Structural basis for nicotinamide cleavage and ADP-ribose transfer by NAD+-dependent Sir2 histone/protein deacetylases

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 101, Issue 23, 2004, Pages 8563-8568

  Zhao, Kehao ^a   Harshaw, Robyn ^a   Chai, Xiaomei ^a   Marmorstein, Ronen ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

2' O ACETYL ADENOSINE DIPHOSPHATE RIBOSE; ADENOSINE DIPHOSPHATE RIBOSE; ASPARAGINE; HISTONE; LYSINE; NICOTINAMIDE; NICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE; SILENT INFORMATION REGULATOR PROTEIN 2; UNCLASSIFIED DRUG;

ACETYLATION; ARTICLE; CATALYSIS; CELL FUNCTION; CRYSTALLIZATION; DNA REPAIR; ENZYME BINDING; GENE SILENCING; GENETIC STABILITY; HYDROLYSIS; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN TARGETING; REACTION ANALYSIS; STRUCTURE ANALYSIS;

ADENOSINE DIPHOSPHATE RIBOSE; BINDING SITES; HISTONE DEACETYLASES; MODELS, MOLECULAR; NAD; NIACINAMIDE; PROTEIN CONFORMATION; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SILENT INFORMATION REGULATOR PROTEINS, SACCHAROMYCES CEREVISIAE; SIRTUINS; THERMODYNAMICS;

EID: 2942534101     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.0401057101     Document Type: Article

References (39)

1. Bitterman, K. J., Medvedik, O. & Sinclair, D. A. (2003) Microbiol. Mol. Biol. Rev. 67, 376-399.
2. Guarente, L. (2000) Genes Dev. 14, 1021-1026.
3. Avalos, J. L., Celic, I., Muhammad, S., Cosgrove, M. S., Boeke, J. D. & Wolberger, C. (2002) Mol. Cell 10, 523-535.
4. Finnin, M. S., Donigian, J. R. & Pavletich, N. P. (2001) Nat. Struct. Biol. 8, 621-625.
5. Zhao, K., Chai, X., Clements, A. & Marmorstein, R. (2003) Nat. Struct. Biol. 10, 864-871.
6. Min, J., Landry, J., Sternglanz, R. & Xu, R. M. (2001) Cell 105, 269-279.
7. Zhao, K., Chai, X. & Marmorstein, R. (2003) Structure (Cambridge, MA) 11, 1403-1411.
8. Jackson, M. D. & Denu, J. M. (2002) J. Biol. Chem. 277, 18535-18544.
9. Sauve, A. A., Celic, I., Avalos, J., Deng, H. T., Boeke, J. D. & Schramm, V. L. (2001) Biochemistry 40, 15456-15463.
10. Chang, J. H., Kim, H. C., Hwang, K. Y., Lee, J. W., Jackson, S. P., Bell, S. D. & Cho, Y. (2002) J. Biol. Chem. 277, 34489-34498.
11. Tanny, J. C., Dowd, G. J., Huang, J., Hilz, H. & Moazed, D. (1999) Cell 99, 735-745.
12. Slama, J. T. & Simmons, A. M. (1989) Biochemistry 28, 7688-7694.
13. Slama, J. T., Aboul-Ela, N., Goli, D. M., Cheesman, B. V., Simmons, A. M. & Jacobson, M. K. (1995) J. Med. Chem. 38, 389-393.
14. Landry, J., Slama, J. T. & Sternglanz, R. (2000) Biochem. Biophys. Res. Commun. 278, 685-690.
15. Brunger, A. T., Adams, P. D., Clore, G. M., DeLano, W. L., Gros, P., Grosse-Kunstleve, R. W., Jiang, J. S., Kuszewski, J., Nilges, M., Pannu, N. S., et al. (1998) Acta Crystallogr. D 54, 905-921.
16. Jones, T. A., Zou, J. Y., Cowan, S. W. & Kjeldgaard, M. (1991) Acta Crystallogr. A 47, 110-119.
17. Armstrong, C. M., Kaeberlein, M., Imai, S. I. & Guarente, L. (2002) Mol. Biol. Cell 13, 1427-1438.
18. Sauve, A. A. & Schramm, V. L. (2003) Biochemistry 42, 9249-9256.
19. Jackson, M. D., Schmidt, M. T., Oppenheimer, N. J. & Denu, J. M. (2003) J. Biol. Chem. 278, 50985-50998.
20. Barlev, N. A., Liu, L., Chehab, N. H., Mansfield, K., Harris, K. G., Halazonetis, T. D. & Berger, S. L. (2001) Mol. Cell 8, 1243-1254.
21. Liu, L., Scolnick, D. M., Trievel, R. C., Zhang, H. B., Marmorstein, R., Halazonetis, T. D. & Berger, S. L. (1999) Mol. Cell. Biol. 19, 1202-1209.
22. Ito, A., Lai, C. H., Zhao, X., Saito, S., Hamilton, M. H., Appella, E. & Yao, T. P. (2001) EMBO J. 20, 1331-1340.
23. Sakaguchi, K., Herrera, J. E., Saito, S., Miki, T., Bustin, M., Vassilev, A., Anderson, C. W. & Appella, E. (1998) Genes Dev. 12, 2831-2841.
24. Luo, J. Y., Nikolaev, A. Y., Imai, S., Chen, D. L., Su, F., Shiloh, A., Guarente, L. & Gu, W. (2001) Cell 107, 137-148.
25. Vaziri, H., Dessain, S. K., Eagon, E. N., Imai, S. I., Frye, R. A., Pandita, T. K., Guarente, L. & Weinberg, R. A. (2001) Cell 107, 149-159.
26. Langley, E., Pearson, M., Faretta, M., Bauer, U. M., Frye, R. A., Minucci, S., Pelicci, P. G. & Kouzarides, T. (2002) EMBO J. 21, 2383-2396.
27. Cheng, H. L., Mostoslavsky, R., Saito, S., Manis, J. P., Gu, Y. S., Patel, P., Bronson, R., Appella, E., Alt, F. W. & Chua, K. F. (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 10794-10799.
28. Grozinger, C. M., Chao, E. D., Blackwell, H. E., Moazed, D. & Schreiber, S. L. (2001) J. Biol. Chem. 276, 38837-38843.
29. Bedalov, A., Gatbonton, T., Irvine, W. P., Gottschling, D. E. & Simon, J. A. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 15113-15118.
30. Hirao, M., Posakony, J., Nelson, M., Hruby, H., Jung, M., Simon, J. A. & Bedalov, A. (2003) J. Biol. Chem. 278, 52773-52782.
31. Bitterman, K. J., Anderson, R. M., Cohen, H. Y., Latorre-Esteves, M. & Sinclair, D. A. (2002) J. Biol. Chem. 277, 45099-45107.
32. Lin, S. J., Defossez, P. A. & Guarente, L. (2000) Science 289, 2126-2128.
33. Lin, S. J., Kaeberlein, M., Andalis, A. A., Sturtz, L. A., Defossez, P. A., Culotta, V. C., Fink, G. R. & Guarente, L. (2002) Nature 418, 344-348.
34. Tissenbaum, H. A. & Guarente, L. (2001) Nature 410, 227-230.
35. Hekimi, S. & Guarente, L. (2003) Science 299, 1351-1354.
36. Howitz, K. T., Bitterman, K. J., Cohen, H. Y., Lamming, D. W., Lavu, S., Wood, J. G., Zipkin, R. E., Chung, P., Kisielewski, A., Zhang, L. L., et al. (2003) Nature 425, 191-196.
37. Hall, S. S. (2003) Science 301, 1165.
38. Anderson, R. M., Bitterman, K. J., Wood, J. G., Medvedik, O. & Sinclair, D. A. (2003) Nature 423, 181-185.
39. Gallo, C. M., Smith, D. L., Jr., & Smith, J. S. (2004) Mol. Cell. Biol. 24, 1301-1312.