-
3
-
-
79952743209
-
-
An, C. L.; Chen, D. S.; Makridakis, N. M. Hum. Mutat. 2011, 32, 415
-
(2011)
Hum. Mutat.
, vol.32
, pp. 415
-
-
An, C.L.1
Chen, D.S.2
Makridakis, N.M.3
-
4
-
-
39149130715
-
-
Dalal, S.; Chikova, A.; Jaeger, J.; Sweasy, J. B. Nucleic Acids Res. 2008, 36, 411
-
(2008)
Nucleic Acids Res.
, vol.36
, pp. 411
-
-
Dalal, S.1
Chikova, A.2
Jaeger, J.3
Sweasy, J.B.4
-
5
-
-
34547195827
-
-
Lang, T. M.; Dalal, S.; Chikova, A.; DiMaio, D.; Sweasy, J. B. Mol. Cell. Biol. 2007, 27, 5587
-
(2007)
Mol. Cell. Biol.
, vol.27
, pp. 5587
-
-
Lang, T.M.1
Dalal, S.2
Chikova, A.3
Dimaio, D.4
Sweasy, J.B.5
-
6
-
-
13944279514
-
-
Starcevic, D.; Dalal, S.; Sweasy, J. B. Cell Cycle 2004, 3, 998
-
(2004)
Cell Cycle
, vol.3
, pp. 998
-
-
Starcevic, D.1
Dalal, S.2
Sweasy, J.B.3
-
7
-
-
0032748078
-
-
Iwanaga, A.; Ouchida, M.; Miyazaki, K.; Hori, K.; Mukai, T. Mutat. Res., DNA Repair 1999, 435, 121
-
(1999)
Mutat. Res., DNA Repair
, vol.435
, pp. 121
-
-
Iwanaga, A.1
Ouchida, M.2
Miyazaki, K.3
Hori, K.4
Mukai, T.5
-
8
-
-
84855827214
-
-
Nicolay, N. H.; Helleday, T.; Sharma, R. A. Curr. Mol. Pharmacol. 2012, 5, 54
-
(2012)
Curr. Mol. Pharmacol.
, vol.5
, pp. 54
-
-
Nicolay, N.H.1
Helleday, T.2
Sharma, R.A.3
-
10
-
-
0028857681
-
-
Seeberg, E.; Eide, L.; Bjoras, M. Trends Biochem. Sci. 1995, 20, 391
-
(1995)
Trends Biochem. Sci.
, vol.20
, pp. 391
-
-
Seeberg, E.1
Eide, L.2
Bjoras, M.3
-
13
-
-
58949084649
-
-
Maynard, S.; Schurman, S. H.; Harboe, C.; de Souza-Pinto, N. C.; Bohr, V. A. Carcinogenesis 2009, 30, 2
-
(2009)
Carcinogenesis
, vol.30
, pp. 2
-
-
Maynard, S.1
Schurman, S.H.2
Harboe, C.3
De Souza-Pinto, N.C.4
Bohr, V.A.5
-
16
-
-
0030930760
-
-
Sawaya, M. R.; Prasad, R.; Wilson, S. H.; Kraut, J.; Pelletier, H. Biochemistry 1997, 36, 11205
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 11205
-
-
Sawaya, M.R.1
Prasad, R.2
Wilson, S.H.3
Kraut, J.4
Pelletier, H.5
-
17
-
-
0028136070
-
-
Sawaya, M. R.; Pelletier, H.; Kumar, A.; Wilson, S. H.; Kraut, J. Science 1994, 264, 1930
-
(1994)
Science
, vol.264
, pp. 1930
-
-
Sawaya, M.R.1
Pelletier, H.2
Kumar, A.3
Wilson, S.H.4
Kraut, J.5
-
18
-
-
0028049441
-
-
Pelletier, H.; Sawaya, M. R.; Kumar, A.; Wilson, S. H.; Kraut, J. Science 1994, 264, 1891
-
(1994)
Science
, vol.264
, pp. 1891
-
-
Pelletier, H.1
Sawaya, M.R.2
Kumar, A.3
Wilson, S.H.4
Kraut, J.5
-
19
-
-
0030010766
-
-
Werneburg, B. G.; Ahn, J.; Zhong, X.; Hondal, R. J.; Kraynov, V. S.; Tsai, M. D. Biochemistry 1996, 35, 7041
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 7041
-
-
Werneburg, B.G.1
Ahn, J.2
Zhong, X.3
Hondal, R.J.4
Kraynov, V.S.5
Tsai, M.D.6
-
20
-
-
0035793560
-
-
Vande Berg, B. J.; Beard, W. A.; Wilson, S. H. J. Biol. Chem. 2001, 276, 3408
-
(2001)
J. Biol. Chem.
, vol.276
, pp. 3408
-
-
Vande Berg, B.J.1
Beard, W.A.2
Wilson, S.H.3
-
23
-
-
0030897244
-
-
Kraynov, V. S.; Werneburg, B. G.; Zhong, X.; Lee, H.; Ahn, J.; Tsai, M. D. Biochem. J. 1997, 323, 103
-
(1997)
Biochem. J.
, vol.323
, pp. 103
-
-
Kraynov, V.S.1
Werneburg, B.G.2
Zhong, X.3
Lee, H.4
Ahn, J.5
Tsai, M.D.6
-
24
-
-
0036295231
-
-
Yang, L.; Beard, W. A.; Wilson, S. H.; Broyde, S.; Schlick, T. J. Mol. Biol. 2002, 317, 651
-
(2002)
J. Mol. Biol.
, vol.317
, pp. 651
-
-
Yang, L.1
Beard, W.A.2
Wilson, S.H.3
Broyde, S.4
Schlick, T.5
-
26
-
-
17544370107
-
-
Beard, W. A.; Osheroff, W. P.; Prasad, R.; Sawaya, M. R.; Jaju, M.; Wood, T. G.; Kraut, J.; Kunkel, T. A.; Wilson, S. H. J. Biol. Chem. 1996, 271, 12141
-
(1996)
J. Biol. Chem.
, vol.271
, pp. 12141
-
-
Beard, W.A.1
Osheroff, W.P.2
Prasad, R.3
Sawaya, M.R.4
Jaju, M.5
Wood, T.G.6
Kraut, J.7
Kunkel, T.A.8
Wilson, S.H.9
-
27
-
-
2942666430
-
-
Yang, L. J.; Beard, W. A.; Wilson, S. H.; Broyde, S.; Schlick, T. Biophys. J. 2004, 86, 3392
-
(2004)
Biophys. J.
, vol.86
, pp. 3392
-
-
Yang, L.J.1
Beard, W.A.2
Wilson, S.H.3
Broyde, S.4
Schlick, T.5
-
28
-
-
3142702966
-
-
Yang, L.; Arora, K.; Beard, W. A.; Wilson, S. H.; Schlick, T. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 8441
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.126
, pp. 8441
-
-
Yang, L.1
Arora, K.2
Beard, W.A.3
Wilson, S.H.4
Schlick, T.5
-
31
-
-
44449088925
-
-
Lin, P.; Batra, V. K.; Pedersen, L. C.; Beard, W. A.; Wilson, S. H.; Pedersen, L. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 5670
-
(2008)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.105
, pp. 5670
-
-
Lin, P.1
Batra, V.K.2
Pedersen, L.C.3
Beard, W.A.4
Wilson, S.H.5
Pedersen, L.G.6
-
32
-
-
79956058665
-
-
Schlick, T.; Collepardo-Guevara, R.; Halvorsen, L. A.; Jung, S.; Xiao, X. Q. Rev. Biophys. 2011, 44, 191
-
(2011)
Q. Rev. Biophys.
, vol.44
, pp. 191
-
-
Schlick, T.1
Collepardo-Guevara, R.2
Halvorsen, L.A.3
Jung, S.4
Xiao, X.5
-
34
-
-
76249127905
-
-
Santoso, Y.; Joyce, C. M.; Potapova, O.; Le Reste, L.; Hohlbein, J.; Torella, J. P.; Grindley, N. D. F.; Kapanidis, A. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 715
-
(2010)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.107
, pp. 715
-
-
Santoso, Y.1
Joyce, C.M.2
Potapova, O.3
Le Reste, L.4
Hohlbein, J.5
Torella, J.P.6
Grindley, N.D.F.7
Kapanidis, A.N.8
-
38
-
-
77957750629
-
-
Nashine, V. C.; Hammes-Schiffer, S.; Benkovic, S. J. Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 644
-
(2010)
Curr. Opin. Chem. Biol.
, vol.14
, pp. 644
-
-
Nashine, V.C.1
Hammes-Schiffer, S.2
Benkovic, S.J.3
-
40
-
-
80052585808
-
-
Prasad, B. R.; Warshel, A. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2011, 79, 2900
-
(2011)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.79
, pp. 2900
-
-
Prasad, B.R.1
Warshel, A.2
-
41
-
-
77951226274
-
-
Kamerlin, S. C. L.; Warshel, A. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2010, 78, 1339
-
(2010)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.78
, pp. 1339
-
-
Kamerlin, S.C.L.1
Warshel, A.2
-
43
-
-
0041784950
-
-
MacKerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586
-
-
MacKerell, A.D.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack, R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-Mccarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher, W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stote, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
45
-
-
3142714765
-
-
Mackerell, A. D., Jr.; Feig, M.; Brooks, C. L., III. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1400
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1400
-
-
Mackerell Jr., A.D.1
Feig, M.2
Brooks Iii, C.L.3
-
46
-
-
0000801009
-
-
Dellago, C.; Bolhuis, P. G.; Chandler, D. J. Chem. Phys. 1998, 108, 9236
-
(1998)
J. Chem. Phys.
, vol.108
, pp. 9236
-
-
Dellago, C.1
Bolhuis, P.G.2
Chandler, D.3
-
47
-
-
2742515916
-
-
Bolhuis, P. G.; Dellago, C.; Chandler, D. Faraday Discuss. 1998, 110, 421
-
(1998)
Faraday Discuss.
, vol.110
, pp. 421
-
-
Bolhuis, P.G.1
Dellago, C.2
Chandler, D.3
-
48
-
-
0034705109
-
-
Bolhuis, P. G.; Dellago, C.; Chandler, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 5877
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.97
, pp. 5877
-
-
Bolhuis, P.G.1
Dellago, C.2
Chandler, D.3
-
50
-
-
0344270866
-
-
Hagan, M. F.; Dinner, A. R.; Chandler, D.; Chakraborty, A. K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 13922
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.100
, pp. 13922
-
-
Hagan, M.F.1
Dinner, A.R.2
Chandler, D.3
Chakraborty, A.K.4
-
59
-
-
55949096608
-
-
Saen-oon, S.; Quaytman-Machleder, S.; Schramm, V. L.; Schwartz, S. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 16543
-
(2008)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.105
, pp. 16543
-
-
Saen-Oon, S.1
Quaytman-Machleder, S.2
Schramm, V.L.3
Schwartz, S.D.4
-
60
-
-
0035815755
-
-
Shah, A. M.; Li, S. X.; Anderson, K. S.; Sweasy, J. B. J. Biol. Chem. 2001, 276, 10824
-
(2001)
J. Biol. Chem.
, vol.276
, pp. 10824
-
-
Shah, A.M.1
Li, S.X.2
Anderson, K.S.3
Sweasy, J.B.4
-
63
-
-
0026085471
-
-
Derbyshire, V.; Grindley, N. D. F.; Joyce, C. M. EMBO J. 1991, 10, 17
-
(1991)
EMBO J.
, vol.10
, pp. 17
-
-
Derbyshire, V.1
Grindley, N.D.F.2
Joyce, C.M.3
-
65
-
-
76449098262
-
-
Adams, P. D.; Afonine, P. V.; Bunkoczi, G.; Chen, V. B.; Davis, I. W.; Echols, N.; Headd, J. J.; Hung, L.-W.; Kapral, G. J.; Grosse-Kunstleve, R. W.; McCoy, A. J.; Moriarty, N. W.; Oeffner, R.; Read, R. J.; Richardson, D. C.; Richardson, J. S.; Terwilliger, T. C.; Zwart, P. H. Acta Crystallogr. 2010, D66, 213
-
(2010)
Acta Crystallogr.
, vol.66
, pp. 213
-
-
Adams, P.D.1
Afonine, P.V.2
Bunkoczi, G.3
Chen, V.B.4
Davis, I.W.5
Echols, N.6
Headd, J.J.7
Hung, L.-W.8
Kapral, G.J.9
Grosse-Kunstleve, R.W.10
McCoy, A.J.11
Moriarty, N.W.12
Oeffner, R.13
Read, R.J.14
Richardson, D.C.15
Richardson, J.S.16
Terwilliger, T.C.17
Zwart, P.H.18
-
66
-
-
77949535720
-
-
Emsley, P.; Lohkamp, B.; Scott, W. G.; Cowtan, K. Acta Crystallogr. 2010, D66, 486
-
(2010)
Acta Crystallogr.
, vol.66
, pp. 486
-
-
Emsley, P.1
Lohkamp, B.2
Scott, W.G.3
Cowtan, K.4
-
67
-
-
34547592557
-
-
Davis, I. W.; Leaver-Fay, A.; Chen, V. B.; Block, J. N.; Kapral, G. J.; Wang, X.; Murray, L. W.; Arendall, W. B., III; Snoeyink, J.; Richardson, J. S.; Richardson, D. C. Nucleic Acids Res. 2007, 35, W375
-
(2007)
Nucleic Acids Res.
, vol.35
, pp. 375
-
-
Davis, I.W.1
Leaver-Fay, A.2
Chen, V.B.3
Block, J.N.4
Kapral, G.J.5
Wang, X.6
Murray, L.W.7
Arendall Iii, W.B.8
Snoeyink, J.9
Richardson, J.S.10
Richardson, D.C.11
-
69
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187
-
(1983)
J. Comput. Chem.
, vol.4
, pp. 187
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
70
-
-
0029878720
-
-
Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics Modell. 1996, 14, 33
-
(1996)
J. Mol. Graphics Modell.
, vol.14
, pp. 33
-
-
Humphrey, W.1
Dalke, A.2
Schulten, K.3
-
71
-
-
27344436659
-
-
Phillips, J. C.; Braun, R.; Wang, W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid, E.; Villa, E.; Chipot, C.; Skeel, R. D.; Kale, L.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781
-
(2005)
J. Comput. Chem.
, vol.26
, pp. 1781
-
-
Phillips, J.C.1
Braun, R.2
Wang, W.3
Gumbart, J.4
Tajkhorshid, E.5
Villa, E.6
Chipot, C.7
Skeel, R.D.8
Kale, L.9
Schulten, K.10
-
72
-
-
36449007836
-
-
Feller, S. E.; Zhang, Y. H.; Pastor, R. W.; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 1995, 103, 4613
-
(1995)
J. Chem. Phys.
, vol.103
, pp. 4613
-
-
Feller, S.E.1
Zhang, Y.H.2
Pastor, R.W.3
Brooks, B.R.4
-
73
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089
-
(1993)
J. Chem. Phys.
, vol.98
, pp. 10089
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
75
-
-
0036424048
-
-
Bolhuis, P. G.; Chandler, D.; Dellago, C.; Geissler, P. L. Annu. Rev. Phys. Chem. 2002, 53, 291
-
(2002)
Annu. Rev. Phys. Chem.
, vol.53
, pp. 291
-
-
Bolhuis, P.G.1
Chandler, D.2
Dellago, C.3
Geissler, P.L.4
-
77
-
-
84860208934
-
-
Kirby, T. W.; Derose, E. F.; Cavanaugh, N. A.; Beard, W. A.; Shock, D. D.; Mueller, G. A.; Wilson, S. H.; London, R. E. Nucleic Acids Res. 2012, 40, 2974
-
(2012)
Nucleic Acids Res.
, vol.40
, pp. 2974
-
-
Kirby, T.W.1
Derose, E.F.2
Cavanaugh, N.A.3
Beard, W.A.4
Shock, D.D.5
Mueller, G.A.6
Wilson, S.H.7
London, R.E.8
-
78
-
-
0034719142
-
-
Kraynov, V. S.; Showalter, A. K.; Liu, J.; Zhong, X. J.; Tsai, M. D. Biochemistry 2000, 39, 16008
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 16008
-
-
Kraynov, V.S.1
Showalter, A.K.2
Liu, J.3
Zhong, X.J.4
Tsai, M.D.5
-
79
-
-
26444470895
-
-
Arora, K.; Beard, W. A.; Wilson, S. H.; Schlick, T. Biochemistry 2005, 44, 13328
-
(2005)
Biochemistry
, vol.44
, pp. 13328
-
-
Arora, K.1
Beard, W.A.2
Wilson, S.H.3
Schlick, T.4
-
80
-
-
0031053276
-
-
Ahn, J.; Werneburg, B. G.; Tsai, M. D. Biochemistry 1997, 36, 1100
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 1100
-
-
Ahn, J.1
Werneburg, B.G.2
Tsai, M.D.3
-
81
-
-
0032055511
-
-
Ahn, J. W.; Kraynov, V. S.; Zhong, X. J.; Werneburg, B. G.; Tsai, M. D. Biochem. J. 1998, 331, 79
-
(1998)
Biochem. J.
, vol.331
, pp. 79
-
-
Ahn, J.W.1
Kraynov, V.S.2
Zhong, X.J.3
Werneburg, B.G.4
Tsai, M.D.5
-
82
-
-
79955016714
-
-
Murphy, D. L.; Jaeger, J.; Sweasy, J. B. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 6279
-
(2011)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.133
, pp. 6279
-
-
Murphy, D.L.1
Jaeger, J.2
Sweasy, J.B.3
-
83
-
-
77949519759
-
-
Yamtich, J.; Starcevic, D.; Lauper, J.; Smith, E.; Shi, I.; Rangarajan, S.; Jaeger, J.; Sweasy, J. B. Biochemistry 2010, 49, 2326
-
(2010)
Biochemistry
, vol.49
, pp. 2326
-
-
Yamtich, J.1
Starcevic, D.2
Lauper, J.3
Smith, E.4
Shi, I.5
Rangarajan, S.6
Jaeger, J.7
Sweasy, J.B.8
-
84
-
-
48649103574
-
-
Murphy, D. L.; Kosa, J.; Jaeger, J.; Sweasy, J. B. Biochemistry 2008, 47, 8048
-
(2008)
Biochemistry
, vol.47
, pp. 8048
-
-
Murphy, D.L.1
Kosa, J.2
Jaeger, J.3
Sweasy, J.B.4
-
85
-
-
28544444617
-
-
Dalal, S.; Hile, S.; Eckert, K. A.; Sun, K. W.; Starcevic, D.; Sweasy, J. B. Biochemistry 2005, 44, 15664
-
(2005)
Biochemistry
, vol.44
, pp. 15664
-
-
Dalal, S.1
Hile, S.2
Eckert, K.A.3
Sun, K.W.4
Starcevic, D.5
Sweasy, J.B.6
-
86
-
-
0347052870
-
-
Dalal, S.; Kosa, J. L.; Sweasy, J. B. J. Biol. Chem. 2004, 279, 577
-
(2004)
J. Biol. Chem.
, vol.279
, pp. 577
-
-
Dalal, S.1
Kosa, J.L.2
Sweasy, J.B.3
-
90
-
-
42449128363
-
-
Venkatramani, R.; Radhakrishnan, R. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2008, 71, 1360
-
(2008)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.71
, pp. 1360
-
-
Venkatramani, R.1
Radhakrishnan, R.2
|