Systems biology brings new dimensions for structure-based drug design

Journal of the American Chemical Society

Volumn 136, Issue 33, 2014, Pages 11556-11565

  Pei, Jianfeng ^a   Yin, Ning ^a   Ma, Xiaomin ^a   Lai, Luhua ^a,b,c  

^a PEKING UNIVERSITY   (China)

^b PEKING UNIVERSITY   (China)

^c Tsinghua University   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHEMISTRY; SYNTHESIS (CHEMICAL);

DRUG DISCOVERY RESEARCHES; DRUG TARGETS; INTERVENTION ANALYSIS; NEW DIMENSIONS; STRUCTURE-BASED DRUG DESIGN; SYSTEMS BIOLOGY;

DRUG DELIVERY;

ALLOSTERISM; BINDING KINETICS; DRUG BINDING SITE; DRUG DESIGN; DRUG REPOSITIONING; DRUG STRUCTURE; DRUG TARGETING; GENE EXPRESSION PROFILING; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; REVIEW; CHEMICAL STRUCTURE; HUMAN; SYSTEMS BIOLOGY;

DRUG DESIGN; HUMANS; MOLECULAR STRUCTURE; SYSTEMS BIOLOGY;

EID: 84906347107     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja504810z     Document Type: Review

References (154)

1. Kitchen, D. B.; Decornez, H.; Furr, J. R.; Bajorath, J. Nat. Rev. Drug Discovery 2004, 3, 935
2. Andricopulo, A. D.; Salum, L. B.; Abraham, D. J. Curr. Top. Med. Chem. 2009, 9, 771
3. Chen, L.; Morrow, J. K.; Tran, H. T.; Phatak, S. S.; Du-Cuny, L.; Zhang, S. Curr. Pharm. Des. 2012, 18, 1217
4. Maddaford, S. P. Methods Mol. Biol. 2012, 841, 351
5. Zheng, M.; Liu, X.; Xu, Y.; Li, H.; Luo, C.; Jiang, H. Trends Pharmacol. Sci. 2013, 34, 549
6. Kalyaanamoorthy, S.; Chen, Y. P. Drug Discovery Today 2011, 16, 831
7. Tan, J. J.; Cong, X. J.; Hu, L. M.; Wang, C. X.; Jia, L.; Liang, X. J. Drug Discovery Today 2010, 15, 186
8. Traxler, P.; Bold, G.; Buchdunger, E.; Caravatti, G.; Furet, P.; Manley, P.; O'Reilly, T.; Wood, J.; Zimmermann, J. Med. Res. Rev. 2001, 21, 499
9. Jorgensen, W. L. Science 2004, 303, 1813
10. Mullard, A. Nat. Rev. Drug Discovery 2014, 13, 85
11. Mullard, A. Nat. Rev. Drug Discovery 2013, 12, 87
12. Khanna, I. Drug Discovery Today 2012, 17, 1088
13. Kitano, H. Science 2002, 295, 1662
14. Barabasi, A. L.; Oltvai, Z. N. Nat. Rev. Genet. 2004, 5, 101
15. Kitano, H. Nature 2002, 420, 206
16. Berg, E. L. Drug Discovery Today 2014, 19, 113
17. Iskar, M.; Zeller, G.; Zhao, X. M.; van Noort, V.; Bork, P. Curr. Opin. Biotechnol. 2012, 23, 609
18. Butcher, E. C.; Berg, E. L.; Kunkel, E. J. Nat. Biotechnol. 2004, 22, 1253
19. Keith, C. T.; Borisy, A. A.; Stockwell, B. R. Nat. Rev. Drug Discovery 2005, 4, 71
20. Butcher, E. C. Nat. Rev. Drug Discovery 2005, 4, 461
21. Barabasi, A. L.; Gulbahce, N.; Loscalzo, J. Nat. Rev. Genet. 2011, 12, 56
22. Loscalzo, J.; Barabasi, A. L. Wiley Interdiscip. Rev. Syst. Biol. Med. 2011, 3, 619
23. Franceschini, A.; Szklarczyk, D.; Frankild, S.; Kuhn, M.; Simonovic, M.; Roth, A.; Lin, J.; Minguez, P.; Bork, P.; von Mering, C.; Jensen, L. J. Nucleic Acids Res. 2013, 41, D808
24. Kanehisa, M.; Goto, S.; Sato, Y.; Furumichi, M.; Tanabe, M. Nucleic Acids Res. 2012, 40, D109
25. Schaefer, C. F.; Anthony, K.; Krupa, S.; Buchoff, J.; Day, M.; Hannay, T.; Buetow, K. H. Nucleic Acids Res. 2009, 37, D674
26. Szilagyi, A.; Nussinov, R.; Csermely, P. Curr. Top. Med. Chem. 2013, 13, 64
27. Csermely, P.; Nussinov, R.; Szilagyi, A. Curr. Top. Med. Chem. 2013, 13, 2
28. Nussinov, R.; Tsai, C. J.; Csermely, P. Trends Pharmacol. Sci. 2011, 32, 686
29. Yang, K.; Ma, W.; Liang, H.; Ouyang, Q.; Tang, C.; Lai, L. PLoS Comput. Biol. 2007, 3, e55
30. Yang, K.; Bai, H.; Ouyang, Q.; Lai, L.; Tang, C. Mol. Syst. Biol. 2008, 4, 228
31. Yin, N.; Ma, W.; Pei, J.; Ouyang, Q.; Tang, C.; Lai, L. PLoS One 2014, 9, e93960
32. Lehar, J.; Zimmermann, G. R.; Krueger, A. S.; Molnar, R. A.; Ledell, J. T.; Heilbut, A. M.; Short, G. F., III; Giusti, L. C.; Nolan, G. P.; Magid, O. A.; Lee, M. S.; Borisy, A. A.; Stockwell, B. R.; Keith, C. T. Mol. Syst. Biol. 2007, 3, 80
33. Garmaroudi, F. S.; Marchant, D.; Si, X.; Khalili, A.; Bashashati, A.; Wong, B. W.; Tabet, A.; Ng, R. T.; Murphy, K.; Luo, H.; Janes, K. A.; McManus, B. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 17053
34. Tyson, J. J.; Chen, K. C.; Novak, B. Curr. Opin. Cell Biol. 2003, 15, 221
35. Chen, J.; Yue, H.; Ouyang, Q. PLoS Comput. Biol. 2014, 10, e1003451
36. Araujo, R. P.; Liotta, L. A.; Petricoin, E. F. Nat. Rev. Drug Discovery 2007, 6, 871
37. Purvis, J. E.; Lahav, G. Cell 2013, 152, 945
38. Wang, Z.; Sun, Y. Transl. Oncol. 2010, 3, 1
39. Baud, V.; Karin, M. Nat. Rev. Drug Discovery 2009, 8, 33
40. Behar, M.; Barken, D.; Werner, S. L.; Hoffmann, A. Cell 2013, 155, 448
41. Ainsworth, C. Nat. Med. 2011, 17, 1166
42. Peracchi, A.; Mozzarelli, A. Biochim. Biophys. Acta 2011, 1814, 922
43. Tsai, C. J.; Del Sol, A.; Nussinov, R. Mol. BioSyst. 2009, 5, 207
44. Arkin, M. R.; Wells, J. A. Nat. Rev. Drug Discovery 2004, 3, 301
45. Yang, Y.; Xu, Y.; Xia, T.; Chen, F.; Zhang, C.; Liang, W.; Lai, L.; Fang, X. Chem. Commun. 2011, 47, 5440
46. Datta, D.; Scheer, J. M.; Romanowski, M. J.; Wells, J. A. J. Mol. Biol. 2008, 381, 1157
47. Hardy, J. A.; Lam, J.; Nguyen, J. T.; O'Brien, T.; Wells, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 12461
48. Gunasekaran, K.; Ma, B.; Nussinov, R. Proteins 2004, 57, 433
49. Huang, Z.; Mou, L.; Shen, Q.; Lu, S.; Li, C.; Liu, X.; Wang, G.; Li, S.; Geng, L.; Liu, Y.; Wu, J.; Chen, G.; Zhang, J. Nucleic Acids Res. 2014, 42, D510
50. McClendon, C. L.; Friedland, G.; Mobley, D. L.; Amirkhani, H.; Jacobson, M. P. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 2486
51. Demerdash, O. N.; Daily, M. D.; Mitchell, J. C. PLoS Comput. Biol. 2009, 5, e1000531
52. Yuan, Y.; Pei, J.; Lai, L. Curr. Pharm. Des. 2013, 19, 2326
53. Miao, Y.; Nichols, S. E.; McCammon, J. A. Chem. Biol. Drug Des. 2014, 83, 237
54. Ngan, C. H.; Bohnuud, T.; Mottarella, S. E.; Beglov, D.; Villar, E. A.; Hall, D. R.; Kozakov, D.; Vajda, S. Nucleic Acids Res. 2012, 40, W271
55. Qi, Y. F.; Wang, Q.; Tang, B.; Lai, L. H. J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 2962
56. Swain, J. F.; Gierasch, L. M. Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 102
57. Wang, Q.; Qi, Y.; Yin, N.; Lai, L. PLoS One 2014, 9, e94829
58. Panjkovich, A.; Daura, X. BMC Bioinformatics 2012, 13, 273
59. Huang, B.; Schroeder, M. BMC Struct. Biol. 2006, 6, 19
60. Panjkovich, A.; Daura, X. Bioinformatics 2014, 30, 1314
61. Huang, W.; Lu, S.; Huang, Z.; Liu, X.; Mou, L.; Luo, Y.; Zhao, Y.; Liu, Y.; Chen, Z.; Hou, T.; Zhang, J. Bioinformatics 2013, 29, 2357
62. Le Guilloux, V.; Schmidtke, P.; Tuffery, P. BMC Bioinformatics 2009, 10, 168
63. Liu, J.; Perumal, N. B.; Oldfield, C. J.; Su, E. W.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Biochemistry 2006, 45, 6873
64. Uversky, V. N.; Oldfield, C. J.; Dunker, A. K. Annu. Rev. Biophys. 2008, 37, 215
65. Cumberworth, A.; Lamour, G.; Babu, M. M.; Gsponer, J. Biochem. J. 2013, 454, 361
66. Liu, Z.; Huang, Y. Protein Sci. 2014, 23, 539
67. Ekman, D.; Light, S.; Bjorklund, A. K.; Elofsson, A. Genome Biol. 2006, 7, R45
68. Motlagh, H. N.; Wrabl, J. O.; Li, J.; Hilser, V. J. Nature 2014, 508, 331
69. Hammoudeh, D. I.; Follis, A. V.; Prochownik, E. V.; Metallo, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 7390
70. Yin, X.; Giap, C.; Lazo, J. S.; Prochownik, E. V. Oncogene 2003, 22, 6151
71. Jin, F.; Yu, C.; Lai, L.; Liu, Z. PLoS Comput. Biol. 2013, 9, e1003249
72. Gashaw, I.; Ellinghaus, P.; Sommer, A.; Asadullah, K. Drug Discovery Today 2011, 16, 1037
73. Thomas, J. R.; Hergenrother, P. J. Chem. Rev. 2008, 108, 1171
74. Damsma, G. E.; Alt, A.; Brueckner, F.; Carell, T.; Cramer, P. Nat. Struct. Mol. Biol. 2007, 14, 1127
75. Wang, X. D.; Ou, T. M.; Lu, Y. J.; Li, Z.; Xu, Z.; Xi, C.; Tan, J. H.; Huang, S. L.; An, L. K.; Li, D.; Gu, L. Q.; Huang, Z. S. J. Med. Chem. 2010, 53, 4390
76. Balasubramanian, S.; Hurley, L. H.; Neidle, S. Nat. Rev. Drug Discovery 2011, 10, 261
77. Shaw, K. T.; Utsuki, T.; Rogers, J.; Yu, Q. S.; Sambamurti, K.; Brossi, A.; Ge, Y. W.; Lahiri, D. K.; Greig, N. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 7605
78. Michael, T. H.; Reyes-Irisarri, E.; Hüll, M.; Kummer, M. P. Curr. Neuropharm. 2011, 9, 643
79. Ramya Kapadia, J. H.; R, V. Front. Biosci. 2009, 1813
80. Sharma, S.; Kelly, T. K.; Jones, P. A. Carcinogenesis 2010, 31, 27
81. Saito, Y.; Liang, G.; Egger, G.; Friedman, J. M.; Chuang, J. C.; Coetzee, G. A.; Jones, P. A. Cancer Cell 2006, 9, 435
82. Nicoll, A. J.; Trevitt, C. R.; Tattum, M. H.; Risse, E.; Quarterman, E.; Ibarra, A. A.; Wright, C.; Jackson, G. S.; Sessions, R. B.; Farrow, M.; Walthod, J. P.; Clarke, A. R.; Collingea, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 17610
83. Van Goor, F.; Hadida, S.; Grootenhuis, P. D.; Burton, B.; Stack, J. H.; Straley, K. S.; Decker, C. J.; Miller, M.; McCartney, J.; Olson, E. R.; Wine, J. J.; Frizzell, R. A.; Ashlock, M.; Negulescu, P. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 18843
84. Schmit, T. L.; Ledesma, M. C.; Ahmad, N. Pharm. Res. 2010, 27, 989
85. Copeland, R. A.; Pompliano, D. L.; Meek, T. D. Nat. Rev. Drug Discovery 2006, 5, 730
86. Lu, H.; Tonge, P. J. Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 467
87. Ohlson, S. Drug Discovery Today 2008, 13, 433
88. Swinney, D. C.; Anthony, J. Nat. Rev. Drug Discovery 2011, 10, 507
89. Vauquelin, G.; Charlton, S. J. Br. J. Pharmacol. 2010, 161, 488
90. Wei, D.; Zheng, H.; Su, N.; Deng, M.; Lai, L. J. Chem. Inf. Model. 2010, 50, 1855
91. Copeland, R. A. Future Med. Chem. 2011, 3, 1491
92. Bairy, S.; Wong, C. F. Proteins 2011, 79, 2491
93. Yin, N.; Pei, J.; Lai, L. Mol. BioSyst. 2013, 9, 1381
94. Bai, F.; Xu, Y.; Chen, J.; Liu, Q.; Gu, J.; Wang, X.; Ma, J.; Li, H.; Onuchic, J. N.; Jiang, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 4273
95. Carroll, M. J.; Mauldin, R. V.; Gromova, A. V.; Singleton, S. F.; Collins, E. J.; Lee, A. L. Nat. Chem. Biol. 2012, 8, 246
96. Schmidtke, P.; Luque, F. J.; Murray, J. B.; Barril, X. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 18903
97. Schneider, E. V.; Bottcher, J.; Huber, R.; Maskos, K.; Neumann, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 8081
98. Bai, H.; Yang, K.; Yu, D.; Zhang, C.; Chen, F.; Lai, L. Proteins 2011, 79, 720
99. Kutchukian, P. S.; Shakhnovich, E. I. Expert Opin. Drug Discovery 2010, 5, 789
100. Yuan, Y.; Pei, J.; Lai, L. J. Chem. Inf. Model. 2011, 51, 1083
101. Wang, R.; Gao, Y.; Lai, L. J. Mol. Model. 2000, 6, 498
102. Luo, Z.; Wang, R.; Lai, L. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1996, 36, 1187
103. Ni, S.; Yuan, Y.; Huang, J.; Mao, X.; Lv, M.; Zhu, J.; Shen, X.; Pei, J.; Lai, L.; Jiang, H.; Li, J. J. Med. Chem. 2009, 52, 5295
104. Goldberg, D. R.; Hao, M. H.; Qian, K. C.; Swinamer, A. D.; Gao, D. A.; Xiong, Z.; Sarko, C.; Berry, A.; Lord, J.; Magolda, R. L.; Fadra, T.; Kroe, R. R.; Kukulka, A.; Madwed, J. B.; Martin, L.; Pargellis, C.; Skow, D.; Song, J. J.; Tan, Z.; Torcellini, C. A.; Zimmitti, C. S.; Yee, N. K.; Moss, N. J. Med. Chem. 2007, 50, 4016
105. Cogan, D. A.; Aungst, R.; Breinlinger, E. C.; Fadra, T.; Goldberg, D. R.; Hao, M. H.; Kroe, R.; Moss, N.; Pargellis, C.; Qian, K. C.; Swinamer, A. D. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2008, 18, 3251
106. Kandil, S.; Biondaro, S.; Vlachakis, D.; Cummins, A. C.; Coluccia, A.; Berry, C.; Leyssen, P.; Neyts, J.; Brancale, A. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 2935
107. Park, H.; Bahn, Y. J.; Ryu, S. E. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 4330
108. Bhayye, S. S.; Roy, K.; Saha, A. Med. Chem. Res. 2014, 1
109. Congreve, M.; Chessari, G.; Tisi, D.; Woodhead, A. J. J. Med. Chem. 2008, 51, 3661
110. Chessari, G.; Woodhead, A. J. Drug Discovery Today 2009, 14, 668
111. Sheng, C.; Zhang, W. Med. Res. Rev. 2013, 33, 554
112. Hoffer, L.; Renaud, J. P.; Horvath, D. Comb. Chem. High Throughput Screen. 2011, 14, 500
113. Brown, D.; Superti-Furga, G. Drug Discovery Today 2003, 8, 1067
114. Kamb, A.; Wee, S.; Lengauer, C. Nat. Rev. Drug Discovery 2007, 6, 115
115. Cavalli, A.; Bolognesi, M. L.; Minarini, A.; Rosini, M.; Tumiatti, V.; Recanatini, M.; Melchiorre, C. J. Med. Chem. 2008, 51, 347
116. Feala, J. D.; Cortes, J.; Duxbury, P. M.; Piermarocchi, C.; McCulloch, A. D.; Paternostro, G. Wiley Interdiscip. Rev. Syst. Biol. Med. 2010, 2, 181
117. Fitzgerald, J. B.; Schoeberl, B.; Nielsen, U. B.; Sorger, P. K. Nat. Chem. Biol. 2006, 2, 458
118. Perelson, A. S.; Essunger, P.; Cao, Y.; Vesanen, M.; Hurley, A.; Saksela, K.; Markowitz, M.; Ho, D. D. Nature 1997, 387, 188
119. Gu, S.; Yin, N.; Pei, J.; Lai, L. Mol. BioSyst. 2013, 9, 1931
120. Gu, S.; Yin, N.; Pei, J.; Lai, L. Mol. BioSyst. 2013, 9, 2696
121. Liang, X.; Li, H.; Li, S. Mol. BioSyst. 2014, 10, 1014
122. Morphy, R.; Rankovic, Z. J. Med. Chem. 2005, 48, 6523
123. Morphy, R.; Kay, C.; Rankovic, Z. Drug Discovery Today 2004, 9, 641
124. Knox, A. J.; Price, T.; Pawlak, M.; Golfis, G.; Flood, C. T.; Fayne, D.; Williams, D. C.; Meegan, M. J.; Lloyd, D. G. J. Med. Chem. 2009, 52, 2177
125. Wu, Y.; He, C.; Gao, Y.; He, S.; Liu, Y.; Lai, L. J. Med. Chem. 2012, 55, 2597
126. Chen, Z.; Wu, Y.; Liu, Y.; Yang, S.; Chen, Y.; Lai, L. J. Med. Chem. 2011, 54, 3650
127. Wei, D.; Jiang, X.; Zhou, L.; Chen, J.; Chen, Z.; He, C.; Yang, K.; Liu, Y.; Pei, J.; Lai, L. J. Med. Chem. 2008, 51, 7882
128. Shang, E.; Yuan, Y.; Chen, X.; Liu, Y.; Pei, J.; Lai, L. J. Chem. Inf. Model. 2014, 54, 1235
129. Besnard, J.; Ruda, G. F.; Setola, V.; Abecassis, K.; Rodriguiz, R. M.; Huang, X. P.; Norval, S.; Sassano, M. F.; Shin, A. I.; Webster, L. A.; Simeons, F. R.; Stojanovski, L.; Prat, A.; Seidah, N. G.; Constam, D. B.; Bickerton, G. R.; Read, K. D.; Wetsel, W. C.; Gilbert, I. H.; Roth, B. L.; Hopkins, A. L. Nature 2012, 492, 215
130. Lounkine, E.; Keiser, M. J.; Whitebread, S.; Mikhailov, D.; Hamon, J.; Jenkins, J. L.; Lavan, P.; Weber, E.; Doak, A. K.; Cote, S.; Shoichet, B. K.; Urban, L. Nature 2012, 486, 361
131. Ma'ayan, A.; Jenkins, S. L.; Goldfarb, J.; Iyengar, R. Mt. Sinai J. Med. 2007, 74, 27
132. Li, Y. Y.; Jones, S. J. Genome Med. 2012, 4, 27
133. Lussier, Y. A.; Chen, J. L. Sci. Transl. Med. 2011, 3, 96ps35
134. Ashburn, T. T.; Thor, K. B. Nat. Rev. Drug Discovery 2004, 3, 673
135. Sirota, M.; Dudley, J. T.; Kim, J.; Chiang, A. P.; Morgan, A. A.; Sweet-Cordero, A.; Sage, J.; Butte, A. J. Sci. Transl. Med. 2011, 3, 96ra77
136. Chong, C. R.; Sullivan, D. J., Jr. Nature 2007, 448, 645
137. Ivanov, A. A.; Khuri, F. R.; Fu, H. Trends Pharmacol. Sci. 2013, 34, 393
138. Sperandio, O.; Reynes, C. H.; Camproux, A. C.; Villoutreix, B. O. Drug Discovery Today 2010, 15, 220
139. London, N.; Raveh, B.; Schueler-Furman, O. Curr. Opin. Chem. Biol. 2013, 17, 952
140. Morelli, X.; Bourgeas, R.; Roche, P. Curr. Opin. Chem. Biol. 2011, 15, 475
141. Kallen, J.; Welzenbach, K.; Ramage, P.; Geyl, D.; Kriwacki, R.; Legge, G.; Cottens, S.; Weitz-Schmidt, G.; Hommel, U. J. Mol. Biol. 1999, 292, 1
142. McMillan, K.; Adler, M.; Auld, D. S.; Baldwin, J. J.; Blasko, E.; Browne, L. J.; Chelsky, D.; Davey, D.; Dolle, R. E.; Eagen, K. A.; Erickson, S.; Feldman, R. I.; Glaser, C. B.; Mallari, C.; Morrissey, M. M.; Ohlmeyer, M. H.; Pan, G.; Parkinson, J. F.; Phillips, G. B.; Polokoff, M. A.; Sigal, N. H.; Vergona, R.; Whitlow, M.; Young, T. A.; Devlin, J. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 1506
143. Niederhauser, O.; Mangold, M.; Schubenel, R.; Kusznir, E. A.; Schmidt, D.; Hertel, C. J. Neurosci. Res. 2000, 61, 263
144. Fuller, J. C.; Burgoyne, N. J.; Jackson, R. M. Drug Discovery Today 2009, 14, 155
145. Dai, Z.; Lai, L. Mol. BioSyst. 2014, 10, 1385
146. He, C.; Wu, Y.; Lai, Y.; Cai, Z.; Liu, Y.; Lai, L. Mol. BioSyst. 2012, 8, 1585
147. Zhang, C.; Shen, Q.; Tang, B.; Lai, L. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 11059
148. Zhang, C.; Lai, L. Proteins 2012, 80, 1078
149. Zhang, C.; Lai, L. Biochem. Soc. Trans. 2011, 39, 1382
150. Zhang, C.; Lai, L. J. Comput. Chem. 2011, 32, 2598
151. Bi, S.; Yu, D.; Si, G.; Luo, C.; Li, T.; Ouyang, Q.; Jakovljevic, V.; Sourjik, V.; Tu, Y.; Lai, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 16814
152. Ouyang, Q.; Lai, L.; Tang, C. ACS Synth. Biol. 2012, 1, 254
153. Bayer, T. S.; Smolke, C. D. Nat. Biotechnol. 2005, 23, 337
154. Peisajovich, S. G.; Garbarino, J. E.; Wei, P.; Lim, W. A. Science 2010, 328, 368