Fitness variations and their impact on the evolution of antiretroviral drug resistance

Current Drug Targets - Infectious Disorders

Volumn 3, Issue 4, 2003, Pages 355-371

  Menéndez Arias, Luis ^a   Martínez, Miguel A ^b   Quiñones Mateu, Miguel E ^c   Martinez Picado, Javier ^b  

^a UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE MADRID   (Spain)

^b HOSPITAL UNIVERSITARI GERMANS TRIAS I PUJOL   (Spain)

^c LERNER RESEARCH INSTITUTE   (United States)

Author keywords

Antiretroviral drugs; Drug resistance; Evolution; Fitness; HIV; Protease; Reverse transcriptase

Indexed keywords

AMINO ACID; AMPRENAVIR; ANTIRETROVIRUS AGENT; ATAZANAVIR; INDINAVIR; LOPINAVIR; NELFINAVIR; PROTEINASE; PROTEINASE INHIBITOR; RITONAVIR; RNA DIRECTED DNA POLYMERASE; RNA DIRECTED DNA POLYMERASE INHIBITOR; SAQUINAVIR; ZIDOVUDINE;

AMINO ACID SUBSTITUTION; DISEASE COURSE; DRUG RECEPTOR BINDING; DRUG RESISTANCE; DRUG STRUCTURE; GENETIC HETEROGENEITY; GENETIC VARIABILITY; HUMAN; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS INFECTION; IN VITRO STUDY; IN VIVO STUDY; MOLECULAR MECHANICS; NONHUMAN; POPULATION GENETICS; REVIEW; STRUCTURE ANALYSIS; VIROGENESIS; VIRUS INFECTIVITY; VIRUS MUTATION; VIRUS RECOMBINATION; VIRUS REPLICATION; VIRUS TRANSMISSION;

ANTI-HIV AGENTS; DRUG RESISTANCE, MULTIPLE, VIRAL; EVOLUTION, MOLECULAR; HIV INFECTIONS; HIV-1; HUMANS; MODELS, MOLECULAR; POINT MUTATION; VARIATION (GENETICS); VIRUS REPLICATION;

EID: 0347513227     PISSN: 15680053     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/1568005033481033     Document Type: Review

References (151)

1. Menéndez-Arias, L. Prog. Nucl. Acid Res. Mol. Biol., 2002, 71, 91.
2. Svaroskaia, E.S.; Cheslock, S.R.; Zhang, W.-H.; Hu, W.-S.; Pathak, V.K. Front. Biosci., 2003, 8, D117.
3. Menéndez-Arias, L. Trends Pharmacol. Sci., 2002, 23, 381.
4. Domingo, E.; Holland, J.J. Annu. Rev. Microbiol., 1997, 51, 151.
5. Domingo, E.; Escarmis, C.; Menéndez-Arias, L.; Holland, J.J. In Origin and Evolution of Viruses; Domingo, E.; Webster, R.; Holland, J.J. Eds.; Academic Press: San Diego, California, USA, 1999, pp. 141.
6. Gulnik, S.V.; Suvorov, L.I.; Liu, B.; Yu, B.; Anderson, B.; Mitsuya, H.; Erickson, J.W.; Biochemistry, 1995, 34, 9282.
7. Erickson, J.W.; Gulnik, S.V.; Markowitz, M. AIDS, 1999, 13 (suppl. A), S189.
8. Quiñones-Mateu, M.E.; Arts, E.J. Drug Resistance Updates, 2002, 5, 224.
9. Ho, D.D.; Toyoshima, T.; Mo, H.; Kempf, D.J.; Norbeck, D.; Chen, C.-M.; Wideburg, N.E.; Burt, S.K.; Erickson, J.W.; Singh, M.K. J. Virol., 1994, 68, 2016.
10. Markowitz, M.; Mo, H.; Kempf, D.J.; Norbeck, D.W.; Bhat, T.N.; Erickson, J.W.; Ho, D.D. J. Virol., 1995, 69, 701.
11. Maeda, Y.; Venzon, D.J.; Mitsuya, H. J. Infect. Dis., 1998, 177, 1207.
12. Martinez-Picado, J.; Savara, A.V.; Sutton, L.; D'Aquila, R.T. J. Virol., 1999, 73, 3744.
13. Prado, J.G.; Wrin, T.; Beauchaine, J.; Ruiz, L.; Petropoulos, C.J.; Frost, S.D.W.; Clotet, B.; D'Aquila, R.T.; Martínez-Picado, J. AIDS, 2002, 16, 1009.
14. Harrigan, P.R.; Kinghorn, I.; Bloor, S.; Kemp, S.D.; Nájera, I.; Kohli, A.; Larder, B.A. J. Virol., 1996, 70, 5930.
15. Sharma, P.L.; Crumpacker, C.S. J. Virol., 1997, 71, 8846.
16. Kosalaraksa, P.; Kavlick, M.F.; Maroun, V.; Le, R.; Mitsuya, H. J. Virol., 1999, 73, 5356.
17. Goudsmit, J.; de Ronde, A.; Ho, D.D.; Perelson, A.S. J. Virol., 1996, 70, 5662.
18. Crow, J.F.; Kimura, M. An introduction to population genetics theory, Harper & Row: New York, 1970.
19. Marée, A.F.M.; Keulen, W.; Boucher, C.A.B.; De Boer, R.J. J. Virol. 2000, 74, 11067.
20. De Ronde, A.; van Dooren, M.; van der Hoek, L.; Bouwhuis, D.; de Rooij, E.; van Gemen, B.; de Boer, R.; Goudsmit, J. J. Virol., 2001, 75, 595.
21. Mammano, F.; Trouplin, V.; Zennou, V.; Clavel, F. J. Virol., 2000, 74, 8524.
22. Bleiber, G.; Munoz, M.; Ciuffi, A.; Meylan, P.; Telenti, A. J. Virol., 2001, 75, 3291.
23. Gamarnik, A.; Wrin, T.; Ziermann, R.; Huang, W.; Whitehurst, N.; Whitcomb, J.M.; Petropoulos, C.J.; The ViroLogic Clinical Reference Laboratory. Antivir. Ther., 2000, 5 (suppl. 3), 92.
24. Huang, W.; Gamarnik, A.; Limoli, K.; Petropoulos, C.J.; Whitcomb, J.M. J. Virol., 2003, 77, 1512.
25. Petropoulos, C.J.; Parkin, N.T.; Limoli, K.L.; Lie, Y.S.; Wrin, T.; Huang, W.; Tian, H.; Smith, D.; Winslow, G.A.; Capon, D.J.; Whitcomb, J.M. Antimicrob. Agents Chemother., 2000, 44, 920.
26. Stoddart, C.A.; Liegler, T.J.; Mammano, F.; Linquist-Stepps, V.D.; Hayden, M.S.; Deeks, S.G.; Grant, R.M.; Clavel, F.; McCune, J.M. Nat. Med., 2001, 7, 712.
27. Perelson, A.S.; Neumann, A.U.; Markowitz, M.; Leonard, J.M.; Ho, D.D. Science, 1996, 271, 1582.
28. Goudsmit, J.; de Ronde, A.; de Rooij, E.; de Boer, R. J. Virol., 1997, 71, 4479.
29. Frost, S.D.W.; Nijhuis, M.; Schuurman, R.; Boucher, C.A.B.; Leigh Brown, A.J. J. Virol., 2000, 74, 6262.
30. Eastman, P.S.; Mittler, J.; Kelso, R.; Gee, C.; Boyer, E.; Kolberg, J.; Urdea, M.; Leonard, J.M.; Norbeck, D.W.; Mo, H.; Markowitz, M. J. Virol., 1998, 72, 5154.
31. Wlodawer, A.; Vondrasek, J. Anuu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 1998, 27, 249.
32. Potts, K.E.; Smidt, M.L.; Tucker, S.P.; Stiebel, T.R., Jr.; McDonald, J.J.; Stallings, W.C.; Bryant, M.L. Antivir. Chem. Chemother., 1997, 8, 447.
33. Smidt, M.L.; Potts, K.E.; Tucker, S.P.; Blystone, L.; Stiebel, T.R., Jr.; Stallings, W.C.; McDonald, J.J.; Pillay, D.; Richman, D.D.; Bryant, M.L, Antimicrob. Agents Chemother., 1997, 41, 515.
34. Sugiura, W.; Matsuda, Z.; Yokomaku, Y.; Hertogs, K.; Larder, B.; Nagai, Y. Antivir. Ther., 2000, 5 (suppl. 3), 33.
35. Sugiura, W.; Matsuda, Z.; Yokomaku, Y.; Hertogs, K.; Larder, B.; Oishi, T.; Okano, A.; Shiino, T.; Tatsumi, M.; Matsuda, M.; Abumi, H.; Takata, N.; Shirahata, S.; Yamada, K.; Yoshikura, H.; Nagai, Y. Antimicrob. Agents Chemother., 2002, 46, 708.
36. Croteau, G.; Doyon, L.; Thibeault, D.; McKercher, G.; Pilote, L.; Lamarre, D. J. Virol., 1997, 71, 1089.
37. Martínez-Picado, J.; Savara, A.V.; Shi, L.; Sutton, L.; D'Aquila, R.T. Virology, 2000, 275, 318.
38. Maguire, M.F.; Guinea, R.; Griffin, P.; Macmanus, S.; Elston, R.C.; Wolfram, J.; Richards, N.; Hanlon, M.H.; Porter, D.J.T.; Wrin, T.; Parkin, N.; Tisdale, M.; Furfine, E.; Petropoulos, C.; Snowden, B.W.; Kleim, J.-P. J. Virol., 2002, 76, 7398.
39. King, R.W.; Garber, S.; Winslow, D.L.; Reid, C.; Bacheler, L.T.; Anton, E.; Otto, M.J. Antivir. Chem. Chemother., 1995, 6, 80.
40. Tucker, S.P.; Stiebel, T.R., Jr.; Potts, K.E.; Smidt, M.L.; Bryant, M.L. Antimicrob. Agents Chemother., 1998, 42, 478.
41. NiJhuis, M.; Schuurman, R.; de Jong, D.; Erickson, J.; Gustchina, E.; Albert, J.; Schipper, P.; Gulnik, S.; Boucher, C.A.B. AIDS, 1999, 13, 2349.
42. Rayner, M.M.; Cordova, B.; Jackson, D.A. Virology, 1997, 236, 85.
43. Resch, W.; Ziermann, R.; Parkin, N.; Gamarnik, A.; Swanstrom, R. J. Virol., 2002, 76, 8659.
44. Doyon, L.; Croteau, G.; Thibeault, D.; Poulin, F.; Pilote, L.; Lamarre, D. J. Virol., 1996, 70, 3763.
45. Zhang, Y.-M.; Imamichi, H.; Imamichi, T,; Lane, H.C.; Falloon, J.; Vasudevachari, M.B.; Salzman, N.P. J. Virol., 1997, 71, 6662.
46. Jacobsen, H.; Yasargil, K.; Winslow, D.L.; Craig, J.C.; Kröhn, A.; Duncan, I.B.; Mous, J. Virology, 1995, 206, 527.
47. Rose, R.E.; Gong, Y.-F.; Greytok, J.A.; Bechtold, C.M.; Terry, B.J.; Robinson, B.S.; Alam, M.; Colonno, R.J.; Lin, P.-F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1996, 93, 1648.
48. Robinson, L.H.; Myers, R.E.; Snowden, B.W.; Tisdale, M.; Blair, E.D. AIDS Res. Human Retrovir., 2000, 16, 1149.
49. Zennou, V.; Mammano, F.; Paulous, S.; Mathez, D.; Clavel, F. J. Virol., 1998, 72, 3300.
50. Condra, J.H.; Schleif, W.A.; Blahy, O.M.; Gabryelski, L.J.; Graham, D.J.; Quintero, J.C.; Rhodes, A.; Robbins, H.L.; Roth, E.; Shivaprakash, M.; Titus, D.; Yang, T.; Teppler, H.; Squires, K.E.; Deutsch, P.J.; Emini, E.A. Nature, 1995, 374, 569.
51. Chen, Z.; Li, Y.; Schock, H.B.; Hall, D.; Chen, E.; Koo, L.C. J. Biol. Chem., 1995, 270, 21433.
52. Schock, H.B.; Garsky, V.M.; Kuo, L.C. J. Biol. Chem., 1996, 271, 31957.
53. Yusa, K.; Song, W.; Bartelmann, M.; Harada, S. J. Virol., 2002, 76, 3031.
54. Devereux, H.L.; Emery, V.C.; Johnson, M.A.; Loveday, C. J. Med. Virol., 2001, 65, 218.
55. Kantor, R.; Fessel, W.J.; Zolopa, A.R.; Israelski, D.; Shulman, N.; Montoya, J.G.; Harbour, M.; Schapiro, J.M.; Shafer, R.W. Antimicrob. Agents Chemother., 2002, 46, 1086.
56. Svedhem, V.; Lindkvist, A.; Lidman, K.; Sönnerborg, A. J. Med. Virol., 2002, 68, 473.
57. Antinori, A.; Liuzzi, G.; Cingoluni, A.; Bertoli, A.; Di Giambenedetto, S.; Trotta, M.P.; Rizzo, M.G.; Girardi, E.; De Luca, A.; Perno, C.F. AIDS, 2001, 15, 2325.
58. Hance, A.J.; Lemiale, V.; Izopet, J.; Lecossier, D.; July, V.; Massip, P.; Mammano, F.; Descamps, D.; Brun-Vézinet, F.; Clavel, F. J. Virol. 2001, 75, 6410.
59. Fehér, A.; Weber, I.T.; Bagossi, P.; Boross, P.; Mahalingam, B.; Louis, J.M.; Copeland, T.D.; Torshin, I.Y.; Harrison, R.W.; Tözsér, J. Eur. J. Biochem., 2002, 269, 4114.
60. Pettit, S.C.; Henderson, G.J.; Schiffer, C.A.; Swanstrom, R. J. Virol., 2002, 76, 10226.
61. Matsuoka-Aizawa, S.; Sato, H.; Hachiya, A.; Tsuchiya, K.; Takebe, Y.; Gatanaga, H.; Kimura, S.; Oka, S. J. Virol., 2003, 77, 318.
62. Doyon, L.; Payant, C.; Brakier-Gingras, L.; Lamarre, D. J. Virol., 1998, 72, 6146.
63. Gatanaga, FL; Suzuki, Y.; Tsang, H.; Yoshimura, K.; Kavlick, M.F.; Nagashima, K.; Gorelick, R.J.; Mardy, S.; Tang, C.; Summers, M.F.; Mitsuya, H. J. Biol. Chem., 2002, 277, 5952.
64. Esnouf, R.M.; Ren, J.; Hopkins, A.L.; Ross, C,K.; Jones, E.Y.; Stammers, D.K.; Stuart, D.I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1997, 94, 3984.
65. Gerondelis, P.; Archer, R.H.; Palaniappan, C.; Reichman, R.C.; Fay, P.J.; Bambara, R.A.; Demeter, L.M. J. Virol., 1999, 73, 5803.
66. Imamichi, T.; Berg, S.C.; Imamichi, H.; Lopez, J.C.; Metcalf, J.A.; Falloon, J.; Lane, H.C. J. Virol., 2000, 74, 10958.
67. Huang, W.; Wrin, T.; Gamarnik, A.; Beauchaine, J.; Whitcomb, J.M.; Petropoulos, C.J. Antivir. Ther., 2002, 7, S60.
68. Nicastri, E.; Sarmati, L.; d'Ettorre, G.; Palmisano, L.; Parisi, S.G.; Uccella, I.; Rianda, A.; Concia, E.; Vullo, V.; Vella, S.; Andreoni, M. J. Med. Virol., 2003, 69, 1.
69. Archer, R.H.; Dykes, C.; Gerondelis, P.; Lloyd, A.; Fay, P.; Reichman, R.C.; Bambara, R.A.; Demeter, L.M. J. Virol., 2000, 74, 8390.
70. Iglesias-Ussel, M.D.; Casado, C.; Yuste, E.; Olivares, I.; López-Galíndez, C. J. Gen. Virol., 2002, 83, 93.
71. Dykes, C.; Fox, K.; Lloyd, A.; Chiulli, M.; Morse, E.; Demeter, L.M. Virology, 2001, 285, 193.
72. Pelemans, H.; Aertsen, A.; van Laethem, K.; Vandamme, A-M.; de Clercq, E.; Pérez-Pérez, M.J.; San-Félix, A.; Velázquez, S.; Camarasa, M.-J.; Balzarini, J. Virology, 2001, 280, 97.
73. Olmsted, R.A.; Slade, D.E.; Kopta, L.A.; Poppe, S.M.; Poel, T.J.; Newport, S.W.; Rank, K.B.; Biles, C.; Morge, R.A.; Dueweke, T.J.; Yagi, Y.; Romero, D.L.; Thomas, R.C.; Sharma, S.K.; Tarpley, W.G. J. Virol., 1996, 70, 3698.
74. Fan, N.; Rank, K.B.; Slade, D.E.; Poppe, S.M.; Evans, D.B.; Kopta, L.A.; Olmsted, R.A.; Thomas, R.C.; Tarpley, W.G.; Sharma, S.K. Biochemistry, 1996, 35, 9737.
75. Harrigan, P.R.; Bloor, S.; Larder, B.A. J. Virol., 1998, 72, 3773.
76. Kellam, P.; Boucher, C.A.; Larder, B.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 1992, 89, 1934.
77. Jeeninga, R.E.; Keulen, W.; Boucher, C.; Sanders, R.W.; Berkhout, B. Virology, 2001, 283, 294.
78. Larder, B.A. J. Gen. Virol., 1994, 75, 951.
79. Yerly, S.; Rakik, A.; de Loes, S.K.; Hirschel, B.; Descamps, D.; Brun-Vézinet, F.; Perrin, L. J. Virol., 1998, 72, 3520.
80. Garcia-Lerma, J.G.; Nidtha, S.; Blumoff, K.; Weinstock, H.; Heneine, W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2001, 98, 13907.
81. Kuritzkes, D.R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2001, 98, 13485,
82. Back, N.K.T.; Nijhuis. M.; Keulen, W.; Boucher, C.A.B.; Oude Essink, B.B.; van Kuilenburg, A.B.P.; van Gennip, A.H.; Berkhout, B. EMBO J., 1996, 15, 4040.
83. Keulen, W.; Back, N.K.T.; van Wijk, A.; Boucher, C.A.B.; Berkhout, B. J. Virol., 1997, 71, 3346.
84. Miller, M.D.; Anton, K.E.; Mulato, A.S.; Lamy, P.D.; Cherrington, J.M. J. Infect. Dis., 1999, 179, 92.
85. Shafer, R.W.; Winters, M.A.; Iversen, A.K.N.; Merigan, T.C. Antimicrob. Agents Chemother., 1996, 40, 2887,
86. Yoshimura, K.; Feldman, R.; Kodama, E.; Kavlick, M.F.; Qiu, Y.-L.; Zemlicka, J.; Mitsuya, H. Antimicrob. Agents Chemother., 1999, 43, 2479.
87. Harrigan, P.R.; Stone, C.; Griffin, P.; Nájera, I.; Bloor, S.; Kemp, S.; Tisdale, M.; Larder, B.; The CNA2001 Investigative Group. J. Infect. Dis., 2000, 181, 912.
88. Brenner, B.G.; Routy, J.-P.; Petrella, M.; Moisi, D.; Oliveira, M.; Detorio, M.; Spira, B.; Essabag, V.; Conway, B.; Lalonde, R.; Sekaly, R.-P.; Wainberg, M.A. J. Virol., 2002, 76, 1753.
89. Martinez-Picado, J.; Morales-Lopetegui, K.; Wrin, T.; Prado, J.G.; Frost, S.D.; Petropoulos, C,J.; Clotet, B.; Ruiz, L. AIDS, 2002, 16, 895.
90. Diallo, K.; Oliveira, M.; Moisi, D.; Brenner, B.; Wainberg, M.A.; Götte, M. Antimicrob. Agents Chemother., 2002, 46, 2254.
91. Wei, X.; Liang, C.; Götte, M.; Wainberg, M.A. AIDS, 2002, 16, 2391.
92. Whitney, J.B.; Oliveira, M.; Detorio, M.; Guan, Y.; Wainberg, M.A. J. Virol., 2002, 76, 8958.
93. Sharma, P.L.; Crumpacker, C.S. J. Virol., 1999, 73, 8448.
94. White, K.L.; Margot, N.A.; Wrin, T.; Petropoulos, C.J.; Miller, M.D.; Naeger, L.K. Antimicrob. Agents Chemother. 2002, 46, 3437.
95. Miller, M.D.; Lamy, P.D.; Fuller, M.D.; Mulato, A.S.; Margot, N.A.; Cihlar, T.; Cherrington, J.M. Mol. Pharmacol., 1998, 54, 291.
96. Deval, J.; Navarro, J.-M.; Selmi, B.; Courcambeck, J.; Boretto, J.; Halfon, P.; Sire, J.; Canard, B. Antivir. Ther., 2003, 8, S40.
97. Shirasaka, T.; Kavlick, M.F.; Ueno, T.; Gao, W.-Y.; Kojima, E.; Alcaide, M.L.; Chokekijchai, S.; Roy, B.M.; Arnold, E.; Yarchoan, R.; Mitsuya, H. Proc. Natl. Acad Sci. U.S.A., 1995, 92, 2398.
98. Iversen, A.K.N.; Shafer, R.W.; Wehrly, K.; Winter, M.A.; Mullins, J.I., Chesebro, B.; Merigan, T.C. J. Virol., 1996, 70, 1086.
99. García-Lerma, J.G.; Gerrish, P.J.; Wright, A.C.; Qari, S.H.; Heneine, W. J. Virol., 2000, 74, 9339.
100. Matsumi, S.; Kosalaraksa, P.; Tsang, H.; Kavlick, M.F.; Harada, S.; Mitsuya, H. AIDS, 2003, 17, 1127.
101. Mas, A.; Parera, M.; Briones, C.; Soriano, V.; Martínez, M.A.; Domingo, E.; Menéndez-Arias, L. EMBO J., 2000, 19, 5752.
102. Quiñiones-Mateu, M.E.; Tadele, M.; Parera, M.; Mas, A.; Weber, J.; Rangel, H.R.; Chakraborty, B.; Clotet, B.; Domingo, E.; Menéndez-Arias, L.; Martínez, M.A. J. Virol., 2002, 76, 10546.
103. Briones, C.; Mas, A.; Gómez-Mariano, G.; Altisent, C.; Menéndez-Arias, L.; Soriano, V.; Domingo, E. Virus Res., 2000, 66, 13.
104. Lukashov, V.V.; Huismans, R.; Jebbink, M.F.; Danner, S.A.; de Boer, R.J.; Goudsmit, J. AIDS Res. Human Retrovir., 2001, 17, 807.
105. Imamichi, T.; Murphy, M.A.; Imamichi, H.; Lane, H.C. J. Virol., 2001, 75, 3988.
106. Rimsky, L.T.; Shugars, D.C.; Matthews, T.J. J. Virol., 1998, 72, 986.
107. Lu, J.; Kuritzkes, D.R. Antivir. Ther., 2001, 6 (suppl. 1), 19.
108. Lu, J.; Sista, P.; Cammack, N.; Kuritzkes, D. Antivir. Ther., 2002, 7, S67.
109. Reeves, J.D.; Gallo, S.A.; Ahmad, N.; Miamidian, J.L.; Harvey, P.E.; Sharron, M.; Pöhlmann, S.; Sfakianos, J.N.; Derdeyn, C.A.; Blumenthal, R.; Hunter, E.; Doms, R.W. Proc. Natl. Acad Sci. U.S.A., 2002, 99, 16249.
110. Rangel, H.R.; Weber, J.; Chakraborty, B.; Gutiérrez, A.; Marotta, M.L.; Mirza, M.; Kiser, P.; Martínez, M.A.; Esté, J.A.; Quiñones-Mateu, M.E. J. Virol., 2003, 77, 9069.
111. Armand-Ugón, M.; Quiñones-Mateu, M.E.; Gutiérrez, A.; Barretina, J.; Blanco, J.; Schols, D.; de Clercq, E.; Clotet, B.; Esté, J.A. Antivir. Ther., 2003, 8, 1.
112. Hazuda, D.J.; Felock, P.; Witmer, M.; Wolfe, A.; Stillmock, K.; Grobler, J.A.; Espeseth, A.; Gabryelski, L.; Schleif, W.; Blau, C.; Miller, M.D. Science, 2000, 287, 646.
113. Fikkert, V.; van Maele, B.; van Remoortel, B.; Michiels, M.; Vercammen, J.; Pannecouque, C.; Engelborghs, Y.; de Clercq, E.; Debyser, Z.; Witvrouw, M. 10th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections, Boston, 2003. Abstract 556.
114. Marki, Y.; Kaufmann, G.R.; Battegay, M.; Klimkait, T. J. Infect. Dis002, 185, 1844.
115. Weber, J.; Rangel, H.R.; Chakraborty, B.; Marotta, M.L.; Valdez, H.; Fransen, K.; Florence, E.; Connick, E.; Smith, K.Y.; Colebunders, R.L.; Landay, A.; Kuritzkes, D.R.; Lederman, M.M.; Vanham, G.; Quiñones-Mateu, M.E. J. Acquir. Immune Defic. Syndr., 2003, 33, 448.
116. Weber, J.; Rangel, H.R.; Chakraborty, B.; Tadele, M.; Martínez, M.A.; Martinez-Picado, J,; Marotta, M.L.; Mirza, M.; Ruiz, L.; Clotet, B.; Wrin, T.; Petropoulos, C.J.; Quiñones-Mateu, M.E. J. Gen. Virol., 2003, 84, 2217.
117. Roger, M. FASEB J., 1998, 12, 625.
118. Hogan, C.M.; Hammer, S.M. Ann. Int. Aled., 2001, 134, 978.
119. Hogan, C.M.; Hammer, S.M. Ann. Int. Med., 2001, 134, 761.
120. Moore, C.B.; John, M.; James, I.R.; Christiansen, F.T.; Witt, C.S.; Mallal, S.A. Science, 2002, 296, 1439.
121. Karlsson, A.C.; Decks, S.G.; Barbour, J.D.; Heiken, B.D.; Younger, S.R.; Hoh, R.; Lane, M.; Sallberg, M.; Ortiz, G.M.; Demarest, J.F.; Liegler, T.; Grant, R.M.; Martin, J.N.; Nixon, D.F. J. Virol., 2003, 77, 6743.
122. Quiñones-Mateu, M.E.; Ball, S.C.; Marozsan, A.J.; Torre, V.S.; Albright, J.L.; Vanham, G.; van Der Gruen, G.; Colebunders, R.L.; Arts, E.J. J. Virol., 2000, 74, 9222.
123. Decks, S.G.; Wrin, T.; Liegler, T.; Hoh, R.; Hayden, M.; Barbour, J.D.; Hellmann, N.S.; Petropoulos, C.J.; McCune, J.M.; Hellerstein, M.K.; Grant, R.M. N. Engl. J. Med., 2001, 344, 472.
124. Barbour, J.D.; Wrin, T.; Grant, R.M.; Martin, J.N.; Segal, M.R.; Petropoulos, C.J.; Deeks, S.G. J. Virol., 2002, 76, 11104.
125. Haubrich, R.; Wrin, T.; Hellmann, N.; McCutchan, J.A.; Keiser, P.; Kemper, C.; Witt, M.; Leedom, J.; Forthal, D.; Richman, D.; The CCTG. Antivir. Ther., 2002, 7, S101.
126. Tebas, P.; Patick, A.K.; Kane, E.M.; Klebert, M.K.; Simpson, J.H.; Erice, A.; Powderly, W.G.; Henry, K. AIDS, 1999, 13, F23.
127. Zolopa, A.R.; Shafer, R.W.; Warford, A.; Montoya, J.G.; Hsu, P.; Katzenstein, D.; Merigan, T.C.; Efron, B. Ann. Int. Med,, 1999, 131, 813.
128. Liegler, T.J.; Hayden, M.S.; Lee, K,H.; Hoh, R.; Deeks, S.G.; Grant, R.M. AIDS, 2001, 15, 179.
129. Penn, M.L.; Myers, M.; Eckstein, D.A.; Liegler, T.J.; Hayden, M.; Mammano, F.; Clavel, F.; Deeks, S.G.; Grant, R.M.; Goldsmith, M.A. AIDS Res. Human Retrovir., 2001, 17, 517.
130. Decks, S.G.; Paxinos, E.E.; Wrin, T.; Hoh, R.; Aweeka, F.; Martin, J.N.; Petropoulos, C.J.; Grant, R.M. Antivir. Ther., 2003, 8, S73.
131. Boden, D.; Hurley, A.; Zhang, L.; Cao, Y.; Goo, Y.; Jones, E.; Tsay, J.; Ip, J.; Farthing, C.; Limoli, K.; Parkin, N.; Markowitz, M. J. Amer. Med. Assoc., 1999, 282, 1135.
132. Little, S.J.; Daar, E.S.; D'Aquila, R.T.; Keiser, P.H.; Connick, E.; Whitcomb, J.M.; Hellmann, N.S.; Petropoulos, C.J.; Sutton, L.; Pitt, J.A.; Rosenberg, E.S.; Koup, R.A.; Walker, B.D.; Richman, D.D. J. Amer. Med. Assoc., 1999, 282, 1142.
133. Yerly, S.; Kaiser, L.; Race, E.; Bru, J.P.; Clavel, F.; Perrin, L. Lancet, 1999, 354, 729.
134. UK Collaborative Group on Monitoring the Transmission of HIV Drug resistance. Brit. Med. J, 2001, 322, 1087.
135. Little, S.J.; Holte, S.; Routy, J.P.; Daar, E.S.; Markowitz, M.; Collier, A.C.; Koup, R.A.; Mellors, J.W.; Connick, E.; Conway, B.; Kilby, M.; Wang, L.; Whitcomb, J.M.; Hellmann, N.S.; Richman, D.D. N. Engl. J. Med., 2002, 347, 385.
136. Leigh Brown, A.J.; Frost, S.D.W.; Mathews, W.C.; Dawson, K.; Hellmann, N.S.; Daar, E.S.; Richman, D.D.; Little, S.J. J. Infect. Dis., 2003, 187, 683.
137. Simon, V.; Padte, N.; Murray, D.; Vanderhoeven, J.; Wrin, T.; Parkin, N.; Di Mascio, M.; Markowitz, M. J. Virol., 2003, 77, 7736.
138. Izopet, J.; Massip, P.; Souyris, C.; Sandres, K.; Puissant, B.; Obadia, M.; Pasquier, C.; Bonnet, E.; Marchou, B.; Puel, J. AIDS, 2000, 14, 2247.
139. Miller, V.; Sabim, C.; Hertogs, K.; Bloor, S.; Martinez-Picado, J,; D'Aquila, R.; Larder, B.; Lutz, T.; Gute, P.; Weidmann, E.; Rabenau, H.; Phillips, A.; Staszewski, S. AIDS, 2000, 14, 2857.
140. Turner, D.; Brenner, B.G.; Routy, J.-P.; Moisi, D.; Wainberg, M.A. Antivir. Ther., 2003, 7, S143.
141. Barbour, J.D.; Wrin, T.; Hecht, F.M.; Hellmann, N.S.; Petropoulos, C.J.; Segal, M.R.; Grant, R.M. Antivir. Ther., 2003, 7, S80.
142. Grant, R.M.; Barbour, J.D.; Wrin, T.; Warmerdam, M.; Hellmann, N.S.; Kahn, J.O.; Petropoulos, C.J.; Hecht, F.R. Antivir. Ther., 2002, 7, S41.
143. Little, S.J.; Dawson, K.; Hellman, N.S.; Richman, D.D.; Frost, S.D.W. Antivir. Ther., 2003, 7, S129.
144. Robinson, L.H.; Gale, C.V.; Kleim, J.P. J. Virol. Methods, 2002, 104, 147.
145. Mammano, F.; Petit, C.; Clavel, F. J. Virol., 1998, 72, 7632.
146. Peters, S.; Munoz, M.; Yerly, S.; Sánchez-Merino, V.; López-Galíndez, C.; Perrin, L.; Larder, B.; Cmarko, D.; Fakan, S.; Meylan, P.; Telenti, A. J. Virol., 2001, 75, 9644.
147. Arts, E.J.; Quiñones-Mateu, M.E. AIDS, 2003, 17, 780.
148. Hirsch, M.S.; Brun-Vézinet, F.; Clotet, B.; Conway, B.; Kuritzkes, D.R.; D'Aquila, R.T.; Demeter, L.M.; Hammer, S.M.; Johnson, V.A.; Loveday, C.; Mellors, J.W.; Jacobsen, D.M.; Richman, D.D. Clin. Infect. Dis., 2003, 37, 113.
149. Clavel, F.; Race, E.; Mammano, F. Adv. Pharmacol., 2000, 49, 41.
150. Nijhuis, M.; Deeks, S.; Boucher, C. Curr. Opin. Infect. Dis., 2001, 14, 23.
151. Quiñones-Mateu, M.E.; Arts, E.J. In HIV Sequence Compendium 2001, Kuiken, C.; Foley, B.; Hahn, B.; Marx, P.; McCutchan, F.; Mellors, J.; Wolinsky, S.; Korber, B. Eds.; Theoretical Biology and Biophysics Group, Los Alamos National Laboratory: Los Alamos, NM, 2001, pp. 134.