Nicotinamide adenine dinucleotide: Beyond a redox coenzyme

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 5, Issue 16, 2007, Pages 2541-2554

  Lin, Hening ^a  

^a Department of Obstetrics Gynecology   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ENZYMATIC REACTIONS; NICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE; RIBOSYLATION;

BIOACTIVITY; COENZYMES; ENZYME KINETICS; REDOX REACTIONS;

NUCLEIC ACIDS;

ADENOSINE DIPHOSPHATE RIBOSE; NICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE;

ANIMAL; ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CONFORMATION; HUMAN; METABOLISM; OXIDATION REDUCTION REACTION; PHYSIOLOGY; SYNTHESIS;

ADENOSINE DIPHOSPHATE RIBOSE; ANIMALS; HUMANS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR CONFORMATION; NAD; OXIDATION-REDUCTION;

EID: 34547607850     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b706887e     Document Type: Article

References (143)

1. F. Berger M. H. Ramirez-Hernandez M. Ziegler Trends Biochem. Sci. 2004 29 111 118
2. P. O. Hassa S. S. Haenni M. Elser M. O. Hottiger Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2006 70 789 829
3. I. R. Lehman Science 1974 186 790 797
4. J. Y. Lee C. Chang H. K. Song J. Moon J. K. Yang H. K. Kim S. T. Kwon S. W. Suh EMBO J. 2000 19 1119 1129
5. A. Wilkinson J. Day R. Bowater Mol. Microbiol. 2001 40 1241 1248
6. D. D'Amours S. Desnoyers I. D'Silva G. G. Poirier Biochem. J. 1999 342 249 268
7. V. Schreiber F. Dantzer J.-C. Ame G. de Murcia Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2006 7 517 528
8. B. Alexander Bioessays 2001 23 795 806
9. L. Virag C. Szabo Pharmacol. Rev. 2002 54 375 429
10. D. Corda M. D. Girolamo EMBO J. 2003 22 1953 1958
11. M. Di Girolamo N. Dani A. Stilla D. Corda FEBS J. 2005 272 4565 4575
12. I. J. Okazaki J. Moss J. Biol. Chem. 1998 273 23617 23620
13. S. Michan D. Sinclair Biochem. J. 2007 404 1 13
14. A. A. Sauve C. Wolberger V. L. Schramm J. D. Boeke Annu. Rev. Biochem. 2006 75 435 465
15. M. Miwa M. Ishihara S. Takishima N. Takasuka M. Maeda Z. Yamaizumi T. Sugimura S. Yokoyama T. Miyazawa J. Biol. Chem. 1981 256 2916 2921
16. T. Kinoshita I. Nakanishi M. Warizaya A. Iwashita Y. Kido K. Hattori T. Fujii FEBS Lett. 2004 556 43 46
17. A. Ruf V. Rolli G. de Murcia G. E. Schulz J. Mol. Biol. 1998 278 57 65
18. A. W. Oliver J.-C. Ame S. M. Roe V. Good G. de Murcia L. H. Pearl Nucleic Acids Res. 2004 32 456 464
19. C. E. Bell D. Eisenberg Biochemistry 1996 35 1137 1149
20. G. Felsenfeld M. Groudine Nature 2003 421 448 453
21. G. G. Poirier G. D. Murcia J. Jongstra-Bilen C. Niedergang P. Mandel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1982 79 3423 3427
22. G. de Murcia A. Huletsky D. Lamarre A. Gaudreau J. Pouyet M. Daune G. G. Poirier J. Biol. Chem. 1986 261 7011 7017
23. F. R. Althaus J. Cell Sci. 1992 102 663 670
24. M. E. Bonicalzi J. F. Haince A. Droit G. G. Poirier Cell. Mol. Life Sci. 2005 62 739 750
25. K. W. Caldecott S. Aoufouchi P. Johnson S. Shall Nucleic Acids Res. 1996 24 4387 4394
26. J.-F. Haince S. Kozlov V. L. Dawson T. M. Dawson M. J. Hendzel M. F. Lavin G. G. Poirier J. Biol. Chem. 2007 10.1074/jbc.M608406200
27. G. I. Karras G. Kustatscher H. R. Buhecha M. D. Allen C. Pugieux F. Sait M. Bycroft A. G. Ladurner EMBO J. 2005 24 1911 1920
28. G. Kustatscher M. Hothorn C. Pugieux K. Scheffzek A. G. Ladurner Nat. Struct. Mol. Biol. 2005 12 624 625
29. M. Y. Kim S. Mauro N. Gevry J. T. Lis W. L. Kraus Cell 2004 119 803 814
30. D. A. Nusinow I. Hernandez-Munoz T. G. Fazzio G. M. Shah W. L. Kraus B. Panning J. Biol. Chem. 2007 282 12851 12859
31. M. Cohen-Armon L. Visochek D. Rozensal A. Kalal I. Geistrikh R. Klein S. Bendetz-Nezer Z. Yao R. Seger Mol. Cell 2007 25 297 308
32. S.-W. Yu H. Wang M. F. Poitras C. Coombs W. J. Bowers H. J. Federoff G. G. Poirier T. M. Dawson V. L. Dawson Science 2002 297 259 263
33. S.-W. Yu S. A. Andrabi H. Wang N. S. Kim G. G. Poirier T. M. Dawson V. L. Dawson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 18314 18319
34. A. Tulin A. Spradling Science 2003 299 560 562
35. G. Gradwohl A. Mazen G. de Murcia Biochem. Biophys. Res. Commun. 1987 148 913 919
36. F. Berger C. Lau M. Ziegler Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 3765 3770
37. B.-G. Ju V. V. Lunyak V. Perissi I. Garcia-Bassets D. W. Rose C. K. Glass M. G. Rosenfeld Science 2006 312 1798 1802
38. K. Chikamori J. E. Hill D. R. Grabowski E. Zarkhin A. G. Grozav S. A. J. Vaziri J. Wang A. V. Gudkov L. R. Rybicki R. M. Bukowski A. Yen M. Tanimoto M. K. Ganapathi R. Ganapathi Leukemia 2006 20 1809 1818
39. Y. L. Lyu C.-P. Lin A. M. Azarova L. Cai J. C. Wang L. F. Liu Mol. Cell. Biol. 2006 26 7929 7941
40. P. O. Hassa C. Buerki C. Lombardi R. Imhof M. O. Hottiger J. Biol. Chem. 2003 278 45145 45153
41. J.-C. Amé C. Spenlehauer G. de Murcia Bioessays 2004 26 882 893
42. S. Smith I. Giriat A. Schmitt T. de Lange Science 1998 282 1484 1487
43. S. Smith T. de Lange Curr. Biol. 2000 10 1299 1302
44. P. Chang M. K. Jacobson T. J. Mitchison Nature 2004 432 645 649
45. P. Chang M. Coughlin T. J. Mitchison Nat. Cell Biol. 2005 7 1133 1139
46. W. Chang J. N. Dynek S. Smith Biochem. J. 2005 391 177 184
47. C. T. Walsh, Posttranslational Modification of Proteins: Expanding Nature's Inventory, Roberts and Company Publishers, Englewood, Colorado, 2005
48. A. Zolkiewska M. S. Nightingale J. Moss Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992 89 11352 11356
49. F. Koch-Nolte F. Haag R. Braren M. Kuhl J. Hoovers S. Balasubramanian F. Bazan H.-G. Thiele Genomics 1997 39 370 376
50. G. Glowacki R. Braren K. Firner M. Nissen M. Kuhl P. Reche F. Bazan M. Cetkovic-Cvrlje E. Leiter F. Haag F. Koch-Nolte Protein Sci. 2002 11 1657 1670
51. A. Zolkiewska J. Moss J. Biol. Chem. 1993 268 25273 25276
52. Z. F. Zhao J. Gruszczynska-Biegala A. Zolkiewska Biochem. J. 2005 385 309 317
53. A. Zolkiewska J. Moss J. Biol. Chem. 1995 270 9227 9233
54. S. Okamoto O. Azhipa Y. Yu E. Russo G. Dennert J. Immunol. 1998 160 4190 4198
55. Z.-X. Liu Y. Yu G. Dennert J. Biol. Chem. 1999 274 17399 17401
56. G. Paone A. Wada L. A. Stevens A. Matin T. Hirayama R. L. Levine J. Moss Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 8231 8235
57. E. M. Jones A. Baird Biochem. J. 1997 323 173 177
58. B. A. Saxty M. Yadollahi-Farsani P. D. Upton S. R. Johnstone J. MacDermot Br. J. Pharmacol. 2001 133 1219 1226
59. S. Adriouch W. Ohlrogge F. Haag F. Koch-Nolte M. Seman J. Immunol. 2001 167 196 203
60. M. Seman S. Adriouch F. Scheuplein C. Krebs D. Freese G. Glowacki P. Deterre F. Haag F. Koch-Nolte Immunity 2003 19 571 582
61. C. Krebs W. Koestner M. Nissen V. Welge I. Parusel F. Malavasi E. H. Leiter R. M. Santella F. Haag F. Koch-Nolte Anal. Biochem. 2003 314 108 115
62. S. Bruzzone L. Guida E. Zocchi L. Franco A. De Flora FASEB J. 2001 15 10 12
63. R. Lupi D. Corda M. Di Girolamo J. Biol. Chem. 2000 275 9418 9424
64. A. Herrero-Yraola S. M. A. Bakhit P. Franke C. Weise M. Schweiger D. Jorcke M. Ziegler EMBO J. 2001 20 2404 2412
65. G. H. Leno B. E. Ledford FEBS J. 1990 276 29 33
66. G. Liszt E. Ford M. Kurtev L. Guarente J. Biol. Chem. 2005 280 21313 21320
67. M. C. Haigis R. Mostoslavsky K. M. Haigis K. Fahie D. C. Christodoulou A. J. Murphy D. M. Valenzuela G. D. Yancopoulos M. Karow G. Blander C. Wolberger T. A. Prolla R. Weindruch F. W. Alt L. Guarente Cell 2006 126 941 954
68. J. L. Fendrick W. J. Iglewski Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1989 86 554 557
69. M. Bektas H. Akcakaya A. Aroymak R. Nurten E. Bermek Int. J. Biochem. Cell Biol. 2005 37 91
70. S. Y. Roth J. M. Denu C. D. Allis Annu. Rev. Biochem. 2001 70 81 120
71. C. M. Grozinger S. L. Schreiber Chem. Biol. 2002 9 3 16
72. M. Kaeberlein M. McVey L. Guarente Genes Dev. 1999 13 2570 2580
73. S.-i. Imai C. M. Armstrong M. Kaeberlein L. Guarente Nature 2000 403 795 800
74. K. G. Tanner J. Landry R. Sternglanz J. M. Denu Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2000 97 14178 14182
75. J. C. Tanny D. Moazed Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 415 420
76. A. A. Sauve I. Celic J. Avalos H. Deng J. D. Boeke V. L. Schramm Biochemistry 2001 40 15456 15463
77. M. D. Jackson J. M. Denu J. Biol. Chem. 2002 277 18535 18544
78. M. D. Jackson M. T. Schmidt N. J. Oppenheimer J. M. Denu J. Biol. Chem. 2003 278 50985 50998
79. B. C. Smith J. M. Denu Biochemistry 2006 45 272 282
80. B. C. Smith J. M. Denu J. Am. Chem. Soc. 2007 129 5802 5803
81. A. A. Sauve V. L. Schramm Biochemistry 2003 42 9249 9256
82. J. L. Avalos I. Celic S. Muhammad M. S. Cosgrove J. D. Boeke C. Wolberger Mol. Cell 2002 10 523 535
83. J.-H. Chang H.-C. Kim K.-Y. Hwang J.-W. Lee S. P. Jackson S. D. Bell Y. Cho J. Biol. Chem. 2002 277 34489 34498
84. J. Min J. Landry R. Sternglanz R.-M. Xu Cell 2001 105 269 279
85. K. Zhao X. Chai R. Marmorstein Structure 2003 11 1403 1411
86. M. S. Finnin J. R. Donigian N. P. Pavletich Nat. Struct. Mol. Biol. 2001 8 621 625
87. K. Zhao X. Chai R. Marmorstein J. Mol. Biol. 2004 337 731 741
88. K. G. Hoff J. L. Avalos K. Sens C. Wolberger Structure 2006 14 1231 1240
89. B. D. Sanders K. Zhao J. T. Slama R. Marmorstein Mol. Cell 2007 25 463 472
90. K. Zhao R. Harshaw X. Chai R. Marmorstein Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 8563 8568
91. R. M. Anderson K. J. Bitterman J. G. Wood O. Medvedik D. A. Sinclair Nature 2003 423 181 185
92. M. Kaeberlein R. W. Powers, III K. K. Steffen E. A. Westman D. Hu N. Dang E. O. Kerr K. T. Kirkland S. Fields B. K. Kennedy Science 2005 310 1193 1196
93. P. Fabrizio C. Gattazzo L. Battistella M. Wei C. Cheng K. McGrew V. D. Longo Cell 2005 123 655 667
94. V. J. Starai I. Celic R. N. Cole J. D. Boeke J. C. Escalante-Semerena Science 2002 298 2390 2392
95. R. A. Frye Biochem. Biophys. Res. Commun. 2000 273 793 798
96. H. Vaziri S. K. Dessain E. N. Eaton S.-I. Imai R. A. Frye T. K. Pandita L. Guarente R. A. Weinberg Cell 2001 107 149 159
97. A. Brunet L. B. Sweeney J. F. Sturgill K. F. Chua P. L. Greer Y. Lin H. Tran S. E. Ross R. Mostoslavsky H. Y. Cohen L. S. Hu H.-L. Cheng M. P. Jedrychowski S. P. Gygi D. A. Sinclair F. W. Alt M. E. Greenberg Science 2004 303 2011 2015
98. M. C. Motta N. Divecha M. Lemieux C. Kamel D. Chen W. Gu Y. Bultsma M. McBurney L. Guarente Cell 2004 116 551 563
99. B. J. North B. L. Marshall M. T. Borra J. M. Denu E. Verdin Mol. Cell 2003 11 437 444
100. W. C. Hallows S. Lee J. M. Denu Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 10230 10235
101. B. Schwer J. Bunkenborg R. O. Verdin J. S. Andersen E. Verdin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 10224 10229
102. H. Y. Cohen C. Miller K. J. Bitterman N. R. Wall B. Hekking B. Kessler K. T. Howitz M. Gorospe R. de Cabo D. A. Sinclair Science 2004 305 390 392
103. J. C. Tanny G. J. Dowd J. Huang H. Hilz D. Moazed Cell 1999 99 735 745
104. J. Abelson C. R. Trotta H. Li J. Biol. Chem. 1998 273 12685 12688
105. G. M. Culver S. M. McCraith S. A. Consaul D. R. Stanford E. M. Phizicky J. Biol. Chem. 1997 272 13203 13210
106. S. L. Spinelli S. A. Consaul E. M. Phizicky RNA 1997 3 1388 1400
107. S. L. Spinelli R. Kierzek D. H. Turner E. M. Phizicky J. Biol. Chem. 1999 274 2637 2644
108. M. A. Steiger J. E. Jackman E. M. Phizicky RNA 2005 11 99 106
109. S. L. Spinelli H. S. Malik S. A. Consaul E. M. Phizicky Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1998 95 14136 14141
110. F. A. Laski A. Z. Fire U. L. RajBhandary P. A. Sharp J. Biol. Chem. 1983 258 11974 11980
111. T. Takamura-Enya M. Watanabe Y. Totsuka T. Kanazawa Y. Matsushima-Hibiya K. Koyama T. Sugimura K. Wakabayashi Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 12414 12419
112. T. Takamura-Enya M. Watanabe K. Koyama T. Sugimura K. Wakabayashi Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004 323 579 582
113. Y. Matsushima-Hibiya M. Watanabe K. I. P. J. Hidari D. Miyamoto Y. Suzuki T. Kasama T. Kanazawa K. Koyama T. Sugimura K. Wakabayashi J. Biol. Chem. 2003 278 9972 9978
114. T. Nakano Y. Matsushima-Hibiya M. Yamamoto S. Enomoto Y. Matsumoto Y. Totsuka M. Watanabe T. Sugimura K. Wakabayashi Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 13652 13657
115. L. A. Maggio-Hall J. C. Escalante-Semerena Microbiology 2003 149 983 990
116. S. Quan T. Imai Y. Mikami K. Yazawa E. R. Dabbs N. Morisaki S. Iwasaki Y. Hashimoto K. Furihata Antimicrob. Agents Chemother. 1999 43 181 184
117. H. C. Lee Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 2001 41 317 345
118. H. C. Lee R. Aarhus Cell Regul. 1991 2 203 209
119. T. Kaisho J. Ishikawa K. Oritani J. Inazawa H. Tomizawa O. Muraoka T. Ochi T. Hirano Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994 91 5325 5329
120. G. S. Prasad D. E. McRee E. A. Stura D. G. Levitt H. C. Lee C. D. Stout Nat. Struct. Biol. 1996 3 957 964
121. S. Yamamoto-Katayama M. Ariyoshi K. Ishihara T. Hirano H. Jingami K. Morikawa J. Mol. Biol. 2002 316 711 723
122. Q. Liu I. A. Kriksunov R. Graeff C. Munshi H. C. Lee Q. Hao Structure 2005 13 1331 1339
123. R. Aarhus R. M. Graeff D. M. Dickey T. F. Walseth H. C. Lee J. Biol. Chem. 1995 270 30327 30333
124. A. A. Sauve C. Munshi H. C. Lee V. L. Schramm Biochemistry 1998 37 13239 13249
125. A. A. Sauve H. Deng R. H. Angeletti V. L. Schramm J. Am. Chem. Soc. 2000 122 7856 7859
126. M. L. Love D. M. E. Szebenyi I. A. Kriksunov D. J. Thiel C. Munshi R. Graeff H. C. Lee Q. Hao Structure 2004 12 477 486
127. Q. Liu I. A. Kriksunov R. Graeff C. Munshi H. C. Lee Q. Hao J. Biol. Chem. 2006 281 32861 32869
128. H. C. Lee R. Aarhus J. Biol. Chem. 1995 270 2152 2157
129. H. C. Lee R. Aarhus T. F. Walseth Science 1993 261 352 355
130. H. C. Lee J. Biol. Chem. 2005 280 33693 33696
131. M. Yamasaki G. C. Churchill A. Galione FEBS J. 2005 272 4598 4606
132. A. Galione H. C. Lee W. B. Busa Science 1991 253 1143 1146
133. T. F. Walseth R. Aarhus J. A. Kerr H. C. Lee J. Biol. Chem. 1993 268 26686 26691
134. A. Galione M. Ruas Cell. Calcium 2005 38 273 280
135. R. A. Billington J. Bak A. Martinez-Coscolla M. Debidda A. A. Genazzani Br. J. Pharmacol. 2004 142 1241 1246
136. L. Franco L. Guida S. Bruzzone E. Zocchi C. Usai A. D. Flora FASEB J. 1998 12 1507 1520
137. L. Guida S. Bruzzone L. Sturla L. Franco E. Zocchi A. De Flora J. Biol. Chem. 2002 277 47097 47105
138. L. Guida L. Franco S. Bruzzone L. Sturla E. Zocchi G. Basile C. Usai A. De Flora J. Biol. Chem. 2004 279 22066 22075
139. R. A. Billington E. A. Bellomo E. M. Floriddia J. Erriquez C. Distasi A. A. Genazzani FASEB J. 2006 20 521 523
140. S. Soares M. Thompson T. White A. Isbell M. Yamasaki Y. Prakash F. E. Lund A. Galione E. N. Chini Am. J. Physiol.: Cell Physiol. 2007 292 C227 239
141. D. Lin H.-X. Liu H. Hirai T. Torashima T. Nagai O. Lopatina N. A. Shnayder K. Yamada M. Noda T. Seike K. Fujita S. Takasawa S. Yokoyama K. Koizumi Y. Shiraishi S. Tanaka M. Hashii T. Yoshihara K. Higashida M. S. Islam N. Yamada K. Hayashi N. Noguchi I. Kato H. Okamoto A. Matsushima A. Salmina T. Munesue N. Shimizu S. Mochida M. Asano H. Higashida Nature 2007 446 41 45
142. C. B. Munshi R. Graeff H. C. Lee J. Biol. Chem. 2002 277 49453 49458
143. F. E. Lund Mol. Med. 2006 12 328 333