Interactions of electrons with bare and hydrated biomolecules: From nucleic acid bases to DNA segments

Chemical Reviews

Volumn 112, Issue 11, 2012, Pages 5603-5640

  Gu, Jiande ^a   Leszczynski, Jerzy ^b   Schaefer III, Henry F ^c  

^a SHANGHAI INSTITUTE OF MATERIA MEDICA   (China)

^b JACKSON STATE UNIVERSITY   (United States)

^c UNIVERSITY OF GEORGIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL MOLECULE; DNA SEGMENTS; ELECTRON ATTACHMENT; ENERGY DIFFERENCES; EQUILIBRIUM STRUCTURES; GEOMETRY RELAXATION; NEUTRAL MOLECULES; NEUTRAL SPECIES; NUCLEAR CONFIGURATION; NUCLEIC ACID BASIS; OPTIMIZED GEOMETRIES; RADICAL ANIONS;

BIOMOLECULES; MOLECULES; NEGATIVE IONS; NUCLEIC ACIDS; RADIATION DAMAGE;

ELECTRONS;

DNA; NUCLEIC ACID; PURINE NUCLEOSIDE; PYRIMIDINE NUCLEOSIDE; WATER;

CHEMISTRY; ELECTRON; QUANTUM THEORY; REVIEW;

DNA; ELECTRONS; NUCLEIC ACIDS; PURINE NUCLEOSIDES; PYRIMIDINE NUCLEOSIDES; QUANTUM THEORY; WATER;

EID: 84869161589     PISSN: 00092665     EISSN: 15206890     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr3000219     Document Type: Review

References (247)

1. Sanche, L. Radiat. Phys. Chem. 1989, 34, 15
2. Uehara, U.; Nikjoo, H.; Goodhead, D. T. Radiat. Res. 1999, 152, 202
3. LaVerne, J. A.; Pimblott, S. M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 10540
4. LaVerne, J. A.; Pimblott, S. M. Radiat. Res. 1995, 141, 208
5. Sanche, L. Eur. Phys. J. D 2005, 35, 367
6. Ward, J. F. In Advances in Radiation Biology 5; Lett, J. T.; Adler, H., Eds.; Academic Press: New York, 1977; pp 181-239.
7. Yamanoto, O. In Aging, Carcinogenesis and Radiation Biology; Smith, K., Ed.; Plenum: New York, 1976; pp 165-192.
8. Fucarelli, A. F.; Zimbrick, J. D., Eds.; Radiation Damage in DNA: Structure/Function Relationships at Early Times; Battelle: Columbus, OH, 1995.
9. von Sonntag, C. The Chemical Basis for Radiation Biology; Taylor and Francis: London, 1987.
10. von Sonntag, C. Adv. Quantum Chem. 2007, 52, 5
11. Becker, D.; Sevilla, M. D. The Chemical Consequences of Radiation Damage to DNA. In Advances in Radiation Biology, Vol. 17; Lett, J., Ed.; Academic Press: New York, 1993; pp 121-180.
12. Boudaiffa, B.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Huels, M. A.; Sanche, L. Science 2000, 287, 1658
13. Martin, F.; Burrow, P. D.; Cai, Z.; Coultier, P.; Hunting, D.; Sanche, L. Phys. Rev. Lett. 2004, 93, 068101
14. Pan, X.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Sanche, L. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 208102
15. Caron, L. G.; Sanche, L. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 113201
16. Zheng, Y.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Wagner, J. R.; Sanche, L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1002
17. Huels, M. A.; Boudaiffa, B.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Sanche, L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 4467
18. Abdoul-Carime, H.; Gohlke, S.; Fischbach, E.; Scheike, J.; Illenberger, E. Chem. Phys. Lett. 2004, 387, 267
19. Zheng, Y.; Cloutier, P.; Hunting, D. J.; Sanche, L.; Wagner, J. R. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 16592
20. Zheng, Y.; Cloutier, P.; Hunting, D. J.; Wagner, J. R.; Sanche, L. J. Chem. Phys. 2006, 124, 064710
21. Li, Z.; Zheng, Y.; Cloutier, P.; Sanche, L.; Wagner, J. R. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 5612
22. Abdoub-Carime, H.; Sanche, L. Int. J. Radiat. Biol. 2002, 78, 89
23. Sanche, L. Scanning Microsc. 1995, 9, 619
24. Sanche, L. Mass Spectrom. Rev. 2002, 21, 349
25. Steenken, S.; Telo, J. P.; Novais, H. M.; Candeias, L. P. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4701
26. Colson, A. O.; Sevilla, M. D. Int. J. Radiat. Biol. 1995, 67, 627
27. Sanche, L. Low-Energy Electron Interaction with DNA: Bond Dissociation and Formation of Transient Anions, Radicals, and Radical Anions. In Radical and Radical Ion Reactivity in Nucleic Acid Chemistry; Greenberg, M. M., Ed.; John Wiley & Sons: 2010; pp 239-293.
28. Sanche, L. Low Energy Electron Damage to DNA. In Radiation Induced Molecular Phenomena in Nucleic Acids; Shukla, M.; Leszczynski, J., Eds.; A Comprehensive Theoretical and Experimental Analysis (Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics); Springer: 2008; pp 531-575.
29. Kumar, A.; Sevilla, M. D. Radiation effects on DNA: Theoretical Investigations of Electron, Hole and Excitation Pathways to DNA Damage. In Radiation Induced Molecular Phenomena in Nucleic Acids; Shukla, M.; Leszczynski, J., Eds.; A Comprehensive Theoretical and Experimental Analysis (Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics); Springer: 2008; pp 577-617.
30. Kumar, A.; Sevilla, M. D. In Low Energy Electron (LEE) Induced DNA Damage: Theoretical Approaches to Modeling Experiment; Shukla, M.; Leszczynski, J., Eds.; Handbook of Computational Chemistry Vol. III: Applications- Biomolecules; Springer: 2012.
31. Rienstra-Kiracofe, J. C.; Tschumper, G. S.; Schaefer, H. F.; Nandi, S.; Ellison, G. B. Chem. Rev. 2002, 102, 231
32. Schiedt, J.; Weinkauf, R.; Neumark, D. M.; Schlag, E. W. Chem. Phys. 1998, 239, 511
33. Saenger, W. Principles of Nucleic Acid Structure; Springer-Verlag: New York, 1984.
34. Wiley, J. R.; Robinson, J. M.; Ehdaie, S.; Chen, E. C. M.; Chen, E. S. D.; Wentworth, W. E. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1991, 180, 841
35. Desfrancois, C.; Abdoul-Carime, H.; Schermann, J. P. J. Chem. Phys. 1996, 104, 7792
36. Desfrancois, C.; Abdoul-Carime, H.; Carles, S.; Periquet, V.; Schermann, J. P.; Smith, D. M. A.; Adamowicz, L. J. Chem. Phys. 1999, 110, 17876
37. Desfrancois, C.; Periquet, V.; Bouteiller, Y.; Schermann, J. P. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1274
38. Desfrancois, C.; Abdoul-Carime, H.; Schermann, J. P. Int. J. Mod. Phys. B 1996, 10, 1339
39. Desfrancois, C.; Carles, S.; Schermann, J. P. Chem. Rev. 2000, 100, 3943
40. Hendricks, J. H.; Lyapustina, S. A.; de Clercq, H. L.; Snodgrass, J. T.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 1996, 104, 7788
41. Hendricks, J. H.; Lyapustina, S. A.; de Clercq, H. L.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 1998, 108, 8
42. Eustis, S.; Wang, D.; Lyapustina, S.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 2007, 127, 224309
43. Haranczyk, M.; Gutowski, M.; Li, X.; Bowen, K. H. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 14073
44. Haranczyk, M.; Gutowski, M.; Li, X.; Bowen, K. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 4804
45. Li, X.; Bowen, K. H.; Haranczyk, M.; Mazurkiewicz, K.; Rak, J.; Gutowski, M. J. Chem. Phys. 2007, 127, 174309
46. Gutowski, M.; Dabkowska, I.; Rak, J.; Xu, S.; Nilles, J. M.; Radisic, D.; Bowen, K. H. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 431
47. Haranczyk, M.; Dabkowska, I.; Rak, J.; Gutowski, M.; Nilles, J. M.; Stokes, S.; Radisic, D.; Bowen, K. H. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 6919
48. Haranczyk, M.; Bachorz, R.; Rak, J.; Gutowski, M.; Radisic, D.; Stokes, S. T.; Nilles, J. M.; Bowen, K. H. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 7889
49. Haranczyk, M.; Rak, J.; Gutowski, M.; Radisic, D.; Stokes, S. T.; Nilles, J. M.; Bowen, K. H. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 13383
50. Mazurkiewicz, K.; Haranczyk, M.; Gutowski, M.; Rak, J.; Radisic, D.; Eustis, S. N.; Wang, D.; Bowen, K. H. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 1216
51. Storoniak, P.; Mazurkiewicz, K.; Haranczyk, M.; Gutowski, M.; Rak, J.; Eustis, S. N.; Ko, Y. J.; Wang, H.; Bowen, K. H. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 11353
52. Szyperska, A.; Rak, J.; Leszczynski, J.; Li, X.; Ko, Y. J.; Wang, H.; Bowen, K. H. ChemPhysChem 2010, 11, 880
53. Szyperska, A.; Rak, J.; Leszczynski, J.; Li, X.; Ko, Y. J.; Wang, H.; Bowen, K. H. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 2663
54. Stokes, S. T.; Li, X.; Grubisic, A.; Ko, Y. J.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 2007, 127, 84321
55. Ray, S. G.; Daube, S. S.; Naaman, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 15
56. Naaman, R.; Sanche, L. Chem. Rev. 2007, 107, 1553
57. Younkin, J. M.; Smith, L. J.; Compton, R. N. Theor. Chim. Acta (Berlin) 1976, 41, 157
58. Colson, A.; Besler, B.; Close, D. M.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. 1992, 96, 661
59. Colson, A.; Besler, B.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. 1992, 96, 9787
60. Colson, A.; Besler, B.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. 1993, 97, 13852
61. Sevilla, M. D.; Brent, B.; Colson, A. J. Phys. Chem. 1994, 98, 2215
62. Sevella, M. D.; Besler, B.; Colson, A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 1060
63. Oyler, N. A.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. 1993, 97, 11122
64. Oyler, N. A.; Adamowicz, L. Chem. Phys. Lett. 1994, 219, 223
65. Russo, N.; Toscano, M.; Grand, A. J. Comput. Chem. 2000, 21, 1243
66. Wetmore, S. D.; Boyd, R. J.; Eriksson, L. A. Chem. Phys. Lett. 2000, 322, 129
67. Saettel, N. J.; Wiest, O. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2693
68. Wesolowski, S. S.; Leininger, M. L.; Pentchev, P. N.; Schaefer, H. F. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4023
69. Richardson, N. A.; Gu, J.; Wang, S.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 4404
70. Bao, X.; Wang, J.; Gu, J.; Leszczynski, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 5658
71. Gu, J.; Wang, J.; Leszczynski, J. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 9322
72. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1250
73. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. ChemPhysChem 2006, 7, 1885
74. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. Nucleic Acids Res. 2007, 35, 5165
75. Reynisson, J.; Steenken, S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 5353
76. Richardson, N. A.; Wesolowski, S. S.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 848
77. Li, X.; Cai, Z.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 9345
78. Kumar, A.; Knapp-Mohammady, M.; Mishra, P. C.; Suhai, S. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1047
79. Radisic, D.; Bowen, K. H.; Dakowska, I.; Storoniak, P.; Rak, J.; Gutowski, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 6443
80. Kumar, A.; Mishra, P. C.; Suhai, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 3971
81. Kim, S.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 10381
82. Richardson, N. A.; Wesolowski, S. S.; Schaefer, H. F. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 10163
83. Li, X.; Cai, Z.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 10115
84. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 13067
85. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. J. Chem. Phys. 2007, 127, 155107
86. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 19696
87. Kim, S.; Schaefer, H. F. J. Chem. Phys. 2007, 126, 64301
88. Kim, S.; Wheeler, S. E.; Schaefer, H. F. J. Chem. Phys. 2006, 124, 204310
89. Kim, S.; Schaefer, H. F. J. Chem. Phys. 2006, 125, 144305
90. Bao, X.; Sun, H.; Wong, N.-B.; Gu, J. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 5865
91. Bao, X.; Liang, G.; Wong, N.-B.; Gu, J. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 666
92. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. Chem.-Eur. J. 2010, 16, 5089
93. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. Chem. Phys. Lett. 2009, 473, 213
94. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. Chem. Eur. J. 2012, 18, 5232
95. Gu, J.; Wang, J.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 1458
96. Gu, J.; Wong, N.-B.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. Chem.-Eur. J. 2010, 16, 13155
97. Compton, R. N.; Yoshioka, Y.; Jordan, K. D. Theor. Chim. Acta (Berlin) 1980, 54, 259
98. Dewar, M. J. S.; Zoebisch, E. G.; Healy, E. F. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3902
99. Zhang, Q.; Chen, E. C. M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995, 217, 755
100. Bachorz, R. A.; Klopper, W.; Gutowski, M. J. Chem. Phys. 2007, 126, 085101
101. Dedikova, P.; Demovic, L.; Pitonak, M.; Neogrady, P.; Urban, M. Chem. Phys. Lett. 2009, 481, 107
102. Head-Gordon, M.; Pople, J. A.; Frisch, M. J. Chem. Phys. Lett. 1988, 153, 503
103. Head-Gordon, M.; Head-Gordon, T. Chem. Phys. Lett. 1994, 220, 122
104. Saebø, S.; Almlöf, J. Chem. Phys. Lett. 1989, 154, 83
105. Frisch, M. J.; Head-Gordon, M.; Pople, J. A. Chem. Phys. Lett. 1990, 166, 275
106. Frisch, M. J.; Head-Gordon, M.; Pople, J. A. Chem. Phys. Lett. 1990, 166, 281
107. Cizek, J. In Advances in Chemical Physics, Vol. 14; LeFebvre, R.; Moser, C., Eds.; Wiley Interscience: New York, 1969; p 35.
108. Purvis, G. D.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 1982, 76, 1910
109. Scuseria, G. E.; Janssen, C. L.; Schaefer, H. F. J. Chem. Phys. 1988, 89, 7382
110. Scuseria, G. E.; Schaefer, H. F. J. Chem. Phys. 1989, 90, 3700
111. Bachorz, R. A.; Rak, J.; Gutowski, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 2116
112. Gu, J.; Unpublished.
113. Dykstra, C. E. Chem. Phys. Lett. 1977, 45, 466
114. Handy, N. C.; Pople, J. A.; Head-Gordon, M.; Raghavachari, K.; Trucks, G. W. Chem. Phys. Lett. 1989, 164, 185
115. Kobayashi, R.; Handy, N. C.; Amos, R. D.; Trucks, G. W.; Frisch, M. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1991, 95, 6723
116. Andersson, K.; Malmqvist, P.-A.; Roos, B. O. J. Chem. Phys. 1992, 96, 1218
117. Roca-Sanjuan, D.; Merchan, M.; Serrano-Andres, L.; Rubio, M. J. Chem. Phys. 2008, 129, 095104
118. Curtiss, L. A.; Redfern, P. C.; Raghavachari, K. J. Chem. Phys. 2007, 126, 084108
119. Curtiss, L. A.; Redfern, P. C.; Raghavachari, K. J. Chem. Phys. 2007, 127, 124105
120. Galbraith, J. M.; Schaefer, H. F. J. Chem. Phys. 1996, 105, 862
121. Tschumper, G. S.; Schaefer, H. F. J. Chem. Phys. 1997, 107, 2529
122. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785
123. Miehlich, B.; Savin, A.; Stoll, H.; Preuss, H. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 200
124. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648
125. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822
126. Backe, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098
127. Backe, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1372
128. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 34, 7406
129. Perdew, J. P.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1992, 45, 13244
130. Zhao, Y.; Schultz, N. E.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 364
131. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 2008, 120, 215
132. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Chem. Phys. Lett. 2011, 502, 1
133. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Acc. Chem. Res. 2008, 41, 157
134. Gu, J.; Wang, J.; Leszczynski, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. Chem. Phys. Lett. 2008, 459, 164
135. Gu, J.; Wang, J.; Leszczynski, J. Chem. Phys. Lett. 2011, 512, 108
136. Siefermann, K. R.; Abel, B. Agew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 5264
137. Sanche, L. Nature 2009, 461, 358
138. Wang, C.-R.; Nguyen, J.; Lu, Q.-B. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 11320
139. Wang, C.-R.; Lu, Q.-B. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 14710
140. Migus, A.; Gauduel, Y.; Martin, J. L.; Antonetti, A. Phys. Rev. Lett. 1987, 58, 1559
141. Rossky, P. J.; Schnitker, J. J. Phys. Chem. 1988, 92, 4277
142. Long, F. H.; Lu, H.; Eisenthal, K. B. Phys. Rev. Lett. 1990, 64, 1469
143. Laenen, R.; Roth, T.; Laubereau, A. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 50
144. Borgis, D.; Rossky, P. J.; Turi, L. J. Chem. Phys. 2007, 127, 174508
145. Wang, C.-R.; Luo, T.; Lu, Q.-B. Phys. Chem. Chem. Phys. 2008, 10, 4463
146. Orozco, M.; Luque, F. J. Chem. Rev. 2000, 100, 4187
147. Cossi, M.; Barone, V.; Cammi, R.; Tomasi, J. Chem. Phys. Lett. 1996, 255, 327
148. Tomasi, J.; Mennucci, B.; Cammi, R. Chem. Rev. 2005, 105, 2999
149. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 1221
150. Li, X.; Cai, Z.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 1596
151. Wetmore, S. D.; Boyd, R. J.; Eriksson, L. A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9332
152. Haranczyk, M.; Gutowski, M. Angew. Chem., Int. Ed. 2005, 44, 6585
153. Roehrig, G. J.; Oyler, N. A.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. 1995, 99, 14285
154. Smith, D. M. A.; Jalbout, A. F.; Smets, J.; Adamowicz, L. Chem. Phys. 2000, 260, 45
155. Mazurkiewicz, K.; Bachorz, R. A.; Gutowski, M.; Rak, J. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 24696
156. Li, X.; Sanche, L.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 11248
157. Wetmore, S. D.; Boyd, R. J.; Eriksson, L. Chem. Phys. Lett. 2001, 343, 151
158. Li, X.; Sevilla, M. D.; Sanche, L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 13688
159. Liang, G.; Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. Unpublished.
160. Kumar, A.; Sevilla, M. D. Chem. Rev. 2010, 110, 7002
161. Steenken, S. Chem. Rev. 1989, 89, 503
162. Jena, N. R.; Mishra, P. C. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 5418
163. Luo, Q.; Li, Q.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. Collect. Czech. Chem. Commun. 2005, 70, 826
164. Xie, H.; Cao, Z. Int. J. Quantum Chem. 2007, 107, 1261
165. Evangelista, F. A.; Paul, A.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 3565
166. Luo, Q.; Li, Q.; Kim, S.; Wheeler, S. E.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 861
167. Profeta, L. T. M.; Larkin, J. D.; Schaefer, H. F. Mol. Phys. 2003, 101, 3277
168. Jiao, D.; Wang, H. Mol. Phys. 2008, 106, 2653
169. Li, X.; Sanche, L.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 5472
170. Jalbout, A. F.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 1033
171. Smets, J.; McCarthy, W. J.; Adamowicz, L. Chem. Phys. Lett. 1996, 256, 360
172. Frigato, T.; Svozil, D.; Jungwirth, P. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 2916
173. Morgado, C. A.; Pichugin, K. Y.; Adamowicz, L. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2758
174. Smets, J.; McCarthy, W. J.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. 1996, 100, 14655
175. Smets, J.; Smith, D. M. A.; Elkadi, Y.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. 1997, 101, 9152
176. Dolgounitcheva, O.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 7912
177. Dedikova, P.; Neogrady, P.; Urban, M. J. Phys. Chem. A 2011, 115, 2350
178. Li, D.; Ai, H. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 11732
179. Jalbout, A. F.; Adamowicz, L. J. Mol. Struct. 2002, 605, 93
180. Mazurkiewicz, K.; Haranczyk, M.; Storoniak, R.; Gutowski, M.; Rak, J.; Radisic, D.; Eustis, S. N.; Wang, D.; Bowen, K. H. Chem. Phys. 2007, 342, 215
181. Yates, B. F.; Bouma, W. J.; Radom, L. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 5805
182. Al-Jihad, I.; Smets, J.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 2994
183. Stepanian, S. G.; Jalbout, A. F.; Hall, C. S.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 7911
184. Li, X.; Sevilla, M. D.; Sanche, L. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8916
185. Kobylecka, M.; Leszczynski, J.; Rak, J. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 15683
186. Szyperska, A.; Gajewicz, A.; Mazurkiewicz, K.; Leszczynski, J.; Rak, J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 19499
187. Smets, J.; Jalbout, A. F.; Adamowicz, L. Chem. Phys. Lett. 2001, 342, 342
188. Kobylecka, M.; Leszczynski, J.; Rak, J. J. Chem. Phys. 2009, 131, 085103
189. Kumar, A.; Sevilla, M. D.; Suhai, S. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 5189
190. Tian, S. X. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 5153
191. Zhang, J. D.; Chen, Z.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 6217
192. Zhang, J. D.; Schaefer, H. F. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 115
193. Zhang, J. D.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 12010
194. Kumar, A.; Mishra, P. C.; Suhai, S. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 7719
195. Lind, M. C.; Richardson, N. A.; Wheeler, S. E.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 5525
196. Kim, S.; Lind, M. C.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 3545
197. Xie, H.; Xia, F.; Cao, Z. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 4384
198. Cossi, M.; Rega, N.; Scalmani, G.; Barone, V. J. Comput. Chem. 2003, 24, 669
199. Barone, V.; Cossi, M. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1995
200. Lind, M. C.; Bera, P. P.; Richardson, N. C.; Wheeler, S. E.; Schaefer, H. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 7554
201. Zheng, Y.; Cloutier, P.; Hunting, D. J.; Wagner, J. R.; Sanche, L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1002
202. Gu, J.; Xie, Y.; Schaefer, H. F. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1053
203. Li, X.; Sanche, L.; Sevilla, M. D. Radiat. Res. 2006, 165, 721
204. Liang, G.; Bao, X.; Gu, J. J. Comput. Chem. 2008, 29, 2648
205. Evangelista, F. A.; Schaefer, H. F. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 10258
206. Barrios, R.; Skurski, P.; Simons, J. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7991
207. Barrios, R.; Anusiewicz, I.; Skurski, P.; Simons, J. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 2999
208. Berdys, J.; Anusiewicz, I.; Skurski, P.; Simons, J. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6441
209. Berdys, J.; Skurski, P.; Simons, J. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 5800
210. Anusiewicz, I.; Berdys, J.; Sobczyk, M.; Skurski, P.; Simons, J. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 11381
211. Kumar, A.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 5464
212. Rak, J.; Kobylecka, M.; Storoniak, P. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 1911
213. Schyman, P.; Laaksonen, A. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 12254
214. Kobylecka, M.; Gu, J.; Rak, J.; Leszczynski, J. J. Chem. Phys. 2008, 128, 44315
215. Stokes, S. T.; Grubisic, A.; Li, X.; Ko, Y. J.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 2008, 128, 44314
216. Foresman, J. B.; Keith, T. A.; Wiberg, K. B.; Snoonian, J.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16098
217. Chen, H.-Y.; Kao, C.-L.; Hsu, S. C. N. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15930
218. Maseras, F.; Morokuma, K. J. Comput. Chem. 1995, 16, 1170
219. Humbel, S.; Sieber, S.; Morokuma, K. J. Chem. Phys. 1996, 105, 1959
220. Matsubara, T.; Sieber, S.; Morokuma, K. Int. J. Quantum Chem. 1996, 60, 1101
221. Svensson, M.; Humbel, S.; Froese, R. D. J.; Matsubara, T.; Sieber, S.; Morokuma, K. J. Phys. Chem. 1996, 100, 19357
222. Svensson, M.; Humbel, S.; Morokuma, K. J. Chem. Phys. 1996, 105, 3654
223. Dapprich, S.; Komaromi, I.; Byun, K. S.; Morokuma, K.; Frisch, M. J. J. Mol. Struct. 1999, 462, 1
224. Vreven, T.; Morokuma, K. J. Comput. Chem. 2000, 21, 1419
225. Gu, J.; Wang, J.; Rak, J.; Leszczynski, J. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 3479
226. Dabkowska, I.; Rak, J.; Gutowski, M. Eur. Phys. J. D 2005, 35, 429
227. Lyngdoh, R. H. D.; Schaefer, H. F. Acc. Chem. Res. 2009, 42, 563
228. Simons, J. Acc. Chem. Res. 2006, 39, 772
229. Simons, J. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 6401
230. Kumar, A.; Sevilla, M. D. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 2130
231. Gu, J.; Wang, J.; Leszczynski, J. Nucleic Acids Res. 2010, 38, 5280
232. Gu, J.; Wang, J.; Leszczynski, J. ChemPhysChem 2010, 11, 175
233. Gu, J.; Wang, J.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 14831
234. Xie, H.; Wu, R.; Xia, F.; Cao, Z. J. Comput. Chem. 2008, 29, 2025
235. Kumar, A.; Sevilla, M. D. ChemPhysChem 2009, 10, 1426
236. Zhang, R.; Zhang, K.; Eriksson, L. A. Chem.-Eur. J. 2008, 14, 2850
237. Caron, L. G.; Sanche, L. Theoretical Studies of Electron Interactions with DNA and its Subunits: from Tetrahydrofuran to Plasmid DNA. In Low-Energy Electron Scattering from Molecules, Biomolecules and Surfaces; Carsky, P.; Curik, R., Eds.; CRC Press: Boca Raton, FL, 2011; pp 171-247.
238. Kim, S.; Schaefer, H. F. J. Chem. Phys. 2010, 133, 144305
239. Li, X.; Wang, H.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 2010, 133, 144304
240. Gianturco, F. A.; Lucchese, R. R. J. Chem. Phys. 2004, 120, 7446
241. Gianturco, F. A.; Sebastianelli, F.; Lucchese, R. R.; Baccarelli, I.; Sanna, N. J. Chem. Phys. 2008, 128, 174302
242. Winstead, C.; McKoy, V. J. Chem. Phys. 2006, 125, 174304
243. Winstead, C.; McKoy, V. J. Chem. Phys. 2006, 125, 244302
244. Winstead, C.; McKoy, V.; Sanchez, S. dA. J. Chem. Phys. 2007, 127, 85105
245. Winstead, C.; McKoy, V. J. Chem. Phys. 2006, 125, 74302
246. Winstead, C.; McKoy, V. Radiat. Phys. Chem. 2008, 77, 1258
247. Wang, Y.; Tian, S. X. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 6169