Erratum: Affinity-based probes based on type II kinase inhibitors (Journal of the American Chemical Society (2012) 134 (19017-19025) DOI: 10.1021/ja306035v);Affinity-based probes based on type II kinase inhibitors

Journal of the American Chemical Society

Volumn 134, Issue 46, 2012, Pages 19017-19025

  Ranjitkar, Pratistha ^a   Perera, B Gayani K ^a   Swaney, Daniel L ^a   Hari, Sanjay B ^a   Larson, Eric T ^b   Krishnamurty, Ratika ^a   Merritt, Ethan A ^b   Villén, Judit ^a   Maly, Dustin J ^a  

^a UNIVERSITY OF WASHINGTON   (United States)

^b UNIVERSITY OF WASHINGTON SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; BINDING SITES; CELLS; CYTOLOGY; MAMMALS; MOLECULAR BIOLOGY; PROBES; SIGNAL TRANSDUCTION;

ATP-BINDING SITE; COMPLEX PROTEOMES; COVALENT MODIFICATIONS; NEW TECHNOLOGIES; SIGNAL TRANSDUCTION NETWORKS; TYPE II KINASE INHIBITOR; TYROSINE KINASE; WHOLE CELL EXTRACTS;

ENZYMES;

PHENYL GROUP; PROTEIN KINASE; TRIFLUOROMETHYLPHENYL DIAZIRINE; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME ACTIVITY; ENZYME CONFORMATION; MOLECULAR PROBE; PROTEOMICS;

EID: 84869453987     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja3120967     Document Type: Erratum

References (48)

1. Cohen, P. Nat. Cell Biol. 2002, 4, e127-e130
2. Brognard, J.; Hunter, T. Curr. Opin. Genet. Dev. 2011, 21, 4-11
3. Manning, G.; Whyte, D. B.; Martinez, R.; Hunter, T.; Sudarsanam, S. Science 2002, 298, 1912-1934
4. Bantscheff, M.; Hopf, C.; Savitski, M. M.; Dittmann, A.; Grandi, P.; Michon, A. M.; Schlegl, J.; Abraham, Y.; Becher, I.; Bergamini, G.; Boesche, M.; Delling, M.; Dumpelfeld, B.; Eberhard, D.; Huthmacher, C.; Mathieson, T.; Poeckel, D.; Reader, V.; Strunk, K.; Sweetman, G.; Kruse, U.; Neubauer, G.; Ramsden, N. G.; Drewes, G. Nat. Biotechnol. 2011, 29, 255-265
5. Brehmer, D.; Greff, Z.; Godl, K.; Blencke, S.; Kurtenbach, A.; Weber, M.; Muller, S.; Klebl, B.; Cotten, M.; Keri, G.; Wissing, J.; Daub, H. Cancer Res. 2005, 65, 379-382
6. Daub, H.; Olsen, J. V.; Bairlein, M.; Gnad, F.; Oppermann, F. S.; Korner, R.; Greff, Z.; Keri, G.; Stemmann, O.; Mann, M. Mol. Cell 2008, 31, 438-448
7. Li, J.; Rix, U.; Fang, B.; Bai, Y.; Edwards, A.; Colinge, J.; Bennett, K. L.; Gao, J.; Song, L.; Eschrich, S.; Superti-Furga, G.; Koomen, J.; Haura, E. B. Nat. Chem. Biol. 2010, l6, 291-299
8. Bach, S.; Knockaert, M.; Reinhardt, J.; Lozach, O.; Schmitt, S.; Baratte, B.; Koken, M.; Coburn, S. P.; Tang, L.; Jiang, T.; Liang, D. C.; Galons, H.; Dierick, J. F.; Pinna, L. A.; Meggio, F.; Totzke, F.; Schachtele, C.; Lerman, A. S.; Carnero, A.; Wan, Y.; Gray, N.; Meijer, L. J. Biol. Chem. 2005, 280, 31208-31219
9. Rix., U.; Remsing Rix, L. L.; Terker, A. S.; Fernbach, N. V.; Hantschel, O.; Planyavsky, M.; Breitwieser, F. P.; Herrmann, H.; Colinge, J.; Bennett, K. L.; Augustin, M.; Till, J. H.; Heinrich, M. C.; Valent, P.; Superti-Furga, G. Leukemia 2010, 24, 44-50
10. Remsing Rix, L. L.; Rix, U.; Colinge, J.; Hantschel, O.; Bennett, K. L.; Stranzl, T.; Müller, A.; Baumgartner, C.; Valent, P.; Augustin, M.; Till, J. H.; Superti-Furga, G. Leukemia 2009, 23, 477-485
11. Rix, U.; Hantschel, O.; Dürnberger, G.; Remsing Rix, L. L.; Planyavsky, M.; Fernbach, N. V.; Kaupe, I.; Bennett, K. L.; Valent, P.; Colinge, J.; Köcher, T.; Superti-Furga, G. Blood 2007, 110, 4055-4063
12. Hantschel, O.; Rix, U.; Schmidt, U.; Bürckstümmer, T.; Kneidinger, M.; Schütze, G.; Colinge, J.; Bennett, K. L.; Ellmeier, W.; Valent, P.; Superti-Furga, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 13283-13288
13. Bantscheff, M.; Eberhard, D.; Abraham, Y.; Bastuck, S.; Boesche, M.; Hobson, S.; Mathieson, T.; Perrin, J.; Raida, M.; Rau, C.; Reader, V.; Sweetman, G.; Bauer, A.; Bouwmeester, T.; Hopf, C.; Kruse, U.; Neubauer, G.; Ramsden, N.; Rick, J.; Kuster, B.; Drewes, G. Nat. Biotechnol. 2007, 25, 1035-1044
14. Wissing, J.; Jansch, L.; Nimtz, M.; Dieterich, G.; Hornberger, R.; Keri, G.; Wehland, J.; Daub, H. Mol. Cell. Proteomics 2007, 6, 537-547
15. Godl, K.; Wissing, J.; Kurtenbach, A.; Habenberger, P.; Blencke, S.; Gutbrod, H.; Salassidis, K.; Stein-Gerlach, M.; Missio, A.; Cotten, M.; Daub, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 15434-15439
16. Knockaert, M.; Gray, N.; Damiens, E.; Chang, Y. T.; Grellier, P.; Grant, K.; Fergusson, D.; Mottram, J.; Soete, M.; Dubremetz, J. F.; Le Roch, K.; Doerig, C.; Schultz, P.; Meijer, L. Chem. Biol. 2000, 7, 411-422
17. Patricelli, M. P.; Szardenings, A. K.; Liyanage, M.; Nomanbhoy, T. K.; Wu, M.; Weissig, H.; Aban, A.; Chun, D.; Tanner, S.; Kozarich, J. W. Biochemistry 2007, 46, 350-358
18. Patricelli, M. P.; Nomanbhoy, T. K.; Wu, J.; Brown, H.; Zhou, D.; Zhang, J.; Jagannathan, S.; Aban, A.; Okerberg, E.; Herring, C.; Nordin, B.; Weissig, H.; Yang, Q.; Lee, J. D.; Gray, N. S.; Kozarich, J. W. Chem. Biol. 2011, 18, 699-710
19. Cohen, M. S.; Hadjivassiliou, H.; Taunton, J. Nat. Chem. Biol. 2007, 3, 156-60
20. Shi, H.; Zhang, C. J.; Chen, G. Y.; Yao, S. Q. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 3001-3014
21. Shi, H.; Cheng, X.; Sze, S. K.; Yao, S. Q. Chem. Commun. 2011, 47, 11306-11308
22. Fischer, J. J.; Dalhoff, C.; Schrey, A. K.; Graebner, O. Y.; Michaelis, S.; Andrich, K.; Glinski, M.; Kroll, F.; Sefkow, M.; Dreger, M.; Koester, H. J. Proteomics 2011, 75, 160-168
23. Simon, G. M.; Cravatt, B. F. J. Biol. Chem. 2010, 285, 11051-11055
24. Cravatt, B. F.; Wright, A. T.; Kozarich, J. W. Annu. Rev. Biochem. 2008, 77, 383-414
25. Evans, M. J.; Cravatt, B. F. Chem. Rev. 2006, 106, 3279-3301
26. Taylor, S. S.; Bubis, J.; Toner-Webb, J.; Saraswat, L. D.; First, E. A.; Buechler, J. A.; Knighton, D. R.; Sowadski, J. FASEB J. 1988, 2, 2677-2685
27. Hanks, S. K.; Hunter, T. FASEB J. 1995, 9, 576-96
28. Wong, L.; Jennings, P. A.; Adams, J. A. Acc. Chem. Res. 2004, 37, 304-11
29. Huse, M.; Kuriyan, J. Cell 2002, 109, 275-282
30. Eswaran, J.; Knapp, S. Biochim. Biophys. Acta 2010, 1804, 429-432
31. Jura, N; Zhang, X.; Endres, N. F.; Seeliger, M. A.; Schindler, T.; Kuriyan, J. Mol. Cell 2011, 42, 9-22
32. Schindler, T.; Bornmann, W.; Pellicena, P.; Miller, W. T.; Clarkson, B.; Kuriyan, J. Science 2000, 289, 1938-1942
33. Pargellis, C.; Tong, L.; Churchill, L.; Cirillo, P. F.; Gilmore, T.; Graham, A. G.; Grob, P. M.; Hickey, E. R.; Moss, N.; Pav, S.; Regan, J. Nat. Struct. Biol. 2002, 9, 268-272
34. Liu, Y.; Gray, N. S. Nat. Chem. Biol. 2006, 2, 358-364
35. Kornev, A. P.; Haste, N. M.; Taylor, S. S.; Eyck, L. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 17783-1788
36. Zuccotto, F.; Ardini, E.; Casale, E.; Angiolini, M. J. Med. Chem. 2010, 53, 2681-94
37. DiMauro, E. F.; Newcomb, J.; Nunes, J. J.; Bemis, J. E.; Boucher, C.; Buchanan, J. L.; Buckner, W. H.; Cee, V. J.; Chai, L.; Deak, H. L.; Epstein, L. F.; Faust, T.; Gallant, P.; Geuns-Meyer, S. D.; Gore, A.; Gu, Y.; Henkle, B.; Hodous, B. L.; Hsieh, F.; Huang, X.; Kim, J. L.; Lee, J. H.; Martin, M. W.; Masse, C. E.; McGowan, D. C.; Metz, D.; Mohn, D.; Morgenstern, K. A.; Oliveira-dos-Santos, A.; Patel, V. F.; Powers, D.; Rose, P. E.; Schneider, S.; Tomlinson, S. A.; Tudor, Y. Y.; Turci, S. M.; Welcher, A. A.; White, R. D.; Zhao, H.; Zhu, L.; Zhu, X. J. Med. Chem. 2006, 49, 5671-5786
38. Ranjitkar, P.; Brock, A. M.; Maly, D. J. Chem. Biol. 2010, 17, 195-206
39. Seeliger, M. A.; Ranjitkar, P.; Kasap, C.; Shan, Y.; Shaw, D. E.; Shah, N. P.; Kuriyan, J.; Maly, D. J. Cancer Res. 2009, 69, 2384-2392
40. Brunner, J.; Senn, H.; Richards, F. M. J. Biol. Chem. 1980, 255, 3313-3318
41. Choi, Y.; Syeda, F.; Walker, J. R.; Finerty, P. J., Jr.; Cuerrier, D.; Wojciechowski, A.; Liu, Q.; Dhe-Paganon, S.; Gray, N. S. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2009, 19, 4467-4470
42. Dar, A. C.; Lopez, M. S.; Shokat, K. M. Chem. Biol. 2008, 15, 1015-1022
43. Simard, J. R.; Klüter, S.; Grütter, C.; Getlik, M.; Rabiller, M.; Rode, H. B.; Rauh, D. Nat. Chem. Biol. 2009, 5, 394-396
44. Sullivan, J. E.; Holdgate, G. A.; Campbell, D.; Timms, D.; Gerhardt, S.; Breed, J.; Breeze, A. L.; Bermingham, A.; Pauptit, R. A.; Norman, R. A.; Embrey, K. J.; Read, J.; VanScyoc, W. S.; Ward, W. H. Biochemistry 2005, 44, 16475-16490
45. Davis, M. I.; Hunt, J. P.; Herrgard, S.; Ciceri, P.; Wodicka, L. M.; Pallares, G.; Hocker, M.; Treiber, D. K.; Zarrinkar, P. P. Nat. Biotechnol. 2011, 29, 1046-1051
46. Fedorov, O.; Marsden, B.; Pogacic, V.; Rellos, P.; Muller, S.; Bullock, A. N.; Schwaller, J.; Sundstrom, M.; Knapp, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 20523-20528
47. Wodicka, L. M.; Ciceri, P.; Davis, M. I.; Hunt, J. P.; Floyd, M.; Salerno, S.; Hua, X. H.; Ford, J. M.; Armstrong, R. C.; Zarrinkar, P. P.; Treiber., D. K. Chem. Biol. 2010, 17, 1241-1249
48. Ong, S.; Kratchmarova, I.; Mann, M. J. Proteome Res. 2003, 2, 173-181