Protein conformational switches: From nature to design

Chemistry - A European Journal

Volumn 18, Issue 26, 2012, Pages 7984-7999

  Ha, Jeung Hoi ^a   Loh, Stewart N ^a  

^a State University of New York Upstate Medical University: College of Medicine   (United States)

Author keywords

allostery; biosensors; protein design; protein engineering; protein folding

Indexed keywords

ALLOSTERIC PROTEINS; ALLOSTERY; AS-LIGANDS; BIOLOGICAL FUNCTIONS; CONFORMATIONAL CHANGE; CONFORMATIONAL SWITCHES; DOMAIN MOVEMENT; FUNCTIONAL RESPONSE; INPUT SIGNAL; MOLECULAR SWITCHES; PROTEIN DESIGN; PROTEIN ENGINEERING; RIGID BODY; STRUCTURAL REARRANGEMENT; SWITCHABLE;

BIOCHEMICAL ENGINEERING; BIOLOGICAL MATERIALS; BIOSENSORS; CELL ENGINEERING; CHEMICAL MODIFICATION; CONFORMATIONS; DESIGN; GENETIC ENGINEERING; MACHINERY; MOLECULES; PROTEIN FOLDING;

PROTEINS;

PROTEIN;

CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; GENETIC PROCEDURES; HUMAN; INSTRUMENTATION; METHODOLOGY; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN ENGINEERING; REVIEW;

BIOSENSING TECHNIQUES; HUMANS; MODELS, MOLECULAR; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN ENGINEERING; PROTEINS;

EID: 84862526773     PISSN: 09476539     EISSN: 15213765     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/chem.201200348     Document Type: Review

References (183)

1. S. G. Rasmussen, B. T. DeVree, Y. Zou, A. C. Kruse, K. Y. Chung, T. S. Kobilka, F. S. Thian, P. S. Chae, E. Pardon, D. Calinski, J. M. Mathiesen, S. T. Shah, J. A. Lyons, M. Caffrey, S. H. Gellman, J. Steyaert, G. Skiniotis, W. I. Weis, R. K. Sunahara, B. K. Kobilka, Nature 2011, 477, 549-555.
2. S. C. Harrison, Nat. Struct. Mol. Biol. 2008, 15, 690-698.
3. W. Weissenhorn, A. Dessen, S. C. Harrison, J. J. Skehel, D. C. Wiley, Nature 1997, 387, 426-430.
4. D. R. Beniac, S. L. deVarennes, A. Andonov, R. He, T. F. Booth, PLoS One 2007, 2, e 1082.
5. V. N. Malashkevich, B. J. Schneider, M. L. McNally, M. A. Milhollen, J. X. Pang, P. S. Kim, Proc Natl Acad Sci USA 1999, 96, 2662-2667
6. W. Weissenhorn, A. Carfi, K. H. Lee, J. J. Skehel, D. C. Wiley, Mol. Cell 1998, 2, 605-616.
7. M. Gerstein, W. Krebs, Nucleic Acids Res. 1998, 26, 4280-4290
8. S. Flores, N. Echols, D. Milburn, B. Hespenheide, K. Keating, J. Lu, S. Wells, E. Z. Yu, M. Thorpe, M. Gerstein, Nucleic Acids Res. 2006, 34, D 296-301
9. G. Qi, R. Lee, S. Hayward, Bioinformatics 2005, 21, 2832-2838
10. F. Seeliger, T. Leeb, M. Peters, M. Brugmann, M. Fehr, M. Hewicker-Trautwein, Vet. Pathol. 2003, 40, 530-539
11. T. Amemiya, R. Koike, S. Fuchigami, M. Ikeguchi, A. Kidera, J. Mol. Biol. 2011, 408, 568-584.
12. P. E. Wright, H. J. Dyson, Curr. Opin. Struct. Biol. 2009, 19, 31-38
13. M. M. Babu, R. van der Lee, N. S. de Groot, J. Gsponer, Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 432-440
14. C. K. Fisher, C. M. Stultz, Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 426-431
15. P. Tompa, Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 419-425.
16. K. Chen, I. Bachtiar, G. Piszczek, F. Bouamr, C. Carter, N. Tjandra, Biochemistry 2008, 47, 1928-1937
17. C. Tang, E. Loeliger, P. Luncsford, I. Kinde, D. Beckett, M. F. Summers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 517-522.
18. C. M. Petit, J. Zhang, P. J. Sapienza, E. J. Fuentes, A. L. Lee, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 18249-18254.
19. M. W. Clarkson, S. A. Gilmore, M. H. Edgell, A. L. Lee, Biochemistry 2006, 45, 7693-7699.
20. S. R. Tzeng, C. G. Kalodimos, Curr. Opin. Struct. Biol. 2011, 21, 62-67.
21. B. F. Volkman, D. Lipson, D. E. Wemmer, D. Kern, Science 2001, 291, 2429-2433.
22. X. I. Ambroggio, B. Kuhlman, Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 525-530
23. M. Ostermeier, Curr. Opin. Struct. Biol. 2009, 19, 442-448
24. M. Ostermeier, Protein Eng. Des. Sel. 2005, 18, 359-364
25. C. M. Wright, R. A. Heins, M. Ostermeier, Curr. Opin. Chem. Biol. 2007, 11, 342-346
26. A. Vallée-Bélisle, K. W. Plaxco, Curr. Opin. Struct. Biol. 2010, 20, 518-526
27. S. Koide, Curr. Opin. Biotechnol. 2009, 20, 398-404
28. M. V. Golynskiy, M. S. Koay, J. L. Vinkenborg, M. Merkx, ChemBioChem 2011, 12, 353-361
29. M. M. Stratton, S. N. Loh, Protein Sci. 2011, 20, 19-29.
30. L. Mäler, J. Blankenship, M. Rance, W. J. Chazin, Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 245-250.
31. M. A. Dwyer, H. W. Hellinga, Curr. Opin. Struct. Biol. 2004, 14, 495-504.
32. I. Lager, M. Fehr, W. B. Frommer, S. Lalonde, FEBS Lett. 2003, 553, 85-89
33. A. J. Björkman, S. Mowbray, J. Mol. Biol. 1998, 279, 651-664
34. K. P. Ravindranathan, E. Gallicchio, R. M. Levy, J. Mol. Biol. 2005, 353, 196-210
35. N. C. Vercillo, K. J. Herald, J. M. Fox, B. S. Der, J. D. Dattelbaum, Protein Sci. 2007, 16, 362-368.
36. I. L. Medintz, J. R. Deschamps, Curr. Opin. Biotechnol. 2006, 17, 17-27
37. J. D. Dattelbaum, L. L. Looger, D. E. Benson, K. M. Sali, R. B. Thompson, H. W. Hellinga, Protein Sci. 2005, 14, 284-291.
38. M. J. Borrok, Y. Zhu, K. T. Forest, L. L. Kiessling, ACS Chem. Biol. 2009, 4, 447-456.
39. U. Magnusson, B. N. Chaudhuri, J. Ko, C. Park, T. A. Jones, S. L. Mowbray, J. Biol. Chem. 2002, 277, 14077-14084.
40. N. Akiyama, K. Takeda, K. Miki, J. Mol. Biol. 2009, 392, 559-565.
41. M. J. Cuneo, L. S. Beese, H. W. Hellinga, J. Biol. Chem. 2009, 284, 33217-33223.
42. S. Trakhanov, N. K. Vyas, H. Luecke, D. M. Kristensen, J. Ma, F. A. Quiocho, Biochemistry 2005, 44, 6597-6608
43. J. S. Sack, S. D. Trakhanov, I. H. Tsigannik, F. A. Quiocho, J. Mol. Biol. 1989, 206, 193-207
44. G. A. Bermejo, M. P. Strub, C. Ho, N. Tjandra, Biochemistry 2010, 49, 1893-1902
45. G. A. Bermejo, M. P. Strub, C. Ho, N. Tjandra, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 9532-9537
46. A. Scirè, A. Marabotti, M. Staiano, L. Iozzino, M. S. Luchansky, B. S. Der, J. D. Dattelbaum, F. Tanfani, S. D'Auria, Mol. BioSyst. 2010, 6, 687-698.
47. N. K. Karpowich, H. H. Huang, P. C. Smith, J. F. Hunt, J. Biol. Chem. 2003, 278, 8429-8434
48. K. P. Locher, E. Borths, FEBS Lett. 2004, 564, 264-268.
49. B. C. Chu, H. J. Vogel, Biol. Chem. 2011, 392, 39-52.
50. C. Cavazza, L. Martin, E. Laffly, H. Lebrette, M. V. Cherrier, L. Zeppieri, P. Richaud, M. Carriere, J. C. Fontecilla-Camps, FEBS Lett. 2011, 585, 711-715.
51. L. Zhang, M. Koay, M. J. Maher, Z. Xiao, A. G. Wedd, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 5834-5850
52. F. Arnesano, L. Banci, I. Bertini, A. R. Thompsett, Structure 2002, 10, 1337-1347
53. F. Hussain, E. Sedlak, P. Wittung-Stafshede, Arch. Biochem. Biophys. 2007, 467, 58-66.
54. I. Alicea, J. S. Marvin, A. E. Miklos, A. D. Ellington, L. L. Looger, E. R. Schreiter, J. Mol. Biol. 2011, 414, 356-369.
55. B. Vergauwen, J. Elegheert, A. Dansercoer, B. Devreese, S. N. Savvides, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 13270-13275.
56. R. M. De Lorimier, J. J. Smith, M. A. Dwyer, L. L. Looger, K. M. Sali, C. D. Paavola, S. S. Rizk, S. Sadigov, D. W. Conrad, L. Loew, H. W. Hellinga, Protein Sci. 2002, 11, 2655-2675.
57. M. Fehr, W. B. Frommer, S. Lalonde, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 9846-9851.
58. M. Fehr, S. Lalonde, I. Lager, M. W. Wolff, W. B. Frommer, J. Biol. Chem. 2003, 278, 19127-19133.
59. K. Teasley Hamorsky, C. M. Ensor, Y. Wei, S. Daunert, Angew. Chem. 2008, 120, 3778-3781
60. Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 3718-3721.
61. F. van den Ent, J. Moller-Jensen, L. A. Amos, K. Gerdes, J. Lowe, EMBO J. 2002, 21, 6935-6943
62. S. Kunzelmann, M. R. Webb, Biochem. J. 2011, 440, 43-49.
63. S. Kunzelmann, M. R. Webb, J. Biol. Chem. 2009, 284, 33130-33138.
64. T. Wan, R. L. Beavil, S. M. Fabiane, A. J. Beavil, M. K. Sohi, M. Keown, R. J. Young, A. J. Henry, R. J. Owens, H. J. Gould, B. J. Sutton, Nat. Immunol. 2002, 3, 681-686
65. M. D. Holdom, A. M. Davies, J. E. Nettleship, S. C. Bagby, B. Dhaliwal, E. Girardi, J. Hunt, H. J. Gould, A. J. Beavil, J. M. McDonnell, R. J. Owens, B. J. Sutton, Nat. Struct. Mol. Biol. 2011, 18, 571-576.
66. J. Hunt, A. H. Keeble, R. E. Dale, M. K. Corbett, R. L. Beavil, J. Levitt, M. J. Swann, K. Suhling, S. Ameer-Beg, B. J. Sutton, A. J. Beavil, J. Biol. Chem. 2012, in press.
67. P. Sarkar, T. Saleh, S. R. Tzeng, R. B. Birge, C. G. Kalodimos, Nat. Chem. Biol. 2011, 7, 51-57.
68. A. Severin, R. E. Joseph, S. Boyken, D. B. Fulton, A. H. Andreotti, J. Mol. Biol. 2009, 387, 726-743.
69. S. C. Lummis, D. L. Beene, L. W. Lee, H. A. Lester, R. W. Broadhurst, D. A. Dougherty, Nature 2005, 438, 248-252.
70. W. Y. Lee, S. M. Sine, Nature 2005, 438, 243-247.
71. C. Schiene-Fischer, T. Aumüller, G. Fischer, Top Curr. Chem. 2012, in press
72. K. P. Lu, G. Finn, T. H. Lee, L. K. Nicholson, Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 619-629
73. Y. C. Liou, X. Z. Zhou, K. P. Lu, Trends Biochem. Sci. 2011, 36, 501-514.
74. T. L. Radley, A. I. Markowska, B. T. Bettinger, J.-H. Ha, S. N. Loh, J. Mol. Biol. 2003, 332, 529-536.
75. G. Guntas, T. J. Mansell, J. R. Kim, M. Ostermeier, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 11224-11229
76. G. Guntas, S. F. Mitchell, M. Ostermeier, Chem. Biol. 2004, 11, 1483-1487
77. G. Guntas, M. Ostermeier, J. Mol. Biol. 2004, 336, 263-273.
78. J. Liang, J. R. Kim, J. T. Boock, T. J. Mansell, M. Ostermeier, Protein Sci. 2007, 16, 929-937.
79. C. M. Wright, A. Majumdar, J. R. Tolman, M. Ostermeier, Proteins Struct. Funct. Bioinf. 2010, 78, 1423-1430.
80. B. K. Shoichet, Nat. Biotechnol. 2007, 25, 1109-1110.
81. A. Möglich, K. Moffat, Photochem. Photobiol. Sci. 2010, 9, 1286-1300.
82. N. C. Rockwell, Y. S. Su, J. C. Lagarias, Annu. Rev. Plant Biol. 2006, 57, 837-858
83. A. Nagatani, Curr. Opin. Plant Biol. 2010, 13, 565-570.
84. A. T. Ulijasz, G. Cornilescu, C. C. Cornilescu, J. Zhang, M. Rivera, J. L. Markley, R. D. Vierstra, Nature 2010, 463, 250-254
85. X. Yang, J. Kuk, K. Moffat, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 15639-15644.
86. J. E. Toettcher, D. Gong, W. A. Lim, O. D. Weiner, Methods Enzymol. 2011, 497, 409-423.
87. S. Shimizu-Sato, E. Huq, J. M. Tepperman, P. H. Quail, Nat. Biotechnol. 2002, 20, 1041-1044.
88. D. W. Leung, C. Otomo, J. Chory, M. K. Rosen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 12797-12802.
89. A. B. Tyszkiewicz, T. W. Muir, Nat. Methods 2008, 5, 303-305.
90. J. E. Toettcher, D. Gong, W. A. Lim, O. D. Weiner, Nat. Methods 2011, 8, 837-839.
91. S. M. Harper, L. C. Neil, K. H. Gardner, Science 2003, 301, 1541-1544.
92. J. P. Zayner, C. Antoniou, T. R. Sosnick, J. Mol. Biol. 2012, in press.
93. D. Strickland, K. Moffat, T. R. Sosnick, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 10709-10714.
94. D. Strickland, X. Yao, G. Gawlak, M. K. Rosen, K. H. Gardner, T. R. Sosnick, Nat. Methods 2010, 7, 623-626.
95. J. Vreede, J. Juraszek, P. G. Bolhuis, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 2397-2402
96. A. Xie, L. Kelemen, J. Hendriks, B. J. White, K. J. Hellingwerf, W. D. Hoff, Biochemistry 2001, 40, 1510-1517
97. C. Bernard, K. Houben, N. M. Derix, D. Marks, M. A. van der Horst, K. J. Hellingwerf, R. Boelens, R. Kaptein, N. A. van Nuland, Structure 2005, 13, 953-962
98. G. Cheng, M. A. Cusanovich, V. H. Wysocki, Biochemistry 2006, 45, 11744-11751.
99. S. A. Morgan, S. Al-Abdul-Wahid, G. A. Woolley, J. Mol. Biol. 2010, 399, 94-112
100. S. A. Morgan, G. A. Woolley, Photochem. Photobiol. Sci. 2010, 9, 1320-1326.
101. H. Y. Fan, S. A. Morgan, K. E. Brechun, Y. Y. Chen, A. S. Jaikaran, G. A. Woolley, Biochemistry 2011, 50, 1226-1237.
102. S. Crosson, S. Rajagopal, K. Moffat, Biochemistry 2003, 42, 2-10.
103. A. Möglich, R. A. Ayers, K. Moffat, J. Mol. Biol. 2009, 385, 1433-1444.
104. A. Möglich, R. A. Ayers, K. Moffat, J. Mol. Biol. 2010, 400, 477-486.
105. Y. I. Wu, D. Frey, O. I. Lungu, A. Jaehrig, I. Schlichting, B. Kuhlman, K. M. Hahn, Nature 2009, 461, 104-108.
106. S. K. Yoo, Q. Deng, P. J. Cavnar, Y. I. Wu, K. M. Hahn, A. Huttenlocher, Dev. Cell 2010, 18, 226-236
107. X. Wang, L. He, Y. I. Wu, K. M. Hahn, D. J. Montell, Nat. Cell Biol. 2010, 12, 591-597.
108. D. Wildemann, C. Schiene-Fischer, T. Aumuller, A. Bachmann, T. Kiefhaber, C. Lucke, G. Fischer, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4910-4918.
109. Y. Huang, Z. Cong, L. Yang, S. Dong, J. Pept. Sci. 2008, 14, 1062-1068.
110. Y. Huang, G. Jahreis, C. Lucke, D. Wildemann, G. Fischer, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 7578-7579.
111. A. Reiner, D. Wildemann, G. Fischer, T. Kiefhaber, J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 8079-8084.
112. X. Shen, C. A. Valencia, J. W. Szostak, B. Dong, R. Liu, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 5969-5974.
113. A. Miyawaki, J. Llopis, R. Heim, J. M. McCaffery, J. A. Adams, M. Ikura, R. Y. Tsien, Nature 1997, 388, 882-887.
114. T. Nagai, A. Sawano, E. S. Park, A. Miyawaki, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 3197-3202.
115. G. S. Baird, D. A. Zacharias, R. Y. Tsien, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 11241-11246.
116. B. N. G. Giepmans, S. R. Adams, M. H. Ellisman, R. Y. Tsien, Science 2006, 312, 217-224
117. N. Demaurex, M. Frieden, Cell Calcium 2003, 34, 109-119.
118. I. V. Korendovych, D. W. Kulp, Y. Wu, H. Cheng, H. Roder, W. F. DeGrado, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2011, 108, 6823-6827.
119. D. Röthlisberger, O. Khersonsky, A. M. Wollacott, L. Jiang, J. DeChancie, J. Betker, J. L. Gallaher, E. A. Althoff, A. Zanghellini, O. Dym, S. Albeck, K. N. Houk, D. S. Tawfik, D. Baker, Nature 2008, 453, 190-195
120. L. Jiang, E. A. Althoff, F. R. Clemente, L. Doyle, D. Rothlisberger, A. Zanghellini, J. L. Gallaher, J. L. Betker, F. Tanaka, C. F. Barbas III, D. Hilvert, K. N. Houk, B. L. Stoddard, D. Baker, Science 2008, 319, 1387-1391.
121. R. C. Tyler, N. J. Murray, F. C. Peterson, B. F. Volkman, Biochemistry 2011, 50, 7077-7079
122. A. G. Murzin, Science 2008, 320, 1725-1726.
123. R. L. Tuinstra, F. C. Peterson, S. Kutlesa, E. S. Elgin, M. A. Kron, B. F. Volkman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 5057-5062.
124. X. Luo, Z. Tang, G. Xia, K. Wassmann, T. Matsumoto, J. Rizo, H. Yu, Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 338-345
125. X. Luo, H. Yu, Structure 2008, 16, 1616-1625.
126. C. G. Roessler, B. M. Hall, W. J. Anderson, W. M. Ingram, S. A. Roberts, W. R. Montfort, M. H. Cordes, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 2343-2348.
127. I. Yadid, N. Kirshenbaum, M. Sharon, O. Dym, D. S. Tawfik, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 7287-7292.
128. W. J. Anderson, L. O. Van Dorn, W. M. Ingram, M. H. Cordes, Protein Eng. Des. Sel. 2011, 24, 765-771.
129. T. A. Anderson, M. H. Cordes, R. T. Sauer, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 18344-18349
130. M. C. Mossing, R. T. Sauer, Science 1990, 250, 1712-1715.
131. X. I. Ambroggio, B. Kuhlman, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1154-1161
132. Y. Hori, Y. Sugiura, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 9362-9363
133. E. Cerasoli, B. K. Sharpe, D. N. Woolfson, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 15008-15009.
134. S. Dalal, L. Regan, Protein Sci. 2000, 9, 1651-1659.
135. P. A. Alexander, Y. He, Y. Chen, J. Orban, P. N. Bryan, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 21149-21154
136. P. A. Alexander, Y. He, Y. Chen, J. Orban, P. N. Bryan, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007, 104, 11963-11968
137. P. A. Alexander, D. A. Rozak, J. Orban, P. N. Bryan, Biochemistry 2005, 44, 14045-14054
138. Y. He, Y. Chen, P. Alexander, P. N. Bryan, J. Orban, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 14412-14417.
139. Y. He, Y. Chen, P. A. Alexander, P. N. Bryan, J. Orban, Structure 2012, 20, 283-291.
140. V. N. Uversky, A. K. Dunker, Biochim. Biophys. Acta Proteins Proteomics 2010, 1804, 1231-1264.
141. P. J. O'Donovan, D. M. Livingston, Carcinogenesis 2010, 31, 961-967
142. M. S. Huen, S. M. Sy, J. Chen, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2010, 11, 138-148.
143. W. Y. Mark, J. C. Liao, Y. Lu, A. Ayed, R. Laister, B. Szymczyna, A. Chakrabartty, C. H. Arrowsmith, J. Mol. Biol. 2005, 345, 275-287.
144. H. Zhang, K. Somasundaram, Y. Peng, H. Tian, D. Bi, B. L. Weber, W. S. El-Deiry, Oncogene 1998, 16, 1713-1721.
145. K. A. Cissell, S. Shrestha, J. Purdie, D. Kroodsma, S. K. Deo, Anal. Bioanal. Chem. 2008, 391, 1721-1729.
146. J. M. Flanagan, M. Kataoka, D. Shortle, D. M. Engelman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 748-752.
147. J. E. Kohn, K. W. Plaxco, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 10841-10845.
148. M. M. Stratton, D. M. Mitrea, S. N. Loh, ACS Chem. Biol. 2008, 3, 723-732.
149. D. M. Mitrea, L. Parsons, S. N. Loh, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 2824-2829.
150. M. M. Stratton, S. N. Loh, Proteins Struct. Funct. Bioinf. 2010, 78, 3260-3269
151. M. M. Stratton, S. McClendon, D. Eliezer, S. N. Loh, Biochemistry 2011, 50, 5583-5589.
152. N. J. Skelton, J. Kordel, W. J. Chazin, J. Mol. Biol. 1995, 249, 441-462.
153. M. Gautel, Pfluegers Arch. 2011, 462, 119-134.
154. O. Mayans, P. F. van der Ven, M. Wilm, A. Mues, P. Young, D. O. Furst, M. Wilmanns, M. Gautel, Nature 1998, 395, 863-869.
155. E. M. Puchner, A. Alexandrovich, A. L. Kho, U. Hensen, L. V. Schafer, B. Brandmeier, F. Grater, H. Grubmuller, H. E. Gaub, M. Gautel, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 13385-13390
156. F. Gräter, J. Shen, H. Jiang, M. Gautel, H. Grubmuller, Biophys. J. 2005, 88, 790-804.
157. D. E. Leckband, Q. le Duc, N. Wang, J. de Rooij, Curr. Opin. Cell Biol. 2011, 23, 523-530
158. G. A. Gomez, R. W. McLachlan, A. S. Yap, Trends Cell Biol. 2011, 21, 499-505.
159. M. A. Schwartz, D. W. DeSimone, Curr. Opin. Cell Biol. 2008, 20, 551-556.
160. B. A. Kesner, F. Ding, B. R. Temple, N. V. Dokholyan, Proteins 2010, 78, 12-24.
161. J. R. Forman, Z. T. Yew, S. Qamar, R. N. Sandford, E. Paci, J. Clarke, Structure 2009, 17, 1582-1590
162. G. Dalagiorgou, E. K. Basdra, A. G. Papavassiliou, Int. J. Biochem. Cell Biol. 2010, 42, 1610-1613.
163. J. Chen, A. Zolkiewska, PLoS One 2011, 6, e 22837.
164. C. A. Kumamoto, Nat. Rev. Microbiol. 2008, 6, 667-673.
165. M. Mederos y Schnitzler, U. Storch, T. Gudermann, Curr. Opin. Pharmacol. 2011, 11, 112-116.
166. T. Cutler, S. N. Loh, J. Mol. Biol. 2007, 371, 308-316
167. T. Cutler, B. M. Mills, D. J. Lubin, L. T. Chong, S. N. Loh, J. Mol. Biol. 2009, 386, 854-868.
168. J.-H. Ha, J. S. Butler, D. M. Mitrea, S. N. Loh, J. Mol. Biol. 2006, 357, 1058-1062.
169. J.-H. Ha, J. M. Karchin, N. Walker-Kopp, L.-S. Huang, E. A. Berry, S. N. Loh, J. Mol. Biol. 2012, 416, 495-502.
170. Q. Peng, H. Li, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 13347-13354.
171. L. M. Luheshi, C. M. Dobson, FEBS Lett. 2009, 583, 2581-2586.
172. C. Tang, C. D. Schwieters, G. M. Clore, Nature 2007, 449, 1078-1082.
173. D. M. Miller III, J. S. Olson, J. W. Pflugrath, F. A. Quiocho, J. Biol. Chem. 1983, 258, 13665-13672.
174. S. Kunzelmann, M. R. Webb, ACS Chem. Biol. 2010, 5, 415-425.
175. D. Pan, A. Philip, W. D. Hoff, R. A. Mathies, Biophys. J. 2004, 86, 2374-2382.
176. S. R. Martin, S. Linse, C. Johansson, P. M. Bayley, S. Forsen, Biochemistry 1990, 29, 4188-4193.
177. A. Vallée-Bélisle, F. Ricci, K. W. Plaxco, J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 2876-2879.
178. H. N. Motlach, V. J. Hilser, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2012, in press.
179. A. J. Björkman, R. A. Binnie, H. Zhang, L. B. Cole, M. A. Hermodson, S. L. Mowbray, J. Biol. Chem. 1994, 269, 30206-30211.
180. A. S. Halavaty, K. Moffat, Biochemistry 2007, 46, 14001-14009.
181. E. D. Getzoff, K. N. Gutwin, U. K. Genick, Nat. Struct. Biol. 2003, 10, 663-668.
182. M. Zhang, T. Tanaka, M. Ikura, Nat. Struct. Biol. 1995, 2, 758-767.
183. M. Ikura, G. M. Clore, A. M. Gronenborn, G. Zhu, C. B. Klee, A. Bax, Science 1992, 256, 632-638.