Structure and function of DNA photolyase and cryptochrome blue-light photoreceptors

Chemical Reviews

Volumn 103, Issue 6, 2003, Pages 2203-2237

  Sancar, Aziz ^a  

^a UNIVERSITY OF NORTH CAROLINA SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BLUE-LIGHT PHOTORECEPTOR; CRYPTOCHROME; DEAZAFLAVIN; ELECTRON DONOR; ELECTRON TRANSFER; PHOTOANTENNA; PHOTOLYASE; PHOTOREACTIVATION; PTERIN;

AMINO ACIDS; BIOCHEMISTRY; CATALYSIS; CATALYSTS; CHROMOPHORES; CRYSTAL STRUCTURE; ELECTRON TRANSPORT PROPERTIES; HYDROGEN BONDS; LIGHT ABSORPTION; PHOTOCHEMICAL REACTIONS; PROTEINS; ULTRAVIOLET RADIATION;

ENZYME KINETICS;

DEOXYRIBODIPYRIMIDINE PHOTOLYASE;

BINDING SITE; CHEMISTRY; CIRCADIAN RHYTHM; DNA REPAIR; ELECTRON TRANSPORT; GENETICS; METABOLISM; MOLECULAR GENETICS; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PHOTORECEPTOR; PHYSIOLOGY; REVIEW; SEQUENCE HOMOLOGY; ULTRAVIOLET RADIATION;

BASE SEQUENCE; BINDING SITES; CIRCADIAN RHYTHM; DEOXYRIBODIPYRIMIDINE PHOTO-LYASE; DNA REPAIR; ELECTRON TRANSPORT; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PHOTORECEPTORS; SEQUENCE HOMOLOGY; ULTRAVIOLET RAYS;

EID: 0038305458     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr0204348     Document Type: Article

References (271)

1. Kelner, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1949, 35, 73.
2. Dulbecco, R. Nature 1949, 163, 949.
3. (a) Sancar, A.; Rupert, C. S. Gene 1978, 4, 294.
4. (b) Sancar, A. A study on photoreactivating enzyme (DNA photolyase) of Escherichia coli. Ph.D. Dissertation, 1977, University of Texas at Dallas.
5. Husain, I.; Carrier, W. L.; Reagan, J. D.; Sancar, A. Photochem. Photobiol. 1988, 48, 233.
6. Rupert, C. S.; Goodgal, S. H.; Herriott, R. M. J. Gen. Physiol. 1958, 41, 451.
7. (a) Sancar, G. B. Mutat. Res. 1990, 236, 147.
8. (b) Heelis, P. F. Kim, S. T.; Okamura, T. Sancar, A. J. Photochem. Photobiol. 1993, 17, 219.
9. Kim, S. T.; Sancar, A. Photochem. Photobiol. 1993, 57, 895.
10. Taylor, J.-S. Acc. Chem. Res. 1994, 27, 76.
11. Begley, T. P. Acc. Chem. Res. 1994, 27, 394.
12. Sancar, A. Biochemistry 1994, 33, 2.
13. Heelis, P. F.; Hartman, R. F.; Rose, S. D. Chem. Soc. Rev. 1995, 24, 289.
14. (a) Todo, T. Mutat. Res. 1999, 434, 89.
15. (b) Sancar, G. B. Mutat. Res. 2000, 451, 25.
16. Deisenhofer, J. Mutat. Res. 2000, 460, 143.
17. Sancar, A.; Thompson, C.; Thresher, R. J.; Araujo, F.; Mo, J.; Özgür, S.; Vagas, E.; Dawut, L.; Selby, C. P. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 2000, 65, 157.
18. (a) Sancar, A. Annu. Rev. Biochem. 2000, 69, 31.
19. (b) Kavakli, I. H.; Sancar, A. Mol. Interventions 2002, 2, 484.
20. (c) Thompson, C. L.; Sancar, A. Oncogene 2002, 9043.
21. Carell, T.; Burgdorf, L. T.; Kundu, L. M.; Cichon, M. Curr. Opin. Chem. Biol. 2001, 5, 491.
22. Cashmore, A. R.; Jarillo, J. A.; Wu, Y. J.; Liu, D. Science 1999, 284, 760.
23. Hall, J. C. Curr. Opin. Neurobiol. 2000, 10, 456.
24. Young, M. W. Trends Biochem. Sci. 2000, 25, 601.
25. Devlin, P. F.; Kay, S. A. Annu. Rev. Physiol. 2000, 63, 729.
26. Reppert, S. M.; Weaver, D. R. Annu. Rev. Physiol. 2001, 63, 647.
27. (a) Cermakian, N.; Sassone-Corsi, P. Nat. Rev. 2000, 1, 59.
28. (b) Van Gelder, R. N. J. Biol. Rhythms 2002, 110.
29. Aschoff, J. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1960, 25, 11.
30. Li, Y. I.; Kim, S. T.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 4389.
31. Hsu, D. S.; Zhao, X.; Zhao, S.; Kazantsev, A.; Wang, R. P.; Todo, T.; Wei, Y. F.; Sancar, A. Biochemistry 1996, 35, 13871.
32. Afonso, C. L.; Tulman, E. R.; Lu, Z.; Oma, E.; Kutish, G. F.; Rock, D. L. J. Virol. 1999, 73, 533.
33. Srinivasan, V.; Schnitzlein, W. M.; Tripathy, D. N. J. Virol. 2001, 75, 1681.
34. Sancar, G. B.; Sancar, A. Trends Biochem. Sci. 1987, 12, 259.
35. Sancar, A.; Sancar, G. B. Annu. Rev. Biochem. 1987, 57, 29.
36. Sancar, G. B.; Smith, F. W.; Reid, R.; Payne, G.; Levy, M.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1987, 262, 478.
37. Jorns, M. S.; Baldwin, E. T.; Sancar, G. B.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1987, 262, 486.
38. Sancar, G. B.; Jorns, M. S.; Payne, G.; Fluke, D. J.; Rupert, C. S.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1984, 262, 492.
39. Payne, G.; Sancar, A. Biochemistry 1990, 29, 7715.
40. Ramsey, A. J.; Alderfer, J. L.; Jorns, M. S. Biochemistry 1992, 31, 4.
41. Malhotra, K.; Baer, M.; Li, Y. I.; Sancar, G. B.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1992, 267, 2909.
42. Park, H. W.; Sancar, A.; Deisenhofer, J. J. Mol. Biol. 1993, 231, 1122.
43. Park, H. W.; Kim, S. T.; Sancar, A.; Deisenhofer, J. Science 1995, 1866.
44. Tamada, T.; Kitadokoro, K.; Higuchi, Y.; Inaka, K.; Yasui, A.; deRuiter, P. E.; Eker, A. P. M.; Miki, K. Nat. Struct. Biol. 1997, 11, 887.
45. Kato, T.; Todo T.; Ayoki, H.; Ishizaki, K.; Morita, T.; Mitra, S.; Ikenaga, M. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 4119.
46. Yasui, A.; Eker, A. P. M.; Yasuhira, S.; Yajima, H.; Kobayashi, T.; Takao, M.; Oikawa, A. EMBO J. 1994, 13, 6143.
47. Aravind, L.; Anantharaman, V.; Koonin, E. V. Proteins 2002, 48, 1.
48. Ames, B. N.; Elson-Schwab, I.; Silver, E. A. Am. J. Clin. Nutr. 2002, 75, 1.
49. Walsh, C. T. Acc. Chem. Res. 1986, 19, 216.
50. Payne, G.; Heelis, P. F.; Rohrs, B. R.; Sancar, A. Biochemistry 1987, 26, 7121.
51. Jorns, M. S.; Wang, B.; Jordan, S. P.; Chanderkar, L. P. Biochemistry 1990, 29, 552.
52. Payne, G.; Wills, M.; Walsh, C. T.; Sancar, A. Biochemistry 1990, 29, 5706.
53. Malhotra, K.; Kim, S. T.; Walsh, C. T.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1992, 267, 15406.
54. Harm, W.; Harm, H.; Rupert, C. S. Mutat. Res. 1968, 6, 371.
55. Sancar, G. B.; Smith, F. W.; Sancar, A. Nucleic Acids Res. 1983, 11, 6667.
56. Sancar, A.; Sancar, G. B. J. Mol. Biol. 1984, 172, 223.
57. Zhao, X.; Liu, J.; Hsu, D. S.; Zhao, S.; Taylor, J. S.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1997, 272, 32580.
58. Selby, C. P.; Sancar, A. Photochem. Photobiol. 1999, 69, 105.
59. Zhao, S.; Sancar, A. Photochem. Photobiol. 1997, 66, 727.
60. Hitomi, K.; Kim, S. T.; Iwai, S.; Harima, N.; Otoshi, E.; Ikenaga, M.; Todo, T. J. Biol. Chem. 1997, 272, 32591.
61. Malhotra, K.; Kim, S. T.; Batschauer, A.; Dawut, L.; Sancar, A. Biochemistry 1995, 34, 6892.
62. Kim, S. T.; Sancar, A.; Essenmacher, C.; Babcock, G. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 8023.
63. Petersen, J. L.; Small, G. D. Nucleic Acids Res. 2001, 29, 4472.
64. Sancar, G. B.; Smith, F. W.; Heelis, P. F. J. Biol. Chem. 1987, 262, 15457.
65. Jorns, M. S.; Sancar, G. B.; Sancar, A. Biochemistry 1984, 23, 2673.
66. Eker, A. P. M.; Kooiman, P.; Hessels, J. K. C.; Yasui, A. J. Biol. Chem. 1990, 265, 8009.
67. Li, Y. F.; Sancar, A. Nucleic Acids Res. 1991, 18, 4885.
68. Heelis, P. F.; Sancar, A. Biochemistry 1986, 25, 8163.
69. Heelis, P. F.; Payne, G. P.; Sancar, A. Biochemistry 1987, 26, 4634.
70. Jorns, M. S.; Wang B.; Jordan, S. P. Biochemistry 1987, 26, 6810.
71. Johnson, J. L.; Hamm-Alvarez, S.; Payne, G.; Sancar, G. B.; Rajagopalan, K. V.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 2046.
72. Kim, S. T.; Malhotra, K.; Ryo, H.; Sancar, A.; Todo, T. Mutat. Res. 1996, 363, 97.
73. Hamm-Alvarez, S.; Sancar, A.; Rajagopalan, K. V. J. Biol. Chem. 1989, 264, 9649.
74. Hamm-Alvarez, S. F.; Sancar, A.; Rajagopalan, K. V. J. Biol. Chem. 1990, 265, 9850.
75. Hamm-Alvarez, S. F.; Sancar, A.; Rajagopalan, K. V. J. Biol. Chem. 1990, 265, 18656.
76. Eker, A. P. M.; Yajima, H.; Yasui, A. Photochem. Photobiol. 1994, 60, 125.
77. Malhotra, K.; Kim, S. T.; Sancar, A. Biochemistry 1994, 33, 8712.
78. Eker, A. P. M.; Hessels, J. K. C.; van de Velde, J. Biochemistry 1988, 27, 1758.
79. Eker, A. P. M.; Dekker, R. H.; Berends, W. Photochem. Photobiol. 1981, 33, 65.
80. Eker, A. P. M.; Hessels, J. K. C.; Dekker, R. H. Photochem. Photobiol. 1986, 44, 197.
81. Massey, V.; Hemmerich, P. Biochemistry 1978, 17, 9.
82. Kiener, A.; Husain, I.; Sancar, A.; Walsh, C. T. J. Biol. Chem. 1989, 264, 13880.
83. Komori, H.; Masui, R.; Kuramitsu, S.; Yokoyama, S.; Shibata, T.; Inoue, Y.; Miki, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 13560.
84. Förster, T. Discuss. Faraday Soc. 1959, 27, 7.
85. Rupert, C. S. J. Gen. Physiol. 1960, 43, 573.
86. Rupert, C. S. J. Gen. Physiol. 1962, 45, 725.
87. Rupert, C. S. J. Gen. Physiol. 1962, 45, 703.
88. (a) Harm, H.; Rupert, C. S. Mutat. Res. 1968, 6, 355.
89. (b) Harm, H.; Rupert, C. S. Mutat. Res. 1970, 10, 307.
90. Harm, H.; Rupert, C. S. Mutant. Res. 1976, 34, 75.
91. Myles, G. M.; Van Houten, B.; Sancar, A. Nucleic Acids Res. 1987, 15, 1227.
92. Svoboda, D. L.; Smith, C. A.; Taylor, J.-S.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1993, 268, 10694.
93. Sancar, G. B.; Smith, F. W.; Sancar, A. Biochemistry 1985, 24, 1849.
94. Husain, I.; Sancar, A. Nucleic Acids Res. 1987, 15, 1109.
95. Jorns, M. S.; Sancar, G. B.; Sancar, A. Biochemistry 1985, 24, 1986.
96. Jordan, S. P.; Alderfer, J. L.; Chanderkar, L. P.; Jorns, M. S. Biochemistry 1989, 28, 8149.
97. Kim, S. T.; Sancar, A. Biochemistry 1991, 30, 8623.
98. Baer, M.; Sancar, G. B. Mol. Cell. Biol. 1989, 9, 4777.
99. Baer, M.; Sancar, G. B. J. Biol. Chem. 1993, 268, 16717.
100. Vande Berg, B. J.; Sancar, G. B. J. Biol. Chem. 1998, 273, 20276.
101. Li, Y. F.; Sancar, A. Biochemistry 1990, 29, 5698.
102. (a) Kim, S. T.; Li, Y. F.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 900.
103. (b) Christine, K. S.; MacFarlane, IV, A. W.; Yang, K.; Stanley, R. J. J. Biol. Chem. 2002, 277, 38339.
104. Antony, J.; Medvedev, D. M.; Stuchebrukhov, A. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1057.
105. Hahn, J.; Michel-Beyerle, M. E.; Rosch, N. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 2001.
106. Hahn, J.; Michel-Beyerle, M. E.; Rosch, N. J. Mol. Model 1998, 4, 73.
107. Sander, S. D. B.; Wiest, O. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 5127.
108. Husain, I.; Sancar, G. B.; Holbrook, S. R.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1987, 13188.
109. Kim, S. T.; Sancar, A. Photochem. Photobiol. 1995, 61, 171.
110. Sancar, A.; Smith, F. W.; Sancar, G. B. J. Biol. Chem. 1984, 259, 6028.
111. Ramaiah, D.; Kan, Y.; Koch, T.; Orum, H.; Schuster, G. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 12902.
112. Butenandt, J.; Burgdorf, L. T.; Carell, T. Angew. Chem., Int. Ed. 1999, 38, 708.
113. Kim, S. T.; Malhotra, K.; Smith, C. A.; Taylor, J. S.; Sancar, A. Biochemistry 1993, 32, 7065
114. Pearlman, D. A.; Holbrook, R.; Pirkle, D. H.; Kim, S. T. Science 1985, 277, 1304.
115. (a) Husain, I.; Griffith, J. D.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 2258.
116. (b) Park, H.; Zhang, K.; Ren, Y.; Nadji, S.; Sinha, N.; Taylor, J. S.; Kang, C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 15965.
117. Wang, C. I.; Taylor, J.-S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 9072.
118. Kemmink, J.; Boelens, R.; Koning, T. M. G.; Kaptein, R.; van der Marel, G. A.; van Boom, J. H. Eur. J. Biochem. 1987, 162, 37.
119. Kemmink, J.; Boelens, R.; Koning, T. M. G.; van der Marel, G. A.; van Boom, J. H.; Kaplein, R. Nucleic Acids Res. 1987, 15, 4645.
120. Taylor, J.-S.; Garrett, D. S.; Brockie, I. R.; Svoboda, D. L.; Telser, J. Biochemistry 1990, 29, 8858.
121. Lee, B. J.; Sakashi, O.; Ohkubo, T.; Ikehara, M.; Doi, T.; Morikawa, K.; Kyogoku, Y.; Osafune, T.; Iwai, S.; Ohtsuka, E Biochemistry 1994, 33, 57.
122. (a) Kim, J. K.; Patel, D.; Choi, B. S. Photochem. Photobiol. 1995, 62, 44.
123. (b) Miaskewicz, K.; Miller, J.; Cooney, M.; Osman, R. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 9156.
124. (c) McAteer, K.; Jing, Y.; Kate, J.; Taylor, J. S.; Kennedy, M. A. J. Mol. Biol. 1998, 282, 1013.
125. Roberts, R. J.; Cheng, X. Annu. Rev. Biochem. 1998, 67, 181.
126. Mol, C. D.; Parikh, S. S.; Putnam, C. D.; Lo, T. P.; Tainer, J. A. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1999, 28, 101.
127. Pearl, L. H. Mutat. Res. 2000, 460, 165.
128. Hollis, T.; Lau, A.; Ellenberger, T. Mutat. Res. 2000, 460, 201.
129. Morikawa, K.; Shirakawa, M. Mutat. Res. 2000, 460, 257.
130. Van Noort, S. J. T.; Orisini, F.; Eker, A. P. M.; Wyman, C.; de Grooth, B.; Greve, J. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 3875.
131. MacFarlane IV, A. W.; Stanley, R. J. Biochemistry 2001, 40, 15203.
132. Jordan, S. P.; Jorns, M. S. Biochemistry 1988, 27, 8915.
133. Kim, S. T.; Heelis, P. F.; Okamura, T.; Hirata, Y.; Mataga, N.; Sancar, A. Biochemistry 1991, 30, 11262.
134. Heelis, P. F. J. Photochem. Photobiol. 1997, 38, 31.
135. Okamura, T.; Sancar, A.; Heelis, P. F.; Begley, T. P.; Hirata, Y.; Mataga, N. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 3143.
136. Kim, S. T.; Heelis, P. F.; Sancar, A. Biochemistry 1992, 31, 11244.
137. Rokita, S. E.; Walsh, C. T. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 4589.
138. Pac, C.; Miyake, K.; Maasaki, Y.; Yamagichi, S.; Ohno, T.; Yoshimura, A. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10756.
139. Heelis, P. F.; Deeble, D. J.; Kim, S. T.; Sancar, A. Int. J. Radiat. Biol. 1992, 62, 137.
140. Kim, S. T.; Volk, M.; Rousseau, G.; Heelis, P. F.; Sancar, A.; Michel-Beyerle, M. E. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3115.
141. Deeble, D. J.; Das, S.; Van Sonntag, C. J. Phys. Chem. 1985, 89, 5784.
142. Ogrodnik, A.; Kruger, H. W.; Orthuber, H.; Haberkorn, R.; Michel-Beyerle, M. E. Biophys. J. 1982, 39, 91.
143. Langenbacher, T.; Zhao, X.; Bieser, G.; Heelis, P. F.; Sancar, A.; Michel-Beyerle, M. E. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 10532.
144. Epple, R.; Wallenborn, E.-U.; Carell, T. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7440.
145. Yeh, S. R.; Falvey, D. E. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 8557.
146. Yeh, S. R.; Falvey, D. E. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 7313.
147. Kim, S. T.; Sancar, A.; Essenmacher, C.; Babcock, G. T. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 442.
148. Witmer, M. R.; Altmann, E.; Young, H.; Begley, T.; Sancar, A. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 9264.
149. McMordie, R. A.; Begley, T. P. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1886.
150. McMordie, R. A.; Altmann, E.; Begley, T. P. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 10370.
151. Burdie, D.; Begley, T. P. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 7768.
152. Scannell, M. P.; Fenick, D. J.; Yeh, S. R.; Falvey, D. E. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 1971.
153. Medvedev, D.; Stuchebrukhov, A. A. J. Theor. Biol. 2001, 237.
154. Kay, C. W. M.; Feicht, R.; Schulz, K.; Sadewater, P.; Sancar, A.; Bacher, A.; Möbius, K.; Richter, G.; Weber, S. Biochemistry 1999, 38, 16740.
155. Weber, S.; Möbius, K.; Richter, G.; Kay, C. W. M. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3790.
156. Marcus, R. A.; Sutin, N. Biochim. Biophys. Acta 1985, 811, 265.
157. Van Camp, J. R.; Young, T.; Hartman, R. F.; Rose, S. D. Photochem. Photobiol. 1987, 45, 365.
158. Kim, S. T.; Rose, S. D. Photochem. Photobiol. 1990, 52, 789.
159. Hartzfeld, D. G.; Rose, S. D. Photochem. Photobiol. 1990, 52, 789.
160. (a) Pouwels, P. J.; Hartman, R. I.; Rose, S. D.; Kaptein, R. Photochem. Photobiol. 1995, 61, 575.
161. Ghisla, S.; Massey, V.; Lhoste, J. M.; Mayhew, S. G. Biochemistry 1974, 13, 589.
162. Hartman, R. F.; Rose, S. D. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 3559.
163. Carell, T.; Epple, R. Eur. J. Org. Chem. 1998, 1245, 5.
164. Epple, R.; Carell, T. Angew. Chem., Int. Ed. 1998, 37, 938.
165. Epple, R.; Carell, T. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 7318.
166. Lamola, A. A. Photochem. Photobiol. 1969, 9, 291.
167. Helene, C.; Charlier, M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1971, 43-252.
168. Lamola, A. A. Mol. Photochem. 1972, 4, 107.
169. Roth, H. D.; Lamola, A. A. J. Am. Chem. Soc. 1972, 94, 1013.
170. Meistrich, M. L.; Lamola, A. A. J. Mol. Biol. 1972, 66, 83.
171. Jorns, M. S. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 3133.
172. Carell, T.; Epple, R.; Gramlich, V. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1996, 35, 620.
173. Okamura, T.; Sancar, A.; Heelis, P. F.; Hirata, Y.; Mataga, N. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 5967.
174. Heelis, P. F.; Sancar, A.; Okamura, T. J. Photochem. Photobiol. 1992, 16, 387.
175. Gindt, Y. M.; Vollenbrook, E.; Westphal, K.; Sackett, H.; Sancar, A.; Babcock, G. T. Biochemistry 1999, 38, 3857.
176. Heelis, P. F.; Okamura, T.; Sancar, A. Biochemistry 1990, 29, 5694.
177. Kim, S. T.; Heelis, P. F.; Sancar, A. Methods Enzymol. 1995, 258, 319.
178. Essenmacher, C.; Kim, S. T.; Atamian, M.; Babcock, G. T.; Sancar, A. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 1602.
179. Aubert, C.; Vos, N. H.; Eker, A. P M.; Brettel, K. Nature 2000, 405, 586.
180. Sancar, G. B.; Smith, F. W.; Lorence, M. C.; Rupert, C. S.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1984, 259, 6033.
181. Li, Y. F.; Heelis, P. F.; Sancar, A. Biochemistry 1991, 30, 11262.
182. Cheung, M. S.; Daizadeh, I.; Stachebrukhov, A. A.; Heelis, P. F. Biophys. J. 1999, 76, 1241.
183. Aubert, C.; Mathis, P.; Eker, A. P. M.; Brettel, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 5423.
184. Weber, S.; Kay, C. W. M.; Mogling, H.; Mobius, K.; Hitomi, K.; Todo, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 1319.
185. Tai, L. A.; Hwang, K. C. Photochem. Photobiol. 2001, 73, 439.
186. Zhong, D.; Zewail, A. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 11867.
187. Tyrrell, R. M.; Webb, R. B.; Brown, M. S. Photochem. Photobiol. 1973, 18, 249.
188. Epple, R.; Carell, T. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 7318.
189. Epple, R.; Carell, T. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 7318.
190. Sancar, A. Annu. Rev. Biochem. 1996, 65, 43.
191. Wood, R. D. J. Biol. Chem. 1977, 272, 23465.
192. Harm, W.; Hillebrandt, B. Photochem. Photobiol. 1962, 1, 271.
193. Yamamoto, K.; Satake, M.; Shinawaga, H.; Fujiwara, Y. Mol. Gen. Genet. 1983, 190, 511.
194. Sancar, G. B.; Smith, F. W. Mol. Cell. Biol. 1989, 9, 4767.
195. Sancar, A.; Franklin, K. A.; Sancar, G. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1984, 81, 7397.
196. Huang, J. C.; Svoboda, D. L.; Reardon, J. T.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 3664.
197. Selby, C. P.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 3522.
198. Fox, M. E.; Feldman, B. J.; Chu, G. Mol. Cell. Biol. 1994, 14, 8071.
199. Özer, Z.; Reardon, J. T.; Hsu, D.; Malhotra, K.; Sancar, A. Biochemistry 1995, 34, 15886.
200. Walker, G. C. Microbial. Rev. 1984, 48, 60.
201. Payne, N. P.; Sancar, A. Mutat. Res. 1989, 218, 207.
202. (a) Nishioka, H.; Harm, W. Mutat. Res. 1972, 16, 121.
203. Mironov, A. S.; Gusarov, I.; Rafikov, R.; Lopez, L. E.; Shatalin, K.; Kreneva, R. A.; Permov, D. A.; Nudler, E. Cell 2002, 111, 747.
204. Sebastian, J.; Kraus, B.; Sancar, G. B. Mol. Cell. Biol. 1990, 10, 4630.
205. Sebastian, J.; Sancar, G. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1991, 88, 11251.
206. Jang, Y. K., Wang, L.; Sancar, G. B. Mol. Cell. Biol. 1999, 19, 7630.
207. Birell, G. W.; Brown, J. A.; Wu, H. J.; Gidever, G.; Chu, A. M.; Davis, R. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 8778.
208. Yasuhira, S.; Mitani, H.; Shima, A. Photochem. Photobiol. 1991, 53, 211.
209. Mitani, H.; Uchida, N., Shima, A. Photochem. Photobiol. 1996, 64, 943.
210. Berrocal-Tito, G.; Sametz-Baron, L.; Eichenberg, K.; Horwitz, B. A.; Herrera-Estrella, A. J. Biol. Chem. 1999, 274-14288.
211. Mitani, H.; Uchida, N. Shima, A. Photochem. Photobiol. 1996, 64, 943.
212. Pang, Q.; Hays, J. B. Plant Physiol. 1991, 95, 536.
213. Uchida, N.; Mitani, H.; Shima, A. Photochem. Photobiol. 1995, 61, 79.
214. Suter, B., Livingstone-Zatche, J. M.; Thoma, R. EMBO J. 1997, 21, 2150.
215. Lamola, A. A. Photochem. Photobiol. 1968, 8, 601.
216. Rahn, R. O.; Hozzzu, J. L. Photochem. Photobiol. 1969, 10, 131.
217. Taylor, J. -S.; Cohrs, M. P. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 2834.
218. Prakash, G.; Falvey, D. E. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 11375.
219. Brash, D. E.; Franklin, W. A.; Sancar, G. B.; Sancar, A.; Haseltine, W. A. J. Biol. Chem. 1985, 260, 11438.
220. Sancar, A.; Rupp, W. D. Cell 1983, 33, 249.
221. Todo, T.; Takemori, H.; Ryo, H. Ihara, M.; Matsunaga, T.; Nikaido, O.; Sato, K.; Nomura, T. Nature 1993, 361, 371.
222. Kim, S. T., Malhotra, K., Smith, C. A.; Taylor, J.-S.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1994, 269, 8535.
223. Kim, S. T.; Malhotra, K., Taylor, J.-S.; Sancar, A. Photochem. Photobiol. 1996, 63, 292.
224. Nakajima, S.; Sugiyama, M.; Iwai, S.; Hitomi, K.; Otoshi, E.; Kim, S. T.; Jiang, C. Z.; Todo, T.; Britt, A. B.; Yamamoto, K. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 638.
225. Todo, T.; Ryo, H.; Yamamoto, K., Toh, H.; Inui, T.; Ayaki, H.; Nomura, T.; Ikenaga, M. Science 1996, 272, 109.
226. Sancar, A. Science 1996, 272, 48.
227. Heelis, P. F.; Liu, S. J. Am. Chem. Soc. 1997, 29366
228. Hitomi, K., Nakamura, H.; Kim, S. T.; Mizukoshi, T.; Ishikawa T.; Iwai, S.; Todo, T. J. Biol. Chem. 2001, 276, 10103.
229. Wang, Y.; Gasper, P. P.; Taylor, J. S. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5510.
230. Joseph, A.; Prakash, G.; Falvey, D. E. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 11219.
231. Miranda, M. A.; Izquierdo, M. A.; Galindo, F. Org. Lett. 2001, 3, 1965.
232. Cichon, M. K.; Arnold, S.; Carell, T. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 767.
233. Gressel, J. Photochem. Photobiol. 1977, 30, 749.
234. Briggs, W. R.; Huala, E. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 1999, 15, 33.
235. Ahmad, M.; Cashmore, A. R. Nature 1993, 366, 162.
236. Batschauer, A. Plant J. 1993, 4, 705.
237. Lin, C.; Robertson, D. E.; Ahmad, M., Raibekas, A. A.; Jorns M. S.; Dutton, P. L.; Cashmore, A. R. Science 1995, 269, 968.
238. Adams, M. D.; Kerlavage, A. R., Fleischman, R. R., Fuldner, R., Bult, C. J.; Lee, N. H.; Kirkness, E. F.; Weinstock, K. G.; Gocayne, J. D.; White, O.; et al.. Nature 1995, 377, 3.
239. Van der Spek, P. J., Kobayashi, K.; Bootsma, D.; Takao, N.; Eker A. P. N.; Yasui, A. Genomics 1996, 37, 177.
240. Miyamato, Y.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 6097.
241. Yang, H. Q.; Wu, Y. J.; Tang, R. H.; Liu, D.; Cashmore, A. R. Cell 2000, 103, 815.
242. Shalitin, D.; Yang, H.; Mockler, T. C.; Maymon, M.; Guo, H.; Whitelam, G. C.; Lin, C. Nature 2002, 417, 763.
243. Cermakian, N.; Pando, M. P.; Thompson, C. L., Pinchak, A. B.; Selby, C. P.; Gutierrez, L.; Wells, D. E.; Cahill, G. M.; Sancar, A.; Sassone-Corsi, P. Curr. Biol. 2002, 12, 844.
244. Stanewsky, R.; Kaneko, M.; Emery, P.; Beretta, B.; Wager-Smith, K.; Kay, S. A.; Rosbash, M.; Hull, J. C. Cell 1998, 95, 681.
245. Helfrich-Forster, C.; Winter, C.; Hofbauer, A.; Hall, J. C.; Stanewsky, R. Neuron 2001, 30, 249.
246. (a) Selby, C. P.; Thompson, C.; Therese, S. M.; Van Gelder, R. N.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 14697.
247. (b) Van Gelder, R. N.; Gibler, T. M. Tu, D.; Embry, K.; Selby, C. P.; Thompson, C. L.; Sancar A. J. Neurogenet. 2002, 16, 181.
248. Thompson, C. L.; Blaner, W. S.; van Gelder, R. N.; Lui, k.; Quadro, L.; Colantuoni, V.; Gottesman, M. E.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 11708.
249. Thresher, R. J.; Vitaterna, M. H.; Miyamoto, Y.; Kazantsev, A,; Hsu, D. S.; Petit, C.; Selby, C. P.; Dawut, L.; Smithies, O.; Takahashi, J. S.; Sancar, A. Science 1998, 282, 1490.
250. (a) Vitaterna, M. H.; Selby, C. P.; Todo, T.; Niwa, H.; Thompson, C.; Fruechte, E. M.; Hitomi, K.; Thresher, R. J.; Ishikawa, T.; Miyazaki, J.; Takahashi, J. S.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 12114.
251. (b) Palmer, J. D. The Living Clock; Oxford University Press: New York, 2002.
252. Ronneberg, T.; Foster, R. G. Photochem. Photobiol. 1997, 66, 549.
253. Czeisler, C. A.; Shanahan, T. L.; Klerman, E. B.; Martens, H.; Brotman, D. J.; et al. N. Engl. J. Med. 1995, 332, 6.
254. Yanovsky, M. Y.; Mazella, M. A.; Casal, J. J. Curr. Biol. 2000, 10, 1013.
255. Van der Horst, G. T.; Muijtgens, M.; Kobayashi, K.; Takano, R.; Kanno, S.; Takao, M.; de Wit, J.; Verkerk, A.; Eker, A. P. M.; van Leenen, D.; Buijs, R.; Bootsma, D.; Hoeijmakers, J. H. J.; Yasui, A. Nature 1999, 398, 627.
256. Kume, K.; Zylka, M. J.; Sriram, S.; Shearman, L. P.; WeaverD. R.; Jin, X.; Maywood, E. S.; Hasting, M. H.; Reppert, S. M. Cell 1999, 98, 193.
257. (a) Miyamoto, Y.; Sancar, A. Mol. Brain Res. 1999, 71, 248.
258. (b) Van Gelder, R. N.; Wee, R.; Lee, J.; Tu, D. C. Science 2003, 299, 222.
259. Provencio, I.; Jiang, G.; DeGrip, V. J.; Hayes, W. P., Rollag, M. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 340.
260. Provencio, I.; Rodriguez, I. R.; Jiang, G.; Hayes, W. P.; Moreira, E. F.; Rollag, M. D. J. Neurosci. 2000, 600.
261. Gooley, J. J.; Lu, J.; Chou, T. C.; Scammel, T. E.; Saper, C. B. Nat. Neurosci. 2001, 12, 1165.
262. Hannibal, J.; Hindersson, P.; Knudsen, S. M.; Georg, B.; Fahrenkrug, J. J. Neurosci. 2002, 22, RC191:1.
263. Berson, D. M.; Dunn, F. A.; Takao, M. Science 2002, 295, 1070.
264. Hattar, S.; Liao, H. W.; Takao, M.; Berson, D. M.; Yau, K. W. Science 2002, 295, 1065.
265. Provencio, I.; Rollag, M. D.; Castrucci, A. M. Nature 2002, 145, 4.
266. Barinaga, M. Science 2002, 295, 955.
267. Ruby, N. F.; Brennan, T. J.; Xie, X.; Cao, V.; Franken, P.; Heller, H. C.; O'Hara, B. F. Science 2002, 298, 2211.
268. Panda, S.; Sato, T. K.; Castrucci, A. M.; Rollag, M. D.; DeGrip, W. J.; Hogenesch, J. B.; Prevencio, I.; Kay, S. A. Science 2002, 298, 2213.
269. Ceriani, M. F., Darlington, T. K.; Stakins, D.; Mas, P.; Petti, A. A.; Weitz, C. J.; Kay, S. A. Science 1994, 285, 553.
270. Rosato, E.; Codd, V.; Mazzotta, G.; Piccin, A.; Zordan, M.; Costa, R.; Kyriacou, C. P. Curr. Biol. 2001, 11, 909.
271. Folta, K. M.; Spalding, E. P. Plant J. 2001, 28, 333.