Transformation of biomass into commodity chemicals using enzymes or cells

Chemical Reviews

Volumn 114, Issue 3, 2014, Pages 1871-1908

  Straathof, Adrie J J ^a  

^a DELFT UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ENZYME; GLUCOSE; PYRUVIC ACID DERIVATIVE;

BIOMASS; CHEMISTRY; METABOLISM; REVIEW; WOOD;

BIOMASS; ENZYMES; GLUCOSE; PYRUVATES; WOOD;

EID: 84894177844     PISSN: 00092665     EISSN: 15206890     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr400309c     Document Type: Review

References (439)

1. Sengupta, D.; Pike, R. W. Chemicals from Biomass; Integrating Bioprocesses into Chemical Production Complexes for Sustainable Development; CRC Press: Boca Raton, FL, 2012.
2. Ashina, Y.; Suto, M. In Industrial Application of Immobilized Biocatalysts; Tanaka, A., Tosa, T., Kobayashi, T., Eds.; Marcel Dekker: New York, 1993; p 91.
3. Doudna, J. A.; Cech, T. R. Nature 2002, 418, 222
4. Lilly, M. D. Chem. Eng. Sci. 1994, 49, 151
5. Collins, A. M.; Kennedy, M. J. Australas. Biotechnol. 1999, 9, 86
6. Zhang, Y. H. P. Biotechnol. Bioeng. 2010, 105, 663
7. Bujara, M.; Schumperli, M.; Billerbeek, S.; Heinemann, M.; Panke, S. Biotechnol. Bioeng. 2010, 106, 376
8. Guterl, J. K.; Garbe, D.; Carsten, J.; Steffler, F.; Sommer, B.; Reisse, S.; Philipp, A.; Haack, M.; Ruhmann, B.; Koltermann, A.; Kettling, U.; Bruck, T.; Sieber, V. ChemSusChem 2012, 5, 2165
9. Danner, H.; Braun, R. Chem. Soc. Rev. 1999, 28, 395
10. Jang, Y. S.; Kim, B.; Shin, J. H.; Choi, Y. J.; Choi, S.; Song, C. W.; Lee, J.; Park, H. G.; Lee, S. Y. Biotechnol. Bioeng. 2012, 109, 2437
11. Lee, J. W.; Kim, H. U.; Choi, S.; Yi, J.; Lee, S. Y. Curr. Opin. Biotechnol. 2011, 3, 1
12. Rabinovitch-Deere, C. A.; Oliver, J. W. K.; Rodriguez, G. M.; Atsumi, S. Chem. Rev. 2013, 113, 4611
13. Cheng, H. N.; Gu, Q. M. Polymers 2012, 4, 1311
14. Kobayashi, S.; Makino, A. Chem. Rev. 2009, 109, 5288
15. Gao, X.; Chen, J. C.; Wu, Q.; Chen, G. Q. Curr. Opin. Biotechnol. 2011, 22, 768
16. Donot, F.; Fontana, A.; Baccou, J. C.; Schorr-Galindo, S. Carbohydr. Polym. 2012, 87, 951
17. Becker, J.; Wittmann, C. Curr. Opin. Biotechnol. 2012, 23, 718
18. Scheller, H. V.; Ulvskov, P. In Annual Review of Plant Biology; Merchant, S.; Briggs, W. R.; Ort, D., Eds.; Annual Reviews: Palo Alto, CA, 2010; Vol. 61, p 263.
19. Bugg, T. D. H.; Ahmad, M.; Hardiman, E. M.; Rahmanpour, R. Nat. Prod. Rep. 2011, 28, 1883
20. Xiao, C.; Anderson, C. T. Front. Plant Sci. 2013, 4, 1
21. Sweeney, M. D.; Xu, F. Catalysts 2012, 2, 244
22. Clomburg, J. M.; Gonzalez, R. Trends Biotechnol. 2013, 31, 20
23. Jarboe, L. R.; Liu, P.; Royce, L. Curr. Opin. Chem. Eng. 2011, 1, 38
24. Wiermans, L.; Perez-Sanchez, M.; de Maria, P. D. ChemSusChem 2013, 6, 251
25. Reiter, J.; Strittmatter, H.; Wiemann, L. O.; Schieder, D.; Sieber, V. Green Chem. 2013, 15, 1373
26. Taylor, C. R.; Hardiman, E. M.; Ahmad, M.; Sainsbury, P. D.; Norris, P. R.; Bugg, T. D. H. J. Appl. Microbiol. 2012, 113, 521
27. Munasinghe, P. C.; Khanal, S. K. Bioresour. Technol. 2010, 101, 5013
28. Henstra, A. M.; Sipma, J.; Rinzema, A.; Stams, A. J. M. Curr. Opin. Biotechnol. 2007, 18, 200
29. Abubackar, H. N.; Veiga, M. C.; Kennes, C. Biofuels, Bioprod. Biorefin. 2011, 5, 93
30. Nyns, E.-J. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2000; Vol. 23, p 13.
31. Ferry, J. G. Planet. Space Sci. 2010, 58, 1775
32. Krishania, M.; Kumar, V.; Vijay, V. K.; Malik, A. Fuel 2013, 106, 1
33. Schneider-Belhaddad, F.; Kolattukudy, P. Arch. Biochem. Biophys. 2000, 377, 341
34. Warui, D. M.; Li, N.; Norgaard, H.; Krebs, C.; Bollinger, J. M.; Booker, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 3316
35. Li, N.; Chang, W. C.; Warui, D. M.; Booker, S. J.; Krebs, C.; Bollinger, J. M. Biochemistry 2012, 51, 7908
36. Schirmer, A.; Rude, M. A.; Li, X. Z.; Popova, E.; del Cardayre, S. B. Science 2010, 329, 559
37. Domínguez de María, P. ChemSusChem 2011, 4, 327
38. Morschbacker, A. Polym. Rev. 2009, 49, 79
39. Fukuda, H.; Ogawa, T.; Tanase, S. Adv. Microb. Physiol. 1993, 35, 275
40. Lieberman, M. Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1979, 30, 533
41. Ogawa, T.; Takahashi, M.; Fujii, T.; Tazaki, M.; Fukuda, H. J. Ferment. Bioeng. 1990, 69, 287
42. Fukuda, H.; Ogawa, T.; Tazaki, M.; Nagahama, K.; Fujii, T.; Tanase, S.; Morino, Y. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1992, 188, 483
43. Guerrero, F.; Carbonell, V.; Cossu, M.; Correddu, D.; Jones, P. R. PLoS One 2012, 7, e50470
44. Larsson, C.; Snoep, J. L.; Norbeck, J.; Albers, E. IET Proc.: Syst. Biol. 2011, 5, 245
45. Wang, J. P.; Wu, L. X.; Xu, F.; Lv, J.; Jin, H. J.; Chen, S. F. Bioresour. Technol. 2010, 101, 6404
46. Shimokawa, K.; Kasai, Z. Agric. Biol. Chem. 1970, 34, 1646
47. Abeles, F. B. Ann. Rev. Plant Physiol. 1972, 23, 259
48. Marliere, P. Eur. Pat. Appl. 2336340, June 22, 2011.
49. Marlière, P. Eur. Pat. Appl. 2336341, June 22, 2011.
50. Eisele, P.; Killpack, R. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH Verlag: Weinheim, 2011; Vol. 30, p 281.
51. Fukuda, H.; Fujii, T.; Ogawa, T. Agric. Biol. Chem. 1984, 48, 1679
52. Fukuda, H.; Kawaoka, Y.; Fujii, T.; Ogawa, T. Agric. Biol. Chem. 1987, 51, 1529
53. Roberts, E. S.; Vaz, A. D.; Coon, M. J. Proc. Natl. Acad. Sci. 1991, 88, 8963
54. Nishida, Y.; Itoh, H.; Yamazaki, A. Polyhedron 1994, 13, 2473
55. Araujo, A. S.; Souza, M. J. B.; Fernandes, V. J.; Diniz, J. C. React. Kinet. Catal. Lett. 1999, 66, 141
56. McCoy, M. Chem. Eng. News 2010, 88, 11
57. van Leeuwen, B. N. M.; van der Wulp, A. M.; Duijnstee, I.; van Maris, A. J. A.; Straathof, A. J. J. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012, 93, 1377
58. Fujii, T.; Ogawa, T.; Fukuda, H. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1987, 25, 430
59. Fujii, T.; Ogawa, T.; Fukuda, H. Agric. Biol. Chem. 1985, 49, 1541
60. Fukuda, H.; Fujii, T.; Sukita, E.; Tazaki, M.; Nagahama, S.; Ogawa, T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1994, 201, 516
61. Shimaya, C.; Fujii, T. J. Biosci. Bioeng. 2000, 90, 465
62. Gogerty, D. S.; Bobik, T. A. Appl. Environ. Microbiol. 2010, 76, 8004
63. Marlière, P. Pat. Appl. WO2010001078, January 7, 2010.
64. Grub, J.; Löser, E. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 6, p 381.
65. Burk, M. J.; Burgard, A. P.; Osterhout, R. E.; Sun, J.; Pharkya, P. Pat. Appl. WO2012177710, December 27, 2012.
66. Pearlman, P. S.; Chen, C.; Botes, A. L. Pat. Appl. WO2012174439, December 20, 2012.
67. Cervin, M. A.; Whited, G. M.; Chotani, G. K.; Valle, F.; Fioresi, C.; Sanford, K. J.; Mcauliffe, J. C.; Feher, F. J.; Puhala, A. S.; Miasnikov, A.; Aldor, I. S. U.S. Pat. Appl. 2009203102, August 13, 2009.
68. Whited, G. M.; Feher, F. J.; Benko, D. A.; Cervin, M. A.; Chotani, G. K.; McAuliffe, J. C.; LaDuca, R. J.; Ben-Shoshan, E. A.; Sanford, K. J. Ind. Biotechnol. 2011, 6, 152
69. Guenther, A.; Karl, T.; Harley, P.; Wiedinmyer, C.; Palmer, P. I.; Geron, C. Atmos. Chem. Phys. 2006, 6, 3181
70. Singh, R. Org. Process Res. Dev. 2010, 15, 175
71. Peralta-Yahya, P. P.; Zhang, F. Z.; del Cardayre, S. B.; Keasling, J. D. Nature 2012, 488, 320
72. Chandran, S. S.; Kealey, J. T.; Reeves, C. D. Process Biochem. 2011, 46, 1703
73. Renninger, N. S.; Newman, J.; Rolling, K. K.; Regentin, R.; Paddon, C. J. U.S. Patent 7659097 (B2), September 2, 2010.
74. Westfall, P. J.; Pitera, D. J.; Lenihan, J. R.; Eng, D.; Woolard, F. X.; Regentin, R.; Horning, T.; Tsuruta, H.; Melis, D. J.; Owens, A.; Fickes, S.; Diola, D.; Benjamin, K. R.; Keasling, J. D.; Leavell, M. D.; McPhee, D. J.; Renninger, N. S.; Newman, J. D.; Paddon, C. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 111
75. Weissermel, K.; Arpe, H.-J. Industrial Organic Chemistry, 3 rd ed.; VCH: Weinheim, 1997.
76. Beller, H. R.; Goh, E. B.; Keasling, J. D. Appl. Environ. Microbiol. 2010, 76, 1212
77. Frias, J. A.; Richman, J. E.; Erickson, J. S.; Wackett, L. P. J. Biol. Chem. 2011, 286, 10930
78. Rude, M. A.; Baron, T. S.; Brubaker, S.; Alibhai, M.; Del Cardayre, S. B.; Schirmer, A. Appl. Environ. Microbiol. 2011, 77, 1718
79. Qiu, Y.; Tittiger, C.; Wicker-Thomas, C.; Le Goff, G.; Young, S.; Wajnberg, E.; Fricaux, T.; Taquet, N.; Blomquist, G. J.; Feyereisen, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2012, 109, 14858
80. Fabri, J.; Graeser, U.; Simo, T. A. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2008; Vol. 37, p 109.
81. Fischer-Romero, C.; Tindall, B. J.; Jüttner, F. Int. J. Syst. Bacteriol. 1996, 46, 183
82. Heider, J.; Spormann, A. M.; Beller, H. R.; Widdel, F. FEMS Microbiol. Rev. 1998, 22, 459
83. James, D. H.; Castor, W. M. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 34, p 529.
84. McKenna, R.; Nielsen, D. R. Metab. Eng. 2011, 13, 544
85. Verhoef, S.; Ruijssenaars, H. J.; de Bont, J. A. M.; Wery, J. J. Biotechnol. 2007, 132, 49
86. Verhoef, S.; Wierckx, N.; Westerhof, R. G. M.; de Winde, J. H.; Ruijssenaars, H. J. Appl. Environ. Microbiol. 2009, 75, 931
87. Collin, G.; Höke, H.; Greim, H. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2003; Vol. 23, p 661.
88. Chen, J.; Henderson, G.; Grimm, C. C.; Lloyd, S. W.; Laine, R. A. Nature 1998, 392, 558
89. Daisy, B. H.; Strobel, G. A.; Castillo, U.; Ezra, D.; Sears, J.; Weaver, D. K.; Runyon, J. B. Microbiology (U.K.) 2002, 148, 3737
90. Bäck, J.; Aaltonen, H.; Hellen, H.; Kajos, M. K.; Patokoski, J.; Taipale, R.; Pumpanen, J.; Heinonsalo, J. Atmos. Environ. 2010, 44, 3651
91. Ahamed, A.; Ahring, B. K. Bioresour. Technol. 2011, 102, 9718
92. Heiden, A. C.; Kobel, K.; Komenda, M.; Koppmann, R.; Shao, M.; Wildt, J. Geophys. Res. Lett. 1999, 26, 1283
93. Yuan, Z. L.; Chen, Y. C.; Xu, B. G.; Zhang, C. L. Crit. Rev. Biotechnol. 2012, 32, 363
94. Ott, J.; Gronemann, V.; Pontzen, F.; Fiedler, E.; Grossmann, G.; Kersebohm, D. B.; Weiss, G.; Witte, C. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2012; p 1.
95. Redmond, M. C.; Valentine, D. L.; Sessions, A. L. Appl. Environ. Microbiol. 2010, 76, 6412
96. Hakemian, A. S.; Rosenzweig, A. C. In Annual Review of Biochemistry; Annual Reviews: Palo Alto, CA, 2007; Vol. 76, p 223.
97. Mehta, P. K.; Mishra, S.; Ghose, T. K. Biotechnol. Bioeng. 1991, 37, 551
98. Falbe, J.; Bahrmann, H.; Lipps, W.; Mayer, D.; Frey, G. D. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2013; p 1.
99. Walker, G. M. J. Inst. Brew. 2011, 117, 3
100. Brandberg, T.; Karimi, K.; Taherzadeh, M. J.; Franzen, C. J.; Grustafsson, L. Biotechnol. Bioeng. 2007, 98, 80
101. Cysewski, G. R.; Wilke, C. R. Biotechnol. Bioeng. 1977, 19, 1125
102. Thomas, K. C.; Ingledew, W. M. J. Ind. Microbiol. 1992, 10, 61
103. Hasunuma, T.; Rondo, A. Biotechnol. Adv. 2012, 30, 1207
104. Wisselink, H. W.; Toirkens, M. J.; Wu, Q.; Pronk, J. T.; van Maris, A. J. A. Appl. Environ. Microbiol. 2009, 75, 907
105. Stanley, D.; Bandara, A.; Fraser, S.; Chambers, P. J.; Stanley, G. A. J. Appl. Microbiol. 2010, 109, 13
106. Teixeira, M. C.; Godinho, C. P.; Cabrito, T. R.; Mira, N. P.; Sa-Correia, I. Microb. Cell. Fact. 2012, 11, 98
107. Taylor, M. P.; Eley, K. L.; Martin, S.; Tuffin, M. I.; Burton, S. G.; Cowan, D. A. Trends Biotechnol. 2009, 27, 398
108. Abdel-Banat, B. M. A.; Hoshida, H.; Ano, A.; Nonklang, S.; Akada, R. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 85, 861
109. Almeida, J. R. M.; Modig, T.; Petersson, A.; Hahn-Hagerdal, B.; Liden, G.; Gorwa-Grauslund, M. F. J. Chem. Technol. Biotechnol. 2007, 82, 340
110. Koppram, R.;; Albers, E.;; Olsson, L. Biotechnol. Biofuels 2012, 5, doi:10.1186/1754-6834-5-32.
111. Papa, A. J. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 30; p 243.
112. Eden, A.; Van Nedervelde, L.; Drukker, M.; Benvenisty, N.; Debourg, A. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001, 55, 296
113. Atsumi, S.; Hanai, T.; Liao, J. C. Nature 2008, 451, 86
114. Shen, C. R.; Liao, J. C. Metab. Eng. 2008, 10, 312
115. Choi, Y. J.; Park, J. H.; Kim, T. Y.; Lee, S. Y. Metab. Eng. 2012, 14, 477
116. Atsumi, S.; Liao, J. C. Appl. Environ. Microbiol. 2008, 74, 7802
117. Jain, R.; Yan, Y. J. Microb. Cell Fact. 2011, 10
118. Chen, J. S.; Hiu, S. F. Biotechnol. Lett. 1986, 8, 371
119. Krouwel, P. G.; Groot, W. J.; Kossen, N. W. F.; Vanderlaan, W. F. M. Enzyme Microb. Technol. 1983, 5, 46
120. Jojima, T.; Inui, M.; Yukawa, H. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008, 77, 1219
121. Hanai, T.; Atsumi, S.; Liao, J. C. Appl. Environ. Microbiol. 2007, 73, 7814
122. Inokuma, K.; Liao, J. C.; Okamoto, M.; Hanai, T. J. Biosci. Bioeng. 2010, 110, 696
123. Jones, D. T.; Woods, D. R. Microbiol. Rev. 1986, 50, 484
124. Jang, Y. S.; Lee, J.; Malaviya, A.; Seung, D. Y.; Cho, J. H.; Lee, S. Y. Biotechnol. J. 2012, 7, 186
125. Green, E. M. Curr. Opin. Biotechnol. 2011, 22, 337
126. Shen, C. R.; Lan, E. I.; Dekishima, Y.; Baez, A.; Cho, K. M.; Liao, J. C. Appl. Environ. Microbiol. 2011, 77, 2905
127. Ezeji, T. C.; Qureshi, N.; Blaschek, H. P. Curr. Opin. Biotechnol. 2007, 18, 220
128. Dellomonaco, C.; Clomburg, J. M.; Miller, E. N.; Gonzalez, R. Nature 2011, 476, 355
129. Berezina, O. V.; Zakharova, N. V.; Yarotsky, C. V.; Zverlov, V. V. Appl. Biochem. Microbiol. 2012, 48, 625
130. Oudshoorn, A.; van der Wielen, L. A. M.; Straathof, A. J. J. Ind. Eng. Chem. Res. 2009, 48, 7325
131. Ezeji, T. C.; Qureshi, N.; Blaschek, H. P. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2004, 63, 653
132. Ni, Y.; Hagedoorn, P. L.; Xu, J. H.; Arends, I.; Hollmann, F. Chem. Commun. 2012, 48, 12056
133. Donaldson, G. K.; Eliot, A. C.; Huang, L. L.; Nagarajan, V.; Nakamura, C. E. Pat. Appl. WO2007130518, November 15, 2007.
134. Manitto, P.; Chialva, F.; Speranza, G.; Rinaldo, C. J. Agric. Food Chem. 1994, 42, 886
135. Speranza, G.; Corti, S.; Fontana, G.; Manitto, P.; Galli, A.; Scarpellini, M.; Chialva, F. J. Agric. Food Chem. 1997, 45, 3476
136. Speranza, G.; Morelli, C. F.; Orlandi, M.; Scarpellini, M.; Manitto, P. Helv. Chim. Acta 2001, 84, 335
137. Donaldson, G. K.; Eliot, A. C.; Maggio-Hall, L. A.; Nagarajan, V.; Nakamura, C. E.; Tomb, J. F. Pat. Appl. WO2009134276, November 5, 2009.
138. Muramatsu, M.; Suzuki, K. U.S. Pat. Appl. 2011281315, November 17, 2011.
139. Burk, M. J.; Pharkya, P.; Burgard, A. P. Pat. Appl. WO2010057022, May 20, 2010.
140. Kolodziej, R.; Scheib, J. Hydrocarbon Process. 2012, September) 79
141. Trinh, C. T.; Li, J.; Blanch, H. W.; Clark, D. S. Appl. Environ. Microbiol. 2011, 77, 4894
142. Bastian, S.; Liu, X.; Meyerowitz, J. T.; Snow, C. D.; Chen, M. M. Y.; Arnold, F. H. Metab. Eng. 2011, 13, 345
143. Smith, K. M.; Liao, J. C. Metab. Eng. 2011, 13, 674
144. Kondo, T.; Tezuka, H.; Ishii, J.; Matsuda, F.; Ogino, C.; Kondo, A. J. Biotechnol. 2012, 159, 32
145. Brat, D.; Weber, C.; Lorenzen, W.; Bode, H. B.; Boles, E. Biotechnol. Biofuels 2012, 5, 65
146. Smith, K.; Cho, K.-M.; Liao, J. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 87, 1045
147. Blombach, B.; Riester, T.; Wieschalka, S.; Ziert, C.; Youn, J. W.; Wendisch, V. F.; Eikmanns, B. J. Appl. Environ. Microbiol. 2011, 77, 3300
148. Jia, X. Q.; Li, S. S.; Xie, S.; Wen, J. P. Appl. Biochem. Biotechnol. 2012, 168, 1
149. Higashide, W.; Li, Y. C.; Yang, Y. F.; Liao, J. C. Appl. Environ. Microbiol. 2011, 77, 2727
150. Baez, A.; Cho, K.-M.; Liao, J. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2011, 90, 1681
151. Hazelwood, L. A.; Daran, J.-M.; van Maris, A. J. A.; Pronk, J. T.; Dickinson, J. R. Appl. Environ. Microbiol. 2008, 74, 2259
152. Cann, A. F.; Liao, J. C. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008, 81, 89
153. Connor, M. R.; Liao, J. C. Appl. Environ. Microbiol. 2008, 74, 5769
154. Connor, M. R.; Cann, A. F.; Liao, J. C. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 86, 1155
155. Zhang, K. C.; Sawaya, M. R.; Eisenberg, D. S.; Liao, J. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 20653
156. Dekishima, Y.; Lan, E. I.; Shen, C. R.; Cho, K. M.; Liao, J. C. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 11399
157. Machado, H. B.; Dekishima, Y.; Luo, H.; Lan, E. I.; Liao, J. C. Metab. Eng. 2012, 14, 504
158. Noweck, K.; Grafahrend, W. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2006; Vol. 14, p 117.
159. Steen, E. J.; Kang, Y. S.; Bokinsky, G.; Hu, Z. H.; Schirmer, A.; McClure, A.; del Cardayre, S. B.; Keasling, J. D. Nature 2010, 463, 559
160. Akhtar, M. K.; Turner, N. J.; Jones, P. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2013, 110, 87
161. Vidal, R.; Lopez-Maury, L.; Guerrero, M. G.; Florencio, F. J. J. Bacteriol. 2009, 191, 4383
162. Willis, R. M.; Wahlen, B. D.; Seefeldt, L. C.; Barney, B. M. Biochemistry 2011, 50, 10550
163. Liu, H.; Ramos, K. R. M.; Valdehuesa, K. N. G.; Nisola, G. M.; Lee, W.-K.; Chung, W.-J. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013, 97, 3409
164. Rebsdat, S.; Mayer, D. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH, 2000; Vol. 13, p 531.
165. Widersten, M.; Gurell, A.; Lindberg, D. Biochim. Biophys. Acta, Gen. Subj. 2010, 1800, 316
166. Boronat, A.; Aguilar, J. J. Bacteriol. 1979, 140, 320
167. Voelker, F.; Dumon-Seignovert, L.; Soucaille, P. U.S. Pat. Appl. 2012122169, May 17, 2012.
168. Clomburg, J. M.; Gonzalez, R. Biotechnol. Bioeng. 2011, 108, 867
169. Sanchez-Riera, F.; Cameron, D. C.; Cooney, C. L. Biotechnol. Lett. 1987, 9, 449
170. Altaras, N. E.; Cameron, D. C. Biotechnol. Prog. 2000, 16, 940
171. Berrios-Rivera, S. J.; San, K. Y.; Bennett, G. N. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2003, 30, 34
172. Jung, J. Y.; Choi, E. S.; Oh, M. K. J. Microbiol. Biotechnol. 2008, 18, 1797
173. Lee, W.; DaSilva, N. A. Metab. Eng. 2006, 8, 58
174. Wilkens, E.; Ringel, A. K.; Hortig, D.; Willke, T.; Vorlop, K. D. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012, 93, 1057
175. Gonzalez-Pajuelo, M.; Meynial-Salles, I.; Mendes, F.; Andrade, J. C.; Vasconcelos, I.; Soucaille, P. Metab. Eng. 2005, 7, 329
176. Nakamura, C. E.; Whited, G. M. Curr. Opin. Biotechnol. 2003, 14, 454
177. Cervin, M. A.; Soucaille, P.; Valle, F. U.S. Patent 7745184 (B2), June 29, 2010.
178. Burk, M. J. Int. Sugar J. 2010, 1123, 30
179. Yim, H.; Haselbeck, R.; Niu, W.; Pujol-Baxley, C.; Burgard, A.; Boldt, J.; Khandurina, J.; Trawick, J. D.; Osterhout, R. E.; Stephen, R.; Estadilla, J.; Teisan, S.; Schreyer, H. B.; Andrae, S.; Yang, T. H.; Lee, S. Y.; Burk, M. J.; Van Dien, S. Nat. Chem. Biol. 2011, 7, 445
180. van Haveren, J.; Scott, E. L.; Sanders, J. Biofuels, Bioprod. Biorefin. 2008, 2, 41
181. Ji, X. J.; Huang, H.; Ouyang, P. K. Biotechnol. Adv. 2011, 29, 351
182. Zhang, L. Y.; Sun, J. A.; Hao, Y. L.; Zhu, J. W.; Chu, J.; Wei, D. Z.; Shen, Y. L. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2010, 37, 857
183. Ma, C. Q.; Wang, A. L.; Qin, J. Y.; Li, L. X.; Ai, X. L.; Jiang, T. Y.; Tang, H. Z.; Xu, P. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2009, 82, 49
184. Dziedzic, S. Z.; Kearsley, M. W. Handbook of Starch Hydrolysis Products and Their Derivatives; Chapman and Hall: London, 1995.
185. Schenck, F. W. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2006; Vol. 17, p 45.
186. Pedersen, S. In Industrial Application of Immobilized Biocatalysts; Tanaka, A.; Tosa, T.; Kobayashi, T., Eds.; Marcel Dekker: New York, 1993; p 185.
187. Rafiqul, I. S. M.; Sakinah, A. M. M. Food Rev. Int. 2013, 29, 127
188. Schiweck, H.; Bär, A.; Vogel, R.; Schwarz, E.; Kunz, M.; Dusautois, C.; Clement, A.; Lefranc, C.; Lüssem, B.; Moser, M.; Peters, S. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2012; p 1.
189. Cheetham, P. S. J. Methods Enzymol. 1987, 136, 432
190. Moon, H. J.; Jeya, M.; Kim, I. W.; Lee, J. K. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 86, 1017
191. Jeya, M.; Lee, K. M.; Tiwari, M. K.; Kim, J. S.; Gunasekaran, P.; Kim, S. Y.; Kim, I. W.; Lee, J. K. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2009, 83, 225
192. Granstrom, T. B.; Izumori, K.; Leisola, M. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2007, 74, 273
193. Choi, J. H.; Moon, K. H.; Ryu, Y. W.; Seo, J. H. Biotechnol. Lett. 2000, 22, 1625
194. Hallborn, J.; Walfridsson, M.; Airaksinen, U.; Ojamo, H.; Hahn-Hägerdal, B.; Penttilä, M.; Keräsnen, S. Bio/Technology 1991, 9, 1090
195. Lee, W. J.; Ryu, Y. W.; Seo, J. H. Process Biochem. 2000, 35, 1199
196. Silveira, M. M.; Jonas, R. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002, 59, 400
197. Gallezot, P. Chem. Soc. Rev. 2012, 41, 1538
198. Leigh, D.; Scopes, R. K.; Rogers, P. L. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1984, 20, 413
199. Zachariou, M.; Scopes, R. K. J. Bacteriol. 1986, 167, 863
200. Silveira, M. M.; Wisbeck, E.; Lemmel, C.; Erzinger, G.; da Costa, J. P. L.; Bertasso, M.; Jonas, R. J. Biotechnol. 1999, 75, 99
201. Savergave, L. S.; Gadre, R. V.; Vaidya, B. K.; Jogdand, V. V. Bioprocess. Biosyst. Eng. 2013, 36, 193
202. Makkee, M.; Kieboom, A. P. G.; van Bekkum, H. Starch/Staerke 1985, 37, 136
203. Saha, B. C.; Racine, F. M. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2011, 89, 879
204. Kulbe, K. D.; Schwab, U.; Howaldt, M. Ann. N.Y. Acad. Sci. 1987, 501, 216
205. Nidetzky, B.; Haltrich, D.; Schmidt, K.; Schmidt, H.; Weber, A.; Kulbe, K. D. Biocatal. Biotransform. 1996, 14, 47
206. Weber, M.; Weber, M.; Kleine-Boymann, M. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2004; Vol. 26, p 503.
207. Wierckx, N. J. P.; Ballerstedt, H.; de Bont, J. A. M.; Wery, J. Appl. Environ. Microbiol. 2005, 71, 8221
208. Rebsdat, S.; Mayer, D. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2000; Vol. 13, p 547.
209. de Bont, J. A. M.; van Ginkel, C. G.; Tramper, J.; Luyben, K. C. A. M. Enzyme Microb. Technol. 1983, 5, 55
210. Baer, H.; Bergamo, M.; Forlin, A.; Pottenger, L. H.; Lindner, J. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2012; p 1.
211. Leak, D. J.; Aikens, P. J.; Seyedmahmoudian, M. Trends Biotechnol. 1992, 10, 256
212. Dominguez de Maria, P.; van Gemert, R. W.; Straathof, A. J. J.; Hanefeld, U. Nat. Prod. Rep. 2010, 27, 370
213. Reuss, G.; Disteldorf, W.; Gamer, A. O.; Hilt, A. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2000; Vol. 15, p 735.
214. Sakai, Y.; Tani, Y. J. Ferment. Technol. 1987, 65, 489
215. Tani, Y.; Yamada, K.; Sakai, Y.; Vongsuvanlert, V. FEMS Microbiol. Rev. 1990, 87, 285
216. Eckert, M.; Fleischmann, G.; Jira, R.; Bolt, H. M.; Golka, K. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2006; Vol. 1, p 191.
217. Romano, P.; Suzzi, G.; Turbanti, L.; Polsinelli, M. FEMS Microbiol. Lett. 1994, 118, 213
218. Zhu, H. L.; Gonzalez, R.; Bobik, T. A. Appl. Environ. Microbiol. 2011, 77, 6441
219. Papa, A. J. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2012; Vol. 30, p 227.
220. Raff, D. K. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2013; p 1.
221. Pospisil, S.; Sedmera, P.; Havlicek, V.; Prikrylova, V. FEMS Microbiol. Lett. 1994, 119, 95
222. Rogers, P.; Palosaari, N. Appl. Environ. Microbiol. 1987, 53, 2761
223. Rodriguez, G. M.; Atsumi, S. Microb. Cell Fact. 2012, 11
224. Sifniades, S.; Levy, A. B.; Bahl, H. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 1, p 257.
225. Lehmann, D.; Radomski, N.; Lutke-Eversloh, T. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012, 96, 1325
226. Han, B.; Gopalan, V.; Ezeji, T. C. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2011, 91, 565
227. Ni, Y.; Sun, Z. H. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2009, 83, 415
228. Mermelstein, L. D.; Papoutsakis, E. T.; Petersen, D. J.; Bennett, G. N. Biotechnol. Bioeng. 1993, 42, 1053
229. Bermejo, L. L.; Welker, N. E.; Papoutsakis, E. T. Appl. Environ. Microbiol. 1998, 64, 1079
230. Rackemann, D. W.; Doherty, W. O. S. Biofuels Bioprod. Biorefin. 2011, 5, 198
231. Min, K.; Kim, S.; Yum, T.; Kim, Y.; Sang, B.-I.; Um, Y. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013, http://dx.doi.org/10.1007/s00253-013-4879-9.
232. Osterhout, R. E.; Burgard, A. P.; Burk, M. J.; Pharkya, P. Pat. Appl. WO2010132845, November 18, 2010.
233. Miller, C.; Fosmer, A.; Rush, B.; McMullin, T.; Beacom, D.; Suominen, P. In Comprehensive Biotechnology, 2nd ed.; Elsevier: New York, 2011; Vol. 3, p 179.
234. Curran, K. A.; Leavitt, J.; Karim, A.; Alper, H. S. Metab. Eng. 2013, 15, 55
235. Reutemann, W.; Kieczka, H. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 16, p 13.
236. Anonymous. Wikipedia; 2013.
237. Sawers, R. G. Biochem. Soc. Trans. 2005, 33, 42
238. Munjal, N.; Mattam, A. J.; Pramanik, D.; Srivastava, P. S.; Yazdani, S. S. Microb. Cell Fact. 2012, 11
239. Fan, Z. M.; Yuan, L.; Chatterjee, R. PLoS One 2009, 4, e4432
240. Cheung, H.; Tanke, R. S.; Torrence, G. P. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 1, p 209.
241. Mori, A. In Industrial Application of Immobilized Biocatalysts; Tanaka, A.; Tosa, T.; Kobayashi, T., Eds.; Marcel Dekker: New York, 1993; p 291.
242. Ebner, H.; Follmann, H.; Sellmer, S. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2000; Vol. 38, p 89.
243. Arnold, S.; Becker, T.; Delgado, A.; Emde, F.; Enenkel, A. J. Biotechnol. 2002, 97, 133
244. Xu, Z.; Shi, Z.; Jiang, L. In Comprehensive Biotechnology, 2nd ed.; Elsevier: New York, 2011; Vol. 3, p 189.
245. Agler, M. T.; Wrenn, B. A.; Zinder, S. H.; Angenent, L. T. Trends Biotechnol. 2011, 29, 70
246. Dischert, W.; Colomb, C.; Soucaille, P. U.S. Pat. Appl. 2012178136, July 12, 2012.
247. Miltenberger, K. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2000; Vol. 18, p 481.
248. Codd, G. A.; Bowien, B.; Schlegel, H. G. Arch. Microbiol. 1976, 110, 167
249. Nancucheo, I.; Johnson, D. B. Appl. Environ. Microbiol. 2010, 76, 461
250. Wei, G. D.; Yang, X. P.; Gan, T. L.; Zhou, W. Y.; Lin, J. P.; Wei, D. Z. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2009, 36, 1029
251. Dischert, W.; Soucaille, P. U.S. Pat. Appl. 2012315682, December 13, 2012.
252. Samel, U.-R.; Kohler, W.; Gamer, A. O.; Keuser, U. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 30, p 296.
253. Playne, M. J. In Comprehensive Biotechnology, 1 st ed.; Moo Young, M., Ed.; Pergamon Press: Oxford, 1985; Vol. 3, p 731.
254. Suwannakham, S.; Huang, Y.; Yang, S. T. Biotechnol. Bioeng. 2006, 94, 383
255. Zhang, A.; Yang, S. T. Biotechnol. Bioeng. 2009, 104, 766
256. Zhang, A.; Yang, S. T. Process Biochem. 2009, 44, 1346
257. Straathof, A. J. J.; Sie, S.; Franco, T. T.; van der Wielen, L. A. M. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2005, 67, 727
258. Ansede, J. H.; Pellechia, P. J.; Yoch, D. C. Appl. Environ. Microbiol. 1999, 65, 5075
259. Curson, A. R. J.; Todd, J. D.; Sullivan, M. J.; Johnston, A. W. B. Nat. Rev. Microbiol. 2011, 9, 849
260. Schweiger, G.; Buckel, W. FEBS Lett. 1985, 185, 253
261. Akedo, M.; Cooney, C. L.; Sinskey, A. J. Bio/Technology 1983, 1, 791
262. Lee, S. H.; Park, S. J.; Park, O. J.; Cho, J.; Rhee, J. W. J. Microbiol. Biotechnol. 2009, 19, 474
263. O'Brien, D. J.; Panzer, C. C.; Eisele, W. P. Biotechnol. Prog. 1990, 6, 237
264. Ikada, Y.; Jamshidi, K.; Tsuji, H.; Hyon, S. H. Macromolecules 1987, 20, 904
265. Datta, R.; Henry, M. J. Chem. Technol. Biotechnol. 2006, 81, 1119
266. Litchfield, J. H. In Advances in Applied Microbiology; Neidleman, S. L.; Laskin, A. I., Eds.; Elsevier Academic Press Inc: San Diego, 1996; Vol. 42, p 45.
267. Okano, K.; Tanaka, T.; Ogino, C.; Fukuda, H.; Kondo, A. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 85, 413
268. Yamane, T.; Tanaka, R. J. Biosci. Bioeng. 2013, 115, 90
269. Wang, L. M.; Zhao, B.; Li, F. S.; Xu, K.; Ma, C. Q.; Tao, F.; Li, Q. G.; Xu, P. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2011, 89, 1009
270. Ohleyer, E.; Blanch, H. W.; Wilke, C. R. Appl. Biochem. Biotechnol. 1985, 11, 317
271. Suthers, P. F.; Cameron, D. C. U.S. Patent 6852517 (B1), August 2, 2005.
272. Takamizawa, K.; Horitsu, H.; Ichikawa, T.; Kawai, K.; Suzuki, T. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1993, 40, 196
273. Jiang, X. L.; Meng, X.; Xian, M. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2009, 82, 995
274. Rathnasingh, C.; Raj, S. M.; Jo, J. E.; Park, S. Biotechnol. Bioeng. 2009, 104, 729
275. Luo, L. H.; Kim, C. H.; Heo, S. Y.; Oh, B. R.; Hong, W. K.; Kim, S.; Kim, D. H.; Seo, J. W. Bioresour. Technol. 2012, 103, 1
276. Henry, C. S.; Broadbelt, L. J.; Hatzimanikatis, V. Biotechnol. Bioeng. 2010, 106, 462
277. Liao, H. H.; Gokarn, R. R.; Gort, S. J.; Jessen, H. J.; Selifonova, O. U.S. Patent 8043841 (B2), October 25, 2011.
278. Rathnasingh, C.; Raj, S. M.; Lee, Y.; Catherine, C.; Ashoka, S.; Park, S. J. Biotechnol. 2012, 157, 633
279. Lynch, M. D.; Gill, R. T.; Lipscomb, T. E. W. U.S. Pat. Appl. 2013071893, March 21, 2013.
280. Li, Y.; Chen, J.; Lun, S. Y. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001, 57, 451
281. Xu, P.; Qiu, J. H.; Gao, C.; Ma, C. Q. J. Biosci. Bioeng. 2008, 105, 169
282. van Maris, A. J. A.; Geertman, J. M. A.; Vermeulen, A.; Groothuizen, M. K.; Winkler, A. A.; Piper, M. D. W.; van Dijken, J. P.; Pronk, J. T. Appl. Environ. Microbiol. 2004, 70, 159
283. Zelic, B.; Gostovic, S.; Vuorilehto, K.; Vasic-Racki, B.; Takors, R. Biotechnol. Bioeng. 2004, 85, 638
284. Ma, C. Q.; Xu, P.; Dou, Y. M.; Qu, Y. B. Biotechnol. Prog. 2003, 19, 1672
285. Gao, C.; Qiu, J. H.; Ma, C. Q.; Xu, P. PLoS One 2012, 7, e40755
286. Jiang, L.; Wang, J. F.; Liang, S. Z.; Cai, J.; Xu, Z. N.; Cen, P. L.; Yang, S. T.; Li, S. A. Biotechnol. Bioeng. 2011, 108, 31
287. Zhang, C. H.; Yang, H.; Yang, F. X.; Ma, Y. J. Curr. Microbiol. 2009, 59, 656
288. Dwidar, M.; Park, J. Y.; Mitchell, R. J.; Sang, B. I. Sci. World J. 2012, 2012, 471417
289. Sjöblom, M.; Rova, U.; Jaros, A.; Berglund, K. A., 2013; http://sim.confex.com/sim/35th/ webprogram/Paper23848.html.
290. Ryu, H. W.; Cho, K. S.; Kim, B. S.; Chang, Y. K.; Chang, H. N.; Shim, H. J. J. Microbiol. Biotechnol. 1999, 9, 751
291. Kawata, Y.; Kawasaki, K.; Shigeri, Y. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012, 96, 913
292. Lee, S. Y.; Lee, Y.; Wang, F. L. Biotechnol. Bioeng. 1999, 65, 363
293. Lee, S. H.; Park, S. J.; Lee, S. Y.; Hong, S. H. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008, 79, 633
294. Bauer, W. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 23, p 1.
295. Burk, M. J.; Burgard, A. P.; Osterhout, R. E.; Pharkya, P. Eur. Pat. Appl. 2285973, February 23, 2011.
296. Rohwerder, T.; Muller, R. H. Microb. Cell Fact. 2010, 9
297. Hoefel, T.; Wittmann, E.; Reinecke, L.; Weuster-Botz, D. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 88, 477
298. Cheng, K. K.; Zhao, X. B.; Zeng, J.; Zhang, J. A. Biofuels, Bioprod. Biorefin. 2012, 6, 302
299. Lin, H.; Bennett, G. N.; San, K. Y. Biotechnol. Bioeng. 2005, 90, 775
300. Beauprez, J. J.; De Mey, M.; Soetaert, W. K. Process Biochem. 2010, 45, 1103
301. Vemuri, G. N.; Eiteman, M. A.; Altman, E. J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2002, 28, 325
302. Okino, S.; Inui, M.; Yukawa, H. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2005, 68, 475
303. Meynial-Salles, I.; Dorotyn, S.; Soucaille, P. Biotechnol. Bioeng. 2008, 99, 129
304. Dijkgraaf, A. In C2W; Beta Publishers: The Hague, 2013.
305. Takata, I.; Tosa, T. In Industrial Application of Immobilized Biocatalysts; Tanaka, A.; Tosa, T.; Kobayashi, T., Eds.; Marcel Dekker: New York, 1993, p 53.
306. Battat, E.; Peleg, Y.; Bercovitz, A.; Rokem, J. S.; Goldberg, I. Biotechnol. Bioeng. 1991, 37, 1108
307. Goldberg, I.; Rokem, J. S.; Pines, O. J. Chem. Technol. Biotechnol. 2006, 81, 1601
308. Straathof, A. J. J.; Van Gulik, W. M. In Reprogramming Microbial Metabolic Pathways; Wang, X.; Chen, J.; Quinn, P., Eds.; Springer: Dordrecht, 2012, p 225.
309. Ng, T. K.; Hesser, R. J.; Stieglitz, B.; Griffiths, B. S.; Ling, L. B. Biotechnol. Bioeng. Symp. 1986, 17, 355
310. Willke, T.; Vorlop, K. D. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001, 56, 289
311. Okabe, M.; Lies, D.; Kanamasa, S.; Park, E. Y. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2009, 84, 597
312. Klement, T.; Büchs, J. Bioresour. Technol. 2013, 135, 422
313. Kuenz, A.; Gallenmüller, Y.; Willke, T.; Vorlop, K. D. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012, 96, 1209
314. Kanamasa, S.; Dwiarti, L.; Okabe, M.; Park, E. Y. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008, 80, 223
315. Barth, G.; Bodinus, C. " Entwicklung eines biotechnologischen Verfahrens zur Herstellung von Itaconsäure mit genetisch veränderten Hefen der Gattung Pseudozyma aus nachwachsenden Rohstoffen. Report, Institut für Mikrobiologie Dresden, 2011.
316. Steinbusch, K. J. J.; Hamelers, H. V. M; Plugge, C. M.; Buisman, C. J. N. Energy Environ. Sci. 2011, 4, 216
317. Seedorf, H.; Fricke, W. F.; Veith, B.; Bruggemann, H.; Liesegang, H.; Strittimatter, A.; Miethke, M.; Buckel, W.; Hinderberger, J.; Li, F. L.; Hagemeier, C.; Thauer, R. K.; Gottschalk, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 2128
318. Polen, T.; Spelberg, M.; Bott, M. J. Biotechnol. 2013, http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2012.07.008.
319. Niu, W.; Draths, K. M.; Frost, J. W. Biotechnol. Prog. 2002, 18, 201
320. Mizuno, S.; Yoshikawa, N.; Seki, M.; Mikawa, T.; Imada, Y. Appl. Microbiol. Biotechnol. 1988, 28, 20
321. Choi, W. J.; Lee, E. Y.; Cho, M. H.; Choi, C. Y. J. Ferment. Bioeng. 1997, 84, 70
322. Rosatella, A. A.; Simeonov, S. P.; Frade, R. F. M.; Afonso, C. A. M. Green Chem. 2011, 13, 754
323. Sousa, A. F.; Matos, M.; Freire, C. S. R.; Silvestre, A. J. D.; Coelho, J. F. J. Polymer 2013, 54, 513
324. Casanova, O.; Iborra, S.; Corma, A. ChemSusChem 2009, 2, 1138
325. Vuyyuru, K. R.; Strasser, P. Catal. Today 2012, 195, 144
326. Koopman, F.; Wierckx, N.; de Winde, J. H.; Ruijssenaars, H. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 4919
327. Koopman, F.; Wierckx, N.; de Winde, J. H.; Ruijssenaars, H. J. Bioresour. Technol. 2010, 101, 6291
328. van Deurzen, M. P. J.; van Rantwijk, F.; Sheldon, R. A. J. Carbohydr. Chem. 1997, 16, 299
329. Krystof, M.; Perez-Sanchez, M.; de Maria, P. D. ChemSusChem 2013, 6, 826
330. Milsom, P. E.; Meers, J. L. In Comprehensive Biotechnology, 1 st ed.; Moo Young, M., Ed.; Pergamon Press: Oxford, 1985; Vol. 3, p 665.
331. Dhillon, G. S.; Brar, S. K.; Verma, M.; Tyagi, R. D. Food Bioprocess Technol. 2011, 4, 505
332. Soccol, C. R.; Vandenberghe, L. P. S.; Rodrigues, C.; Pandey, A. Food Technol. Biotechnol. 2006, 44, 141
333. Papagianni, M.; Mattey, M.; Kristiansen, B. Enzyme Microb. Technol. 1999, 25, 710
334. Hustede, H.; Haberstroh, H.-J.; Schinzig, E. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2000; Vol. 17, p 37.
335. Rogers, P.; Chen, J.-S.; Zidwick, M. J. In The Prokaryotes, 3 rd ed.; Rosenberg, E.; Stackebrandt, E.; Thompson, F.; DeLong, E.; Lory, S., Eds.; Springer: Berlin, 2006; Vol. 1, p 511.
336. Singh, O. V.; Kumar, R. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2007, 75, 713
337. Anastassiadis, S.; Aivasidis, A.; Wandrey, C. U.S. Pat. Appl. 5962286, May 10, 1999.
338. Anastassiadis, S.; Aivasidis, A.; Wandrey, C. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2003, 61, 110
339. Reichstein, T.; Grüssner, A. Helv. Chim. Acta 1934, 17, 311
340. De Wulf, P.; Soetaert, W.; Vandamme, E. J. Biotechnol. Bioeng. 2000, 69, 339
341. Boudrant, J. Enzyme Microb. Technol. 1990, 12, 322
342. Hancock, R. D.; Viola, R. Trends Biotechnol. 2002, 20, 299
343. Takagi, Y.; Sugisawa, T.; Hoshino, T. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 86, 469
344. Cui, L.; Xie, P.; Sun, J. W.; Yu, T.; Yuan, J. Q. Comput. Chem. Eng. 2012, 36, 386
345. Sauer, M.; Porro, D.; Mattanovich, D.; Branduardi, P. Trends Biotechnol. 2008, 26, 100
346. Buchholz, K.; Seibel, J. Carbohydr. Res. 2008, 343, 1966
347. Anneken, D. J.; Both, S.; Christoph, R.; Fieg, G.; Steinberner, U.; Westfechtel, A. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2006; Vol. 14, p 73.
348. Schörken, U.; Kempers, P. Eur. J. Lipid Sci. Technol. 2009, 111, 627
349. Lennen, R. M.; Pfleger, B. F. Trends Biotechnol. 2012, 30, 659
350. Maki, T.; Takeda, K. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2000; Vol. 5, p 329.
351. Noda, S.; Kitazono, E.; Tanaka, T.; Ogino, C.; Kondo, A. Microb. Cell Fact. 2012, 11, 49
352. Pires, E. L.; Miranda, E. A.; Valenca, G. P. Appl. Biochem. Biotechnol. 2002, 98, 963
353. Chaibakhsh, N.; Rahman, M. B. A.; Basri, M.; Salleh, A. B.; Abd-Aziz, S. Biotechnol. J. 2010, 5, 848
354. Röttig, A.; Wenning, L.; Bröker, D.; Steinbüchel, A. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010, 85, 1713
355. OECD/FAO. The OECD/FAO Agricultural Outlook 2012-2021; OECD Publishing and FAO: Paris, 2012.
356. Du, W.; Li, W.; Sun, T.; Chen, X.; Liu, D. H. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2008, 79, 331
357. Zhang, B. H.; Weng, Y. Q.; Xu, H.; Mao, Z. P. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012, 93, 61
358. Li, L. L.; Du, W.; Liu, D. H.; Wang, L.; Li, Z. B. J. Mol. Catal., B 2006, 43, 58
359. Elbahloul, Y.; Steinbuchel, A. Appl. Environ. Microbiol. 2010, 76, 4560
360. Voith, M. Chem. Eng. News 2010, 88, 28
361. Zhu, Y. L.; Yang, J.; Dong, G. Q.; Zheng, H. Y.; Zhang, H. H.; Xiang, H. W.; Li, Y. W. Appl. Catal., B 2005, 57, 183
362. Varadarajan, S.; Miller, D. J. Biotechnol. Prog. 1999, 15, 845
363. Efe, C.; Straathof, A. I. J.; van der Wielen, L. A. M. Biotechnol. Bioeng. 2008, 99, 1392
364. Horvath, I. T.; Mehdi, H.; Fabos, V.; Boda, L.; Mika, L. T. Green Chem. 2008, 10, 238
365. Lange, J. P.; Vestering, J. Z.; Haan, R. J. Chem. Commun. 2007, 3488
366. Martin, C. H.; Prather, K. L. J. J. Biotechnol. 2009, 139, 61
367. Martin, C. H.; Wu, D. Y.; Prather, K. L. J. Appl. Environ. Microbiol. 2010, 76, 417
368. Brazdil, J. F. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2012, p 1.
369. But, A.; Le Notre, J.; Scott, E. L.; Wever, R.; Sanders, J. P. M. ChemSusChem 2012, 5, 1199
370. Le Notre, J.; Scott, E. L.; Franssen, M. C. R.; Sanders, J. P. M. Green Chem. 2011, 13, 807
371. Xie, S. X.; Kato, Y.; Asano, Y. Biosci. Biotechnol. Biochem. 2001, 65, 2666
372. Kato, Y.; Ooi, R.; Asano, Y. Appl. Environ. Microbiol. 2000, 66, 2290
373. Soucaille, P.; Figge, R. Pat. Appl. WO2007144346, December 21, 2007.
374. Peters-Wendisch, P.; Stolz, M.; Etterich, H.; Kennerknecht, N.; Sahm, H.; Eggeling, L. Appl. Environ. Microbiol. 2005, 71, 7139
375. Rontein, D.; Nishida, I.; Tashiro, G.; Yoshioka, K.; Wu, W. I.; Voelker, D. R.; Basset, G.; Hanson, A. D. J. Biol. Chem. 2001, 276, 35523
376. Rontein, D.; Rhodes, D.; Hanson, A. D. Plant Cell Physiol. 2003, 44, 1185
377. Medici, R.; de Maria, P. D.; Otten, L. G.; Straathof, A. J. J. Adv. Synth. Catal. 2011, 353, 2369
378. Foti, M.; Médici, R.; Ruijssenaars, H. J. J. Biotechnol. 2013, http://dx.doi.org/10.1016/j.jbiotec.2013.07.013.
379. Qian, Z. G.; Xia, X. X.; Lee, S. Y. Biotechnol. Bioeng. 2009, 104, 651
380. Schneider, J.; Eberhardt, D.; Wendisch, V. F. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012, 95, 169
381. Bommarius, A. S.; Drauz, K. Bioorg. Med. Chem. 1994, 2, 617
382. Konst, P. M.; Franssen, M. C. R.; Scott, E. L.; Sanders, J. P. M. Green Chem. 2011, 13, 1167
383. Konst, P. M.; Turras, P.; Franssen, M. C. R.; Scott, E. L.; Sanders, J. P. M. Adv. Synth. Catal. 2010, 352, 1493
384. Kind, S.; Wittmann, C. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2011, 91, 1287
385. Mimizuka, T.; Kazami, J. Jap. Pat. Appl. 2002223771, August 13, 2002.
386. Teng, Y. L.; Scott, E. L.; van Zeeland, A. N. T.; Sanders, J. P. M. Green Chem. 2011, 13, 624
387. Mimitsuka, T.; Sawai, H.; Hatsu, M.; Yamada, K. Biosci. Biotechnol. Biochem. 2007, 71, 2130
388. Tateno, T.; Okada, Y.; Tsuchidate, T.; Tanaka, T.; Fukuda, H.; Kondo, A. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2009, 82, 115
389. Kind, S.; Jeong, W. K.; Schroder, H.; Wittmann, C. Metab. Eng. 2010, 12, 341
390. Qian, Z. G.; Xia, X. X.; Lee, S. Y. Biotechnol. Bioeng. 2011, 108, 93
391. Chen, N.; Huang, J.; Feng, Z. B.; Yu, L.; Xu, Q. Y.; Wen, T. Y. Appl. Biochem. Biotechnol. 2009, 158, 595
392. Lee, K. H.; Park, J. H.; Kim, T. Y.; Kim, H. U.; Lee, S. Y. Mol. Syst. Biol. 2007, 3, 149
393. Drauz, K.; Grayson, I.; Kleemann, A.; Krimmer, H.-P.; Leuchtenberger, W.; Weckbecker, C. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2007; Vol. 3, p 1.
394. Hasegawa, S.; Uematsu, K.; Natsuma, Y.; Suda, M.; Hiraga, K.; Jojima, T.; Inui, M.; Yukawa, H. Appl. Environ. Microbiol. 2012, 78, 865
395. Hasegawa, S.; Suda, M.; Uematsu, K.; Natsuma, Y.; Hiraga, K.; Jojima, T.; Inui, M.; Yukawa, H. Appl. Environ. Microbiol. 2013, 79, 1250
396. Liese, A.; Seelbach, K.; Buchholz, A.; Haberland, J. In Industrial Biotransformations; Liese, A.; Seelbach, K.; Wandrey, C., Eds.; Wiley-VCH: Weinheim, 2006; p 147.
397. Frey, K. M.; Oppermann-Sanio, F. B.; Schmidt, H.; Steinbuchel, A. Appl. Environ. Microbiol. 2002, 68, 3377
398. Abd-El-Karem, Y.; Elbers, T.; Reichelt, R.; Steinbuchel, A. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2011, 89, 1177
399. Ault, A. J. Chem. Educ. 2004, 81, 347
400. Chen, N.; Du, J.; Liu, H.; Xu, Q. Y. Ann. Microbiol. 2009, 59, 317
401. Becker, J.; Zelder, O.; Hafner, S.; Schroder, H.; Wittmann, C. Metab. Eng. 2011, 13, 159
402. Konst, P. M.; Franssen, M. C. R.; Scott, E. L.; Sanders, J. P. M. Green Chem. 2009, 11, 1646
403. Lammens, T. M.; De Biase, D.; Franssen, M. C. R.; Scott, E. L.; Sanders, J. P. M. Green Chem. 2009, 11, 1562
404. Dhakal, R.; Bajpai, V. K.; Baek, K. H. Braz. J. Microbiol. 2012, 43, 1230
405. Li, H. X.; Qiu, T.; Huang, G. D.; Cao, Y. S. Microb. Cell. Fact. 2010, 9, doi:10.1186/1475-2859-9-85.
406. Lee, S.; Ahn, J.; Kim, Y. G.; Jung, J. K.; Lee, H.; Lee, E. G. Int. J. Mol. Sci. 2013, 14, 1728
407. Ritz, J.; Fuchs, H.; Kieczka, H.; Moran, W. C. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 00, p 1.
408. Raemakers-Franken, P. C.; Nossin, P. M. M.; Brandts, P. M.; Wubbolts, M. G.; Peeters, W. P. H.; Ernste, S.; De Wildeman, S. M. A.; Schuermann, M. U.S. Patent 7491520 (B2), February 17, 2009.
409. Raemakers-Franken, P. C.; Schuermann, M.; Trefzer, A. C.; De Wildeman, S. M. A. Pat. Appl. WO2009113855, September 17, 2009.
410. Turk, S. C. H.; Schuermann, M.; Trefzer, A. C.; Raemakers-Franken, P. C.; Menke, H. H. Pat. Appl. WO2012031911, March 15, 2012.
411. Trefzer, A. C.; Turk, S. C. H. J. Pat. Appl. WO2012031910, March 15, 2012.
412. Fortmann, L.; Rosenberg, A. Chemosphere 1984, 13, 53
413. van Pee, K. H. In Natural Product Biosynthesis by Microorganisms and Plants, Pt B; Hopwood, D. A., Ed.; Elsevier Academic Press Inc: San Diego, 2012; Vol. 516, p 237.
414. Blasiak, L. C.; Drennan, C. L. Acc. Chem. Res. 2009, 42, 147
415. Matucha, M.; Gryndler, M.; Forczek, S. T.; Uhlirova, H.; Fuksova, K.; Schroder, P. Environ. Chem. Lett. 2003, 1, 127
416. van Pee, K. H. Curr. Org. Chem. 2012, 16, 2583
417. Deng, H.; O'Hagan, D. Curr. Opin. Chem. Biol. 2008, 12, 582
418. Rossberg, M.; Lendle, W.; Pfleiderer, G.; Tögel, A.; Torkelson, T. R.; Beutel, K. K. In Ullmann's Encyclopedia of Industrial Chemistry; Wiley-VCH: Weinheim, 2011; Vol. 9, p 15.
419. Bayer, T. S.; Widmaier, D. M.; Temme, K.; Mirsky, E. A.; Santi, D. V.; Voigt, C. A. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 6508
420. Ni, X. H.; Hager, L. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 3611
421. Navarro, R. M.; Pena, M. A.; Fierro, J. L. G. Chem. Rev. 2007, 107, 3952
422. Lee, H. S.; Vermaas, W. F. J.; Rittmann, B. E. Trends Biotechnol. 2010, 28, 262
423. Woodward, J.; Orr, M.; Cordray, K.; Greenbaum, E. Nature 2000, 405, 1014
424. Martín del Campo, J. S.; Rollin, J.; Myung, S.; Chun, Y.; Chandrayan, S.; Patiño, R.; Adams, M. W. W.; Zhang, Y. H. P. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 4587
425. Dennis, M.; Kolattukudy, P. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 5306
426. Van Dien, S. Curr. Opin. Biotechnol. 2013, http://dx.doi.org/10.1016/j. copbio.2013.03.002.
427. Straathof, A. J. J. In Comprehensive Biotechnology; 2 nd ed.; Moo-Young, M., Ed.; Elsevier: New York, 2011; Vol. 2, p 811.
428. Ellis, L. B. M.; Roe, D.; Wackett, L. P. Nucleic Acids Res. 2006, 34, D517
429. Schomburg, I.; Chang, A. J.; Hofmann, O.; Ebeling, C.; Ehrentreich, F.; Schomburg, D. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 54
430. Kanehisa, M.; Goto, S.; Kawashima, S.; Nakaya, A. Nucleic Acids Res. 2002, 30, 42
431. Cho, A.; Yun, H.; Park, J. H.; Lee, S. Y.; Park, S. BMC Syst. Biol. 2010, 4, doi:10.1186/1752-0509-4-35.
432. Brunk, E.; Neri, M.; Tavernelli, I.; Hatzimanikatis, V.; Rothlisberger, U. Biotechnol. Bioeng. 2012, 109, 572
433. Soh, K. C.; Hatzimanikatis, V. Curr. Opin. Microbiol. 2010, 13, 350
434. Goldberg, R. N.; Tewari, Y. B.; Bhat, T. N. Bioinformatics 2004, 20, 2874
435. Jankowski, M. D.; Henry, C. S.; Broadbelt, L. J.; Hatzimanikatis, V. Biophys. J. 2008, 95, 1487
436. Blank, L. M.; Ebert, B. E. Curr. Opin. Biotechnol. 2013, 24, 13
437. Jang, Y. S.; Park, J. M.; Choi, S.; Choi, Y. J.; Seung, D. Y.; Cho, J. H.; Lee, S. Y. Biotechnol. Adv. 2012, 30, 989
438. Fisher, M. A.; Tullman-Ercek, D. Curr. Opin. Biotechnol. 2013, http://dx.doi.org/10.1016/j.copbio.2013.02.027.
439. Woodley, J. M.; Bisschops, M.; Straathof, A. J. J.; Ottens, M. J. Chem. Technol. Biotechnol. 2008, 83, 121