Enzymatic Assays Coupled with Mass Spectrometry with or without Embedded Liquid Chromatography

ChemBioChem

Volumn 16, Issue 14, 2015, Pages 1985-1992

  Burkhardt, Therese ^a   Kaufmann, Christine M ^a   Letzel, Thomas ^a   Grassmann, Johanna ^a  

^a TECHNICAL UNIVERSITY OF MUNICH   (Germany)

Author keywords

continuous flow assays; enzymes; functional proteomics; mass spectrometry; metabolomics

Indexed keywords

ARTICLE; BIOTECHNOLOGICAL PROCEDURES; CONTINUOUS FLOW ASSAY; DRUG RESEARCH; EMBEDDING; ENZYMATIC ASSAY; ENZYME ACTIVITY; ENZYME DEGRADATION; ENZYME KINETICS; ENZYME SPECIFICITY; FOOD; HIGH THROUGHPUT SCREENING; KINETIC PARAMETERS; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; MULTIPLEX ASSAY; ONLINE COUPLED CONTINUOUS FLOW MIXING ASSAY; PRIORITY JOURNAL; ANIMAL; DEVICES; ENZYME ASSAY; EQUIPMENT DESIGN; HUMAN; PRECLINICAL STUDY; PROCEDURES;

ENZYME INHIBITOR;

ANIMALS; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; DRUG EVALUATION, PRECLINICAL; ENZYME ASSAYS; ENZYME INHIBITORS; EQUIPMENT DESIGN; HUMANS; MASS SPECTROMETRY;

EID: 84941748289     PISSN: 14394227     EISSN: 14397633     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.201500325     Document Type: Article

References (80)

1. T. D. Sutherland, I. Horne, K. M. Weir, C. W. Coppin, M. R. Williams, M. Selleck, R. J. Russell, J. G. Oakeshott, Clin. Exp. Pharmacol. Physiol. 2004, 31, 817-821;
2. M. A. Rao, R. Scelza, F. Acevedo, M. C. Diez, L. Gianfreda, Chemosphere 2014, 107, 145-162.
3. D. Panyam, A. Kilara, Trends Food Sci. Technol. 1996, 7, 120-125;
4. G. A. Tucker, L. Woods, Enzymes in Food Processing, Springer, New York, NY, 1995.
5. A. Schmid, F. Hollmann, J. B. Park, B. Bühler, Curr. Opin. Biotechnol. 2002, 13, 359-366;
6. K. M. Koeller, C.-H. Wong, Nature 2001, 409, 232-240.
7. T. Palmer, P. L. Bonner, Enzymes: Biochemistry, Biotechnology, Clinical Chemistry, Elsevier, Amsterdam, 2007;
8. J. P. Rasor, E. Voss, Appl. Catal. A 2001, 221, 145-158.
9. V. B. Urlacher, S. Lutz-Wahl, R. D. Schmid, Appl. Microbiol. Biotechnol. 2004, 64, 317-325;
10. M. K. Bhat, Biotechnol. Adv. 2000, 18, 355-383;
11. K.-E. Jaeger, T. Eggert, Curr. Opin. Biotechnol. 2002, 13, 390-397.
12. T. Letzel, Anal. Bioanal. Chem. 2008, 390, 257-261;
13. K. D. Greis, Mass Spectrom. Rev. 2007, 26, 324-339;
14. A. R. de Boer, H. Lingeman, W. M. A. Niessen, H. Irth, Trac-Trends Anal. Chem. 2007, 26, 867-883;
15. K. F. Geoghegan, M. A. Kelly, Mass Spectrom. Rev. 2005, 24, 347-366;
16. A. Liesener, U. Karst, Anal. Bioanal. Chem. 2005, 382, 1451-1464;
17. J. Grassmann, R. K. Scheerle, T. Letzel, Anal. Bioanal. Chem. 2012, 402, 625-645;
18. M. T. Reetz, M. H. Becker, H.-W. Klein, D. Stöckigt, Angew. Chem. Int. Ed. 1999, 38, 1758-1761;
19. Angew. Chem. 1999, 111, 1872-1875.
20. T. Letzel, E. Sahmel-Schneider, K. Skriver, T. Ohnuma, T. Fukamizo, Carbohydr. Res. 2011, 346, 863-866.
21. A. R. de Boer, T. Letzel, H. Lingeman, H. Irth, Anal. Bioanal. Chem. 2005, 381, 647-655.
22. C. M. Kaufmann, J. Grassmann, D. Treutter, T. Letzel, Rapid Commun. Mass Spectrom. 2014, 28, 869-878.
23. N. Dennhart, L. M. M. Weigang, M. Fujiwara, T. Fukamizo, K. Skriver, T. Letzel, J. Biotechnol. 2009, 143, 274-283;
24. M. Zitouni, M. Fortin, R. K. Scheerle, T. Letzel, D. Matteau, S. Rodrigue, R. Brzezinski, Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013, 97, 5801-5813.
25. R. K. Scheerle, J. Grassmann, T. Letzel, Anal. Sci. 2012, 28, 607-612.
26. C. F. B. Holmes, Toxicon 1991, 29, 469-477.
27. T. Schenk, G. J. Breel, P. Koevoets, S. van den Berg, A. C. Hogenboom, H. Irth, U. R. Tjaden, J. van der Greef, J. Biomol. Screening 2003, 8, 421-429;
28. R. J. Derks, A. C. Hogenboom, G. van der Zwan, H. Irth, Anal. Chem. 2003, 75, 3376-3384.
29. A. R. de Boer, T. Letzel, D. A. van Elswijk, H. Lingeman, W. M. A. Niessen, H. Irth, Anal. Chem. 2004, 76, 3155-3161.
30. K. Ingkaninan, C. M. de Best, R. van der Heijden, A. J. P. Hofte, B. Karabatak, H. Irth, U. R. Tjaden, J. van der Greef, R. Verpoorte, J. Chromatogr. A 2000, 872, 61-73;
31. A. R. de Boer, B. Bruyneel, J. G. Krabbe, H. Lingeman, W. M. Niessen, H. Irth, Lab Chip 2005, 5, 1286-1292.
32. A. R. de Boer, J. M. Alcaide-Hidalgo, J. G. Krabbe, J. Kolkman, C. N. V. Boas, W. M. A. Niessen, H. Lingeman, H. Irth, Anal. Chem. 2005, 77, 7894-7900.
33. T. Teutenberg, S. Wiese, P. Wagner, J. Gmehling, J. Chromatogr. A 2009, 1216, 8480-8487.
34. N. H. Schebb, F. Heus, T. Saenger, U. Karst, H. Irth, J. Kool, Anal. Chem. 2008, 80, 6764-6772;
35. J. Kool, M. Eggink, H. van Rossum, S. M. van Liempd, D. A. van Elswijk, H. Irth, J. N. Commandeur, J. H. Meerman, N. P. Vermeulen, J. Biomol. Screening 2007, 12, 396-405;
36. J. Kool, R. Ramautar, S. M. van Liempd, J. Beckman, F. J. de Kanter, J. H. Meerman, T. Schenk, H. Irth, J. N. Commandeur, N. P. Vermeulen, J. Med. Chem. 2006, 49, 3287-3292;
37. J. Kool, S. M. van Liempd, R. Ramautar, T. Schenk, J. H. Meerman, H. Irth, J. N. Commandeur, N. P. Vermeulen, J. Biomol. Screening 2005, 10, 427-436.
38. N. H. Schebb, T. Vielhaber, A. Jousset, U. Karst, J. Chromatogr. A 2009, 1216, 4407-4415;
39. J. Hirata, L. P. Chung, F. Ariese, H. Irth, C. Gooijer, J. Chromatogr. A 2005, 1081, 140-144.
40. C. F. de Jong, R. J. E. Derks, B. Bruyneel, W. Niessen, H. Irth, J. Chromatogr. A 2006, 1112, 303-310.
41. R. K. Scheerle, J. Grassmann, T. Letzel, Anal. Methods 2011, 3, 822-830.
42. S. Benetton, J. Kameoka, A. Tan, T. Wachs, H. Craighead, J. D. Henion, Anal. Chem. 2003, 75, 6430-6436;
43. K. Kanno, H. Maeda, S. Izumo, M. Ikuno, K. Takeshita, A. Tashiro, M. Fujii, Lab Chip 2002, 2, 15-18;
44. J. Wang, Electrophoresis 2002, 23, 713-718;
45. J. Svobodová, S. Mathur, A. Muck, T. Letzel, A. Svatos, Electrophoresis 2010, 31, 2680-2685.
46. S. Ohla, D. Belder, Curr. Opin. Chem. Biol. 2012, 16, 453-459.
47. M. Krappmann, C. M. Kaufmann, R. K. Scheerle, J. Grassmann, T. Letzel, J. Proteomics Bioinform. 2014, 7, 264-271.
48. C. S. Pundir, N. Chauhan, Anal. Biochem. 2012, 429, 19-31.
49. N. Tabet, Age Ageing 2006, 35, 336-338;
50. V. N. Talesa, Mech. Ageing Dev. 2001, 122, 1961-1969.
51. G. M. Murray, in Encyclopedia of Analytical Chemistry, Wiley, Hoboken, 2006.
52. M. J. Dixon, O. A. Andersen, D. M. van Aalten, I. M. Eggleston, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2005, 15, 4717-4721;
53. N. Dahiya, R. Tewari, G. S. Hoondal, Appl. Microbiol. Biotechnol. 2006, 71, 773-782.
54. S. B. Chavan, M. V. Deshpande, Biotechnol. Prog. 2013, 29, 833-846.
55. D. Somashekar, R. Joseph, Bioresour. Technol. 1996, 55, 35-45;
56. N. Thadathil, S. P. Velappan, Food Chem. 2014, 150, 392-399.
57. R. W. Ammann, E. Tagwecher, H. Kashiwagi, H. Rosenmund, Am. J. Dig. Dis. 1968, 13, 123-146.
58. D. G. Kellner, S. A. Maves, S. G. Sligar, Curr. Opin. Biotechnol. 1997, 8, 274-278;
59. S. Kumar, Expert Opin. Drug Metab. Toxicol. 2010, 6, 115-131.
60. K. T. Chen, M. S. Malo, L. K. Beasley-Topliffe, K. Poelstra, J. L. Millan, G. Mostafa, S. N. Alam, S. Ramasamy, H. S. Warren, E. L. Hohmann, R. A. Hodin, Dig. Dis. Sci. 2011, 56, 1020-1027;
61. J. P. Lallès, Nutr. Rev. 2010, 68, 323-332;
62. M. Mizumori, M. Ham, P. H. Guth, E. Engel, J. D. Kaunitz, Y. Akiba, J. Physiol. 2009, 587, 3651-3663;
63. M. J. Bours, E. L. Swennen, F. Di Virgilio, B. N. Cronstein, P. C. Dagnelie, Pharmacol. Ther. 2006, 112, 358-404.
64. C. S. Karigar, S. S. Rao, Enzyme Res. 2011, 805187;
65. U. Kües, Curr. Opin. Biotechnol. 2015, 33, 268-278;
66. R. Chandra, P. Chowdhary, Environ. Sci. Processes Impacts 2015, 17, 326-342.
67. D. K. Choi, S. Pennathur, C. Perier, K. Tieu, P. Teismann, D. C. Wu, V. Jackson-Lewis, M. Vila, J. P. Vonsattel, J. W. Heinecke, S. Przedborski, J. Neurosci. 2005, 25, 6594-6600;
68. D. L. Lefkowitz, J. Mone, S. S. Lefkowitz, Curr. Immunol. Rev. 2010, 6, 123-129.
69. J. Grassmann, S. Hippeli, R. Vollmann, E. F. Elstner, J. Agric. Food Chem. 2003, 51, 7576-7582.
70. P. Pacher, A. Nivorozhkin, C. Szabo, Pharmacol. Rev. 2006, 58, 87-114.
71. D. M. Townsend, K. D. Tew, Oncogene 2003, 22, 7369-7375;
72. D. M. Townsend, V. L. Findlay, K. D. Tew, in Methods in Enzymology, Vol. 401: Glutathione Transferases and gamma-Glutamyl Transpeptidases (Eds.:, H. Sies, L. Packer,), Academic Press, San Diego, 2005, pp. 287-307.
73. Z. Yu, L. C. Chen, M. K. Mandal, H. Nonami, R. Erra-Balsells, K. Hiraoka, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2012, 23, 728-735.
74. N. Johnston, P. W. Dettmar, B. Bishwokarma, M. O. Lively, J. A. Koufman, Laryngoscope 2007, 117, 1036-1039.
75. M. Hirota, M. Ohmuraya, H. Baba, J. Gastroenterol. 2006, 41, 832-836.
76. J. Kool, G. E. de Kloe, B. Bruyneel, J. S. de Vlieger, K. Retra, M. Wijtmans, R. van Elk, A. B. Smit, R. Leurs, H. Lingeman, I. J. de Esch, H. Irth, J. Med. Chem. 2010, 53, 4720-4730.
77. J. Hirata, F. Ariese, C. Gooijer, H. Irth, Anal. Chim. Acta 2003, 478, 1-10.
78. R. Haselberg, C. Hempen, S. M. van Leeuwen, M. Vogel, U. Karst, J. Chromatogr. B 2006, 830, 47-53.
79. D. A. van Elswijk, O. Diefenbach, S. van der Berg, H. Irth, U. R. Tjaden, J. van der Greef, J. Chromatogr. A 2003, 1020, 45-58.
80. N. Schebb, H. Faber, R. Maul, F. Heus, J. Kool, H. Irth, U. Karst, Anal. Bioanal. Chem. 2009, 394, 1361-1373.