Microarray technology as a universal tool for high-throughput analysis of biological systems

Combinatorial Chemistry and High Throughput Screening

Volumn 9, Issue 5, 2006, Pages 365-380

  Sobek, Jens ^a   Bartscherer, Kerstin ^b   Jacob, Anette ^b   Hoheisel, Jvrg D ^b   Angenendt, Philipp ^b  

^a UNIVERSITY OF ZURICH   (Switzerland)

^b GERMAN CANCER RESEARCH CENTER DKFZ   (Germany)

Author keywords

Antibody microarray; Cell microarray; DNA microarray; Peptide microarray; Protein microarray; Reverse transfection; Surface chemistry

Indexed keywords

ANTIBODY SCREENING; CELL SCREENING; DNA DETERMINATION; DNA MICROARRAY; ENZYME SUBSTRATE; FUNCTIONAL ASSESSMENT; HIGH THROUGHPUT SCREENING; IN VITRO STUDY; IN VIVO STUDY; MICROARRAY ANALYSIS; PEPTIDE SYNTHESIS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN DNA INTERACTION; PROTEIN MICROARRAY; REVIEW; RNA ANALYSIS; RNA TRANSLATION;

ANTIBODIES, MONOCLONAL; ANTIBODY SPECIFICITY; COMBINATORIAL CHEMISTRY TECHNIQUES; DRUG EVALUATION, PRECLINICAL; MICROARRAY ANALYSIS; OLIGONUCLEOTIDE ARRAY SEQUENCE ANALYSIS; PROTEIN ARRAY ANALYSIS; TISSUE ARRAY ANALYSIS; TRANSFECTION;

EID: 33744811399     PISSN: 13862073     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/138620706777452429     Document Type: Review

References (202)

1. Hodneland, C.D.; Lee, Y.S.; Min, D.H.; Mrksich, M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2002, 99, 5048-5052.
2. Zhou, X.; Wu, L.; Zhou, J. Langmuir, 2004, 20, 8877-8885.
3. Huang, N.P.; Michel, R.; Voros, J.; Textor, M.; Hofer, R.; Rossi, A.; Elbert, D.L.; Hubbell, J.A.; Spencer, N.D. Langmuir, 2001, 17, 489-498.
4. Neuschafer, D.; Budach, W.; Wanke, C.; Chibout, S.D. Biosens. Bioelectron., 2003, 18, 489-497.
5. Shchepinov, M.S.; Case-Green, S.C.; Southern, E.M. Nucleic Acids Res., 1997, 25, 1155-1161.
6. Levicky, R.; Horgan, A. Trends Biotechnol., 2005, 23, 143-149.
7. Jin, L.; Horgan, A.; Levicky, R. Langmuir, 2003, 19, 6968-6975.
8. Osborne, M.A.; Barnes, C.L.; Balasubramanian, S.; Klenerman, D. J. Phys. Chem. B, 2001, 105, 3120-3126.
9. Wong, E.L.S.; Chow, E.; Gooding, J.J. Langmuir, 2005, 21, 6957-6965.
10. Sobek, J.; Aquino, C.; Schlapbach, R. Methods Mol. Biol., 2005, in press.
11. Beaucage, S.L. Curr. Med. Chem., 2001, 8, 1213-1244.
12. Xu, Q.; Lam, K.S. J. Biomed. Biotechnol., 2003, 2003, 257-266.
13. Seetharaman, S.; Zivarts, M.; Sudarsan, N.; Breaker, R.R. Nat. Biotechnol., 2001, 19, 336-341.
14. Gong, P.; Grainger, D.W. Surface Sci., 2004, 570, 67-77.
15. Sompuram, S.R.; Vani, K.; Wei, L.; Ramanathan, H.; Olken, S.; Bogen, S.A. Anal. Biochem., 2004, 326, 55-68.
16. Barnes-Seeman, D.; Park, S.B.; Koehler, A.N.; Schreiber, S.L. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2003, 42, 2376-2379.
17. Miller, J.C.; Zhou, H.; Kwekel, J.; Cavallo, R.; Burke, J.; Butler, E.B.; Teh, B.S.; Haab, B.B. Proteomics, 2003, 3, 56-63.
18. Kanoh, N.; Kumashiro, S.; Simizu, S.; Kondoh, Y.; Hatakeyama, S.; Tashiro, H.; Osada, H. Angew. Chem. Int. Ed Engl., 2003, 42, 5584-5587.
19. Caelen, I.; Gao, H.; Sigrist, H. Langmuir, 2002, 18, 2463-2467.
20. Seo, T.S.; Bai, X.; Ruparel, H.; Li, Z.; Turro, N.J.; Ju, J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, 101, 5488-5493.
21. Wang, H.Y.; Malek, R.L.; Kwitek, A.E.; Greene, A.S.; Luu, T.V.; Behbahani, B.; Frank, B.; Quackenbush, J.; Lee, N.H. Genome Biol., 2003, 4, R5.
22. Hoff, A.; Andre, T.; Fischer, R.; Voss, S.; Hulko, M.; Marquardt, U.; Wiesmuller, K.H.; Brock, R. Mol. Divers., 2004, 8, 311-320.
23. Ziauddin, J.; Sabatini, D.M. Nature, 2001, 411, 107-110.
24. Delehanty, J.B.; Shaffer, K.M.; Lin, B. Anal. Chem., 2004, 76, 7323-7328.
25. Kim, S.H.; Tamrazi, A.; Carlson, K.E.; Daniels, J.R.; Lee, I.Y.; Katzenellenbogen, J.A. J. Am. Chem. Soc., 2004, 126, 4754-4755.
26. Walsh, M.K.; Wang, X.; Weimer, B.C. J. Biochem. Biophys. Methods, 2001, 47, 221-231.
27. Piehler, J.; Brecht, A.; Valiokas, R.; Liedberg, B.; Gauglitz, G. Biosensors & Bioelectronics, 2000, 15, 473-481.
28. Park, S.; Lee, M.R.; Pyo, S.J.; Shin, I. J. Am. Chem. Soc., 2004, 126, 4812-4819.
29. Ataka, K.; Giess, F.; Knoll, W.; Naumann, R.; Haber-Pohlmeier, S.; Richter, B.; Heberle, J. J. Am. Chem. Soc., 2004, 126, 16199-16206.
30. Jo, S.; Park, K. Biomaterials, 2000, 21, 605-616.
31. Lee, M.R.; Shin, I. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2005, 44, 2881-2884.
32. Uttamchandani, M.; Walsh, D.P.; Yao, S.Q.; Chang, Y.T. Curr. Opin. Chem. Biol., 2005, 9, 4-13.
33. Butler, J.E. Methods, 2000, 22, 4-23.
34. Chan, V.; Graves, D.J.; Fortina, P.; McKenzie, S.E. Langmuir, 1997, 13, 320-329.
35. Vainrub, A.; Pettitt, B.M. Chem. Phys. Lett., 2000, 323, 160-166.
36. Vainrub, A.; Pettitt, B.M. Phys. Rev., 2002, 66.
37. Vainrub, A.; Pettitt, B.M. Biopolymers, 2003, 68, 265-270.
38. Biebricher, A.; Paul, A.; Tinnefeld, P.; Golzhauser, A.; Sauer, M. J. Biotechnol., 2004, 112, 97-107.
39. Lee, S.J.; Lee, S.Y. Anal. Biochem., 2004, 330, 311-316.
40. Weimer, B.C.; Walsh, M.K.; Wang, X. J. Biochem. Biophys. Methods, 2000, 45, 211-219.
41. Soltys, P.J.; Etzel, M.R. Biomaterials, 2000, 21, 37-48.
42. Houseman, B.T.; Huh, J.H.; Kron, S.J.; Mrksich, M. Nat. Biotechnol., 2002, 20, 270-274.
43. Yeo, W.S.; Mrksich, M. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2003, 42, 3121-3124.
44. MacBeath, G.; Koehler, A.N.; Schreiber, S.L. J. Am. Chem. Soc., 1999, 121, 7967-7968.
45. MacBeath, G.; Schreiber, S.L. Science, 2000, 289, 1760-1763.
46. Benters, R.; Niemeyer, C.M.; Wohrle, D. Chembiochem., 2001, 2, 686-694.
47. Arenkov, P.; Kukhtin, A.; Gemmell, A.; Voloshchuk, S.; Chupeeva, V.; Mirzabekov, A. Anal. Biochem., 2000, 278, 123-131.
48. Rubina, A.Y.; Pan'kov, S.V.; Dementieva, E.I.; Pen'kov, D.N.; Butygin, A.V.; Vasiliskov, V.A.; Chudinov, A.V.; Mikheikin, A.L.; Mikhailovich, V.M.; Mirzabekov, A.D. Anal. Biochem., 2004, 325, 92-106.
49. Zhou, Y.; Andersson, O.; Lindberg, P.; Liedberg, B. Microchimica Acta, 2004, 147, 21-30.
50. Karlsson, O. P.; Lofas, S. Anal. Biochem., 2002, 300, 132-138.
51. Xu, Y.Q.; Bao, G. Analytical Chemistry, 2003, 75, 5345-5351.
52. Dubitsky, A.; DeCollibus, D.; Ortolano, G.A. J. Biochem. Biophys. Methods, 2002, 51, 47-56.
53. Ge, H. Nucleic Acids Res., 2000, 28, e3.
54. Afanassiev, V.; Hanemann, V.; Wolfl, S. Nucleic Acids Res., 2000, 28, E66.
55. Wei, Y.; Ning, G.; Hai-Qian, Z.; Jian-Guo, W.; Yi-Hong, W.; Wesche, K.D. Sensors and Actuators B: Chemical, 2004, 98, 83-91.
56. Kingshott, P.; Griesser, H.J. Curr. Opin. Solid State Mat. Sci., 1999, 4, 403.
57. Qiu, B.; Stefanos, S.; Ma, J.; Lalloo, A.; Perry, B.A.; Leibowitz, M.J.; Sinko, P.J.; Stein, S. Biomaterials, 2003, 24, 11-18.
58. Hessner, M.J.; Meyer, L.; Tackes, J.; Muheisen, S.; Wang, X. BMC. Genomics, 2004, 5, 53.
59. Neuman, D.V; Amara, R.R.; Steinman, L.; Utz, P.J.; Robinson, H.L.; Robinson, W.H. J. Virol., 2003, 77, 11125-11138.
60. Angenendt, P.; Glökler, J.; Sobek, J.; Lehrach, H.; Cahill, D.J. J. Chromatogr. A, 2003, 1009, 97-104.
61. Robinson, W.H.; DiGennaro, C.; Hueber, W.; Haab, B.B.; Kamachi, M.; Dean, E.J.; Fournel, S.; Fong, D.; Genovese, M.C.; de Vegvar, H.E.; Skriner, K.; Hirschberg, D.L.; Morris, R.I.; Muller, S.; Pruijn, G.J.; van Venrooij, W.J.; Smolen, J.S.; Brown, P.O.; Steinman, L.; Utz, P.J. Nat. Med., 2002, 8, 295-301.
62. Haab, B.B.; Dunham, M.J.; Brown, P.O. Genome Biol., 2001, 2, RESEARCH0004.
63. Angenendt, P.; Glökler, J.; Murphy, D.; Lehrach, H.; Cahill, D.J. Anal. Biochem., 2002, 309, 253-260.
64. Mousses, S.; Caplen, N.J.; Cornelison, R.; Weaver, D.; Basik, M.; Hautaniemi, S.; Elkahloun, A.G.; Lotufo, R.A.; Choudary, A.; Dougherty, E.R.; Suh, E.; Kallioniemi, O. Genome Res., 2003, 13, 2341-2347.
65. Sobek, J.; Schlappbach, R. Pharmagenomics, 2004, Sept.
66. Rupcich, N.; Goldstein, A.; Brennan, J.D. Chemistry of Materials, 2003, 15, 1803-1811.
67. Rubina, A.Y.; Dementieva, E.I.; Stomakhin, A.A.; Darii, E.L.; Pan'kov, S.V.; Barsky, V.E.; Ivanov, S.M.; Konovalova, E.V.; Mirzabekov, A.D. Biotechniques, 2003, 34, 1008-1014.
68. Xu, Y.; Bao, G. Anal. Chem., 2003, 75, 5345-5351.
69. Butler, J.E.; Ni, L.; Brown, W.R.; Joshi, K.S.; Chang, J.; Rosenberg, B.; Voss, E.W., Jr. Molecular Immunology, 1993, 30, 1165-1175.
70. Houseman, B.T.; Gawalt, E.S.; Mrksich, M. Langmuir, 2003, 19, 1522-1531.
71. Houseman, B.T.; Mrksich, M. Trends Biotechnol., 2002, 20, 279-281.
72. Falsey, J.R.; Renil, M.; Park, S.; Li, S.J.; Lam, K.S. Bioconjugate Chemistry, 2001, 12, 346-353.
73. Lesaicherre, M.L.; Uttamchandani, M.; Chen, G.Y.; Yao, S.Q. Bioorg. Med. Chem. Lett., 2002, 12, 2079-2083.
74. Chelius, D.; Shaler, T.A. Bioconjugate Chemistry, 2003, 14, 205-211.
75. Wade, J.D.; Domagala, T.; Rothacker, J.; Catimel, B.; Nice, E. Lett. Peptide Sci., 2001, 8, 211-220.
76. Takahashi, M.; Nokihara, K.; Mihara, H. Chem. Biol., 2003, 10, 53-60.
77. Melnyk, O.; Duburcq, X.; Olivier, C.; Urbes, F.; Auriault, C.; Gras-Masse, H. Bioconjug. Chem., 2002, 13, 713-720.
78. Olivier, C.; Hot, D.; Huot, L.; Ollivier, N.; El Mahdi, O.; Gouyette, C.; Huynh-Dinh, T.; Gras-Masse, H.; Lemoine, Y.; Melnyk, O. Bioconjug. Chem., 2003, 14, 430-439.
79. Bieri, C.; Ernst, O.P.; Heyse, S.; Hofmann, K.P.; Vogel, H. Nat. Biotechnol., 1999, 17, 1105-1108.
80. Heyse, S.; Ernst, O.P.; Dienes, Z.; Hofmann, K.P.; Vogel, H. Biochemistry, 1998, 37, 507-522.
81. Fang, Y.; Frutos, A.G.; Lahiri, J. J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 2394-2395.
82. Fang, Y.; Frutos, A.G.; Lahiri, J. Chembiochem., 2002, 3, 987-991.
83. Peluso, P.; Wilson, D.S.; Do, D.; Tran, H.; Venkatasubbaiah, M.; Quincy, D.; Heidecker, B.; Poindexter, K.; Tolani, N.; Phelan, M.; Witte, K.; Jung, L.S.; Wagner, P.; Nock, S. Anal. Biochem., 2003, 312, 113-124.
84. Wacker, R.; Schroder, H.; Niemeyer, C.M. Anal. Biochem., 2004, 330, 281-287.
85. Catimel, B.; Nerrie, M.; Lee, F.T.; Scott, A.M.; Ritter, G.; Welt, S.; Old, L.J.; Burgess, A.W.; Nice, E.C. J. Chromatogr. A, 1997, 776, 15-30.
86. Nisnevitch, M.; Firer, M.A. J. Biochem. Biophys. Methods, 2001, 49, 467-480.
87. Kusnezow, W.; Hoheisel, J.D. J. Mol. Recognit., 2003, 16, 165-176.
88. Vikholm, I.; Albers, W.M. Langmuir, 1998, 14, 3865-3872.
89. Bilkova, Z.; Slovakova, M.; Lycka, A.; Horak, D.; Lenfeld, J.; Turkova, J.; Churacek, J. J. Chromatogr. B Analyt. Technol. Biomed. Life Sci., 2002, 770, 25-34.
90. Gering, J.P.; Quaroni, L.; Chumanov, G. J. Colloid Interface Sci., 2002, 252, 50-56.
91. Shriver-Lake, L.C.; Donner, B.; Edelstein, R.; Breslin, K.; Bhatia, S.K.; Ligler, F.S. Biosens. Bioelectron., 1997, 12, 1101-1106.
92. Stolowitz, M.L.; Ahlem, C.; Hughes, K.A.; Kaiser, R.J.; Kesicki, E.A.; Li, G.; Lund, K.P.; Torkelson, S.M.; Wiley, J.P. Bioconjug. Chem., 2001, 12, 229-239.
93. Pavlinkova, G.; Lou, D.; Kohler, H. Methods, 2000, 22, 44-48.
94. Zhu, H.; Bilgin, M.; Bangham, R.; Hall, D.; Casamayor, A.; Bertone, P.; Lan, N.; Jansen, R.; Bidlingmaier, S.; Houfek, T.; Mitchell, T.; Miller, P.; Dean, R.A.; Gerstein, M.; Snyder, M. Science, 2001, 293, 2101-2105.
95. Cheng, C.W.; Lin, K.C.; Pan, F.M.; Sinchaikul, S.; Wong, C.H.; Su, W.C.; Hsu, C.H.; Chen, S.T. Bioorg. Med. Chem. Lett., 2004, 14, 1987-1990.
96. Wegner, G.J.; Lee, H.J.; Marriott, G.; Corn, R.M. Anal. Chem., 2003, 75, 4740-4746.
97. Lesaicherre, M.L.; Lue, R.Y.; Chen, G.Y.; Zhu, Q.; Yao, S.Q. J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 8768-8769.
98. Lue, R.Y.; Chen, G.Y.; Hu, Y.; Zhu, Q.; Yao, S.Q. J. Am. Chem. Soc., 2004, 126, 1055-1062.
99. Weng, S.; Gu, K.; Hammond, P.W.; Lohse, P.; Rise, C.; Wagner, R.W.; Wright, M.C.; Kuimelis, R.G. Proteomics, 2002, 2, 48-57.
100. Kohn, M.; Breinbauer, R. Angewandte Chemie-International Edition, 2004, 43, 3106-3116.
101. Soellner, M.B.; Dickson, K.A.; Nilsson, B.L.; Raines, R.T. J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 11790-11791.
102. Kindermann, M.; George, N.; Johnsson, N.; Johnsson, K. J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 7810-7811.
103. Muronetz, V.I.; Korpela, T. J. Chromatogr. B-Analytical Technol. Biomed. Life Sci., 2003, 790, 53-66.
104. Yakovleva, J.; Davidsson, R.; Bengtsson, M.; Laurell, T.; Emneus, J. Biosensors & Bioelectronics, 2003, 19, 21-34.
105. Danczyk, R.; Krieder, B.; North, A.; Webster, T.; HogenEsch, H.; Rundell, A. Biotechnol. Bioeng., 2003, 84, 215-223.
106. Anderson, L.; Seilhamer, J. Electrophoresis, 1997, 18, 533-537.
107. Rajagopalan, K.; Pavlinkova, G.; Levy, S.; Pokkuluri, P.R.; Schiffer, M.; Haley, B.E.; Kohler, H. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 1996, 93, 6019-6024.
108. Khrapko, K.R.; Lysov Yu, P.; Khorlyn, A.A.; Shick, V.V.; Florentiev, V.L.; Mirzabekov, A.D. FEBS Lett., 1989, 256, 118-122.
109. Drmanac, R.; Labat, I.; Brukner, I.; Crkvenjakov, R. Genomics, 1989, 4, 114-128.
110. Maskos, U.; Southern, E.M. Nucleic Acids Res., 1993, 21, 2267-2268.
111. Hoheisel, J.D.; Maier, E.; Mott, R.; McCarthy, L.; Grigoriev, A.V.; Schalkwyk, L.C.; Nizetic, D.; Francis, F.; Lehrach, H. Cell, 1993, 73, 109-120.
112. Meier-Ewert, S.; Maier, E.; Ahmadi, A.; Curtis, J.; Lehrach, H. Nature, 1993, 361, 375-376.
113. Schwaenen, C.; Nessling, M.; Wessendorf, S.; Salvi, T.; Wrobel, G.; Radlwimmer, B.; Kestler, H.A.; Haslinger, C.; Stilgenbauer, S.; Dohner, H.; Bentz, M.; Lichter, P. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004, 101, 1039-1044.
114. Tonisson, N.; Zernant, J.; Kurg, A.; Pavel, H.; Slavin, G.; Roomere, H.; Meiel, A.; Hainaut, P.; Metspalu, A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2002, 99, 5503-5508.
115. Adorjan, P.; Distler, J.; Lipscher, E.; Model, F.; Muller, J.; Pelet, C.; Braun, A.; Florl, A.R.; Gutig, D.; Grabs, G.; Howe, A.; Kursar, M.; Lesche, R.; Leu, E.; Lewin, A.; Maier, S.; Muller, V.; Otto, T.; Scholz, C.; Schulz, W.A.; Seifert, H.H.; Schwope, I.; Ziebarth, H.; Berlin, K.; Piepenbrock, C.; Olek, A. Nucleic Acids Res., 2002, 30, e21.
116. Cantor, C.R.; Mirzabekov, A.; Southern, E. Genomics, 1992, 13, 1378-1383.
117. Shendure, J.; Mitra, R.D.; Varma, C.; Church, G.M. Nat. Rev. Genet., 2004, 5, 335-344.
118. Larkin, J.E.; Frank, B.C.; Gavras, H.; Sultana, R.; Quackenbush, J. Nat. Methods, 2005, 2, 337-344.
119. Khan, J.; Simon, R.; Bittner, M.; Chen, Y.; Leighton, S.B.; Pohida, T.; Smith, P.D.; Jiang, Y.; Gooden, G.C.; Trent, J.M.; Meltzer, P.S. Cancer Res., 1998, 58, 5009-5013.
120. Johnson, J.M.; Castle, J.; Garrett-Engele, P.; Kan, Z.; Loerch, P.M.; Armour, C.D.; Santos, R.; Schadt, E.E.; Stoughton, R.; Shoemaker, D.D. Science, 2003, 302, 2141-2144.
121. Fehlbaum, P.; Guihal, C.; Bracco, L.; Cochet, O. Nucleic Acids Res., 2005, 33, e47.
122. Ren, B.; Robert, F.; Wyrick, J.J.; Aparicio, O.; Jennings, E.G.; Simon, I.; Zeitlinger, J.; Schreiber, J.; Hannett, N.; Kanin, E.; Volkert, T.L.; Wilson, C.J.; Bell, S.P.; Young, R.A. Science, 2000, 290, 2306-2309.
123. Buck, M.J.; Lieb, J.D. Genomics, 2004, 83, 349-360.
124. He, M.; Taussig, M.J. Nucleic Acids Res., 2001, 29, 73-73.
125. Weiler, J.; Hoheisel, J.D. Anal. Biochem., 1996, 243, 218-227.
126. Tian, J.; Gong, H.; Sheng, N.; Zhou, X.; Gulari, E.; Gao, X.; Church, G. Nature, 2004, 432, 1050-1054.
127. Cello, J.; Paul, A.V.; Wimmer, E. Science, 2002, 297, 1016-1018.
128. Smith, H.O.; Hutchison, C. A., 3rd; Pfannkoch, C.; Venter, J.C. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2003, 100, 15440-15445.
129. Lajoix, A.D.; Gross, R.; Aknin, C.; Dietz, S.; Granier, C.; Laune, D. Mol. Divers., 2004, 8, 281-290.
130. Lentze, N.; Narberhaus, F. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2004, 325, 401-407.
131. Deswal, R.; Singh, R.; Lynn, A.M.; Frank, R. Peptides, 2005, 26, 395-404.
132. Gosalia, D.N.; Salisbury, C.M.; Ellman, J.A.; Diamond, S.L. Mol. Cell Proteomics, 2005.
133. Uttamchandani, M.; Chen, G.Y.; Lesaicherre, M.L.; Yao, S.Q. Methods Mol. Biol., 2004, 264, 191-204.
134. Kato, R.; Kunimatsu, M.; Fujimoto, S.; Kobayashi, T.; Honda, H. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2004, 315, 22-29.
135. Huang, W.; Beharry, Z.; Zhang, Z.; Palzkill, T. Protein Engineering, 2003, 16, 853-860.
136. Fodor, S.P.A.; Read, J.L.; Pirrung, M.C.; Stryer, L.; Lu, A.T.; Solas, D. Science, 1991, 251, 767-773.
137. Gao, X.; Zhou, X.; Gulari, E. Proteomics, 2003, 3, 2135-2141.
138. Frank, R. Tetrahedron, 1992, 48, 9217-9232.
139. Frank, R. J. Immunol. Methods, 2002, 267, 13-26.
140. Dikmans, A.J.; Morr, M.; Zander, N.; Adler, F.; Turk, G.; Frank, R. Mol. Divers., 2004, 8, 197-207.
141. Bischoff, F.R. BIOspektrum, 2002, 654-657.
142. Lebl, M.; Pokorny, V.; Krchnak, V. J. Comb. Chem., 2005, 7, 42-45.
143. Jacob, A.; Dauber, M.; Brandt, O.; Stephan, A.; Kassahn, D.; Illges, H.; Hoheisel, J. D., Frankfurt 2005.
144. Dauber, M.; Schnölzer, M.; Hoheisel, J.D.; Jacob, A., San Diego 2005.
145. Lebl, M.; Hachmann, J. Methods Mol. Biol., 2005, 298, 167-194.
146. Sun, L.; Rush, J.; Ghosh, I.; Maunus, J.R.; Xu, M.Q. Biotechniques, 2004, 37, 430-436, 438, 440 passim.
147. Gosalia, D.N.; Salisbury, C.M.; Maly, D.J.; Ellman, J.A.; Diamond, S.L. Proteomics, 2005, 5, 1292-1298.
148. Blake, T.A.; Ouyang, Z.; Wiseman, J.M.; Takats, Z.; Guymon, A.J.; Kothari, S.; Cooks, R.G. Anal. Chem., 2004, 76, 6293-6305.
149. Rickert, J.; Brecht, A.; Gopel, W. Biosens. Bioelectron., 1997, 12, 567-575.
150. Wegner, G.J.; Wark, A.W.; Lee, H.J.; Codner, E.; Saeki, T.; Fang, S.; Corn, R.M. Anal. Chem., 2004, 76, 5677-5684.
151. Duburcq, X.; Olivier, C.; Malingue, F.; Desmet, R.; Bouzidi, A.; Zhou, F.; Auriault, C.; Gras-Masse, H.; Melnyk, O. Bioconjug. Chem., 2004, 15, 307-316.
152. Diks, S.H.; Kok, K.; O'Toole, T.; Hommes, D.W.; van Dijken, P.; Joore, J.; Peppelenbosch, M.P. J. Biol. Chem., 2004, 279, 49206-49213.
153. Bialek, K.; Swistowski, A.; Frank, R. Anal. Bioanal. Chem., 2003, 376, 1006-1013.
154. Espanel, X.; van Huijsduijnen, R.H. Methods, 2005, 35, 64-72.
155. Huber, A.H.; Weis, W.I. Cell, 2001, 105, 391-402.
156. Toepert, F.; Knaute, T.; Guffler, S.; Pires, J.R.; Matzdorf, T.; Oschkinat, H.; Schneider-Mergener, J. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2003, 42, 1136-1140.
157. Haehnel, W. Mol. Divers., 2004, 8, 219-229.
158. Angenendt, P.; Glökler, J. Methods Mol. Biol., 2004, 278, 123-134.
159. Merkel, J.S.; Michaud, G.A.; Salcius, M.; Schweitzer, B.; Predki, P.F. Curr. Opin. Biotechnol., 2005, 16, 447-452.
160. Hoogenboom, H.R. Nat. Biotechnol., 2005, 23, 1105-1116.
161. Holz, C.; Hesse, O.; Bolotina, N.; Stahl, U.; Lang, C. Protein Expr. Purif., 2002, 25, 372-378.
162. Madoz-Gurpide, J.; Wang, H.; Misek, D.E.; Brichory, F.; Hanash, S.M. Proteomics, 2001, 1, 1279-1287.
163. Sheehan, K.M.; Calvert, V.S.; Kay, E.W.; Lu, Y.; Fishman, D.; Espina, V.; Aquino, J.; Speer, R.; Araujo, R.; Mills, G.B.; Liotta, L.A.; Petricoin, E.F., 3rd; Wulfkuhle, J.D. Mol. Cell Proteomics, 2005, 4, 346-355.
164. Ramachandran, N.; Hainsworth, E.; Bhullar, B.; Eisenstein, S.; Rosen, B.; Lau, A.Y.; Walter, J.C.; LaBaer, J. Science, 2004, 305, 86-90.
165. Feng, Y.; Ke, X.; Ma, R.; Chen, Y.; Hu, G.; Liu, F. Clin. Chem., 2004, 50, 416-422.
166. Quintana, F.J.; Hagedorn, P.H.; Elizur, G.; Merbl, Y.; Domany, E.; Cohen, I.R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2004.
167. Lueking, A.; Huber, O.; Wirths, C.; Schulte, K.; Stieler, K.M.; Blume-Peytavi, U.; Kowald, A.; Hensel-Wiegel, K.; Tauber, R.; Lehrach, H.; Meyer, H.E.; Cahill, D.J. Mol. Cell Proteomics, 2005, 4, 1382-1390.
168. Li, B.; Jiang, L.; Song, Q.; Yang, J.; Chen, Z.; Guo, Z.; Zhou, D.; Du, Z.; Song, Y.; Wang, J.; Wang, H.; Yu, S.; Yang, R. Infect. Immun., 2005, 73, 3734-3739.
169. Chen, Z.; Pei, D.; Jiang, L.; Song, Y.; Wang, J.; Wang, H.; Zhou, D.; Zhai, J.; Du, Z.; Li, B.; Qiu, M.; Han, Y.; Guo, Z.; Yang, R. Clin. Chem., 2004, 50, 988-995.
170. Steller, S.; Angenendt, P.; Cahill, D.J.; Heuberger, S.; Lehrach, H.; Kreutzberger, J. Proteomics, 2005, 5, 2048-2055.
171. Lin, Y.; Huang, R.; Chen, L.P.; Lisoukov, H.; Lu, Z.H.; Li, S.; Wang, C.C.; Huang, R.P. Proteomics, 2003, 3, 1750-1757.
172. Lin, Y.; Huang, R.; Chen, L.; Li, S.; Shi, Q.; Jordan, C.; Huang, R.P. Int. J. Cancer, 2004, 109, 507-515.
173. Szodoray, P.; Alex, P.; Brun, J.G.; Centola, M.; Jonsson, R. Scand. J. Immunol., 2004, 59, 592-599.
174. Turtinen, L.W.; Prall, D.N.; Bremer, L.A.; Nauss, R.E.; Hartsel, S.C. Antimicrob. Agents Chemother., 2004, 48, 396-403.
175. Cho, W.C.; Yip, T.T.; Yip, C.; Yip, V.; Thulasiraman, V.; Ngan, R.K.; Yip, T.T.; Lau, W.H.; Au, J.S.; Law, S.C.; Cheng, W.W.; Ma, V.W.; Lim, C.K. Clin. Cancer Res., 2004, 10, 43-52.
176. Huang, R.; Lin, Y.; Shi, Q.; Flowers, L.; Ramachandran, S.; Horowitz, I.R.; Parthasarathy, S.; Huang, R.P. Clin. Cancer Res., 2004, 10, 598-609.
177. Nam, M.J.; Madoz-Gurpide, J.; Wang, H.; Lescure, P.; Schmalbach, C.E.; Zhao, R.; Misek, D.E.; Kuick, R.; Brenner, D.E.; Hanash, S.M. Proteomics, 2003, 3, 2108-2115.
178. Sun, Z.; Fu, X.; Zhang, L.; Yang, X.; Liu, F.; Hu, G. Anticancer Res., 2004, 24, 1159-1165.
179. Boutell, J.M.; Hart, D.J.; Godber, B.L.; Kozlowski, R.Z.; Blackburn, J.M. Proteomics, 2004, 4, 1950-1958.
180. Knezevic, V.; Leethanakul, C.; Bichsel, V.E.; Worth, J.M.; Prabhu, V.V.; Gutkind, J.S.; Liotta, L.A.; Munson, P.J.; Petricoin, E.F.R.; Krizman, D.B. Proteomics, 2001, 1, 1271-1278.
181. Ghobrial, I.M.; McCormick, D.J.; Kaufmann, S.H.; Leontovich, A.A.; Loegering, D.A.; Dai, N.T.; Krajnik, K.L.; Stenson, M.J.; Melhem, M.F.; Novak, A.J.; Ansell, S.M.; Witzig, T.E. Blood, 2005, 105, 3722-3730.
182. Gao, W.M.; Kuick, R.; Orchekowski, R.P.; Misek, D.E.; Qiu, J.; Greenberg, A.K.; Rom, W.N.; Brenner, D.E.; Omenn, G.S.; Haab, B.B.; Hanash, S.M. BMC Cancer, 2005, 5, 110.
183. rd. Curr. Opin. Mol. Ther., 2005, 7, 240-245.
184. Paweletz, C.P.; Charboneau, L.; Bichsel, V.E.; Simone, N.L.; Chen, T.; Gillespie, J.W.; Emmert-Buck, M.R.; Roth, M.J.; Petricoin, I.E.; Liotta, L.A. Oncogene, 2001, 20, 1981-1989.
185. Gulmann, C.; Espina, V.; Petricoin, E., 3rd; Longo, D.L.; Santi, M.; Knutsen, T.; Raffeld, M.; Jaffe, E.S.; Liotta, L.A.; Feldman, A.L. Clin. Cancer Res., 2005, 11, 5847-5855.
186. Feilner, T.; Hultschig, C.; Lee, J.; Meyer, S.; Immink, R.G.; Koenig, A.; Possling, A.; Seitz, H.; Beveridge, A.; Scheel, D.; Cahill, D.J.; Lehrach, H.; Kreutzberger, J.; Kersten, B. Mol. Cell Proteomics, 2005, 4, 1558-1568.
187. Jung, G.Y.; Stephanopoulos, G. Science, 2004, 304, 428-431.
188. Funeriu, D.P.; Eppinger, J.; Denizot, L.; Miyake, M.; Miyake, J. Nat. Biotechnol., 2005, 23, 622-627.
189. Angenendt, P.; Lehrach, H.; Kreutzberger, J.; Glökler, J. Proteomics, 2005, 5, 420-425.
190. Angenendt, P.; Glökler, J.; Konthur, Z.; Lehrach, H.; Cahill, D.J. Anal. Chem., 2003, 75, 4368-4372.
191. Angenendt, P. Drug Discov. Today, 2005, 10, 503-511.
192. Angenendt, P.; Wilde, J.; Kijanka, G.; Baars, S.; Cahill, D.J.; Kreutzberger, J.; Lehrach, H.; Konthur, Z.; Glökler, J. Anal. Chem., 2004, 76, 2916-2921.
193. Arlt, D.; Huber, W.; Liebel, U.; Schmidt, C.; Majety, M.; Sauermann, M.; Rosenfelder, H.; Bechtel, S.; Mehrle, A.; Bannasch, D.; Schupp, I.; Seiler, M.; Simpson, J.C.; Hahne, F.; Moosmayer, P.; Ruschhaupt, M.; Guilleaume, B.; Wellenreuther, R.; Pepperkok, R.; Sultmann, H.; Poustka, A.; Wiemann, S. Cancer Res., 2005, 65, 7733-7742.
194. Ota, T.; Suzuki, Y.; Nishikawa, T.; Otsuki, T.; Sugiyama, T.; Irie, R.; Wakamatsu, A.; Hayashi, K.; Sato, H.; Nagai, K.; Kimura, K.; Makita, H.; Sekine, M.; Obayashi, M.; Nishi, T.; Shibahara, T.; Tanaka, T.; Ishii, S.; Yamamoto, J.; Saito, K.; Kawai, Y.; Isono, Y.; Nakamura, Y.; Nagahari, K.; Murakami, K.; Yasuda, T.; Iwayanagi, T.; Wagatsuma, M.; Shiratori, A.; Sudo, H.; Hosoiri, T.; Kaku, Y.; Kodaira, H.; Kondo, H.; Sugawara, M.; Takahashi, M.; Kanda, K.; Yokoi, T.; Furuya, T.; Kikkawa, E.; Omura, Y.; Abe, K.; Kamihara, K.; Katsuta, N.; Sato, K.; Tanikawa, M.; Yamazaki, M.; Ninomiya, K.; Ishibashi, T.; Yamashita, H.; Murakawa, K.; Fujimori, K.; Tanai, H.; Kimata, M.; Watanabe, M.; Hiraoka, S.; Chiba, Y.; Ishida, S.; Ono, Y.; Takiguchi, S.; Watanabe, S.; Yosida, M.; Hotuta, T.; Kusano, J.; Kanehori, K.; Takahashi-Fujii, A.; Hara, H.; Tanase, T.O.; Nomura, Y.; Togiya, S.; Komai, F.; Hara, R.; Takeuchi, K.; Arita, M.; Imose, N.; Musashino, K.; Yuuki, H.; Oshima, A.; Sasaki, N.; Aotsuka, S.; Yoshikawa, Y.; Matsunawa, H.; Ichihara, T.; Shiohata, N.; Sano, S.; Moriya, S.; Momiyama, H.; Satoh, N.; Takami, S.; Terashima, Y.; Suzuki, O.; Nakagawa, S.; Senoh, A.; Mizoguchi, H.; Goto, Y.; Shimizu, F.; Wakebe, H.; Hishigaki, H.; Watanabe, T.; Sugiyama, A.; Takemoto, M.; Kawakami, B.; Watanabe, K.; Kumagai, A.; Itakura, S.; Fukuzumi, Y.; Fujimori, Y.; Komiyama, M.; Tashiro, H.; Tanigami, A.; Fujiwara, T.; Ono, T.; Yamada, K.; Fujii, Y.; Ozaki, K.; Hirao, M.; Ohmori, Y.; Kawabata, A.; Hikiji, T.; Kobatake, N.; Inagaki, H.; Ikema, Y.; Okamoto, S.; Okitani, R.; Kawakami, T.; Noguchi, S.; Itoh, T.; Shigeta, K.; Senba, T.; Matsumura, K.; Nakajima, Y.; Mizuno, T.; Morinaga, M.; Sasaki, M.; Togashi, T.; Oyama, M.; Hata, H.; Komatsu, T.; Mizushima-Sugano, J.; Satoh, T.; Shirai, Y.; Takahashi, Y.; Nakagawa, K.; Okumura, K.; Nagase, T.; Nomura, N.; Kikuchi, H.; Masuho, Y.; Yamashita, R.; Nakai, K.; Yada, T.; Ohara, O.; Isogai, T.; Sugano, S. Nat. Genet., 2004, 36, 40-45.
195. Kato, K.; Umezawa, K.; Miyake, M.; Miyake, J.; Nagamune, T. Biotechniques, 2004, 37, 444-448, 450, 452.
196. Bailey, S.N.; Sabatini, D.M.; Stockwell, B.R. Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 2004, 101, 16144-16149.
197. Boutros, M.; Kiger, A.A.; Armknecht, S.; Kerr, K.; Hild, M.; Koch, B.; Haas, S.A.; Consortium, H.F.; Paro, R.; Perrimon, N. Science, 2004, 303, 832-835.
198. Muller, P.; Kuttenkeuler, D.; Gesellchen, V.; Zeidler, M.P.; Boutros, M. Nature, 2005, 436, 871-875.
199. Waterworth, A.; Horgan, K.; Speirs, V.; Hanby, A.M. Int. J. Oncol., 2004, 25, 167-171.
200. Kononen, J.; Bubendorf, L.; Kallioniemi, A.; Barlund, M.; Schraml, P.; Leighton, S.; Torhorst, J.; Mihatsch, M.J.; Sauter, G.; Kallioniemi, O.P. Nat. Med., 1998, 4, 844-847.
201. Nishizuka, S.; Charboneau, L.; Young, L.; Major, S.; Reinhold, W.C.; Waltham, M.; Kouros-Mehr, H.; Bussey, K.J.; Lee, J.K.; Espina, V.; Munson, P.J.; Petricoin, E., 3rd; Liotta, L.A.; Weinstein, J.N. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2003, 100, 14229-14234.
202. Palmer, E.; Freeman, T. Pharmacogenomics, 2005, 6, 527-534.