Prokaryotic nucleotide excision repair: The UvrABC system

Chemical Reviews

Volumn 106, Issue 2, 2006, Pages 233-252

  Truglio, James J ^a   Croteau, Deborah L ^b   van Houten, Bennett ^b   Kisker, Caroline ^a,c  

^a STONY BROOK UNIVERSITY   (United States)

^b NATIONAL INSTITUTE OF ENVIRONMENTAL HEALTH SCIENCES   (United States)

^c UNIVERSITY OF WÜRZBURG   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING ENERGY; CRYSTAL STRUCTURE; DNA SEQUENCES; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR STRUCTURE; OLIGOMERS; PROTEINS;

DAMAGE RECOGNITION; NUCLEOTIDE EXCISION REPAIR (NER); OLIGOMERIC STATE; PROKARYOTIC NUCLEOTIDE EXCISION;

DNA;

EID: 33644619706     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr040471u     Document Type: Review

References (230)

1. Hoeijmakers, J. H. Nature 2001, 411, 366.
2. Lindahl, T.; Wood, R. D. Science 1999, 286, 1897.
3. Boyce, R. P.; Howard-Flanders, P. Proc. Natl. Acad Sci. U. S. A. 1964, 51, 293.
4. Setlow, R. B.; Carrier, W. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1964, 51, 226.
5. Hanawalt, P. C.; Haynes, R. H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1965, 19, 462.
6. Howard-Flanders, P.; Boyce, R. P.; Theriot, L. Genetics 1966, 53, 1119.
7. Janion, C. Acta Biochim. Pol. 2001, 48, 599.
8. Van Houten, B. Microbiol. Rev. 1990, 54, 18.
9. Sancar, A.; Rupp, W. D. Cell 1983, 33, 249.
10. Mazur, S.; Grossman, L. Biochemistry 1991, 30, 4432.
11. Orren, D. K.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad Sci. U. S. A. 1989, 86, 5237.
12. Verhoeven, E. E.; Wyman, C.; Moolenaar, G. F.; Goosen, N. EMBO J. 2002, 21, 4196.
13. Machius, M.; Henry, L.; Palnitkar, M.; Deisenhofer, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999, 96, 11717.
14. Nakagawa, N.; Sugahara, M.; Masui, R.; Kato, R.; Fukuyama, K.; Kuramitsu, S. J. Biochem. (Tokyo) 1999, 126, 986.
15. Theis, K.; Chen, P. J.; Skorvaga, M.; Van Houten, B.; Kisker, C. EMBO J. 1999, 18, 6899.
16. Hildebrand, E. L.; Grossman, L. J. Biol. Chem. 1999, 274, 27885.
17. Van Houten, B.; Snowden, A. Bioessays 1993, 15, 51.
18. DellaVecchia, M. J.; Croteau, D. L.; Skorvaga, M.; Dezhurov, S. V.; Lavrik, O. I.; Van Houten, B. J. Biol. Chem. 2004, 279, 45245.
19. Orren, D. K.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1990, 265, 15796.
20. Verhoeven, E. E.; van Kesteren, M.; Moolenaar, G. F.; Visse, R.; Goosen, N. J. Biol. Chem. 2000, 275, 5120.
21. Moolenaar, G. F.; Herron, M. F.; Monaco, V.; van der Marel, G. A.; van Boom, J. H.; Visse, R.; Goosen, N. J. Biol. Chem. 2000, 275, 8044.
22. Lin, J. J.; Phillips, A. M.; Hearst, J. E.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1992, 267, 17693.
23. Lin, J. J.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1992, 267, 17688.
24. Caron, P. R.; Kushner, S. R.; Grossman, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1985, 82, 4925.
25. Husain, I.; Van Houten, B.; Thomas, D. C.; Abdel-Monem, M.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1985, 82, 6774.
26. Goosen, N.; Moolenaar, G. F. Res. Microbiol. 2001, 152, 401.
27. Lloyd, R. S.; Van Houten, B. In DNA Repair Mechanisms: Impact on Human Diseases and Cancer Vos, J.-M., Ed.; R. G. Landes Company, Biomedical Publishers: Austin, Texas, 1995.
28. Sancar, A. Annu. Rev. Biochem. 1996, 65, 43.
29. Theis, K.; Skorvaga, M.; Machius, M.; Nakagawa, N.; Van Houten, B.; Kisker, C. Mutat. Res. 2000, 460, 277.
30. Van Houten, B.; Croteau, D. L.; DellaVecchia, M. J.; Wang, H.; Kisker, C. Mutat. Res., in press.
31. Friedberg, E. C.; Walker, G. C.; Siede, W. DNA repair and mutagenesis; ASM Press: Washington, DC, 1995.
32. Sancar, A. Science 1994, 266, 1954.
33. Moolenaar, G. F.; Uiterkamp, R. S.; Zwijnenburg, D. A.; Goosen, N. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 462.
34. Chandrasekhar, D.; Van Houten, B. Mutat. Res. 2000, 450, 19.
35. Minko, I. G.; Zou, Y.; Lloyd, R. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 1905.
36. Zou, Y.; Ma, H.; Minko, I. G.; Shell, S. M.; Yang, Z.; Qu, Y.; Xu, Y.; Geacintov, N. E.; Lloyd, R. S. Biochemistry 2004, 43, 4196.
37. Minko, I. G.; Kurtz, A. J.; Croteau, D. L.; Van Houten, B.; Harris, T. M.; Lloyd, R. S. Biochemistry 2005, 44, 3000.
38. Kow, Y. W.; Wallace, S. S.; Van Houten, B. Mutat. Res. 1990, 235, 147.
39. Verhoeven, E. E.; van Kesteren, M.; Turner, J. J.; van der Marel, G. A.; van Boom, J. H.; Moolenaar, G. F.; Goosen, N. Nucleic Acids Res. 2002, 30, 2492.
40. Geacintov, N. E.; Broyde, S.; Buterin, T.; Naegeli, H.; Wu, M.; Yan, S.; Patel, D. J. Biopolymers 2002, 65, 202.
41. Doolittle, R. F.; Johnson, M. S.; Husain, I.; Van Houten, B.; Thomas, D. C.; Sancar, A. Nature 1986, 323, 451.
42. Navaratnam, S.; Myles, G. M.; Strange, R. W.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1989, 264, 16067.
43. Visse, R.; de Ruijter, M.; Ubbink, M.; Brandsma, J. A.; van de Putte, P. Mutat. Res. 1993, 294, 263.
44. Wang, J.; Mueller, K. L.; Grossman, L. J. Biol. Chem. 1994, 269, 10771.
45. Buchko, G. W.; Daughdrill, G. W.; de Lorimier, R.; Rao, B. K.; Isern, N. G.; Lingbeck, J. M.; Taylor, J. S.; Wold, M. S.; Gochin, M.; Spicer, L. D.; Lowry, D. F.; Kennedy, M. A. Biochemistry 1999, 38, 15116.
46. Ikegami, T.; Kuraoka, I.; Saijo, M.; Kodo, N.; Kyogoku, Y.; Morikawa, K.; Tanaka, K.; Shirakawa, M. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 701.
47. Asahina, H.; Kuraoka, I.; Shirakawa, M.; Morita, E. H.; Miura, N.; Miyamoto, I.; Ohtsuka, E.; Okada, Y.; Tanaka, K. Mutat. Res. 1994, 315, 229.
48. Kuraoka, I.; Morita, E. H.; Saijo, M.; Matsuda, T.; Morikawa, K.; Shirakawa, M.; Tanaka, K. Mutat. Res. 1996, 362, 87.
49. Hopfner, K. P.; Karcher, A.; Shin, D. S.; Craig, L.; Arthur, L. M.; Carney, J. P.; Tainer, J. A. Cell 2000, 101, 789.
50. Lamers, M. H.; Perrakis, A.; Enzlin, J. H.; Winterwerp, H. H.; de Wind, N.; Sixma, T. K. Nature 2000, 407, 711.
51. Lowe, J.; Cordell, S. C.; van den Ent, F. J. Mol. Biol. 2001, 306, 25.
52. Hopfner, K. P.; Tainer, J. A. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 249.
53. Smith, P. C.; Karpowich, N.; Millen, L.; Moody, J. E.; Rosen, J.; Thomas, P. J.; Hunt, J. F. Mol. Cell 2002, 10, 139.
54. Lammens, A.; Schele, A.; Hopfner, K. P. Curr. Biol. 2004, 14, 1778.
55. Orren, D. K.; Sancar, A. UCLA Symp. Mol. Cell. Biol. 1988, 83, 87.
56. Myles, G. M.; Hearst, J. E.; Sancar, A. Biochemistry 1991, 30, 3824.
57. Myles, G. M.; Sancar, A. Biochemistry 1991, 30, 3834.
58. Obmolova, G.; Ban, C.; Hsieh, P.; Yang, W. Nature 2000, 407, 703.
59. Junop, M. S.; Obmolova, G.; Rausch, K.; Hsieh, P.; Yang, W. Mol. Cell 2001, 7, 1.
60. Thiagalingam, S.; Grossman, L. J. Biol. Chem. 1991, 266, 11395.
61. Thiagalingam, S.; Grossman, L. J. Biol. Chem. 1993, 268, 18382.
62. Seeberg, E.; Steinum, A. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1982, 79, 988.
63. Caron, P. R.; Grossman, L. Nucleic Acids Res. 1988, 16, 10891.
64. Oh, E. Y.; Claassen, L.; Thiagalingam, S.; Mazur, S.; Grossman, L. Nucleic Acids Res. 1989, 17, 4145.
65. Truglio, J. J.; Croteau, D. L.; Skorvaga, M.; DellaVecchia, M. J.; Theis, K.; Mandavilli, B. S.; Van Houten, B.; Kisker. C. EMBO J. 2004, 23, 2498.
66. Zou, Y.; Bassett, H.; Walker, R.; Bishop, A.; Amin, S.; Geacintov, N. E.; Van Houten, B. J. Mol. Biol. 1998, 281, 107.
67. Wang, J.; Grossman, L. J. Biol. Chem. 1993, 268, 5323.
68. Oh, E. Y.; Grossman, L. Nucleic Acids Res. 1986, 14, 8557.
69. Van Houten, B.; Gamper, H.; Hearst, J. E.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1988, 263, 16553.
70. Van Houten, B.; Gamper, H.; Sancar, A.; Hearst, J. E. J. Biol. Chem. 1987, 262, 13180.
71. Reardon, J. T.; Nichols, A. F.; Keeney, S.; Smith, C. A.; Taylor, J. S.; Linn, S.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1993, 268, 21301.
72. Strike, P.; Rupp, W. D. Mutat. Res. 1985, 145, 43.
73. Yamagata, A.; Masui, R.; Kato, R.; Nakagawa, N.; Ozaki, H.; Sawai, H.; Kuramitsu, S.; Fukuyama, K. J. Biol. Chem. 2000, 275, 13235.
74. Sohi, M.; Alexandrovich, A.; Moolenaar, G.; Visse, R.; Goosen, N.; Vernede, X.; Fontecilla-Camps, J. C.; Champness, J.; Sanderson, M. R. FEBS Lett. 2000, 465, 161.
75. Alexandrovich, A.; Sanderson, M. R.; Moolenaar, G. F.; Goosen, N.; Lane, A. N. FEBS Lett. 1999, 451, 181.
76. Velankar, S. S.; Soultanas, P.; Dillingham, M. S.; Subramanya, H. S.; Wigley, D. B. Cell 1999, 97, 75.
77. Korolev, S.; Hsieh, J.; Gauss, G. H.; Lohmann, T. M.; Waksman, G. Cell 1997, 90, 635.
78. Kim, J. L.; Morgenstern, K. A.; Griffith, J. P.; Dwyer, M. D.; Thomson, J. A.; Murcko, M. A.; Lin, C.; Caron, P. R. Structure 1998, 6, 89.
79. Seeley, T. W.; Grossman, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1989, 86, 6577.
80. Grossman, L.; Thiagalingam, S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 16871.
81. Hall, M. C.; Matson, S. W. Mol. Microbial. 1999, 34, 867.
82. Gordienko, I.; Rupp, W. D. EMBO J. 1997, 16, 889.
83. Moolenaar, G. F.; Visse, R.; Ortiz-Buysse, M.; Goosen, N.; van de Putte, P. J. Mol. Biol. 1994, 240, 294.
84. Skorvaga, M.; DellaVecchia, M. J.; Croteau, D. L.; Theis, K.; Truglio, J. J.; Mandavilli, B. S.; Kisker, C.; Van Houten, B. J. Biol. Chem. 2004, 279, 51574.
85. Koo, H. S.; Claassen, L.; Grossman, L.; Liu, L. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991, 88, 1212.
86. Kovalsky, O. I.; Grossman, L.; Ahn, B. J. Biol. Chem. 1996, 52, 33236.
87. Seeley, T. W.; Grossman, L. J. Biol. Chem. 1990, 265, 7158.
88. Skorvaga, M.; Theis, K.; Mandavilli, B. S.; Kisker, C.; Van Houten, B. J. Biol. Chem. 2002, 277, 1553.
89. Goosen, N.; Moolenaar, G. F.; Visse, R.; Putte, P. V. D. In Nucleic Acids and Molecular Biology; Eckstein, F., Lilley, D. M. J., Eds.; Springer-Verlag: Berlin, 1998; Vol. 12.
90. Hsu, D. S.; Kim, S. T.; Sun, Q.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1995, 270, 8319.
91. Selby, C. P.; Sancar, A. Science 1993, 260, 53.
92. Moolenaar, G. F.; Franken, K. L.; Dijkstra, D. M.; Thomas-Oates, J. E.; Visse, R.; van de Putte, P.; Goosen, N. J. Biol. Chem. 1995, 270, 30508.
93. Moolenaar, G. F.; Franken, K. L. M. C.; van de Putte, P.; Goosen, N. Mutat Res. 1998, 385, 195.
94. Nakagawa, N.; Masui, R.; Kato, R.; Kuramitsu, S. J. Biol. Chem. 1997, 272, 22703.
95. Moolenaar, G. F.; Bazuine, M.; van Knippenberg, I. C.; Visse, R.; Goosen, N. J. Biol. Chem. 1998, 273, 34896.
96. Claassen, L. A.; Ahn, B.; Koo, H. S.; Grossman, L. J. Biol. Chem. 1991, 266, 11380.
97. Claassen, L. A.; Grossman, L. J. Biol. Chem. 1991, 266, 11388.
98. Moolenaar, G. F.; Monaco, V.; van der Marel, G. A.; van Boom, J. H.; Visse, R.; Goosen, N. J. Biol. Chem. 2000, 275, 8038.
99. Van Houten, B.; Gamper, H.; Holbrook, S. R.; Hearst, J. E.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1986, 83, 8077.
100. Sancar, A.; Hearst, J. E. Science 1993, 259, 1415.
101. Wilson, S. H.; Kunkel, T. A. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 176.
102. Zou, Y.; Walker, R.; Bassett, H.; Geacintov, N. E.; Van Houten, B. J. Biol. Chem. 1997, 272, 4820.
103. Zou, Y.; Luo, C.; Geacintov, N. E. Biochemistry 2001, 40, 2923.
104. Visse, R.; de Ruijter, M.; Moolenaar, G. F.; van de Putte, P. J. Biol. Chem. 1992, 267, 6736.
105. Branum, M. E.; Reardon, J. T.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 2001, 276, 25421.
106. Moolenaar, G. F.; Hoglund, L.; Goosen, N. EMBO J. 2001, 20, 6140.
107. Yeung, A. T.; Mattes, W. B.; Grossman, L. Nucleic Acids Res. 1986, 14, 2567.
108. Yeung, A. T.; Mattes, W. B.; Oh, E. Y.; Grossman, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1983, 80, 6157.
109. Allan, J. M.; Routledge, M. N.; Garner, R. C. Mutat. Res. 1996, 362, 261.
110. Orren, D. K.; Selby, C. P.; Hearst, J. E.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1992, 267, 780.
111. Hong, Z.; Ferrari, E.; Wright-Minogue, J.; Chase, R.; Risano, C.; Seelig, G.; Lee, C. G.; Kwong, A. D. J. Virol. 1996, 70, 4261.
112. Tai, C. L.; Chi, W. K.; Chen, D. S.; Hwang, L. H. J. Viral. 1996, 70, 8477.
113. Lohman, T. M.; Chao, K.; Green, J. M.; Sage, S.; Runyon, G. T. J. Biol. Chem. 1989, 264, 10139.
114. Yarranton, G. T.; Das, R. H.; Gefter, M. L. J. Biol. Chem. 1979, 254, 12002.
115. Bird, L. E.; Brannigan, J. A.; Subramanya, H. S.; Wigley, D. B. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 2686.
116. Zou, Y.; Liu, T. M.; Geacintov, N. E.; Van Houten, B. Biochemistry 1995, 34, 13582.
117. Bruner, S. D.; Norman, D. P.; Verdine, G. L. Nature 2000, 403, 859.
118. Lau, A. Y.; Scharer, O. D.; Samson, L.; Verdine, G. L.; Ellenberger, T. Cell 1998, 95, 249.
119. Slupphaug, G.; Mol, C. D.; Kavli, B.; Arvai, A. S.; Krokan, H. E.; Tainer, J. A. Nature 1996, 384, 87.
120. Sancar, A.; Franklin, K. A.; Sancar, G. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1984, 81, 7397.
121. Shi, Q.; Thresher, R.; Sancar, A.; Griffith, J. J. Mol. Biol. 1992, 226, 425.
122. Verhoeven, E. E.; Wyman, C.; Moolenaar, G. F.; Hoeijmakers, J. H.; Goosen, N. EMBO J. 2001, 20, 601.
123. Hsu, D. S.; Takahashi, M.; Delagoutte, E.; Bertrand-Burggraf, E.; Wang, Y. H.; Norden, B.; Fuchs, R. P.; Griffith, J.; Sancar, A. J. Mol. Biol. 1994, 241, 645.
124. Lahm, A.; Suck, D. J. Mol. Biol. 1991, 222, 645.
125. Gordienko, I.; Rupp, W. D. EMBO J. 1997, 16, 880.
126. Zou, Y.; Van Houten, B. EMBO J. 1999, 18, 4889.
127. Zou, Y.; Crowley, D. J.; Van Houten, B. J. Biol. Chem. 1998, 273, 12887.
128. Bertrand-Burggraf, E.; Selby, C. P.; Hearst, J. E.; Sancar, A. J. Mol. Biol. 1991, 219, 27.
129. Snowden, A.; Van Houten, B. J. Mol. Biol. 1991, 220, 19.
130. Visse, R.; de Ruijter, M.; Brouwer, J.; Brandsma, J. A.; van de Putte, P. J. Biol. Chem 1991, 266, 7609.
131. Voigt, J. M.; Van Houten, B.; Sancar, A.; Topal, M. D. J. Biol. Chem. 1989, 264, 5172.
132. Thomas, D. C.; Levy, M.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1985, 260, 9875.
133. Truglio, J. J.; Rhau, B.; Croteau, D. L.; Wang, L.; Skorvaga, M.; Karakas, E.; DellaVecchia, M. J.; Wang, H.; Van Houten, B.; Kisker, C. EMBO J. 2005.
134. Aravind, L.; Walker, D. R.; Koonin, E. V. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 1223.
135. Van Roey, P.; Meehan, L.; Kowalski, J. C.; Belfort, M.; Derbyshire, V. Nat. Struct. Biol. 2002, 9, 806.
136. Kowalski, J. C.; Belfort, M.; Stapleton, M. A.; Holpert, M.; Dansereau, J. T.; Pietrokovski, S.; Baxter, S. M.; Derbyshire, V. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 2115.
137. Galburt, E. A.; Stoddard, B. L. Biochemistry 2002, 41, 13851.
138. Galburt, E. A. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 1096.
139. Singh, S.; Folkers, G. E.; Bonvin, A. M.; Boelens, R.; Wechselberger, R.; Niztayev, A.; Kaptein, R. EMBO J. 2002, 21, 6257.
140. Doherty, A. J.; Serpell, L. C.; Pouting, C. P. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 2488.
141. Shao, X.; Grishin, N. V. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 2643.
142. Ariyoshi, M.; Nishino, T.; Iwasaki, H.; Shinagawa, H.; Morikawa, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000, 97, 8257.
143. Lee, J. Y.; Chang, C.; Song, H. K.; Moon, J.; Yang, J. K.; Kim, H. K.; Kwon, S. T.; Sub, S. W. EMBO J. 2000, 19, 1119.
144. Pelletier, H.; Sawaya, M. R. Biochemistry 1996, 35, 12778.
145. Roe, S. M.; Barlow, T.; Brown, T.; Oram, M.; Keeley, A.; Tsaneva, I. R.; Pearl, L. H. Mol. Cell 1998, 2, 361.
146. Thayer, M. M.; Ahern, H.; Xing, D.; Cunningham, R. P.; Tainer, J. A. EMBO J. 1995, 14, 4108.
147. Nazimiec, M.; Lee, C. S.; Tang, Y. L.; Ye, X.; Case, R.; Tang, M. Biochemistry 2001, 40, 11073.
148. Tang, M.; Nazimiec, M.; Ye, X.; Iyer, G. H.; Eveleigh, J.; Zheng, Y.; Zhou, W.; Tang, Y. Y. J. Biol. Chem. 2001, 276, 3904.
149. Moolenaar, G. F.; van Rossum-Fikkert, S.; van Kesteren, M.; Goosen, N. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 1467.
150. Van Houten, B.; Eisen, J. A.; Hanawalt, P. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 2581.
151. Fernandez De Henestrosa, A. R.; Ogi, T.; Aoyagi, S.; Chafin, D.; Hayes, J. J.; Ohmori, H.; Woodgate, R. Mol. Microbiol. 2000, 35, 1560.
152. Smith, B. T.; Grossman, A. D.; Walker, G. C. J. Bacteriol. 2002, 184, 488.
153. Lin, C. G.; Kovalsky, O.; Grossman, L. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 3151.
154. Moolenaar, G. F.; Moorman, C.; Goosen, N. J. Bacteriol. 2000, 182, 5706.
155. Ikenaga, M.; Ichikawa-Ryo, H.; Kondo, S. J. Mol. Biol. 1975, 92, 341.
156. Thomas, D. C.; Morton, A. G.; Bohr, V. A.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1988, 85, 3723.
157. Thomas, D. C.; Husain, I.; Chaney, S. G.; Panigrahi, G. B.; Walker, I. G. Nucleic Acids Res. 1991, 19, 365.
158. Lin, J. J.; Sancar, A. Biochemistry 1989, 28, 7979.
159. Snowden, A.; Kow, Y. W.; Van Houten, B. Biochemistry 1990, 29, 7251.
160. Bockrath, R.; Kow, Y. W.; Wallace, S. S. Mutat. Res. 1993, 288, 207.
161. Oleykowski, C. A.; Mayernik, J. A.; Lim, S. E.; Groopman, J. D.; Grossman, L.; Wogan, G. N.; Yeung, A. T. J. Biol. Chem. 1993, 268, 7990.
162. Routledge, M. N.; Allan, J. M.; Garner, R. C. Carcinogenesis 1997, 18, 1407.
163. Chen, J. X.; Zheng, Y.; West, M.; Tang, M. S. Cancer Res. 1998, 58, 2070.
164. Alekseyev, Y. O.; Hamm, M. L.; Essigmann, J. M. Carcinogenesis 2004, 25, 1045.
165. Chen, B. X.; Kubo, K.; Ide, H.; Erlanger, B. F.; Wallace, S. S.; Kow, Y. W. Mutat. Res. 1992, 273, 253.
166. Purmal, A. A.; Rabow, L. E.; Lampman, G. W.; Cunningham, R. P.; Kow, Y. W. Mutat. Res. 1996, 364, 193.
167. Krugh, T. R.; Graves, D. E.; Stone, M. P. Biochemistry 1989, 28, 9988.
168. Nazimiec, M.; Grossman, L.; Tang, M. S. J. Biol. Chem. 1992, 267, 24716.
169. Gunz, D.; Hess, M. T.; Naegeli, H. J. Biol. Chem. 1996, 271, 25089.
170. Gomez-Pinto, I.; Cubero, E.; Kalko, S. G.; Monaco, V.; van der Marel, G.; van Boom, J. H.; Orozco, M.; Gonzalez, C. J. Biol. Chem. 2004, 279, 24552.
171. Lawley, P. D. In Chemical Carcinogens; Searle, C. E., Ed.; American Chemical Society: Washington, DC, 1984; Vol. 1.
172. Chambers, R. W.; Sledziewska-Gojska, E.; Hirani-Hojatti, S.; Borowy-Borowski, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1985, 82, 7173.
173. Samson, L.; Thomale, J.; Rajewsky, M. F. EMBO J. 1988, 7, 2261.
174. Chambers, R. W.; Sledziewska-Gojska, E.; Hirani-Hojatti, S. Mol. Gen. Genet. 1988, 213, 325.
175. Tang, M.; Lieberman, M. W.; King, C. M. Nature 1982, 299, 646.
176. Fuchs, R. P.; Seeberg, E. EMBO J. 1984, 3, 757.
177. Sancar, A.; Franklin, K. A.; Sancar, G.; Tang, M. S. J. Mol. Biol. 1985, 184, 725.
178. Bichara, M.; Fuchs, R. P. J. Bacteriol. 1987, 169, 423.
179. Pierce, J. R.; Case, R.; Tang, M. S. Biochemistry 1989, 28, 5821.
180. Gordienko, I.; Rupp, W. D. EMBO J. 1998, 17, 626.
181. Zou, Y.; Shell, S. M.; Utzat, C. D.; Luo, C.; Yang, Z.; Geacintov,
182. Seeberg, E.; Steinum, A. L.; Nordenskjold, M.; Soderhall, S.; Jernstrom, B. Mutat. Res. 1983, 112, 139.
183. Vadi, H. V. Carcinogenesis 1983, 4, 1379.
184. Van Houten, B.; Masker, W. E.; Carrier, W. L.; Regan, J. D. Carcinogenesis 1986, 7, 83.
185. Hoare, S.; Zou, Y.; Purohit, V.; Krishnasamy, R.; Skorvaga, M.; Van Houten, B.; Geacintov, N. E.; Basu, A. K. Biochemistry 2000, 39, 12252.
186. Ziegel, R.; Shallop, A.; Upadhyaya, P.; Jones, R.; Tretyakova, N. Biochemistry 2004, 43, 540.
187. Yeung, A. T.; Jones, B. K.; Capraro, M.; Chu, T. Nucleic Acids Res. 1987, 15, 4957.
188. Munn, M. M.; Rupp, W. D. J. Biol. Chem. 1991, 266, 24748.
189. Huang, J. C.; Hsu, D. S.; Kazantsev, A.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994, 91, 12213.
190. Ramaswamy, M.; Yeung, A. T. J. Biol. Chem. 1994, 269, 485.
191. Selby, C. P.; Sancar, A. Biochemistry 1988, 27, 7184.
192. Tang, M. S.; Lee, C. S.; Doisy, R.; Ross, L.; Needham-VanDevanter, D. R.; Hurley, L. H. Biochemistry 1988, 27, 893.
193. Beek, D. J.; Popoff, S., Sancar, A.; Rupp, W. D. Nucleic Acids Res. 1985, 13, 7395.
194. Husain, I.; Chaney, S. G.; Sancar, A. J. Bacteriol. 1985, 163, 817.
195. Popoff, S. C.; Beck, D. J.; Rupp, W. D. Mutat. Res. 1987, 183, 129.
196. Visse, R.; King, A.; Moolenaar, G. F.; Goosen, N.; van de Putte, P. Biochemistry 1994, 33, 9881.
197. Brandsma, J. A.; de Ruijter, M.; Visse, R.; van Meerten, D.; van der Kaaden, M.; Moggs, J. G.; van de Putte, P. Mutat. Res. 1996, 362, 29.
198. Chaney, S. G.; Campbell, S. L.; Temple, B.; Bassett, E.; Wu, Y.; Faldu, M. J. Inorg. Biochem. 2004, 98, 1551.
199. Thomas, D. C.; Kunkel, T. A.; Casna, N. J.; Ford, J. P.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1986, 261, 14496.
200. Fram, R. J.; Sullivan, J.; Marinus, M. G. Murat. Res. 1986, 166, 299.
201. Pu, W. T.; Kahn, R.; Munn, M. M.; Rupp, W. D. J. Biol. Chem. 1989, 264, 20697.
202. Li, V. S.; Reed, M.; Zheng, Y.; Kohn, H.; Tang, M. Biochemistry 2000, 39, 2612.
203. Li, V. S.; Tang, M. S.; Kohn, H. Bioorg. Med. Chem. 2001, 9, 863.
204. Lage, C.; de Padula, M.; de Alencar, T. A.; da Fonseca Goncalves, S. R.; da Silva Vidal, L.; Cabral-Neto, J.; Leitao, A. C. Mutat. Res. 2003, 544, 143.
205. Kacinski, B. M.; Rupp, W. D.; Ludlum, D. B. Cancer Res. 1985, 45, 6471.
206. Bohr, V. A. Adv. Exp. Med. Biol. 1991, 283, 225.
207. Van Houten, B.; Sancar, A. J. Bacteriol. 1987, 169, 540.
208. Van Houten, B.; Gamper, H.; Hearst, J. E.; Sancar, A. J. Biol. Chem. 1986, 261, 141135.
209. Cheng, S.; Van Houten, B.; Gamper, H. B.; Sanear, A.; Hearst, J. E. J. Biol. Chem. 1988, 263, 15110.
210. Jones, B. K.; Yeung, A. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1988, 85, 8410.
211. Duval-Valentin, G.; Takasugi, M.; Helene, C.; Sage, E. J. Mol. Biol. 1998, 278, 815.
212. Barre, F. X.; Asseline, U.; Harel-Bellan, A. J. Mol. Biol. 1999, 286, 1379.
213. Seeberg, E. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 1981, 26, 217.
214. Franklin, W. A.; Haseltine, W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1984, 81, 3821.
215. Myles, G. M.; Van Houten, B.; Sancar, A. Nucleic Acids Res. 1987, 15, 1227.
216. Parniewski, P.; Bacolla, A.; Jaworski, A.; Wells, R. D. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 616.
217. Bienstock, R. J.; Skorvaga, M.; Mandavilli, B. S.; Van Houten, B. J. Biol. Chem. 2003, 278, 5309.
218. Delagoutte, E.; Fuchs, R. P.; Bertrand-Burggraf, E. J. Mol. Biol. 2002, 320, 73.
219. Selby, C. P.; Sancar, A. Biochemistry 1991, 30, 3841.
220. Selby, C. P.; Sancar, A. Prog. Clin. Biol. Res. 1990, 340A, 179.
221. Selby, C. P.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1990, 87, 3522.
222. Lambert, B.; Jones, B. K.; Roquas, B. P.; Le Pecq, J. B.; Yeung, A. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1989, 86, 6557.
223. Lambert, B.; Segal-Bendirdjian, E.; Esnault, C.; Le Pecq, J. B.; Roques, B. P.; Jones, B.; Yeung, A. T. Anticancer Drug Des. 1990, 5, 43.
224. Kacinski, B. M.; Rupp, W. D. Nature 1981, 294, 480.
225. Anderson, R. D.; Veigl, M. L.; Baxter, J.; Sedwick, W. D. Mutat. Res. 1993, 294, 215.
226. Arikan, E.; Kulkarni, M. S.; Thomas, D. C.; Sancar, A. Nucleic Acids Res. 1986, 14, 2637.
227. Caron, P. R.; Grossman, L. Nucleic Acids Res. 1988, 16, 10903.
228. Grossman, L.; Lin, C. I.; Ahn, Y. In DNA damage and repair; Nickoloff, J. A., Hoekstra, M. F., Eds.; Humana Press: Totowas, NJ, 1998; Vol. 1.
229. Ahn, B.; Grossman, L. J. Biol. Chem. 1996, 271, 21462.
230. Assenmacher, N.; Wenig, K.; Lammens, A.; Hopfner, K. P. J. Mol. Biol. 2006, 355, 675.