Evidence of the E*-E equilibrium from rapid kinetics of Na+ binding to activated protein C and factor Xa*

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 49, 2010, Pages 16125-16130

  Vogt, Austin D ^a   Bah, Alaji ^a   Di Cera, Enrico ^a  

^a SAINT LOUIS UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIVATED PROTEIN C; ACTIVATED PROTEINS; FACTOR XA; HIGH ACTIVITY; PRO-THROMBOTIC FUNCTIONS; STRUCTURAL DATA; TIME-SCALES;

SODIUM;

BLOOD CLOTTING FACTOR 10A; PROTEIN C; SODIUM;

ARTICLE; CHEMISTRY; HUMAN; KINETICS; METABOLISM; PROTEIN BINDING; THERMODYNAMICS;

FACTOR XA; HUMANS; KINETICS; PROTEIN BINDING; PROTEIN C; SODIUM; THERMODYNAMICS;

EID: 78650120937     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp105502c     Document Type: Article

References (110)

1. Neurath, H.; Dixon, G. H. Fed. Proc. 1957, 16, 791-801
2. Fehlhammer, H.; Bode, W. J. Mol. Biol. 1975, 98, 683-692
3. Fehlhammer, H.; Bode, W.; Huber, R. J. Mol. Biol. 1977, 111, 415-438
4. Wang, D.; Bode, W.; Huber, R. J. Mol. Biol. 1985, 185, 595-624
5. Reiling, K. K.; Krucinski, J.; Miercke, L. J.; Raymond, W. W.; Caughey, G. H.; Stroud, R. M. Biochemistry 2003, 42, 2616-2624
6. Hedstrom, L. Chem. Rev. 2002, 102, 4501-4524
7. Bode, W.; Schwager, P.; Huber, R. J. Mol. Biol. 1978, 118, 99-112
8. Di Cera, E. Mol. Aspects Med. 2008, 29, 203-254
9. Ayala, Y. M.; Cantwell, A. M.; Rose, T.; Bush, L. A.; Arosio, D.; Di Cera, E. Proteins 2001, 45, 107-116
10. Dang, O. D.; Vindigni, A.; Di Cera, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 5977-5981
11. Dang, Q. D.; Guinto, E. R.; Di Cera, E. Nat. Biotechnol. 1997, 15, 146-149
12. Myles, T.; Yun, T. H.; Hall, S. W.; Leung, L. L. J. Biol. Chem. 2001, 276, 25143-25149
13. Nogami, K.; Zhou, Q.; Myles, T.; Leung, L. L.; Wakabayashi, H.; Fay, P. J. J. Biol. Chem. 2005, 280, 18476-18487
14. Yun, T. H.; Baglia, F. A.; Myles, T.; Navaneetham, D.; Lopez, J. A.; Walsh, P. N.; Leung, L. L. J. Biol. Chem. 2003, 278, 48112-48119
15. Degen, S. J.; McDowell, S. A.; Sparks, L. M.; Scharrer, I. Thromb. Haemostasis 1995, 73, 203-209
16. Miyata, T.; Aruga, R.; Umeyama, H.; Bezeaud, A.; Guillin, M. C.; Iwanaga, S. Biochemistry 1992, 31, 7457-7462
17. Henriksen, R. A.; Dunham, C. K.; Miller, L. D.; Casey, J. T.; Menke, J. B.; Knupp, C. L.; Usala, S. J. Blood 1998, 91, 2026-2031
18. Sun, W. Y.; Smirnow, D.; Jenkins, M. L.; Degen, S. J. Thromb. Haemostasis 2001, 85, 651-654
19. Stanchev, h.; Philips, M.; Villoutreix, B. O.; Aksglaede, L.; Lethagen, S.; Thorsen, S. Thromb. Haemostasis 2006, 95, 195-198
20. Rouy, S.; Vidaud, D.; Alessandri, J. L.; Dautzenberg, M. D.; Venisse, L.; Guillin, M. C.; Bezeaud, A. Br. J. Haematol. 2006, 132, 770-773
21. Pineda, A. O.; Carrell, C. J.; Bush, L. A.; Prasad, S.; Caccia, S.; Chen, Z. W.; Mathews, F. S.; Di Cera, E. J. Biol. Chem. 2004, 279, 31842-31853
22. Gibbs, C. S.; Coutre, S. E.; Tsiang, M.; Li, W. X.; Jain, A. K.; Dunn, K. E.; Law, V. S.; Mao, C. T.; Matsumura, S. Y.; Mejza, S. J.; Paborsky, L. R.; Leung, L. L. K. Nature 1995, 378, 413-416
23. Tsiang, M.; Paborsky, L. R.; Li, W. X.; Jain, A. K.; Mao, C. T.; Dunn, K. E.; Lee, D. W.; Matsumura, S. Y.; Matteucci, M. D.; Coutre, S. E.; Leung, L. L.; Gibbs, C. S. Biochemistry 1996, 35, 16449-16457
24. Cantwell, A. M.; Di Cera, E. J. Biol. Chem. 2000, 275, 39827-39830
25. Gruber, A.; Cantwell, A. M.; Di Cera, E.; Hanson, S. R. J. Biol. Chem. 2002, 277, 27581-27584
26. Bah, A.; Carrell, C. J.; Chen, Z.; Gandhi, P. S.; Di Cera, E. J. Biol. Chem. 2009, 284, 20034-20040
27. Bah, A.; Garvey, L. C.; Ge, J.; Di Cera, E. J. Biol. Chem. 2006, 281, 40049-40056
28. Gianni, S.; Ivarsson, Y.; Bah, A.; Bush-Pelc, L. A.; Di Cera, E. Biophys. Chem. 2007, 131, 111-114
29. Niu, W.; Chen, Z.; Bush-Pelc, L. A.; Bah, A.; Gandhi, P. S.; Di Cera, E. J. Biol. Chem. 2009, 284, 36175-36185
30. Wells, C. M.; Di Cera, E. Biochemistry 1992, 31, 11721-11730
31. Di Cera, E.; Guinto, E. R.; Vindigni, A.; Dang, Q. D.; Ayala, Y. M.; Wuyi, M.; Tulinsky, A. J. Biol. Chem. 1995, 270, 22089-22092
32. Lai, M. T.; Di Cera, E.; Shafer, J. A. J. Biol. Chem. 1997, 272, 30275-30282
33. Adams, T. E.; Li, W.; Huntington, J. A. J. Thromb. Haemostasis 2009, 7, 1688-1695
34. Huntington, J. A. J. Thromb. Haemostasis 2009, 7 (Suppl 1) 159-164
35. Lechtenberg, B. C.; Johnson, D. J.; Freund, S. M.; Huntington, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010.
36. Kamath, P.; Huntington, J. A.; Krishnaswamy, S. J. Biol. Chem. 2010.
37. Carrell, C. J.; Bush, L. A.; Mathews, F. S.; Di Cera, E. Biophys. Chem. 2006, 121, 177-184
38. Bush-Pelc, L. A.; Marino, F.; Chen, Z.; Pineda, A. O.; Mathews, F. S.; Di Cera, E. J. Biol. Chem. 2007, 282, 27165-27170
39. Pineda, A. O.; Savvides, S. N.; Waksman, G.; Di Cera, E. J. Biol. Chem. 2002, 277, 40177-40180
40. Pineda, A. O.; Zhang, E.; Guinto, E. R.; Savvides, S. N.; Tulinsky, A.; Di Cera, E. Biophys. Chem. 2004, 112, 253-256
41. Gandhi, P. S.; Page, M. J.; Chen, Z.; Bush-Pelc, L. A.; Di Cera, E. J. Biol. Chem. 2009, 284, 24098-24105
42. Gandhi, P. S.; Chen, Z.; Mathews, F. S.; Di Cera, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 1832-1837
43. Pineda, A. O.; Chen, Z. W.; Bah, A.; Garvey, L. C.; Mathews, F. S.; Di Cera, E. J. Biol. Chem. 2006, 281, 32922-32928
44. Johnson, D. J.; Adams, T. E.; Li, W.; Huntington, J. A. Biochem. J. 2005, 392, 21-28
45. Dang, Q. D.; Di Cera, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 10653-10656
46. Krem, M. M.; Di Cera, E. Embo. J. 2001, 20, 3036-3045
47. Zhang, E.; Tulinsky, A. Biophys. Chem. 1997, 63, 185-200
48. Scharer, K.; Morgenthaler, M.; Paulini, R.; Obst-Sander, U.; Banner, D. W.; Schlatter, D.; Benz, J.; Stihle, M.; Diederich, F. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2005, 44, 4400-4404
49. Bajaj, S. P.; Schmidt, A. E.; Agah, S.; Bajaj, M. S.; Padmanabhan, K. J. Biol. Chem. 2006, 281, 24873-24888
50. Schmidt, A. E.; Padmanabhan, K.; Underwood, M. C.; Bode, W.; Mather, T.; Bajaj, S. P. J. Biol. Chem. 2002, 277, 28987-28995
51. Rezaie, A. R.; He, X. Biochemistry 2000, 39, 1817-1825
52. Rezaie, A. R.; Kittur, F. S. J. Biol. Chem. 2004, 279, 48262-48269
53. Orthner, C. L.; Kosow, D. P. Arch. Biochem. Biophys. 1978, 185, 400-406
54. Monnaie, D.; Arosio, D.; Griffon, N.; Rose, T.; Rezaie, A. R.; Di Cera, E. Biochemistry 2000, 39, 5349-54
55. Underwood, M. C.; Zhong, D.; Mathur, A.; Heyduk, T.; Bajaj, S. P. J. Biol. Chem. 2000, 275, 36876-36884
56. Camire, R. M. J. Biol. Chem. 2002, 277, 37863-37870
57. Levigne, S.; Thiec, F.; Cherel, S.; Irving, J. A.; Fribourg, C.; Christophe, O. D. J. Biol. Chem. 2007, 282, 31569-31579
58. He, X.; Rezaie, A. R. J. Biol. Chem. 1999, 274, 4970-4976
59. Steiner, S. A.; Amphlett, G. W.; Castellino, F. J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1980, 94, 340-347
60. Steiner, S. A.; Castellino, F. J. Biochemistry 1982, 21, 4609-4614
61. Steiner, S. A.; Castellino, F. J. Biochemistry 1985, 24, 1136-1141
62. Steiner, S. A.; Castellino, F. J. Biochemistry 1985, 24, 609-617
63. Petrovan, R. J.; Ruf, W. Biochemistry 2000, 39, 14457-14463
64. Zogg, T.; Brandstetter, H. Structure 2009, 17, 1669-1678
65. Schmidt, A. E.; Stewart, J. E.; Mathur, A.; Krishnaswamy, S.; Bajaj, S. P. J. Mol. Biol. 2005, 350, 78-91
66. Page, M. J.; Di Cera, E. Thromb. Haemostasis 2006, 95, 920-921
67. Rezaie, A. R.; Esmon, C. T. J. Biol. Chem. 1992, 267, 26104-26109
68. Roberts, P. S.; Ottenbrite, R. M.; Fleming, P. B.; Wigand, J. Thromb. Diath. Haemorrh. 1974, 31, 309-318
69. Leach, R. D.; DeWind, S. A.; Slattery, C. W.; Herrmann, E. C. Thromb. Res. 1991, 62, 635-648
70. Griffon, N.; Di Stasio, E. Biophys. Chem. 2001, 90, 89-96
71. Yang, L.; Prasad, S.; Di Cera, E.; Rezaie, A. R. J. Biol. Chem. 2004, 279, 38519-38524
72. Dang, Q. D.; Di Cera, E. Blood 1997, 89, 2220-2222
73. Mann, K. G. Chest 2003, 124, 4S-10S
74. Doyle, M. F.; Mann, K. G. J. Biol. Chem. 1990, 265, 10693-10701
75. Kim, P. Y.; Nesheim, M. E. J. Biol. Chem. 2007, 282, 32568-32581
76. Bianchini, E. P.; Orcutt, S. J.; Panizzi, P.; Bock, P. E.; Krishnaswamy, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 10099-10104
77. Orcutt, S. J.; Krishnaswamy, S. J. Biol. Chem. 2004, 279, 54927-54936
78. Lee, C. J.; Wu, S.; Eun, C.; Pedersen, L. G. Biophys. Chem. 2010, 149, 28-33
79. Papaconstantinou, M. E.; Gandhi, P. S.; Chen, Z.; Bah, A.; Di Cera, E. Cell. Mol. Life Sci. 2008, 65, 3688-3697
80. Griffin, J. H.; Zlokovic, B.; Fernandez, J. A. Semin. Hematol. 2002, 39, 197-205
81. Bae, J. S.; Yang, L.; Rezaie, A. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 2867-2872
82. Kerschen, E. J.; Fernandez, J. A.; Cooley, B. C.; Yang, X. V.; Sood, R.; Mosnier, L. O.; Castellino, F. J.; Mackman, N.; Griffin, J. H.; Weiler, H. J. Exp. Med. 2007, 204, 2439-2448
83. Mosnier, L. O.; Zampolli, A.; Kerschen, E. J.; Schuepbach, R. A.; Banerjee, Y.; Fernandez, J. A.; Yang, X. V.; Riewald, M.; Weiler, H.; Ruggeri, Z. M.; Griffin, J. H. Blood 2009, 113, 5970-5978
84. Riewald, M.; Petrovan, R. J.; Donner, A.; Mueller, B. M.; Ruf, W. Science 2002, 296, 1880-1882
85. Yang, L.; Bae, J. S.; Manithody, C.; Rezaie, A. R. J. Biol. Chem. 2007, 282, 25493-25500
86. Feistritzer, C.; Schuepbach, R. A.; Mosnier, L. O.; Bush, L. A.; Di Cera, E.; Griffin, J. H.; Riewald, M. J. Biol. Chem. 2006, 281, 20077-20084
87. Mosnier, L. O.; Yang, X. V.; Griffin, J. H. J. Biol. Chem. 2007, 282, 33022-33033
88. Di Cera, E. Blood 2009, 113, 5699-5700
89. Yang, X. V.; Banerjee, Y.; Fernandez, J. A.; Deguchi, H.; Xu, X.; Mosnier, L. O.; Urbanus, R. T.; de Groot, P. G.; White-Adams, T. C.; McCarty, O. J.; Griffin, J. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 274-279
90. Gantt, S. L.; Joseph, C. G.; Fierke, C. A. J. Biol. Chem. 2010, 285, 6036-6043
91. Di Cera, E. IUBMB Life 2009, 61, 510-515
92. Rohr, K. B.; Selwood, T.; Marquardt, U.; Huber, R.; Schechter, N. M.; Bode, W.; Than, M. E. J. Mol. Biol. 2006, 357, 195-209
93. Krojer, T.; Garrido-Franco, M.; Huber, R.; Ehrmann, M.; Clausen, T. Nature 2002, 416, 455-459
94. Jing, H.; Babu, Y. S.; Moore, D.; Kilpatrick, J. M.; Liu, X. Y.; Volanakis, J. E.; Narayana, S. V. J. Mol. Biol. 1998, 282, 1061-1081
95. Hink-Schauer, C.; Estebanez-Perpina, E.; Wilharm, E.; Fuentes-Prior, P.; Klinkert, W.; Bode, W.; Jenne, D. E. J. Biol. Chem. 2002, 277, 50923-50933
96. Shia, S.; Stamos, J.; Kirchhofer, D.; Fan, B.; Wu, J.; Corpuz, R. T.; Santell, L.; Lazarus, R. A.; Eigenbrot, C. J. Mol. Biol. 2005, 346, 1335-1349
97. Carvalho, A. L.; Sanz, L.; Barettino, D.; Romero, A.; Calvete, J. J.; Romao, M. J. J. Mol. Biol. 2002, 322, 325-337
98. Rickert, K. W.; Kelley, P.; Byrne, N. J.; Diehl, R. E.; Hall, D. L.; Montalvo, A. M.; Reid, J. C.; Shipman, J. M.; Thomas, B. W.; Munshi, S. K.; Darke, P. L.; Su, H. P. J. Biol. Chem. 2008, 283, 34864-34872
99. Spraggon, G.; Hornsby, M.; Shipway, A.; Tully, D. C.; Bursulaya, B.; Danahay, H.; Harris, J. L.; Lesley, S. A. Protein Sci. 2009, 18, 1081-1094
100. Ponnuraj, K.; Xu, Y.; Macon, K.; Moore, D.; Volanakis, J. E.; Narayana, S. V. Mol. Cell 2004, 14, 17-28
101. Barrette-Ng, I. H.; Ng, K. K.; Mark, B. L.; Van Aken, D.; Cherney, M. M.; Garen, C.; Kolodenko, Y.; Gorbalenya, A. E.; Snijder, E. J.; James, M. N. J. Biol. Chem. 2002, 277, 39960-39966
102. Cavarelli, J.; Prevost, G.; Bourguet, W.; Moulinier, L.; Chevrier, B.; Delagoutte, B.; Bilwes, A.; Mourey, L.; Rifai, S.; Piemont, Y.; Moras, D. Structure 1997, 5, 813-824
103. Vath, G. M.; Earhart, C. A.; Rago, J. V.; Kim, M. H.; Bohach, G. A.; Schlievert, P. M.; Ohlendorf, D. H. Biochemistry 1997, 36, 1559-1566
104. Eisenmesser, E. Z.; Bosco, D. A.; Akke, M.; Kern, D. Science 2002, 295, 1520-1523
105. Lu, H. P.; Xun, L.; Xie, X. S. Science 1998, 282, 1877-1882
106. Sytina, O. A.; Heyes, D. J.; Hunter, C. N.; Alexandre, M. T.; van Stokkum, I. H.; van Grondelle, R.; Groot, M. L. Nature 2008, 456, 1001-1004
107. Erlandson, K. J.; Miller, S. B.; Nam, Y.; Osborne, A. R.; Zimmer, J.; Rapoport, T. A. Nature 2008, 455, 984-987
108. Zimmer, J.; Nam, Y.; Rapoport, T. A. Nature 2008, 455, 936-943
109. Gros, P.; Milder, F. J.; Janssen, B. J. Nat. Rev. Immunol. 2008, 8, 48-58
110. Banner, D. W. Thromb. Haemostasis 1997, 78, 512-515