Rapid analysis of tryptically digested cerebrospinal fluid using capillary electrophoresis-electrospray ionization-fourier transform ion cyclotron resonance-mass spectrometry

Journal of Proteome Research

Volumn 1, Issue 4, 2002, Pages 361-366

  Wetterhall, Magnus ^a   Palmblad, Magnus ^b   Håkansson, Per ^b   Markides, Karin E ^a   Bergquist, Jonas ^a,c  

^a UPPSALA UNIVERSITY   (Sweden)

^b UPPSALA UNIVERSITY   (Sweden)

^c SAHLGRENSKA UNIVERSITY HOSPITAL   (Sweden)

Author keywords

Body fluids; Capillary electrophoresis; Cerebrospinal fluid; ESI FTICR mass spectrometry; Peptide mapping; Proteins

Indexed keywords

PROTEIN;

ARTICLE; CAPILLARY ELECTROPHORESIS; HUMAN; INFRARED SPECTROSCOPY; MASS SPECTROMETRY; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN CEREBROSPINAL FLUID LEVEL; PROTEOMICS;

CEREBROSPINAL FLUID; ELECTROPHORESIS, CAPILLARY; HUMANS; PEPTIDE FRAGMENTS; PROTEOME; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED;

EID: 0344407503     PISSN: 15353893     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/pr025526s     Document Type: Article

References (54)

1. Thompson, J.; Salinsky, M. Epilepsia 1988, 29, 195-197.
2. Thompson, E. J.; Keir, G. Ann. Clin. Biochem. 1990, 27, 425-435.
3. Blennow, K.; Fredman, P.; Wallin, A.; Gottfries, C. G.; Långström, G.; Svennerholm, L. Eur. Neurol. 1993, 33, 126-128.
4. Stone, M. J. Blood 1990, 75, 531-545.
5. Bergquist, J.; Andersen, O.; Westman, A. Clin. Chem. 2000, 46, 1293-1300.
6. Davidsson, P.; Jahn, R.; Bergquist, J.; Ekman, R.; Blennow, K. Mol. Chem. Neuropathol. 1996, 27, 195-210.
7. Blennow, K.; Davidsson, P.; Gottfries, C. G.; Ekman, R.; Heilig, M. Lancet 1996, 348, 692-693.
8. Sjögren, M.; Blomberg, M.; Jonsson, M.; Wahlund, L. O.; Edman, A.; Lind, K.; Rosengren, L.; Blennow, K.; Wallin, A. J. Neurosci. Res. 2001, 66, 510-516.
9. Sjögren, M.; Davidsson, P.; Gottfries, J.; Vanderstichele, H.; Edman, A.; Vanmechelen, E.; Wallin, A.; Blennow, K. Dement. Geriatr. Cogn. Disord. 2001, 12, 257-264.
10. O'Farrell, P. H. J. Biol. Chem. 1975, 250, 4007-4021.
11. Klose, J. Humangenetik 1975, 26, 231-243.
12. Mann, M.; Hojrup, P.; Roepstorff, P. Biol. Mass Spectrom. 1993, 22, 338-345.
13. Stark, M.; Danielsson, O.; Griffiths, W. J.; Jornvall, H.; Johansson, J. J. Chromatogr. B Biomed. Sci. Appl. 2001, 754, 357-367.
14. Heine, G.; Raida, M.; Forssmann, W. G. J. Chromatogr. A 1997, 776, 117-124.
15. Olefirowicz, T. M.; Ewing, A. G. Anal. Chem. 1990, 62, 1872-1876.
16. Bergquist, J.; Tarkowski, A.; Ekman, R.; Ewing, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 12912-12916.
17. Paez, X.; Hernandez, L. Biopharm. Drug Dispos. 2001, 22, 273-289.
18. Zhang, J. Z.; Chen, D. Y.; Wu, S.; Harke, H. R.; Dovichi, N. J. Clin. Chem. 1991, 37, 1492-1496.
19. Smith, R. D.; Udseth, H. R. Nature 1988, 331, 639-640.
20. Yamashita, M.; Fenn, J. B. J. Phys. Chem. 1984, 88, 4451-4459.
21. Karas, M.; Hillenkamp, F. Anal. Chem. 1988, 60, 2299-2301.
22. Figeys, D.; Gygi, S. P.; Zhang, Y.; Watts, J.; Gu, M.; Aebersold, R. Electrophoresis 1998, 19, 1811-1818.
23. Johnson, T.; Bergquist, J.; Ekman, R.; Nordhoff, E.; Schurenberg, M.; Klöppel, K. D.; Müller, M.; Lehrach, H.; Gobom, J. Anal. Chem. 2001, 73, 1670-1675.
24. Zhan, Q.; Gusev, A.; Hercules, D. M. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1999, 13, 2278-2283.
25. Cao, P.; Moini, M. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1998, 12, 864-870.
26. Barnidge, D. R.; Nilsson, S.; Markides, K. E. Anal. Chem. 1999, 4115, 5-4118.
27. Olivares, J. A.; Nguyen, N. T.; Yonker, C. R.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1987, 59, 1230-1232.
28. Ingendoh, A.; Kiehne, A.; Greiner, M. Chromatographia 1999, 49, S87-S92.
29. Hofstadler, S. A.; Wahl, J. H.; Bruce, J. E.; Smith, R. D. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 6983-6984.
30. Severs, J. C.; Hofstadler, S. A.; Zhao, Z.; Senh, R. T.; Smith, R. D. Electrophoresis 1996, 17, 1808-1817.
31. Jensen, P. K.; Pasa-Tolic, L.; Anderson, G. A.; Horner, J. A.; Lipton, M. S.; Bruce, J. E.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1999, 71, 2076-2084.
32. Jensen, P. K.; Pasa-Tolic, L.; Peden, K. K.; Martinovic, S.; Lipton, M. S.; Anderson, G. A.; Tolic, N.; Wong, K. K.; Smith, R. D. Electrophoresis 2000, 21, 1372-1380.
33. Hiraoka, A.; Arato, T.; Tominaga, I.; Anjyo, A. J. Pharm. Biomed. Anal. 1997, 15, 1257-1263.
34. Hiraoka, A.; Arato, T.; Tominaga, I.; Eguchi, N.; Oda, H.; Urade, Y. J. Chromatogr. B Biomed. Sci. Appl. 1997, 697, 141-147.
35. Hiraoka, A.; Arato, T.; Tominaga, I.; Eguchi, N.; Oda, H.; Urade, Y. J. Chromatogr. A 1998, 802, 143-148.
36. Hiraoka, A.; Tominaga, I.; Hori, K. J. Chromatogr. A 2000, 895, 339-344.
37. Bergquist, J.; Gilman, S. D.; Ewing, A. G.; Ekman, R. Anal. Chem. 1994, 66, 3512-3518.
38. Clarke, N. J.; Tomlinson, A. J.; Naylor, S. J. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1997, 8, 743-748.
39. Conrads, T. P.; Anderson, G. A.; Veenstra, T. D.; Pasa-Tolic, L.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2000, 72, 3349-3354.
40. Bergquist, J.; Palmblad, M.; Wetterhall, M.; Håkansson, P.; Markides, K. E. Mass Spectrom. Rev. 2002, 21, in press.
41. Barnidge, D. R.; Nilsson, S.; Markides, K. E.; Rapp, H.; Hjort, K. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1999, 994-1002.
42. Nilsson, S.; Wetterhall, M.; Bergquist, J.; Nyholm, L.; Markides, K. E. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2001, 15, 1997-2000.
43. Kelly, J. F.; Ramaley, L.; Thibault, P. Anal Chem. 1997, 69, 51-60.
44. Samskog, J.; Wetterhall, M.; Jacobsson, S.; Markides, K. J. Mass Spectrom. 2000, 35, 919-924.
45. Palmblad, M.; Håkansson, K.; Håkansson, P.; Feng, X.; Cooper, H. J.; Giannakopulos, A. E.; Green, P. S.; Derrick, P. J. Eur. Mass Spectrom. 2000, 6, 267-275.
46. http://www.angstrom.uu.se/ionphysics/software.html: The Ion Physics Software Depository.
47. Palmblad, M.; Ramström, M.; Markides, K. E.; Håkansson, P.; Bergquist, J. Manuscript in preparation.
48. Grossman, P. D.; Colburn, J. C.; Lauer, H. H. Anal. Biochem. 1989, 179, 28-33.
49. van de Goor, T. A.; Janssen, P. S.; van Nispen, J. W.; van Zeeland, M. J.; Everaerts, F. M. J. Chromatogr. 1991, 545, 379-389.
50. Cifuentes, A.; Poppe, H. J. Chromatogr. A 1994, 680, 321-340.
51. Castagnola, M.; Rossetti, D. V.; Corda, M.; Pellegrini, M.; Misiti, F.; Olianas, A.; Giardina, B.; Messana, I. Electrophoresis 1998, 19, 2273-2277.
52. Ramström, M.; Palmblad, M.; Markides, K. E.; Håkansson, P.; Bergquist, J. Manuscript in preparation.
53. Godlett, D. R.; Wahl, J. H.; Udseth, H. R.; Smith, R. D. J. Microcol. Sep. 1993, 5, 57-62.
54. Palmblad, M.; Wetterhall, M.; Markides, K.; Håkansson, P.; Bergquist, J. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2000, 14, 1029-1034.