Mass spectrometry-based approaches for the detection of proteins of Staphylacoccus species

Infectious Disorders - Drug Targets

Volumn 8, Issue 3, 2008, Pages 166-182

  Ho, Yen Peng ^a   Reddy, Muralidhar P ^a  

^a NATIONAL DONG HWA UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

Chomatography; Database search; Electrophoresis; Mass spectrometry; Pathogens; Protein; Proteomics; Staphylococcus

Indexed keywords

ADHESIN; ALPHA HEMOLYSIN; ANTIBIOTIC AGENT; BACTERIAL PROTEIN; BETA LACTAM ANTIBIOTIC; CHLORTETRACYCLINE; CHOLERA TOXIN; COAGULASE; CYSTEINE PROTEINASE; EPILANCIN; MESSENGER RNA; METICILLIN; PENICILLIN BINDING PROTEIN; PENICILLIN G; PROTEIN A; PROTEINASE; STAPHYLOCOCCUS ENTEROTOXIN B; STAPHYLOCOCCUS ENTEROTOXIN C; STAPHYLOKINASE; TOXIC SHOCK SYNDROME TOXIN 1; TRIACYLGLYCEROL LIPASE; UNCLASSIFIED DRUG; VANCOMYCIN; VON WILLEBRAND FACTOR; WARNERICIN RB4; BIOLOGICAL MARKER;

ACCURACY; ANTIBACTERIAL ACTIVITY; ANTIBIOTIC RESISTANCE; BACTEREMIA; BACTERIAL CELL; BACTERIAL ENDOCARDITIS; BACTERIAL GENETICS; BACTERIAL IMMUNITY; BACTERIAL MENINGITIS; BACTERIAL PNEUMONIA; BACTERIAL SKIN DISEASE; BACTERIUM IDENTIFICATION; CAPILLARY ELECTROPHORESIS; COLLISIONALLY ACTIVATED DISSOCIATION; DEVICE INFECTION; DISEASE MARKER; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; FOOD POISONING; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; HOSPITAL INFECTION; HUMAN; IMMUNOMAGNETIC SEPARATION; INTERMETHOD COMPARISON; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; MASTITIS; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; METHICILLIN RESISTANT STAPHYLOCOCCUS AUREUS; MULTIDRUG RESISTANCE; NONHUMAN; OSTEOMYELITIS; PATHOGENESIS; PHLEBITIS; POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS; PROTEIN ANALYSIS; REVIEW; SENSITIVITY ANALYSIS; SEPARATION TECHNIQUE; SOLID PHASE EXTRACTION; STAPHYLOCOCCUS; STAPHYLOCOCCUS AUREUS; STAPHYLOCOCCUS EPIDERMIDIS; STAPHYLOCOCCUS INFECTION; STAPHYLOCOCCUS XYLOSUS; SURGICAL INFECTION; TANDEM MASS SPECTROMETRY; TOXIC SHOCK SYNDROME; TWO DIMENSIONAL GEL ELECTROPHORESIS; URINARY TRACT INFECTION; CHEMISTRY; CHROMATOGRAPHY; LABORATORY DIAGNOSIS; METHODOLOGY; MICROBIOLOGY;

BACTERIAL PROTEINS; BACTERIAL TYPING TECHNIQUES; BIOLOGICAL MARKERS; CHROMATOGRAPHY; ELECTROPHORESIS, GEL, TWO-DIMENSIONAL; HUMANS; MASS SPECTROMETRY; SPECIMEN HANDLING; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION; STAPHYLOCOCCAL INFECTIONS; STAPHYLOCOCCUS; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EID: 52449125299     PISSN: 18715265     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/1871526510808030166     Document Type: Review

References (214)

1. Burlingame, A.L.; Boyd, R.K.; Gaskell, S.J. Anal. Chem., 1996, 68, 599R.
2. Tomer, K.B. Chem. Rev., 2001, 101, 297.
3. Burlingame, A.L.; Boyd, R.K.; Gaskell, S.J. Anal. Chem., 1998, 70, 647R.
4. Smith, J.C.; Lambert, J.P.; Elisma, F.; Figeys, D. Anal. Chem., 2007, 79, 4325.
5. Lubec, G.; Sadat, L.A. Chem. Rev., 2007, 107, 3568.
6. Aebersold, R.A.; Goodlett, D.R.G.; Chem. Rev., 2001, 101, 269.
7. Lill, J.R.; Ingle, E.S.; Liu, P.S.; Pham, V.; Sandoval, W.N. Mass Spectrom. Rev. 2007, 26, 657.
8. Heck, A.J.R.; Heuvel, R.H.H. Mass Spectrom. Rev., 2004, 23, 368.
9. Gygi, S.P.; Aebersold, R. Curr. Opin. Chem. Biol., 2000, 4, 489.
10. Aebersold, R.; Mann, M. Nature, 2003, 422(6928) 198.
11. Wu, C.C.; Yates, J.R. Nat. Biotechnol., 2003, 21(3) 262.
12. Jungblut, P.; Thiede, B. Mass Spectrom. Rev., 1997, 16, 145.
13. Kopplin, P.S.; Frommberger, M. Electrophoresis, 2003, 24, 3837.
14. Hu, A.; Tsai, P.J.; Ho, Y.P. Anal. Chem., 2005, 77, 1488.
15. Hu, A.; Chen, C.T.; Tsai, P.J.; Ho, Y.P. Anal. Chem., 2006, 78, 5124.
16. Hu, A.; Lo, A.A.L.; Chen, C.T.; Lin, K.C.; Ho, Y.P. Electrophoresis, 2007, 28, 1387.
17. Ho, Y.P.; Hsu, P.H. J. Chromatogr. A, 2002, 976, 103.
18. Lo, A.A.L.; Hu, A.; Ho, Y.P. J. Mass Spectrom, 2006, 41, 1049.
19. Fenn, J.B.; Mann, M.; Meng, C.K.; Wong, S.F.; Whitehouse, C.M. Science, 1989, 246, 64.
20. Karas, M.; Hillenkamp, F. Anal. Chem., 1988, 60, 2299.
21. Baar, B.L.M. FEMS Microbiol. Rev., 2000, 24, 193.
22. Cech, N.B.; Enke, C.G. Mass Spectrom. Rev., 2001, 20, 362.
23. Andersen, J.S.; Svensson, B.; Roepstorff, P. Nat. Biotechnol., 1996, 14, 449.
24. Loo, J.A. Mass Spectrom. Rev., 1997, 16, 1.
25. Banoub, J.H.; Newton, R.P.; Esmans, E.; Ewing, D.F.; Mackenzie, G.M. Chem. Rev., 2005, 105, 1869.
26. Nordhoff, E.; Kirpekar, F.; Roepstorff, P. Mass Spectrom. Rev., 1996, 15, 67.
27. Esmans, E.L.; Broes, D.; Hoes, I.; Lemiere, F.; Vanhoutte, K. J. Chromatogr. A, 1998, 794, 109.
28. Dell, A.; Morris, H.R.; Panico, M.; Haslam, S.; Easton, R.; Khoo, K.H. Carbohydr. Eur., 1997, 10.
29. Gross, J.; Strupat, K. Trends Anal. Chem., 1998, 70, 470.
30. Yates, J.R. J. Mass Spectrom, 1998, 33, 1.
31. Larsen, M.R; Roepstorff, P. Fresenius J. Anal. Chem., 2000, 366, 677.
32. Eklund, P.; Andersson, H.O.; Kamali, M.M.; Sundstrom, L.; Flensburg, J. J. Chromatogr. A, 2003, 1009, 179.
33. Hardouin, J.; Hubert, R.M.; Delmas, A.F.; Lange, C. Rapid Commun. Mass Spectrom, 2006, 20, 725.
34. Fenyo, D.; Beavis, R.C. Mass Spectrom. Rev., 2008, 27, 1.
35. Hernandez, P.; Muller, M.; Appel, R.D. Mass Spectrom. Rev., 2006, 25, 235.
36. Carey, A. J.; Saiman, L.; Polin, R. A. Clinics in Perinatology, 2008, 35(1) 223.
37. Carmeli, Y. Clin. Microbiol. Infect., 2008, 14(3) 22.
38. Evans, C. T.; Lavela, S. L.; Weaver, F. M.; Priebe, M.; Sandford, P.; Niemiec, P.; Miskevics, S.; Parada, J. P. Infect. Control Hospital Epidemiol., 2008, 29(3) 234.
39. Wallin, T. R.; Hern, H. G.; Frazee, B. W. Emerg. Med. Clin. North Am., 2008, 26(2) 431.
40. Alder, J. Crit. Care Clin., 2008, 24(2) 349.
41. Chastre, J. Clin. Microbiol. Infect., 2008, 14(3) 3.
42. Karnani, R.; Myers, J. P. Infect. Dis. Clin. Pract., 2008, 16(2) 94.
43. Feng, Y.; Chen, C.J.; Su, L.H.; Hu, S.; Yu, J.; Chiu, C.H. FEMS Microbiol. Rev., 2007, 1.
44. Tverdek, F. P.; Crank, C. W.; Segreti, J. Crit. Care Clin., 2008, 24(2) 249.
45. Hecker, M.; Engelmann, S.; Cordwell, S.J. J. Chromatogr. B, 2003, 787, 179.
46. Deurenberg, R.H.; Vink, C.; Kalenic, S.; Friedrich, A.W.; Bruggeman, C.A.; Stobberingh, E.E. Clin. Microbiol. Infect., 2007, 13, 222.
47. Kuroda, M.; Ohta, T.; Uchiyama, I.; Baba, T.; Yuzawa, H.; Kobayashi, I.; Cui, L.; Oguchi, A.; Aoki, K.; Nagai, Y.; Lian, J.; Ito, T.; Kanamori, M.; Matsumaru, H.; Maruyama, A.; Murakami, H.; Hosoyama, A.; Mizutani-Ui, Y.; Takahashi, N.K.; Sawano, T.; Inoue, R.; Kaito, C.; Sekimizu, K.; Hirakawa, H.; Kuhara, S.; Goto, S.; Yabuzaki, J.; Kanehisa, M.; Yamashita, A.; Oshima, K.; Furuya, K.; Yoshino, C.; Shiba, T.; Hattori, M.; Ogasawara N.; Hayashi, H.; Hiramatsu, K. Lancet, 2001, 357, 1225.
48. Kulakowska, A.B.; Krzysik, A.B.; Dylag, T.; Drabik, A.; Suder, P.; Noga, M.; Jarzebinska, J.; Silberring, J. J. Chromatogr. B, 2007, 849, 1.
49. Freeman, W.M.; Hemby, S.E. Neurochem. Res., 2004, 29(6) 1065.
50. Penton, Z.E. Adv. Chromatogr., 1997, 37, 205.
51. Wang, H.; Hanash, S. Mass Spectrom. Rev., 2005, 24, 413.
52. Mozaz, S.R.; Lopez de Alda, M.J.; Barcelo, D. J. Chromatogr. A, 2007, 1152, 97.
53. Franke, J.P.; Zeeuw, R.A. J. Chromatogr. B, 1998, 713, 51.
54. Fritz, J.S.; Macka. M. J. Chromatogr. A, 2000, 902, 137.
55. Hennion, M.C. J. Chromatogr. A, 1999, 856, 3.
56. Rossi, D.T.; Zhang N. J. Chromatogr. A, 2000, 885, 97.
57. McLoughlin, D.A.; Olah, T.V.; Gilbert. J.D. J. Pharm. Biomed. Anal., 1997, 15, 1893.
58. Nielen, M.W.F.; Valk, A.J.; Frei, R.W.; Brinkman, U.A.T. J. Chromatogr., 1987, 393, 69.
59. Ekstroam, S.; Malmstrom, J.; Wallman, L.; Lofgren, M.; Nilsson, J.; Laurell, T.; Marko, V.G. Proteomics, 2002, 2, 413.
60. Bergkvist, J.; Ekstrom, S.; Wallman, L.; Lofgren, M.; Marko, V.G.; Nilsson, J.; Laurell, T. Proteomics, 2002, 2, 422.
61. Lion, N.; Rohner, T.C.; Dayon, L.; Arnaud, I.L.; Damoc, E.; Youhnovski, N.; Wu, Z.Y.; Roussel, C.; Josserand, J.; Jensen, H.; Rossier, J.S.; Przybylski, M.; Girault, H.H. Electrophoresis, 2003, 24, 3533.
62. Wallman, L.; Ekstrom, S.; Marko, V.G.; Laurel, T.; Nilsson, J. Electrophoresis, 2004, 25, 3778.
63. Gustafsson, M.; Hirschberg, D.; Palmberg, C.; Jornvall, H.; Bergman, T. Anal. Chem., 2004, 76, 345.
64. Hirschberg, D.; Jagerbrink, T.; Samskog, J.; Gustafsson, M.; Stahlberg, M.; Alvelius, G.; Husman, B.; Carlquist, M.; Jornvall, H.; Bergman, T. Anal. Chem., 2004, 76, 5864.
65. Ekstrom, S.; Wallman, L.; Malm, J.; Becker, C.; Lilja, H.; Laurell, T. Electrophoresis, 2004, 25, 3769.
66. Ekstrom, S.; Wallman, L.; Hok, D.; Marko, V.G.; Laurell, T. J. Proteome Res., 2006, 5, 1071.
67. Wenzhang, C.; Jing, S.; Xuefeng, Y.; Yingnian, Y.; Rapid Commun. Mass Spectrom., 2007, 21, 35.
68. Monton, M.R.N.; Terabe, S. J. Chromatogr. B, 2006, 841, 88.
69. Stutz, H. Electrophoresis, 2005, 26, 1254.
70. Haselberg, R.; Jong, G.J.; Somsen, G.W. J. Chromatogr. A, 2007, 1159, 81.
71. Fliser, D.; Wittke, S.; Mischak, H. Electrophoresis, 2005, 26, 2708.
72. Zhang, J.; Hu, H.; Gao, M.; Yang, P.; Zhang, X. Electrophoresis, 2004, 25, 2374.
73. Wetterhall, M.; Palmblad, M.; Hakansson, P.; Markides, K.E.; Bergquist, J. Proteome Res., 2002, 1, 361.
74. Wittke, S.; Fliser, D.; Haubitz, M.; Bartel, S.; Krebs, R.; Hausadel, F.; Hillmann, M.; Golovko, I.; Koester, P.; Haller, H.; Kaiser, T.; Mischak, H.; Weissinger, E.M. J. Chromatogr. A, 2003, 1013, 173.
75. Kaiser, T.; Hermann, A.; Kielstein, J.T.; Wittke, S.; Bartel, S.; Krebs, R.; Hausadel, F.; Hillmann, M.; Golovko, I.; Koester, P.; Haller, H.; Weissinger, E.M.; Fliser, D.; Mischak, H. J. Chromatogr. A, 2003, 1013, 157.
76. Simpson, D.C.; Smith, R.D. Electrophoresis, 2005, 26, 1291.
77. Hoehn, G.T.; Sufferdini, A.F. Crit. Care Med., 2005, 33, S444.
78. Evans, C.R.; Jorgenson, J.W. Anal. Bionanal. Chem., 2004, 378, 1952.
79. Gorg, A.; Obermaier, C.; Bought, G.; Harder, A.; Scheibe, B.; Wildgruber, R.; Wiess, W. Electrophoresis, 2000, 21, 1037.
80. Gorg, A.; Weiss, W.; Dunn, M.J. Proteomics, 2004, 4, 3665.
81. Jungblut, P.; Thiede, B. Mass Spectrom. Rev., 1997, 16, 145.
82. Rais, I.; Karas, M.; Schagger, H. Proteomics, 2004, 4, 2567.
83. Rabilloud, T. Anal. Chem., 2000, 72, 48A.
84. Nishihara, J.C.; Champion, K.M. Electrophoresis, 2002, 23, 2203.
85. Schlags, W.; Walther, M.; Masree, M.; Kratzel, M.; Noe, C.R.; Lachman, B. Electrophoresis, 2005, 26, 246.
86. Rabilloud, T.; Strub, J.M.; Luche, S.; Dorsselear, A.V.; Lunardi, J. Proteomics, 2001, 1, 699.
87. Steinberg, T.H.; Top, K.P.O.; Berggren, K.N.; Kemper, C.; Jones, L.; Diwu, Z.J.; Haugland, R.P.; Patton, W.F. Proteomics, 2001, 1, 841.
88. Steinberg, T.H.; Agnew, B.J.; Gee, K.R.; Leung, W.Y.; Goodman, T.; Hendrickson, B.; Beechem, J.M.; Haugland, R.P.; Patton, W.F. Proteomics, 2003, 3, 1128.
89. Badock, V.; Steinhusen, U.; Bommert, K.; Otto, A. Electrophoresis, 2001, 22, 2856.
90. Van, D.B.G.; Clerens, S.; Vandesande, F.; Arckens, L.; Electrophoresis, 2003, 24, 1471.
91. Butt, A.; Davison, M.D.; Smith, G.J.; Young, J.A.; Gaskell, S.J.; Oliver, S.G.; Beynon, R.J. Proteomics, 2001, 1, 42.
92. Arora, P.S.; Yamagiwa, H.; Srivastava, A.; Bolander, M.E.; Sarkar, G. J. Orthop. Sci., 2005, 10, 160.
93. Hu, L.; Ye, M.; Jiang, X.; Feng, S.; Zou, H. Anal. Chim. Acta, 2007, 598, 193.
94. Delahunty, C.; Yates, J.R. Methods, 2005, 35, 248.
95. Kislinger, T.; Gramolini, A.O.; MacLennan, D.H.; Emili, A. J. Am. Soc. Mass Spectrom, 2005, 16, 1207.
96. Bayer, E.M.; Bottrill, A.R.; Walshaw, J.; Vigouroux, M.; Naldrett, M.J.; Thomas, C.L.; Maule, A.J. Proteomics, 2006, 6, 301.
97. Cagney, G.; Park, S.; Chung, C.; Tong, B.; ODushlaine, C.; Shields, D.C.; Emili, A. J. Proteome Res., 2005, 4, 1757.
98. Zhou, X.W.; Kafsack, B.F.; Cole, R.N.; Beckett, P.; Shen, R.F.; Carruthers, V.B. J. Biol. Chem., 2005, 280, 34233.
99. Scripps Center for Mass Spectrometry, http://masspec.scripps.edu/ Services/Proteomics/salttol.php
100. Canarelli, S.; Fisch, I.; Freitag, R. J. Chromatogr. A, 2002, 948, 139.
101. Wilson, D.J.; Konermann, L. Anal. Chem., 2005, 77(21) 6887.
102. Lindberg, P.; Dahlin, A.P.; Bergstrom, S.K.; Thorslund, S.; Andren, P.E.; Nikolajeff, F.; Bergquist, J. Electrophoresis, 2006, 27(11) 2075.
103. Takats, Z.; Wiseman, J.M.; Gologan, B.; Cooks, R.G. Science, 2004, 306, 471.
104. Cooks, R.G.; Ouyang, Z.; Takats, Z.; Wiseman, J.M. Science, 2006, 311, 1566.
105. Beavis, R.C.; Chait, B.T. Rapid Commun. Mass Spectrom, 1989, 3, 432.
106. Beavis, R.C.; Chaudhary, T.; Chait, B.T. Org. Mass Spectrom, 1992, 27, 156.
107. Strupat, K.; Karas, M.; Hillenkamp, F. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes, 1991, 111 89.
108. Laugesen, S.; Roepstorff, P. J. Am. Soc. Mass Spectrom, 2003, 14, 992.
109. Vorm, O.; Roepstorff, P.; Mann, M. Anal. Chem., 1994, 66, 3281.
110. Kussmann, M.; Nordhoff, E.; Rahbek, N.H.; Haebel, S.; Rossel, L.M.; Jakobsen, L.; Gobom, J.; Mirgorodskaya, E.; Kroll, K.A.; Palm, L.; Roepstorff, P. J. Mass Spectrom, 1997, 32, 593.
111. Cohen, S.L.; Chait, B.T. Anal. Chem., 1996, 38, 31.
112. Ishihama, Y.; Rappsilber, J.; Mann, M. J. Proteome Res., 2006, 5, 988.
113. Rappsilber, J.; Ishihama, Y.; Mann, M. Anal. Chem., 2003, 75, 663.
114. Erdjument, B.H.; Lui, M.; Lacomis, L.; Grewal, A.; Annan, R.S.; McNulty D.E.; Carr, S.A.; Tempst, P. J. Chromatogr. A, 1998, 826, 167.
115. Schiffer, E.; Mischak, H.; Novak, J. Proteomics, 2006, 6, 5615.
116. Kolch, W.; Neususs, C.; Peizing, M., Mischak, H. Mass Spectrom. Rev., 2005, 24, 959.
117. Lam, M.T.; Wan, Q.H.; Boulet, C.A.; Le, X.C. J. Chromatogr. A, 1999, 853, 545.
118. Feng, H.T.; Sfy, L.; Chia, P.S.; Loke, W.K. J. Liq. Chromatogr. & Rtd. Tech., 2006, 28, 1447.
119. Palmblad, M.; Ramstrom, M.; Markides, K.E.; Hakansson, P.; Bergquist, J. Anal. Chem., 2002, 74, 5826.
120. Williams, T.L.; Leopold, P.; Musser, S. Anal. Chem., 2002, 74, 5807.
121. Dworzanski, J.P.; Snyder, P.; Chen, R.; Zhang, H.; Wishart, D.; Li, L. Anal. Chem., 2004, 76, 2355.
122. Tao, L.; Yu, X.; Snyder, P.A.; Li, L. Anal. Chem., 2004, 76, 6609.
123. Kientz, C.E.; Hulst, A.G.; Wils, E.R.J. J. Chromatogr. A, 1997, 757, 51.
124. Dinges, M.M.; Orwin, P.M.; Schlievert, P.M. Clin. Microbiol. Rev., 2000, 13, 16.
125. Bhakdi, S.; Tranum J.J. Microbiol. Rev., 1991, 55, 733.
126. Bohach, G.A.; Fast, D.J.; Nelson, R.D.; Schlievert, P.M. Crit. Rev. Microbiol., 1990, 17, 251.
127. Navarre, W.W.; Schneewind, O. Microbiol. Mol. Biol. Rev., 1999, 63, 174.
128. Simons, J.W.F.A.; Adams, H.; Cox, R.C.; Dekker, N.; Gotz, F.; Slotboom, A.J.; Verheij, H.M. Eur. J. Biochem., 1996, 242, 760.
129. Kawano, Y.; Ito, Y.; Yamakawa, Y.; Yamashino, T.; Horii, T.; Hasegawa, T.; Ohta, M. FEMS Microbiol. Lett., 2000, 189, 103.
130. Carol, J.; Gorseling, M.C.J.K.; Jong, C.F.; Lingeman, H.; Kientz, C.E.; Barr, B.L.M.; Irth, H. Anal. Biochem., 2005, 346, 150.
131. Sharkov, N.A.; Cai, D. The J. Biol. Chem., 2002, 277(8) 5796.
132. Toney, J.; Hammond, G. G.; Leiting, B.; Pryor, K.; Wu, J. K.; Cuca, G. C.; Pompliano, D.L. Anal. Biochem., 1998, 255, 113.
133. Sun, Y.; Bauer, M.D.; Lu, W. J. Mass Spectrom, 1998, 33, 1009.
134. Lu, W.P.; Sun, Y.; Bauer, M.D.; Paule, S.; Koenigs, P.M.; Kraft, W.G. Biochem., 1999, 38, 6537.
135. Mehlin, C.; Headley, C.M.; Klebanoff, S.J. J. Exp. Med., 1999, 189(6) 907.
136. Otto, M.; O'Mahoney, S.D.; Gina, T.; Klebanoff, S.J. J. Infect. Dis., 2004, 190, 748.
137. Ekkelenkamp, M.B.; Hanssen, M.; Hsu, S.T.D.; Jong, A.; Milatovic, D.; Verhoef, J.; Nuland, N.A.J. FEBS Lett., 2005, 579, 1917.
138. Minamikawa, M.; Kawai, Y.; Inoue, N.; Yamazaki. K. Curr. Microbiol., 2005, 51, 22.
139. Bera, A.; Herbert, S.; Jakob, A.; Vollmer, W.; Gotz, F. Mol. Microbiol., 2005, 55(3) 778.
140. Panchaud, A.; Widmer, E.; Kussmann, M.; Moreillon, P.; Affolter, M. Inter. J. Mass Spectrom, 2007, 268, 234.
141. Edwards, J.V.; Claydon, M.A.; Evason, D.J.; Walker, J.; Fox, A.; Gordon, D.B. J. Med. Microbiol., 2000, 49, 295.
142. Walker, J.; Fox, A.J.; Edwards V.J.; Gordon, D.B. J. Microbiol. Meth., 2002, 48, 117.
143. Jackson, K.A.; Jones, E.V.; Suttona, C.W.; Fox, A.J. J. Microbiol. Meth., 2005, 62, 273.
144. Bernardo, K.; Fleer, S.; Pakulat, N.; Krut, O.; Hunger, F.; Kronke, M. Proteomics, 2002, 2, 740.
145. Pieper, R.; Bunai, C.L.G.; Mongodin, E.F.; Parmar, P.P.; Huang, S.T.; Clark, D.J.; Fleischmann, R.D.; Gill, S.R.; Peterson, S.N. Proteomics, 2006, 6, 4246.
146. Hartleib, J.; Kohler, N.; Dickinson, R.B.; Chhatwal, G.S.; Sixma, J.J.; Hartford, O.M.; Foster, T.J.; Peters, G.; Kehrel, B.E.; Herrmann, M. Blood, 2000, 96, 2149.
147. Gomez, M.I.; Lee, A.; Reddy, B.; Muir, A.; Soong, G.; Pitt, A.; Cheung, A.; Prince, A. Nat. Med., 2004, 10, 842.
148. Palmqvist, N.; Foster, T.; Tarkowski, A.; Josefsson, E. Microb. Pathog., 2002, 33, 239.
149. Cheung, A.L.; Schmidt, K.; Bateman, B.; Manna, A.C. Infect. Immun., 2001, 69, 2448.
150. Said, S.B.; Dunman, P.M.; McAleese, F.M.; Macapagal, D.; Murphy, E.; McNamara, P.J.; Arvidson, S.; Foster, T.J.; Projan, S.J.; Kreiswirth, B.N. J. Bacteriol., 2003, 185, 610.
151. Schmidt, K.A.; Manna, A.C.; Cheung, A.L. Infect. Immun., 2003, 71, 5139.
152. Oscarsson, J.; Harlos, C.; Arvidson, S. Inter. J. Med. Microbiol., 2005, 295, 253.
153. Oliveira, S.S.; Nascimento, J.S.; Povoa, D.C.; Araujo, S.A.; Gamon, M.R.; Bastos, M.C.F. J. Appl. Microbiol., 1998, 85, 972
154. Oliveira, S.S.; Abrantes, J.; Cardoso, M.; Sordelli, D.; Bastos, M.C.F. Letters Appl. Microbiol., 1998, 27, 287.
155. Netz, D.J.A.; Pohl, R.; Sickinger, A.G.B.; Selmer, T.; Pierik, A.J.; Bastos, M.C.F.; Sahl, H.G. J. Mol. Biol., 2002, 319, 745.
156. Schneewind, O.; Fowler, A.; Faull, K.F. Science, 1995, 268, 103.
157. That, H.T.; Faull, K.F.; Schneewind, O. The J. Biol. Chem., 1997, 272(35) 22285.
158. Navarre, W.W.; That, H.T.; Faull, K.F.; Schneewind, O.; The J. Biol. Chem., 1998, 273(44) 29135.
159. That, H.T.; Labischinski, H.; Bachi, B.B.; Schneewind, O. The J. Biol. Chem., 1998, 273(44) 29143.
160. Wilm, M.; Shevchenko, A.; Houthaeve, T.; Breit, S.; Schweigerer, L.; Fotsis, T.; Mann, M. Nature, 1996, 379, 466.
161. Cordwell, S.J.; Larsen, M.R.; Cole, R.T.; Walsh, B.J. Microbiology, 2002, 148, 2765.
162. Cordwell, S.J.; Nouwens, A.S.; Walsh, B.J. Proteomics, 2001, 1, 580.
163. Ziebandt, A.K.; Weber, H.; Rudolph, J.; Schmid, R.; Hoper, D.; Engelmann, S.; Hecker, M. Proteomics, 2001, 1, 480.
164. Kohler, C.; Wolff, S.; Albrecht, D.; Fuchs, S.; Becher, D.; Buttner, K.; Engelmann, S.; Hecker, M. Inter. J. Med. Microbiol., 2005, 295, 547.
165. Scherl, A.; Francois, P.; Bento, M.; Deshusses, J.M.; Charbonnier,Y.; Converset, V.; Huyghe, A.; Walter, N.; Hoogland, C.; Appel, R.D.; Sanchez, J.C.; Ivol, C.G.Z.; Corthals, G.L.; Hochstrasser, D.F.; Schrenzel, J. J. Microbiol. Meth., 2005, 60, 247.
166. Nandakumar, R.; Nandakumar, M.P.; Marten, M.R.; Ross, J.M.; J. Proteome Res., 2005, 4, 250.
167. Gertz, S.; Engelmann, S.; Schmid, R.; Ziebandt, A.K. J. Bacteriol., 2000, 182, 6983.
168. Resch, A.; Leicht, S.; Saric, M.; Pasztor, L.; Jakob, A.; Gotz1, F.; Nordheim, A. Proteomics, 2006, 6, 1867.
169. Taverna, F.; Negri, A.; Piccinini, R.; Zecconi, A.; Nonnis, S.; Ronchi, S.; Tedeschi, G. Veter. Microbiol., 2007, 119, 240.
170. Bernardo, K.; Fleer, S.; Pakulat, N.; Krut, O.; Hunger, F.; Kronke, M. Proteomics, 2002, 2, 740.
171. Gatlin, C.L.; Pieper, R.; Huang, S.T.; Mongodin, E.; Gebregeorgis, E.; Parmer, P.P.; Clark, D.J.; Alami, H.A.; Papazisi, L.; Fleischmann, R.D.; Gill, S.R.; Peterson, S.N. Proteomics, 2006, 6, 1530.
172. Komatsuzawa, H.; Suzuki, J.; Sugai, M.; Miyake, Y.; Suginaka, H. J. Antimicrob. Chemother., 1994, 34, 885.
173. Komatsuzawa, H.; Sugai, M.; Shirai, C.; Suzuki, J.; Hiramatsu, K.; Suginaka, H. FEMS Microbiol. Lett., 1995, 134, 209.
174. Dunman, P.M.; Murphy, E.; Haney, S.; Palacios, D.; Kellogg, G.T.; Wu, S.; Brown, E.L.; Zagursky, R.J.; Shlaes, D.; Projan, S.J. J. Bacteriol., 2001, 183, 7341.
175. Waber, H.; Engelmann, S.; Becher, D.; Hecker, M. Mol. Microbiol., 2004, 52(1) 133.
176. Sellman, B.R.; Howell, A.P.; Boyd, C.K.; Baker, S.M. Infect. Immun., 2005, 73(10) 6591.
177. Kohler, C.; Eiff, C.; Peters, G.; Proctor, R.A.; Hecker, M.; Engelmann, S. E. J. Bacteriol., 2003, 185(23) 6928.
178. Vytvytska, O.; Nagy E.; Bluggel M.; Meyer H.E.; Kurzbauer, R.; Huber, L.A.; Klade, C.S. Proteomics, 2002, 2, 580.
179. Brady, R.A.; Leid, J.G.; Camper, A.K.; Costerton, W.J.; Shirtliff, M.E. Infect. Immun., 2006, 74(6) 3415.
180. Burlak, C.; Hammer, C.H.; Robinson, M.A.; Whitney, A.R.; Mc Gavin, M.; Kreiswirth, B.N.; DeLeo, F.R. Cell. Microbiol., 2007, 9(5) 1172.
181. Planchon, S.; Chambon, C.; Desvaux, M.; Chafsey, I.; Leroy, S.; Talon, R.; Hebraud, M. J. Proteomic Res., 2007, 6, 3566.
182. Tseng, C.H.; Ho, K.C.; Lin, Y.S.; Chen, Y.C. Anal. Chem., 2004, 76, 4337.
183. Kong, X. L.; Huang, L.C.L.; Hsu, C.M.; Chen, W.H.; Han, C.C.; Chang, H.C. Anal. Chem., 2005, 77, 259.
184. Chen, C.T.; Chen, Y.C. Anal. Chem., 2005, 77, 5912.
185. Zhang, Y.; Yu, X.; Wang, X.; Shan, W.; Yang, P.; Tang, Y. Chem. Commun., 2004, 2882.
186. Chou, P.H.; Chen, S.H.; Liao, H.K.; Lin, P.C.; Her, G.R.; Lai, A. C.Y.; Chen, J.H.; Lin, C.C.; Chen, Y.J. Anal. Chem., 2005, 77, 5990.
187. Flad, T.; Schiestel, T.; Brunner, H.; Tolson, J.; Ouyang, Q.; Pawelec, G.; Mueller, G.A.; Mueller, C.A.; Tovar, G.E.M.; Beck, H. J. Immunol. Methods, 2003, 283, 205.
188. Maier, M.; Fritz, H.; Gerster, M.; Schewitz, J.; Bayer, E. Anal. Chem., 1998, 70, 2197-2204.
189. Kong, X.; Huang, L.C.L.; Liau, S.C.V.; Han, C.C.; Chang, H.C. Anal. Chem., 2005, 77, 4273.
190. Huang, Y.F.; Chang, H.T. Anal. Chem., 2006, 78, 1485.
191. Chan, W.Y.; Wang, L.S.; Chiu, H.T.; Chen, Y.C. J. Am. Soc. Mass Spectrom, 2004, 15, 1629.
192. Ho, K.C.; Tsai, P.J.; Lin, Y.S.; Chen, Y.C. Anal. Chem., 2004, 76, 7162.
193. Lin, Y.S.; Tsai, P.J.; Weng, M.F.; Chen, Y.C. Anal. Chem., 2005, 77, 1753.
194. Gu, H.; Ho. P.L.; Tsang, K.W.T.; Yu, C.W.; Xu, B. Chem. Commun., 2003, 1966.
195. Gu, H.; Ho. P.L.; Tsang, K.W.T.; Ling, W.; Xu, B. J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 15702.
196. Chang, S.Y.; Zheng, N.Y.; Chen, C.S.; Chen, C. D.; Chen, Y.Y.; Wang, C. R. C. J. Am. Soc. Mass Spectrom, 2007, 18, 910.
197. Madonna, A.J.; Cuyk, S.V.; Voorhees, K.J. Rapid Commun. Mass Spectrom, 2003, 17, 257.
198. Madonna, A.J.; Basile, F.; Furlong, E.; Voorhees, K.J. Rapid Commun. Mass Spectrom, 2001, 15, 1068.
199. Freire, S.L.S.; Wheeler, A.R. Lab Chip., 2006, 6, 1415.
200. Chen, L.; Deng, L.; Liu, L.; Peng, Z. Biosens. Bioelectro., 2007, 22, 1487.
201. Nedelkov, D.; Nelson, R.W. Appl. Environ. Microbiol., 2003, 69(9) 5212.
202. Vermeiren, C.L.; Pluym, M.; Mack, J.; Heinrichs, D.E.; Stillman, M.J. Biochem., 2006, 45, 12867.
203. Pluym, M.; Vermeiren, C.L.; Mack, J.; Heinrichs, D.E.; Stillman, M.J. Biochem., 2007, 46, 12777.
204. Eschenbrenner, M.; Wagner, M.A.; Horn, T.A.; Kraycer, J.A.; Mujer, C.V.; Hagius, S. J. Bacteriol., 2002, 184, 4962.
205. Krishnamurthy, T.; Ross, P.L. Rapid Commun. Mass Spectrom, 1996, 10, 1992.
206. Krishnamurthy, T.; Ross, P.L.; Rajamani, U. Rapid Commun. Mass Spectrom, 1996, 10, 883.
207. Bright, J.J.; Claydon, M.A.; Soufian, M.; Gordon, D.B. J. Microbiol. Methods, 2002, 48, 127.
208. Du, Z.; Yang, R.; Guo, Z.; Song, Y.; Wang, J. Anal. Chem., 2002, 74, 5487
209. Carbonnelle, E.; Beretti, J.L.; Cottyn, S.; Quesne, G.; Berche, P.; Nassif, X.; Ferroni, A. J. Clin. Microbiol., 2007, 45(7) 2156.
210. Claydon, M.A.; Davey, N.; Jones, V.E.; Gordon, D.B. Nat. Biotechnol., 1996, 14, 1584.
211. Haag, A.M.; Chaiban, J.; Johnston, K.H.; Cole, R.B. J. Mass Spectrom, 2001, 36, 15.
212. Lorenz, U.; Ohlsen, K.; Karch, H.; Hecker, M.; Thiede, A.; Hacker, J. FEMS Immunol. Med. Microbiol., 2000, 29, 145.
213. Cordwell, S.J.; Larsen, M.R.; Cole, R.T.; Walsh, B.J. Microbiology, 2002, 148, 2765
214. Ventura, C.L.; Higdon, R.; Kolker, E.; Skerrett, S. J.; Rubens, C.E. Infect. Immun., 2008, 76(3) 888.