Protein modification for single molecule fluorescence microscopy

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 6, Issue 17, 2008, Pages 3031-3037

  Dillingham, Mark S ^a   Wallace, Mark I ^b  

^a UNIVERSITY OF BRISTOL   (United Kingdom)

^b UNIVERSITY OF OXFORD   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLUORESCENCE; FLUORESCENCE MICROSCOPY; IMAGING TECHNIQUES; LIGHT EMISSION; LUMINESCENCE; MICROSCOPIC EXAMINATION;

BIOLOGICAL PHENOMENA; FLUORESCENT LABELING; PROTEIN MODIFICATIONS; SINGLE-MOLECULE FLUORESCENCE MICROSCOPY; SINGLE-MOLECULE METHODS; SINGLE-MOLECULE MICROSCOPY;

MOLECULES;

DIAGNOSTIC AGENT; FLUORESCENT DYE; GREEN FLUORESCENT PROTEIN; PROTEIN;

ARTICLE; CHEMISTRY; FLUORESCENCE MICROSCOPY; MOLECULAR PROBE; NANOTECHNOLOGY; PROTEIN PROCESSING;

FLUORESCENT DYES; GREEN FLUORESCENT PROTEINS; MICROSCOPY, FLUORESCENCE; MOLECULAR PROBES; NANOTECHNOLOGY; PROTEIN PROCESSING, POST-TRANSLATIONAL; PROTEINS;

EID: 49549091342     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b808552h     Document Type: Article

References (91)

1. X. S. Xie H. P. Lu J. Biol. Chem. 1999 274 15967 15970
2. S. N. Xie Single Mol. 2001 2 229 236
3. R. D. Smiley G. G. Hammes Chem. Rev. 2006 106 3080 3094
4. A. Yildiz J. N. Forkey S. A. McKinney T. Ha Y. E. Goldman P. R. Selvin Science 2003 300 2061 2065
5. A. Yildiz M. Tomishige R. D. Vale P. R. Selvin Science 2004 303 676 678
6. M. D. Stone M. Mihalusova C. M. O'Connor R. Prathapam K. Collins X. W. Zhuang Nature 2007 446 458 461
7. L. Bai T. J. Santangelo M. D. Wang Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2006 35 343 360
8. J. Elf G. W. Li X. S. Xie Science 2007 316 1191 1194
9. J. Yu J. Xiao X. J. Ren K. Q. Lao X. S. Xie Science 2006 311 1600 1603
10. C. Brauchle G. Seisenberger T. Endress M. U. Ried H. Buning M. Hallek ChemPhysChem 2002 3 299 303
11. W. D. Yang S. M. Musser J. Cell Biol. 2006 174 951 961
12. V. Jacquier M. Prummer J. M. Segura H. Pick H. Vogel Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006 103 14325 14330
13. K. Suzuki K. Ritchie E. Kajikawa T. Fujiwara A. Kusumi Biophys. J. 2005 88 3659 3680
14. C. Tardin L. Cognet C. Bats B. Lounis D. Choquet EMBO J. 2003 22 4656 4665
15. M. Bohmer J. Enderlein ChemPhysChem 2003 4 793 808
16. P. V. Cornish T. Ha Chem. Biol. 2007 2 53 61
17. N. Kahya P. Schwille Mol. Membr. Biol. 2006 23 29 39
18. W. E. Moerner D. P. Fromm Rev. Sci. Instrum. 2003 74 3597 3619
19. S. M. Nie R. N. Zare Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1997 26 567 596
20. T. Plakhotnik E. A. Donley U. P. Wild Annu. Rev. Phys. Chem. 1997 48 181 212
21. Y. Sako Mol. Syst. Biol. 2006 56 1 6
22. G. J. Schutz M. Sonnleitner P. Hinterdorfer H. Schindler Mol. Membr. Biol. 2000 17 17 29
23. M. J. Levene J. Korlach S. W. Turner M. Foquet H. G. Craighead W. W. Webb Science 2003 299 682 686
24. D. Schomburg and I. Schomburg, Springer Handbook of Enzymes, Springer, New York, 2 edn, 2001
25. M. Eisenstein Nature 2006 443 1019 1020
26. G. Donnert J. Keller R. Medda M. A. Andrei S. O. Rizzoli R. Lurmann R. Jahn C. Eggeling S. W. Hell Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006 103 11440 11445
27. R. Y. Tsien and A. Waggoner, Handbook of Biological Confocal Microscopy, Plenum Press, New York, 1995
28. Y. Chen J. D. Muller P. T. C. So E. Gratton Biophys. J. 1999 77 553 567
29. M. C. Mota P. Carvalho J. Ramalho E. Leite Int. Ophthal. 1991 15 321 326
30. A. Waggoner Curr. Opin. Chem. Biol. 2006 10 62 66
31. S. K. Das M. Darshi S. Cheley M. I. Wallace H. Bayley ChemBioChem 2007 8 994 999
32. M. C. Leake J. H. Chandler G. H. Wadhams F. Bai R. M. Berry J. P. Armitage Nature 2006 443 355 358
33. P. S. Dittrich P. Schwille Appl. Phys. B 2001 73 829 837
34. M. Cooper A. Ebner M. Briggs M. Burrows N. Gardner R. Richardson R. West J. Fluoresc. 2004 14 145 150
35. C. Jung B. K. Muller D. C. Lamb F. Nolde K. Mullen C. Brauchle J. Am. Chem. Soc. 2006 128 5283 5291
36. J. E. H. Buston J. R. Young H. L. Anderson Chem. Commun. 2000 905 906
37. W. M. Nau J. Mohanty Int. J. Photoenergy 2005 7 133 141
38. A. C. Bhasikuttan J. Mohanty W. M. Nau H. Pal Angew. Chem., Int. Ed. 2007 46 4120 4122
39. G. Donnert C. Eggeling S. W. Hell Nat. Methods 2007 4 81 86
40. I. Rasnik S. A. McKinney T. Ha Nat. Methods 2006 3 891 893
41. J. Widengren A. Chmyrov C. Eggeling P. A. Lofdahl C. A. M. Seidel J. Phys. Chem. A 2007 111 429 440
42. A. P. Alivisatos W. Gu C. Larabell Annu. Rev. Biomed. Eng. 2005 7 55 76
43. C.-C. Fu H.-Y. Lee K. Chen T.-S. Lim H.-Y. Wu P.-K. Lin P.-K. Wei P.-H. Tsao H.-C. Chang W. Fann Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007 104 727 732
44. M. Kuno D. P. Fromm H. F. Hamann A. Gallagher D. J. Nesbitt J. Chem. Phys. 2000 112 3117 3120
45. H. Yang G. Luo P. Karnchanaphanurach T.-M. Louie I. Rech S. Cova L. Xun X. S. Xie Science 2003 302 262 266
46. X. Zhuang T. Ha H. D. Kim T. Centner S. Labeit S. Chu Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000 97 14241 14244
47. S. Brasselet W. E. Moerner Single Mol. 2000 1 17 23
48. C. W. Lin A. Y. Ting J. Am. Chem. Soc. 2006 128 4542 4543
49. Y. Lu M. Paige J. Fluoresc. 2007 17 739 748
50. E. B. Getz M. Xiao T. Chakrabarty R. Cooke P. R. Selvin Anal. Biochem. 1999 273 73 80
51. R. Galletto S. C. Kowalczykowski Nature 2006 443 875 878
52. J. J. Smith D. W. Conrad M. J. Cuneo H. W. Hellinga Protein Sci. 2005 14 64 73
53. L. Wang J. Xie P. G. Schultz Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2006 35 225 249
54. D. Summerer S. Chen N. Wu A. Deiters J. W. Chin P. G. Schultz Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006 103 9785 9789
55. L. Wang Z. Zhang A. Brock P. G. Schultz Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003 100 56 61
56. D. Kiga K. Sakamoto K. Kodama T. Kigawa T. Matsuda T. Yabuki M. Shirouzu Y. Harada H. Nakayama K. Takio Y. Hasegawa Y. Endo I. Hirao S. Yokoyama Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002 99 9715 9720
57. J. Olejnik S. Gite S. Mamaev K. J. Rothschild Methods 2005 36 252 260
58. M. Taki T. Hohsaka H. Murakami K. Taira M. Sisido FEBS Lett. 2001 507 35 38
59. M. Chalfie Y. Tu G. Euskirchen W. W. Ward D. C. Prasher Science 1994 263 802 805
60. O. Shimomura F. H. Johnson Y. Saiga J. Cell. Comp. Physiol. 1962 59 223 239
61. J. Zhang R. E. Campbell A. Y. Ting R. Y. Tsien Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2002 3 906 918
62. N. C. Shaner P. A. Steinbach R. Y. Tsien Nat. Methods 2005 2 905 909
63. G. I. Mashanov J. E. Molloy Biophys. J. 2007 92 2199 2211
64. U. Haupts S. Maiti P. Schwille W. W. Webb Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1998 95 13573 13578
65. W. Zeng H. E. Seward A. Malnasi-Csizmadia S. Wakelin R. J. Woolley G. S. Cheema J. Basran T. R. Patel A. J. Rowe C. R. Bagshaw Biochemistry 2006 45 10482 10491
66. N. George H. Pick H. Vogel N. Johnsson K. Johnsson J. Am. Chem. Soc. 2004 126 8896 8897
67. J. Yin A. J. Lin D. E. Golan C. T. Walsh Nat. Protocols 2006 1 280 285
68. H. Sato M. Ikeda K. Suzuki K. Hirayama Biochemistry 1996 35 13072 13080
69. M. Taki M. Shiota K. Taira Protein Eng., Des. Sel. 2004 17 119 126
70. M. Jager E. Nir S. Weiss Protein Sci. 2006 15 640 646
71. S. R. Adams R. E. Campbell L. A. Gross B. R. Martin G. K. Walkup Y. Yao J. Llopis R. Y. Tsien J. Am. Chem. Soc. 2002 124 6063 6076
72. D. Beckett E. Kovaleva P. J. Schatz Protein Sci. 1999 8 921 929
73. I. Chen M. Howarth W. Lin A. Y. Ting Nat. Methods 2005 2 99 104
74. I. Chen Y. A. Choi A. Y. Ting J. Am. Chem. Soc. 2007 129 6619 6625
75. B. P. Duckworth Z. Zhang A. Hosokawa M. D. Distefano ChemBioChem 2007 8 98 105
76. A. Keppler M. Kindermann S. Gendreizig H. Pick H. Vogel K. Johnsson Methods 2004 32 437 444
77. P. E. Dawson T. W. Muir I. Clark-Lewis S. B. Kent Science 1994 266 776 779
78. B. Schuler L. K. Pannell Bioconjugate Chem. 2002 13 1039 1043
79. T. W. Muir Annu. Rev. Biochem. 2003 72 249 289
80. V. Muralidharan T. W. Muir Nat. Methods 2006 3 429 438
81. M.-Q. Xu T. C. Evans Methods 2001 24 257 277
82. C. F. W. Becker R. Seidel M. Jahnz K. Bacia T. Niederhausen K. Alexandrov P. Schwille R. S. Goody M. Engelhard ChemBioChem 2006 7 891 895
83. Z. Machova R. v. Eggelkraut-Gottanka N. Wehofsky F. Bordusa A. G. Beck-Sickinger Angew. Chem., Int. Ed. 2003 42 4916 4918
84. H. Mao S. A. Hart A. Schink B. A. Pollok J. Am. Chem. Soc. 2004 126 2670 2671
85. M. W. Popp J. M. Antos G. M. Grotenbreg E. Spooner H. L. Ploegh Nat. Chem. Biol. 2007 3 707 708
86. E. G. Guignet J.-M. Segura R. Hovius H. Vogel ChemPhysChem 2007 8 1221 1227
87. C. T. Hauser R. Y. Tsien Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2007 104 3693 3697
88. L. W. Miller J. Sable P. Goelet M. P. Sheetz V. W. Cornish Angew. Chem., Int. Ed. 2004 43 1672 1675
89. K. M. Marks P. D. Braun G. P. Nolan Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004 101 9982 9987
90. I. Amitani R. J. Baskin S. C. Kowalczykowski Mol. Cell 2006 23 143 148
91. J. Farinas A. S. Verkman J. Biol. Chem. 1999 274 7603 7606