, J. T.; Tian, G. Comb. Chem. High Throughput Screen, 2001, 4, 525.
59. Colwill, K.; Pawson, T.; Andrews, B.; Prasad, J.; Manley, J. L.; Bell, J. C.; Duncan, P. I. Embo J., 1996, 15, 265.
60. Knebel, A.; Morrice, N.; Cohen, P. EMBO J., 2001, 20, 4360.
61. Shah, K.; Shokat, K. M. Methods Mol. Biol., 2003, 233, 253.
62. Shah, K.; Liu, Y.; Deirmengian, C.; Shokat, K. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1997, 94, 3565.
63. Warrior, U.; Chiou, X. G.; Sheets, M. P.; Sciotti, R. J.; Parry, J. M.; Simmer, R. L.; Surber, B. W.; Burns, D. J.; Beutel, B. A.; Mollison, K. W.; Djuric, S. W.; Trevillyan, J. M. J. Biomol. Screen, 1999, 4, 129.
64. Johnston, P. A. Drug Discov. Today, 2002, 7, 353.
65. Croston, G. E. Trends Biotechnol., 2002, 20, 110.
66. Lehel, C.; Daniel-Issakani, S.; Brasseur, M.; Strulovici, B. Anal. Biochem., 1997, 244, 340.
67. Seethala, R.; Menzel, R. Anal. Biochem., 1997, 253, 210.
68. Braunwalder, A. F.; Yarwood, D. R.; Sills, M. A.; Lipson, K. E. Anal. Biochem., 1996, 235, 159.
69. Waddleton, D.; Ramachandran, C.; Wang, Q. Anal. Biochem., 2002, 309, 150.
70. Turek, T. C.; Small, E. C.; Bryant, R. W.; Hill, W. A. Anal. Biochem., 2001, 299, 45.
71. Park, Y. W.; Cummings, R. T.; Wu, L.; Zheng, S.; Cameron, P. M.; Woods, A.; Zaller, D. M.; Marcy, A. I.; Hermes, J. D. Anal. Biochem., 1999, 269, 94.
72. Mallari, R.; Swearingen, E.; Liu, W.; Ow, A.; Young, S. W.; Huang, S. G. J. Biomol. Screen, 2003, 8, 198.
73. McDonald, O. B.; Chen, W. J.; Ellis, B.; Hoffman, C.; Overton, L.; Rink, M.; Smith, A.; Marshall, C. J.; Wood, E. R. Anal. Biochem., 1999, 268, 318.
74. Beveridge, M.; Park, Y. W.; Hermes, J.; Marenghi, A.; Brophy, G.; Santos, A. J. Biomol. Screen, 2000, 5, 205.
75. Kolb, A. J.; Kaplita, P. V.; Hayes, D. J.; Park, Y. W.; Pernell, C.; Major, J. S.; Mathis, G. DDT, 1998, 3, 333.
76. Ullman, E. F.; Kirakossian, H.; Switchenko, A. C.; Ishkanian, J.; Ericson, M.; Wartchow, C. A.; Pirio, M.; Pease, J.; Irvin, B. R.; Singh, S.; Singh, R.; Patel, R.; Dafforn, A.; Davalian, D.; Skold, C.; Kurn, N.; Wagner, D. B. Clin. Chem., 1996, 42, 1518.
77. Rouleau, N.; Turcotte, S.; Mondou, M. H.; Roby, P.; Bosse, R. J. Biomol. Screen, 2003, 8, 191.
78. Miraglia, S.; Swartzman, E. E.; Mellentin-Michelotti, J.; Evangelista, L.; Smith, C.; Gunawan, I.I.; Lohman, K.; Goldberg, E. M.; Manian, B.; Yuan, P. M. J. Biomol. Screen. 1999, 4, 193.
79. Lee, J. Y.; Miraglia, S.; Yan, X.; Swartzman, E.; Cornell-Kennon, S.; Mellentin-Michelotti, J.; Bruseo, C.; France, D. S. J. Biomol. Screen, 2003, 8, 81.
80. Cohen, C. B.; Chin-Dixon, E.; Jeong, S.; Nikiforov, T. T. Anal. Biochem., 1999, 273, 89.
81. Wu, G.; Yuan, Y.; Hodge, C. N. J. Biomol. Screen, 2003, 8, 694.
82. Sadler, T. M.; Achilleos, M.; Ragunathan, S.; Pitkin, A.; LaRocque, J.; Morin, J.; Annable, R.; Greenberger, L. M.; Frost, P.; Zhang, Y. Anal. Biochem., 2004, 326, 106.
83. Ohmi, N.; Wingfield, J. M.; Yazawa, H.; Inagaki, O. J. Biomol. Screen, 2000, 5, 463.
84. Gaudet, E. A.; Huang, K. S.; Zhang, Y.; Huang, W.; Mark, D.; Sportsman, J. R. J. Biomol. Screen, 2003, 8, 164.
85. Sportsman, J. R.; Daijo, J.; Gaudet, E. A. Comb. Chem. High Throughput Screen, 2003, 6, 195.
86. Seethala, R.; Menzel, R. Anal. Biochem., 1998, 255, 257.
87. Coffin, J.; Latev, M.; Bi, X.; Nikiforov, T. T. Anal. Biochem., 2000, 278, 206.
88. Fowler, A.; Swift, D.; Longman, E.; Acornley, A.; Hemsley, P.; Murray, D.; Unitt, J.; Dale, I.; Sullivan, E.; Coldwell, M. Anal. Biochem., 2002, 308, 223.
89. Johnson, L. N.; Noble, M. E.; Owen, D. J. Cell, 1996, 85, 149.
90. Schindler, T.; Sicheri, F.; Pico, A.; Gazit, A.; Levitzki, A.; Kuriyan, J. Mol. Cell, 1999, 3, 639.
91. Xu, W.; Doshi, A.; Lei, M.; Eck, M. J.; Harrison, S. C. Mol. Cell, 1999, 3, 629.
92. Eglen, R. M.; Singh, R. Comb. Chem. High Throughput Screen, 2003, 6, 381.
93. Vainshtein, I.; Silveria, S.; Kaul, P.; Rouhani, R.; Eglen, R. M.; Wang, J. J. Biomol. Screen, 2002, 7, 507.
94. Langley, K. E.; Zabin, I. Biochemistry, 1976, 15, 4866.
95. Meggio, F.; Donella Deana, A.; Ruzzene, M.; Brunati, A. M.; Cesaro, L.; Guerra, B.; Meyer, T.; Mett, H.; Fabbro, D.; Furet, P.; et al. Eur. J. Biochem., 1995, 234, 317.
96. Hubert, C. L.; Sherling, S. E.; Johnston, P. A.; Stancato, L. F. J. Biomol. Screen, 2003, 8, 399.
97. Sills, M. A.; Weiss, D.; Pham, Q.; Schweitzer, R.; Wu, X.; Wu, J. J. J. Biomol. Screen, 2002, 7, 191.