Light-controlled tools

Angewandte Chemie - International Edition

Volumn 51, Issue 34, 2012, Pages 8446-8476

  Brieke, Clara ^a   Rohrbach, Falk ^c   Gottschalk, Alexander ^b   Mayer, Günter ^c   Heckel, Alexander ^a  

^a GOETHE UNIVERSITY   (Germany)

^b Buchmann Institute for Molecular Life Sciences   (Germany)

^c UNIVERSITY OF BONN   (Germany)

Author keywords

bioorganic chemistry; caged compounds; optogenetics; photochemistry; photoswitches

Indexed keywords

BIOLOGICAL PROCESS; BIOORGANIC CHEMISTRY; CAGED COMPOUNDS; LIVING SYSTEMS; OPTOGENETICS; PHOTOCLEAVAGES; PHOTOSWITCHES; PHOTOSWITCHING; TEMPORAL CONTROLS; WELL-ESTABLISHED TECHNIQUES;

BIOCHEMISTRY; BIOLOGICAL SYSTEMS; PHOTOCHEMICAL REACTIONS;

EXPERIMENTS;

INSTRUMENTATION; METHODOLOGY; OPTOGENETICS; ORGANIC CHEMISTRY; PHOTOCHEMISTRY; REVIEW;

CHEMISTRY, ORGANIC; OPTOGENETICS; PHOTOCHEMISTRY;

EID: 84865101790     PISSN: 14337851     EISSN: 15213773     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/anie.201202134     Document Type: Review

References (448)

1. G. Mayer, A. Heckel, Angew. Chem. 2006, 118, 5020-5042
2. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 4900-4921.
3. U. Krauss, T. Drepper, K.-E. Jäger, Chem. Eur. J. 2011, 17, 2552-2560.
4. T. Drepper, U. Krauss, S. Meyer zu Berstenhorst, J. Pietruszka, K.-E. Jäger, Appl. Microbiol. Biotechnol. 2011, 90, 23-40.
5. S. Silvi, M. Venturi, A. Credi, Chem. Commun. 2011, 47, 2483-2489.
6. A. A. Beharry, G. A. Woolley, Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 4422-4437.
7. F. Erdmann, Y. Zhang, Mol. BioSyst. 2010, 6, 2103-2109.
8. A. Deiters, ChemBioChem 2010, 11, 47-53.
9. A. Specht, F. Bolze, Z. Omran, J.-F. Nicoud, M. Goeldner, HFSP J. 2009, 3, 255-264.
10. H.-M. Lee, D. R. Larson, D. S. Lawrence, ACS Chem. Biol. 2009, 4, 409-427.
11. R. H. Kramer, D. L. Fortin, D. Trauner, Curr. Opin. Neurobiol. 2009, 19, 544-552.
12. G. C. R. Ellis-Davies, Nat. Methods 2007, 4, 619-628.
13. W. R. Browne, B. L. Feringa, Nat. Nanotechnol. 2006, 1, 25-35.
14. J. H. Kaplan, B. Forbush III, J. F. Hoffman, Biochemistry 1978, 17, 1929-1935.
15. J. Engels, E.-J. Schlaeger, J. Med. Chem. 1977, 20, 907-911.
16. H. Lusic, A. Deiters, Synthesis 2006, 13, 2147-2150.
17. L. Kammari, T. Šolomek, B. P. Ngoy, D. Heger, P. Klán, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 11431-11433.
18. W. R. Zipfel, R. M. Williams, W. W. Webb, Nat. Biotechnol. 2003, 21, 1369-1377.
19. C. N. LaFratta, J. T. Fourkas, T. Baldacchini, R. A. Farrer, Angew. Chem. 2007, 119, 6352-6374
20. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 6238-6258.
21. M. Matsuzaki, G. C. R. Ellis-Davies, T. Nemoto, Y. Miyashita, M. Iino, H. Kasai, Nat. Neurosci. 2001, 4, 1086-1092.
22. G. C. R. Ellis-Davies, ACS Chem. Neurosci. 2011, 2, 185-197.
23. D. Warther, S. Gug, A. Specht, F. Bolze, J.-F. Nicoud, A. Mourot, M. Goeldner, Bioorg. Med. Chem. 2010, 18, 7753-7758.
24. S. Kantevari, C. J. Hoang, J. Ogrodnik, M. Egger, E. Niggli, G. C. R. Ellis-Davies, ChemBioChem 2006, 7, 174-180.
25. A. Momotake, N. Lindegger, E. Niggli, R. J. Barsotti, G. C. R. Ellis-Davies, Nat. Methods 2006, 3, 35-40.
26. M. Matsuzaki, T. Hayama, H. Kasai, G. C. R. Ellis-Davies, Nat. Chem. Biol. 2010, 6, 255-257.
27. X. Tang, S. Maegawa, E. S. Weinberg, I. J. Dmochowski, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 11000-11001.
28. O. D. Fedoryak, T. M. Dore, Org. Lett. 2002, 4, 3419-3422.
29. M. Lu, O. D. Fedoryak, B. R. Moister, T. M. Dore, Org. Lett. 2003, 5, 2119-2122.
30. Y. Zhu, C. M. Pavlos, J. P. Toscano, T. M. Dore, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 4267-4276.
31. N. Gagey, P. Neveu, L. Jullien, Angew. Chem. 2007, 119, 2519-2521
32. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 2467-2469.
33. N. Gagey, P. Neveu, C. Benbrahim, B. Goetz, I. Aujard, J.-B. Baudin, L. Jullien, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 9986-9998.
34. A. Specht, J.-S. Thomann, K. Alarcon, W. Wittayanan, D. Ogden, T. Furuta, Y. Kurakawa, M. Goeldner, ChemBioChem 2006, 7, 1690-1695.
35. S. Gug, S. Charon, A. Specht, K. Alarcon, D. Ogden, B. Zietz, J. Leonard, S. Haacke, F. Bolze, J.-F. Nicoud, M. Goeldner, ChemBioChem 2008, 9, 1303-1307.
36. S. Gug, F. Bolze, A. Specht, C. Bourgogne, M. Goeldner, J.-F. Nicoud, Angew. Chem. 2008, 120, 9667-9671
37. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 9525-9529.
38. D. Warther, F. Bolze, J. Leonard, S. Gug, A. Specht, D. Puliti, X.-H. Sun, P. Kessler, Y. Lutz, J.-L. Vonesch, B. Winsor, J.-F. Nicoud, M. Goeldner, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 2585-2590.
39. L. Donato, A. Mourot, C. M. Davenport, C. Herbivo, D. Warther, J. Léonard, F. Bolze, J.-F. Nicoud, R. H. Kramer, M. Goeldner, A. Specht, Angew. Chem. 2012, 124, 1876-1879
40. Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 1840-1843.
41. N. Kotzur, B. Briand, M. Beyermann, V. Hagen, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 16927-16931.
42. M. Goeldner, R. Givens, Dynamic Studies in Biology: Phototriggers, Photoswitches and Caged Biomolecules, Wiley-VCH, Weinheim, 2005.
43. J. Noguchi, A. Nagaoka, S. Watanabe, G. C. R. Ellis-Davies, K. Kitamura, M. Kano, M. Matsuzaki, H. Kasai, J. Physiol. 2011, 589, 2447-2457.
44. D. K. Sinha, P. Neveu, N. Gagey, I. Aujard, C. Benbrahim-Bouzidi, T. Le Saux, C. Rampon, C. Gauron, B. Goetz, S. Dubruille, M. Baaden, M. Volovitch, D. Bensimon, S. Vriz, L. Jullien, ChemBioChem 2010, 11, 653-663.
45. P. Neveu, I. Aujard, C. Benbrahim, T. Le Saux, J.-F. Allemand, S. Vriz, D. Bensimon, L. Jullien, Angew. Chem. 2008, 120, 3804-3806
46. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 3744-3746.
47. A. Shigenaga, J. Yamamoto, Y. Sumikawa, T. Furuta, A. Otaka, Tetrahedron Lett. 2010, 51, 2868-2871.
48. G. C. R. Ellis-Davies, M. Matsuzaki, M. Paukert, H. Kasai, D. E. Bergles, J. Neurosci. 2007, 27, 6601-6604.
49. S. Kantevari, Y. Buskila, G. C. R. Ellis-Davies, Photochem. Photobiol. Sci. 2012, 11, 508-513.
50. M. J. Davis, C. H. Kragor, K. G. Reddie, H. C. Wilson, Y. Zhu, T. M. Dore, J. Org. Chem. 2009, 74, 1721-1729.
51. M. C. Pirrung, T. M. Dore, Y. Zhu, V. S. Rana, Chem. Commun. 2010, 46, 5313-5315.
52. D. Wöll, J. Smirnova, W. Pfleiderer, U. E. Steiner, Angew. Chem. 2006, 118, 3042-3045
53. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 2975-2978.
54. D. Wöll, S. Laimgruber, M. Galetskaya, J. Smirnova, W. Pfleiderer, B. Heinz, P. Gilch, U. E. Steiner, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 12148-12158.
55. G. Papageorgiou, M. Lukeman, P. Wan, J. E. T. Corrie, Photochem. Photobiol. Sci. 2004, 3, 366-373.
56. G. Papageorgiou, D. Ogden, J. E. T. Corrie, J. Org. Chem. 2004, 69, 7228-7233.
57. K. Dakin, W. Li, Nat. Methods 2006, 3, 959.
58. Y. Zhao, Q. Zheng, K. Dakin, K. Xu, M. L. Martinez, W.-H. Li, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 4653-4663.
59. C. Orange, A. Specht, D. Puliti, E. Sakr, T. Furuta, B. Winsor, M. Goeldner, Chem. Commun. 2008, 1217-1219.
60. M. San, M. Alvarez, O. Filevich, R. Etchenique, A. del Campo, Langmuir 2012, 28, 1217-1221.
61. I. Aujard, C. Benbrahim, M. Gouget, O. Ruel, J.-B. Baudin, P. Neveu, L. Jullien, Chem. Eur. J. 2006, 12, 6865-6879.
62. C. G. Bochet, Tetrahedron Lett. 2000, 41, 6341-6346.
63. C. G. Bochet, Angew. Chem. 2001, 113, 2140-2142
64. Angew. Chem. Int. Ed. 2001, 40, 2071-2073.
65. A. Blanc, C. G. Bochet, J. Org. Chem. 2002, 67, 5567-5577.
66. M. Kessler, R. Glatthar, B. Giese, C. G. Bochet, Org. Lett. 2003, 5, 1179-1181.
67. A. Blanc, C. G. Bochet, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 7174-7175.
68. A. Blanc, C. G. Bochet, Org. Lett. 2007, 9, 2649-2651.
69. C. G. Bochet, Synlett 2004, 2268-2274.
70. C. G. Bochet, Pure Appl. Chem. 2006, 78, 241-247.
71. A. del Campo, D. Boos, H. W. Spiess, U. Jonas, Angew. Chem. 2005, 117, 4785-4791
72. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 4707-4712.
73. P. Stegmaier, J. M. Alonso, A. del Campo, Langmuir 2008, 24, 11872-11879.
74. P. Wang, Y. Wang, H. Hu, C. Spencer, X. Liang, L. Pan, J. Org. Chem. 2008, 73, 6152-6157.
75. S. Kantevari, M. Matsuzaki, Y. Kanemoto, H. Kasai, G. C. R. Ellis-Davies, Nat. Methods 2010, 7, 123-125.
76. M. A. Priestman, L. Sun, D. S. Lawrence, ACS Chem. Biol. 2011, 6, 377-384.
77. F. Schäfer, K. B. Joshi, M. A. H. Fichte, T. Mack, J. Wachtveitl, A. Heckel, Org. Lett. 2011, 13, 1450-1453.
78. C. Menge, A. Heckel, Org. Lett. 2011, 13, 4620-6423.
79. M. San, C. G. Bochet, A. del Campo, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 5380-5388.
80. D. D. Young, A. Deiters, Angew. Chem. 2007, 119, 4368-4370
81. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 4290-4292.
82. S. B. Cambridge, D. Geissler, F. Calegari, K. Anastassiadis, M. T. Hasan, A. F. Stewart, W. B. Huttner, V. Hagen, T. Bonhoeffer, Nat. Methods 2009, 6, 527-531.
83. S. B. Cambridge, D. Geissler, S. Keller, B. Cürten, Angew. Chem. 2006, 118, 2287-2289
84. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 2229-2231.
85. D. J. Sauers, M. K. Temburni, J. B. Biggins, L. M. Ceo, D. S. Galileo, J. T. Koh, ACS Chem. Biol. 2010, 5, 313-320.
86. D. D. Young, R. A. Garner, J. A. Yoder, A. Deiters, Chem. Commun. 2009, 568-570.
87. B. Wulffen, M. C. R. Buff, M. Pofahl, G. Mayer, A. Heckel, Photochem. Photobiol. Sci. 2012, 11, 489-492.
88. A. Nomura, T. Q. P. Uyeda, N. Yumoto, Y. Tatsu, Chem. Commun. 2006, 3588-3590.
89. B. Asrican, J. Lisman, N. Otmakhov, J. Neurosci. 2007, 27, 14007-14011.
90. G. M. Shankar, B. L. Bloodgood, M. Townsend, D. M. Walsh, D. J. Selkoe, B. L. Sabatini, J. Neurosci. 2007, 27, 2866-2875.
91. Y.-P. Zhang, N. Holbro, T. G. Oertner, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 12039-12044.
92. M. Heine, L. Groc, R. Frischknecht, J.-C. Beique, B. Lounis, G. Rumbaugh, R. L. Huganir, L. Cognet, D. Choquet, Science 2008, 320, 201-205.
93. R. J. Richardson, J. A. Blundon, I. T. Bayazitov, S. S. Zakharenko, J. Neurosci. 2009, 29, 6406-6417.
94. S. Remy, J. Csicsvari, H. Beck, Neuron 2009, 61, 906-916.
95. G. C. R. Ellis-Davies, Nat. Protoc. 2011, 6, 314-326.
96. M. Matsuzaki, G. C. R. Ellis-Davies, H. Kasai, J. Neurophysiol. 2008, 99, 1535-1544.
97. J. Zhao, T. D. Gover, S. Muralidharan, D. A. Auston, D. Weinreich, J. P. Y. Kao, Biochemistry 2006, 45, 4915-4926.
98. D. Gilbert, K. Funk, B. Dekowski, R. Lechler, S. Keller, F. Mohrlen, S. Frings, V. Hagen, ChemBioChem 2007, 8, 89-97.
99. T. Strünker, I. Weyand, W. Bonigk, Q. Van, A. Loogen, J. E. Brown, N. Kashikar, V. Hagen, E. Krause, U. B. Kaupp, Nat. Cell Biol. 2006, 8, 1149-1154.
100. S. Kantevari, G. R. J. Gordon, B. A. MacVicar, G. C. R. Ellis-Davies, Nat. Protoc. 2011, 6, 327-337.
101. G. R. J. Gordon, K. J. Iremonger, S. Kantevari, G. C. R. Ellis-Davies, B. A. MacVicar, J. S. Bains, Neuron 2009, 64, 391-403.
102. D. Subramanian, V. Laketa, R. Müller, C. Tischer, S. Zarbakhsh, R. Pepperkok, C. Schultz, Nat. Chem. Biol. 2010, 6, 324-326.
103. M. Mentel, V. Laketa, D. Subramanian, H. Gillandt, C. Schultz, Angew. Chem. 2011, 123, 3895-3898
104. Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 3811-3814.
105. E. J. Quann, E. Merino, T. Furuta, M. Huse, Nat. Immunol. 2009, 10, 627-635.
106. G. C. R. Ellis-Davies, Chem. Rev. 2008, 108, 1603-1613.
107. Y. A. Kim, D. M. C. Ramirez, W. J. Costain, L. J. Johnston, R. Bittman, Chem. Commun. 2011, 47, 9236-9238.
108. R. S. Lankalapalli, A. Ouro, L. Arana, A. Gõmez-Muñoz, R. Bittman, J. Org. Chem. 2009, 74, 8844-8847.
109. O. Sadovski, A. S. I. Jaikaran, S. Samanta, M. R. Fabian, R. J. O. Dowling, N. Sonenberg, G. A. Woolley, Bioorg. Med. Chem. 2010, 18, 7746-7752.
110. N. Umeda, T. Ueno, C. Pohlmeyer, T. Nagano, T. Inoue, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 12-14.
111. A. V. Karginov, Y. Zou, D. Shirvanyants, P. Kota, N. V. Dokholyan, D. D. Young, K. M. Hahn, A. Deiters, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 420-423.
112. J. B. Biggins, A. Hashimoto, J. T. Koh, ChemBioChem 2007, 8, 799-803.
113. F. Kilic, N. D. Kashikar, R. Schmidt, L. Alvarez, L. Dai, I. Weyand, B. Wiesner, N. Goodwin, V. Hagen, U. B. Kaupp, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 4027-4030.
114. K. Hishikawa, H. Nakagawa, T. Furuta, K. Fukuhara, H. Tsumoto, T. Suzuki, N. Miyata, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 7488-7489.
115. E. W. Miller, N. Taulet, C. S. Onak, E. J. New, J. K. Lanselle, G. S. Smelick, C. J. Chang, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 17071-17073.
116. D. Arian, L. Kovbasyuk, A. Mokhir, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 3972-3980.
117. Z. Dai, N. G. Dulyaninova, S. Kumar, A. R. Bresnick, D. S. Lawrence, Chem. Biol. 2007, 14, 1254-1260.
118. H.-M. Lee, W. Xu, D. S. Lawrence, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 2331-2333.
119. T. Muraoka, C.-Y. Koh, H. Cui, S. I. Stupp, Angew. Chem. 2009, 121, 6060-6063
120. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 5946-5949.
121. S. Petersen, J. M. Alonso, A. Specht, P. Duodu, M. Goeldner, A. del Campo, Angew. Chem. 2008, 120, 3236-3239
122. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 3192-3195.
123. C. Goubko, S. Majumdar, A. Basak, X. Cao, Biomed. Microdevices 2010, 12, 555-568.
124. S. Mizukami, M. Hosoda, T. Satake, S. Okada, Y. Hori, T. Furuta, K. Kikuchi, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 9524-9525.
125. T. Kuner, Y. Li, K. R. Gee, L. F. Bonewald, G. J. Augustine, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 347-352.
126. L. L. Parker, J. W. Kurutz, S. B. H. Kent, S. J. Kron, Angew. Chem. 2006, 118, 6470-6473
127. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 6322-6325.
128. M. Toebes, M. Coccoris, A. Bins, B. Rodenko, R. Gomez, N. J. Nieuwkoop, W. van de Kasteele, G. F. Rimmelzwaan, J. B. A. G. Haanen, H. Ovaa, T. N. M. Schumacher, Nat. Med. 2006, 12, 246-251.
129. M. Bhagawati, S. Lata, R. Tampe, J. Piehler, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 5932-5933.
130. H. Li, J.-M. Hah, D. S. Lawrence, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10474-10475.
131. K. Katayama, S. Tsukiji, T. Furuta, T. Nagamune, Chem. Commun. 2008, 5399-5401.
132. M. J. Tucker, J. R. Courter, J. Chen, O. Atasoylu, A. B. Smith, R. M. Hochstrasser, Angew. Chem. 2010, 122, 3694-3698
133. Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 3612-3616.
134. C. C. Liu, P. G. Schultz, Annu. Rev. Biochem. 2010, 79, 413-444.
135. A. Deiters, D. Groff, Y. Ryu, J. Xie, P. G. Schultz, Angew. Chem. 2006, 118, 2794-2797
136. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 2728-2731.
137. C. Chou, D. D. Young, A. Deiters, Angew. Chem. 2009, 121, 6064-6067
138. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 5950-5953.
139. W. F. Edwards, D. D. Young, A. Deiters, ACS Chem. Biol. 2009, 4, 441-445.
140. C. Chou, D. D. Young, A. Deiters, ChemBioChem 2010, 11, 972-977.
141. C. Chou, A. Deiters, Angew. Chem. 2011, 123, 6971-6974
142. Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 6839-6842.
143. A. Gautier, A. Deiters, J. W. Chin, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 2124-2127.
144. A. Gautier, D. P. Nguyen, H. Lusic, W. An, A. Deiters, J. W. Chin, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 4086-4088.
145. E. A. Lemke, D. Summerer, B. H. Geierstanger, S. M. Brittain, P. G. Schultz, Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 769-772.
146. B. J. Wilkins, S. Marionni, D. D. Young, J. Liu, Y. Wang, S. Di, A. Deiters, T. A. Cropp, Biochemistry 2010, 49, 1557-1559.
147. C. Ludwig, D. Schwarzer, H. D. Mootz, J. Biol. Chem. 2008, 283, 25264-25272.
148. M. Vila-Perellõ, Y. Hori, M. Ribõ, T. W. Muir, Angew. Chem. 2008, 120, 7878-7881
149. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 7764-7767.
150. L. Berrade, Y. Kwon, J. A. Camarero, ChemBioChem 2010, 11, 1368-1372.
151. J. Binschik, J. Zettler, H. D. Mootz, Angew. Chem. 2011, 123, 3307-3310
152. Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 3249-3252.
153. S. Banala, D. Maurel, S. Manley, K. Johnsson, ACS Chem. Biol. 2012, 7, 289-293.
154. C. Campos, M. Kamiya, S. Banala, K. Johnsson, M. González- Gaitán, Dev. Dyn. 2011, 240, 820-827.
155. D. Maurel, S. Banala, T. Laroche, K. Johnsson, ACS Chem. Biol. 2010, 5, 507-516.
156. R. K. McGinty, J. Kim, C. Chatterjee, R. G. Roeder, T. W. Muir, Nature 2008, 453, 812-816.
157. C. Chatterjee, R. K. McGinty, J.-P. Pellois, T. W. Muir, Angew. Chem. 2007, 119, 2872-2876
158. Angew. Chem. Int. Ed. 2007, 46, 2814-2818.
159. A. Aemissegger, C. N. Carrigan, B. Imperiali, Tetrahedron 2007, 63, 6185-6190.
160. B. N. Goguen, A. Aemissegger, B. Imperiali, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 11038-11041.
161. B. N. Goguen, B. D. Hoffman, J. R. Sellers, M. A. Schwartz, B. Imperiali, Angew. Chem. 2011, 123, 5785-5788
162. Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 5667-5670.
163. A. Rodrigues-Correia, M. B. Koeppel, F. Schäfer, K. B. Joshi, T. Mack, A. Heckel, Anal. Bioanal. Chem. 2011, 399, 441-447.
164. S. G. Chaulk, A. M. MacMillan, Nat. Protoc. 2007, 2, 1052-1058.
165. I. J. Dmochowski, X. Tang, BioTechniques 2007, 43, 161-171.
166. X. Tang, I. J. Dmochowski, Mol. BioSyst. 2007, 3, 100-110.
167. A. Deiters, Curr. Opin. Chem. Biol. 2009, 13, 678-686.
168. J. P. Casey, R. A. Blidner, W. T. Monroe, Mol. Pharm. 2009, 6, 669-685.
169. L. M. Ceo, J. T. Koh, ChemBioChem 2012, 13, 511-513.
170. V. Mikat, A. Heckel, RNA 2007, 13, 2341-2347.
171. S. Shah, S. Rangarajan, S. H. Friedman, Angew. Chem. 2005, 117, 1352-1356
172. Angew. Chem. Int. Ed. 2005, 44, 1328-1332.
173. S. Shah, S. H. Friedman, Oligonucleotides 2007, 17, 35-43.
174. S. Shah, P. K. Jain, A. Kala, D. Karunakaran, S. H. Friedman, Nucleic Acids Res. 2009, 37, 4508-4517.
175. P. K. Jain, S. Shah, S. H. Friedman, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 440-446.
176. A. Kala, S. H. Friedman, Pharm. Res. 2011, 28, 3050-3057.
177. R. A. Blidner, K. R. Svoboda, R. P. Hammer, W. T. Monroe, Mol. BioSyst. 2008, 4, 431-440.
178. Q. N. Nguyen, R. V. Chavli, J. T. Marques, P. G. Conrad II, D. Wang, W. He, B. E. Belisle, A. Zhang, L. M. Pastor, F. R. Witney, M. Morris, F. Heitz, G. Divita, B. R. G. Williams, G. K. McMaster, Biochim. Biophys. Acta Biomembr. 2006, 1758, 394-403.
179. X. Tang, I. J. Dmochowski, Nat. Protoc. 2007, 1, 3041-3048.
180. X. Tang, I. J. Dmochowski, Angew. Chem. 2006, 118, 3603-3606
181. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 3523-3526.
182. X. Tang, J. Swaminathan, A. M. Gewirtz, I. J. Dmochowski, Nucleic Acids Res. 2008, 36, 559-569.
183. A. Rotaru, J. Kovacs, A. Mokhir, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 4336-4338.
184. D. D. Young, H. Lusic, M. O. Lively, J. A. Yoder, A. Deiters, ChemBioChem 2008, 9, 2937-2940.
185. J. M. Govan, A. L. McIver, A. Deiters, Bioconjugate Chem. 2011, 22, 2136-2142.
186. I. A. Shestopalov, S. Sinha, J. K. Chen, Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 650-651.
187. X. Ouyang, I. A. Shestopalov, S. Sinha, G. Zheng, C. L. W. Pitt, W.-H. Li, A. J. Olson, J. K. Chen, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 13255-13269.
188. I. A. Shestopalov, J. K. Chen, Methods Cell Biol. 2011, 104, 151-172.
189. A. Deiters, R. A. Garner, H. Lusic, J. M. Govan, M. Dush, N. M. Nascone-Yoder, J. A. Yoder, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 15644-15650.
190. G. Zheng, L. Cochella, J. Liu, O. Hobert, W. Li, ACS Chem. Biol. 2011, 6, 1332-1338.
191. J. M. Govan, M. O. Lively, A. Deiters, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 13176-13182.
192. S. Yamaguchi, Y. Chen, S. Nakajima, T. Furuta, T. Nagamune, Chem. Commun. 2010, 46, 2244-2246.
193. J. L. Richards, X. Tang, A. Turetsky, I. J. Dmochowski, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 6255-6258.
194. M. Famulok, J. S. Hartig, G. Mayer, Chem. Rev. 2007, 107, 3715-3743.
195. A. Heckel, G. Mayer, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 822-823.
196. P. Jayapal, G. Mayer, A. Heckel, F. Wennmohs, J. Struct. Biol. 2009, 166, 241-250.
197. Y. Li, J. Shi, Z. Luo, H. Jiang, X. Chen, F. Wang, X. Wu, Q. Guo, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 5368-5371.
198. Y. M. Li, J. Shi, R. Cai, X. Chen, Z. F. Luo, Q. X. Guo, J. Photochem. Photobiol. A 2010, 211, 129-134.
199. A. Heckel, M. C. R. Buff, M. L. Raddatz, J. Müller, B. Pötzsch, G. Mayer, Angew. Chem. 2006, 118, 6900-6902
200. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 6748-6750.
201. M. C. R. Buff, F. Schäfer, B. Wulffen, J. Müller, B. Pötzsch, A. Heckel, G. Mayer, Nucleic Acids Res. 2010, 38, 2111-2118.
202. G. Mayer, A. Lohberger, S. Butzen, M. Pofahl, M. Blind, A. Heckel, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 6561-6564.
203. G. Mayer, J. Müller, T. Mack, D. F. Freitag, T. Höver, B. Pötzsch, A. Heckel, ChemBioChem 2009, 10, 654-657.
204. A. Pinto, S. Lennarz, A. Rodrigues-Correia, A. Heckel, C. K. O'Sullivan, G. Mayer, ACS Chem. Biol. 2012, 7, 360-366.
205. A. Marx, O. Seitz, Molecular Beacons, Springer, Berlin, 2008.
206. C. Wang, Z. Zhu, Y. Song, H. Lin, C. J. Yang, W. Tan, Chem. Commun. 2011, 47, 5708-5710.
207. K. B. Joshi, A. Vlachos, V. Mikat, T. Deller, A. Heckel, Chem. Commun. 2012, 48, 2746-2748.
208. K. Furukawa, H. Abe, S. Tsuneda, Y. Ito, Org. Biomol. Chem. 2010, 8, 2309-2311.
209. M. L. Metzker, Genome Res. 2005, 15, 1767-1776.
210. W. Wu, B. P. Stupi, V. A. Litosh, D. Mansouri, D. Farley, S. Morris, S. Metzker, M. L. Metzker, Nucleic Acids Res. 2007, 35, 6339-6349.
211. V. A. Litosh, W. Wu, B. P. Stupi, J. Wang, S. E. Morris, M. N. Hersh, M. L. Metzker, Nucleic Acids Res. 2011, 39, e 39.
212. B. P. Stupi, H. Li, J. Wang, W. Wu, S. E. Morris, V. A. Litosh, J. Muniz, M. N. Hersh, M. L. Metzker, Angew. Chem. 2012, 124, 1756-1759
213. Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 1724-1727.
214. K. Tanaka, H. Katada, N. Shigi, A. Kuzuya, M. Komiyama, ChemBioChem 2008, 9, 2120-2126.
215. K. Tanaka, A. Kuzuya, M. Komiyama, Chem. Lett. 2008, 37, 584-585.
216. A. Kuzuya, F. Okada, M. Komiyama, Bioconjugate Chem. 2009, 20, 1924-1929.
217. A. Kuzuya, K. Tanaka, H. Katada, M. Komiyama, Molecules 2011, 17, 328-340.
218. D. D. Young, H. Lusic, M. O. Lively, A. Deiters, Nucleic Acids Res. 2009, 37, e 58 /1-e 58 /8.
219. D. D. Young, W. F. Edwards, H. Lusic, M. O. Lively, A. Deiters, Chem. Commun. 2008, 462-464.
220. D. D. Young, A. Deiters, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006, 16, 2658-2661.
221. H. Lusic, D. D. Young, M. O. Lively, A. Deiters, Org. Lett. 2007, 9, 1903-1906.
222. H. Lusic, M. O. Lively, A. Deiters, Mol. BioSyst. 2008, 4, 508-511.
223. D. D. Young, M. O. Lively, A. Deiters, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 6183-6193.
224. J. L. Richards, G. K. Seward, Y.-H. Wang, I. J. Dmochowski, ChemBioChem 2010, 11, 320-324.
225. A. Nierth, M. Singer, A. Jäschke, Chem. Commun. 2010, 46, 7975-7977.
226. B. Fürtig, C. Richter, P. Schell, P. Wenter, S. Pitsch, H. Schwalbe, RNA Biol. 2008, 5, 41-48.
227. P. Wenter, B. Fürtig, A. Hainard, H. Schwalbe, S. Pitsch, ChemBioChem 2006, 7, 417-420.
228. B. Fürtig, P. Wenter, L. Reymond, C. Richter, S. Pitsch, H. Schwalbe, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 16222-16229.
229. B. Fürtig, J. Buck, V. Manoharan, W. Bermel, A. Jaeschke, P. Wenter, S. Pitsch, H. Schwalbe, Biopolymers 2007, 86, 360-383.
230. B. Fürtig, P. Wenter, S. Pitsch, H. Schwalbe, ACS Chem. Biol. 2010, 5, 753-765.
231. N. C. Seeman, Annu. Rev. Biochem. 2010, 79, 65-87.
232. A. K. Mok, N. A. Kedzierski, P. N. Chung, P. S. Lukeman, Chem. Commun. 2011, 47, 4905-4907.
233. T. L. Schmidt, M. B. Koeppel, J. Thevarpadam, D. P. N. Gonçalves, A. Heckel, Small 2011, 7, 2163-2167.
234. M.-M. Russew, S. Hecht, Adv. Mater. 2010, 22, 3348-3360.
235. D. Bléger, Z. Yu, S. Hecht, Chem. Commun. 2011, 47, 12260-12266.
236. H. Duerr, H. Bouas-Laurent, Photochromism: Molecules and Systems, rev. ed., Elsevier, 2003.
237. Y. Hirshberg, C. R. Hebd. Seances Acad. Sci. 1950, 231, 903-904.
238. J. Griffiths, Chem. Soc. Rev. 1972, 1, 481-493.
239. H. Rau, in Photochromism: Molecules and Systems, rev. ed., (Eds.: H. Dürr, H. Bouas-Laurent,), Elsevier, Amsterdam, 2003.
240. D. J. W. Bullock, C. W. N. Cumper, A. I. Vogel, J. Chem. Soc. 1965, 5316-5323.
241. D. A. James, D. C. Burns, G. A. Woolley, Protein Eng. 2001, 14, 983-991.
242. N. Pozhidaeva, M.-E. Cormier, A. Chaudhari, G. A. Woolley, Bioconjugate Chem. 2004, 15, 1297-1303.
243. N. Nishimura, T. Tanaka, M. Asano, Y. Sueishi, J. Chem. Soc. Perkin Trans. 2 1986, 1839-1845.
244. W. R. Brode, J. H. Gould, G. M. Wyman, J. Am. Chem. Soc. 1953, 75, 1856-1859.
245. K. S. Schanze, T. F. Mattox, D. G. Whitten, J. Org. Chem. 1983, 48, 2808-2813.
246. L. Chi, O. Sadovski, G. A. Woolley, Bioconjugate Chem. 2006, 17, 670-676.
247. W. A. Sokalski, R. W. Gõra, W. Bartkowiak, P. Kobylin'ski, J. Sworakowski, A. Chyla, J. Leszczyn'ski, J. Chem. Phys. 2001, 114, 5504-5508.
248. N. Nishimura, T. Sueyoshi, H. Yamanaka, E. Imai, S. Yamamoto, S. Hasegawa, Bull. Chem. Soc. Jpn. 1976, 49, 1381-1387.
249. A. A. Beharry, O. Sadovski, G. A. Woolley, Org. Biomol. Chem. 2008, 6, 4323-4332.
250. H. Nishioka, X. Liang, H. Kashida, H. Asanuma, Chem. Commun. 2007, 4354-4356.
251. O. Sadovski, A. A. Beharry, F. Zhang, G. A. Woolley, Angew. Chem. 2009, 121, 1512-1514
252. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 1484-1486.
253. H. Asanuma, X. Liang, M. Komiyama, Tetrahedron Lett. 2000, 41, 1055-1058.
254. R. Behrendt, C. Renner, M. Schenk, F. Wang, J. Wachtveitl, D. Oesterhelt, L. Moroder, Angew. Chem. 1999, 111, 2941-2943
255. Angew. Chem. Int. Ed. 1999, 38, 2771-2774.
256. K. Rueck-Braun, S. Kempa, B. Priewisch, A. Richter, S. Seedorff, L. Wallach, Synthesis 2009, 4256-4267.
257. A. A. Beharry, O. Sadovski, G. A. Woolley, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 19684-19687.
258. A. Meister, M. E. Anderson, Annu. Rev. Biochem. 1983, 52, 711-760.
259. C. Boulègue, M. Löweneck, C. Renner, L. Moroder, ChemBioChem 2007, 8, 591-594.
260. R. F. Standaert, S. B. Park, J. Org. Chem. 2006, 71, 7952-7966.
261. A. A. Beharry, L. Wong, V. Tropepe, G. A. Woolley, Angew. Chem. 2011, 123, 1361-1363
262. Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 1325-1327.
263. U. Kusebauch, S. A. Cadamuro, H.-J. Musiol, M. O. Lenz, J. Wachtveitl, L. Moroder, C. Renner, Angew. Chem. 2006, 118, 7170-7173
264. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 7015-7018.
265. F. Zhang, O. Sadovski, G. A. Woolley, ChemBioChem 2008, 9, 2147-2154.
266. S. Samanta, G. A. Woolley, ChemBioChem 2011, 12, 1712-1723.
267. D. Bléger, J. Dokic, M. Peters, L. Grubert, P. Saalfrank, S. Hecht, J. Phys. Chem. B 2011, 115, 9930-9940.
268. F. Cisnetti, R. Ballardini, A. Credi, M. T. Gandolfi, S. Masiero, F. Negri, S. Pieraccini, G. P. Spada, Chem. Eur. J. 2004, 10, 2011-2021.
269. D. H. Waldeck, Chem. Rev. 1991, 91, 415-436.
270. T. Lougheed, V. Borisenko, T. Hennig, K. Rueck-Braun, G. A. Woolley, Org. Biomol. Chem. 2004, 2, 2798-2801.
271. T. Yamaguchi, T. Seki, T. Tamaki, K. Ichimura, Bull. Chem. Soc. Jpn. 1992, 65, 649-656.
272. T. Seki, T. Tamaki, T. Yamaguchi, K. Ichimura, Bull. Chem. Soc. Jpn. 1992, 65, 657-663.
273. S. Herre, W. Steinle, K. Rueck-Braun, Synthesis 2005, 3297-3300.
274. T. Schadendorf, C. Hoppmann, K. Rueck-Braun, Tetrahedron Lett. 2007, 48, 9044-9047.
275. T. Cordes, C. Elsner, T. T. Herzog, C. Hoppmann, T. Schadendorf, W. Summerer, K. Rueck-Braun, W. Zinth, Chem. Phys. 2009, 358, 103-110.
276. M. Erdélyi, M. Varedian, C. Skold, I. B. Niklasson, J. Nurbo, A. Persson, J. Bergquist, A. Gogoll, Org. Biomol. Chem. 2008, 6, 4356-4373.
277. M. Varedian, V. Langer, J. Bergquist, A. Gogoll, Tetrahedron Lett. 2008, 49, 6033-6035.
278. N. J. V. Lindgren, M. Varedian, A. Gogoll, Chem. Eur. J. 2009, 15, 501-505.
279. T. Sakata, Y. Yan, G. Marriott, J. Org. Chem. 2005, 70, 2009-2013.
280. M. Bletz, U. Pfeifer-Fukumura, U. Kolb, W. Baumann, J. Phys. Chem. A 2002, 106, 2232-2236.
281. R. Guglielmetti, in Photochromism: Molecules and Systems, rev. ed., (Eds.: H. Dürr, H. Bouas-Laurent,), Elsevier, Amsterdam, 2003.
282. Y. Shiraishi, M. Itoh, T. Hirai, Phys. Chem. Chem. Phys. 2010, 12, 13737-13745.
283. C. P. McCoy, C. Rooney, C. R. Edwards, D. S. Jones, S. P. Gorman, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 9572-9573.
284. H. Görner, Chem. Phys. 1997, 222, 315-329.
285. T. Sakata, Y. Yan, G. Marriott, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 4759-4764.
286. G. Marriott, in Photosensitive Molecules for Controlling Biological Function (Eds.:, J. J. Chambers, R. H. Kramer,), Springer, New York, 2011, pp. 213-231.
287. A. Kocer, M. Walko, W. Meijberg, B. L. Feringa, Science 2005, 309, 755-758.
288. H. Asanuma, K. Shirasuka, T. Yoshida, T. Takarada, X. Liang, M. Komiyama, Chem. Lett. 2001, 108-109.
289. C. Beyer, H.-A. Wagenknecht, Synlett 2010, 1371-1376.
290. J. Andersson, S. Li, P. Lincoln, J. Andréasson, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 11836-11837.
291. T. Stafforst, D. Hilvert, Chem. Commun. 2009, 287-288.
292. T. Sakata, D. K. Jackson, S. Mao, G. Marriott, J. Org. Chem. 2008, 73, 227-233.
293. D. Movia, A. Prina-Mello, Y. Volkov, S. Giordani, Chem. Res. Toxicol. 2010, 23, 1459-1466.
294. N. Shao, J. Jin, H. Wang, J. Zheng, R. Yang, W. Chan, Z. Abliz, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 725-736.
295. J. R. Nilsson, S. Li, B. Onfelt, J. Andreasson, Chem. Commun. 2011, 47, 11020-11022.
296. S. Mao, R. K. P. Benninger, Y. Yan, C. Petchprayoon, D. Jackson, C. J. Easley, D. W. Piston, G. Marriott, Biophys. J. 2008, 94, 4515-4524.
297. G. Marriott, S. Mao, T. Sakata, J. Ran, D. K. Jackson, C. Petchprayoon, T. J. Gomez, E. Warp, O. Tulyathan, H. L. Aaron, E. Y. Isacoff, Y. Yan, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 17789-17794.
298. M. Irie, Chem. Rev. 2000, 100, 1685-1716.
299. Y. Yokoyama, Chem. Rev. 2000, 100, 1717-1740.
300. M. Irie, in Molecular Switches (Eds.:, B. L. Feringa,), Wiley-VCH, Weinheim, 2001, pp. 37-62.
301. A. Peters, N. R. Branda, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 3404-3405.
302. S. Pu, C. Zheng, Z. Le, G. Liu, C. Fan, Tetrahedron 2008, 64, 2576-2585.
303. M. Takeshita, M. Irie, Chem. Commun. 1997, 2265-2266.
304. D. Vomasta, C. Högner, N. R. Branda, B. König, Angew. Chem. 2008, 120, 7756-7759
305. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 7644-7647.
306. T. Hirose, K. Matsuda, M. Irie, J. Org. Chem. 2006, 71, 7499-7508.
307. T. Hirose, M. Irie, K. Matsuda, Adv. Mater. 2008, 20, 2137-2141.
308. S. M. Polyakova, V. N. Belov, M. L. Bossi, S. W. Hell, Eur. J. Org. Chem. 2011, 3301-3312.
309. Y. Yokoyama, in Molecular Switches (Ed.:, B. L. Feringa,), Wiley-VCH, Weinheim, 2001, pp. 107-121.
310. Y. Liang, A. S. Dvornikov, P. M. Rentzepis, J. Photochem. Photobiol. A 1999, 125, 79-84.
311. S. Draxler, T. Brust, S. Malkmus, F. O. Koller, B. Heinz, S. Laimgruber, C. Schulz, S. Dietrich, K. Rueck-Braun, W. Zinth, M. Braun, J. Mol. Liq. 2008, 141, 130-136.
312. X. Chen, N. I. Islamova, R. V. Robles, W. J. Lees, Photochem. Photobiol. Sci. 2011, 10, 1023-1029.
313. I. Willner, S. Rubin, J. Wonner, F. Effenberger, P. Baeuerle, J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 3150-3151.
314. X. Chen, N. I. Islamova, S. P. Garcia, J. A. DiGirolamo, W. J. Lees, J. Org. Chem. 2009, 74, 6777-6783.
315. S. Herre, T. Schadendorf, I. Ivanov, C. Herrberger, W. Steinle, K. Rueck-Braun, R. Preissner, H. Kuhn, ChemBioChem 2006, 7, 1089-1095.
316. D. Fujita, M. Murai, T. Nishioka, H. Miyoshi, Biochemistry 2006, 45, 6581-6586.
317. D. Pearson, A. J. Downard, A. Muscroft-Taylor, A. D. Abell, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 14862-14863.
318. R. Briesewitz, G. T. Ray, T. J. Wandless, G. R. Crabtree, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 1953-1958.
319. Y. Zhang, F. Erdmann, G. Fischer, Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 724-726.
320. U. Al-Atar, R. Fernandes, B. Johnsen, D. Baillie, N. R. Branda, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15966-15967.
321. M. R. Banghart, M. Volgraf, D. Trauner, Biochemistry 2006, 45, 15129-15141.
322. P. Gorostiza, E. Y. Isacoff, Science 2008, 322, 395-399.
323. M. Volgraf, P. Gorostiza, S. Szobota, M. R. Helix, E. Y. Isacoff, D. Trauner, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 260-261.
324. D. L. Fortin, M. R. Banghart, T. W. Dunn, K. Borges, D. A. Wagenaar, Q. Gaudry, M. H. Karakossian, T. S. Otis, W. B. Kristan, D. Trauner, R. H. Kramer, Nat. Methods 2008, 5, 331-338.
325. M. R. Banghart, A. Mourot, D. L. Fortin, J. Z. Yao, R. H. Kramer, D. Trauner, Angew. Chem. 2009, 121, 9261-9265
326. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 9097-9101.
327. A. Mourot, M. A. Kienzler, M. R. Banghart, T. Fehrentz, F. M. E. Huber, M. Stein, R. H. Kramer, D. Trauner, ACS Chem. Neurosci. 2011, 2, 536-543.
328. M. Sollogoub, S. Guieu, M. Geoffroy, A. Yamada, A. Estévez-Torres, K. Yoshikawa, D. Baigl, ChemBioChem 2008, 9, 1201-1206.
329. A. Diguet, N. K. Mani, M. Geoffroy, M. Sollogoub, D. Baigl, Chem. Eur. J. 2010, 16, 11890-11896.
330. A. Estévez-Torres, C. Crozatier, A. Diguet, T. Hara, H. Saito, K. Yoshikawa, D. Baigl, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 12219-12223.
331. C. Dohno, S. Uno, K. Nakatani, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 11898-11899.
332. C. Dohno, S. Uno, S. Sakai, M. Oku, K. Nakatani, Bioorg. Med. Chem. 2009, 17, 2536-2543.
333. C. Dohno, T. Yamamoto, K. Nakatani, Eur. J. Org. Chem. 2009, 4051-4058.
334. D. D. Young, A. Deiters, ChemBioChem 2008, 9, 1225-1228.
335. G. Hayashi, M. Hagihara, C. Dohno, K. Nakatani, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 8678-8679.
336. G. Hayashi, M. Hagihara, K. Nakatani, Chem. Eur. J. 2009, 15, 424-432.
337. H.-W. Lee, S. G. Robinson, S. Bandyopadhyay, R. H. Mitchell, D. Sen, J. Mol. Biol. 2007, 371, 1163-1173.
338. G. A. Woolley, Acc. Chem. Res. 2005, 38, 486-493.
339. C. Renner, L. Moroder, ChemBioChem 2006, 7, 868-878.
340. P. Hamm, J. Helbing, J. Bredenbeck, Annu. Rev. Phys. Chem. 2008, 59, 291-317.
341. S.-L. Dong, M. Loeweneck, T. E. Schrader, W. J. Schreier, W. Zinth, L. Moroder, C. Renner, Chem. Eur. J. 2006, 12, 1114-1120.
342. T. E. Schrader, W. J. Schreier, T. Cordes, F. O. Koller, G. Babitzki, R. Denschlag, C. Renner, M. Loeweneck, S.-L. Dong, L. Moroder, P. Tavan, W. Zinth, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 15729-15734.
343. T. E. Schrader, T. Cordes, W. J. Schreier, F. O. Koller, S.-L. Dong, L. Moroder, W. Zinth, J. Phys. Chem. B 2011, 115, 5219-5226.
344. S. Jurt, A. Aemissegger, P. Güntert, O. Zerbe, D. Hilvert, Angew. Chem. 2006, 118, 6445-6448
345. Angew. Chem. Int. Ed. 2006, 45, 6297-6300.
346. U. Kusebauch, S. A. Cadamuro, H.-J. Musiol, L. Moroder, C. Renner, Chem. Eur. J. 2007, 13, 2966-2973.
347. C. Hoppmann, S. Seedorff, A. Richter, H. Fabian, P. Schmieder, K. Rueck-Braun, M. Beyermann, Angew. Chem. 2009, 121, 6763-6766
348. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 6636-6639.
349. C. Hoppmann, P. Schmieder, P. Domaing, G. Vogelreiter, J. Eichhorst, B. Wiesner, I. Morano, K. Rueck-Braun, M. Beyermann, Angew. Chem. 2011, 123, 7841-7845
350. Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 7699-7702.
351. F. Zhang, A. Zarrine-Afsar, M. S. Al-Abdul-Wahid, R. S. Prosser, A. R. Davidson, G. A. Woolley, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 2283-2289.
352. T. Fehrentz, M. Schoenberger, D. Trauner, Angew. Chem. 2011, 123, 12362-12390
353. Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 12156-12182.
354. B. Schierling, A.-J. Noel, W. Wende, L. T. Hien, E. Volkov, E. Kubareva, T. Oretskaya, M. Kokkinidis, A. Roempp, B. Spengler, A. Pingoud, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 1361-1366.
355. L.-T. Hien, T. S. Zatsepin, B. Schierling, E. M. Volkov, W. Wende, A. Pingoud, E. A. Kubareva, T. S. Oretskaya, Bioconjugate Chem. 2011, 22, 1366-1373.
356. F. Bonardi, G. London, N. Nouwen, B. L. Feringa, A. J. M. Driessen, Angew. Chem. 2010, 122, 7392-7396
357. Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 7234-7238.
358. H. Asanuma, T. Ito, T. Yoshida, X. Liang, M. Komiyama, Angew. Chem. 1999, 111, 2547-2549
359. Angew. Chem. Int. Ed. 1999, 38, 2393-2395.
360. H. Ito, X. Liang, H. Nishioka, H. Asanuma, Org. Biomol. Chem. 2010, 8, 5519-5524.
361. M. Liu, H. Asanuma, M. Komiyama, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1009-1015.
362. J. Chen, T. Serizawa, M. Komiyama, Chem. Lett. 2011, 40, 482-483.
363. X. Liang, K. Fujioka, H. Asanuma, Chem. Eur. J. 2011, 17, 10388-10396.
364. X. Liang, H. Asanuma, H. Kashida, A. Takasu, T. Sakamoto, G. Kawai, M. Komiyama, J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 16408-16415.
365. H. Asanuma, D. Matsunaga, M. Komiyama, Nucleic Acids Symp. Ser. 2005, 49, 35-36.
366. H. Asanuma, X. Liang, H. Nishioka, D. Matsunaga, M. Liu, M. Komiyama, Nat. Protoc. 2007, 2, 203-212.
367. H. Kang, H. Liu, J. A. Phillips, Z. Cao, Y. Kim, Y. Chen, Z. Yang, J. Li, W. Tan, Nano Lett. 2009, 9, 2690-2696.
368. Q. Yuan, Y. Zhang, Y. Chen, R. Wang, C. Du, E. Yasun, W. Tan, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2011, 108, 9331-9336.
369. S. Ogasawara, M. Maeda, Angew. Chem. 2008, 120, 8971-8974
370. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 8839-8842.
371. M. Singer, A. Jaeschke, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 8372-8377.
372. T. Stafforst, D. Hilvert, Angew. Chem. 2010, 122, 10195-10198
373. Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 9998-10001.
374. A. Kuzuya, K. Tanaka, M. Komiyama, J. Nucleic Acids 2011, 2011, 162452.
375. M. Zhou, X. Liang, T. Mochizuki, H. Asanuma, Angew. Chem. 2010, 122, 2213-2216
376. Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 2167-2170.
377. S. Ogasawara, M. Maeda, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2011, 21, 5457-5459.
378. Y. Kim, J. A. Phillips, H. Liu, H. Kang, W. Tan, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 6489-6494.
379. S. Ogasawara, M. Maeda, Angew. Chem. 2009, 121, 6799-6802
380. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 6671-6674.
381. M. Liu, H. Jinmei, H. Abe, Y. Ito, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2010, 20, 2964-2967.
382. F. Tanaka, T. Mochizuki, X. Liang, H. Asanuma, S. Tanaka, K. Suzuki, S. Kitamura, A. Nishikawa, K. Ui-Tei, M. Hagiya, Nano Lett. 2010, 10, 3560-3565.
383. D. Han, J. Huang, Z. Zhu, Q. Yuan, M. You, Y. Chen, W. Tan, Chem. Commun. 2011, 47, 4670-4672.
384. M. You, R.-W. Wang, X. Zhang, Y. Chen, K. Wang, L. Peng, W. Tan, ACS Nano 2011, 5, 10090-10095.
385. H. Nishioka, X. Liang, T. Kato, H. Asanuma, Angew. Chem. 2012, 124, 1191-1194
386. Angew. Chem. Int. Ed. 2012, 51, 1165-1168.
387. P. Gorostiza, E. Isacoff, Mol. BioSyst. 2007, 3, 686-704.
388. M. Mank, O. Griesbeck, Chem. Rev. 2008, 108, 1550-1564.
389. I. T. Li, E. Pham, K. Truong, Biotechnol. Lett. 2006, 28, 1971-1982.
390. L. L. Looger, O. Griesbeck, Curr. Opin. Neurobiol. 2012, 22, 18-23.
391. G. Miesenböck, Curr. Opin. Neurobiol. 2004, 14, 395-402.
392. L. Fenno, O. Yizhar, K. Deisseroth, Annu. Rev. Neurosci. 2011, 34, 389-412.
393. G. Nagel, T. Szellas, W. Huhn, S. Kateriya, N. Adeishvili, P. Berthold, D. Ollig, P. Hegemann, E. Bamberg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 13940-13945.
394. F. Zhang, L. P. Wang, M. Brauner, J. F. Liewald, K. Kay, N. Watzke, P. G. Wood, E. Bamberg, G. Nagel, A. Gottschalk, K. Deisseroth, Nature 2007, 446, 633-639.
395. G. Nagel, D. Ollig, M. Fuhrmann, S. Kateriya, A. M. Musti, E. Bamberg, P. Hegemann, Science 2002, 296, 2395-2398.
396. E. S. Boyden, F. Zhang, E. Bamberg, G. Nagel, K. Deisseroth, Nat. Neurosci. 2005, 8, 1263-1268.
397. X. Li, D. V. Gutierrez, M. G. Hanson, J. Han, M. D. Mark, H. Chiel, P. Hegemann, L. T. Landmesser, S. Herlitze, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 17816-17821.
398. T. Ishizuka, M. Kakuda, R. Araki, H. Yawo, Neurosci. Res. 2006, 54, 85-94.
399. G. Nagel, M. Brauner, J. F. Liewald, N. Adeishvili, E. Bamberg, A. Gottschalk, Curr. Biol. 2005, 15, 2279-2284.
400. S. Schröder-Lang, M. Schwarzel, R. Seifert, T. Strunker, S. Kateriya, J. Looser, M. Watanabe, U. B. Kaupp, P. Hegemann, G. Nagel, Nat. Methods 2007, 4, 39-42.
401. S. Weissenberger, C. Schultheis, J. F. Liewald, K. Erbguth, G. Nagel, A. Gottschalk, J. Neurochem. 2011, 116, 616-625.
402. R. D. Airan, K. R. Thompson, L. E. Fenno, H. Bernstein, K. Deisseroth, Nature 2009, 458, 1025-1029.
403. Y. I. Wu, D. Frey, O. I. Lungu, A. Jaehrig, I. Schlichting, B. Kuhlman, K. M. Hahn, Nature 2009, 461, 104-108.
404. M. J. Kennedy, R. M. Hughes, L. A. Peteya, J. W. Schwartz, M. D. Ehlers, C. L. Tucker, Nat. Methods 2010, 7, 973-975.
405. A. Levskaya, O. D. Weiner, W. A. Lim, C. A. Voigt, Nature 2009, 461, 997-1001.
406. S. Q. Lima, G. Miesenbock, Cell 2005, 121, 141-152.
407. B. V. Zemelman, N. Nesnas, G. A. Lee, G. Miesenbock, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 1352-1357.
408. B. V. Zemelman, G. A. Lee, M. Ng, G. Miesenbock, Neuron 2002, 33, 15-22.
409. A. Bi, J. Cui, Y. P. Ma, E. Olshevskaya, M. Pu, A. M. Dizhoor, Z. H. Pan, Neuron 2006, 50, 23-33.
410. C. Schroll, T. Riemensperger, D. Bucher, J. Ehmer, T. Voller, K. Erbguth, B. Gerber, T. Hendel, G. Nagel, E. Buchner, A. Fiala, Curr. Biol. 2006, 16, 1741-1747.
411. A. D. Douglass, S. Kraves, K. Deisseroth, A. F. Schier, F. Engert, Curr. Biol. 2008, 18, 1133-1137.
412. B. R. Arenkiel, J. Peca, I. G. Davison, C. Feliciano, K. Deisseroth, G. J. Augustine, M. D. Ehlers, G. Feng, Neuron 2007, 54, 205-218.
413. L. Petreanu, D. Huber, A. Sobczyk, K. Svoboda, Nat. Neurosci. 2007, 10, 663-668.
414. Y. P. Zhang, T. G. Oertner, Nat. Methods 2007, 4, 139-141.
415. V. Gradinaru, K. R. Thompson, F. Zhang, M. Mogri, K. Kay, M. B. Schneider, K. Deisseroth, J. Neurosci. 2007, 27, 14231-14238.
416. X. Han, E. S. Boyden, PLoS ONE 2007, 2, e 299.
417. S. Zhao, C. Cunha, F. Zhang, Q. Liu, B. Gloss, K. Deisseroth, G. J. Augustine, G. Feng, Brain Cell Biol. 2008, 36, 141-154.
418. V. Busskamp, J. Duebel, D. Balya, M. Fradot, T. J. Viney, S. Siegert, A. C. Groner, E. Cabuy, V. Forster, M. Seeliger, M. Biel, P. Humphries, M. Paques, S. Mohand-Said, D. Trono, K. Deisseroth, J. A. Sahel, S. Picaud, B. Roska, Science 2010, 329, 413-417.
419. B. Y. Chow, X. Han, A. S. Dobry, X. Qian, A. S. Chuong, M. Li, M. A. Henninger, G. M. Belfort, Y. Lin, P. E. Monahan, E. S. Boyden, Nature 2010, 463, 98-102.
420. I. Diester, M. T. Kaufman, M. Mogri, R. Pashaie, W. Goo, O. Yizhar, C. Ramakrishnan, K. Deisseroth, K. V. Shenoy, Nat. Neurosci. 2011, 14, 387-397.
421. X. Han, X. Qian, J. G. Bernstein, H. H. Zhou, G. T. Franzesi, P. Stern, R. T. Bronson, A. M. Graybiel, R. Desimone, E. S. Boyden, Neuron 2009, 62, 191-198.
422. J. F. Liewald, M. Brauner, G. J. Stephens, M. Bouhours, C. Schultheis, M. Zhen, A. Gottschalk, Nat. Methods 2008, 5, 895-902.
423. Q. Liu, G. Hollopeter, E. M. Jorgensen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 10823-10828.
424. F. Zhang, M. Prigge, F. Beyrière, S. Tsunoda, J. Mattis, O. Yizhar, P. Hegemann, K. Deisseroth, Nat. Neurosci. 2008, 11, 631-633.
425. O. Yizhar, L. E. Fenno, T. J. Davidson, M. Mogri, K. Deisseroth, Neuron 2011, 71, 9-34.
426. A. Berndt, O. Yizhar, L. A. Gunaydin, P. Hegemann, K. Deisseroth, Nat. Neurosci. 2009, 12, 229-234.
427. L. A. Gunaydin, O. Yizhar, A. Berndt, V. S. Sohal, K. Deisseroth, P. Hegemann, Nat. Neurosci. 2010, 13, 387-392.
428. J. Y. Lin, M. Z. Lin, P. Steinbach, R. Y. Tsien, Biophys. J. 2009, 96, 1803-1814.
429. L. Wen, H. Wang, S. Tanimoto, R. Egawa, Y. Matsuzaka, H. Mushiake, T. Ishizuka, H. Yawo, PLoS ONE 2010, 5, e 12893.
430. S. Kleinlogel, K. Feldbauer, R. E. Dempski, H. Fotis, P. G. Wood, C. Bamann, E. Bamberg, Nat. Neurosci. 2011, 14, 513-518.
431. F. Zhang, J. Vierock, O. Yizhar, L. E. Fenno, S. Tsunoda, A. Kianianmomeni, M. Prigge, A. Berndt, J. Cushman, J. Polle, J. Magnuson, P. Hegemann, K. Deisseroth, Cell 2011, 147, 1446-1457.
432. S. Kleinlogel, U. Terpitz, B. Legrum, D. Gokbuget, E. S. Boyden, C. Bamann, P. G. Wood, E. Bamberg, Nat. Methods 2011, 8, 1083-1088.
433. H. E. Kato, F. Zhang, O. Yizhar, C. Ramakrishnan, T. Nishizawa, K. Hirata, J. Ito, Y. Aita, T. Tsukazaki, S. Hayashi, P. Hegemann, A. D. Maturana, R. Ishitani, K. Deisseroth, O. Nureki, Nature 2012, 482, 369-374.
434. P. Anikeeva, A. S. Andalman, I. Witten, M. Warden, I. Goshen, L. Grosenick, L. A. Gunaydin, L. M. Frank, K. Deisseroth, Nat. Neurosci. 2012, 15, 163-170.
435. J. G. Bernstein, X. Han, M. A. Henninger, E. Y. Ko, X. Qian, G. T. Franzesi, J. P. McConnell, P. Stern, R. Desimone, E. S. Boyden, Proc. Soc. Photo-Opt. Instrum. Eng. 2008, 6854, 68540H.
436. J. P. Rickgauer, D. W. Tank, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 15025-15030.
437. E. Papagiakoumou, F. Anselmi, A. Begue, V. de Sars, J. Gluckstad, E. Y. Isacoff, V. Emiliani, Nat. Methods 2010, 7, 848-854.
438. J. N. Stirman, M. M. Crane, S. H. Husson, S. Wabnig, C. Schultheis, A. Gottschalk, H. Lu, Nat. Methods 2011, 8, 153-158.
439. A. M. Leifer, C. Fang-Yen, M. Gershow, M. J. Alkema, A. D. Samuel, Nat. Methods 2011, 8, 147-152.
440. B. K. Andrasfalvy, B. V. Zemelman, J. Tang, A. Vaziri, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 11981-11986.
441. P. S. Lagali, D. Balya, G. B. Awatramani, T. A. Munch, D. S. Kim, V. Busskamp, C. L. Cepko, B. Roska, Nat. Neurosci. 2008, 11, 667-675.
442. V. Gradinaru, M. Mogri, K. R. Thompson, J. M. Henderson, K. Deisseroth, Science 2009, 324, 354-359.
443. W. J. Alilain, X. Li, K. P. Horn, R. Dhingra, T. E. Dick, S. Herlitze, J. Silver, J. Neurosci. 2008, 28, 11862-11870.
444. T. Bruegmann, D. Malan, M. Hesse, T. Beiert, C. J. Fuegemann, B. K. Fleischmann, P. Sasse, Nat. Methods 2010, 7, 897-900.
445. M. Stierl, P. Stumpf, D. Udwari, R. Gueta, R. Hagedorn, A. Losi, W. Gartner, L. Petereit, M. Efetova, M. Schwarzel, T. G. Oertner, G. Nagel, P. Hegemann, J. Biol. Chem. 2011, 286, 1181-1188.
446. M. H. Ryu, O. V. Moskvin, J. Siltberg-Liberles, M. Gomelsky, J. Biol. Chem. 2010, 285, 41501-41508.
447. X. Wang, X. Chen, Y. Yang, Nat. Methods 2012, 9, 266-269.
448. C. Ran, Z. Zhang, J. Hooker, A. Moore, Mol. Imaging Biol. 2011, 1-7.