-
2
-
-
33748633480
-
-
Warshel, A.; Sharma, P. K.; Kato, M.; Xiang, Y.; Liu, H.; Olsson, M. H. M. Chem. Rev. 2006, 106, 3210-3235
-
(2006)
Chem. Rev.
, vol.106
, pp. 3210-3235
-
-
Warshel, A.1
Sharma, P.K.2
Kato, M.3
Xiang, Y.4
Liu, H.5
Olsson, M.H.M.6
-
3
-
-
1542355573
-
-
Cleland, W. W.; Frey, P. A.; Gerlt, J. A. J. Biol. Chem. 1998, 273, 22529-22532
-
(1998)
J. Biol. Chem.
, vol.273
, pp. 22529-22532
-
-
Cleland, W.W.1
Frey, P.A.2
Gerlt, J.A.3
-
4
-
-
0028040716
-
-
Frey, P. A.; Whitt, S. A.; Tobin, J. B. Science 1994, 264, 1927-1930
-
(1994)
Science
, vol.264
, pp. 1927-1930
-
-
Frey, P.A.1
Whitt, S.A.2
Tobin, J.B.3
-
6
-
-
10544255345
-
-
Halkides, C. J.; Wu, Y. Q.; Murray, C. J. Biochemistry 1996, 35, 15941-15948
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 15941-15948
-
-
Halkides, C.J.1
Wu, Y.Q.2
Murray, C.J.3
-
7
-
-
77957134656
-
-
Zhao, Q. J.; Abeygunawardana, C.; Talalay, P.; Mildvan, A. S. Biochemistry 1996, 33, 2682-2687
-
(1996)
Biochemistry
, vol.33
, pp. 2682-2687
-
-
Zhao, Q.J.1
Abeygunawardana, C.2
Talalay, P.3
Mildvan, A.S.4
-
10
-
-
33646262869
-
-
Kraut, D. A.; Sigala, P. A.; Pybus, B.; Liu, C. W.; Ringe, D.; Petsko, G. A.; Herschlag, D. PLoS Biol. 2006, 4, 0501-0519
-
(2006)
PLoS Biol.
, vol.4
, pp. 0501-0519
-
-
Kraut, D.A.1
Sigala, P.A.2
Pybus, B.3
Liu, C.W.4
Ringe, D.5
Petsko, G.A.6
Herschlag, D.7
-
11
-
-
70149104037
-
-
Schwans, J. P.; Kraut, D. A.; Herschlag, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 14271-14275
-
(2009)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.106
, pp. 14271-14275
-
-
Schwans, J.P.1
Kraut, D.A.2
Herschlag, D.3
-
12
-
-
53849096731
-
-
Sigala, P. A.; Kraut, D. A.; C., J. M. M.; Pybus, B.; Ruben, E. A.; Ringe, D.; Petsko, G. A.; Herschlag, D. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 13696-13708
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.130
, pp. 13696-13708
-
-
Sigala, P.A.1
Kraut, D.A.2
M, M.C.J.3
Pybus, B.4
Ruben, E.A.5
Ringe, D.6
Petsko, G.A.7
Herschlag, D.8
-
13
-
-
77749239790
-
-
Kamerlin, S. C. L.; Sharma, P. K.; Chu, Z. T.; Warshel, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2010, 107, 4075-4080
-
(2010)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.107
, pp. 4075-4080
-
-
Kamerlin, S.C.L.1
Sharma, P.K.2
Chu, Z.T.3
Warshel, A.4
-
16
-
-
84962460761
-
-
Kumar, G. A.; Pan, Y.; Smallwood, C. J.; McAllister, M. A. J. Comput. Chem. 1998, 19, 1345-1352
-
(1998)
J. Comput. Chem.
, vol.19
, pp. 1345-1352
-
-
Kumar, G.A.1
Pan, Y.2
Smallwood, C.J.3
McAllister, M.A.4
-
17
-
-
77951226274
-
-
Kamerlin, S. C. L.; Warshel, A. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2010, 78, 1339-1375
-
(2010)
Proteins: Struct., Funct., Bioinf.
, vol.78
, pp. 1339-1375
-
-
Kamerlin, S.C.L.1
Warshel, A.2
-
18
-
-
84891505647
-
-
Pihko P.M. Ed.; Wiley VCH Verlag GmBH & Co.: Weinheim, Germany.
-
Pihko, P.; Rapakko, S.; Wierenga, R. K. In Hydrogen Bonding in Organic Synthesis; Pihko, P. M., Ed.; Wiley VCH Verlag GmBH & Co.: Weinheim, Germany, 2009.
-
(2009)
Hydrogen Bonding in Organic Synthesis
-
-
Pihko, P.1
Rapakko, S.2
Wierenga, R.K.3
-
19
-
-
0015497445
-
-
Robertus, J. D.; Kraut, J.; Alden, R. A.; Birktoft, J. J. Biochemistry 1972, 11, 4293-4303
-
(1972)
Biochemistry
, vol.11
, pp. 4293-4303
-
-
Robertus, J.D.1
Kraut, J.2
Alden, R.A.3
Birktoft, J.J.4
-
20
-
-
0343006258
-
-
Bryan, P.; Pantoliano, M. W.; Quill, S. G.; Hsiao, H.-Y.; Poulos, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83, 3743-3745
-
(1986)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.83
, pp. 3743-3745
-
-
Bryan, P.1
Pantoliano, M.W.2
Quill, S.G.3
Hsiao, H.-Y.4
Poulos, T.5
-
21
-
-
0024538543
-
-
Warshel, A.; Naray-Szabo, G.; Sussman, F.; Hwang, J.-K. Biochemistry 1989, 28, 3629-3637
-
(1989)
Biochemistry
, vol.28
, pp. 3629-3637
-
-
Warshel, A.1
Naray-Szabo, G.2
Sussman, F.3
Hwang, J.-K.4
-
22
-
-
33847006589
-
-
Warshel, A.; Sharma, P. K.; Chu, Z. T.; Aqvist, J. Biochemistry 2007, 46, 1466-1476
-
(2007)
Biochemistry
, vol.46
, pp. 1466-1476
-
-
Warshel, A.1
Sharma, P.K.2
Chu, Z.T.3
Aqvist, J.4
-
27
-
-
0026596911
-
-
Lee, F. S.; Chu, Z. T.; Bolger, M. B.; Warshel, A. Protein Eng. 1992, 5, 215-228
-
(1992)
Protein Eng.
, vol.5
, pp. 215-228
-
-
Lee, F.S.1
Chu, Z.T.2
Bolger, M.B.3
Warshel, A.4
-
28
-
-
0342321950
-
-
Sham, Y. Y.; Chu, Z. T.; Tao, H.; Warshel, A. Proteins: Struct., Funct., Genet. 2000, 39, 393-407
-
(2000)
Proteins: Struct., Funct., Genet.
, vol.39
, pp. 393-407
-
-
Sham, Y.Y.1
Chu, Z.T.2
Tao, H.3
Warshel, A.4
-
29
-
-
34547457947
-
-
Sharma, P. K.; Chu, Z. T.; Olsson, M. H. M.; Warshel, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 9661-9666
-
(2007)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.104
, pp. 9661-9666
-
-
Sharma, P.K.1
Chu, Z.T.2
Olsson, M.H.M.3
Warshel, A.4
-
30
-
-
38349001243
-
-
Ishikita, H.; Warshel, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 697-700
-
(2008)
Angew. Chem., Int. Ed.
, vol.47
, pp. 697-700
-
-
Ishikita, H.1
Warshel, A.2
-
31
-
-
0024278562
-
-
Warshel, A.; Sussman, F.; Hwang, J.-K. J. Mol. Biol. 1988, 201, 139-159
-
(1988)
J. Mol. Biol.
, vol.201
, pp. 139-159
-
-
Warshel, A.1
Sussman, F.2
Hwang, J.-K.3
-
33
-
-
0024713705
-
-
Warshel, A.; Åqvist, J.; Creighton, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 5820-5824
-
(1989)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.86
, pp. 5820-5824
-
-
Warshel, A.1
Åqvist, J.2
Creighton, S.3
-
35
-
-
0033954256
-
-
Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 235-242
-
(2000)
Nucleic Acids Res.
, vol.28
, pp. 235-242
-
-
Berman, H.M.1
Westbrook, J.2
Feng, Z.3
Gilliland, G.4
Bhat, T.N.5
Weissig, H.6
Shindyalov, I.N.7
Bourne, P.E.8
-
37
-
-
0041429611
-
-
Štrajbl, M.; Shurki, A.; Kato, M.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 10228-10237
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.125
, pp. 10228-10237
-
-
Štrajbl, M.1
Shurki, A.2
Kato, M.3
Warshel, A.4
-
39
-
-
0000728542
-
-
Lee, F. S.; Chu, Z. T.; Warshel, A. J. Comput. Chem. 1993, 14, 161-185
-
(1993)
J. Comput. Chem.
, vol.14
, pp. 161-185
-
-
Lee, F.S.1
Chu, Z.T.2
Warshel, A.3
-
40
-
-
0038626673
-
-
In; Gaussian, Inc., Wallingford, CT.
-
Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A.; Vreven, J. T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.;; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, G.; Scalmani, N.; Rega, G. A.; Petersson, H. N.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.;; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas; O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Strfanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. In Gaussian 03; Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2004.
-
(2004)
Gaussian 03
-
-
Frisch, M.J.1
Trucks, G.W.2
Schlegel, H.B.3
Scuseria, G.E.4
Robb, M.A.5
Cheeseman, J.R.6
Montgomery, J.A.7
Vreven, J.T.8
Kudin, K.N.9
Burant, J.C.10
Millam, J.M.11
Iyengar, S.S.12
Tomasi, J.13
Barone, V.14
Mennucci, B.15
Cossi, G.16
Scalmani, N.17
Rega, G.A.18
Petersson, H.N.19
Hada, M.20
Ehara, M.21
Toyota, K.22
Fukuda, R.23
Hasegawa, J.24
Ishida, M.25
Nakajima, T.26
Honda, Y.27
Kitao, O.28
Nakai, H.29
Klene, M.30
Li, X.31
Knox, J.E.32
Hratchian, H.P.33
Cross, J.B.34
Bakken, V.35
Adamo, C.36
Jaramillo, J.37
Gomperts, R.38
Stratmann, R.E.39
Yazyev, O.40
Austin, A.J.41
Pomelli, C.42
Ochterski, J.W.43
Ayala, P.Y.44
Morokuma, K.45
Voth, G.A.46
Salvador, P.47
Dannenberg, J.J.48
Zakrzewski, V.G.49
Dapprich, S.50
Daniels, A.D.51
Strain, M.C.52
Farkas, O.53
Malick, D.K.54
Rabuck, A.D.55
Raghavachari, K.56
Foresman, J.B.57
Ortiz, J.V.58
Cui, Q.59
Baboul, A.G.60
Clifford, S.61
Cioslowski, J.62
Strfanov, B.B.63
Liu, G.64
Liashenko, A.65
Piskorz, P.66
Komaromi, I.67
Martin, R.L.68
Fox, D.J.69
Keith, T.70
Al-Laham, M.A.71
Peng, C.Y.72
Nanayakkara, A.73
Challacombe, M.74
Gill, P.M.W.75
Johnson, B.76
Chen, W.77
Wong, M.W.78
Gonzalez, C.79
Pople, J.A.80
more..
-
42
-
-
12944268384
-
-
Kim, K. S.; Kyung, S. O.; Lee, J. Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 6373-6378
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.97
, pp. 6373-6378
-
-
Kim, K.S.1
Kyung, S.O.2
Lee, J.Y.3
-
43
-
-
11644294259
-
-
Bentzien, J.; Muller, R. P.; Florian, J.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2293-2301
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 2293-2301
-
-
Bentzien, J.1
Muller, R.P.2
Florian, J.3
Warshel, A.4
-
44
-
-
33846076119
-
-
Warshel, A.; Sharma, P. K.; Kato, M.; Parson, W. W. Biochim. Biophys. Acta 2006, 1764, 1647-1676
-
(2006)
Biochim. Biophys. Acta
, vol.1764
, pp. 1647-1676
-
-
Warshel, A.1
Sharma, P.K.2
Kato, M.3
Parson, W.W.4
-
46
-
-
65249154106
-
-
Roca, M.; Vardi-Kilshtain, A.; Warshel, A. Biochemistry 2009, 48, 3046-3056
-
(2009)
Biochemistry
, vol.48
, pp. 3046-3056
-
-
Roca, M.1
Vardi-Kilshtain, A.2
Warshel, A.3
-
47
-
-
74849088792
-
-
Roethlisberger, D.; Khersonsky, O.; Wollacott, A. M.; Jiang, L.; DeChancie, J.; Betker, J.; Gallaher, J. L.; Althoff, E. A.; Zanghellini, A.; Dym, O.; Albeck, S.; Houk, K. N.; Tawfik, D. S.; Baker, D. Nature 2008, 453, 164-166
-
(2008)
Nature
, vol.453
, pp. 164-166
-
-
Roethlisberger, D.1
Khersonsky, O.2
Wollacott, A.M.3
Jiang, L.4
Dechancie, J.5
Betker, J.6
Gallaher, J.L.7
Althoff, E.A.8
Zanghellini, A.9
Dym, O.10
Albeck, S.11
Houk, K.N.12
Tawfik, D.S.13
Baker, D.14
-
48
-
-
40449116114
-
-
Jiang, L.; Althoff, E. A.; Clemente, F. R.; Doyle, L.; Roethlisberger, D.; Zanghellini, A.; Gallaher, J. L.; Betker, J. L.; Tanaka, F.; Barbas, I., C. F.; Hilvert, D.; Houk, K. N.; Stoddard, B. L.; Baker, D. Science 2008, 319, 1387-1391
-
(2008)
Science
, vol.319
, pp. 1387-1391
-
-
Jiang, L.1
Althoff, E.A.2
Clemente, F.R.3
Doyle, L.4
Roethlisberger, D.5
Zanghellini, A.6
Gallaher, J.L.7
Betker, J.L.8
Tanaka, F.9
Barbas, I..C.F.10
Hilvert, D.11
Houk, K.N.12
Stoddard, B.L.13
Baker, D.14
-
50
-
-
0032567157
-
-
Schiøtt, B.; Iversen, B. B.; Madsen, G. K. H.; Bruice, T. C. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 12117-12124
-
(1998)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.120
, pp. 12117-12124
-
-
Schiøtt, B.1
Iversen, B.B.2
Madsen, G.K.H.3
Bruice, T.C.4
-
51
-
-
65549084794
-
-
Vardi-Kilshtain, A.; Roca, M.; Warshel, A. Biotechnol. J. 2009, 4, 495-500
-
(2009)
Biotechnol. J.
, vol.4
, pp. 495-500
-
-
Vardi-Kilshtain, A.1
Roca, M.2
Warshel, A.3
-
52
-
-
0034610398
-
-
Warshel, A.; Strajbl, M.; Villa, J.; Florian, J. Biochemistry 2000, 39, 14728-14738
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 14728-14738
-
-
Warshel, A.1
Strajbl, M.2
Villa, J.3
Florian, J.4
-
54
-
-
0034102419
-
-
Wu, N.; Mo, Y.; Gao, J.; Pai, E. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 2017-2022
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.97
, pp. 2017-2022
-
-
Wu, N.1
Mo, Y.2
Gao, J.3
Pai, E.F.4
-
55
-
-
0034682613
-
-
Miller, B.; Snider, M. J.; Short, S.; Wolfenden, R. Biochemistry 2000, 39, 8113-8118
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 8113-8118
-
-
Miller, B.1
Snider, M.J.2
Short, S.3
Wolfenden, R.4
-
56
-
-
75749143420
-
-
Barnett, S. A.; Amyes, T. L.; Wood, B. M.; Gerlt, J. A.; Richard, J. P. Biochemistry 2010, 49, 824-826
-
(2010)
Biochemistry
, vol.49
, pp. 824-826
-
-
Barnett, S.A.1
Amyes, T.L.2
Wood, B.M.3
Gerlt, J.A.4
Richard, J.P.5
-
58
-
-
38949172353
-
-
Amyes, T. L.; Wood, B. M.; Chan, K.; Gerlt, J. A.; Richard, J. P. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 1574-1575
-
(2008)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.130
, pp. 1574-1575
-
-
Amyes, T.L.1
Wood, B.M.2
Chan, K.3
Gerlt, J.A.4
Richard, J.P.5
-
60
-
-
67649210974
-
-
Chan, K. K.; Wood, B. M.; Fedorov, A. A.; Fedorov, E. V.; Imker, H. J.; Amyes, T. L.; Richard, J. P.; Almo, S. C.; Gerlt, J. A. Biochemistry 2009, 48, 5518-5531
-
(2009)
Biochemistry
, vol.48
, pp. 5518-5531
-
-
Chan, K.K.1
Wood, B.M.2
Fedorov, A.A.3
Fedorov, E.V.4
Imker, H.J.5
Amyes, T.L.6
Richard, J.P.7
Almo, S.C.8
Gerlt, J.A.9
-
66
-
-
0000997465
-
-
Štrajbl, M.; Sham, Y. Y.; Villà, J.; Chu, Z. T.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 4578-4584
-
(2000)
J. Phys. Chem. B
, vol.104
, pp. 4578-4584
-
-
Štrajbl, M.1
Sham, Y.Y.2
Villà, J.3
Chu, Z.T.4
Warshel, A.5
-
67
-
-
66449098496
-
-
Kamerlin, S. C. L.; Haranczyk, M.; Warshel, A. ChemPhysChem 2009, 10, 1125-1134
-
(2009)
ChemPhysChem
, vol.10
, pp. 1125-1134
-
-
Kamerlin, S.C.L.1
Haranczyk, M.2
Warshel, A.3
-
68
-
-
0022960903
-
-
Dewar, M. J. Enzyme 1986, 36, 8-20
-
(1986)
Enzyme
, vol.36
, pp. 8-20
-
-
Dewar, M.J.1
-
69
-
-
0018771457
-
-
Andrea, T. A.; Dietrich, S. W.; Murray, W. J.; Kollman, P. A.; Jorgensen, E. C.; Rothenberg, S. J. J. Med. Chem. 1979, 22, 221-232
-
(1979)
J. Med. Chem.
, vol.22
, pp. 221-232
-
-
Andrea, T.A.1
Dietrich, S.W.2
Murray, W.J.3
Kollman, P.A.4
Jorgensen, E.C.5
Rothenberg, S.J.6
-
70
-
-
0032253961
-
-
Tantillo, D. J.; Chen, J.; Houk, K. N. Curr. Opin. Chem. Biol. 1988, 2, 743-750
-
(1988)
Curr. Opin. Chem. Biol.
, vol.2
, pp. 743-750
-
-
Tantillo, D.J.1
Chen, J.2
Houk, K.N.3
-
71
-
-
0001275939
-
-
Oh, K. S.; Cha, S.-S.; Kim, D.-H.; Choo, H.-S.; Ha, N.-C.; Choi, G.; Lee, P. L.; Tarakeshwar, P.; Son, S. H.; Choi, K. Y.; Oh, B.-H.; Kim, K. S. Biochemistry 2000, 39, 13891-13896
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 13891-13896
-
-
Oh, K.S.1
Cha, S.-S.2
Kim, D.-H.3
Choo, H.-S.4
Ha, N.-C.5
Choi, G.6
Lee, P.L.7
Tarakeshwar, P.8
Son, S.H.9
Choi, K.Y.10
Oh, B.-H.11
Kim, K.S.12
|