Structural basis of head to head polyketide fusion by CorB

Chemical Science

Volumn 6, Issue 11, 2015, Pages 6525-6536

  Zocher, Georg ^a   Vilstrup, Joachim ^b   Heine, Daniel ^c   Hallab, Asis ^d   Goralski, Emilie ^e   Hertweck, Christian ^c,f   Stahl, Mark ^a   Schäberle, Till F ^e   Stehle, Thilo ^a,g  

^a UNIVERSITY OF TÜBINGEN   (Germany)

^b AARHUS UNIVERSITY   (Denmark)

^c HANS KNÖLL INSTITUTE   (Germany)

^d MAX PLANCK INSTITUTE FOR PLANT BREEDING RESEARCH   (Germany)

^e UNIVERSITY OF BONN   (Germany)

^f FRIEDRICH SCHILLER UNIVERSITY JENA   (Germany)

^g VANDERBILT UNIVERSITY MEDICAL CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; BIOCHEMISTRY; CATALYSIS; CHAINS; CONDENSATION REACTIONS; STRUCTURAL ANALYSIS;

CATALYTIC TRIAD; CORALLOPYRONIN; DENSITY-BASED MODEL; HIGH RESOLUTION; POLYKETIDE SYNTHASES; REACTION CATALYZED; SITE DIRECTED MUTAGENESIS; STRUCTURAL BASIS;

KETONES;

EID: 84944096766     PISSN: 20416520     EISSN: 20416539     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5sc02488a     Document Type: Article

References (61)

1. I. Chopra L. Hesse A. J. O'Neill J. Appl. Microbiol. 2002 92 4S 15S
2. C. Hertweck Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2009 48 4688 4716
3. J. W. Li J. C. Vederas Science 2009 325 161 165
4. O. Erol T. F. Schaberle A. Schmitz S. Rachid C. Gurgui M. El Omari F. Lohr S. Kehraus J. Piel R. Muller G. M. Konig ChemBioChem 2010 11 1253 1265
5. A. Schiefer A. Schmitz T. F. Schaberle S. Specht C. Lammer K. L. Johnston D. G. Vassylyev G. M. Konig A. Hoerauf K. Pfarr J. Infect. Dis. 2012 206 249 257
6. J. Mukhopadhyay K. Das S. Ismail D. Koppstein M. Jang B. Hudson S. Sarafianos S. Tuske J. Patel R. Jansen H. Irschik E. Arnold R. H. Ebright Cell 2008 135 295 307
7. K. Mariner M. McPhillie R. Trowbridge C. Smith A. J. O'Neill C. W. Fishwick I. Chopra Antimicrob. Agents Chemother. 2011 55 2413 2416
8. H. Irschik R. Jansen G. Hofle K. Gerth H. Reichenbach J. Antibiot. 1985 38 145 152
9. T. F. Schaberle A. Schiefer A. Schmitz G. M. Konig A. Hoerauf K. Pfarr Int. J. Med. Microbiol. 2014 304 72 78
10. S. Brand D. Holscher A. Schierhorn A. Svatos J. Schroder B. Schneider Planta 2006 224 413 428
11. Y. Katsuyama M. Matsuzawa N. Funa S. Horinouchi J. Biol. Chem. 2007 282 37702 37709
12. B. Shen Curr. Opin. Chem. Biol. 2003 7 285 295
13. S. J. Wakil J. K. Stoops V. C. Joshi Annu. Rev. Biochem. 1983 52 537 579
14. B. Middleton Biochem. J. 1972 126 35 47
15. A. M. Haapalainen G. Merilainen R. K. Wierenga Trends Biochem. Sci. 2006 31 64 71
16. C. Davies R. J. Heath S. W. White C. O. Rock Structure 2000 8 185 195
17. T. Bretschneider G. Zocher M. Unger K. Scherlach T. Stehle C. Hertweck Nat. Chem. Biol. 2012 8 154 161
18. Q. L. He X. Y. Jia M. C. Tang Z. H. Tian G. L. Tang W. Liu ChemBioChem 2009 10 813 819
19. H. Sucipto J. H. Sahner E. Prusov S. C. Wenzel R. W. Hartmann J. Koehnke R. Muller Chem. Sci. 2015 6 5076 5085
20. M. N. Price P. S. Dehal A. P. Arkin Mol. Biol. Evol. 2009 26 1641 1650
21. K. P. Schliep Bioinformatics 2011 27 592 593
22. S. W. Fuchs K. A. Bozhuyuk D. Kresovic F. Grundmann V. Dill A. O. Brachmann N. R. Waterfield H. B. Bode Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2013 52 4108 4112
23. H. Sucipto S. C. Wenzel R. Muller ChemBioChem 2013 14 1581 1589
24. L. Holm C. Sander Trends Biochem. Sci. 1995 20 478 480
25. K. S. Gajiwala S. Margosiak J. Lu J. Cortez Y. Su Z. Nie K. Appelt FEBS Lett. 2009 583 2939 2946
26. S. D. Pegan K. Rukseree G. C. Capodagli E. A. Baker O. Krasnykh S. G. Franzblau A. D. Mesecar Biochemistry 2013 52 912 925
27. X. Qiu A. E. Choudhry C. A. Janson M. Grooms R. A. Daines J. T. Lonsdale S. S. Khandekar Protein Sci. 2005 14 2087 2094
28. X. Qiu C. A. Janson W. W. Smith M. Head J. Lonsdale A. K. Konstantinidis J. Mol. Biol. 2001 307 341 356
29. M. B. Austin M. E. Bowman J. L. Ferrer J. Schroder J. P. Noel Chem. Biol. 2004 11 1179 1194
30. M. B. Austin T. Saito M. E. Bowman S. Haydock A. Kato B. S. Moore R. R. Kay J. P. Noel Nat. Chem. Biol. 2006 2 494 502
31. K. Gokulan S. E. O'Leary W. K. Russell D. H. Russell M. Lalgondar T. P. Begley T. R. Ioerger J. C. Sacchettini J. Biol. Chem. 2013 288 16484 16494
32. H. Morita S. Kondo S. Oguro H. Noguchi S. Sugio I. Abe T. Kohno Chem. Biol. 2007 14 359 369
33. S. B. Rubin-Pitel H. Zhang T. Vu J. S. Brunzelle H. Zhao S. K. Nair Chem. Biol. 2008 15 1079 1090
34. M. He M. Varoglu D. H. Sherman J. Bacteriol. 2000 182 2619 2623
35. J. M. Jez M. B. Austin J. Ferrer M. E. Bowman J. Schroder J. P. Noel Chem. Biol. 2000 7 919 930
36. J. G. Olsen A. Kadziola P. von Wettstein-Knowles M. Siggaard-Andersen Y. Lindquist S. Larsen FEBS Lett. 1999 460 46 52
37. N. Campobasso M. Patel I. E. Wilding H. Kallender M. Rosenberg M. N. Gwynn J. Biol. Chem. 2004 279 44883 44888
38. F. Pojer J. L. Ferrer S. B. Richard D. A. Nagegowda M. L. Chye T. J. Bach J. P. Noel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 11491 11496
39. N. Shafqat A. Turnbull J. Zschocke U. Oppermann W. W. Yue J. Mol. Biol. 2010 398 497 506
40. M. M. Alhamadsheh F. Musayev A. A. Komissarov S. Sachdeva H. T. Wright N. Scarsdale G. Florova K. A. Reynolds Chem. Biol. 2007 14 513 524
41. F. Musayev S. Sachdeva J. N. Scarsdale K. A. Reynolds H. T. Wright J. Mol. Biol. 2005 346 1313 1321
42. M. B. Austin J. P. Noel Nat. Prod. Rep. 2003 20 79 110
43. J. M. Jez M. E. Bowman J. P. Noel Biochemistry 2001 40 14829 14838
44. A. T. Keatinge-Clay D. A. Maltby K. F. Medzihradszky C. Khosla R. M. Stroud Nat. Struct. Mol. Biol. 2004 11 888 893
45. C. N. Steussy A. A. Vartia J. W. Burgner 2nd A. Sutherlin V. W. Rodwell C. V. Stauffacher Biochemistry 2005 44 14256 14267
46. A. K. Bera V. Atanasova H. Robinson E. Eisenstein J. P. Coleman E. C. Pesci J. F. Parsons Biochemistry 2009 48 8644 8655
47. A. Rentsch M. Kalesse Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2012 51 11381 11384
48. W. Kabsch Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2010 66 133 144
49. W. Kabsch Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2010 66 125 132
50. M. Remmert A. Biegert A. Hauser J. Soding Nat. Methods 2012 9 173 175
51. A. J. McCoy R. W. Grosse-Kunstleve P. D. Adams M. D. Winn L. C. Storoni R. J. Read J. Appl. Crystallogr. 2007 40 658 674
52. G. N. Murshudov A. A. Vagin E. J. Dodson Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 1997 53 240 255
53. P. Emsley B. Lohkamp W. G. Scott K. Cowtan Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2010 66 486 501
54. M. D. Winn M. N. Isupov G. N. Murshudov Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2001 57 122 133
55. P. D. Adams P. V. Afonine G. Bunkoczi V. B. Chen I. W. Davis N. Echols J. J. Headd L. W. Hung G. J. Kapral R. W. Grosse-Kunstleve A. J. McCoy N. W. Moriarty R. Oeffner R. J. Read D. C. Richardson J. S. Richardson T. C. Terwilliger P. H. Zwart Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2010 66 213 221
56. V. B. Chen W. B. Arendall 3rd J. J. Headd D. A. Keedy R. M. Immormino G. J. Kapral L. W. Murray J. S. Richardson D. C. Richardson Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2010 66 12 21
57. Schrodinger, LLC, unpublished work
58. W. J. Kent Genome Res. 2002 12 656 664
59. K. Katoh K. Misawa K. Kuma T. Miyata Nucleic Acids Res. 2002 30 3059 3066
60. E. Paradis J. Claude K. Strimmer Bioinformatics 2004 20 289 290
61. C. Hertweck Trends Biochem. Sci. 2015 40 189 199