Chemical approaches to controlling intracellular protein degradation

ChemBioChem

Volumn 6, Issue 1, 2005, Pages 40-46

  Schneekloth Jr , John S ^a   Crews, Craig M ^a  

^a YALE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

Bioorganic chemistry; Chemical genetics; Protein modifications; RNA; Signal transduction

Indexed keywords

ANDROGEN RECEPTOR; ANDROSTANOLONE; CELL PROTEIN; CHIMERIC PROTEIN; DOUBLE STRANDED RNA; ESTRADIOL; ESTROGEN RECEPTOR; FK 506 BINDING PROTEIN; FUMAGILLIN; GELDANAMYCIN; HEAT SHOCK PROTEIN 90; HYPOXIA INDUCIBLE FACTOR 1; I KAPPA B ALPHA; PROTEASOME; PROTEOLYSIS TARGETING CHIMERIC MOLECULE; SMALL INTERFERING RNA; TESTOSTERONE; UBIQUITIN; UBIQUITIN PROTEIN LIGASE E3; UNCLASSIFIED DRUG;

CANCER; CHEMICAL GENETICS; DRUG STRUCTURE; DRUG TARGETING; HUMAN; KNOCKOUT GENE; NONHUMAN; POSTTRANSCRIPTIONAL GENE SILENCING; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN DEGRADATION; PROTEIN EXPRESSION; PROTEIN PROCESSING; PROTEOMICS; REACTION ANALYSIS; RNA INTERFERENCE; SHORT SURVEY; UBIQUITINATION;

ANIMALS; BENZOQUINONES; GENE SILENCING; LACTAMS, MACROCYCLIC; PROTEIN DENATURATION; PROTEIN PROCESSING, POST-TRANSLATIONAL; PROTEINS; QUINONES; RECOMBINANT PROTEINS; RNA, SMALL INTERFERING;

EID: 12344305450     PISSN: 14394227     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.200400274     Document Type: Short Survey

References (66)

1. D. M. Harvey, C. T. Caskey, Curr. Opin. Chem. Biol. 1998, 2, 512.
2. M. V. Dwek, S. A. Brooks, Curr. Cancer Drug Targets 2004, 4, 425.
3. A. C. Bishop, O. Buzko, K. M. Shokat, Trends Cell. Biol. 2001, 11, 167.
4. K. Shokat, M. Velleca, Drug Discovery Today 2002, 7, 872.
5. J. Adams, Curr. Opin. Oncol. 2002, 14, 628.
6. A. Fire, S. Xu, M. K. Montgomery, S. A. Kostas, S. E. Driver, C. C. Mello, Nature 1998, 391, 806.
7. R. Jorgensen, Trends Biotechnol. 1990, 8, 340.
8. C. Napoli, C. Lemieux, R. Jorgensen, Plant Cell 1990, 2, 279.
9. A. R. van der Krol, L. A. Mur, P. de Lange, J. N. Mol, A. R. Stuitje, Plant Mol. Biol. 1990, 14, 457.
10. M. Pal-Bhadra, U. Bhadra, J. A. Birchler, Cell 1997, 90, 479.
11. N. Romano, G. Macino, Mol. Microbiol. 1992, 6, 3343.
12. A. Fire, D. Albertson, S. W. Harrison, D. G. Moerman, Development 1991, 113, 503.
13. A. F. Dernburg, J. Zalevsky, M. P. Colaiacovo, A. M. Villeneuve, Genes Dev. 2000, 14, 1578.
14. G. J. Hannon, Nature 2002, 418, 244.
15. S. R. Eddy, Nat. Rev. Genet. 2001, 2, 919.
16. E. C. Lai, Curr. Biol. 2003, 13, R925.
17. S. I. Grewal, D. Moazed, Science 2003, 301, 798.
18. J. Blaszczyk, J. E. Tropea, M. Bubunenko, K. M. Routzahn, D. S. Waugh, D. L. Court, X. Ji, Structure (Cambridge, MA, USA) 2001, 9, 1225.
19. S. M. Hammond, E. Bernstein, D. Beach, G. J. Hannon, Nature 2000, 404, 293.
20. C. M. Crews, Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 534.
21. M. Scheffner, K. Munger, J. M. Huibregtse, P. M. Howley, EMBO J. 1992, 11, 2425.
22. P. Zhou, R. Bogacki, L. McReynolds, P. M. Howley, Mol. Cell 2000, 6, 751.
23. P. Zhou, P. M. Howley, Mol. Cell 1998, 2, 571.
24. N. Dyson, P. M. Howley, K. Munger, E. Harlow, Science 1989, 243, 934.
25. N. Dyson, P. Guida, K. Munger, E. Harlow, J. Virol. 1992, 66, 6893.
26. K. Munger, B. A. Werness, N. Dyson, W. C. Phelps, E. Harlow, P. M. Howley, EMBO J. 1989, 8, 4099.
27. C. Bai, P. Sen, K. Hofmann, L. Ma, M. Goebl, J. W. Harper, S. J. Elledge, Cell 1996, 86, 263.
28. D. M. Spencer, T. J. Wandless, S. L. Schreiber, G. R. Crabtree, Science 1993, 262, 1019.
29. P. Belshaw, S. Ho, G. Crabtree, S. Schreiber, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 4604.
30. C. DeBoer, P. A. Meulman, R. J. Wnuk, D. H. Peterson, J. Antibiot. 1970, 23, 442.
31. K. Sasaki, H. Yasuda, K. Onodera, J. Antibiot. 1979, 32, 849.
32. P. Miller, C. DiOrio, M. Moyer, R. C. Schnur, A. Bruskin, W. Cullen, J. D. Moyer, Cancer Res. 1994, 54, 2724.
33. M. B. Andrus, E. L. Meredith, B. L. Simmons, B. B. Soma Sekhar, E. J. Hicken, Org. Lett. 2002, 4, 3549.
34. M. Nakata, T. Osumi, A. Ueno, T. Kimura, T. Tamai, K. Tatsuta, Bull. Chem. Soc. Jpn. 1992, 65, 2974.
35. K. D. Carter, J. S. Panek, Org. Lett. 2004, 6, 55.
36. S. F. Martin, J. A. Dodge, L. E. Burgess, C. Limberakis, M. Hartmann, Tetrahedron 1996, 52, 3229.
37. J. S. Panek, F. Xu, A. C. Rondon, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4113.
38. L. Whitesell, E. G. Mimnaugh, B. De Costa, C. E. Myers, L. M. Neckers, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 8324.
39. C. Schneider, L. Sepp-Lorenzino, E. Nimmesgern, O. Ouerfelli, S. Danishefsky, N. Rosen, F. U. Hartl, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996, 93, 14536.
40. L. F. Stancato, A. M. Silverstein, J. K. Owens-Grillo, Y. H. Chow, R. Jove, W. B. Pratt, J. Biol. Chem. 1997, 272, 4013.
41. M. Wartmann, R. J. Davis, J. Biol. Chem. 1994, 269, 6695.
42. W. B. Pratt, Proc. Soc. Exp. Biol. Med. 1998, 277, 420.
43. W. B. Pratt, D. O. Toft, Endocr. Rev. 1997, 18, 306.
44. F. F. Zheng, S. D. Kuduk, G. Chiosis, P. N. Munster, L. Sepp-Lorenzino, S. J. Danishefsky, N. Rosen, Cancer Res. 2000, 60, 2090.
45. S. D. Kuduk, F. F. Zheng, L. Sepp-Lorenzino, N. Rosen, S. J. Danishefsky, Bioorg. Med. Chem. Lett. 1999, 9, 1233.
46. S. D. Kuduk, T. C. Harris, F. F. Zheng, L. Sepp-Lorenzino, Q. Ouerfelli, N. Rosen, S. J. Danishefsky, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2000, 10, 1303.
47. J. D. Debes, D. J. Tindall, Cancer Lett. 2002, 187, 1.
48. J. S. Schneekloth, Jr., F. N. Fonseca, M. Koldobskiy, A. Mandal, R. Deshaies, K. Sakamoto, C. M. Crews, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3748.
49. K. M. Sakamoto, K. B. Kim, R. Verma, A. Ransick, B. Stein, C. M. Crews, R. J. Deshaies, Mol. Cell. Proteomics 2003, 2, 1350.
50. K. M. Sakamoto, K. B. Kim, A. Kumagai, F. Mercurio, C. M. Crews, R. J. Deshaies, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2001, 98, 8554.
51. X. Li, Y.-H. Chang, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 12357.
52. N. Sin, L. Meng, M. Q. W. Wang, J. J. Wen, W. G. Bornmann, C. M. Crews, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997, 94, 6099.
53. A. Yaron, A. Hatzubai, M. Davis, I. Lavon, S. Amit, A. M. Manning, J. S. Andersen, M. Mann, F. Mercurio, Y. Ben-Neriah, Nature 1998, 396, 590.
54. A. Yaron, H. Gonen, I. Alkalay, A. Hatzubai, S. Jung, S. Beyth, F. Mercurio, A. M. Manning, A. Ciechanover, Y. Ben-Neriah, EMBO J. 1997, 16, 6486.
55. R. J. Deshaies, Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 1999, 15, 435.
56. A. Howell, S. J. Howell, D. G. Evans, Cancer Chemother. Pharmacol. 2003, 52 Suppl 1, S39.
57. Y. Yanai, K. Irie, H. Ohigashi, P. A. Wender, Bioorg. Med. Chem. 1997, 5, 117.
58. D. Derossi, A. H. Joliot, G. Chassaing, A. Prochiantz, J. Biol. Chem. 1994, 269, 10444.
59. S. Fawell, J. Seery, Y. Daikh, C. Moore, L. L. Chen, B. Pepinsky, J. Barsoum, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 664.
60. W. C. Hon, M. I. Wilson, K. Harlos, T. D. Claridge, C. J. Schofield, C. W. Pugh, P. H. Maxwell, P. J. Ratcliffe, D. I. Stuart, E. Y. Jones, Nature 2002, 417, 975.
61. A. C. Epstein, J. M. Gleadle, L. A. McNeill, K. S. Hewitson, J. O'Rourke, D. R. Mole, M. Mukherji, E. Metzen, M. I. Wilson, A. Dhanda, Y. M. Tian, N. Masson, D. L. Hamilton, P. Jaakkola, R. Barstead, J. Hodgkin, P. H. Maxwell, C. W. Pugh, C. J. Schofield, P. J. Ratcliffe, Cell 2001, 107, 43.
62. M. Ohh, C. W. Park, M. Ivan, M. A. Hoffman, T. Y. Kim, L. E. Huang, N. Pavletich, V. Chau, W. G. Kaelin, Nat. Cell Biol. 2000, 2, 423.
63. K. Tanimoto, Y. Makino, T. Pereira, L. Poellinger, EMBO J. 2000, 19, 4298.
64. W. Yang, L. W. Rozamus, S. Narula, C. T. Rollins, R. Yuan, L. J. Andrade, M. K. Ram, T. B. Phillips, M. R. van Schravendijk, D. Dalgarno, T. Clackson, D. A. Holt, J. Med. Chem. 2000, 43, 1135.
65. C. T. Rollins, V. M. Rivera, D. N. Woolfson, T. Keenan, M. Hatada, S. E. Adams, L. J. Andrade, D. Yaeger, M. R. van Schravendijk, D. A. Holt, M. Gilman, T. Clackson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 7096.
66. D. Zhang, S. H. Baek, A. Ho, K. Kim, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 645.