RNA sequencing supports distinct reactive oxygen species-mediated pathways of apoptosis by high and low size mass fractions of Bay leaf (Lauris nobilis) in HT-29 cells

Food and Function

Volumn 6, Issue 8, 2015, Pages 2507-2524

  Rodd, Annabelle L ^a,b   Ververis, Katherine ^a,b   Sayakkarage, Dheeshana ^a   Khan, Abdul W ^a   Rafehi, Haloom ^a,b   Ziemann, Mark ^a   Loveridge, Shanon J ^a   Lazarus, Ross ^a   Kerr, Caroline ^c   Lockett, Trevor ^c   El Osta, Assam ^a,b,d   Karagiannis, Tom C ^a,b   Bennett, Louise E ^c  

^a BAKER IDI HEART AND DIABETES INSTITUTE   (Australia)

^b UNIVERSITY OF MELBOURNE   (Australia)

^c CSIRO   (Australia)

^d MONASH UNIVERSITY   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CELL CULTURE; CELL DEATH; ESSENTIAL OILS; GENE EXPRESSION; GENE EXPRESSION REGULATION; IRON; MAMMALS; NUCLEIC ACIDS; OXYGEN; RADIATION EFFECTS;

ADENOCARCINOMA CELLS; ANTI-PROLIFERATIVE; AQUEOUS FRACTIONS; DNA DOUBLE STRAND BREAKS; EQUIVALENT EFFECT; LOW MOLECULAR MASS; PRO-APOPTOTIC EFFECTS; REACTIVE OXYGEN SPECIES;

MOLECULAR BIOLOGY;

LAURUS NOBILIS; MAMMALIA;

PLANT EXTRACT; REACTIVE OXYGEN METABOLITE;

ANIMAL; APOPTOSIS; CELL CYCLE; CELL DIFFERENTIATION; CHEMISTRY; COLORECTAL NEOPLASMS; DOUBLE STRANDED DNA BREAK; DRUG EFFECTS; GENETICS; HT 29 CELL LINE; HUMAN; LAURUS; METABOLISM; MOLECULAR WEIGHT; PATHOPHYSIOLOGY; PLANT LEAF; SEQUENCE ANALYSIS;

ANIMALS; APOPTOSIS; CELL CYCLE; CELL DIFFERENTIATION; COLORECTAL NEOPLASMS; DNA BREAKS, DOUBLE-STRANDED; HT29 CELLS; HUMANS; LAURUS; MOLECULAR WEIGHT; PLANT EXTRACTS; PLANT LEAVES; REACTIVE OXYGEN SPECIES; SEQUENCE ANALYSIS, RNA;

EID: 84938767564     PISSN: 20426496     EISSN: 2042650X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5fo00467e     Document Type: Article

References (98)

1. J. Ferlay, H. R. Shin, F. Bray, D. Forman, C. Mathers and D. M. Parkin, International Agency for Research on Cancer, Lyon, France, 2010
2. C. N. Arnold A. Goel H. E. Blum C. R. Boland Cancer 2005 104 2035 2047
3. C. Esteban-Jurado M. Garre P. Vila J. J. lozano A. Pristoupilova S. Beltran A. Abuli J. Munoz F. Balaguer T. Ocana A. Castells J. M. Pique A. Carracedo C. Ruiz-Ponte X. Bessa M. Andreu L. Bujanda T. Caldes S. Castellvi-Bel World J. Gastroenterol. 2014 20 1961 1971
4. K. M. Emmons C. M. McBride E. Puleo K. I. Pollak B. H. Marcus M. Napolitano E. Clipp J. Onken F. A. Farraye R. Fletcher Prev. Med. 2005 40 527 534
5. T. Tanaka Y. Matsuo I. Kouno Int. J. Mol. Sci. 2010 11 14 40
6. I. Herr M. W. Buchler Cancer Treat. Rev. 2010 36 377 383
7. C. Fimognari P. Hrelia Mutat. Res., Rev. Mutat. Res. 2007 635 90 104
8. I. Villegas S. Sanchez-Fidalgo C. A. de la Lastra Mol. Nutr. Food Res. 2008 52 1040 1061
9. A. Bishayee Cancer Prev. Res. 2009 2 409 418
10. H. T. Saied A. M. Shamsuddin Anticancer Res. 1998 18 1479 1484
11. M. Turktekin E. Konac H. I. Onen E. Alp A. Yilmaz S. Menevse J. Med. Food 2011 14 1107 1117
12. H. Kitamura M. Cho B. H. Lee J. R. Gum B. B. Siddiki S. B. Ho N. W. Toribara T. Lesuffleur A. Zweibaum Y. Kitamura S. Yonezawa Y. S. Kim Eur. J. Cancer 1996 32A 1788 1796
13. Y. J. Lee G. Erdos Z. Z. Hou S. H. Kim J. H. Kim J. M. Cho P. M. Corry Mol. Cell. Biochem. 1994 137 141 154
14. Y. S. Huang N. Xie Q. Su J. Su C. Huang Q. J. Liao Mol. Med. Rep. 2011 4 553 559
15. S. Veeriah T. Kautenburger N. Habermann J. Sauer H. Dietrich F. Will B. L. Pool-Zobel Mol. Carcinog. 2006 45 164 174
16. K. Sakulnarmrat M. Fenech P. Thomas I. Konczak Food Chem. 2013 136 9 17
17. A. Clemente M. C. Marin-Manzano E. Jimenez M. C. Arques C. Domoney Br. J. Nutr. 2012 108 S135 S144
18. D. K. Park H. J. Park Food Sci. Biotechnol. 2012 21 683 690
19. M. L. Mollah D. K. Park H. J. Park Evidence-Based Complementary Altern. Med. 2012 249217 10.1155/2012/249217
20. I. Lavi D. Friesem S. Geresh Y. Hadar B. Schwartz Cancer Lett. 2006 244 61 70
21. E. M. Coates G. Popa C. I. Gill M. J. McCann G. J. McDougall D. Stewart I. Rowland J. Carcinog. 2007 6 4 10.1186/1477-3163-6-4
22. M. E. Juan U. Wenzel V. Ruiz-Gutierrez H. Daniel J. M. Planas J. Nutr. 2006 136 2553 2557
23. G. X. Shen C. J. Xu C. Chen V. Hebbar A. N. T. Kong Cancer Chemother. Pharmacol. 2006 57 317 327
24. C. Chen G. X. Shen V. Hebbar R. Hu E. D. Owuor A. N. T. Kong Carcinogenesis 2003 24 1369 1378
25. M. R. Loizzo R. Tundis F. Menichini A. M. Saab G. A. Stati Anticancer Res. 2007 27 3293 3299
26. L. E. Bennett M. Y. Abeywardena S. Burnard S. Forsyth R. Head K. King G. S. Patten P. Watkins R. Williams D. Zabaras T. Lockett Nutr. Cancer: Int. J. 2013 65 746 764
27. H. M. Prince M. J. Bishton R. W. Johnstone Future Oncol. 2009 5 601 612
28. S. D. Aust L. A. Morehouse C. E. Thomas J. Free Radicals Biol. Med. 1985 1 3 25
29. L. H. Long A. Hoi B. Halliwell Arch. Biochem. Biophys. 2010 501 162 169
30. P. Bellion M. Olk F. Will H. Dietrich M. Baum G. Eisenbrand C. Janzowski Mol. Nutr. Food Res. 2009 53 1226 1236
31. S. C. Roques N. Landrault P. L. Teissedre C. Laurent P. Besancon J. M. Rouant B. Caporiccio Free Radical Res. 2002 36 593 599
32. C. Ibanez A. Valdes V. Garcia-Canas C. Simo M. Celebier L. Rocamora-Reverte A. Gomez-Martinez M. Herrero M. Castro-Puyana A. Segura-Carretero E. Ibanez J. A. Ferragut A. Cifuentes J. Chromatogr. A 2012 1248 139 153
33. E. Choe D. B. Min Crit. Rev. Food Sci. Nutr. 2006 46 1 22
34. E. A. Hassoun X. Wang J. Biochem. Mol. Toxicol. 1999 13 179 185
35. G. Waris M. A. Khan S. Khan K. Alam J. Exp. Clin. Cancer Res. 2007 26 499 504
36. J. Moscat M. T. Diaz-Meco Trends Biochem. Sci. 2012 37 230 236
37. B. E. Bernstein A. Meissner E. S. Lander Cell 2007 128 669 681
38. L. J. Mah A. El-Osta T. C. Karagiannis Leukemia 2010 24 679 686
39. L. J. Mah R. S. Vasireddy M. M. Tang G. T. Georgiadis A. El-Osta T. C. Karagiannis J. Vis. Exp. 2010 10.3791/1957
40. T. C. Karagiannis A. El-Osta Cell. Mol. Life Sci. 2004 61 2137 2147
41. E. P. Rogakou W. Nieves-Neira C. Boon Y. Pommier W. M. Bonner J. Biol. Chem. 2000 275 9390 9395
42. I. H. Ismail J. P. Gagne M. C. Caron D. McDonald Z. Xu J. Y. Masson G. G. Poirier M. J. Hendzel Nucleic Acids Res. 2012 40 5497 5510
43. V. Ginjala K. Nacerddine A. Kulkarni J. Oza S. J. Hill M. Yao E. Citterio M. van Lohuizen S. Ganesan Mol. Cell. Biol. 2011 31 1972 1982
44. W. Henning H. W. Sturzbecher Toxicology 2003 193 91 109
45. H. Koehn N. Magan R. J. Isaacs K. M. Stowell Anti-Cancer Drugs 2007 18 419 425
46. H. L. Klein DNA Repair 2008 7 686 693
47. E. Raderschall K. Stout S. Freier V. Suckow S. Schweiger T. Haaf Cancer Res. 2002 62 219 225
48. M. J. Gray N. A. Dallas G. Van Buren L. Xia A. D. Yang R. J. Somcio P. Gaur L. S. Mangala P. E. Vivas-Mejia F. Fan A. M. Sanguino G. E. Gallick G. Lopez-Berestein A. K. Sood L. M. Ellis Oncogene 2008 27 7192 7200
49. M. L. Smith I. T. Chen Q. Zhan I. Bae C. Y. Chen T. M. Gilmer M. B. Kastan P. M. O'Connor A. J. Fornace Jr. Science 1994 266 1376 1380
50. A. Umar A. B. Buermeyer J. A. Simon D. C. Thomas A. B. Clark R. M. Liskay T. A. Kunkel Cell 1996 87 65 73
51. W. Chen J. Lee S. Y. Cho H. A. Fine Cancer Res. 2004 64 3949 3957
52. A. Goga D. Yang A. D. Tward D. O. Morgan J. M. Bishop Nat. Med. 2007 13 820 827
53. P. Hauser L. Ma D. Agrawal E. Haura W. D. Cress W. J. Pledger Mol. Cancer Res. 2004 2 96 104
54. A. B. Gladden J. A. Diehl Cancer Cell 2003 4 160 162
55. C. Denicourt S. F. Dowdy Genes Dev. 2004 18 851 855
56. Y. Xiong H. Zhang D. Beach Genes Dev. 1993 7 1572 1583
57. K. F. Macleod N. Sherry G. Hannon D. Beach T. Tokino K. Kinzler B. Vogelstein T. Jacks Genes Dev. 1995 9 935 944
58. J. Roman-Gomez J. A. Castillejo A. Jimenez M. G. Gonzalez F. Moreno C. Rodriguez Mdel M. Barrios J. Maldonado A. Torres Blood 2002 99 2291 2296
59. T. K. Zirbes S. E. Baldus S. P. Moenig S. Nolden D. Kunze S. T. Shafizadeh P. M. Schneider J. Thiele A. H. Hoelscher H. P. Dienes Int. J. Cancer 2000 89 14 18
60. D. Lu J. Chen T. Hai Biochem. J. 2007 401 559 567
61. C. Yan D. D. Boyd Cell Cycle 2006 5 926 929
62. N. C. Whitlock J. H. Bahn S. H. Lee T. E. Eling S. J. Baek Cancer Prev. Res. 2011 4 116 127
63. C. Yan D. Lu T. Hai D. D. Boyd EMBO J. 2005 24 2425 2435
64. C. G. James A. Woods T. M. Underhill F. Beier BMC Mol. Biol. 2006 7 30
65. F. Fan S. Jin S. A. Amundson T. Tong W. Fan H. Zhao X. Zhu L. Mazzacurati X. Li K. L. Petrik A. J. Fornace Jr. B. Rajasekaran Q. Zhan Oncogene 2002 21 7488 7496
66. D. P. Lane Nature 1992 358 15 16
67. L. Roger, G. Gadea and P. Roux, Biology of the cell/under the auspices of the European Cell Biology Organization, 2006, vol. 98, pp. 141-152
68. A. J. Levine Cell 1997 88 323 331
69. L. J. Ko C. Prives Genes Dev. 1996 10 1054 1072
70. N. S. Fearnhead J. L. Wilding W. F. Bodmer Br. Med. Bull. 2002 64 27 43
71. M. B. Kastan O. Onyekwere D. Sidransky B. Vogelstein R. W. Craig Cancer Res. 1991 51 6304 6311
72. S. J. Kuerbitz B. S. Plunkett W. V. Walsh M. B. Kastan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992 89 7491 7495
73. H. Sawai A. Yasuda N. Ochi J. Ma Y. Matsuo T. Wakasugi H. Takahashi H. Funahashi M. Sato H. Takeyama BMC Gastroenterol. 2008 8 56
74. Y. Tang C. Eng Cancer Res. 2006 66 736 742
75. H. Sun R. Lesche D. M. Li J. Liliental H. Zhang J. Gao N. Gavrilova B. Mueller X. Liu H. Wu Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 6199 6204
76. S. Kim C. Domon-Dell J. Kang D. H. Chung J. N. Freund B. M. Evers J. Biol. Chem. 2004 279 4285 4291
77. H. Yao P. Li B. J. Venters S. Zheng P. R. Thompson B. F. Pugh Y. Wang J. Biol. Chem. 2008 283 20060 20068
78. T. Wang D. Xia N. Li C. Wang T. Chen T. Wan G. Chen X. Cao J. Biol. Chem. 2005 280 4374 4382
79. C. K. Ong C. Y. Ng C. Leong C. P. Ng K. T. Foo P. H. Tan H. Huynh J. Biol. Chem. 2004 279 743 754
80. C. K. Ong C. Y. Ng C. Leong C. P. Ng C. S. Ong T. T. Nguyen H. Huynh Endocrinology 2004 145 4763 4774
81. R. Li W. Chen R. Yanes S. Lee J. A. Berliner J. Lipid Res. 2007 48 709 715
82. K. Ueda H. Arakawa Y. Nakamura Oncogene 2003 22 5586 5591
83. Z. Nemeth A. M. Szasz A. Somoracz P. Tatrai J. Nemeth H. Gyorffy A. Szijarto P. Kupcsulik A. Kiss Z. Schaff Pathol. Oncol. Res. 2009 15 533 539
84. M. Osanai M. Murata N. Nishikiori H. Chiba T. Kojima N. Sawada Cancer Res. 2006 66 9125 9133
85. T. A. Martin R. E. Mansel W. G. Jiang Int. J. Mol. Med. 2010 26 723 734
86. P. Dhawan R. Ahmad R. Chaturvedi J. J. Smith R. Midha M. K. Mittal M. Krishnan X. Chen S. Eschrich T. J. Yeatman R. C. Harris M. K. Washington K. T. Wilson R. D. Beauchamp A. B. Singh Oncogene 2011 30 3234 3247
87. S. Tabaries Z. Dong M. G. Annis A. Omeroglu F. Pepin V. Ouellet C. Russo M. Hassanain P. Metrakos Z. Diaz M. Basik N. Bertos M. Park C. Guettier R. Adam M. Hallett P. M. Siegel Oncogene 2011 30 1318 1328
88. D. E. Stange F. Engel T. Longerich B. K. Koo M. Koch N. Delhomme M. Aigner G. Toedt P. Schirmacher P. Lichter J. Weitz B. Radlwimmer GUT 2010 59 1236 1244
89. J. M. Mullin J. Exp. Zool. 1997 279 484 489
90. T. A. Martin W. G. Jiang Histol. Histopathol. 2001 16 1183 1195
91. P. J. Morin Cancer Res. 2005 65 9603 9606
92. A. Pizarro N. Benito P. Navarro J. Palacios A. Cano M. Quintanilla F. Contreras C. Gamallo Br. J. Cancer 1994 69 157 162
93. M. Takeichi Science 1991 251 1451 1455
94. U. H. Frixen J. Behrens M. Sachs G. Eberle B. Voss A. Warda D. Löchner W. Birchmeier J. Cell Biol. 1991 113 173 185
95. J. Behrens M. M. Mareel F. M. Vanroy W. Birchmeier J. Cell Biol. 1989 108 2435 2447
96. K. Vleminckx L. Vakaet M. Mareel W. Fiers F. Vanroy Cell 1991 66 107 119
97. M. C. Uzquiano V. G. Prieto J. W. Nash D. S. Ivan Y. Gong A. J. Lazar A. H. Diwan Modern Pathol. 2008 21 540 543
98. H. Rafehi A. J. Smith A. Balcerczyk M. Ziemann J. Ooi S. J. Loveridge E. K. Baker A. El-Osta T. C. Karagiannis Genes Nutr. 2012 7 343 355