Computational enzymatic catalysis - Clarifying enzymatic mechanisms with the help of computers

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 14, Issue 36, 2012, Pages 12431-12441

  Sousa, Sérgio Filipe ^a   Fernandes, Pedro Alexandrino ^a   Ramos, Maria João ^a  

^a Faculdade de Farmácia da Universidade do Porto   (Portugal)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BETA GALACTOSIDASE; BETA N ACETYLHEXOSAMINIDASE; FARNESYL TRANS TRANSFERASE;

BIOCATALYSIS; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; HUMAN; METABOLISM; MOLECULAR DYNAMICS; QUANTUM THEORY; REVIEW;

BETA-GALACTOSIDASE; BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASES; BIOCATALYSIS; FARNESYLTRANSTRANSFERASE; HUMANS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; QUANTUM THEORY;

EID: 84865477079     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cp41180f     Document Type: Review

References (199)

1. L. Pauling Chem. Eng. News 1946 24 1375
2. L. Pauling Nature 1948 161 707
3. D. Blow Struct. Fold Des. 2000 8 R77 R81
4. A. Kohen J. P. Klinman Acc. Chem. Res. 1998 31 397
5. T. C. Bruice Acc. Chem. Res. 2002 35 139
6. J. L. Gao D. G. Truhlar Annu. Rev. Phys. Chem. 2002 53 467
7. M. Garcia-Viloca J. Gao M. Karplus D. G. Truhlar Science 2004 303 186
8. M. J. Ramos P. A. Fernandes Acc. Chem. Res. 2008 41 689
9. J. L. Gao S. H. Ma D. T. Major K. Nam J. Z. Pu D. G. Truhlar Chem. Rev. 2006 106 3188
10. S. Marti M. Roca J. Andres V. Moliner E. Silla I. Tunon J. Bertran Chem. Soc. Rev. 2004 33 98
11. A. Warshel Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2003 32 425
12. J. Villa A. Warshel J. Phys. Chem. B 2001 105 7887
13. M. J. Field J. Comput. Chem. 2002 23 48
14. A. J. Mulholland Drug Discovery Today 2005 10 1393
15. M. W. van der Kamp A. J. Mulholland Nat. Prod. Rep. 2008 25 1001
16. A. J. Mulholland Biochem. Soc. Trans. 2008 36 22
17. F. Himo Theor. Chem. Acc. 2006 116 232
18. M. Leopoldini T. Marino M. D. Michelini I. Rivalta N. Russo E. Sicilia M. Toscano Theor. Chem. Acc. 2007 117 765
19. P. E. M. Siegbahn F. Himo Wiley Interdiscip. Rev.: Comput. Mol. Sci. 2011 1 323
20. P. E. M. Siegbahn F. Himo JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2009 14 643
21. H. M. Senn W. Thiel Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 1198
22. H. M. Senn W. Thiel Curr. Opin. Chem. Biol. 2007 11 182
23. K. E. Ranaghan A. J. Mulholland Int. Rev. Phys. Chem. 2010 29 65
24. A. J. Mulholland Chem. Cent. J. 2007 1 19
25. J. Aqvist A. Warshel Chem. Rev. 1993 93 2523
26. A. Warshel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1978 75 5250
27. S. C. L. Kamerlin A. Warshel Wiley Interdiscip. Rev.: Comput. Mol. Sci. 2011 1 30
28. R. Car M. Parrinello Phys. Rev. Lett. 1985 55 2471
29. A. Laio J. VandeVondele U. Rothlisberger J. Chem. Phys. 2002 116 6941
30. D. K. Remler P. A. Madden Mol. Phys. 1990 70 921
31. M. Dal Peraro P. Ruggerone S. Raugei F. L. Gervasio P. Carloni Curr. Opin. Struct. Biol. 2007 17 149
32. M. R. A. Blomberg P. E. M. Siegbahn J. Comput. Chem. 2006 27 1373
33. R. Sevastik C. P. Whitman F. Himo Biochemistry 2009 48 9641
34. P. Georgieva Q. Wu M. J. McLeish F. Himo Biochim. Biophys. Acta 2009 1794 1831
35. M. F. Lucas M. J. Ramos J. Am. Chem. Soc. 2005 127 6902
36. S. Pereira P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Am. Chem. Soc. 2005 127 5174
37. N. M. F. S. Cerqueira P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Phys. Chem. B 2006 110 21272
38. P. E. Siegbahn Q. Rev. Biophys. 2003 36 91
39. P. E. M. Siegbahn M. R. A. Blomberg Chem. Rev. 2000 100 421
40. P. E. M. Siegbahn M. R. A. Blomberg Annu. Rev. Phys. Chem. 1999 50 221
41. P. E. M. Siegbahn T. Borowski Acc. Chem. Res. 2006 39 729
42. S. L. Chen W. H. Fang F. Himo J. Inorg. Biochem. 2009 103 274
43. R. Z. Liao J. G. Yu F. Himo Inorg. Chem. 2009 48 1442
44. R. Z. Liao F. Himo J. G. Yu R. Z. Liu J. Inorg. Biochem. 2010 104 37
45. R. Z. Liao J. G. Yu F. Himo J. Phys. Chem. B 2010 114 2533
46. R. Z. Liao J. G. Yu F. Himo Inorg. Chem. 2010 49 6883
47. Y. Zhao B. J. Lynch D. G. Truhlar J. Phys. Chem. A 2004 108 2715
48. R. Z. Liao P. Georgieva J. G. Yu F. Himo Biochemistry 2011 50 1505
49. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos Chemistry 2009 15 4243
50. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Am. Chem. Soc. 2007 129 1378
51. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos Biophys. J. 2005 88 483
52. M. Leopoldini N. Russo M. Toscano Chem.-Eur. J. 2009 15 8026
53. M. E. Alberto T. Marino M. J. Ramos N. Russo J. Chem. Theor. Comput. 2010 6 2424
54. O. Amata T. Marino N. Russo M. Toscano Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 3468
55. R. Z. Liao J. G. Yu F. Himo J. Inorg. Biochem. 2011 105 927
56. R. Z. Liao J. G. Yu F. Himo J. Chem. Theor. Comput. 2011 7 1494
57. A. D. Becke Phys. Rev. A 1988 38 3098
58. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1996 104 1040
59. C. Lee W. Yang R. G. Parr Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1988 37 785
60. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Phys. Chem. A 2007 111 10439
61. Y. Zhao D. G. Truhlar Theor. Chem. Acc. 2008 120 215
62. S. Grimme J. Comput. Chem. 2006 27 1787
63. A. Klamt G. Schuurmann J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1993 799
64. J. Andzelm C. lmel A. Klamt J. Chem. Phys. 1995 103 9312
65. A. Klamt J. Phys. Chem. 1995 99 2224
66. A. Klamt V. Jonas J. Chem. Phys. 1996 105 9972
67. V. Barone M. Cossi J. Phys. Chem. A 1998 102 1995
68. M. Cossi N. Rega G. Scalmani V. Barone J. Comput. Chem. 2003 24 669
69. E. Cances B. Mennucci J. Tomasi J. Chem. Phys. 1997 107 3032
70. B. Mennucci J. Tomasi J. Chem. Phys. 1997 106 5151
71. J. Tomasi M. Persico Chem. Rev. 1994 94 2027
72. J. Tomasi B. Mennucci E. Cances J. Mol. Struct. (Theochem) 1999 464 211
73. J. Florian A. Warshel J. Phys. Chem. B 1997 101 5583
74. M. R. A. Blomberg P. E. M. Siegbahn G. T. Babcock J. Am. Chem. Soc. 1998 120 8812
75. P. E. M. Siegbahn J. Am. Chem. Soc. 1998 120 8417
76. P. E. M. Siegbahn L. A. Eriksson F. Himo M. Pavlov J. Phys. Chem. B 1998 102 10622
77. P. Georgieva F. Himo J. Comput. Chem. 2010 31 1707
78. M. Klahn S. Braun-Sand E. Rosta A. Warshel J. Phys. Chem. B 2005 109 15645
79. A. Warshel M. Levitt J. Mol. Biol. 1976 103 227
80. K. E. Ranaghan L. Ridder B. Szefczyk W. A. Sokalski J. C. Hermann A. J. Mulholland Org. Biomol. Chem. 2004 2 968
81. C. G. Zhan D. Q. Gao Biophys. J. 2005 89 3863
82. S. O. Meroueh J. F. Fischer H. B. Schlegel S. Mobashery J. Am. Chem. Soc. 2005 127 15397
83. P. Hu Y. K. Zhang J. Am. Chem. Soc. 2006 128 1272
84. J. Berges G. Rickards A. Rauk C. Houée-Levin Chem. Phys. Lett. 2006 421 63
85. J. N. Almasi E. A. C. Bushnell J. W. Gauld Molecules 2011 16 8569
86. S. J. Weiner P. A. Kollman D. A. Case U. C. Singh C. Ghio G. Alagona S. Profeta P. Weiner J. Am. Chem. Soc. 1984 106 765
87. S. J. Weiner P. A. Kollman D. T. Nguyen D. A. Case J. Comput. Chem. 1986 7 230
88. W. D. Cornell P. Cieplak C. I. Bayly I. R. Gould K. M. Merz D. M. Fergunson D. C. Spellmeyer T. Fox J. W. Caldwell P. A. Kollman J. Am. Chem. Soc. 1995 117 5179
89. Y. Duan C. Wu S. Chowdhury M. C. Lee G. M. Xiong W. Zhang R. Yang P. Cieplak R. Luo T. Lee J. Caldwell J. M. Wang P. Kollman J. Comput. Chem. 2003 24 1999
90. B. R. Brooks R. E. Bruccoleri B. D. Olafson D. J. States S. Swaminathan M. Karplus J. Comput. Chem. 1983 4 187
91. A. D. MacKerell J. Wiorkiewiczkuczera M. Karplus J. Am. Chem. Soc. 1995 117 11946
92. A. D. MacKerell D. Bashford M. Bellott R. L. Dunbrack J. D. Evanseck M. J. Field S. Fischer J. Gao H. Guo S. Ha D. Joseph-McCarthy L. Kuchnir K. Kuczera F. T. K. Lau C. Mattos S. Michnick T. Ngo D. T. Nguyen B. Prodhom W. E. Reiher B. Roux M. Schlenkrich J. C. Smith R. Stote J. Straub M. Watanabe J. Wiorkiewicz-Kuczera D. Yin M. Karplus J. Phys. Chem. B 1998 102 3586
93. A. D. MacKerell M. Feig C. L. Brooks J. Comput. Chem. 2004 25 1400
94. A. D. MacKerell N. Banavali N. Foloppe Biopolymers 2000 56 257
95. W. L. Jorgensen J. Tirado-Rives J. Am. Chem. Soc. 1988 110 1657
96. J. Pranata S. G. Wierschke W. L. Jorgensen J. Am. Chem. Soc. 1991 113 2810
97. W. L. Jorgensen D. S. Maxwell J. Tirado-Rives J. Am. Chem. Soc. 1996 118 11225
98. H. B. Schlegel J. Comput. Chem. 2003 24 1514
99. Z. H. Ke S. L. Wang D. Q. Xie Y. K. Zhang J. Phys. Chem. B 2009 113 16705
100. H. Zheng S. L. Wang Y. K. Zhang J. Comput. Chem. 2009 30 2706
101. K. P. Eurenius D. C. Chatfield B. R. Brooks M. Hodoscek Int. J. Quantum Chem. 1996 60 1189
102. D. Bakowies W. Thiel J. Phys. Chem. 1996 100 10580
103. F. Maseras K. Morokuma J. Comput. Chem. 1995 16 1170
104. S. Humbel S. Sieber K. Morokuma J. Chem. Phys. 1996 105 1959
105. M. Svensson S. Humbel R. Froese T. Matsubara S. Sieber K. Morokuma J. Phys. Chem. 1996 100 19357
106. T. H. Rod U. Ryde Phys. Rev. Lett. 2005 94 138302
107. T. H. Rod U. Ryde J. Chem. Theor. Comput. 2005 1 1240
108. M. Trajbl G. Y. Hong A. Warshel J. Phys. Chem. B 2002 106 13333
109. Y. K. Zhang H. Y. Liu W. T. Yang J. Chem. Phys. 2000 112 3483
110. E. Rosta M. Klahn A. Warshel J. Phys. Chem. B 2006 110 2934
111. W. J. Chen D. A. Andres J. L. Goldstein D. W. Russell M. S. Brown Cell 1991 66 327
112. W. J. Chen D. A. Andres J. L. Goldstein M. S. Brown Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 11368
113. S. L. Moores M. D. Schaber S. D. Mosser E. Rands M. B. O'Hara V. M. Garsky M. S. Marshall D. L. Pompliano J. B. Gibbs J. Biol. Chem. 1991 266 14603
114. Y. Reiss J. L. Goldstein M. C. Seabra P. J. Casey M. S. Brown Cell 1990 62 81
115. Y. Reiss M. C. Seabra S. A. Armstrong C. A. Slaughter J. L. Goldstein M. S. Brown J. Biol. Chem. 1991 266 10672
116. Y. Takai T. Sasaki T. Matozaki Physiol. Rev. 2001 81 153
117. W. R. Schafer J. Rine Annu. Rev. Genet. 1992 26 209
118. J. A. Glomset C. C. Farnsworth Annu. Rev. Cell Biol. 1994 10 181
119. F. L. Zhang P. J. Casey Annu. Rev. Biochem. 1996 65 241
120. J. F. Hancock A. I. Magee J. E. Childs C. J. Marshall Cell 1989 57 1167
121. J. H. Jackson C. G. Cochrane J. R. Bourne P. A. Solski J. E. Buss C. J. Der Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1990 87 3042
122. K. Kato A. D. Cox M. M. Hisaka S. M. Graham J. E. Buss C. J. Der Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992 89 6403
123. S. Ayral-Kaloustian E. J. Salaski Curr. Med. Chem. 2002 9 1003
124. J. Ohkanda D. B. Knowles M. A. Blaskovich S. M. Sebti A. D. Hamilton Curr. Top. Med. Chem. 2002 2 303
125. T. B. Brunner S. M. Hahn A. K. Gupta R. J. Muschel W. G. McKenna E. J. Bernhard Cancer Res. 2003 63 5656
126. F. Caponigro M. Casale J. Bryce Expert Opin. Invest. Drugs 2003 12 943
127. R. J. Doll P. Kirschmeier W. R. Bishop Curr. Opin. Drug Discovery. Dev. 2004 7 478
128. A. A. Adjei Cancer Chemother. Biol. Response Modif. 2005 22 123
129. R. Kurzrock Clin. Adv. Hematol. Oncol. 2005 3 161
130. N. M. G. M. Appels J. H. Beijnen J. H. M. Schellens Oncologist 2005 10 565
131. A. D. Basso P. Kirschmeier W. R. Bishop J. Lipid Res. 2006 47 15
132. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos Curr. Med. Chem. 2008 15 1478
133. A. G. Agrawal R. R. Somani Mini-Rev. Med. Chem. 2009 9 638
134. N. S. H. N. Moorthy S. F. Sousa M. J. Ramos P. A. Fernandes J. Biomol. Screening 2011 16 1037
135. N. S. H. N. Moorthy S. F. Sousa M. J. Ramos P. A. Fernandes J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 2011 26 777
136. D. Chakrabarti T. Da Silva J. Barger S. Paquette H. Patel S. Patterson C. M. Allen J. Biol. Chem. 2002 277 42066
137. J. Wiesner K. Kettler J. Sakowski R. Ortmann A. Katzin E. Kimura K. Silber G. Klebe H. Jomaa M. Schlitzer Angew. Chem., Int. Ed. 2004 43 251
138. M. P. Glenn S. Y. Chang O. Hucke C. L. Verlinde K. Rivas C. Horney K. Yokoyama F. S. Buckner P. R. Pendyala D. Chakrabarti M. Gelb W. C. Van Voorhis S. M. Sebti A. D. Hamilton Angew. Chem., Int. Ed. 2005 44 4903
139. L. Nallan K. D. Bauer P. Bendale K. Rivas K. Yokoyama C. P. Horney P. R. Pendyala D. Floyd L. J. Lombardo D. K. Williams A. Hamilton S. Sebti W. T. Windsor P. C. Weber F. S. Buckner D. Chakrabarti M. H. Gelb W. C. Van Voorhis J. Med. Chem. 2005 48 3704
140. S. Fletcher C. G. Cummings K. Rivas W. P. Katt C. Horney F. S. Buckner D. Chakrabarti S. M. Sebti M. H. Gelb W. C. Van Voorhis A. D. Hamilton J. Med. Chem. 2008 51 5176
141. K. Kohring J. Wiesner M. Altenkamper J. Sakowski K. Silber A. Hillebrecht P. Haebel H. M. Dahse R. Ortmann H. Jomaa G. Klebe M. Schlitzer ChemMedChem 2008 3 1217
142. K. Yokoyama P. Trobridge F. S. Buckner W. C. Van Voorhis K. D. Stuart M. H. Gelb J. Biol. Chem. 1998 273 26497
143. F. S. Buckner K. Yokoyama L. Nguyen A. Grewal H. Erdjument-Bromage P. Tempst C. L. Strickland L. Xiao W. C. Van Voorhis M. H. Gelb J. Biol. Chem. 2000 275 21870
144. C. Panethymitaki P. W. Bowyer H. P. Price R. J. Leatherbarrow K. A. Brown D. F. Smith Biochem. J. 2006 396 277
145. S. B. Long P. J. Casey L. S. Beese Nature 2002 419 645
146. H. W. Park S. R. Boduluri J. F. Moomaw P. J. Casey L. S. Beese Science 1997 275 1800
147. A. D. Cox C. J. Der Curr. Opin. Pharmacol. 2002 2 388
148. E. K. Rowinsky J. Clin. Oncol. 2006 24 2981
149. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Biol. Inorg. Chem. 2005 10 3
150. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2005 729 125
151. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Comput. Chem. 2007 28 1160
152. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos Proteins 2007 66 205
153. M. A. S. Perez S. F. Sousa E. F. T. Oliveira P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Phys. Chem. B 2011 115 15339
154. Y. Yang D. K. Chakravorty K. M. Merz Biochemistry 2010 49 9658
155. G. Cui K. M. Merz Biochemistry 2007 46 12375
156. G. Cui B. Wang K. M. Merz, Jr. Biochemistry 2005 44 16513
157. M. H. Ho M. De Vivo M. Dal Peraro M. L. Klein J. Chem. Theor. Comput. 2009 5 1657
158. D. A. Tobin J. S. Pickett H. L. Hartman C. A. Fierke J. E. Penner-Hahn J. Am. Chem. Soc. 2003 125 9962
159. R. L. Rardin W. B. Tolman S. J. Lippard New J. Chem. 1991 15 417
160. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos Theor. Chem. Acc. 2007 117 171
161. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Phys. Chem. B 2008 112 8681
162. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos Bioorg. Med. Chem. 2009 17 3369
163. S. F. Sousa P. A. Fernandes M. J. Ramos Int. J. Quantum Chem. 2008 108 1939
164. E. F. Neufeld J. Biol. Chem. 1989 264 10927
165. Y. T. Li M. Y. Mazzotta C. C. Wan R. Orth S. C. Li J. Biol. Chem. 1973 248 7512
166. R. G. Korneluk D. J. Mahuran K. Neote M. H. Klavins B. F. Odowd M. Tropak H. F. Willard M. J. Anderson J. A. Lowden R. A. Gravel J. Biol. Chem. 1986 261 8407
167. R. Myerowitz F. C. Costigan J. Biol. Chem. 1988 263 18587
168. B. L. Mark D. J. Vocadlo S. Knapp B. L. Triggs-Raine S. G. Withers M. N. G. James J. Biol. Chem. 2001 276 10330
169. Y. He M. S. Macauley K. A. Stubbs D. J. Vocadlo G. J. Davies J. Am. Chem. Soc. 2010 132 1807
170. A. Bottoni G. P. Miscione M. Calvaresi Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 9568
171. T. Vreven K. Morokuma J. Comput. Chem. 2000 21 1419
172. S. Dapprich I. Komaromi K. S. Byun K. Morokuma M. J. Frisch J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1999 461 1
173. O. Passos P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Phys. Chem. B 2011 115 14751
174. O. Passos P. A. Fernandes M. J. Ramos Theor. Chem. Acc. 2011 129 119
175. G. Jones P. Willett R. C. Glen J. Mol. Biol. 1995 245 43
176. G. Jones P. Willett R. C. Glen A. R. Leach R. Taylor J. Mol. Biol. 1997 267 727
177. M. L. Verdonk J. C. Cole M. J. Hartshorn C. W. Murray R. D. Taylor Proteins 2003 52 609
178. D. L. Jakeman S. G. Withers Can. J. Chem. 2002 80 866
179. D. H. Juers R. H. Jacobson D. Wigley X. J. Zhang R. E. Huber D. E. Tronrud B. W. Matthews Protein Sci. 2000 9 1685
180. G. Perugino A. Trincone M. Rossi M. Moracci Trends Biotechnol. 2004 22 31
181. T. Maugard D. Gaunt M. D. Legoy T. Besson Biotechnol. Lett. 2003 25 623
182. D. H. Juers T. D. Heightman A. Vasella J. D. McCarter L. Mackenzie S. G. Withers B. W. Matthews Biochemistry 2001 40 14781
183. B. W. Matthews C. R. Biol. 2005 328 549
184. N. F. Bras P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Chem. Theor. Comput. 2010 6 421
185. N. F. Bras S. A. Moura-Tamames P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Comput. Chem. 2008 29 2565
186. J. P. Richard R. E. Huber C. Heo T. L. Amyes S. Lin Biochemistry 1996 35 12387
187. J. P. Richard R. E. Huber S. Lin C. Heo T. L. Amyes Biochemistry 1996 35 12377
188. M. D. Toney Arch. Biochem. Biophys. 2005 433 279
189. A. C. Eliot J. F. Kirsch Annu. Rev. Biochem. 2004 73 383
190. J. Thorndike T. T. Pelliniemi W. S. Beck Cancer Res. 1979 39 3435
191. C. C. Wang Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 1995 35 93
192. S. H. Mudd L. Laster J. D. Finkelstein F. Irreverre Science 1964 143 1443
193. E. F. Oliveira N. M. F. S. Cerqueira P. A. Fernandes M. J. Ramos J. Am. Chem. Soc. 2011 133 15496
194. M. J. S. Dewar E. G. Zoebisch E. F. Healy J. J. P. Stewart J. Am. Chem. Soc. 1985 107 3902
195. L. K. Jackson H. B. Brooks A. L. Osterman E. J. Goldsmith M. A. Phillips Biochemistry 2000 39 11247
196. A. Osterman N. V. Grishin L. N. Kinch M. A. Phillips Biochemistry 1994 33 13662
197. C. S. Coleman B. A. Stanley A. E. Pegg J. Biol. Chem. 1993 268 24572
198. S. Piana D. Bucher P. Carloni U. Rothlisberger J. Phys. Chem. B 2004 108 11139
199. M. Sulpizi A. Laio J. VandeVondele A. Cattaneo U. Rothlisberger P. Carloni Proteins 2003 52 212