Features and strategies of ENU mouse mutagenesis

Current Pharmaceutical Biotechnology

Volumn 10, Issue 2, 2009, Pages 198-213

  Soewarto, Dian ^a,d   Klaften, Matthias ^b   Rubio Aliaga, Isabel ^c  

^a CHARITÉ UNIVERSITÄTSMEDIZIN BERLIN   (Germany)

^b INSTITUTE OF EPIDEMIOLOGY   (Germany)

^c TECHNICAL UNIVERSITY OF MUNICH   (Germany)

^d DZHK GERMAN CENTRE FOR CARDIOVASCULAR RESEARCH   (Germany)

Author keywords

Allelic series; Animal disease model; Drug development; ENU mutagenesis; Modifier screen; Sensitized screen; SNP mapping; Target validation

Indexed keywords

ETHYLNITROSOUREA; METHYLNITROSOUREA; PROTEIN P53; TOLL LIKE RECEPTOR; WNT3 PROTEIN; MUTAGENIC AGENT;

ALKYLATION; BREEDING; CHROMOSOME 11; DNA REPAIR; GENE FREQUENCY; GENE FUNCTION; GENE LOCUS; GENE MAPPING; GENE MUTATION; GENE REPRESSION; GENETIC ASSOCIATION; GENETIC DATABASE; GENETIC MODEL; GENETIC SCREENING; GENOTYPE; GERM CELL; HERITABILITY; IONIZING RADIATION; MOUSE; MOUSE STRAIN; MUTAGEN TESTING; MUTAGENESIS; MUTAGENICITY; NONHUMAN; PHENOTYPE; POINT MUTATION; POLYMERASE CHAIN REACTION; RADIATION EXPOSURE; REPRODUCIBILITY; REVIEW; SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM; ANIMAL; ANIMAL MODEL; GENOME; MUTATION; SITE DIRECTED MUTAGENESIS;

ANIMALIA; MUS;

ANIMALS; ETHYLNITROSOUREA; GENOME; MICE; MODELS, ANIMAL; MUTAGENESIS; MUTAGENESIS, SITE-DIRECTED; MUTAGENS; MUTATION;

EID: 65549125062     PISSN: 13892010     EISSN: 18734316     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/138920109787315079     Document Type: Review

References (159)

1. Brown, S. D. and Peters, J. (1996) Trends Genet., 12, 433-5.
2. Brenner, S. (1974) Genetics, 77, 71-94.
3. Haffter, P.; Granato, M.; Brand, M.; Mullins, M. C.; Hammerschmidt, M.; Kane, D. A.; Odenthal, J.; van Eeden, F. J.; Jiang, Y. J.; Heisenberg, C. P.; Kelsh, R. N.; Furutani-Seiki, M.; Vogelsang, E.; Beuchle, D.; Schach, U.; Fabian, C. and Nusslein-Volhard, C. (1996) Development, 123, 1-36.
4. Nusslein-Volhard, C. and Wieschaus, E. (1980) Nature, 287, 795-801.
5. Justice, M. J.; Noveroske, J. K.; Weber, J. S.; Zheng, B. and Bradley, A. (1999) Hum. Mol. Genet., 8, 1955-63.
6. Zambrowicz, B. P. and Sands, A. T. (2003) Nat. Rev. Drug Discov., 2, 38-51.
7. Lindsay, M. A. (2003) Nat. Rev. Drug Discov., 2, 831-8.
8. Venter, J. C.; Adams, M. D.; Myers, E. W.; Li, P. W.; Mural, R. J.; Sutton, G. G.; Smith, H. O.; Yandell, M.; Evans, C. A.; Holt, R. A.; Gocayne, J. D.; Amanatides, P.; Ballew, R. M.; Huson, D. H.; Wortman, J. R.; Zhang, Q.; Kodira, C. D.; Zheng, X. H.; Chen, L.; Skupski, M.; Subramanian, G.; Thomas, P. D.; Zhang, J.; Gabor Miklos, G. L.; Nelson, C.; Broder, S.; Clark, A. G.; Nadeau, J.; McKusick, V. A.; Zinder, N.; Levine, A. J.; Roberts, R. J.; Simon, M.; Slayman, C.; Hunkapiller, M.; Bolanos, R.; Delcher, A.; Dew, I.; Fasulo, D.; Flanigan, M.; Florea, L.; Halpern, A.; Hannenhalli, S.; Kravitz, S.; Levy, S.; Mobarry, C.; Reinert, K.; Remington, K.; Abu-Threideh, J.; Beasley, E.; Biddick, K.; Bonazzi, V.; Brandon, R.; Cargill, M.; Chandramouliswaran, I.; Charlab, R.; Chaturvedi, K.; Deng, Z.; Di Francesco, V.; Dunn, P.; Eilbeck, K.; Evangelista, C.; Gabrielian, A. E.; Gan, W.; Ge, W.; Gong, F.; Gu, Z.; Guan, P.; Heiman, T. J.; Higgins, M. E.; Ji, R. R.; Ke, Z.; Ketchum, K. A.; Lai, Z.; Lei, Y.; Li, Z.; Li, J.; Liang, Y.; Lin, X.; Lu, F.; Merkulov, G. V.; Milshina, N.; Moore, H. M.; Naik, A. K.; Narayan, V. A.; Neelam, B.; Nusskern, D.; Rusch, D. B.; Salzberg, S.; Shao, W.; Shue, B.; Sun, J.; Wang, Z.; Wang, A.; Wang, X.; Wang, J.; Wei, M.; Wides, R.; Xiao, C. and Yan, C. et al. (2001) Science, 291, 1304-51.
9. Waterston, R. H.; Lindblad-Toh, K.; Birney, E.; Rogers, J.; Abril, J. F.; Agarwal, P.; Agarwala, R.; Ainscough, R.; Alexandersson, M.; An, P.; Antonarakis, S. E.; Attwood, J.; Baertsch, R.; Bailey, J.; Barlow, K.; Beck, S.; Berry, E.; Birren, B.; Bloom, T.; Bork, P.; Botcherby, M.; Bray, N.; Brent, M. R.; Brown, D. G.; Brown, S.D.; Bult, C.; Burton, J.; Butler, J.; Campbell, R. D.; Carninci, P.; Cawley, S.; Chiaromonte, F.; Chinwalla, A. T.; Church, D. M.; Clamp, M.; Clee, C.; Collins, F. S.; Cook, L. L.; Copley, R. R.; Coulson, A.; Couronne, O.; Cuff, J.; Curwen, V.; Cutts, T.; Daly, M.; David, R.; Davies, J.; Delehaunty, K. D.; Deri, J.; Dermitzakis, E. T.; Dewey, C.; Dickens, N. J.; Diekhans, M.; Dodge, S.; Dubchak, I.; Dunn, D. M.; Eddy, S. R.; Elnitski, L.; Emes, R. D.; Eswara, P.; Eyras, E.; Felsenfeld, A.; Fewell, G. A.; Flicek, P.; Foley, K.; Frankel, W. N.; Fulton, L. A.; Fulton, R. S.; Furey, T. S.; Gage, D.; Gibbs, R. A.; Glusman, G.; Gnerre, S.; Goldman, N.; Goodstadt, L.; Grafham, D.; Graves, T. A.; Green, E. D.; Gregory, S.; Guigo, R.; Guyer, M.; Hardison, R. C.; Haussler, D.; Hayashizaki, Y.; Hillier, L. W.; Hinrichs, A.; Hlavina, W.; Holzer, T.; Hsu, F.; Hua, A.; Hubbard, T.; Hunt, A.; Jackson, I.; Jaffe, D. B.; Johnson, L. S.; Jones, M.; Jones, T. A.; Joy, A.; Kamal, M. and Karlsson, E. K., et al. (2002) Nature, 420, 520-62.
10. Chen, Y.; Yee, D.; Dains, K.; Chatterjee, A.; Cavalcoli, J.; Schneider, E.; Om, J.; Woychik, R. P. and Magnuson, T. (2000) Nat. Genet., 24, 314-7.
11. Munroe, R. J.; Bergstrom, R. A.; Zheng, Q. Y.; Libby, B.; Smith, R.; John, S. W.; Schimenti, K. J.; Browning, V. L. and Schimenti, J. C. (2000) Nat. Genet., 24, 318-21.
12. Augustin, M.; Sedlmeier, R.; Peters, T.; Huffstadt, U.; Kochmann, E.; Simon, D.; Schoniger, M.; Garke-Mayerthaler, S.; Laufs, J.; Mayhaus, M.; Franke, S.; Klose, M.; Graupner, A.; Kurzmann, M.; Zinser, C.; Wolf, A.; Voelkel, M.; Kellner, M.; Kilian, M.; Seelig, S.; Koppius, A.; Teubner, A.; Korthaus, D.; Nehls, M. and Wattler, S. (2005) Mamm. Genome., 16, 405-13.
13. Coghill, E. L.; Hugill, A.; Parkinson, N.; Davison, C.; Glenister, P.; Clements, S.; Hunter, J.; Cox, R. D. and Brown, S. D. (2002) Nat. Genet., 30, 255-6.
14. Cuénot, L. Arch. Zool. Exp. Gén., 1905, 4, 123-132.
15. Silver, L. M. (1995) Mouse genetics, Concepts and Applications,
16. Pretsch, W.; Favor, J.; Lehmacher, W. and Neuhauser-Klaus, A. (1994) Mutagenesis, 9, 289-94.
17. Russell, W. L. (1951) Cold Spring Harb Symp. Quant. Biol., 16, 327-36.
18. Oakberg, E. F. (1957) Nature, 180, 1137-8.
19. Ehling, U. H.; Favor, J.; Kratochvilova, J.and Neuhauser-Klaus, A. (1982) Mutat. Res., 92, 181-92.
20. IARC Monogr Eval Carcinog Risks Hum Suppl, 1987, 6, 1-729.
21. Favor, J. (1998) Mutat. Res., 405, 221-6.
22. Russell, L. B. and Russell, W. L. (1992) Mutat. Res., 296, 107-27.
23. Russell, W. L.; Kelly, E. M.; Hunsicker, P. R.; Bangham, J. W.; Maddux, S. C. and Phipps, E. L. (1979) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 76, 5818-9.
24. Ehling, U. H. and Neuhauser-Klaus, A. (1988) Mutat. Res., 202, 139-46.
25. Favor, J.; Sund, M.; Neuhauser-Klaus, A. and Ehling, U. H. (1990) Mutat. Res., 231, 47-54.
26. Popp, R. A.; Bailiff, E. G.; Skow, L. C.; Johnson, F. M. and Lewis, S. E. (1983) Genetics, 105, 157-67.
27. Barbaric, I.; Wells, S.; Russ, A. and Dear, T. N. (2007) Environ Mol. Mutagen, 48, 124-42.
28. Bode, V. C. (1984), Genetics, 108, 457-70.
29. Davis, A. P. and Justice, M. J. (1998) Genetics, 148, 7-12.
30. Justice, M. J. and Bode, V. C. (1988) Genet. Res., 51, 95-102.
31. Shedlovsky, A.; King, T. R. and Dove, W. F. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85, 180-4.
32. Vreugde, S.; Erven, A.; Kros, C. J.; Marcotti, W.; Fuchs, H.; Kurima, K.; Wilcox, E. R.; Friedman, T. B.; Griffith, A. J.; Balling, R.; Hrabe De Angelis, M.; Avraham, K. B. and Steel, K. P. (2002) Nat. Genet, 30, 257-8.
33. Kurima, K.; Peters, L. M.; Yang, Y.; Riazuddin, S.; Ahmed, Z. M.; Naz, S.; Arnaud, D.; Drury, S.; Mo, J.; Makishima, T.; Ghosh, M.; Menon, P. S.; Deshmukh, D.; Oddoux, C.; Ostrer, H.; Khan, S.; Riazuddin, S.; Deininger, P. L.; Hampton, L. L.; Sullivan, S. L.; Battey, J. F., Jr.; Keats, B. J.; Wilcox, E. R.; Friedman, T. B.; Griffith, A. J. Nat Genet, 2002, 30, 277-84.
34. Fitch, K. R.; McGowan, K. A.; van Raamsdonk, C. D.; Fuchs, H.; Lee, D.; Puech, A.; Herault, Y.; Threadgill, D. W.; Hrabe de Angelis, M. and Barsh, G. S. (2003) Genes. Dev., 17, 214-28.
35. Van Raamsdonk, C. D.; Fitch, K. R.; Fuchs, H.; de Angelis, M. H. and Barsh, G. S. (2004) Nat. Genet., 36, 961-8.
36. Ackerman, K. G.; Herron, B. J.; Vargas, S. O.; Huang, H.; Tevosian, S. G.; Kochilas, L.; Rao, C.; Pober, B. R.; Babiuk, R. P.; Epstein, J. A.; Greer, J. J.; Beier, D. R. PLoS Genet, 2005, 1, 58-65.
37. Hitotsumachi, S.; Carpenter, D. A.; Russell, W. L. (1985) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82, 6619-21.
38. Seiler, F.; Kamino, K.; Emura, M.; Mohr, U. and Thomale, J. (1997) Mutat Res., 385, 205-11.
39. Lindahl, T. and Karran, P. (1983) Prog. Clin. Biol. Res., 132[i B, 241-50.
40. Quwailid, M. M.; Hugill, A.; Dear, N.; Vizor, L.; Wells, S.; Horner, E.; Fuller, S.; Weedon, J.; McMath, H.; Woodman, P.; Edwards, D.; Campbell, D.; Rodger, S.; Carey, J.; Roberts, A.; Glenister, P.; Lalanne, Z.; Parkinson, N.; Coghill, E. L.; McKeone, R.; Cox, S.; Willan, J.; Greenfield, A.; Keays, D.; Brady, S.; Spurr, N.; Gray, I.; Hunter, J.; Brown, S. D. and Cox, R. D. (2004) Mamm. Genome., 15, 585-91.
41. Justice, M. J.; Carpenter, D. A.; Favor, J.; Neuhauser-Klaus, A.; Hrabe de Angelis, M.; Soewarto, D.; Moser, A.; Cordes, S.; Miller, D.; Chapman, V.; Weber, J. S.; Rinchik, E. M.; Hunsicker, P. R.; Russell, W. L. and Bode, V. C. (2000) Mamm Genome., 11, 484-8.
42. Weber, J. S.; Salinger, A.and Justice, M. J. (2000) Genesis, 26, 230-3.
43. Mitchison, N. A. and Clarke, B. (2008) Mamm. Genome.,
44. Nolan, P. M.; Peters, J.; Strivens, M.; Rogers, D.; Hagan, J.; Spurr, N.; Gray, I. C.; Vizor, L.; Brooker, D.; Whitehill, E.; Washbourne, R.; Hough, T.; Greenaway, S.; Hewitt, M.; Liu, X.; McCormack, S.; Pickford, K.; Selley, R.; Wells, C.; Tymowska-Lalanne, Z.; Roby, P.; Glenister, P.; Thornton, C.; Thaung, C.; Stevenson, J. A.; Arkell, R.; Mburu, P.; Hardisty, R.; Kiernan, A.; Erven, A.; Steel, K. P.; Voegeling, S.; Guenet, J. L.; Nickols, C.; Sadri, R.; Nasse, M.; Isaacs, A.; Davies, K.; Browne, M.; Fisher, E. M.; Martin, J.; Rastan, S.; Brown, S. D. and Hunter, J. (2000) Nat. Genet., 25, 440-3.
45. Hrabe de Angelis, M. H.; Flaswinkel, H.; Fuchs, H.; Rathkolb, B.; Soewarto, D.; Marschall, S.; Heffner, S.; Pargent, W.; Wuensch, K.; Jung, M.; Reis, A.; Richter, T.; Alessandrini, F.; Jakob, T.; Fuchs, E.; Kolb, H.; Kremmer, E.; Schaeble, K.; Rollinski, B.; Roscher, A.; Peters, C.; Meitinger, T.; Strom, T.; Steckler, T.; Holsboer, F.; Klopstock, T.; Gekeler, F.; Schindewolf, C.; Jung, T.; Avraham, K.; Behrendt, H.; Ring, J.; Zimmer, A.; Schughart, K.; Pfeffer, K.; Wolf, E. and Balling, R. (2000) Nat. Genet., 25, 444-7.
46. Rinchik, E. M. (2000) Mamm Genome., 11, 489-99.
47. Kile, B. T. and Hilton, D. J. (2005) Nat. Rev. Genet., 6, 557-67.
48. Potter, M. D.; Klebig, M. L.; Carpenter, D. A. and Rinchik, E. M. (1995) Mamm Genome., 6, 70-5.
49. Rinchik, E. M. and Carpenter, D. A. (1993) Mamm Genome., 4, 349-53.
50. Rinchik, E. M.; Carpenter, D. A. and Selby, P. B. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87, 896-900.
51. Kile, B. T.; Hentges, K. E.; Clark, A. T.; Nakamura, H.; Salinger, A. P.; Liu, B.; Box, N.; Stockton, D. W.; Johnson, R. L.; Behringer, R. R.; Bradley, A. and Justice, M. J. (2003) Nature, 425, 81-6.
52. Zheng, B.; Sage, M.; Cai, W. W.; Thompson, D. M.; Tavsanli, B. C.; Cheah, Y. C. and Bradley, A. (1999) Nat. Genet., 22, 375-8.
53. Hentges, K. E.; Pollock, D. D.; Liu, B.and Justice, M. J. (2007) PLoS Genet., 3, e72.
54. Rubio-Aliaga, I.; Soewarto, D.; Wagner, S.; Klaften, M.; Fuchs, H.; Kalaydjiev, S.; Busch, D. H.; Klempt, M.; Rathkolb, B.; Wolf, E.; Abe, K.; Zeiser, S.; Przemeck, G. K.; Beckers, J. and de Angelis, M. H. (2007) Genetics, 175, 1451-63.
55. Carpinelli, M. R.; Hilton, D. J.; Metcalf, D.; Antonchuk, J. L.; Hyland, C. D.; Mifsud, S. L.; Di Rago, L.; Hilton, A. A.; Willson, T. A.; Roberts, A. W.; Ramsay, R. G.; Nicola, N. A. and Alexander, W. S. (2004) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 6553-8.
56. Curtis, D. J. (2004) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 7209-10.
57. Speca, D. J.; Rabbee, N.; Chihara, D.; Speed, T. P. and Peterson, A. S. (2006) Genes Brain Behav., 5, 19-28.
58. Tchekneva, E. E.; Rinchik, E. M.; Polosukhina, D.; Davis, L. S.; Kadkina, V.; Mohamed, Y.; Dunn, S. R.; Sharma, K.; Qi, Z.; Fogo, A. B. and Breyer, M. D. (2007) J. Am. Soc. Nephrol., 18, 103-12.
59. Mohan, S.; Baylink, D. J. and Srivastava, A. K. (2008) Bone, 42, 388-95.
60. Matera, I.; Watkins-Chow, D. E.; Loftus, S. K.; Hou, L.; Incao, A.; Silver, D. L.; Rivas, C.; Elliott, E. C.; Baxter, L. L. and Pavan, W. J. (2008) Hum. Mol. Genet.,
61. Brown, S. D.; Hancock, J. M. and Gates, H. (2006) PLoS Genet., 2, e118.
62. Rogers, D. C.; Peters, J.; Martin, J. E.; Ball, S.; Nicholson, S. J.; Witherden, A. S.; Hafezparast, M.; Latcham, J.; Robinson, T. L.; Quilter, C. A. and Fisher, E. M. (2001) Neurosci. Lett., 306, 89-92.
63. Irwin, S. (1968) Psychopharmacologia, 13, 222-57.
64. Flaswinkel, H.; Alessandrini, F.; Rathkolb, B.; Decker, T.; Kremmer, E.; Servatius, A.; Jakob, T.; Soewarto, D.; Marschall, S.; Fella, C.; Behrendt, H.; Ring, J.; Wolf, E.; Balling, R.; Hrabe de Angelis, M. and Pfeffer, K. (2000) Mamm Genome., 11, 526-7.
65. Rathkolb, B.; Decker, T.; Fuchs, E.; Soewarto, D.; Fella, C.; Heffner, S.; Pargent, W.; Wanke, R.; Balling, R.; Hrabe de Angelis, M.; Kolb, H. J. and Wolf, E. (2000) Mamm Genome., 11, 543-6.
66. Fuchs, H.; Schughart, K.; Wolf, E.; Balling, R. and Hrabe de Angelis, M. (2000) Mamm Genome., 11, 528-30.
67. Brown, S. D.; Chambon, P. and de Angelis, M. H. (2005) Nat. Genet., 37, 1155.
68. Bogue, M. A. and Grubb, S. C. (2004) Genetica, 122, 71-4.
69. Grubb, S. C.; Churchill, G. A. and Bogue, M. A. (2004) Bioinformatics, 20, 2857-9.
70. Gailus-Durner, V.; Fuchs, H.; Becker, L.; Bolle, I.; Brielmeier, M.; Calzada-Wack, J.; Elvert, R.; Ehrhardt, N.; Dalke, C.; Franz, T. J.; Grundner-Culemann, E.; Hammelbacher, S.; Holter, S. M.; Holzlwimmer, G.; Horsch, M.; Javaheri, A.; Kalaydjiev, S. V.; Klempt, M.; Kling, E.; Kunder, S.; Lengger, C.; Lisse, T.; Mijalski, T.; Naton, B.; Pedersen, V.; Prehn, C.; Przemeck, G.; Racz, I.; Reinhard, C.; Reitmeir, P.; Schneider, I.; Schrewe, A.; Steinkamp, R.; Zybill, C.; Adamski, J.; Beckers, J.; Behrendt, H.; Favor, J.; Graw, J.; Heldmaier, G.; Hofler, H.; Ivandic, B.; Katus, H.; Kirchhof, P.; Klingenspor, M.; Klopstock, T.; Lengeling, A.; Muller, W.; Ohl, F.; Ollert, M.; Quintanilla-Martinez, L.; Schmidt, J.; Schulz, H.; Wolf, E.; Wurst, W.; Zimmer, A.; Busch, D. H. and de Angelis, M. H. (2005) Nat. Methods, 2, 403-4.
71. Argmann, C. A.; Chambon, P. and Auwerx, J. (2005) Cell Metab., 2, 349-60.
72. Masuya, H.; Yoshikawa, S.; Heida, N.; Toyoda, T.; Wakana, S. and Shiroishi, T. (2007) J. Bioinform. Comput. Biol., 5, 1173-91.
73. Baker, E. J.; Galloway, L.; Jackson, B.; Schmoyer, D. and Snoddy, J. (2004) BMC Bioinformatics, 5, 11.
74. Standards of Mouse Model Phenotyping, Wiley-VCH: Weinheim 2006.
75. Petkov, P. M.; Ding, Y.; Cassell, M. A.; Zhang, W.; Wagner, G.; Sargent, E. E.; Asquith, S.; Crew, V.; Johnson, K. A.; Robinson, P.; Scott, V. E. and Wiles, M. V. (2004) Genome. Res., 14, 1806-11.
76. Beck, J. A.; Lloyd, S.; Hafezparast, M.; Lennon-Pierce, M.; Eppig, J. T.; Festing, M. F. and Fisher, E. M. (2000) Nat. Genet., 24, 23-5.
77. Lane, P. W.; Searle, A. G.; Beechey, C. V. and Eicher, E. (1981) J. Hered, 72, 409-12.
78. Botstein, D.; White, R. L.; Skolnick, M. and Davis, R. W. (1980) Am. J. Hum. Genet., 32, 314-31.
79. Jeffreys, A. J.; Brookfield, J. F. and Semeonoff, R. (1985) Nature, 317, 818-9.
80. Weber, J. L. and May, P. E. (1989) Am. J. Hum. Genet., 44, 388-96.
81. Klaften, M. and Hrabe de Angelis, M. (2005) Nucleic Acids Res., 33, W496-500.
82. Birney, E. (2003)Cold Spring Harb Symp. Quant. Biol., 68, 213-5.
83. Wolfsberg, T. G. (2007) Curr. Protoc. Bioinformatics, Chapter 1, Unit 1 5.
84. Toyoda, T.; Mochizuki, Y.; Player, K.; Heida, N.; Kobayashi, N. and Sakaki, Y. (2007) Bioinformatics, 23, 524-6.
85. Kent, W. J.; Sugnet, C. W.; Furey, T. S.; Roskin, K. M.; Pringle, T. H.; Zahler, A. M. and Haussler, D. (2002) Genome. Res., 12, 996-1006.
86. Shaw, D. (2004) Curr. Protoc. Bioinformatics, Chapter 1, Unit 1 7.
87. Kobayashi, N. and Toyoda, T. (2008) Bioinformatics, 24, 1002-10.
88. Chen, Y.; Schimenti, J. and Magnuson, T. (2000) Mamm Genome., 11, 598-602.
89. Vivian, J. L.; Chen, Y.; Yee, D.; Schneider, E. and Magnuson, T. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99, 15542-7.
90. Grimm, S. (2004) Nat. Rev. Genet., 5, 179-89.
91. Becker, S.; de Angelis, M. H. and Beckers, J. (2006) Methods Mol. Biol,. 329, 397-407.
92. Marschall, S. and Hrabe de Angelis, M. (1999) Trends Genet., 15, 128-31.
93. Marschall, S.; Huffstadt, U.; Balling, R. and Hrabe de Angelis, M. (1999) Mamm Genome., 10, 773-6.
94. Glenister, P. H. and Thornton, C. E. (2000) Mamm Genome., 11, 565-71.
95. Graw, J.; Klopp, N.; Loster, J.; Soewarto, D.; Fuchs, H.; Becker-Follmann, J.; Reis, A.; Wolf, E.; Balling, R. and Habre de Angelis, M. (2001) Genetics., 157, 1313-20.
96. Klopp, N.; Favor, J.; Loster, J.; Lutz, R. B.; Neuhauser-Klaus, A.; Prescott, A.; Pretsch, W.; Quinlan, R. A.; Sandilands, A.; Vrensen, G. F. and Graw, J. (1998) Genomics., 52, 152-8.
97. Kasarskis, A.; Manova, K. and Anderson, K. V. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95, 7485-90.
98. Garcia-Garcia, M. J.; Eggenschwiler, J. T.; Caspary, T.; Alcorn, H. L.; Wyler, M. R.; Huangfu, D.; Rakeman, A. S.; Lee, J. D.; Feinberg, E. H.; Timmer, J. R. and Anderson, K. V. (2005) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 102, 5913-9.
99. Zarbalis, K.; May, S. R.; Shen, Y.; Ekker, M.; Rubenstein, J. L. and Peterson, A. S. (2004) PLoS Biol., 2, E219.
100. Hoebe, K. and Beutler, B. (2008) Adv. Drug. Deliv. Rev., 60, 824-9.
101. Rinchik, E. M.; Carpenter, D. A. and Johnson, D. K. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99, 844-9.
102. Kalff-Suske, M.; Wild, A.; Topp, J.; Wessling, M.; Jacobsen, E. M.; Bornholdt, D.; Engel, H.; Heuer, H.; Aalfs, C. M.; Ausems, M. G.; Barone, R.; Herzog, A.; Heutink, P.; Homfray, T.; Gillessen-Kaesbach, G.; Konig, R.; Kunze, J.; Meinecke, P.; Muller, D.; Rizzo, R.; Strenge, S.; Superti-Furga, A. and Grzeschik, K. H. (1999) Hum. Mol. Genet., 8, 1769-77.
103. Wild, A.; Kalff-Suske, M.; Vortkamp, A.; Bornholdt, D.; Konig, R. and Grzeschik, K. H. (1997) Hum. Mol. Genet., 6, 1979-84.
104. Aigner, B.; Rathkolb, B.; Herbach, N.; de Angelis, M. H.; Wanke, R. and Wolf, E. (2008) Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab., 294, E232-E240.
105. Inoue, M.; Sakuraba, Y.; Motegi, H.; Kubota, N.; Toki, H.; Matsui, J.; Toyoda, Y.; Miwa, I.; Terauchi, Y.; Kadowaki, T.; Shigeyama, Y.; Kasuga, M.; Adachi, T.; Fujimoto, N.; Matsumoto, R.; Tsuchihashi, K.; Kagami, T.; Inoue, A.; Kaneda, H.; Ishijima, J.; Masuya, H.; Suzuki, T.; Wakana, S.; Gondo, Y.; Minowa, O.; Shiroishi, T. and Noda, T. (2004) Hum. Mol. Genet., 13, 1147-57.
106. Aigner, B.; Rathkolb, B.; Mohr, M.; Klempt, M.; Hrabe de Angelis, M. and Wolf, E. (2007) Lipids, 42, 731-737.
107. Aigner, B.; Rathkolb, B.; Herbach, N.; Kemter, E.; Schessl, C.; Klaften, M.; Klempt, M.; de Angelis, M. H.; Wanke, R. and Wolf, E. (2007) Am. J. Physiol. Renal. Physiol., 292, F1560-7.
108. Rathkolb, B.; Tran, T. V.; Klempt, M.; Hrabe de Angelis, M.; Wanke, R.; Wolf, E. and Aigner, B. (2005) Nephron. Exp. Nephrol., 100, e143-9.
109. Cook, M. C.; Vinuesa, C. G. and Goodnow, C. C. (2006) Curr. Opin Immunol., 18, 627-33.
110. Pinto, L. H.; Vitaterna, M. H.; Siepka, S. M.; Shimomura, K.; Lumayag, S.; Baker, M.; Fenner, D.; Mullins, R. F.; Sheffield, V. C.; Stone, E. M.; Heffron, E. and Takahashi, J. S. (2004) Vision Res., 44, 3335-45.
111. Thaung, C.; West, K.; Clark, B. J.; McKie, L.; Morgan, J. E.; Arnold, K.; Nolan, P. M.; Peters, J.; Hunter, A. J.; Brown, S. D.; Jackson, I. J. and Cross, S. H. (2002) Hum. Mol. Genet., 11, 755-67.
112. Brown, S. D.; Hardisty-Hughes, R. E. and Mburu, P. (2008) Nat. Rev. Genet., 9, 277-90.
113. Srivastava, A. K.; Mohan, S.; Wergedal, J. E. and Baylink, D. J. (2003) Bone, 33, 179-91.
114. Hough, T. A.; Polewski, M.; Johnson, K.; Cheeseman, M.; Nolan, P. M.; Vizor, L.; Rastan, S.; Boyde, A.; Pritzker, K.; Hunter, A. J.; Fisher, E. M.; Terkeltaub, R. and Brown, S. D. (2007) J. Bone Miner. Res., 22, 1397-407.
115. Howell, G. R.; Shindo, M.; Murray, S.; Gridley, T.; Wilson, L. A. and Schimenti, J. C. (2007) Genetics, 175, 699-707.
116. Srivastava, A. K.; Kapur, S.; Mohan, S.; Yu, H.; Kapur, S.; Wergedal, J.and Baylink, D. J. (2005) J. Bone Miner. Res., 20, 1041-50.
117. Godinho, S. I. and Nolan, P. M. (2006) Eur. J. Hum. Genet., 14, 651-9.
118. Davisson, M. (2006) Mamm Genome, 17, 363-4.
119. Brown, S. D. and Balling, R. (2001) Curr. Opin. Genet. Dev., 11, 268-73.
120. Hafezparast, M.; Klocke, R.; Ruhrberg, C.; Marquardt, A.; Ahmad-Annuar, A.; Bowen, S.; Lalli, G.; Witherden, A. S.; Hummerich, H.; Nicholson, S.; Morgan, P. J.; Oozageer, R.; Priestley, J. V.; Averill, S.; King, V. R.; Ball, S.; Peters, J.; Toda, T.; Yamamoto, A.; Hiraoka, Y.; Augustin, M.; Korthaus, D.; Wattler, S.; Wabnitz, P.; Dickneite, C.; Lampel, S.; Boehme, F.; Peraus, G.; Popp, A.; Rudelius, M.; Schlegel, J.; Fuchs, H.; Hrabe de Angelis, M.; Schiavo, G.; Shima, D. T.; Russ, A. P.; Stumm, G.; Martin, J. E. and Fisher, E. M. (2003), Science, 300, 808-12.
121. Xie, G.; Clapcote, S. J.; Nieman, B. J.; Tallerico, T.; Huang, Y.; Vukobradovic, I.; Cordes, S. P.; Osborne, L. R.; Rossant, J.; Sled, J. G.; Henderson, J. T. and Roder, J. C. (2007) Genes Brain Behav., 6, 717-27.
122. Isaacs, A. M.; Oliver, P. L.; Jones, E. L.; Jeans, A.; Potter, A.; Hovik, B. H.; Nolan, P. M.; Vizor, L.; Glenister, P.; Simon, A. K.; Gray, I. C.; Spurr, N. K.; Brown, S. D.; Hunter, A. J. and Davies, K. E. (2003) J. Neurosci., 23, 1631-7.
123. Kearney, J. A.; Yang, Y.; Beyer, B.; Bergren, S. K.; Claes, L.; Dejonghe, P. and Frankel, W. N. (2006) Hum. Mol. Genet., 15, 1043-8.
124. Rudelius, M.; Osanger, A.; Kohlmann, S.; Augustin, M.; Piontek, G.; Heinzmann, U.; Jennen, G.; Russ, A.; Matiasek, K.; Stumm, G. and Schlegel, J. (2006) Acta Neuropathol., 112, 267-76.
125. Davies, V. J.; Powell, K. A.; White, K. E.; Yip, W.; Hogan, V.; Hollins, A. J.; Davies, J. R.; Piechota, M.; Brownstein, D. G.; Moat, S. J.; Nichols, P. P.; Wride, M. A.; Boulton, M. E. and Votruba, M. (2008) Brain, 131, 368-80.
126. Isaacs, A. M.; Davies, K. E.; Hunter, A. J.; Nolan, P. M.; Vizor, L.; Peters, J.; Gale, D. G.; Kelsell, D. P.; Latham, I. D.; Chase, J. M.; Fisher, E. M.; Bouzyk, M. M.; Potter, A.; Masih, M.; Walsh, F. S.; Sims, M. A.; Doncaster, K. E.; Parsons, C. A.; Martin, J.; Brown, S. D.; Rastan, S.; Spurr, N. K. and Gray, I. C. (2000) Hum. Mol. Genet., 9, 1865-71.
127. Lloyd, D. J.; Hall, F. W.; Tarantino, L. M.; Gekakis, N. (2005) PLoS Genet., 1, e20.
128. Peters, T.; Thaete, C.; Wolf, S.; Popp, A.; Sedlmeier, R.; Grosse, J.; Nehls, M. C.; Russ, A. and Schlueter, V. (2003) Hum. Mol. Genet., 12, 2109-20.
129. Freeman, H.; Shimomura, K.; Horner, E.; Cox, R. D. and Ashcroft, F. M. (2006) Cell Metab, 3, 35-45.
130. Aponte, J. L.; Sega, G. A.; Hauser, L. J.; Dhar, M. S.; Withrow, C. M.; Carpenter, D. A.; Rinchik, E. M.; Culiat, C. T. and Johnson, D. K. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 98, 641-5.
131. Wu, J. Y.; Kao, H. J.; Li, S. C.; Stevens, R.; Hillman, S.; Millington, D. and Chen, Y. T. (2004) J. Clin. Invest, 113, 434-40.
132. Toye, A. A.; Moir, L.; Hugill, A.; Bentley, L.; Quarterman, J.; Mijat, V.; Hough, T.; Goldsworthy, M.; Haynes, A.; Hunter, A. J.; Browne, M.; Spurr, N. and Cox, R. D. (2004) Diabetes, 53, 1577-83.
133. Vinuesa, C. G.; Cook, M. C.; Angelucci, C.; Athanasopoulos, V.; Rui, L.; Hill, K. M.; Yu, D.; Domaschenz, H.; Whittle, B.; Lambe, T.; Roberts, I. S.; Copley, R. R.; Bell, J. I.; Cornall, R. J. and Goodnow, C. C. (2005) Nature, 435, 452-8.
134. Grosse, J.; Chitu, V.; Marquardt, A.; Hanke, P.; Schmittwolf, C.; Zeitlmann, L.; Schropp, P.; Barth, B.; Yu, P.; Paffenholz, R.; Stumm, G.; Nehls, M. and Stanley, E. R. (2006) Blood, 107, 3350-8.
135. Yu, P.; Constien, R.; Dear, N.; Katan, M.; Hanke, P.; Bunney, T. D.; Kunder, S.; Quintanilla-Martinez, L.; Huffstadt, U.; Schroder, A.; Jones, N. P.; Peters, T.; Fuchs, H.; de Angelis, M. H.; Nehls, M.; Grosse, J.; Wabnitz, P.; Meyer, T. P.; Yasuda, K.; Schiemann, M.; Schneider-Fresenius, C.; Jagla, W.; Russ, A.; Popp, A.; Josephs, M.; Marquardt, A.; Laufs, J.; Schmittwolf, C.; Wagner, H.; Pfeffer, K. and Mudde, G. C. (2005) Immunity, 22, 451-65.
136. Huang, H. W.; Chiang, Y. J.; Hung, S. I.; Li, C. L. and Yen, J. J. (2007) J. Biomed. Sci., 14, 169-81.
137. Carpinelli, M. R.; Wicks, I. P.; Sims, N. A.; O'Donnell, K.; Hanzinikolas, K.; Burt, R.; Foote, S. J.; Bahlo, M.; Alexander, W. S. and Hilton, D. J. (2002) Am. J. Pathol., 161, 1925-33.
138. Van Agtmael, T.; Schlotzer-Schrehardt, U.; McKie, L.; Brownstein, D. G.; Lee, A. W.; Cross, S. H.; Sado, Y.; Mullins, J. J.; Poschl, E. and Jackson, I. J. (2005) Hum. Mol. Genet., 14, 3161-8.
139. Graw, J.; Loster, J.; Soewarto, D.; Fuchs, H.; Meyer, B.; Reis, A.; Wolf, E.; Balling, R. and Hrabe de Angelis, M. (2001) Invest Ophthalmol Vis. Sci., 42, 2909-15.
140. Graw, J.; Jung, M.; Loster, J.; Klopp, N.; Soewarto, D.; Fella, C.; Fuchs, H.; Reis, A.; Wolf, E.; Balling, R. and Hrabe de Angelis, M. (1999) Genomics, 62, 67-73.
141. Graw, J.; Loster, J.; Soewarto, D.; Fuchs, H.; Reis, A.; Wolf, E.; Balling, R. and Hrabe de Angelis, M. (2001) Invest Ophthalmol Vis. Sci., 42, 1574-80.
142. Liu, H.; Du, X.; Wang, M.; Huang, Q.; Ding, L.; McDonald, H. W.; Yates' J. R., 3rd; Beutler, B.; Horwitz, J. and Gong, X. (2005) J. Biol. Chem., 280, 25071-8.
143. Graw, J.; Loster, J.; Soewarto, D.; Fuchs, H.; Reis, A.; Wolf, E.; Balling, R. and Hrabe de Angelis, M. (2002) Mamm Genome, 13, 452-5.
144. Graw, J.; Neuhauser-Klaus, A.; Loster, J.; Klopp, N. and Favor, J. (2002) Genetics, 161, 1633-40.
145. Perveen, R.; Favor, J.; Jamieson, R. V.; Ray, D. W. and Black, G. C.(2007) Hum. Mol. Genet., 16, 1030-8.
146. Graw, J.; Loster, J.; Puk, O.; Munster, D.; Haubst, N.; Soewarto, D.; Fuchs, H.; Meyer, B.; Nurnberg, P.; Pretsch, W.; Selby, P.; Favor, J.; Wolf, E. and Hrabe de Angelis, M. (2005) Invest Ophthalmol Vis. Sci., 46, 4671-83.
147. Hart, A. W.; McKie, L.; Morgan, J. E.; Gautier, P.; West, K.; Jackson, I. J. and Cross, S. H. (2005) Invest Ophthalmol Vis. Sci., 46, 3443-50.
148. Jablonski, M. M.; Dalke, C.; Wang, X.; Lu, L.; Manly, K. F.; Pretsch, W.; Favor, J.; Pardue, M. T.; Rinchik, E. M.; Williams, R. W.; Goldowitz, D. and Graw, J. (2005) Mol. Vis., 11, 569-81.
149. Rhodes, C. R.; Parkinson, N.; Tsai, H.; Brooker, D.; Mansell, S.; Spurr, N.; Hunter, A. J.; Steel, K. P. and Brown, S. D. (2003) J. Neurocytol., 32, 1143-54.
150. Longo-Guess, C.; Gagnon, L. H.; Bergstrom, D. E. and Johnson, K. R. (2007) Hear Res., 234, 21-8.
151. Masuya, H.; Shimizu, K.; Sezutsu, H.; Sakuraba, Y.; Nagano, J.; Shimizu, A.; Fujimoto, N.; Kawai, A.; Miura, I.; Kaneda, H.; Kobayashi, K.; Ishijima, J.; Maeda, T.; Gondo, Y.; Noda, T.; Wakana, S.; Shiroishi, T. Hum Mol Genet, 2005, 14, 575-83.
152. Bosman, E. A.; Penn, A. C.; Ambrose, J. C.; Kettleborough, R.; Stemple, D. L. and Steel, K. P. (2005) Hum. Mol. Genet., 14, 3463-76.
153. Flenniken, A. M.; Osborne, L. R.; Anderson, N.; Ciliberti, N.; Fleming, C.; Gittens, J. E.; Gong, X. Q.; Kelsey, L. B.; Lounsbury, C.; Moreno, L.; Nieman, B. J.; Peterson, K.; Qu, D.; Roscoe, W.; Shao, Q.; Tong, D.; Veitch, G. I.; Voronina, I.; Vukobradovic, I.; Wood, G. A.; Zhu, Y.; Zirngibl, R. A.; Aubin, J. E.; Bai, D.; Bruneau, B. G.; Grynpas, M.; Henderson, J. E.; Henkelman, R. M.; McKerlie, C.; Sled, J. G.; Stanford, W. L.; Laird, D. W.; Kidder, G. M.; Adamson, S. L. and Rossant, J. (2005) Development, 132, 4375-86.
154. Runkel, F.; Marquardt, A.; Stoeger, C.; Kochmann, E.; Simon, D.; Kohnke, B.; Korthaus, D.; Wattler, F.; Fuchs, H.; Hrabe de Angelis, M.; Stumm, G.; Nehls, M.; Wattler, S.; Franz, T. and Augustin, M. (2004) Genomics, 84, 824-35.
155. Besson, V.; Nalesso, V.; Herpin, A.; Bizot, J. C.; Messaddeq, N.; Romand, R.; Puech, A.; Blanquet, V. and Herault, Y. (2005) Biol. Cell, 97, 787-98.
156. Meyer, C. W.; Korthaus, D.; Jagla, W.; Cornali, E.; Grosse, J.; Fuchs, H.; Klingenspor, M.; Roemheld, S.; Tschop, M.; Heldmaier, G.; De Angelis, M. H. and Nehls, M. (2004) Endocrinology, 145, 2531-41.
157. Clapcott, S. J.; Peters, J.; Orban, P. C.; Brambilla, R. and Graham, C. F., (2003) Mamm Genome, 14, 495-505.
158. Pask, A. J.; Kanasaki, H.; Kaiser, U. B.; Conn, P. M.; Janovick, J. A.; Stockton, D. W.; Hess, D. L.; Justice, M. J. and Behringer, R. R. (2005) Mol. Endocrinol., 19, 972-81.
159. Herron, B. J.; Lu, W.; Rao, C.; Liu, S.; Peters, H.; Bronson, R. T.; Justice, M. J.; McDonald, J. D. and Beier, D. R. (2002) Nat. Genet., 30, 185-9.