Interrupted adenylation domains: Unique bifunctional enzymes involved in nonribosomal peptide biosynthesis

Natural Product Reports

Volumn 32, Issue 5, 2015, Pages 641-653

  Labby, Kristin J ^a   Watsula, Stoyan G ^b   Garneau Tsodikova, Sylvie ^c  

^a BELOIT COLLEGE   (United States)

^b UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

^c UNIVERSITY OF KENTUCKY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

NONRIBOSOMAL PEPTIDE SYNTHETASE; PEPTIDE; PEPTIDE SYNTHASE;

CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; METABOLISM; NONRIBOSOMAL PEPTIDE SYNTHESIS;

MOLECULAR STRUCTURE; PEPTIDE BIOSYNTHESIS, NUCLEIC ACID-INDEPENDENT; PEPTIDE SYNTHASES; PEPTIDES;

EID: 84928911386     PISSN: 02650568     EISSN: 14604752     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4np00120f     Document Type: Review

References (80)

1. C. T. Walsh R. V. O'Brien C. Khosla Angew. Chem., Int. Ed. 2013 52 7098 7124
2. F. Lombó A. Velasco A. Castro F. de la Calle A. F. Brana J. M. Sanchez-Puelles C. Mendez J. A. Salas ChemBioChem 2006 7 366 376
3. D. G. Fujimori S. Hrvatin C. S. Neumann M. Strieker M. A. Marahiel C. T. Walsh Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 16498 16503
4. H. M. Patel C. T. Walsh Biochemistry 2001 40 9023 9031
5. D. A. Miller L. Luo N. Hillson T. A. Keating C. T. Walsh Chem. Biol. 2002 9 333 344
6. M. F. Kreutzer H. Kage P. Gebhardt B. Wackler H. P. Saluz D. Hoffmeister M. Nett Appl. Environ. Microbiol. 2011 77 6117 6124
7. T. Hornbogen S. P. Riechers B. Prinz J. Schultchen C. Lang S. Schmidt C. Mugge S. Turkanovic R. D. Sussmuth E. Tauberger R. Zocher ChemBioChem 2007 8 1048 1054
8. D. Tillett E. Dittmann M. Erhard H. von Dohren T. Borner B. A. Neilan Chem. Biol. 2000 7 753 764
9. T. Nishizawa A. Ueda T. Nakano A. Nishizawa T. Miura M. Asayama K. Fujii K. Harada M. Shirai J. Biochem. 2011 149 475 485
10. A. Sandmann F. Sasse R. Muller Chem. Biol. 2004 11 1071 1079
11. M. Ehling-Schulz N. Vukov A. Schulz R. Shaheen M. Andersson E. Martlbauer S. Scherer Appl. Environ. Microbiol. 2005 71 105 113
12. M. Ehling-Schulz M. Fricker H. Grallert P. Rieck M. Wagner S. Scherer BMC Microbiol. 2006 6 20
13. Y. Q. Cheng ChemBioChem 2006 7 471 477
14. B. Silakowski H. U. Schairer H. Ehret B. Kunze S. Weinig G. Nordsiek P. Brandt H. Blocker G. Hofle S. Beyer R. Muller J. Biol. Chem. 1999 274 37391 37399
15. S. Weinig H. J. Hecht T. Mahmud R. Muller Chem. Biol. 2003 10 939 952
16. D. Yu F. Xu J. Valiente S. Wang J. Zhan J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2013 40 159 168
17. O. E. Zolova S. Garneau-Tsodikova J. Antibiot. 2014 67 59 64
18. N. A. Magarvey M. Ehling-Schulz C. T. Walsh J. Am. Chem. Soc. 2006 128 10698 10699
19. A. M. Gulick ACS Chem. Biol. 2009 4 811 827
20. V. Bucevic-Popovic M. Sprung B. Soldo M. Pavela-Vrancic ChemBioChem 2012 13 1913 1920
21. Y. He Y. Sun T. Liu X. Zhou L. Bai Z. Deng Appl. Environ. Microbiol. 2010 76 3283 3292
22. D. Schwarzer R. Finking M. A. Marahiel Nat. Prod. Rep. 2003 20 275 287
23. E. Conti T. Stachelhaus M. A. Marahiel P. Brick EMBO J. 1997 16 4174 4183
24. T. V. Lee L. J. Johnson R. D. Johnson A. Koulman G. A. Lane J. S. Lott V. L. Arcus J. Biol. Chem. 2010 285 2415 2427
25. A. M. Gulick V. J. Starai A. R. Horswill K. M. Homick J. C. Escalante-Semerena Biochemistry 2003 42 2866 2873
26. N. E. Mikkelsen B. Munch-Petersen H. Eklund FEBS J. 2008 275 2151 2160
27. L. Du Y. He Y. Luo Biochemistry 2008 47 11473 11480
28. J. A. Sundlov C. Shi D. J. Wilson C. C. Aldrich A. M. Gulick Chem. Biol. 2012 19 188 198
29. C. A. Mitchell C. Shi C. C. Aldrich A. M. Gulick Biochemistry 2012 51 3252 3263
30. R. H. Baltz J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2011 38 1747 1760
31. R. H. Baltz J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2014 41 357 369
32. A. H. Al-Mestarihi G. Villamizar J. Fernandez O. E. Zolova F. Lombó S. Garneau-Tsodikova J. Am. Chem. Soc. 2014 136 17350 17354
33. W. Zhang W. J. R. Heemstra Jr C. T. Walsh H. J. Imker Biochemistry 2010 49 9946 9947
34. E. Stegmann C. Rausch S. Stockert D. Burkert W. Wohlleben FEMS Microbiol. Lett. 2006 262 85 92
35. S. Lautru D. Oves-Costales J. L. Pernodet G. L. Challis Microbiology 2007 153 1405 1412
36. M. Wolpert B. Gust B. Kammerer L. Heide Microbiology 2007 153 1413 1423
37. E. J. Drake J. Cao J. Qu M. B. Shah R. M. Straubinger A. M. Gulick J. Biol. Chem. 2007 282 20425 20434
38. G. W. Buchko C. Y. Kim T. C. Terwilliger P. J. Myler Tuberculosis 2010 90 245 251
39. E. A. Felnagle J. J. Barkei H. Park A. M. Podevels M. D. McMahon D. W. Drott M. G. Thomas Biochemistry 2010 49 8815 8817
40. H. J. Imker D. Krahn J. Clerc M. Kaiser C. T. Walsh Chem. Biol. 2010 17 1077 1083
41. B. Boll T. Taubitz L. Heide J. Biol. Chem. 2011 286 36281 36290
42. E. Tatham S. Sundaram Chavadi P. Mohandas U. R. Edupuganti S. K. Angala D. Chatterjee L. E. Quadri BMC Microbiol. 2012 12 118
43. D. A. Herbst B. Boll G. Zocher T. Stehle L. Heide J. Biol. Chem. 2013 288 1991 2003
44. B. Boll L. Heide ChemBioChem 2013 14 43 44
45. J. M. Davidsen D. M. Bartley C. A. Townsend J. Am. Chem. Soc. 2013 135 1749 1759
46. C. Zhang L. Kong Q. Liu X. Lei T. Zhu J. Yin B. Lin Z. Deng D. You PLoS One 2013 8 e56772
47. S. A. Sieber M. A. Marahiel Chem. Rev. 2005 105 715 738
48. M. Z. Ansari J. Sharma R. S. Gokhale D. Mohanty BMC Bioinf. 2008 9 454
49. F. Romero F. Espliego J. Perez Baz T. Garcia de Quesada D. Gravalos F. de la Calle J. L. Fernandez-Puentes J. Antibiot. 1997 50 734 737
50. J. Perez Baz L. M. Canedo J. L. Fernandez Puentes M. V. Silva Elipe J. Antibiot. 1997 50 738 741
51. O. E. Zolova A. S. Mady S. Garneau-Tsodikova Biopolymers 2010 93 777 790
52. L. Robbel K. M. Hoyer M. A. Marahiel FEBS J. 2009 276 1641 1653
53. A. Broberg A. Menkis R. Vasiliauskas J. Nat. Prod. 2006 69 97 102
54. C. D. Cox J. Bacteriol. 1980 142 581 587
55. G. Weber K. Schorgendorfer E. Schneider-Scherzer E. Leitner Curr. Genet. 1994 26 120 125
56. X. Wang J. Tabudravu M. E. Rateb K. J. Annand Z. Qin M. Jaspars Z. Deng Y. Yu H. Deng Mol. BioSyst. 2013 9 1286 1289
57. W. Weckwerth K. Miyamoto K. Iinuma M. Krause M. Glinski T. Storm G. Bonse H. Kleinkauf R. Zocher J. Biol. Chem. 2000 275 17909 17915
58. L. Rouhiainen L. Paulin S. Suomalainen H. Hyytiainen W. Buikema R. Haselkorn K. Sivonen Mol. Microbiol. 2000 37 156 167
59. H. T. Chiu B. K. Hubbard A. N. Shah J. Eide R. A. Fredenburg C. T. Walsh C. Khosla Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 8548 8553
60. Y. Mast T. Weber M. Golz R. Ort-Winklbauer A. Gondran W. Wohlleben E. Schinko Microb. Biotechnol. 2011 4 192 206
61. R. Loria D. R. Bignell S. Moll J. C. Huguet-Tapia M. V. Joshi E. G. Johnson R. F. Seipke D. M. Gibson Antonie van Leeuwenhoek 2008 94 3 10
62. Z. Chang P. Flatt W. H. Gerwick V. A. Nguyen C. L. Willis D. H. Sherman Gene 2002 296 235 247
63. M. C. Moffitt B. A. Neilan Appl. Environ. Microbiol. 2004 70 6353 6362
64. Y. Chai S. Shan K. J. Weissman S. Hu Y. Zhang R. Muller Chem. Biol. 2012 19 361 371
65. H. Chen S. O'Connor D. E. Cane C. T. Walsh Chem. Biol. 2001 8 899 912
66. I. Muller R. Muller FEBS J. 2006 273 3768 3778
67. S. Reverchon C. Rouanet D. Expert W. Nasser J. Bacteriol. 2002 184 654 665
68. A. O. Brachmann F. Kirchner C. Kegler S. C. Kinski I. Schmitt H. B. Bode J. Biotechnol. 2012 157 96 99
69. W. N. Cude J. Mooney A. A. Tavanaei M. K. Hadden A. M. Frank C. A. Gulvik A. L. May A. Buchan Appl. Environ. Microbiol. 2012 78 4771 4780
70. R. Novakova Z. Odnogova P. Kutas L. Feckova J. Kormanec Folia Microbiol. 2010 55 119 125
71. C. T. Walsh T. A. Wencewicz Nat. Prod. Rep. 2013 30 175 200
72. G. J. Williams Curr. Opin. Struct. Biol. 2013 23 603 612
73. H. L. Condurso S. D. Bruner Curr. Opin. Chem. Biol. 2012 16 162 169
74. C. T. Walsh ChemBioChem 2002 3 125 134
75. H. G. Menzella C. D. Reeves Curr. Opin. Microbiol. 2007 10 238 245
76. K. T. Nguyen D. Ritz J. Q. Gu D. Alexander M. Chu V. Miao P. Brian R. H. Baltz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 17462 17467
77. G. C. Uguru C. Milne M. Borg F. Flett C. P. Smith J. Micklefield J. Am. Chem. Soc. 2004 126 5032 5033
78. K. Eppelmann T. Stachelhaus M. A. Marahiel Biochemistry 2002 41 9718 9726
79. B. S. Evans Y. Chen W. W. Metcalf H. Zhao N. L. Kelleher Chem. Biol. 2011 18 601 607
80. J. Thirlway R. Lewis L. Nunns M. Al Nakeeb M. Styles A. W. Struck C. P. Smith J. Micklefield Angew. Chem., Int. Ed. 2012 51 7181 7184