Learnings from quantitative structure-activity relationship (QSAR) studies with respect to food protein-derived bioactive peptides: A review

RSC Advances

Volumn 6, Issue 79, 2016, Pages 75400-75413

  Nongonierma, Alice B ^a   Fitzgerald, Richard J ^a  

^a UNIVERSITY OF LIMERICK   (Ireland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ENZYME INHIBITION; MOLECULAR GRAPHICS; PEPTIDES; PROTEINS; STRUCTURES (BUILT OBJECTS);

ANGIOTENSIN-CONVERTING ENZYME; BIOACTIVE PEPTIDES; BIOACTIVE PROPERTIES; DIPEPTIDYL PEPTIDASE IV; PEPTIDE SEQUENCES; QUANTITATIVE STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIP STUDIES; QUANTITATIVE STRUCTURE-ACTIVITY RELATIONSHIPS; STRUCTURAL REQUIREMENTS;

COMPUTATIONAL CHEMISTRY;

EID: 84982162235     PISSN: None     EISSN: 20462069     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c6ra12738j     Document Type: Review

References (90)

1. E. C. Li-Chan Curr. Opin. Food Sci. 2015 1 28 37
2. A. B. Nongonierma R. J. FitzGerald J. Funct. Foods 2015 640 640 656
3. A. B. Nongonierma R. J. FitzGerald Caries Res. 2012 46 234 267
4. W. M. Miner-Williams B. R. Stevens P. J. Moughan Nutr. Res. Rev. 2014 27 308 329
5. B. Chabance P. Jollès C. Izquierdo E. Mazoyer C. Francoual L. Drouet A.-M. Fiat Br. J. Nutr. 1995 73 583 590
6. N. Ledoux S. Mahe M. Dubarry M. Bourras R. Benamouzig D. Tome Food Nahrung 1999 43 196 200
7. H. Meisel S. Fairweather-Tait R. J. FitzGerald R. Hartmann C. N. Lane D. McDonagh B. Teucher J. M. Wal Br. J. Nutr. 2003 89 351 358
8. A. Panchaud M. Affolter M. Kussmann J. Proteomics 2012 75 3546 3559
9. L. Sánchez-Rivera D. Martínez-Maqueda E. Cruz-Huerta B. Miralles I. Recio Food Res. Int. 2014 63 Part B 170 181
10. M. del Mar Contreras I. Lopez-Expsito B. Hernandez-Ledesma M. Ramos I. Recio J. AOAC Int. 2008 91 981 994
11. A. L. Capriotti C. Cavaliere S. Piovesana R. Samperi A. Laganà Anal. Bioanal. Chem. 2016 408 2677 2685
12. S. Le Maux A. B. Nongonierma R. J. FitzGerald Food Chem. 2015 175 847 854
13. S. Le Maux A. B. Nongonierma B. Murray P. M. Kelly R. J. FitzGerald Food Res. Int. 2015 77 534 539
14. M. B. O'Keeffe R. J. FitzGerald Food Chem. 2015 184 140 146
15. A. Iwaniak P. Minkiewicz M. Darewicz M. Protasiewicz D. Mogut J. Funct. Foods 2015 16 334 351
16. D. Agyei M. K. Danquah Biotechnol. Adv. 2011 29 272 277
17. A. B. Nongonierma, M. B. O'Keeffe and R. J. FitzGerald, in Advanced Dairy Chemistry, ed., P. L. H. McSweeney, and, J. A. O'Mahony, Springer-Verlag, New-York, USA, 4th edn, 2016, pp. 417-482
18. A. Cherkasov E. N. Muratov D. Fourches A. Varnek I. I. Baskin M. Cronin J. Dearden P. Gramatica Y. C. Martin R. Todeschini J. Med. Chem. 2014 57 4977 5010
19. A. B. Nongonierma R. J. FitzGerald Trends Food Sci. Technol. 2016 50 26 43
20. H. Jenssen Expert Opin. Drug Discovery 2011 6 171 184
21. R. Jahangiri S. Soltani A. Barzegar Pharm. Sci. 2014 20 122
22. Y. Li J. Yu J. Med. Food 2015 18 147 156
23. A. H. Pripp Y. Ardö Food Chem. 2007 102 880 888
24. J. Wu R. E. Aluko J. Pept. Sci. 2007 13 63 69
25. H.-O. Kim E. C. Y. Li-Chan J. Agric. Food Chem. 2006 54 10102 10111
26. M. Tian B. Fang L. Jiang H. Guo J. Cui F. Ren Dairy Sci. Technol. 2015 95 451 463
27. A. H. Pripp T. Isaksson L. Stepaniak T. Sørhaug Y. Ardö Trends Food Sci. Technol. 2005 16 484 494
28. Q.-S. Du R.-B. Huang K.-C. Chou Curr. Protein Pept. Sci. 2008 9 248 259
29. P. Minkiewicz J. Dziuba A. Iwaniak M. Dziuba M. Darewicz J. AOAC Int. 2008 91 965 980
30. J. Wu R. E. Aluko S. Nakai J. Agric. Food Chem. 2006 54 732 738
31. S. Hellberg L. Eriksson J. Jonsson F. Lindgren M. Sjöström B. Skagerberg S. Wold P. Andrews Int. J. Pept. Protein Res. 1991 37 414 424
32. A. H. Pripp T. Isaksson L. Stepaniak T. Sørhaug Eur. Food Res. Technol. 2004 219 579 583
33. P. Jing B. Qian Y. He X. Zhao J. Zhang D. Zhao Y. Lv Y. Deng Int. Dairy J. 2014 35 95 101
34. S. Hellberg M. Sjöeströem B. Skagerberg S. Wold J. Med. Chem. 1987 30 1126 1135
35. M. B. Strøm W. Stensen J. S. Svendsen Ø. Rekdal J. Pept. Res. 2001 57 127 139
36. S. Nakai J. C. Chan E. C. Li-Chan J. Dou M. Ogawa J. Agric. Food Chem. 2003 51 1215 1223
37. M. Sandberg L. Eriksson J. Jonsson M. Sjöström S. Wold J. Med. Chem. 1998 41 2481 2491
38. J. Jonsson L. Eriksson S. Hellberg M. Sjöström S. Wold Quant. Struct.-Act. Relat. 1989 8 204 209
39. Z.-h. Lin H.-x. Long Z. Bo Y.-q. Wang Y.-z. Wu Peptides 2008 29 1798 1805
40. F. Tian P. Zhou Z. Li J. Mol. Struct. 2007 830 106 115
41. F. Tian L. Yang F. Lv Q. Yang P. Zhou Amino Acids 2009 36 535 554
42. E. R. Collantes W. J. Dunn J. Med. Chem. 1995 38 2705 2713
43. Y.-W. Li B. Li J. Theor. Biol. 2013 318 29 43
44. R. López-Fandiño J. Otte J. van Camp Int. Dairy J. 2006 16 1277 1293
45. I. Sagardia R. H. Roa-Ureta C. Bald Food Chem. 2013 136 1370 1376
46. J. Wu R. E. Aluko S. Nakai QSAR Comb. Sci. 2006 25 873 880
47. H.-S. Cheung F.-l. Wang M. A. Ondetti E. F. Sabo D. W. Cushman J. Biol. Chem. 1980 255 401 407
48. P. Zhou C. Yang Y. Ren C. Wang F. Tian Food Chem. 2013 141 2967 2973
49. R. Kumar K. Chaudhary J. S. Chauhan G. Nagpal R. Kumar M. Sharma G. P. Raghava Sci. Rep. 2015 5 12512
50. X. Wang J. Wang Y. Lin Y. Ding Y. Wang X. Cheng Z. Lin J. Mol. Model. 2011 17 1599 1606
51. G.-D. Huang R. Zhang Y.-P. Luo W. Zeng W.-J. Wu Chin. J. Struct. Chem. 2014 33 1741 1748
52. C. C. Udenigwe H. Li R. E. Aluko Amino Acids 2011 42 1379 1386
53. I. M. Lacroix E. C. Li-Chan Trends Food Sci. Technol. 2016 54 1 16
54. H. Fujita K. Yokoyama M. Yoshikawa J. Food Sci. 2000 65 564 569
55. M. Sato T. Hosokawa T. Yamaguchi T. Nakano K. Muramoto T. Kahara K. Funayama A. Kobayashi T. Nakano J. Agric. Food Chem. 2002 50 6245 6252
56. A. B. Nongonierma R. J. FitzGerald Curr. Opin. Food Sci. 2016 8 19 24
57. C.-L. Jao C.-C. Hung Y.-S. Tung P.-Y. Lin M.-C. Chen K.-C. Hsu Biomedicine 2015 5 9 15
58. O. Power A. Nongonierma P. Jakeman R. FitzGerald Proc. Nutr. Soc. 2014 73 34 46
59. P. Patil S. Mandal S. K. Tomar S. Anand Eur. J. Nutr. 2015 54 863 880
60. I. M. E. Lacroix E. C. Y. Li-Chan Mol. Nutr. Food Res. 2014 58 61 78
61. A. B. Nongonierma R. J. FitzGerald Food Chem. 2014 165 489 498
62. G. Tulipano L. Faggi A. Nardone D. Cocchi A. M. Caroli Int. Dairy J. 2015 48 66 72
63. A. B. Nongonierma R. J. FitzGerald Peptides 2016 79 1 7
64. Y.-W. Li B. Li J. He P. Qian J. Mol. Struct. 2011 998 53 61
65. Y.-W. Li B. Li J. He P. Qian J. Pept. Sci. 2011 17 454 462
66. L. Zheng Y. Zhao H. Dong G. Su M. Zhao J. Funct. Foods 2016 21 485 496
67. T. Lejon M. B. Strøm J. S. Svendsen J. Pept. Sci. 2001 7 74 81
68. C. D. Fjell J. A. Hiss R. E. Hancock G. Schneider Nat. Rev. Drug Discovery 2012 11 37 51
69. N. K. Brogden K. A. Brogden Int. J. Antimicrob. Agents 2011 38 217 225
70. K. Hilpert C. D. Fjell A. Cherkasov Pept.-Based Drug Des. 2008 494 127 159
71. Ø. Rekdal J. Andersen L. H. Vorland J. S. Svendsen J. Pept. Sci. 1999 5 32 45
72. T. Lejon T. Stiberg M. B. Strøm J. S. Svendsen J. Pept. Sci. 2004 10 329 335
73. S. Sánchez-Gómez B. Japelj R. Jerala I. Moriyón M. Fernández Alonso J. Leiva S. E. Blondelle J. Andrä K. Brandenburg K. Lohner G. Martínez de Tejada Antimicrob. Agents Chemother. 2011 55 218 228
74. G. Maccari, R. Nifosì and M. Di Luca, in Microbial pathogens and strategies for combating them: Science, technology and education, ed., A. Méndez-Vilas, Formatex Research Center, Bajadoz, Spain, 2013, pp. 1265-1277
75. L. Yang M. Shu K. Ma H. Mei Y. Jiang Z. Li Amino Acids 2009 38 805 816
76. H. Jenssen C. D. Fjell A. Cherkasov R. E. W. Hancock J. Pept. Sci. 2008 14 110 114
77. V. Frecer B. Ho J. L. Ding Antimicrob. Agents Chemother. 2004 48 3349 3357
78. Y. Cheng F. Luo Z. Zeng L. Wen Z. Xiao H. Bu F. Lv Z. Xu Q. Lin Struct. Chem. 2015 26 739 747
79. R. J. FitzGerald G. O'Cuinn Biotechnol. Adv. 2006 24 234 237
80. B. C. Saha K. Hayashi Biotechnol. Adv. 2001 19 355 370
81. M. Asao H. Iwamura M. Akamatsu T. Fujita J. Med. Chem. 1987 30 1873 1879
82. J.-H. Wang Y.-L. Liu J.-H. Ning J. Yu X.-H. Li F.-X. Wang J. Mol. Struct. 2013 1040 164 170
83. F. Tian P. Zhou F. Lv R. Song Z. Li J. Pept. Sci. 2007 13 549 566
84. J.-B. Tong J. Chang S.-L. Liu M. Bai J. Serb. Chem. Soc. 2015 80 343 353
85. Y. Gu K. Majumder J. Wu Food Res. Int. 2011 44 2465 2474
86. K. Majumder J. Wu Food Res. Int. 2010 43 1371 1378
87. R. Norris A. Poyarkov M. B. O'Keeffe R. J. FitzGerald Food Chem. 2014 156 29 36
88. A. B. Nongonierma S. Le Maux J. Hamayon R. J. FitzGerald Food Funct. 2016 10.1039/c1036fo00239k
89. C. van der Ven H. Gruppen D. B. A. de Bont A. G. J. Voragen Int. Dairy J. 2002 12 813 820
90. A. Quirós B. Hernández-Ledesma M. Ramos P. J. Martín-Álvarez I. Recio J. Dairy Sci. 2012 95 4280 4285