-
1
-
-
0028810769
-
-
Carfi, A.; Pares, S.; Duee, E.; Galleni, M.; Frere, J.-M.; Dideberg, O. EMBO J. 1995, 14, 4914-4921.
-
(1995)
EMBO J.
, vol.14
, pp. 4914-4921
-
-
Carfi, A.1
Pares, S.2
Duee, E.3
Galleni, M.4
Frere, J.-M.5
Dideberg, O.6
-
2
-
-
0031833739
-
-
Carfi, A.; Duee, E.; Galleni, M.; Frere, J.-M.; Dideberg, O. Acta Crystallogr. 1998, D54, 313-323.
-
(1998)
Acta Crystallogr.
, vol.D54
, pp. 313-323
-
-
Carfi, A.1
Duee, E.2
Galleni, M.3
Frere, J.-M.4
Dideberg, O.5
-
3
-
-
0032497362
-
-
Fabiane, S. M.; Sohi, M. K.; Wan, T.; Payne, D. J.; Bateson, J. H.; Mitchell, T.; Sutton, B. J. Biochemistry 1998, 37, 12404-12411.
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 12404-12411
-
-
Fabiane, S.M.1
Sohi, M.K.2
Wan, T.3
Payne, D.J.4
Bateson, J.H.5
Mitchell, T.6
Sutton, B.J.7
-
4
-
-
0034681922
-
-
Concha, N. O.; Janson, C. A.; Rowling, P.; Pearson, S.; Cheever, C. A.; Clarke, B. P.; Lewis, C.; Galleni, M.; Frere, J.-M.; Payne, D. J.; Bateson, J. H.; Abdel-Meguid, S. S. Biochemistry 2000, 39, 4288-4298.
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 4288-4298
-
-
Concha, N.O.1
Janson, C.A.2
Rowling, P.3
Pearson, S.4
Cheever, C.A.5
Clarke, B.P.6
Lewis, C.7
Galleni, M.8
Frere, J.-M.9
Payne, D.J.10
Bateson, J.H.11
Abdel-Meguid, S.S.12
-
5
-
-
0035943678
-
-
Toney, J. H.; Hammond, G. G.; Fitzgerald, P. M. D.; Sharma, N.; Balkovec, J. M.; Rouen, G. P.; Olson, S. H.; Hammond, M. L.; Greenlee, M. L.; Gao, Y.-D. J. Biol. Chem. 2001, 276, 31913-31918.
-
(2001)
J. Biol. Chem.
, vol.276
, pp. 31913-31918
-
-
Toney, J.H.1
Hammond, G.G.2
Fitzgerald, P.M.D.3
Sharma, N.4
Balkovec, J.M.5
Rouen, G.P.6
Olson, S.H.7
Hammond, M.L.8
Greenlee, M.L.9
Gao, Y.-D.10
-
6
-
-
0042666843
-
-
Oelschlaeger, P.; Schmid, R. D.; Pleiss, J. Biochemistry 2003, 42, 8945-8956.
-
(2003)
Biochemistry
, vol.42
, pp. 8945-8956
-
-
Oelschlaeger, P.1
Schmid, R.D.2
Pleiss, J.3
-
7
-
-
0032553559
-
-
Ullah, J. H.; Walsh, T. R.; Taylor, I. A.; Emery, D. C.; Verma, C. S.; Gamblin, S. J.; Spencer, J. J. Mol. Biol. 1998, 284, 125-136.
-
(1998)
J. Mol. Biol.
, vol.284
, pp. 125-136
-
-
Ullah, J.H.1
Walsh, T.R.2
Taylor, I.A.3
Emery, D.C.4
Verma, C.S.5
Gamblin, S.J.6
Spencer, J.7
-
9
-
-
0033056949
-
-
Yang, Y.; Keeney, D.; Tang, X.-J.; Canfield, N.; Rasmussen, B. A. J. Biol. Chem. 1999, 274, 15706-15711.
-
(1999)
J. Biol. Chem.
, vol.274
, pp. 15706-15711
-
-
Yang, Y.1
Keeney, D.2
Tang, X.-J.3
Canfield, N.4
Rasmussen, B.A.5
-
10
-
-
0030931732
-
-
Valladares, M. H.; Felici, A.; Weber, G.; Adolph, H. W.; Zeppezauer, M.; Rossolini, G. M.; Amicosante, G.; Frere, J. M.; Galleni, M. Biochemistry 1997, 36, 11534-11541.
-
(1997)
Biochemistry
, vol.36
, pp. 11534-11541
-
-
Valladares, M.H.1
Felici, A.2
Weber, G.3
Adolph, H.W.4
Zeppezauer, M.5
Rossolini, G.M.6
Amicosante, G.7
Frere, J.M.8
Galleni, M.9
-
11
-
-
0030586055
-
-
Concha, N. O.; Rasmussen, B. A.; Bush, K.; Herzberg, O. Structure 1996, 4, 823-836.
-
(1996)
Structure
, vol.4
, pp. 823-836
-
-
Concha, N.O.1
Rasmussen, B.A.2
Bush, K.3
Herzberg, O.4
-
12
-
-
0031887008
-
-
Carfi, A.; Duee, E.; Paul-Soto, R.; Galleni, M.; Frere, J.-M.; Dideberg, O. Acta Crystallogr. 1998, D54, 47-57.
-
(1998)
Acta Crystallogr.
, vol.D54
, pp. 47-57
-
-
Carfi, A.1
Duee, E.2
Paul-Soto, R.3
Galleni, M.4
Frere, J.-M.5
Dideberg, O.6
-
13
-
-
0029808391
-
-
Crowder, M. W.; Wang, Z.; Franklin, S. L.; Zovinka, E. P.; Benkovic, S. J. Biochemistry 1996, 35, 12126-12132.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 12126-12132
-
-
Crowder, M.W.1
Wang, Z.2
Franklin, S.L.3
Zovinka, E.P.4
Benkovic, S.J.5
-
14
-
-
16244411180
-
-
note
-
Throughout this paper, we follow a numbering scheme that begins at the amino terminus of the 232-residue mature protein although the sequence of the metallo-β-lactamase from B. fragilis contains 249 amino acids.
-
-
-
-
15
-
-
0024218271
-
-
Eriksson, A. E.; Jones, A. T.; Liljas, A. Proteins 1988, 4, 274-282.
-
(1988)
Proteins
, vol.4
, pp. 274-282
-
-
Eriksson, A.E.1
Jones, A.T.2
Liljas, A.3
-
16
-
-
0026463503
-
-
Håkansson, K.; Carlsson, M.; Svensson, L. A.; Liljas, A. J. Mol. Biol. 1992, 227, 1192-1204.
-
(1992)
J. Mol. Biol.
, vol.227
, pp. 1192-1204
-
-
Håkansson, K.1
Carlsson, M.2
Svensson, L.A.3
Liljas, A.4
-
17
-
-
0032951167
-
-
Li, Z.; Rasmussen, B. A.; Herzberg, O. Protein Sci. 1999, 8, 249-252.
-
(1999)
Protein Sci.
, vol.8
, pp. 249-252
-
-
Li, Z.1
Rasmussen, B.A.2
Herzberg, O.3
-
18
-
-
0034687116
-
-
Yanchak, M. P.; Taylor, R. A.; Crowder, M. W. Biochemistry 2000, 39, 11330-11339.
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 11330-11339
-
-
Yanchak, M.P.1
Taylor, R.A.2
Crowder, M.W.3
-
19
-
-
0035852802
-
-
Fast, W.; Wang, Z.; Benkovic, S. J. Biochemistry 2001, 40, 1640-1650.
-
(2001)
Biochemistry
, vol.40
, pp. 1640-1650
-
-
Fast, W.1
Wang, Z.2
Benkovic, S.J.3
-
20
-
-
0030598201
-
-
Walter, M. W.; Felici, A.: Galleni, M.; Soto, R. P.; Adlington, R. M.; Baldwin, J. E.; Frère, J.-M.; Gololobov, M.; Schofield, C. J. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1996, 6, 2455-2458.
-
(1996)
Bioorg. Med. Chem. Lett.
, vol.6
, pp. 2455-2458
-
-
Walter, M.W.1
Felici, A.2
Galleni, M.3
Soto, R.P.4
Adlington, R.M.5
Baldwin, J.E.6
Frère, J.-M.7
Gololobov, M.8
Schofield, C.J.9
-
21
-
-
1542404603
-
-
Tsang, W. Y.; Dhanda, A.; Schofield, C. J.; Frère, J.-M.; Galleni, M.; Page, M. I. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 1737-1739.
-
(2004)
Bioorg. Med. Chem. Lett.
, vol.14
, pp. 1737-1739
-
-
Tsang, W.Y.1
Dhanda, A.2
Schofield, C.J.3
Frère, J.-M.4
Galleni, M.5
Page, M.I.6
-
22
-
-
1242316384
-
-
Buynak, J. D.; Chen, H.; Vogeti, L.; Gadhachanda, V. R.; Buchanan, C. A.; Palzkill, T.; Shaw, R. W.; Spencer, J.; Walsh, T. R. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 1299-1304.
-
(2004)
Bioorg. Med. Chem. Lett.
, vol.14
, pp. 1299-1304
-
-
Buynak, J.D.1
Chen, H.2
Vogeti, L.3
Gadhachanda, V.R.4
Buchanan, C.A.5
Palzkill, T.6
Shaw, R.W.7
Spencer, J.8
Walsh, T.R.9
-
23
-
-
0037430396
-
-
Boerzel, H.; Koeckert, M.; Bu, W.; Spingler, B.; Lippard, S. J. Inorg. Chem. 2003, 42, 1604-1615.
-
(2003)
Inorg. Chem.
, vol.42
, pp. 1604-1615
-
-
Boerzel, H.1
Koeckert, M.2
Bu, W.3
Spingler, B.4
Lippard, S.J.5
-
24
-
-
12244297122
-
-
Siemann, S.; Clarke, A. J.; Viswanatha, T.; Dmitrienko, G. I. Biochemistry 2003, 42, 1673-1683.
-
(2003)
Biochemistry
, vol.42
, pp. 1673-1683
-
-
Siemann, S.1
Clarke, A.J.2
Viswanatha, T.3
Dmitrienko, G.I.4
-
25
-
-
0032830274
-
-
Walter, M. W.; Valladares, M. H.; Adlington, R. M.; Amicosante, G.; Baldwin, J. E.; Frère, J.-M.; Galleni, M.; Rossolini, G. M.; Schofield, C. J. Bioorg. Chem. 1999, 27, 35-40.
-
(1999)
Bioorg. Chem.
, vol.27
, pp. 35-40
-
-
Walter, M.W.1
Valladares, M.H.2
Adlington, R.M.3
Amicosante, G.4
Baldwin, J.E.5
Frère, J.-M.6
Galleni, M.7
Rossolini, G.M.8
Schofield, C.J.9
-
26
-
-
0033530093
-
-
Greenlee, M. L.; Laub, J. B.; Balkovec, J. M.; Hammond, M. L.; Hammond, G. G.; Pompliano, D. L.; Toney, J. H. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1999, 9, 2549-2554.
-
(1999)
Bioorg. Med. Chem. Lett.
, vol.9
, pp. 2549-2554
-
-
Greenlee, M.L.1
Laub, J.B.2
Balkovec, J.M.3
Hammond, M.L.4
Hammond, G.G.5
Pompliano, D.L.6
Toney, J.H.7
-
27
-
-
0032510815
-
-
Fitzgerald, P. M. D.; Wu, J. K.; Toney, J. H. Biochemistry 1998, 37, 6791-6800.
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 6791-6800
-
-
Fitzgerald, P.M.D.1
Wu, J.K.2
Toney, J.H.3
-
28
-
-
13144295022
-
-
Toney, J. H.; Fitzgerald, P. M. D.; Grover-Sharrna, N.; Olson, S. H.; May, W. J.; Sundelof, J. G.; Vanderwall, D. E.; Cleary, K. A.; Grant, S. K.; Wu, J. K.; Kozarich, J. W.; Pompliano, D. L.; Hammond, G. G. Chem. Biol. 1998, 5, 185-196.
-
(1998)
Chem. Biol.
, vol.5
, pp. 185-196
-
-
Toney, J.H.1
Fitzgerald, P.M.D.2
Grover-Sharrna, N.3
Olson, S.H.4
May, W.J.5
Sundelof, J.G.6
Vanderwall, D.E.7
Cleary, K.A.8
Grant, S.K.9
Wu, J.K.10
Kozarich, J.W.11
Pompliano, D.L.12
Hammond, G.G.13
-
29
-
-
0033517787
-
-
Scrofani, S. D. B.; Chung, J.; Huntley, J. J. A.; Benkovic, S. J.; Wright, P. E.; Dyson, H. J. Biochemistry 1999, 38, 14507-14514.
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 14507-14514
-
-
Scrofani, S.D.B.1
Chung, J.2
Huntley, J.J.A.3
Benkovic, S.J.4
Wright, P.E.5
Dyson, H.J.6
-
30
-
-
0034619511
-
-
Huntley, J. J. A.; Scrofani, S. D. B.; Osborne, M. J.; Dyson, H. J. Biochemistry 2000, 39, 13356-13364.
-
(2000)
Biochemistry
, vol.39
, pp. 13356-13364
-
-
Huntley, J.J.A.1
Scrofani, S.D.B.2
Osborne, M.J.3
Dyson, H.J.4
-
31
-
-
0035451514
-
-
Salsbury, F. R., Jr.; Crowley, M. F.; Brooks, C. L., III. Proteins 2001, 44, 448-459.
-
(2001)
Proteins
, vol.44
, pp. 448-459
-
-
Salsbury Jr., F.R.1
Crowley, M.F.2
Brooks III, C.L.3
-
32
-
-
0033520073
-
-
Wang, Z.; Fast, W.; Benkovic, S. J. Biochemistry 1999, 38, 10013-10023.
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 10013-10023
-
-
Wang, Z.1
Fast, W.2
Benkovic, S.J.3
-
34
-
-
0032556222
-
-
Wang, Z.; Fast, W.; Benkovic, S. J. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10788-10789.
-
(1998)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.120
, pp. 10788-10789
-
-
Wang, Z.1
Fast, W.2
Benkovic, S.J.3
-
35
-
-
0034809020
-
-
Kaminskaia, N. V.; Spingler, B.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 6555-6563.
-
(2001)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.123
, pp. 6555-6563
-
-
Kaminskaia, N.V.1
Spingler, B.2
Lippard, S.J.3
-
36
-
-
0034641208
-
-
Kaminskaia, N. V.; Spingler, B.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 6411-6422.
-
(2000)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.122
, pp. 6411-6422
-
-
Kaminskaia, N.V.1
Spingler, B.2
Lippard, S.J.3
-
38
-
-
0039927392
-
-
Diaz, N.; Suarez, D.; Merz, K. M., Jr. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 4197-4208.
-
(2000)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.122
, pp. 4197-4208
-
-
Diaz, N.1
Suarez, D.2
Merz Jr., K.M.3
-
39
-
-
0035840978
-
-
Diaz, N.; Suarez, D.; Merz, K. M., Jr. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9867-9879.
-
(2001)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.123
, pp. 9867-9879
-
-
Diaz, N.1
Suarez, D.2
Merz Jr., K.M.3
-
40
-
-
0038574378
-
-
Peraro, M. D.; Vila, A. J.; Carloni, P. Inorg. Chem. 2003, 42, 4245-4247.
-
(2003)
Inorg. Chem.
, vol.42
, pp. 4245-4247
-
-
Peraro, M.D.1
Vila, A.J.2
Carloni, P.3
-
41
-
-
0037435168
-
-
Olsen, L.; Antony, J.; Ryde, U.; Adolph, H.-W.; Hemmingsen, L. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 2366-2375.
-
(2003)
J. Phys. Chem. B.
, vol.107
, pp. 2366-2375
-
-
Olsen, L.1
Antony, J.2
Ryde, U.3
Adolph, H.-W.4
Hemmingsen, L.5
-
42
-
-
9144235573
-
-
Olsen, L.; Rasmussen, T.; Hemmingsen, L.; Ryde, U. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 17639-17648.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 17639-17648
-
-
Olsen, L.1
Rasmussen, T.2
Hemmingsen, L.3
Ryde, U.4
-
43
-
-
0042666843
-
-
Oelschlaeger, P.; Schmid, R. D.; Pleiss, J. Biochemistry 2003, 42, 8945-8956.
-
(2003)
Biochemistry
, vol.42
, pp. 8945-8956
-
-
Oelschlaeger, P.1
Schmid, R.D.2
Pleiss, J.3
-
44
-
-
14944343171
-
-
Olsen, L.; Pettersson, I.; Hemmingsen, L.; Adolph, H.-W.; Jorgensen, F. S. J. Comput.-Aided Mol. Des. 2004, 18, 287-302.
-
(2004)
J. Comput.-Aided Mol. Des.
, vol.18
, pp. 287-302
-
-
Olsen, L.1
Pettersson, I.2
Hemmingsen, L.3
Adolph, H.-W.4
Jorgensen, F.S.5
-
45
-
-
5444222194
-
-
Brothers, E. N.; Suarez, D.; Deerfield, D. W., II; Merz, K. M., Jr. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1677-1692.
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1677-1692
-
-
Brothers, E.N.1
Suarez, D.2
Deerfield II, D.W.3
Merz Jr., K.M.4
-
46
-
-
0025995716
-
-
Payne, D. J.; Coleman, K.; Cramp, R. J. Antimicrob. Chemother. 1991, 28, 775-776.
-
(1991)
J. Antimicrob. Chemother.
, vol.28
, pp. 775-776
-
-
Payne, D.J.1
Coleman, K.2
Cramp, R.3
-
47
-
-
0028219728
-
-
Payne, D. J.; Cramp, R.; Winstanley, D. J.; Knowles, D. J. Antimicrob. Agents Chemother. 1994, 38, 767-772.
-
(1994)
J. Antimicrob. Agents Chemother.
, vol.38
, pp. 767-772
-
-
Payne, D.J.1
Cramp, R.2
Winstanley, D.J.3
Knowles, D.4
-
48
-
-
11644261806
-
-
Morris, G. M.; Goodsell, D. S.; Halliday, R. S.; Huey, R.; Hart, W. E.; Belew, R. K.; Olson, A. J. J. Comput. Chem. 1998, 19, 1639-1662.
-
(1998)
J. Comput. Chem.
, vol.19
, pp. 1639-1662
-
-
Morris, G.M.1
Goodsell, D.S.2
Halliday, R.S.3
Huey, R.4
Hart, W.E.5
Belew, R.K.6
Olson, A.J.7
-
49
-
-
84986513644
-
-
Field, M. J.; Bash, P. A.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1990, 11, 700-733.
-
(1990)
J. Comput. Chem.
, vol.11
, pp. 700-733
-
-
Field, M.J.1
Bash, P.A.2
Karplus, M.3
-
50
-
-
0003839101
-
-
The Pennsylvania State University
-
Cheng, A.; Stanton, R. S.; Vincent, J. J.; van der Vaart, A.; Damodaran, K. V.; Dixon, S. L.; Hartsough, D. S.; Mori, M.; Best, S. A.; Monard, G.; Garcia, M.; Van Zant, L. C.; Merz, K. M., Jr. ROAR 2.0; The Pennsylvania State University: 1999.
-
(1999)
ROAR 2.0
-
-
Cheng, A.1
Stanton, R.S.2
Vincent, J.J.3
Van Der Vaart, A.4
Damodaran, K.V.5
Dixon, S.L.6
Hartsough, D.S.7
Mori, M.8
Best, S.A.9
Monard, G.10
Garcia, M.11
Van Zant, L.C.12
Merz Jr., K.M.13
-
51
-
-
16244403085
-
-
Schroedinger Inc.: Portland, OR
-
Ringnalda, M. N. Jaguar; Schroedinger Inc.: Portland, OR, 1997
-
(1997)
Jaguar
-
-
Ringnalda, M.N.1
-
54
-
-
0345491105
-
-
Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789.
-
(1988)
Phys. Rev. B
, vol.37
, pp. 785-789
-
-
Lee, C.1
Yang, W.2
Parr, R.G.3
-
55
-
-
37049081497
-
-
Laws, A. P.; Page, M. I. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1989, 2, 1577-1581.
-
(1989)
J. Chem. Soc., Perkin Trans.
, vol.2
, pp. 1577-1581
-
-
Laws, A.P.1
Page, M.I.2
-
56
-
-
0037188355
-
-
Suarez, D.; Brothers, E. N.; Merz, K. M., Jr. Biochemistry 2002, 41, 6615-6630.
-
(2002)
Biochemistry
, vol.41
, pp. 6615-6630
-
-
Suarez, D.1
Brothers, E.N.2
Merz Jr., K.M.3
-
57
-
-
0032080039
-
-
Bounaga, S.; Laws, A. P.; Gallen, M.; Page, M. I. Biochem. J. 1998, 331, 703-711.
-
(1998)
Biochem. J.
, vol.331
, pp. 703-711
-
-
Bounaga, S.1
Laws, A.P.2
Gallen, M.3
Page, M.I.4
-
59
-
-
0001480124
-
-
Oie, T.; Loew, G. H.; Burt, S. K.; Binkley, J. S.; MacElroy, R. D. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 6169-6174.
-
(1982)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.104
, pp. 6169-6174
-
-
Oie, T.1
Loew, G.H.2
Burt, S.K.3
Binkley, J.S.4
MacElroy, R.D.5
-
60
-
-
0347486647
-
-
Jensen, J. H.; Baldridge, K. K.; Gordon, M. S. J. Phys. Chem. 1992, 96, 8340-8351.
-
(1992)
J. Phys. Chem.
, vol.96
, pp. 8340-8351
-
-
Jensen, J.H.1
Baldridge, K.K.2
Gordon, M.S.3
-
61
-
-
0000475167
-
-
Krug, J. P.; Popelier, P. L. A.; Bader, R. F. W. J. Phys. Chem. 1992, 96, 7604-7616.
-
(1992)
J. Phys. Chem.
, vol.96
, pp. 7604-7616
-
-
Krug, J.P.1
Popelier, P.L.A.2
Bader, R.F.W.3
-
62
-
-
12044249594
-
-
Antonczak, S.; Ruiz-López, M. F.; Rivail, J. L. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3912-3921.
-
(1994)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.116
, pp. 3912-3921
-
-
Antonczak, S.1
Ruiz-López, M.F.2
Rivail, J.L.3
-
63
-
-
0034716728
-
-
Park, H.; Sun, J.; Lee, S. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3901-3908.
-
(2000)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.122
, pp. 3901-3908
-
-
Park, H.1
Sun, J.2
Lee, S.3
|