메뉴 건너뛰기




Volumn 118, Issue 38, 1996, Pages 9156-9163

Computational simulations of DNA distortions by a cis,syn-cyclobutane thymine dimer lesion

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARTICLE; COMPUTER SIMULATION; DNA STRUCTURE; MOLECULAR DYNAMICS; NUCLEOTIDE SEQUENCE;

EID: 0029804674     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja9611304     Document Type: Article
Times cited : (68)

References (52)
  • 1
    • 0000177002 scopus 로고
    • H. Morrion, Ed.; John Wiley & Sons: New York
    • Cadet, J.; Vigny, P. Bioorganic Photochemistry, H. Morrion, Ed.; John Wiley & Sons: New York, 1990; Vol. 1, pp 1-272.
    • (1990) Bioorganic Photochemistry , vol.1 , pp. 1-272
    • Cadet, J.1    Vigny, P.2
  • 9
    • 0025874568 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1991) Biochemistry , vol.30 , pp. 8052-8059
    • Augustine, M.L.1    Hamilton, R.W.2    Dodson, M.L.3    Lloyd, R.S.4
  • 10
    • 0025733143 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1991) Mutat. Res. , vol.255 , pp. 19-29
    • Dodson, M.L.1    Prince, M.A.2    Andersen, W.F.3    Lloyd, R.S.4
  • 11
    • 0027301692 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1993) Biochemistry , vol.32 , pp. 8284-8290
    • Dodson, M.L.1    Schrock III, R.D.2    Lloyd, R.S.3
  • 12
    • 0026666226 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A , vol.89 , pp. 9420-9424
    • Doi, T.1    Recktenwald, A.2    Karaki, Y.3    Kikuchi, M.4    Morikawa, K.5    Ikehara, M.6    Inaoka, T.7    Hori, N.8    Ohtsuka, E.9
  • 13
    • 0024464222 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1989) Biochemistry , vol.28 , pp. 8699-8705
    • Dowd, D.R.1    Lloyd, R.S.2
  • 14
    • 0026015334 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1991) Biochemistry , vol.30 , pp. 8638-8648
    • Nickell, C.1    Lloyd, R.S.2
  • 15
    • 0025743926 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1991) J. Biol. Chem. , vol.266 , pp. 10686-10693
    • Prince, M.A.1    Friedman, B.2    Gruskin, E.A.3    Schrock III, R.D.4    Lloyd, R.S.5
  • 16
    • 0024294287 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1988) Biochemistry , vol.27 , pp. 1832-1838
    • Recinos, A.1    Lloyd, R.S.2
  • 17
    • 0027463452 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1993) J. Biol. Chem. , vol.268 , pp. 880-886
    • Schrock III, R.D.1    Lloyd, R.S.2
  • 18
    • 0024294303 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1988) Biochemistry , vol.27 , pp. 1839-1843
    • Stump, D.G.1    Lloyd, R.S.2
  • 19
    • 0025343692 scopus 로고
    • Augustine, M. L.; Hamilton, R. W.; Dodson, M. L., Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8052-8059. Dodson, M. L.; Prince, M. A.; Andersen, W. F.; Lloyd, R. S. Mutat. Res. 1991, 255, 19-29. Dodson, M. L.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1993, 32, 8284-90. Doi, T.; Recktenwald, A.; Karaki, Y.; Kikuchi, M.; Morikawa, K.; Ikehara, M.; Inaoka, T.; Hori, N.; Ohtsuka, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1992, 89, 9420-9424. Dowd, D. R.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1989, 28, 8699-8705. Nickell, C.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1991, 30, 8638-8648. Prince, M. A.; Friedman, B.; Gruskin, E. A.; Schrock, R. D. III.; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10686-93. Recinos, A.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1832-1838. Schrock, R. D. III; Lloyd, R. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 880-886. Stump, D. G.; Lloyd, R. S. Biochemistry 1988, 27, 1839-1843. Ishida, M.; Kanamori, Y.; Hori, N.; Inaoka, T.; Ohtsuka, E. Biochemistry 1990, 29, 3817-3821.
    • (1990) Biochemistry , vol.29 , pp. 3817-3821
    • Ishida, M.1    Kanamori, Y.2    Hori, N.3    Inaoka, T.4    Ohtsuka, E.5
  • 36
    • 0029110156 scopus 로고
    • York, D. M.; Yang, W.; Lee, H.; Darden, T.; Pedersen, L. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5001-5002. Lee, H.; Darden, T. A.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 102, 3830-3834. Weerasinghe, S.; Smith, P. E.; Mohan, V.; Cheng, Y. -K.; Pettitt, B. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2147-2158.
    • (1995) G. J. Am. Chem. Soc. , vol.117 , pp. 5001-5002
    • York, D.M.1    Yang, W.2    Lee, H.3    Darden, T.4    Pedersen, L.5
  • 37
    • 0001628106 scopus 로고
    • York, D. M.; Yang, W.; Lee, H.; Darden, T.; Pedersen, L. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5001-5002. Lee, H.; Darden, T. A.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 102, 3830-3834. Weerasinghe, S.; Smith, P. E.; Mohan, V.; Cheng, Y. -K.; Pettitt, B. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2147-2158.
    • (1995) J. Chem. Phys. , vol.102 , pp. 3830-3834
    • Lee, H.1    Darden, T.A.2    Pedersen, L.G.3
  • 38
    • 0029139897 scopus 로고
    • York, D. M.; Yang, W.; Lee, H.; Darden, T.; Pedersen, L. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5001-5002. Lee, H.; Darden, T. A.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 102, 3830-3834. Weerasinghe, S.; Smith, P. E.; Mohan, V.; Cheng, Y. -K.; Pettitt, B. M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2147-2158.
    • (1995) J. Am. Chem. Soc. , vol.117 , pp. 2147-2158
    • Weerasinghe, S.1    Smith, P.E.2    Mohan, V.3    Cheng, Y.K.4    Pettitt, B.M.5
  • 47
    • 10244225556 scopus 로고
    • Ph.D. Thesis, University of London
    • Norberto de Souza, O. Ph.D. Thesis, University of London, 1994.
    • (1994)
    • Norberto De Souza, O.1


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.