The marine actinomycete genus Salinispora: A model organism for secondary metabolite discovery

Natural Product Reports

Volumn 32, Issue 5, 2015, Pages 738-751

  Jensen, Paul R ^a   Moore, Bradley S ^a,b   Fenical, William ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

SALINISPORA;

BIOLOGICAL PRODUCT;

ACTINOBACTERIA; BIOLOGICAL MODEL; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; GENETICS; MARINE BIOLOGY; METABOLISM; MULTIGENE FAMILY; SYNTHESIS;

ACTINOBACTERIA; BIOLOGICAL PRODUCTS; MARINE BIOLOGY; MODELS, BIOLOGICAL; MOLECULAR STRUCTURE; MULTIGENE FAMILY;

EID: 84928901683     PISSN: 02650568     EISSN: 14604752     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4np00167b     Document Type: Review

References (136)

1. F. E. Koehn G. T. Carter Nat. Rev. Drug Discovery 2005 4 206 220
2. J. W. Li J. C. Vederas Science 2009 325 161 165
3. A.-C. Letzel S. J. Pidot C. Hertweck Nat. Prod. Rep. 2013 30 392 428
4. W. Fenical P. R. Jensen Nat. Chem. Biol. 2006 2 666 673
5. P. G. Williams Trends Biotechnol. 2009 27 45 52
6. J. Berdy J. Antibiot. 2005 58 1 26
7. A. T. Bull J. E. M. Stach Trends Microbiol. 2007 15 491 499
8. K. S. Lam Curr. Opin. Microbiol. 2006 9 245 251
9. H. Weyland Nature 1969 223 858
10. M. Takizawa R. R. Colwell R. T. Hill Appl. Environ. Microbiol. 1993 59 997 1002
11. M. A. Moran L. T. Rutherford R. E. Hodson Appl. Environ. Microbiol. 1995 61 3695 3700
12. A. Prieto-Davó W. Fenical P. R. Jensen Aquat. Microb. Ecol. 2008 52 1 11
13. P. R. Jensen E. Gontang C. Mafnas T. J. Mincer W. Fenical Environ. Microbiol. 2005 7 1039 1048
14. S. T. Khan T. Tamura M. Takagi K. Shin-ya Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2010 60 2775 2779
15. X.-P. Tian S.-K. Tang J.-D. Dong Y.-Q. Zhang L.-H. Xu S. Zhang W.-J. Li Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 59 948 952
16. H. Yi P. Schumann K. Sohn J. Chun Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2004 54 1585 1589
17. S. K. Han O. I. Nedashkovskaya V. V. Mikhailov S. B. Kim K. S. Bae Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003 53 2061 2066
18. X. P. Tian X. Y. Zhi Y. Q. Qiu Y. Q. Zhang S. K. Tang L. H. Xu S. Zhang W. J. Li Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2009 59 222 228
19. L. A. Maldonado W. Fenical P. R. Jensen C. A. Kauffman T. J. Mincer A. C. Ward A. T. Bull M. Goodfellow Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005 55 1759 1766
20. U. Bose A. K. Hewavitharana M. E. Vidgen Y. K. Ng P. N. Shaw J. A. Fuerst M. P. Hodson PLoS One 2014 9 e91488
21. P. R. Jensen P. G. Williams D. C. Oh L. Zeigler W. Fenical Appl. Environ. Microbiol. 2007 73 1146 1152
22. P. Jensen R. Dwight W. Fenical Appl. Environ. Microbiol. 1991 57 1102 1108
23. T. J. Mincer P. R. Jensen C. A. Kauffman W. Fenical Appl. Environ. Microbiol. 2002 68 5005 5011
24. P. R. Jensen C. Mafnas Environ. Microbiol. 2006 8 1881 1888
25. L. Ahmed P. Jensen K. Freel R. Brown A. Jones B.-Y. Kim M. Goodfellow Antonie Van Leeuwenhoek 2013 103 1069 1078
26. K. C. Freel N. Millan-Aguinaga P. R. Jensen Appl. Environ. Microbiol. 2013 79 5997 6005
27. M. E. Vidgen J. N. A. Hooper J. A. Fuerst Antonie Van Leeuwenhoek 2012 101 603 618
28. H. He W.-D. Ding V. S. Bernan A. D. Richardson C. M. Ireland M. Greenstein G. A. Ellestad G. T. Carter J. Am. Chem. Soc. 2001 123 5362 5363
29. T. K. Kim M. J. Garson J. A. Fuerst Environ. Microbiol. 2005 7 509 518
30. T. J. Mincer W. Fenical P. R. Jensen Appl. Environ. Microbiol. 2005 71 7019 7028
31. A. Prieto-Davó L. J. Villarreal-Gómez S. Forschner-Dancause A. T. Bull J. E. Stach D. C. Smith D. C. Rowley P. R. Jensen FEMS Microbiol. Ecol. 2013 84 510 518
32. K. C. Freel A. Edlund P. R. Jensen Environ. Microbiol. Rep. 2012 14 480 493
33. K.-S. Goo M. Tsuda D. Ulanova Antonie Van Leeuwenhoek 2014 105 207 219
34. P. R. Jensen Microbiol Today 2013 112 115
35. D. W. Udwary L. Zeigler R. N. Asolkar V. Singan A. Lapidus W. Fenical P. R. Jensen B. S. Moore Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 10376 10381
36. K. Penn C. Jenkins M. Nett D. W. Udwary E. A. Gontang R. P. McGlinchey B. Foster A. Lapidus S. Podell E. E. Allen B. S. Moore P. R. Jensen ISME J. 2009 3 1193 1203
37. K. Penn P. Jensen BMC Genomics 2012 13 86
38. S. A. Bucarey K. Penn L. Paul W. Fenical P. R. Jensen Appl. Environ. Microbiol. 2012 78 4175 4182
39. J. E. Janso B. A. Haltli A. S. Eustáquio K. Kulowski A. J. Waldman L. Zha H. Nakamura V. S. Bernan H. He G. T. Carter F. E. Koehn E. P. Balskus Tetrahedron 2014 70 4156 4164
40. L. C. Colis C. M. Woo D. C. Hegan Z. Li P. M. Glazer S. B. Herzon Nat. Chem. 2014 6 504 510
41. K. Nicolaou W. M. Dai Angew. Chem., Int. Ed. 1991 30 1387 1416
42. C. M. Woo N. E. Beizer J. E. Janso S. B. Herzon J. Am. Chem. Soc. 2012 134 15285 15288
43. R. D. Kersten A. L. Lane M. Nett T. K. S. Richter B. M. Duggan P. C. Dorrestein B. S. Moore ChemBioChem 2013 14 955 962
44. N. Ziemert A. Lechner M. Wietz N. Millan-Aguinaga K. L. Chavarria P. R. Jensen Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2014 111 E1130 E1139
45. A. J. Waldman E. P. Balskus Org. Lett. 2014 16 640 643
46. S. B. Herzon L. Lu C. M. Woo S. L. Gholap J. Am. Chem. Soc. 2011 133 7260 7263
47. R. H. Feling G. O. Buchanan T. J. Mincer C. A. Kauffman P. R. Jensen W. Fenical Angew. Chem., Int. Ed. 2003 42 355 357
48. R. Z. Orlowski D. J. Kuhn Clin. Cancer Res. 2008 14 1649 1657
49. E. Corey W.-D. Z. Li Chem. Pharm. Bull. 1999 47 1 10
50. S. Omura K. Matsuzaki F. Tomoko K. Kosuge T. Furuya S. Fujita A. Nakagawa J. Antibiot. 1991 44 117 118
51. M. Groll R. Huber B. C. M. Potts J. Am. Chem. Soc. 2006 128 5136 5141
52. A. J. Kale R. P. McGlinchey A. Lechner B. S. Moore ACS Chem. Biol. 2011 6 1257 1264
53. B. C. Potts M. X. Albitar K. C. Anderson S. Baritaki C. Berkers B. Bonavida J. Chandra D. Chauhan J. C. Cusack W. Fenical I. M. Ghobrial M. Groll P. R. Jensen K. S. Lam G. K. Lloyd W. McBride D. J. McConkey C. P. Miller S. T. C. Neuteboom Y. Oki H. Ovaa F. Pajonk P. G. Richardson A. M. Roccaro C. M. Sloss M. A. Spear E. Valashi A. Younes M. A. Palladino Curr. Cancer Drug Targets 2011 11 254 284
54. W. Fenical P. R. Jensen M. A. Palladino K. S. Lam G. K. Lloyd B. C. Potts Bioorg. Med. Chem. 2009 17 2175 2180
55. L. R. Reddy J.-F. Fournier B. V. Subba Reddy E. J. Corey J. Am. Chem. Soc. 2005 127 8974 8976
56. A. Endo S. J. Danishefsky J. Am. Chem. Soc. 2005 127 8298 8299
57. R. R. Manam V. R. Macherla G. Tsueng C. W. Dring J. Weiss S. T. C. Neuteboom K. S. Lam B. C. Potts J. Nat. Prod. 2009 72 295 297
58. G. Tsueng K. S. Lam Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010 86 1525 1534
59. G. Tsueng K. Lam Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008 78 821 826
60. G. Tsueng K. S. Lam Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008 80 873 880
61. G. Tsueng S. Teisan K. S. Lam Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008 78 827 832
62. P. G. Williams G. O. Buchanan R. H. Feling C. A. Kauffman P. R. Jensen W. Fenical J. Org. Chem. 2005 70 6196 6203
63. K. A. Reed R. R. Manam S. S. Mitchell J. Xu S. Teisan T.-H. Chao G. Deyanat-Yazdi S. T. C. Neuteboom K. S. Lam B. C. M. Potts J. Nat. Prod. 2007 70 269 276
64. V. R. Macherla S. S. Mitchell R. R. Manam K. A. Reed T.-H. Chao B. Nicholson G. Deyanat-Yazdi B. Mai P. R. Jensen W. Fenical S. T. C. Neuteboom K. S. Lam M. A. Palladino B. C. M. Potts J. Med. Chem. 2005 48 3684 3687
65. A. S. Eustáquio S.-J. Nam K. Penn A. Lechner M. C. Wilson W. Fenical P. R. Jensen B. S. Moore ChemBioChem 2011 12 61 64
66. K. C. Freel S.-J. Nam W. Fenical P. R. Jensen Appl. Environ. Microbiol. 2011 77 7261 7270
67. M. Stadler J. Bitzer A. Mayer-Bartschmid H. Müller J. Benet-Buchholz F. Gantner H.-V. Tichy P. Reinemer K. B. Bacon J. Nat. Prod. 2007 70 246 252
68. S. Rachid L. Huo J. Herrmann M. Stadler B. Köpcke J. Bitzer R. Müller ChemBioChem 2011 12 922 931
69. L. L. Beer B. S. Moore Org. Lett. 2007 9 845 848
70. A. S. Eustaquio F. Pojer J. P. Noel B. S. Moore Nat. Chem. Biol. 2008 4 69 74
71. A. S. Eustáquio R. P. McGlinchey Y. Liu C. Hazzard L. L. Beer G. Florova M. M. Alhamadsheh A. Lechner A. J. Kale Y. Kobayashi K. A. Reynolds B. S. Moore Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 12295 12300
72. A. J. Kale R. P. McGlinchey B. S. Moore J. Biol. Chem. 2010 285 33710 33717
73. Y. Liu C. Hazzard A. S. Eustáquio K. A. Reynolds B. S. Moore J. Am. Chem. Soc. 2009 131 10376 10377
74. A. Lechner A. Eustáquio T. A. M. Gulder M. Hafner B. S. Moore Chem. Biol. 2011 18 1527 1536
75. S. Mahlstedt E. N. Fielding B. S. Moore C. T. Walsh Biochemistry 2010 49 9021 9023
76. C. Khosla J. D. Keasling Nat. Rev. Drug Discovery 2003 2 1019 1025
77. A. S. Eustáquio B. S. Moore Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 3936 3938
78. C. Dong F. Huang H. Deng C. Schaffrath J. B. Spencer D. O'Hagan J. H. Naismith Nature 2004 427 561 565
79. A. S. Eustáquio D. O'Hagan B. S. Moore J. Nat. Prod. 2010 73 378 382
80. R. P. McGlinchey M. Nett A. S. Eustáquio R. N. Asolkar W. Fenical B. S. Moore J. Am. Chem. Soc. 2008 130 7822 7823
81. M. Nett T. A. Gulder A. J. Kale C. C. Hughes B. S. Moore J. Med. Chem. 2009 52 6163 6167
82. M. Nett B. S. Moore Pure Appl. Chem. 2009 81 1075 1081
83. B. C. Potts K. S. Lam Mar. Drugs 2010 8 835 880
84. T. A. M. Gulder B. S. Moore Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 9346 9367
85. G. O. Buchanan P. G. Williams R. H. Feling C. A. Kauffman P. R. Jensen W. Fenical Org. Lett. 2005 7 2731 2734
86. C. L. Perrin B. L. Rodgers J. M. O'Connor J. Am. Chem. Soc. 2007 129 4795 4799
87. R. P. McGlinchey M. Nett B. S. Moore J. Am. Chem. Soc. 2008 130 2406 2407
88. M. Jean S. Tomasi P. Van De Weghe Org. Biomol. Chem. 2012 10 7453 7456
89. K. Dineshkumar V. Aparna K. Z. Madhuri W. Hopper Chem. Biol. Drug Des. 2014 83 350 361
90. K. C. Nicolaou J. Wang Y. Tang Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 1432 1435
91. K. C. Nicolaou Y. Tang J. Wang Angew. Chem., Int. Ed. 2009 121 3501 3505
92. K. C. Nicolaou J. Wang Y. Tang L. Botta J. Am. Chem. Soc. 2010 132 11350 11363
93. D.-C. Oh P. G. Williams C. A. Kauffman P. R. Jensen W. Fenical Org. Lett. 2006 8 1021 1024
94. Y. Ken-ichiro Y. Minami R. Azuma M. Saeki T. Otani Tetrahedron Lett. 1993 34 2637 2640
95. A. L. Lane S.-J. Nam T. Fukuda K. Yamanaka C. A. Kauffman P. R. Jensen W. Fenical B. S. Moore J. Am. Chem. Soc. 2013 135 4171 4174
96. P. G. Williams E. D. Miller R. N. Asolkar P. R. Jensen W. Fenical J. Org. Chem. 2007 72 5025 5034
97. A. Edlund S. Loesgen W. Fenical P. R. Jensen Appl. Environ. Microbiol. 2011 611
98. R. N. Asolkar K. C. Freel P. R. Jensen W. Fenical T. P. Kondratyuk E.-J. Park J. M. Pezzuto J. Nat. Prod. 2009 72 396 402
99. P. G. Williams R. N. Asolkar T. Kondratyuk J. M. Pezzuto P. R. Jensen W. Fenical J. Nat. Prod. 2007 70 83 88
100. J. Liu J. K. De Brabander J. Am. Chem. Soc. 2009 131 12562 12563
101. I. Paterson M. Razzak E. A. Anderson Org. Lett. 2008 10 3295 3298
102. J. S. Yadav S. Samad Hossain M. Madhu D. K. Mohapatra J. Org. Chem. 2009 74 8822 8825
103. M. C. Wilson T. A. M. Gulder T. Mahmud B. S. Moore J. Am. Chem. Soc. 2010 132 12757 12765
104. T. K. Kim A. K. Hewavitharana P. N. Shaw J. A. Fuerst Appl. Environ. Microbiol. 2006 72 2118 2125
105. A. K. Hewavitharana P. N. Shaw T. K. Kim J. A. Fuerst J. Chromatogr. B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2007 852 362 366
106. S. Matsuda K. Adachi Y. Matsuo M. Nukina Y. Shizuri J. Antibiot. 2009 62 519 526
107. H. Izumi M. E. A. Gauthier B. M. Degnan Y. K. Ng A. K. Hewavitharana P. N. Shaw J. A. Fuerst FEMS Microbiol. Lett. 2010 313 33 40
108. Y. Ng A. Hewavitharana R. Webb P. N. Shaw J. Fuerst Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013 97 3097 3108
109. Y. K. Ng M. P. Hodson A. K. Hewavitharana U. Bose P. N. Shaw J. Fuerst J. Appl. Microbiol. 2014 117 109 125
110. U. Bose A. K. Hewavitharana Y. K. Ng P. N. Shaw J. A. Fuerst M. P. Hodson Mar. Drugs 2015 13 249 266
111. A. Furusaki N. Hashiba T. Matsumoto A. Hirano Y. Iwai S. Omura J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1978 800 801
112. H. Floss T. Yu Chem. Rev. 2005 105 621 632
113. R. N. Asolkar T. N. Kirkland P. R. Jensen W. Fenical J. Antibiot. 2010 63 37 39
114. R. D. Kersten N. Ziemert D. J. Gonzalez B. M. Duggan V. Nizet P. C. Dorrestein B. S. Moore Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013 110 4407 4416
115. H.-S. Kang S. F. Brady J. Am. Chem. Soc. 2014 136 18111 18119
116. B. T. Murphy T. Narender C. A. Kauffman M. Woolery P. R. Jensen W. Fenical Aust. J. Chem. 2010 63 929 934
117. M. K. Renner Y.-C. Shen X.-C. Cheng P. R. Jensen W. Frankmoelle C. A. Kauffman W. Fenical E. Lobkovsky J. Clardy J. Am. Chem. Soc. 1999 121 11273 11276
118. A. W. Schultz D. C. Oh J. R. Carney R. T. Williamson D. W. Udwary P. R. Jensen S. J. Gould W. Fenical B. S. Moore J. Am. Chem. Soc. 2008 130 4507 4516
119. Q. Qian A. W. Schultz B. S. Moore M. E. Tanner Biochemistry 2012 51 7733 7739
120. A. W. Schultz C. A. Lewis M. R. Luzung P. S. Baran B. S. Moore J. Nat. Prod. 2010 73 373 377
121. D. C. Oh E. A. Gontang C. A. Kauffman P. R. Jensen W. Fenical J. Nat. Prod. 2008 71 570 575
122. C. Corre G. L. Challis Nat. Prod. Rep. 2009 26 977 986
123. T. K. S. Richter C. C. Hughes B. S. Moore Environ. Microbiol. 2014 10.1111/1462-2920.12669
124. M. Xu M. L. Hillwig A. L. Lane M. S. Tiernan B. S. Moore R. J. Peters J. Nat. Prod. 2014 77 2144 2147
125. Y. Aotani H. Nagata M. Yoshida J. Antibiot. 1997 50 543 545
126. C. C. Hughes J. B. MacMillan S. P. Gaudencio P. R. Jensen W. Fenical Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 725 727
127. A. Miyanaga J. E. Janso L. McDonald M. He H. Liu L. Barbieri A. S. Eustaquio E. N. Fielding G. T. Carter P. R. Jensen X. Feng M. Leighton F. E. Koehn B. S. Moore J. Am. Chem. Soc. 2011 133 13311 13313
128. J. Piel C. Hertweck P. R. Shipley D. M. Hunt M. S. Newman B. S. Moore Chem. Biol. 2000 7 943 955
129. B. Bonet R. Teufel M. Crüsemann N. Ziemert B. S. Moore J. Nat. Prod. 2014 10.1021/np500664q
130. R. C. Hider X. Kong Nat. Prod. Rep. 2010 27 637 657
131. A. A. Roberts A. W. Schultz R. D. Kersten P. C. Dorrestein B. S. Moore FEMS Microbiol. Lett. 2012 335 95 103
132. N. Ejje C. Z. Soe J. Gu R. Codd Metallomics 2013 5 1519 1528
133. U. Bose M. P. Hodson P. N. Shaw J. A. Fuerst A. K. Hewavitharana Biomed. Chromatogr. 2014 28 1163 1166
134. A. Shindia Folia Microbiol. 1997 42 477 480
135. R. D. Kersten Y.-L. Yang Y. Xu P. Cimermancic S.-J. Nam W. Fenical M. A. Fischbach B. S. Moore P. C. Dorrestein Nat. Chem. Biol. 2011 7 794 802
136. A. Bouslimani L. M. Sanchez N. Garg P. C. Dorrestein Nat. Prod. Rep. 2014 31 718 729