Catalysis effects of water molecules and of charge on intramolecular proton transfer of uracil

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 34, 2009, Pages 11732-11742

  Li, Dejie ^a   Ai, Hongqi ^a  

^a UNIVERSITY OF JINAN   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIVATION ENERGY; CATALYSIS; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; HYDRATES; HYDRATION; ISOMERS; MOLECULES; QUALITY ASSURANCE;

CATALYSIS EFFECTS; CHARGED SYSTEMS; DENSITY FUNCTIONAL THEORY CALCULATIONS; DIFFERENT PROCESS; ENERGY CHANGES; EXCHANGE AND CORRELATION; INTRAMOLECULAR PROTON TRANSFER; OPTIMAL NUMBER; POINT MUTATIONS; POSITIVE CHARGES; RESEARCH OBJECT; STABLE ISOMERS; STRUCTURAL PARAMETER; WATER CLUSTER; WATER MOLECULE;

PROTON TRANSFER;

EID: 70349244816     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9031833     Document Type: Article

References (56)

1. Hanus, M.; Ryjacek, F.; Kabelac, M.; Kubar, T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 7678.
2. Florian, J.; Leszczynski, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3010.
3. Watson, J. D.; Crick, F. H. C. Nature 1953, 171, 737.
4. Barrios, R.; Skurski, P.; Simons, J. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7991.
5. Li, X.; Sevilla, M. D.; Sanche, L. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 5472.
6. Hobza, P.; Sponer, J. Chem. Rev. 1999, 99, 3247.
7. Fogarosi, G. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 1381.
8. van Mourik, T.; Benoit, D. M.; Price, S. L.; Clary, D. C. Phys. Chem. Chem. Phys. 2000, 2, 1281.
9. Clary, D. C.; Benoit, D. M.; van Mourik, T. Ace Chem. Res. 2000, 33, 441.
10. Kobayashi, R. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 10813.
11. Sambrano, J. R.; Souza, A. R.; Queralt, J. J.; Andres, J. Chem. Phys. Lett. 2000, 317, 437.
12. Kryachko, E. S.; Nguyen, M. T.; Zeegers-Huyskens, T. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 1288.
13. Kryachko, E. S.; Nguyen, M. T.; Zeegers-Huyskens, T. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 1934.
14. Chandra, A. K.; Nguyen, M. T.; Zeegers-Huyskens, T. J. Mol. Struct. 2000, 579, 1.
15. Carles, S.; Lecomte, F.; Schermann, J. P.; Desfrancois, C. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 10662.
16. Gorb, L.; Leszczynski, J. Int. J. Quantum Chem. 1998, 70, 855.
17. Luque, F. J.; Sponer, J.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 4192.
18. Bertran, J.; Oliva, A.; et al. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 8159.
19. Hu, X.; Li, H.; Liang, W.; Han, S. Chem. Phys. Lett. 2006, 417, 320.
20. Schllhorn, H.; Thewalt, U.; Lippen, B. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 7213.
21. Gutle, C.; Salpin, J.-Y.; Cartailler, T.; et al. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 41.
22. Roehrig, G. H.; Oyler, N. A.; Adamowicz, L. Chem. Phys. Lett. 1994, 225, 265.
23. Colson, A. O.; Sevila, M. D. J. Phys. Chem. 1996, 100, 4420.
24. Samijlenko, S. P.; Krechkivska, O. M. J. Mol. Struct. 2004, 708, 97.
25. Fogarasi, G. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 1381.
26. Mazurkiewicz, K.; Bachorz, R. A.; Gutowski, M.; Rak, J. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 24696.
27. Nilles, J. M.; Bowen, K. H.; Phys, J. Chem. B 2003, 107, 7889.
28. Bao, X.; Liang, G.; Wang, N.; Gu, J. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 666.
29. Gu, J.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 577.
30. Gorb, L.; Leszczynski, J. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5024.
31. Antonczak, S.; Ruiz-Lopez, M. F.; Rivail, J. L. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3912.
32. Morpugo, S.; Bossa, M.; Morpugo, G. O. Chem. Phys. Lett. 1997, 280, 233.
33. Hobza, P.; Sponer, J. Chem. Rev. 1999, 99, 3247.
34. Shukla, M. K.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 7775.
35. Li, X.; Cai, Z.; Sevilla, M.; Sevilla., D. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 10115.
36. Hendricks, J. H.; Lyapustina, S. A.; de Clercq, H. L.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 1998, 108, 8.
37. Schiedt, J.; Weinkauf, R.; Neumark, D.; Schlag, E. Chem. Phys. 1998 239 511
38. Hu, X.; Li, H.; Liang, W.; Han, S. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 12999.
39. Chandra, A. K.; Uchimaru, T.; Zeegers-Huyskens, T. J. Mol. Struct. 2002, 605, 213.
40. Di Laudo, M.; Whittleton, S. R.; Wetmore, S. D. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 10406.
41. Malick, D. K.; Petersson, G. A. J. Chem. Phys. 1998, 108, 5704.
42. Peiro-Garcia, J.; Nebot-Gil, I. Chem. Phys. Chem. 2003, 4, 843.
43. Nguyen, M. T.; Chandra, A. K.; Zeegers-Huyskens, T. J. Chem. Soc. 1998, 94, 1211.
44. Weinhold, F.; Carpenter, J. E. Plenum: New York, 1988.
45. Frisch, M. J., et al. Gaussian 03, revision C.02; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
46. Gu, J.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 2744.
47. Orozco, M.; Hernandez, B.; Luque, F. J. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5228.
48. Bao, X.; Li, G.; Wang, N.; Gu, J. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 5865.
49. Rejnek, J.; Hanus, M.; Kabela, M.; Ryjaek, F.; Hobza, P. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 2006.
50. Wesolowski, S. S.; Leininger, M. L.; Pentchev, P. N.; Schaefer, H. F. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4023.
51. Wetmore, S. D.; Boyd, R. J.; Eriksson, L. A. Chem. Phys. Lett. 2000, 322, 129.
52. Desfrancüois, C.; Periquet, V.; Bouteiller, Y.; Schermann, J. P. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1274.
53. Russo, N.; Toscano, M.; Grand, A. J. J. Comput. Chem. 2000, 27, 1243.
54. Haranczyk, M.; Gutowski, M. J. Chem. Soc. 2005, 127, 699.
55. Dabkowska, I.; Gutowski, M.; Rak, J. J. Chem. Soc. 2005, 127, 2238
56. Li, P.; Bu, Y. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 18088.