Intermolecular proton transfer in anionic complexes of uracil with alcohols

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 109, Issue 27, 2005, Pages 13383-13391

  Harańczyk, Maciej ^a,b   Rak, Janusz ^a   Gutowski, Maciej ^a,b   Radisic, Dunja ^c   Stokes, Sarah T ^c   Bowen Jr , Kit H ^c  

^a UNIVERSITY OF GDA SK   (Poland)

^b PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

^c JOHNS HOPKINS UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANION PHOTOELECTRON SPECTROSCOPY; ELECTRON TRANSFER SPECTROSCOPY; ELECTRON TRANSMISSION SPECTROSCOPY; VERTICAL DETACHMENT ENERGY (VDE);

ALCOHOLS; COMPLEXATION; DNA; ENTHALPY; NEGATIVE IONS; POTENTIAL ENERGY; RNA; TRANSPORT PROPERTIES; X RAY PHOTOELECTRON SPECTROSCOPY;

PROTONS;

EID: 22944479271     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp050246w     Document Type: Article

References (70)

1. Steenken, S. Chem. Rev. 1989, 89, 503-520.
2. Boudaiffa, B.; Cloutier, P.; Hunting, D.; Huels, M. A.; Sanche, L. Science 2000, 287, 1658-1660.
3. Green, N. J. B.; Bolton, C. E.; Spencer-Smith, R. D. Radiat. Environ. Biophys. 1999, 38, 221-228.
4. Desfrançois, C.; Carles, S.; Schermann, J. P. Chem. Rev. 2000, 100, 3943-3962.
5. Oyler, N. A.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. 1993, 97, 11122-11123.
6. Smets, J.; McCarthy, W. J.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. 1996, 100, 14655-14660.
7. Smets, J.; Smith, D. M. A.; Elkadi, Y.; Adamowicz, L. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 9152-9156.
8. Dolgounitcheva, O.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V. Chem. Phys. Lett. 1999, 307, 220-226.
9. Dolgounitcheva, O.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 7912-7917.
10. Gutowski, M.; Skurski, P.; Simons, J. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 10159-10162.
11. Skurski, P.; Rak, J.; Simons, J.; Gutowski, M. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11073-11074.
12. Rak, J.; Skurski, P.; Gutowski, M. J. Chem. Phys. 2001, 114, 10673-10681.
13. Wesolowski, S. S.; Leininger, M. L.; Pentchev, P. N.; Schaefer, H. F., III J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4023-4028.
14. Hendricks, J. H.; Lyapustina, S. A.; de Clercq, H. L.; Snodgrass, J. T.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 1996, 104, 7788-7791.
15. Hendricks, J. H.; Lyapustina, S. A.; de Clercq, H. L.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 1998, 108, 8-11.
16. Schiedt, J.; Weinkauf, R.; Neumark, D. M.; Schlag, E. W. Chem. Phys. 1998, 239, 511-524.
17. Desfrançois, C.; Abdoul-Carime, H.; Schermann, J. P. J. Chem. Phys. 1996, 104, 7792-7794.
18. Desfrançois, C.; Periquet, V.; Bouteiller, Y.; Schermann, J. P. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1274-1278.
19. Sevilla, M. D.; Besler, B.; Colson, A. O. J. Phys. Chem. 1994, 98, 2215-2215.
20. Sevilla, M. D.; Besler, B.; Colson, A. O. J. Phys. Chem. 1995, 99, 1060-1063.
21. Li, X.; Cai, Z.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 1596-1603.
22. Harańczyk, M.; Gutowski, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 699-706.
23. Harańczyk, M.; Rak, J.; Gutowski, M. J. Am Chem. Soc. Submitted for publication.
24. Bachorz, R. A.; Rak, J.; Gutowski, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 2116.
25. Aflatooni, K.; Gallup, G. A.; Burrow, P. D. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 6205-6207.
26. Lowdin, P. O. Rev. Mod. Phys. 1963, 35, 724-732.
27. Estrin, D. A.; Paglieri, L.; Corongiu, G. J. Phys. Chem. 1994, 98, 5653-5660.
28. Morpugo, S.; Bossa, M.; Morpugo, G. O. Chem. Phys. Lett. 1997, 280, 233-238.
29. Kryachko, E. S.; Nguyen, M. T.; Zeegers-Huyskens, T. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 1288-1295.
30. Kryachko, E. S.; Nguyen, M. T.; Zeegers-Huyskens, T. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 1934-1943.
31. Hobza, P.; Sponer, J. Chem. Rev. 1999, 99, 3247-3276.
32. Kim, Y.; Lim, S.; Kim, Y. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 6632-6637.
33. Bertran, J.; Olivia, A.; Rodriguez-Santiago, L.; Sodupe, M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 8159-8167.
34. Takeuchi, S.; Tahara, T. Chem. Phys. Lett. 1997, 277, 340-346.
35. Zhanpeisov, N. U.; Sponer, J.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 10374-10379.
36. He, F.; Ramirez, J.; Lebrilla, C. B. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 4726-4727.
37. Li, X.; Cai, Z.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 10115-10123.
38. Da̧bkowska, I.; Rak, J.; Gutowski, M. Submitted for publication.
39. Gutowski, M.; Da̧bkowska, I.; Rak, J.; Xu, S.; Nilles, J. M.; Radisic, D.; Bowen, K. H., Jr. Eur. Phys. J. D 2002, 20, 431-439.
40. Harańczyk, M.; Bachorz, R.; Rak, J.; Gutowski, M.; Radisic, D.; Stokes, S. T.; Nilles, J. M.; Bowen, K. H. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 7889-7895.
41. Radisic, D.; Bowen, K. H., Jr.; Da̧bkowska, I.; Storoniak, P.; Rak, J.; Gutowski, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 6443-6450.
42. Coe, J. V.; Snodgrass, J. T.; Freidhoff, C. B.; McHugh, K. M.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 1987, 87, 4302-4309.
43. Coe, J. V.; Snodgrass, J. T.; Freidhoff, C. B.; McHugh, K. M.; Bowen, K. H. J. Chem. Phys. 1986, 84, 618-625.
44. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098-3100.
45. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652.
46. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789.
47. Ditchfield, R.; Hehre, W. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1971, 54, 724-728.
48. Hehre, W. J.; Ditchfield, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257-2261.
49. Da̧bkowska, I.; Rak, J.; Gutowski, M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 7423-7433.
50. Rak, J.; Skurski, P.; Simons, J.; Gutowski, M. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11695-11707.
51. van Mourik, T.; Price, S. L.; Clary, D. C. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 1611-1618.
52. Dkhissi, A.; Adamowicz, L.; Maes, G. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 2112-2119.
53. Rienstra-Kiracofe, J. C.; Tschumper, G. S.; Schaefer, H. F., III Chem. Rev. 2002, 102, 231-282.
54. Simons, J.; Jordan, K. D. Chem. Rev. 1987, 87, 7, 535-555.
55. Gutowski, M.; Simons, J. J. Chem. Phys. 1990, 93, 2546-2553.
56. Modelli, A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 2923-2930.
57. Mariano, D.; Vera, A.; Pierini, A. B. Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 2899-2903.
58. Gutowski, M.; Chalasinski, G. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5540-5554.
59. Gutowski, M.; van Duijneveldt-van de Rijdt, J.; van Lenthe, J. H.; van Duijneveldt, F. B. J. Chem. Phys. 1993, 98, 4728-4737.
60. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
61. Straatsma, T. P.; Aprà, E.; Windus, T. L.; Bylaska, E. J.; de Jong, W.; Hirata, S.; Valiev, M.; Hackler, M.; Pollack, L.; Harrison, R.; Dupuis, M.; Smith, D. M. A.; Nieplocha, J.; Tipparaju V.; Krishnan, M.; Auer, A. A.; Brown, E.; Cisneros, G.; Fann, G.; Früchtl, H.; Garza, J.; Hirao, K.; Kendall, R.; Nichols, J.; Tsemekhman, K.; Wolinski, K.; Anchell, J.; Bernholdt, D.; Borowski, P.; Clark, T.; Clerc, D.; Dachsel, H.; Deegan, M.; Dyall, K.; Elwood, D.; Glendening, E.; Gutowski, M.; Hess, A.; Jaffe, J.; Johnson, B.; Ju, J.; Kobayashi, R.; Kutteh, R.; Lin, Z.; Littlefield, R.; Long, X.; Meng, B.; Nakajima, T.; Niu, S.; Rosing, M.; Sandrone, G.; Stave, M.; Taylor, H.; Thomas, G.; van Lenthe, J.; Wong, A.; Zhang, Z.; NWChem, A Computational Chemistry Package for Parallel Computers, Version 4.6 (2004), Pacific Northwest National Laboratory, Richland, Washington 99352-0999, USA.
62. Hanel, G.; Gstir, B.; Denifl, S.; Scheier, P.; Probst, M.; Farizon, B.; Farizon, M.; Illenberger, E.; Mark, T. D. Phys. Rev. Lett. 2003, 90, 188105.
63. Abdoul-Carime, H.; Gohlke, S.; Illenberger, E. Phys. Rev. Lett. 2004, 92, 168103.
64. Webb, S.; Iordanov, T.; Hammes-Schiffer, S. J. Chem. Phys. 2002, 117, 4106-4118.
65. Smith, J. R.; Kim, J. B.; Lineberger, W. C Phys. Rev. A 1997, 55, 2036-2043.
66. Ramond, T. M.; Davico, G. E.; Schwartz, R. L.; Lineberger, W. C J. Chem. Phys. 2000, 112, 1158-1169.
67. Graul, S. T.; Schnute, M. E.; Squires, R. R. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1990, 96, 181-198.
68. Bartmess, J. E.; Scott, J. A.; McIver, R. T., Jr. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 6046-6056.
69. Dawson, J. H. J.; Jennings, K. R. Int. J. Mass Spectrom. Ion Phys. 1977, 25, 47-53.
70. Taft, R. W.; Koppel, I. J.; Topsom, R. D.; Anvia, F. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 2047-2052.