Green fluorescent protein (GFP): Applications, structure, and related photophysical behavior

Chemical Reviews

Volumn 102, Issue 3, 2002, Pages 759-781

  Zimmer, Marc ^a  

^a The Holleran Center for Community Action and Public Policy   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AEQUOREA; CHROMOPHORE FORMATION; GREEN FLUORESCENT PROTEIN; MOLECULAR MECHANICAL CONFORMATIONAL SEARCHES; MUTANTS; PHOTODYNAMICS; PHOTOISOMERIZATION; PHOTOPHYSICAL BEHAVIOR; PROTONATION STATE; THERMOSENSITIVITY;

CHROMOPHORES; CONFORMATIONS; CRYSTAL STRUCTURE; FLUORESCENCE; FUSION REACTIONS; HYDROGEN BONDS; ISOMERIZATION; MOLECULAR DYNAMICS; PH EFFECTS; PHOTOCHEMICAL REACTIONS; QUANTUM THEORY; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

PROTEINS;

GREEN FLUORESCENT PROTEIN; PHOTOPROTEIN;

CHEMISTRY; PHOTOCHEMISTRY; PROTEIN CONFORMATION; REVIEW;

GREEN FLUORESCENT PROTEINS; LUMINESCENT PROTEINS; PHOTOCHEMISTRY; PROTEIN CONFORMATION;

EID: 0036489443     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr010142r     Document Type: Article

References (258)

1. Chalfie, M. Photochem. Photobiol. 1995, 62, 651-656.
2. Cubitt, A. B.; Heim, R.; Adams, S. R.; Boyd, A. E.; Gross, L. A.; Tsien, R. Y. TIBS 1995, 20, 448-455.
3. Gerdes, H.-H.; Kaether, C. FEBS Lett. 1996, 389, 44-47.
4. Tsien, R. Annu. Rev. Biochem. 1998, 67, 510-544.
5. Kendall, J. M.; Badminton, M. N. TIBTECH 1998, 16, 216-224.
6. Leffel, S. M.; Mabon, S. A.; Steward, J., C. N. Biotechniques 1997, 23, 912-918.
7. Phillips, G. N. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 821-827.
8. Naylor, L. H. Biochem. Pharmacol. 1999, 58, 749-757.
9. Misteli, T.; Spector, D. L. Nat. Biotechnol. 1997, 15, 961-964.
10. Taylor, D. L.; Woo, E. S.; Giuliano, K. A. Curr. Opin. Biotechnol. 2001, 12, 75-81.
11. Green Fluorescent Protein: Properties, Applications, and Protocols; Chalfie, M., Kain, S., Eds.; Wiley-Liss: New York, 1998.
12. Green Fluorescent Protein; Conn, P. M., Ed.; Academic Press: San Diego, 1999; Vol. 302.
13. Green Fluorescent Protein: Methods in Cell Biology; Sullivan, K. F., Kay, S. A., Eds.; Academic Press: San Diego, 1998; Vol. 58.
14. Matus, A. Trends Cell Biol. 1999, 9, 43-43.
15. Matus, A. Trends Cell Biol. 2001, 11, 183.
16. Harvey, E. N. Bioluminescence; Academic Press: New York, 1952.
17. Hastings, J. W.; Morin, J. G. In Green Fluorescent Protein; Chalfie, M., Kain, S., Eds.; Wiley-Liss: New York, 1998.
18. Shimomura, O. In Green Fluorescent Protein; Chalfie, M., Kain, S., Eds.; Wiley-Liss: New York, 1998.
19. Prasher, D. C.; Eckenrode, V. K.; Ward, W. W.; Pendergast, F. G.; Cormier, M. J. Gene 1992, 111, 229-233.
20. Chalfie, M.; Tu, Y.; Euskirchen, G.; Ward, W. W.; Prasher, D. C. Science 1994, 263, 802-805.
21. Davenport, D.; Nicol, J. A. C. Proc. R. Soc. London, Ser. B 1955, 144, 399-411.
22. Shimomura, O.; Musicki, B.; Kishi, Y. Biochem. J. 1988, 251, 405-410.
23. Shimomura, O. Biol. Bull. 1995, 189, 1-5.
24. Morin, J. G.; Hastings, J. W. J. Cell Physiol. 1971, 77, 313-318.
25. Ward, W. W. Photochem. Photobiol. Rev. 1979, 1-57.
26. Morise, H.; Shimomura, O.; Johnson, F. H.; Winant, J. Biochemistry 1974, 13, 2656-2662.
27. Head, J. F.; Inouye, S.; Teranishi, K.; Shimomura, O. Nature 2000, 405, 372-376.
28. Shimomura, O. FEBS Lett. 1979, 104, 220-222.
29. Cody, C. W.; Prasher. D. C.; Westler, W. M.; Pendergast, F. G.; Ward, W. W. Biochemistry 1993, 32, 1212-1218.
30. Yang, F.; Moss, L.; Phillips, G. Nat. Biotechnol. 1996, 14, 1246-1251.
31. Ormoe, M.; Cubit, A. B.; Kallio, K.; Gross, L. A.; Tsien, R. Y.; Remington, S. J. Science 1996, 273, 1392-1395.
32. Rao, B.; Kemple, M.; Pendergast, F. Biophys. J. 1980, 32, 630-632.
33. Ward, W. W. B., S. H. Biochemistry 1982, 21, 4535-4540.
34. Dopf, J.; Horiagon, T. M. Gene 1996, 173, 39-44.
35. Li, X.; Zhang, G.; Ngo, N.; Zhao, X.; Kain, S.; Huang, C.-C. J. Biol. Chem. 1997, 272, 28545-28549.
36. Brejc, K.; Sixma, T. K.; Kitts, P. A.; Kain, S. R.; Tsien, R. Y.; Ormoe, M.; Remington, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. 1997, 94, 2306-2311.
37. Yang, F.; Moss, L. G.; Phillips, G. N. J. Nat. Biotechnol. 1996, 14, 1246-1251.
38. Heim, R.; Prasher, D. C.; Tsien, R. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 12501-12504.
39. Nishiuchi, Y. I., T.; Nishio, H.; Bodi, J.; Kimura, T.; Tsuji, F. I.; Sakakiara, S. Proc. Natl. Acad. Sci U.S.A. 1998, 95, 13549-13554.
40. Bokman, S. H.; Ward, W. W. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1981, 101, 1372-1380.
41. Crameri, A.; Whitehorn, E. A.; Tate, E.; Stemmer W. P. C. Nat. Biotechnol. 1996, 14, 315-319.
42. Reid, B. G.; Flynn, G. C. Biochemistry 1997, 36, 6786-6791.
43. Makino, Y.; Amada, K.; Taguchi, H.; Yoshida, M. J. Biol. Chem. 1997, 272, 12468-12474.
44. Bokman, S. H.; Ward, W. W. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1981, 101, 1372-1380.
45. Kane, J. F.; Hartley, D. L. Trends Biotechnol. 1988, 14, 95-101.
46. Cormack, B. P.; Valdiva, R. H.; Falkow, S. Gene 1996, 173, 33-38.
47. Siemering, K. R.; Globik, R.; Sever, R.; Haselhoff, J. Curr. Biol. 1996, 6, 1653-1663.
48. Kimata, Y.; Lim, C. R.; Kohna, K. In Green Fluorescent Protein; Conn, P. M., Ed.; Academic Press: San Diego, 1999; Vol. 302.
49. Delagrave, S.; Hawith, R. E.; Silva, C. M.; Yang, M. M.; Youvan, D. C. bio/technology 1995, 13, 151-154.
50. Heim, R.; Tsien, R. Curr. Biol. 1996, 6, 178-182.
51. Yang, T.-T.; Sinai, P.; Green, G.; Kitts, P. A.; Chen, Y.-H.; Lybarger, L.; Chervenak, R.; Patterson, G. H.; Piston, D. W.; Kain, S. R. J. Biol., Chem. 1998, 273, 8212-8216.
52. Cubbit, A. B.; Woolenweber, L. A.; Heim, R. Methods Cell Biol. 1999, 58, 19-30.
53. Fukuda, H.; Arai, M.; Kuwajima, K. Biochemistry 2000, 39, 12025-12032.
54. Sacchetti, A.; El Sewedy, T.; Nasr, A. F.; Alberti, S. FEBS Lett. 2001, 492, 151-151.
55. Sacchetti, A.; Cappetti, V.; Marra, P.; Dell'Arciprete, R.; El Sewedy, T.; Crescenzi, C.; Alberti, S. J. Cell. Biochem. 2001, 117-128.
56. Sakikawa, C.; Taguchi, H.; Makino, Y.; Yoshida, M. J. Biol. Chem. 1999, 21251-21256.
57. Weber-Ban, E. U.; Reid, B. G.; Miranker, A. D.; Horwich, A. L. Nature 1999, 401, 90-93.
58. Battistutta, R.; Negro, A.; Zanotti, G. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2000, 41, 429-437.
59. Palm, G. J.; Zdanov, A.; Gaitanaris, G. A.; Stauber, R.; Pavlakis, G. N.; Wlodawer, A. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 361-365.
60. Branchini, B. R.; Nemser, A. R.; Zimmer, M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 1-6.
61. Merkel, J. S.; Regan, L. J. Biol. Chem. 2000, 275, 29200-29206.
62. This reference was deleted on revision.
63. Helms, V.; Straatsma, T. P.; McCammon, J. A. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 3263-3269.
64. Baird, G. S.; Zacharias, D. A.; Tsien, R. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 11241-11246.
65. Ghosh, I.; Hamilton, A. D.; Regan, L. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5658-5659.
66. Nagai, T.; Sawano, A.; Park, E. S.; Miyawaki, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 3197-3202.
67. Abedi, M. R.; Caponigro, G.; Kamb, A. Nucleic Acid Res. 1998, 26, 623-630.
68. Chiang, C. F.; Okou, D. T.; Griffin, T. B.; Verret, C. R.; Williams, M. N. V. Arch. Biochem. Biophys. 2001, 394, 229-235.
69. Schwede, T. F.; Retey, J.; Schulz, G. E. Biochemistry 1999, 38, 5355-5361.
70. Donnelly, M.; Fedeles, F.; Wirstam, M.; Siegbahn, P. E. M.; Zimmer, M. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4679-4686.
71. Heim, R.; Cubitt, A.; Tsien, R. Y. Nature 1995, 373, 663-664.
72. Branchini, B. R.; Lusins, J. O.; Zimmer, M. J. Biomol. Struct. Dyn. 1997, 14, 441-448.
73. Zimmer, M.; Branchini, B. R.; Lusins, J. O. In Bioluminescence and chemiluminescence; Hastings, J. W., Kricka, L. J., Stanley, P. E., Eds.; John Wiley: Chichester, England, 1996; Vol. 9.
74. Remington, S. J. In Bioluminescence and Chemiluminescence, Pt. C; Methods in Enzymology; Academic Press Inc.: San Diego, 2000; Vol. 305.
75. Siegbahn, P. E. M.; Wirstam, M.; Zimmer, M. Int. J. Quantum Chem. 2001, 81, 169-186.
76. Creemers, T. M. H.; Lock, A. J.; Subramaniam, V.; Jovin, T. M.; Volker, S. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 557-560.
77. Niwa, H.; Inouye, S.; Hirano, T.; Matsuno, T.; Kojima, M.; Kubota, M.; Ohashi, M.; Tsuji, F. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 13617-13622.
78. Ward, W. W.; Prentice, H. J.; Roth, A. F.; Cody, C. W.; Reeves, S. C. Photochem. Photobiol. 1982, 35, 803-808.
79. Lossau, H.; Kummer, A.; Heinecke, R.; Poellinger-Dammer, F.; Kompa, C.; Bieser, G.; Jonsson, T.; Silva, C. M.; Yang, M. M.; Youvan, D. C.; Michel-Beyerle, M. E. Chem. Phys. 1996, 213, 1-16.
80. Kummer, A.; Wiehler, J.; Rehaber, H.; Kompa, C.; Steipe, B.; Michel-Beyerle, M. J. Phys. Chem. 2000, 104, 4791-4798.
81. Chattoraj, M.; King, B. A.; Bublitz, G. U.; Boxer, S. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 8362-8367.
82. Yazal, J. E.; Pendergast, F. G.; Shaw, D. E.; Pang, Y.-P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 11411-11416.
83. Elowitz, M. B.; Surette, M. G.; Wolf, P.-E.; Stock, J.; Leibler, S. Curr. Biol. 1997, 7, 809-812.
84. Wachter, R. M.; King, B. A.; Heim, R.; Kallio, K.; Tsien, R. Y.; Boxer, S. G.; Remington, S. J. Biochemistry 1997, 36, 9759-9765.
85. Bublitz, G.; King, B.; Boxer, S. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 9370-9371.
86. Elsliger, M. A.; Wachter, R. M.; Hanson, G. T.; Kallio, K.; Remington, S. J. Biochemistry 1999, 38, 5296-5301.
87. Scharnagl, C.; RauppKossmann, R.; Fischer, S. F. Biophys. J. 1999, 77, 1839-1857.
88. Warren, A.; Zimmer, M. J. Mol. Graphics Modell. 2001, 19, 297-303.
89. Seebacher, C.; Deeg, F.; Brauchle, C.; Wiehler, J.; Steipe, B. J. Phys. Chem. 1999, 103, 7728-7732.
90. Jung, G.; Zumbusch, A.; Brauchle, C. J. Phys. Chem. 2000, 104.
91. Ward, W. W.; Cody, C. W.; Hart, R. C.; Cormier, M. J. Photochem. Photobiol. 1980, 31, 611-615.
92. Shimomura, O. FEBS Lett. 1979, 104, 220-222.
93. McCapra, F.; Razavi, Z.; Neary, A. P. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1988, 790-791.
94. You, Y. J.; He, Y. K.; Borrows, P. E.; Forrest, S. R.; Petasis, N. A.; Thompson, M. E. Adv. Mater. 2000, 12, 1678+.
95. Kummer, A. D.; Kompa, Lossau, H.; Poellinger-Dammer, F.; Michel-Beyerle, M.-E.; Silva, C. M.; Bylina, E. J.; Coleman, W. J.; Yang, M. M.; Youvan, D. C. Chem. Phys. 1998, 237, 183-193.
96. Voityuk, A. A.; Michel-Beyerle, M.-E.; Roesch, N. Chem. Phys. Lett. 1998, 296, 269-276.
97. Chen, M. C.; Lambert, C. R.; Urgitis, J. D.; Zimmer, M. Chem. Phys. 2001, 270, 157-164.
98. Webber, N. M.; Litvinenko, K. L. Meech, S. R. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 8036-8039.
99. Weber, W.; Helms, V.; McCammon, J.; Langhoff, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 6177-6182.
100. Striker, G.; Subramaniam, V.; Seidel, C. A. M.; Volkmer, A. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 8612-8617.
101. van Thor, J.; Pierik, A.; Nugteren-Roodzant, I.; Xie, A.; Hellingwerf, K. Biochemistry 1998, 37, 16915-16921.
102. Yoo, H. Y.; Boatz, J. A.; Helms, V.; McCammon, J. A.; Langhoff, P. W. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 2850-2857.
103. Kummer, A. D.; Wiehler, J.; Rehaber, H.; Kompa, C.; Steipe, B.; MichelBeyerle, M. E. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 4791-4798.
104. Voityuk, A. A.; Michel-Beyerle, M.-E.; Roesch, N. Chem. Phys. Lett. 1997, 272, 162-167.
105. Voityuk, A. A.; Michel-Beyerele, M.-E.; Roesch, N. Chem. Phys. 1998, 231, 13-25.
106. Bell, A. F.; He, X.; Wachter, R. M.; Tonge, P. J. Biochemistry 2000, 39, 4423-4431.
107. Schellenberg, P.; Johnson, E.; Esposito, A. P.; Reid, P. J.; Parson, W. W. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 5316-5322.
108. Dickson, R. M.; Cubit, A. B.; Tsien, R. Y.; Moerner, W. E. Nature 1997, 388, 355-358.
109. Peterman, E. J. G.; Brasselet, S.; Moerner, W. E. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 10553-10560.
110. Garcia-Parajo, M. F.; Segers-Nolten, G. M. J.; Veerman, J.-A.; Greeve, J.; Hulst, N. F. v. Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 7237-7242.
111. Pierce, D. W.; HomBooher, N.; Vale, R. D. Nature 1997, 388, 338-338.
112. Pierce, D. W.; Vale, R. D. Methods Cell. Biol. 1998, 58, 49-73.
113. Jung, G.; Brauchle, C.; Zumbusch, A. J. Chem. Phys. 2001, 114, 3149-3156.
114. Harms, G. S.; Cognet, L.; Lommerse, P. H. M.; Blab, G. A.; Schmidt, T. Biophys. J. 2001, 80, 2396-2408.
115. Cinelli, R. A. G.; Pellegrini, V.; Ferrari, A.; Faraci, P.; Nifosi, R.; Tyagi, M.; Giacca, M.; Beltram, F. Appl. Phys. Lett. 2001, 79, 3353-3355.
116. Wachter. R. M.; Elsiger, M. A.; Kallio, K.; Hanson, G. T.; Remington, S. J. Structure 1998, 6, 1267-1277.
117. Griesbeck, O.; Baird, G. S.; Campbell, R. E.; Zacharias, D. A.; Tsien, R. Y. J. Biol. Chem. 2001, 276, 29188-29194.
118. Schwille, P.; Kummer, S.; Heikal, A. A.; Moerner, W. E.; Webb, W. W. Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 151-156.
119. Ehrig, T.; O'Kane, D. J.; Pendergast, F. G. FEBS Lett. 1995, 367, 163-166.
120. Palm, G. J.; Wlodawer, A. Methods Enzymol. 1999, 302, 378-394.
121. Helms, V.; Winstead, C.; Langhoff, P. W. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2000, 506, 179-189.
122. Hanazono, Y.; Yu, J. M.; Dunbar, C. E.; Emmons, R. V. B. Hum. Gene Ther. 1997, 8, 1313-1319.
123. Liu, H. S.; Jan, M. S.; Chou, C. K.; Chen, P. H.; Ke, N. J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999, 260, 712-717.
124. Wahlfors, J.; Loimas, S.; Pasanen, T.; Hakkarainen, T. Histochem. Cell. Biol. 2001, 115, 59-65.
125. Ehrmann, M. A.; Scheyhing, C. H.; Vogel, R. F. Lett. Appl. Microbiol. 2001, 32, 230-234.
126. Chiu, W.-I.; Niwa, Y.; Zeng, W.; Hirano, T.; Kobayashi, H.; Sheen, J. Curr. Biol. 1996, 6, 325-330.
127. Davis, S. J. V., R. D. Plant Mol. Biol. 1998, 36, 521-528.
128. Cormack, B. P.; Bertram, G.; Egerton, M.; Gow, N. A.; Falcow, S. Microbiology 1997, 143, 303-311.
129. Lorang. J. M.; Tuori. R. P.; Martinez, J. P.; Sawyer, T. L.; Redman, R. S.; Rollins, J. A.; Wolpert, T. J.; Johnson, K. B.; Rodriguez, R. J.; Dickman, M. B.; Ciuffetti, L. M. Appl. Environ. Microbiol. 2001, 67, 1987-1994.
130. Kirkpatrick, S. M.; Naik, R. R.; Stone, M. O. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 2867-2873.
131. Lippincott-Schwartz, J.; Snapp, E.; Kenworthy, A. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2001, 2, 444-456.
132. Bastianes, P. I. H.; Pepperkok. R. Trends Biochem. Sci. 2000, 25, 631-637.
133. Billinton, N.; Knight, A. W. Anal. Biochem. 2001, 291, 175-197.
134. Hanson, M. R.; Kohler, R. H. J. Exp. Bot. 2001, 52, 529-539.
135. Stewart, C. N. Plant Cell Rep. 2001, 20, 376-382.
136. Phillips, G. J. FEMS Microbiol. Lett. 2001, 204, 9-18.
137. Zernicka-Goetz, M.; Pines, J. Methods 2001, 24, 55-60.
138. Burd, C. G. In Applications of Chimeric Genes and Hybrid Proteins, Pt. B; Methods in Enzymology; Academic Press Inc.: San Diego, 2000; Vol. 327.
139. Ikawa, M.; Yamada, S.; Nakanishi, T.; Okabe, M. In Current Topics in Developmental Biology; Academic Press Inc.: San Diego, 1999; Vol. 44.
140. Shinbrot, E.; Spencer, C.; Natale, V.; Kain, S. R. In Applications of Chimeric Genes and Hybrid Proteins Pt. B; Methods in Enzymology; Academic Press Inc.: San Diego, 2000; Vol. 327.
141. Wouters, F. S.; Verveer, P. J.; Bastiaens, P. I. H. Trends Cell Biol. 20001, 11, 203-211.
142. Belmont, A. S. Trends Cell Biol. 2001, 11, 250-257.
143. Toomre, D.; Manstein, D. J. Trends Cell Biol. 2001, 11, 298-303.
144. Chan, A. W. S.; Chong, K. Y.; Martinovich C.; Simerly, C.; Schatten, G. Science 2001, 291, 309-312.
145. Eduardo Kac: Telepresence, Biotelematics and Transgenic Art.; GFP Bunny; Dobrila, P. T., Kostic, A., Eds.; Kibla: Maribor, Slovenia, 2000.
146. Okabe, M.; Ikawa, M.; Kominami, K.; Nakanishi, T.; Nishimune, Y. FEBS Lett. 1997, 407, 313-319.
147. Mercuri, A.; Sacchetti, A.; De Benedetti, L.; Schiva, T.; Alberti, S. Plant Sci. 2001, 161, 961-968.
148. Gory, L.; Montel, M. C.; Zagorec, M. FEMS Microbiol. Lett. 2001, 194, 127-133.
149. Dandie, C. E.; Thomas, S. M.; McClure, N. C. Lett. Appl. Microbiol. 2001, 32, 26-30.
150. Tsien, R. Y. Annu. Rev. Biochem. 1998, 67, 509-544.
151. Zhu, H. Y.; Yamada, H.; Jiang, Y. M.; Yamada, M.; Nishiyama, Y. Arch. Virol. 1999, 144, 1923-1935.
152. McLean, A. J.; Bevan, N.; Rees, S.; Milligan, G. Mol. Pharmacol. 1999, 56, 1182-1191.
153. Haraguchi, T.; Ding, D. Q.; Yamamoto, A.; Kaneda, T.; Koujin, T.; Hiraoka, Y. Cell Struct. Funct. 1999, 24, 291-298.
154. Wymer, C. L.; Fernandez-Abalos, J. M.; Doonan, J. H. Planta 2001, 212, 692-695.
155. Ward, B. M.; Moss, B. J. Virology 2001, 75, 4802-4813.
156. Martinez-Torres, A.; Miledi, R. Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 1947-1951.
157. Kanda, T.; Sullivan, K. F.; Wahl, G. M. Curr. Biol. 1998, 8, 377-385.
158. Siegel, M. S.; Isacoff, E. Y. Neuron 1997, 19, 735-741.
159. Biondi, R. M.; Baehler, P. J.; Reymond, C. D.; Vernon, M. Nucleic Acid Res. 1998, 26, 4946-4952.
160. Hink, M. A.; Griep, R. A.; Borst, J. W.; vanHoek, A.; Eppink, M. H. M.; Schots, A.; Visser, A. J. W. G. J. Biol. Chem. 2000, 275, 17556-17560.
161. Prescott, M.; Nowakowski, S.; Nagley, P.; Devendish, R. Anal. Biochem. 1999, 273, 305-307.
162. Dabrowski, S.; Brillowska-Dabrowska, A.; Kur, J. Biotechniques 2000, 29, 800-806.
163. Kotarsky, K.; Owman, C.; Olde, B. Anal. Biochem. 2001, 288, 209-215.
164. Miller, S.; Kennedy, D.; Thomson, J.; Han, F.; Smith, R.; Ing, N.; Piedrahita, J.; Busbee, D. Toxicol. Sci. 2000, 55, 69-77.
165. Sun, Y.; Wong, M. D.; Rosen, B. P. J. Biol. Chem. 2001, 276; 14955-14960.
166. Zhao, H.; Ivic, L.; Otaki, J. M.; Hashimoto, M.; Mikoshiba, K.; Firestein, S. Science 1998, 279, 237-242.
167. Josenhans, C.; Friedrich, S.; Suerbaum, S. FEMS Microbiology 1998, 161, 263-273.
168. Lemaire-Vieille, C.; Schulze, T.; Podevin-Dimster, V.; Follet, J.; Bailly, Y.; Blanquet-Grossard, F.; Decavel, J. P.; Heinen E.; Cesbron, J. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 5422-5427.
169. Miller, W. G.; Brandl, M. T.; Quinones, B.; Lindow, S. E. Appl. Environ. Microbiol. 2001, 67, 1308-1317.
170. Dumas, B.; Centis, S.; Sarrazin, N.; Esquerre-Tugaye, M. T. Appl. Environ. Microbiol. 1999, 65, 1769-1771.
171. Jacobi, C. A.; Roggenkamp, A.; Rankin, A.; Zumbihl, R.; Leitritz, L.; Heesemann, J. Mol. Microbiol. 1998, 30, 865-882.
172. Jung, S.; Aliberti, J.; Graemmel, P.; Sunshine, M. J.; Kreutzberg, G W.; Sher, A.; Littman, D. R. Mol. Cell. Biol. 2000, 20, 4106-4114.
173. Sexton, A. C.; Howlett, B. J. Physiol. Mol. Plant Pathol. 2001, 58, 13-21.
174. Li, X.; Zhao, X.; Fang, Y.; Jiang, X.; Duong, T.; Fan, C.; Huang, C.-C.; Kain, S. J. Biol. Chem. 1998, 273, 34970-34975.
175. Bastiaens, P. I. H.; Jovin, T. M. In Cell biology: A laboratory handbook; Celis, J. E., Ed.; Academic Press: 1998.
176. Jensen, K. K.; Martini, L.; Schwartz, T. W. Biochemistry 2001, 40, 938-945.
177. Pozzan, T. Nature 1997, 388, 834-835.
178. Pollok, B. A.; Heim, R. Trends Cell Biol. 1999, 9, 57-60.
179. Miyawaki, A.; Llopis, J.; Heim, R.; McCaffrey, J. M.; Adams, J. A.; Ikura, M.; Tsien, R. Y. Nature 1997, 388, 882-887.
180. Miyawaki, A.; Griesbeck, O.; Heim, R.; Tsien, R. Y. Proc. Nat. Acad. Science U.S.A. 1999, 96, 2135-2140.
181. Day, R. N. Mol. Endocrinol. 1998, 12, 1410-1419.
182. Mahajanm, N. P.; Linder, K.; Berry, G.; Gordon, G. W.; Heim, R.; Herman, B. Nat. Biotechnol. 1998, 16, 547-552.
183. Xu, X.; Gerad, A. L.; Huang, B. C.; Anderson, D. C.; Payan, D. G.; Luo, Y. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 2034-2035.
184. Suzuki, Y.; Yasunaga, T.; Ohkura, R.; Wakabayaschi, T.; Sutoh, K. Nature 1998, 396, 380-383.
185. Harpur, A. G.; Wouters, F. S.; Bastiaens, P. I. H. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 167-169.
186. Griffin, B. A.; Adams, S.; Tsien, R. Science 1998, 281, 269-272.
187. Creemers, T. M. H.; Lock, A. J.; Subramanian, V.; Jovin, T. M.; Volker, S. Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 2974-2978.
188. Pearce, L. L.; Gandley, R. E.; Han, W.; Wasserloos, K.; Stitt, M.; Kanai, A. J.; McLaughlin, M. K.; Pitt, B. R.; Levitan, E. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 477-482.
189. Persechini, A.; Lynch, J. A.; Romoser, V. A. Cell Calcium 1997, 22, 209-216.
190. Mahajan, N. P.; HarrisonShostak, D. C.; Michaux, J.; Herman, B. Chem. Biol. 1999, 6, 401-409.
191. Nagai, Y.; Miyazaki, M.; Aoki, R.; Zama, T.; Inouye, S.; Hirose, K.; Iino, M.; Higawa, M. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 313-316.
192. White, J.; Stelzer, E. Trends Cell Biol. 1999, 9, 61-65.
193. Reits, E. A. J.; Neefjes, J. J. Nat. Cell Biol. 2001, 3, E145-E147.
194. Bardeen, C. J.; Yakovlev, V. V.;Squier, J. A.; Wilson, K. R. J. Am. Chem. Soc. 1998, 13023-13027.
195. Allen, G. J.; Kwak, J. M.; Chu, S. P.; Llopis, J.; Tsien, R. Y.; Harper, J. F.; SchroederS, J. I. Plant J. 1999, 19, 735-747.
196. Emmanouilidou, E.; Teschemacher, A. G.; Pouli, E. A.; Nicholls, L. I.; Seward, E. P.; Rutter, G. A. Curr. Biol. 1999, 9, 915-918.
197. Kerr, R.; Lev-Ram, V.; Baird, G.; Vincent, P.; Tsien, R. Y.; Schafer, W. R. Neuron 2000, 26, 583-594.
198. Yu, R.; Hinkle, P. M. J. Biol. Chem. 2000, 275, 23648-23653.
199. Jaconi, M.; Bony, C.; Richards, S. M.; Terzic, A.; Arnaudeau, S.; Vassort, G.; Puceat, M. Mol. Biol. Cell 2000, 11, 1845-1858.
200. Remington, S. J. In Bioluminescence and Chemiluminescence, Pt C; Academic Press Inc.: San Diego, 2000; Vol. 305.
201. Mizuno, H.; Sawano, A.; Eli, P.; Hama, H.; Miyawaki, A. Biochemistry 2001, 40, 2502-2510.
202. Baubet, V.; Le Mouellic, H.; Campbell, A. K.; Lucas-Meunier, E.; Fossier, P.; Brulet, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 7260-7265.
203. Nakai, J.; Ohkura, M.; Imoto, K. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 137-141.
204. Wachter, R. M.; Remington, S. J. Curr. Biol. 1999, 9, R628-R629.
205. Jayaraman, S.; Haggie, P.; Wachter, R. M.; Remington, S. J.; Verkman, A. S. J. Biol. Chem. 2000, 275, 6047-6050.
206. Wachter, R. M.; Yarbrough, D.; Kallio, K.; Remington, S. J. J. Mol. Biol. 2000, 301, 157-171.
207. Li Y.; Arawal, A.; Sakon, J.; Beitle, R. R. J. Chromatogr. A 2001, 909, 183-190.
208. Richmond, T.; Takahashi, T.; Shimkhada, R.; Bernsdorf, J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2000, 268, 462-465.
209. Nordstrom, T.; Senkas, A.; Eriksson, S.; Poentynen, N.; Nordstrom, E.; Lindqvist, C. J. Biotechnol. 1999, 69, 125-133.
210. Nock, S.; Spudich, J. A.; Wagner, P. FEBS Lett. 1997, 414, 233-238.
211. Takahashi, A.; Zhang, Y. P.; Centonze, V. E.; Herman, B. Biotechniques 2001, 30, 804-812.
212. Robey, R. B.; Ruiz, O.; Santos, A. V. P.; Ma, J. F.; Kear, F.; Wang, L. J.; Li, C. J.; Bernardo, A. A.; Arruda, J. A. L. Biochemistry 1998, 37, 9894-9901.
213. Elsliger, M. A.; Wachter, R. M.; Hanson, G. T.; Kallio, K.; Remington, S. J. Biochem. Usa 1999, 38, 5296-5301.
214. Yuste, R.; Miller, R. B.; Holthoff, K.; Zhang, S.; Miesenboeck, G. In Cell Biology and Physiology; Thorner, J., Emr, S. D., Abelson, J. N., Eds.; Academic Press: San Diego, 2000; Vol. 327.
215. Moseyko, N.; Feldman L. J. Plant Cell Environ. 2001, 24, 557-563.
216. Llopis, J.; McCaffery, J. M.; Miyawaki, A.; Farquhar, M. G.; Tsien, R. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 6803-6808.
217. Takahashi, A.; Zhang, Y. P.; Centonze, V. E.; Herman, B. Biotechniques 2001, 30, 804-+.
218. Miesenboeck, G.; Angelis, D. A. D.; Rothman, J. E. Nature 1998, 394, 192.
219. Truong, K.; Ikura, M. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 573-578.
220. Wang, Y.; Wang, G.; O'Kane, D. J.; Szalay, A. A. Mol. Gen. Genet. 2001, 264, 578-587.
221. Waud, J. P.; Fajardo, A. B.; Sudhaharan, T.; Trimby, A. R.; Jeffery, J.; Jones, A.; Campbell, A. K. Biochem. J. 2001, 357, 687-697.
222. Park, S. H.; Raines, R. T. In Applications of Chimeric Genes and Hybrid Proteins, Pt. C; Methods in Enzymology; Academic Press Inc.: San Diego, 2000; Vol. 328.
223. Kiessig, S.; Reissmann, J.; Rascher, C.; Kullertz, G.; Fischer, A.; Thunecke, F. Electrophoresis 2001, 22, 1428-1435.
224. Park, S.-H.; Raines, R. T. Protein Science 1997, 6, 2344-2349.
225. Ozawa, T.; Nogami, S.; Sato, M.; Ohya, Y.; Umezawa, Y. Anal. Chem. 2000, 72, 5151-5157.
226. Endoh, H.; Walhout, A. J. M.; Vidal, M. In Applications of Chimeric Genes and Hybrid Proteins, Pt. C; Methods in Enzymology; Academic Press Inc.: San Diego, 2000; Vol. 328.
227. Chishima, T.; Miyagi, Y.; Wang X.; Baranov, E.; Tan, Y.; Shimada, H.; Moossa, A. R.; Hoffman, R. M. Clin. Exp. Metastasis 1997, 15, 547-552.
228. Chishima, T.; Miyagi, Y.; Wang, X.; Yamaoka, H.; Shimada, H.; Moossa, A. R.; Hoffman, R. M. Cancer Res. 1997, 57, 2042-2047.
229. Hoffman, R. M. Biotechniques 2001, 30, 1024-1026.
230. Yang, M.; Baranov, E.; Li, X. M.; Wang, J. W.; Jiang, P.; Li, L.; Moossa, A. R.; Penman, S.; Hoffman, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 2616-2621.
231. Rashidi, B.; Yang, M.; Jiang, P.; Baranov, E.; An, Z. L.; Wang, X.; Mossa, A. R.; Hoffman, R. M. Clin. Exp. Metastasis 2000, 18, 57-60.
232. Yang, M.; Baranov, E.; Moosa, A. R.; Penman, S.; Hoffman, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 12278-12282.
233. Coralli, C.; Cemazar, M.; Kanthou, C.; Tozer, G. M.; Dachs, G. U. Cancer Res. 2001, 61, 4784-4790.
234. Zhu, M.; Fahl, W. E. Anal. Biochem. 2000, 287, 210-217.
235. Hawley, T. S.; Telford, W. G.; Ramezani, A.; Hawley, R. G. Biotechniques 2001, 30, 1028-1034.
236. Hawley, T. S.; Telford, W. G.; Hawley, R. G. Stem Cells 2001, 19, 118-124.
237. Beavis, A.; Kalejta, R. Cytometry 1999, 37, 51-59.
238. Peelle, B.; Gururaja, T. L.; Payan, D. G.; Anderson, D. C. J. Protein Chem. 2001, 20, 507-519.
239. Matz, M. V.; Fradkov, A. F.; Labas, Y. A. Savistisky, A. P.; Zaraisky, A. G.; Markelov, M. L.; Lukyanov, S. A. Nat. Biotechnol. 1999, 17, 969-973.
240. Tsien, R. Y. Nat. Biotechnol. 1999, 17, 956-957.
241. Heikal, A. A.; Hess, S. T.; Baird, G. S.; Tsien, R. Y.; Webb, W. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 14831-14831.
242. Baird, G. S.; Zacharias, D. A.; Tsien, R. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 11984-11989.
243. Heikal, A. A.; Hess, S. T.; Baird, G. S.; Tsien, R. Y.; Webb, W. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 11996-12001.
244. Vrzheshch, P. V.; Akovbian, N. A.; Varfolomeyev, S. D.; Verkhusha, V. V. FEBS Lett. 2000, 487, 203-208.
245. Gross, L. A.; Baird, G. S.; Hoffman, R. C.; Baldridge, K. K.; Tsien, R. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 11990-11995.
246. Wiehler, J.; von Hummel, J.; Steipe, B. FEBS Lett. 2001, 487, 384-389.
247. Wall, M. A.; Socolich, M.; Ranganathan, R. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 1133-1138.
248. Yarbrough, D.; Wachter, R. M.; Kallio, K.; Matz, M. V.; Remington, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 462-467.
249. Terskikh, A.; Fradkov, A.; Ermakova, G.; Zaraisky, A.; Tan, P.; Kajava, A. V.; Zhao, X. N.; Lukyanov, S.; Matz, M.; Kim, S.; Weissman, I.; Siebert, P. Science 2000, 290, 1585-1588.
250. Fradkov A. F.; Chen, Y.; Ding, L.; Barsova, E. V.; Matz, M. V.; Lukyanov, S. A. FEBS Lett. 2000, 479, 127-130.
251. Lauf U.; Lopez, P.; Falk, M. M. FEBS Lett. 2001, 498, 11-15.
252. Wiedenmann, J.; Elke, C.; Spindler, K. D.; Funke, W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 14091-14096.
253. Lukyanov, K. A.; Fradkov, A. F.; Gurskaya, N. G.; Matz, M. V.; Labas, Y. A.; Savitsky, A. P.; Markelov, M. L.; Zaraisky, A. G.; Zhao, X. N.; Fang, Y.; Tan, W. Y.; Lukyanov, S. A. J. Biol. Chem. 2000, 275, 25879-25882.
254. Martynov, V. I.; Savitsky, A. P.; Martynova, N. Y.; Savitsky, P. A.; Lukyanov, K. A.; Lukyanov, S. A. J. Biol. Chem. 2001, 276, 21012-21016.
255. Gurskaya, N. G.; Fradkov, A. F.; Terskikh, A.; Matz, M. V.; Labas, Y. A.; Martynov, V. I.; Yanushevich, Y. G.; Lukyanov, K. A.; Lukyanov, S. A. FEBS Lett. 2001, 507, 16-20.
256. Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 235-242.
257. Ostergaard, H.; Henriksen, A.; Hansen, F. G.; Winther, J. R. EMBO J. 2001, 20, 5853-5862.
258. Griesbeck, O.; Baird, G. S.; Campbell, R. E. Tsien, R. Y. Manuscript in preparation.