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ChemBioChem

Volumn 12, Issue 3, 2011, Pages 353-361

Engineering Protein Switches: Sensors, Regulators, and Spare Parts for Biology and Biotechnology

(4) Golynskiy, Misha V a Koay, Melissa S a Vinkenborg, Jan L a Merkx, Maarten a

a EINDHOVEN UNIVERSITY OF TECHNOLOGY (Netherlands)

Author keywords

Allosterism; Biosensors; Molecular switches; Protein design; Protein engineering; Synthetic biology

Indexed keywords

REGULATOR PROTEIN;

BIOLOGY; BIOTECHNOLOGY; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN ENGINEERING; REVIEW;

BIOSENSING TECHNIQUES; BIOTECHNOLOGY; CALCIUM-BINDING PROTEINS; DNA-BINDING PROTEINS; MOLECULAR IMAGING; PROTEIN ENGINEERING; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; WISKOTT-ALDRICH SYNDROME PROTEIN, NEURONAL;

EID: 79551521096 PISSN: 14394227 EISSN: 14397633 Source Type: Journal
DOI: 10.1002/cbic.201000642 Document Type: Review

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- Allen, M.D.¹ DiPilato, L.M.² Rahdar, M.³ Ren, Y.R.⁴ Chong, C.⁵ Liu, J.O.⁶ Zhang, J.⁷

64
- 77449142667
- I. Kotera, T. Iwasaki, H. Imamura, H. Noji, T. Nagai, ACS Chem. Biol. 2010, 5, 215.
- (2010) ACS Chem. Biol. , vol.5 , pp. 215
- Kotera, I.¹ Iwasaki, T.² Imamura, H.³ Noji, H.⁴ Nagai, T.⁵

65
- 34547600697
- J. L. Vinkenborg, T. H. Evers, S. W. A. Reulen, E. W. Meijer, M. Merkx, ChemBioChem 2007, 8, 1119.
- (2007) ChemBioChem , vol.8 , pp. 1119
- Vinkenborg, J.L.¹ Evers, T.H.² Reulen, S.W.A.³ Meijer, E.W.⁴ Merkx, M.⁵

66
- 70349621400
- J. L. Vinkenborg, T. J. Nicolson, E. A. Bellomo, M. S. Koay, G. A. Rutter, M. Merkx, Nat. Methods 2009, 6, 737.
- (2009) Nat. Methods , vol.6 , pp. 737
- Vinkenborg, J.L.¹ Nicolson, T.J.² Bellomo, E.A.³ Koay, M.S.⁴ Rutter, G.A.⁵ Merkx, M.⁶

67
- 69749117330
- D. A. Uhlenheuer, D. Wasserberg, H. Nguyen, L. Zhang, C. Blum, V. Subramaniam, L. Brunsveld, Chem. Eur. J. 2009, 15, 8779.
- (2009) Chem. Eur. J. , vol.15 , pp. 8779
- Uhlenheuer, D.A.¹ Wasserberg, D.² Nguyen, H.³ Zhang, L.⁴ Blum, C.⁵ Subramaniam, V.⁶ Brunsveld, L.⁷

68
- 78049318476
- M. V. Golynskiy, W. F. Rurup, M. Merkx, ChemBioChem 2010, 11, 2264.
- (2010) ChemBioChem , vol.11 , pp. 2264
- Golynskiy, M.V.¹ Rurup, W.F.² Merkx, M.³

69
- 44349104094
- J. Huang, A. Koide, K. Makabe, S. Koide, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 6578.
- (2008) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.105 , pp. 6578
- Huang, J.¹ Koide, A.² Makabe, K.³ Koide, S.⁴

70
- 70149092506
- J. Huang, K. Makabe, M. Biancalana, A. Koide, S. Koide, J. Mol. Biol. 2009, 392, 1221.
- (2009) J. Mol. Biol. , vol.392 , pp. 1221
- Huang, J.¹ Makabe, K.² Biancalana, M.³ Koide, A.⁴ Koide, S.⁵

71
- 34250885891
- T. Ohashi, S. D. Galiacy, G. Briscoe, H. P. Erickson, Protein Sci. 2007, 16, 1429.
- (2007) Protein Sci. , vol.16 , pp. 1429
- Ohashi, T.¹ Galiacy, S.D.² Briscoe, G.³ Erickson, H.P.⁴

72
- 21444436724
- A. W. Nguyen, P. S. Daugherty, Nat. Biotechnol. 2005, 23, 355.
- (2005) Nat. Biotechnol. , vol.23 , pp. 355
- Nguyen, A.W.¹ Daugherty, P.S.²

73
- 77949808895
- J. Huang, S. Koide, ACS Chem. Biol. 2010, 5, 273.
- (2010) ACS Chem. Biol. , vol.5 , pp. 273
- Huang, J.¹ Koide, S.²

74
- 48049089845
- F. Fan, B. F. Binkowski, B. L. Butler, P. F. Stecha, M. K. Lewils, K. V. Wood, ACS Chem. Biol. 2008, 3, 346.
- (2008) ACS Chem. Biol. , vol.3 , pp. 346
- Fan, F.¹ Binkowski, B.F.² Butler, B.L.³ Stecha, P.F.⁴ Lewils, M.K.⁵ Wood, K.V.⁶

75
- 48049122439
- S. B. Kim, Y. Umezawa, K. A. Kanno, H. Tao, ACS Chem. Biol. 2008, 3, 359.
- (2008) ACS Chem. Biol. , vol.3 , pp. 359
- Kim, S.B.¹ Umezawa, Y.² Kanno, K.A.³ Tao, H.⁴

76
- 34948822244
- L. M. Zhang, K. C. Lee, M. S. Bhojani, A. P. Khan, A. Shilman, E. C. Holland, B. D. Ross, A. Rehemtulla, Nat. Med. 2007, 13, 1114.
- (2007) Nat. Med. , vol.13 , pp. 1114
- Zhang, L.M.¹ Lee, K.C.² Bhojani, M.S.³ Khan, A.P.⁴ Shilman, A.⁵ Holland, E.C.⁶ Ross, B.D.⁷ Rehemtulla, A.⁸

77
- 58149391761
- V. Zhou, X. Q. Gao, S. L. Han, A. Brinker, J. S. Caldwell, X. J. Gu, Anal. Biochem. 2009, 385, 300.
- (2009) Anal. Biochem. , vol.385 , pp. 300
- Zhou, V.¹ Gao, X.Q.² Han, S.L.³ Brinker, A.⁴ Caldwell, J.S.⁵ Gu, X.J.⁶

78
- 77749270677
- J. J. Agresti, E. Antipov, A. R. Abate, K. Ahn, A. C. Rowat, J. C. Baret, M. Marquez, A. M. Klibanov, A. D. Griffiths, D. A. Weitz, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2010, 107, 4004.
- (2010) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.107 , pp. 4004
- Agresti, J.J.¹ Antipov, E.² Abate, A.R.³ Ahn, K.⁴ Rowat, A.C.⁵ Baret, J.C.⁶ Marquez, M.⁷ Klibanov, A.M.⁸ Griffiths, A.D.⁹ Weitz, D.A.¹⁰

79
- 77955563148
- A. B. Theberge, F. Courtois, Y. Schaerli, M. Fischlechner, C. Abell, F. Hollfelder, W. T. S. Huck, Angew. Chem. 2010, 122, 5982; Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 5846.
- (2010) Angew. Chem. 2010, 122, 5982; Angew. Chem. Int. Ed. , vol.49 , pp. 5846
- Theberge, A.B.¹ Courtois, F.² Schaerli, Y.³ Fischlechner, M.⁴ Abell, C.⁵ Hollfelder, F.⁶ Huck, W.T.S.⁷

80
- 77952516359
- R. Grunberg, T. S. Ferrar, A. M. van der Sloot, M. Constante, L. Serrano, Nucleic Acids Res. 2010, 38, 2645.
- (2010) Nucleic Acids Res. , vol.38 , pp. 2645
- Grunberg, R.¹ Ferrar, T.S.² van der Sloot, A.M.³ Constante, M.⁴ Serrano, L.⁵

81
- 77952473769
- R. Grunberg, L. Serrano, Nucleic Acids Res. 2010, 38, 2663.
- (2010) Nucleic Acids Res. , vol.38 , pp. 2663
- Grunberg, R.¹ Serrano, L.²

82
- 38749117220
- E. H. C. Bromley, K. Channon, E. Moutevelis, D. N. Woolfson, ACS Chem. Biol. 2008, 3, 38.
- (2008) ACS Chem. Biol. , vol.3 , pp. 38
- Bromley, E.H.C.¹ Channon, K.² Moutevelis, E.³ Woolfson, D.N.⁴

83
- 69549120468
- A. Vallée-Bélisle, F. Ricci, K. W. Plaxco, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2009, 106, 13802.
- (2009) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.106 , pp. 13802
- Vallée-Bélisle, A.¹ Ricci, F.² Plaxco, K.W.³

84
- 33947631807
- E. M. W. M. van Dongen, T. H. Evers, L. M. Dekkers, E. W. Meijer, L. W. J. Klomp, M. Merkx, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 3494.
- (2007) J. Am. Chem. Soc. , vol.129 , pp. 3494
- van Dongen, E.M.W.M.¹ Evers, T.H.² Dekkers, L.M.³ Meijer, E.W.⁴ Klomp, L.W.J.⁵ Merkx, M.⁶

85
- 33846809157
- V. M. Krishnamurthy, V. Semetey, P. J. Bracher, N. Shen, G. M. Whitesides, J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 1312.
- (2007) J. Am. Chem. Soc. , vol.129 , pp. 1312
- Krishnamurthy, V.M.¹ Semetey, V.² Bracher, P.J.³ Shen, N.⁴ Whitesides, G.M.⁵

86
- 0035909804
- H. X. Zhou, Biochemistry 2001, 40, 15069.
- (2001) Biochemistry , vol.40 , pp. 15069
- Zhou, H.X.¹

87
- 0037540052
- H. X. Zhou, J. Mol. Biol. 2003, 329, 1.
- (2003) J. Mol. Biol. , vol.329 , pp. 1
- Zhou, H.X.¹

88
- 1442300995
- H. X. Zhou, Biochemistry 2004, 43, 2141.
- (2004) Biochemistry , vol.43 , pp. 2141
- Zhou, H.X.¹

89
- 62649147958
- D. Van Valen, M. Haataja, R. Philips, Biophys. J. 2009, 96, 1275.
- (2009) Biophys. J. , vol.96 , pp. 1275
- Van Valen, D.¹ Haataja, M.² Philips, R.³

90
- 77955620283
- D. C. Gray, S. Mahrus, J. A. Wells, Cell 2010, 142, 637.
- (2010) Cell , vol.142 , pp. 637
- Gray, D.C.¹ Mahrus, S.² Wells, J.A.³

91
- 33751217186
- M. C. Wher, R. Laage, U. Bolz, T. M. Fischer, S. Grünewald, S. Scheek, A. Bach, K.-A. Nave, M. J. Rossner, Nat. Methods 2006, 3, 985.
- (2006) Nat. Methods , vol.3 , pp. 985
- Wher, M.C.¹ Laage, R.² Bolz, U.³ Fischer, T.M.⁴ Grünewald, S.⁵ Scheek, S.⁶ Bach, A.⁷ Nave, K.-A.⁸ Rossner, M.J.⁹

92
- 23344433223
- J. E. Kohn, K. W. Plaxco, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 10841.
- (2005) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.102 , pp. 10841
- Kohn, J.E.¹ Plaxco, K.W.²

93
- 14644435825
- H. J. Dyson, P. E. Wright, Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2005, 6, 197.
- (2005) Nat. Rev. Mol. Cell Biol. , vol.6 , pp. 197
- Dyson, H.J.¹ Wright, P.E.²

94
- 48249097986
- V. N. Uversky, C. J. Oldfield, A. K. Dunker, Annu. Rev. Biophys. Bioeng. 2008, 37, 215.
- (2008) Annu. Rev. Biophys. Bioeng. , vol.37 , pp. 215
- Uversky, V.N.¹ Oldfield, C.J.² Dunker, A.K.³

95
- 72749092609
- G. R. Szilvay, M. A. Blenner, O. Shur, D. M. Cropek, S. Banta, Biochemistry 2009, 48, 11273.
- (2009) Biochemistry , vol.48 , pp. 11273
- Szilvay, G.R.¹ Blenner, M.A.² Shur, O.³ Cropek, D.M.⁴ Banta, S.⁵

96
- 76149119813
- I. Goreshnik, D. J. Maly, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 938.
- (2010) J. Am. Chem. Soc. , vol.132 , pp. 938
- Goreshnik, I.¹ Maly, D.J.²

97
- 67649243556
- H.-M. Lee, D. R. Larson, D. S. Lawrence, ACS Chem. Biol. 2009, 4, 409.
- (2009) ACS Chem. Biol. , vol.4 , pp. 409
- Lee, H.-M.¹ Larson, D.R.² Lawrence, D.S.³

98
- 69949104482
- Y. I. Wu, D. Frey, O. I. Lungu, A. Jaehrig, I. Schlichting, B. Kuhlman, K. M. Hahn, Nature 2009, 461, 104.
- (2009) Nature , vol.461 , pp. 104
- Wu, Y.I.¹ Frey, D.² Lungu, O.I.³ Jaehrig, A.⁴ Schlichting, I.⁵ Kuhlman, B.⁶ Hahn, K.M.⁷

99
- 47649085005
- X. L. Yao, M. K. Rosen, K. H. Gardner, Nat. Chem. Biol. 2008, 4, 491.
- (2008) Nat. Chem. Biol. , vol.4 , pp. 491
- Yao, X.L.¹ Rosen, M.K.² Gardner, K.H.³

100
- 0036789439
- S. Shimizu-Sato, E. Huq, J. M. Tepperman, P. H. Quail, Nat. Biotechnol. 2002, 20, 1041.
- (2002) Nat. Biotechnol. , vol.20 , pp. 1041
- Shimizu-Sato, S.¹ Huq, E.² Tepperman, J.M.³ Quail, P.H.⁴

101
- 51349089700
- D. W. Leung, C. Otomo, J. Choro, M. K. Rosen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 12979.
- (2008) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.105 , pp. 12979
- Leung, D.W.¹ Otomo, C.² Choro, J.³ Rosen, M.K.⁴

102
- 70350070364
- A. Levskaya, O. D. Weiner, W. A. Lim, C. A. Voigt, Nature 2009, 461, 997.
- (2009) Nature , vol.461 , pp. 997
- Levskaya, A.¹ Weiner, O.D.² Lim, W.A.³ Voigt, C.A.⁴

103
- 78650796409
- M. M. Stratton, S. N. Loh, Protein Sci. 2011, 20, 19.
- (2011) Protein Sci. , vol.20 , pp. 19
- Stratton, M.M.¹ Loh, S.N.²

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.