Vibrational spectroscopic detection of beta- and gamma-turns in synthetic and natural peptides and proteins

Chemical Reviews

Volumn 103, Issue 5, 2003, Pages 1917-1954

  Vass, Elemér ^a   Hollósi, Miklós ^a   Besson, Françoise ^b   Buchet, René ^b  

^a EÖTVÖS LORÁND UNIVERSITY   (Hungary)

^b UNIVERSITÉ LYON 1   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINES; BAND STRUCTURE; CHARACTERIZATION; COMPOSITION; GENES; HYDROGEN BONDS; MOLECULAR VIBRATIONS; POLYPEPTIDES; SPECTROSCOPIC ANALYSIS; X RAY ANALYSIS;

CONFORMATIONAL ANALYSIS; DIAMIDE; HYDROGEN BOND ACCEPTOR AMIDE; PEPTIDES; VIBRATIONAL BANDS; VIBRATIONAL SPECTROSCOPY;

PROTEINS;

CYCLOPEPTIDE; PEPTIDE; PROTEIN; RECOMBINANT PROTEIN;

CHEMISTRY; CIRCULAR DICHROISM; INFRARED SPECTROSCOPY; PROTEIN FOLDING; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; RAMAN SPECTROMETRY; REVIEW;

CIRCULAR DICHROISM; PEPTIDES; PEPTIDES, CYCLIC; PROTEIN FOLDING; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; PROTEINS; RECOMBINANT PROTEINS; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN;

EID: 0038281274     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr000100n     Document Type: Article

References (384)

1. Orengo, C. A.; Todd, A. E.; Thorton, J. M. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 374.
2. Gerstein, M.; Jansen, R. Curr. Opin. Struct. Biol. 2000, 10, 574.
3. (a) Jaenicke, R. Biochemistry 1991, 30, 3147.
4. Orengo, C. A.; Michine, A. D.; Jones, S.; Jones, D. T.; Swindells, M. B.; Thorton, J. M. Structure 1997, 5, 1093.
5. Fasman, G. D. In Prediction of Protein Structure and the Principles of Protein Conformation; Fasman, G. D., Ed.; Plenum Press: New York, 1986; pp. 193-316.
6. Sternberg, M. F. E.; Bates, P. A.; Kelley, L. A.; MacCallum, R. M. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 368.
7. (a) Koehl, R.; Levitt, M. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 108.
8. (b) Jones, D. T.; Taylor, W. R.; Thorton, J. M. Nature 1992, 358, 86.
9. Richardson, J. S. Adv. Protein Chem. 1981, 34, 167.
10. (a) Milner-White, E. J. J. Mol. Biol. 1990, 216, 385.
11. (b) Milner-White, E. J.; Ross, B. M.; Ismail, R.; Belhadj-Mostefa, K.; Poet, R. J. Mol. Biol. 1988, 204, 777.
12. (a) Pavone, V.; Gaeta, A. L.; Nastri, F.; Maglio, O.; Isernia, C.; Saviano, M. Biopolymers 1996, 38, 705.
13. (b) Chou, K.-C. Biopolymers 1997, 42, 837.
14. (a) Li, W.; Liu, Z.; Lai, L. Biopolymers 1999, 49, 481.
15. (b) Fiser, A.; Kinh Gian Do, R.; Šali, A. Protein Sci. 2000, 9, 1753.
16. (c) Galaktionov, S.; Nikiforovich, G. V.; Marshall, G. R. Biopolym. (Peptide Sci.) 2001, 60, 153.
17. Sreerama, N.; Woody, R. W. In Circular Dichroism; Berova, N., Nakanishi, K., Woody, R. W., Eds.; Wiley-VCH: New York 2000; Chapter 21, pp 601-620.
18. Venyaminov, S. Yu.; Vassilenko, K. S. Anal. Biochem. 1994, 222, 176.
19. Perczel, A.; Hollósi, M. Circular Dichroism and the Conformational Analysis of Biomolecules; Fasman, G. D., Ed.; Plenum Publishing Co.: New York, 1996; Chapter 9, pp 285-380.
20. (a) Byler, M. D.; Susi, H. Biopolymers 1986, 25, 469.
21. (b) Susi, H.; Byler D. M. Methods Enzymol. 1986, 130, 290-311.
22. (c) Surewicz, W. K.; Mantsch, H. H.; Chapman, D. Biochim. Biophys. Acta 1988, 952, 115.
23. (d) Haris, P. I.; Chapman, D. Trends Biochem. Sci. 1992, 17, 328.
24. (e) Arrondo, J. L. R.; Muga, A.; Castresana, J.; Goñi, F. M. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1993, 59, 23.
25. (f) Haris, P. I.; Chapman, D. Biopolymers 1995, 37, 251.
26. (g) Jackson, M.; Mantsch, H. H. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 1995, 30, 95.
27. (a) Giannis, A.; Kolter, T. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1993, 32, 1244.
28. (b) Hruby, V. J.; Balse, P. M. Curr. Med. Chem. 2000, 7, 945.
29. Burley, S. K.; Almo, S. C.; Bonanno, J. B.; Capel, M.; Chance, M. R.; Gaasterland, T.; Lin, D.; Sali, A.; Studier, F. W.; Swaminathan, S. Nat. Genet. 1999, 23, 151.
30. (a) Prasad, B. V. V.; Balaram, P. CRC Crit. Rev. Biochem. 1984, 16, 307.
31. (b) Kennedy, D. F.; Crisma, M.; Toniolo, C., Chapman, D. Biochemistry 1991, 30, 6541.
32. Chou, P.; Fasman, G. G. J. Mol. Biol. 1977, 115, 135.
33. Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747.
34. Levitt, M.; Greer, J. J. Mol. Biol. 1977, 114, 181.
35. Kabsh, W.; Sander, C. Biopolymers 1983, 22, 2577.
36. Hutchinson, E. G.; Thornton, J. M. Protein Sci. 1994, 3, 2207.
37. Guruprasad, K.; Prasad, M. S.; Kumar, G. R. J. Peptide Res. 2001, 57, 292.
38. (a) Smith, J. A.; Pease, L. G. CRC Crit. Rev. Biochem. 1980, 8, 315.
39. (b) Gierasch, L. M.; Deber, C. M.; Madison, V.; Niu,C. H.; Blout, E. R. Biochemistry 1981, 20, 4730.
40. Rose, G. D.; Gierasch, L. M.; Smith, J. A. Adv. Protein Chem. 1985, 37, 1.
41. (a) Woody, R. W. in The Peptides; Hruby, V. J., Ed.; Academic Press: New York, 1985; Vol. 7, pp. 15-114.
42. (b) Yang, J. T.; Wu C.-S. C.; Martinez H. M. Methods Enzymol. 1986, 130, 208.
43. (c) Johnson, W. C., Jr. Proteins: Struct. Funct. Genet. 1990, 7, 214.
44. Greenfield, N.; Fasman, G. D. Biochemistry 1969, 8, 4108.
45. Woody, R. W. In Peptides, Polypeptides and Proteins; Blout, E. R., Bovey, F. A., Lotan, N., Goodman, M. Eds.; Wiley: New York, 1974; pp. 338-350.
46. Bandekar, J.; Evans, D. J.; Krimm, S.; Leach, S. J.; Lee, S.; Mcquie, J. R.; Minisian, E.; Nemethy, G.; Pottle, M. S.; Scherega, H. A.; Stimson, E. R.; Woody, R. W. Int. J. Pept. Protein Res. 1982, 19, 187.
47. Hollósi, M.; Kövér, K. E.; Holly, S.; Fasman, G. D. Biopolymers 1987, 26, 1527.
48. (b) Hollósi, M.; Kövér, K. E.; Holly, S.; Radics, L.; Fasman, G. D. Biopolymers 1987, 26, 1555.
49. (c) Perczel, A.; Hollósi, M.; Foxman, B. M.; Fasman, G. D. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 9772.
50. Sathyanarayana, B. K.; Applequist, J. Int. J. Pept. Protein Res. 1986, 27, 86.
51. Brahms, S.; Brahms, J.; Soach, G.; Brack, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1977, 74, 3208.
52. Provencher, S. W.; Glökner, J. Biochemistry 1981, 20, 33.
53. Chang, C. T.; Wu, C.-S. C.; Yang, J. T. Anal. Biochem. 1978, 91, 13.
54. Ealick, S. E.; Walter, R. L. Curr. Opin. Stuct. Biol. 1993, 3, 725.
55. Nave, C. Acta Crystallogr., Sect. D 1999, 55, 1663.
56. Stubbs, G. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 615.
57. Byrne, B.; Iwata, S. Curr. Opin. Stuct. Biol. 2002, 12, 239.
58. Faigel, G.; Tegze, M. Rep. Prog. Phys. 1999, 62, 355.
59. Nave, C. Radiat. Phys. Chem. 1995, 45, 483.
60. Marraud, M.; Aubry, A. Biopolymers 1996, 40, 45.
61. Kay, L. E.; Gardner, K. H. Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 722.
62. Dötsch, V.; Wagner, G. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 619.
63. Wider, G.; Wütrich, K. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 594.
64. Moseley, H. N. B.; Montelione, G. T. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 635.
65. Palmer, A. G. III Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 732.
66. Case D. A. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 624.
67. Marassi, F. M.; Opella, S. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 640.
68. De Groot, H. J. M. Curr. Opin. Struct. Biol. 2000, 10, 593.
69. Rossum, B. J.; Förster, H.; de Groor, H. J. M. J. Magn. Reson. 1997, 124, 516.
70. Bruch, M. D.; Rizo, J.; Gierash, L. M. Biopolymers 1992, 32, 1741.
71. Kessler, M.; Gehrke, M.; Griesinger, C. Angew. Chem. 1988, 100, 507.
72. (a) Auer, M.; Scarborough, G. A.; Kühlbrand, W. Nature 1998, 392, 840.
73. (b) Shi, D.; Lewis, M. R.; Youg, H. S.; Stokes, D. L. J. Mol. Biol. 1998, 284, 1547.
74. Stowell, M. H. B.; Miyazawa, A.; Unwin, N. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 595.
75. Kimura, Y.; Vassylyev, D. G.; Miyazawa, A.; Kidera, A.; Matsushima, M.; Mitsuoka, K.; Murata, K.; Hirai, T.; Fujiyoshi Y. Nature 1997, 389, 206.
76. Trewhella, J. Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 702.
77. Bustamante, C.; Rivetti, C.; Keller, D. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 709.
78. Fleming, G. R.; van Grondelle, R. Curr. Opin. Struct. Biol. 1997, 7, 738.
79. Hubbell, W. L.; Gross, A.; Langen, R.; Lietzow, M. A. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 649.
80. Niimura, N.; Minezaki, Y.; Nonaka, T.; Castana, J. C.; Cipriani, F.; Hoghoj, P.; Lehmann, M. S.; Wilkinson, C. Nat. Struct. Biol. 1997, 4, 909.
81. Gustaffsson, M. G. L. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 627.
82. Chalikian, T. V.; Breslauer, K. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 657.
83. (a) Grantcharova, V.; Alm, E. J.; Baker, D.; Horwich, A. L. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 70.
84. (b) Ternstrom, T.; Mayor, U.; Akke, M.; Oliveberg, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 14854.
85. (c) Roder, H.; Ramachandra Shastry, M. C. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 620.
86. Kuntz, I. D. J. Am. Chem. Soc. 1972, 94, 4009.
87. (a) Wilmot, C. M.; Thornton, J. M. J. Mol. Biol. 1988, 203, 221.
88. (b) Wilmot, C. M.; Thornton, J. M. Protein Eng. 1990, 3, 479.
89. Venkatachalam, M. Biopolymers 1968, 6, 1425.
90. Lewis, P. N.; Momany, F. A.; Scheraga, H. A. Biochim. Biophys. Acta 1973, 303, 211.
91. Némethy, G.; Printz, M. P. Macromolecules 1972, 5, 755.
92. Levitt, M. Biochemistry 1978, 17, 4277.
93. Ball, J. B.; Andrews, P. R.; Alewood, P. F.; Hughes, R. A. FEBS Lett. 1990, 273, 15.
94. Perczel, A.; McAllister, M. A.; Császár, P.; Csizmadia, I. G. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 4849.
95. Matthews, B. W. Macromolecules 1972, 5, 818.
96. Miyazawa, T. in Poly-α-Amino Acids; Fasman, G. D., Ed.; Marcel Dekker: New York, 1967; pp. 69-103.
97. Braiman, M. S.; Rotschild, K. J. Annu. Rev. Biophys. Chem. 1988, 17, 541.
98. Fabian, H.; Mäntele, W. In Handbook of Vibrational Spectroscopy; Chalmers, J. M., Griffiths, P. R., Eds; John Wiley & Sons: Chichester, 2002; pp 1-27.
99. (a) Krimm, S.; Bandekar, J. Adv. Prot. Chem. 1986, 38, 181.
100. (b) Bandekar, J. Biochim. Biophys. Acta 1992, 1120, 123.
101. (c) Bandekar, J.; Krimm, S. Biopolymers 1980, 19, 31.
102. (a) Goormagtigh, E.; Cabiaux, V.; Ruysschaert, J. M. Eur J. Biochem. 1990, 193, 409.
103. (b) Goormaghtigh, E.; Cabiaux, V.; Ruysschaert, J. M. in Physical Methods in the Study of Biomembranes; Hilderson, H. J., Ralston, G. B., Eds; Plenum Press: New York, 1994; Vol. 23, pp 329-362.
104. (a) Wharton, C. W. Biochem. J. 1986, 233, 25.
105. (b) Carey, P. R. In Modern Physical Methods in Biochemistry, Part B; Neuberger, A., Van Deenen, L. L. M., Eds.; Elsevier Science Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 1988; pp 27-64.
106. (c) Miura, T.; Thomas, G. J., Jr. Subcell Biochem. 1995, 24, 55.
107. (d) Peticolas, W. L. Methods Enzymol. 1995, 246, 389.
108. (e) Williams, R. W. Methods Enzymol. 1986, 130, 311.
109. (a) Marraud, M.; Aubry, A. Int. J. Pept. Protein Res. 1984, 23, 123.
110. (b) Pietrzynski, G.; Rzeszotarska, B.; Kubica, Z. Int. J. Pept. Protein Res. 1992, 6, 524.
111. (c) Liang, G.-B.; Rito, C. J.; Gellman, S. H. Biopolymers 1992, 32, 293.
112. (d) Takeda, N.; Kato, M.; Taniguchi, Y. Biochemistry 1995, 34, 5980.
113. (e) Baures, P. W.; Ojala, W. H.; Gleason, W. B.; Johnson, R. L. J. Pept. Res. 1997, 50, 1.
114. Hollósi, M.; Majer, Zs.; Rónai, A. Z.; Magyar, A.; Medzihradszky, K.; Holly, S.; Perczel, A.; Fasman, G. D. Biopolymers 1994, 34, 177.
115. (a) Di Bello, C. Simonetti, M.; Dettin, M.; Paolillo, L.; D'Aurla, G.; Falcigno, L.; Saviano, M.; Scatturin, A.; Vertuani, G.; Cohen, P. J. Pept. Sci. 1995, 1, 251.
116. (b) Simonetti, M.; Di Bello, C. Biopolym. (Biospectrosc.) 2001, 62, 95.
117. (c) Simonetti, M.; Di Bello, C. Biopolym. (Biospectrosc.) 2001, 62, 109.
118. (d) Dettin, M.; Falcigno, L.; Campanile, T.; Scarinci, C. D.; Auria, G.; Cusin, M.; Paolillo, L.; Di Bello, C. J. Pept. Sci. 2001, 7, 358.
119. (e) Carpenter, K. A.; Schmidt, R.; von Mentzer, B. Haglund, K.; Roberts, E.; Walpole, C. Biochemistry 2001, 40, 8317.
120. (f) Gerothanassis, I. P.; Birlirakis, N.; Karayannis, T.; Sakarellos-Daitsiotis, M.; Sakarellos, C.; Vitoux, B.; Marraud, M. Eur. J. Biochem. 1992, 210, 693.
121. Mantsch, H. H.; Perczel, A.; Hollósi, M.; Fasman, G. D. Biopolymers 1993, 33, 201.
122. Dwivedi, A. M.; Krimm, S.; Malcolm, B. R. Biopolymers 1984, 23, 2025.
123. (a) Yoder, G.; Keiderling, T. A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 1995, 35, 103.
124. (b) Kubelka, J.; Silva, R. A. G. D.; Keiderling, T. A. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 5325.
125. (a) Miick, S. M.; Martinez, G. V.; Fiori, W. R.; Todd, A. P.; Millhauser, G. L. Nature 1992, 359, 653.
126. (b) Martinez G. V.; Millhauser, G. L. J. Struct. Biol. 1995, 114, 23.
127. (c) Williams, S.; Causgrove, T. P.; Gilmanshin, R.; Fang, K. S.; Callender, R. H.; Woodruff, W. H.; Dyer, R. B. Biochemistry 1996, 35, 691.
128. (d) Yoder, G.; Pancoska, P.; Keiderling, T. A. Biochemistry 1997, 36, 15123.
129. Surewicz, W. K.; Mantsch, H. H.; Chapman, D. Biochemistry 1993, 32, 389.
130. (a) Nelson, J. W.; Kallenbach, N. R. Proteins 1986, 2, 211.
131. (b) Jackson, M.; Mantsch, H. H. Biochim. Biophys. Acta 1992, 1118, 139.
132. (a) Hollósi, M.; Kajtár, M.; Gráf, L. FEBS Lett. 1977, 74, 185.
133. (b) Hollósi, M.; Kawai, M.; Fasman, G. D. Biopolymers 1985, 24 211.
134. (c) Hollósi, M.; Ürge, L.; Perczel, A.; Kajtar J.; Teplan I.; Ötvös, L., Jr.; Fasman, G. D. J. Mol. Biol. 1992, 223, 673.
135. (d) Hollósi M.; Ötvös, L., Jr.; Ürge, L.; Kajtár J.; Perczel A.; Laczkó, I.; Vadász, Zs.; Fasman, G. D. Biopolymers 1993, 33, 497.
136. (e) Perczel, A.; Hollósi, M.; Sándor, P.; Fasman, G. D. Int. J. Pept. Protein Res. 1993, 41, 223.
137. (f) Hollósi, M.; Shen, Z. M.; Perczel, A.; Fasman, G. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91 4902.
138. (a) Laczkó, I.; Hollósi, M.; Ürge, L.; Mantsch, H. H.; Thurin, J.; Ötvös, L., Jr. Biochemistry 1992, 31 4282.
139. (b) Perczel, A.; Kollát, E.; Hollósi, M.; Fasman, G. D. Biopolymers 1993, 33, 665.
140. (c) Horvat, S.; Jakas, A.; Vass, E.; Samu, J.; Hollósi, M. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1997, 2, 1523.
141. (d) Vass, E.; Hollósi, M.; Kveder, M.; Kojic-Prodic, B.; Cudic, M.; Horvat, S. Spectrochim. Acta, Part A 2000, 56, 2479.
142. Holly, S.; Laczkó, I.; Fasman, G. D.; Hollósi, M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1993, 197, 755.
143. (b) Tóth, G. K.; Laczkó, I.; Hegedüs, Z.; Vass, E.; Hollósi, M.; Janáky, T.; Váradi, Gy.; Penke, B.; Monostori, E. Pept. Immunol. 1996, 223.
144. (c) Laczkó, I.; Hollósi, M.; Vass, E.; Hegedûs, Z.; Monostori, E.; Tóth, G. K. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998, 242, 474.
145. (a) Hollósi, M.; Ismail, A. A.; Mantsch, H. H.; Penke, B.; Váradi, I. Gy.; Tóth, G. K.; Laczkó, I.; Kurucz, I.; Nagy, Z.; Fasman, G. D.; Rajnavölgyi, E. Eur. J. Biochem. 1992, 206, 421.
146. (b) laczkó, I.; Hollósi, M.; Ürge, L.; Mantsch, H. H.; Thurin, J.; Ötvös, L., Jr. Biochemistry 1992, 31, 4282.
147. (c) Holly, S.; Majer. Zs.; Tóth, G. K.; Váradi, Gy; Rajnavölgyi, É.; Laczkó, I.; Hollósi, M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1993, 193, 1247.
148. (d) Laczkó, I.; Holly, S.; Kónya, Z.; Soós, K.; Varga, J. L.; Hollósi, M.; Penke, B. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1994, 205, 120.
149. (e) Majer, Zs.; Holly, S.; Tóth, G. K.; Váradi, Gy.; Nagy, Z.; Horváth, A.; Rajnavölgyi, E.; Laczkó, I.; Hollósi, M. Arch. Biochem. Biophys. 1995, 322, 112.
150. (f) Laczkó, I.; Vass, E.; Soós, K.; Varga, J. L.; Száraz, S.; Hollósi, M.; Penke, B. Arch. Biochem. Biophys. 1996, 335, 381.
151. Uray, K.; Kajtár, J.; Vass, E.; Price, M. R.; Hollósi, M.; Hudecz, F. Arch. Biochem. Biophys. 1999, 361, 65.
152. Arad, O.; Goodman, M. Biopolymers 1990, 29, 1651.
153. Gray, R. A.; Vander Velde, D. G.; Burke, C. J.; Manning, M. C.; Middaugh, C. R.; Borchard, R. T. Biochemistry 1994, 33, 1323.
154. Wennerberg, A. B. A.; Jackson, M.; Öhman, A.; Gräslund, A.; Langel, Ü.; Bartfai, T.; Rigler, R.; Mantsch, H. H. Nat. Res. Council Can. 1994, 72, 1495.
155. Szendrei, Gy. I.; Fabian, H.; Mantsch, H. H.; Lovas, S.; Nyéki, O.; Schön, I.; Ötvös, L., Jr. Eur. J. Biochem. 1994, 226, 917.
156. Mimeault, M.; De Léan, A.; Lafleur, M.; Bonenfant, D.; Fournier, A. Biochemistry 1995, 34, 955.
157. Saudek, V.; Atkinson, R. A.; Lepage, P.; Pelton, J. T. Eur. J. Biochem. 1991, 202, 329.
158. Lamthanh, H.; Léonetti, M.; Nabedryk, E.; Ménez, A. Biochim. Biophys. Acta 1993, 1203, 191.
159. Wei, J.; Xie, L.; Lin, Y.-Z.; Tson, C.-L. Biochim. Biophys. Acta 1992, 1110, 69.
160. Shaw, R. A.; Perczel, A.; Mantsch, H. H.; Fasman, G. D. J. Mol. Struct. 1994, 324, 143.
161. (a) Vass, E.; Kurz, M.; Konat, R. K.; Hollósi, M. Spectrochim. Acta. Part A 1998, 54, 773.
162. (b) Kurz, M. Ph.D. Thesis, Technical University of Munich, Munich, Germany, 1992.
163. Likó, Zs.; Botyánszki, J.; Bódi, J.; Vass, E.; Majer, Zs.; Hollósi, M.; Süli-Vargha, H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1996, 227, 351.
164. Vass, E.; Láng, E.; Samu, J.; Majer, Zs.; Kajtár-Peredy, M.; Mák, M.; Radics, L.; hollósi, M. J. Mol. Struct. 1997, 440, 59.
165. (a) Besson, F.; Raimbault, C.; Hourdou, M. L.; Buchet, R. Spectrochim. Acta 1996 52, 793.
166. (b) Peypoux, F.; Pommier, M. T.; Marion, D.; Ptak, M.; Das, B. C.; Michel, G. J. Antibiot. 1986, 39, 636.
167. (c) Besson, F.; Buchet, R. Spectrochim. Acta 1997, 53, 1913.
168. (d) Genest, M.; Marion, D.; Caille, A.; Ptak, M. Eur. J. Biochem. 1987, 169, 389.
169. (a) Besson, F. Spectrochim. Acta 1998 54, 1007.
170. (b) Volpon, L.; Besson, F.; Lancelin, J.-M. Eur. J. Biochem. 1999 264, 200.
171. Vass, E.; Besson, F.; Majer, Zs.; Volpon, L.; Hollósi, M. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2001, 282, 361.
172. Anderson, T. S.; Hellgeth, J.; Lansbury, P. T., Jr. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6540.
173. (a) Kalnin, I. A.; Baikalov, I. A.; Venyaminov, S. Y. Biopolymers 1990, 30, 1273.
174. (b) Prestrelski, S. J.; Byler, D. M.; Thompson, M. P. Int. J. Pept. Protein Res. 1991, 37, 508.
175. (c) Prestrelski, S. J.; Byler, D. M.; Liebman, M. M. Proteins: Struct. Funct. Genet. 1992, 14450.
176. Swamy, M. J.; Heimburg, T.; Marsh, D. Biophys. J. 1996, 71, 840.
177. Cladera, J.; Torres, J.; Padrós, E. Biophys. J. 1996, 70, 2882.
178. Encinar, J. A.; Fernández, A.; Ferragut, J. A.; Gonzáles-Ros, J. M.; DasGupta, B. R.; Montal, M.; Ferrer-Montiel, A. FEBS Lett. 1998, 429, 78.
179. (a) Barth, A.; Kreutz, W.; Mäntele, W. Biochim. Biophys. Acta 1994, 1194, 75.
180. (b) Barth, A.; Mäntele, W. Biophys. J. 1998, 75, 538.
181. Echabe, I.; Dornberger, U.; Prado, A.; Goñi, F. M.; Arrondo, J. L. Protein Sci. 1998, 7, 1172.
182. Wolkers, W. F.; Haris, P. I.; Pistorius, A. M. A.; Chapman, D.; Hemminga, M. A. Biochemistry 1995, 34, 7825.
183. Mouro, C.; Jung, C.; Bondon, A.; Simonneaux, G. Biochemistry 1997, 36, 8125.
184. Cladera, J.; Villaverde, J.; Hartog, A. F.; Padros, E.; Berden, J. A.; Rigaud, J.-L.; Dunach, M. FEBS Lett. 1995, 371, 115.
185. Hierro, A.; Arizmendi, J. M.; De La Rivas, J.; Urbaneja, M. A.; Prado, A.; Muga, A. Eur. J. Biochem. 2001, 268, 1739.
186. Lydakis-Simantiris, N.; Hutchison, R. S.; Betts, S. D.; Barry, B. A.; Yocum, C. F. Biochemistry 1999, 38, 404.
187. Menikh, A.; Saleh, M. T.; Gariépy, J.; Boggs, J. M. Biochemistry 1997, 36, 15865.
188. Dornberger, U.; Fandrei, D.; Backmann, J.; Hübner, W.; Rahmelow, K.; Gührs, K.-H.; Hartmann, M.; Schott, B.; Fritszche, H. Biochim. Biophys. Acta 1996, 1294, 168.
189. Tian, K.; Zhou, B.; Geng, F.; Jing G. Int. J. Biol. Macromol. 1998, 23, 199.
190. From, N. B.; Bowler, B. E. Biochemistry 1998, 37, 1623.
191. Tatulian, S. A.; Marien Cortes, D.; Perozo, E. FEBS Lett. 1998, 423, 205.
192. Shao, W.; Kearns, D. R.; Sanders, G. M. Int. J. Biol. Macromol. 1997, 20, 115.
193. Lorenz, V. A.; Villaverde, J.; Trézéguet, V.; Lauquin, G. J.-M.; Brandolin, G. Padros, E. Biochemistry 2001, 40, 8821.
194. Perez-Pons, J. A.; Padros, E.; Querol, E. Biochem. J. 1999, 308, 791.
195. van Stokkum, I. H. M.; Linsdell, H.; Hadden, J. M.; Haris, P. I.; Chapman, D.; Bloemendal, M. Biochemistry 1995, 34, 10508.
196. Banuelos, S.; Muga, A. Biochemistry 1996, 35, 3892.
197. (a) Chirgadze, Y. N.; Fedorov, O. V.; Trushina, N. P. Biopolymers 1975, 14, 679.
198. (b) Venyaminov, S. Y.; Kalnin, N. N. Biopolymers 1990, 30, 1243.
199. (c) Barth, A. Progr. Biophys. Mol. Biol. 2000, 74, 141.
200. (d) Besson, F.; Buchet, R. Spectrochim. Acta, Part A 1997, 53, 1913.
201. (a) Sarver, R. W.; Krueger, W. C. Biochemistry 1991, 30, 89.
202. (b) Pribic, R.; van Stokkum, I. H. M.; Chapman, D.; Haris, P. T.; Bloemenda, M. 1993, 214, 366.
203. (c) Baumruk, V.; Pancoska, P.; Keiderling, T. A. J. Mol. Biol. 1996, 259, 774.
204. (a) LaBrake, C. C.; Wang, L.; Keiderling T. A.; Fung, W. M. Biochemistry 1993, 32, 10296.
205. (b) Guijarro, J. I.; Jackson, M.; Chaffotte, A. F.; Delepierre, M.; Mantsch, H. H.; Goldberg, M. E. Biochemistry 1995, 34, 2998.
206. (c) Raimbault, C.; Couthon, F.; Vial, C.; Buchet, R. Eur. J. Biochem. 1995, 234, 570.
207. (d) De La Fournière-Bessueille, L.; Grange, D.; Buchet, R. Eur. J. Biochem. 1997, 250, 705.
208. (e) Venyaminov, S. Y., Yang, J. T., Fasman, G. D., Eds. Plenum Press: New York, 1996, pp 69-107.
209. (a) D'Auria, S.; Rossi, M.; Tanfani, F.; Bertoli, E.; Parise, E.; Bazzicalupo, P. Eur. J. Biochem. 1998, 255, 588.
210. (b) Abbott, G. W.; Bloemendal, M.; van Stokkum, I. H. M.; Mercer, E. A. J.; Miller, R. T.; Sewing, S.; Wolters, M.; Pongs, O.; Srai, S. K. S. Biochim. Biophys. Acta 1997, 1341, 71.
211. (c) Glandières, J.-M.; Calmettes, P.; Martel, P.; Zentz, C.; Massat, A.; Ramstein, J.; Alpert, B. Eur. J. Biochem. 1995, 227, 241.
212. (d) Medrano, F. J.; Gasset, M.; López-Zúmel, C.; Usobiaga, P.; Garcia, J. L.; Menéndez, M. J. Biol. Chem. 1996, 271, 29152.
213. (e) Garcia-Quintana, D.; Francesch, A.; Garriga, P.; de Lerra, A. R. Manyosa, E. Biophys. J. 1995, 69, 1077.
214. (f) Menéndez, M.; Gasset, M.; Laynez, J.; López-Zumel, C.; Usobiaga, P.; Töpfer-Petersen, E.; Calvette, J. J. Eur. J. Biochem. 1995, 234, 887.
215. (a) Haris, P. I.; Chapman, D.; Bengha, G. Eur. J. Biochem. 1995, 233, 659.
216. (b) Dong, A.; Kendrick, B.; Kreilgard, L.; Matsuura, J.; Manning, M. C.; Carpenter, J. F. Arch. Biochem. Biophys. 1997, 347, 213.
217. Ferreras, M.; Höper, F.; Dalla Serra, M.; Colin, D. A.; Prévost, G.; Menestrina, G. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1414, 108.
218. Pancoska, P.; Fabian, H.; Yoder, G.; Baumruk, V.; Keiderling, T. A. Biochemistry 1996, 35, 13094.
219. Bonnin, S.; Besson, F.; Gelhausen, M.; Chierci, S.; Roux, B. FEBS Lett. 1999, 456, 361.
220. El-Jastimi, R.; Lafleur, M. Biophys. Biochim. Acta 1997, 1324, 151.
221. Filosa, A.; Wang, Y.; Ismail, A. A.; English, A. M. Biochemistry 2001, 40, 8256.
222. Paquet, M.-J.; Laviolette, M.; Pézolet, M.; Auger, M. Biophys. J. 2001, 81, 305.
223. Gericke, A.; Smith, E. R.; Moore, D. J.; Mendelsohn, R.; Storch, J. Biochemistry 1997, 36, 8311.
224. Cabiaux, V.; Buckley, T.; Wattiez, R.; Ruysschaert, J. M.; Parker, M. W.; van der Goot, F. Biochemistry 1997, 36, 15224.
225. Cabiaux, V.; Oberg, K. A.; Pancoska, P.; Walz, T.; Agre, P.; Engel, A. Biophys. J. 1997, 73, 406.
226. Azuaga, A. I.; Sepulcre, F.; Padrós, E.; Mateo, P. L. Biochemistry 1996, 35, 16328.
227. Barnett, S. M.; Dracheva, S.; Hendler, R. W.; Levin, I. W. Biochemistry 1996, 35, 4558.
228. Datta, G.; Dong, A.; Witt, J.; Tu, A. T. Arch. Biochem. Biophys. 1995, 317, 365.
229. Martinez-Senac, M. M.; Corbalan-Garcia, S.; Gomez-Fernandez, J. C. Biochemistry 2001, 40, 9983.
230. Gasset, M.; Saiz, J. L.; Laynez, J.; Gentzel, M.; Töpfer-Petersen, E.; Calvete, J J. Eur. J. Biochem. 1997, 250, 735.
231. Trouiller, A.; Gerwert, K.; Dupont, Y. Biophys. J. 1996, 71, 2970.
232. Gallagher, S. C.; Gao, Z.-H.; Li, S.; Dyer, B.; Trewhella, J.; Klee, C. B. Biochemistry 2001, 40, 12094.
233. Fabian, H.; Fälber, K.; Gast, K.; Reinstädler, D.; Rogov, V. V.; Naumann, D.; Zamyatkin, D. F.; Filimonov, V. V. Biochemistry 1999, 38, 5633.
234. Bramanti, E.; Benedetti, E.; Nicolini, C.; Berzina, T.; Erokhin, V.; D'Alessio, V.; Benedetti, E. Biopolymers 1997, 43, 227.
235. De Jongh, H. H.; Goormaghtigh, E.; Ruysschaert, J.-M. Biochemistry 1995, 34, 172.
236. Echabe, I.; Haltia T.; Freire, E.; Goni, F. M.; Arrondo, J. L. R. Biochemistry 1995, 34, 13565.
237. Wang, X.-M.; Wattiez, R.; Mock, M.; Falmagne, P.; Ruysschaert, J.-M.; Cabiaux; V. Biochemistry 1997, 36, 14906.
238. Guzman-Casado, M.; Cardenete, A.; Gimenez-Gallego, G.; Parody-Morreale, A. Int. J. Biol. Macromol. 2001, 28, 305.
239. Li, T.; Horan, T.; Osslund, T.; Stearns, G.; Arakawa, T. Biochemistry 1997, 36, 8849.
240. Contreras, L. M.; Aranda, F. J.; Gavilanes, F.; Gonzalez-Ros, J. M.; Villalain, J. Biochemistry 2001, 40, 3196.
241. Raussens, V.; Ruysschaert, J.-M.; Goormaghtigh, E. J. Biol. Chem. 1997, 272, 262.
242. Vila, R.; Ponte, I.; Collado, M.; Arrondo, J. L. R.; Suau, P. J. Biol. Chem. 2001, 276, 30898.
243. Wellner, N.; Belton, P. S.; Tatham, A. S. Biochem. J. 1996, 319, 741.
244. Vecchio, G.; Bossi, A.; Pasta, P.; Carrea, G. Int. J. Pept. Protein Res. 1996, 48, 113.
245. Panick, G.; Malessa, R.; Winter, R. Biochemistry 1999, 38, 6512.
246. Patzlaff, J. S.; Moeller, J. A.; Barry, B. A.; Brooker, R. J. Biochemistry 1998, 37, 15363.
247. Subirade, M.; Guegen, J.; Pézolet, M.; Biochim. Biophys. Acta 1994, 1205, 239.
248. Chehín, R.; Iloro, I.; Marcos, M. J.; Villar, E.; Shnyrov, V. L.; Arrondo, J. L. R. Biochemistry 1999, 38, 1525.
249. Liang, J. J.-N.; Chakrabarti, B. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998, 246, 441.
250. Bañuelos, S.; Arrondo, J. L. R.; Goñi, F. M.; Pifat, G. J. Biol. Chem. 1995, 270, 9192.
251. Saba, R. I.; Goormaghtigh, E.; Ruysschaert, J. M.; Herschuelz, A. Biochemistry 2001, 40, 3324.
252. Baezinger, J. E.; Méthot, N. J. Biol. Chem. 1995, 270, 29129.
253. Chehín, R.; Thorolfsson M.; Knappskog, P. M.; Martínez, A.; Flatmark, T.; Arrondo, J. L. R.; Muga, A. FEBS Lett. 1998, 422, 225.
254. De Las Rivas, J.; Barber, J. Biochemistry 1997, 36, 8897.
255. Takeda, N.; Kato, M.; Taniguchi, Y. Biochemistry 1995, 34, 5980.
256. Panick, G.; Winter, R. Biochemistry 2000, 39, 1862.
257. Dong, A.; Hyslop, R. M.; Pringle, D. L. Arch. Biochem. Biophys. 1996, 333, 275.
258. Li, J.; Uversky, V. N.; Fink, A. L. Biochemistry 2001, 40, 11604.
259. Hadden, J. M.; Bloemendal, M.; Haris, P. I.; van Stokkum, I. H. M.; Chapman, D.; Drai, S. K. S. FEBS Lett. 1994, 350, 235.
260. Martínez, A.; Haavik, J.; Flatmark, T.; Arrondo, J. L.; Muga, A. J. Biol. Chem. 1996, 271, 19737.
261. Serina, L.; Bucurenci, N.; Gilles, A.-M.; Surewicz, W. K.; Fabian, H.; Mantsch, H. H.; Takahashi, M.; Petrescu, I.; Batelier, G.; Bǎrzu, O. Biochemistry 1995, 35, 7003.
262. Thomas, G. J., Jr.; Prescott, B.; Urry, U. W. Biopolymers 1987, 26, 921.
263. Chi, Z.; Chen, X. G.; Holtz, J. S.; Asher, S. A. Biochemistry 1998, 37, 2854.
264. (a) Lagant, P.; Vergoten, G.; Fleury, G.; Loucheux-Lefebvre M. H. Eur. J. Biochem. 1984, 139, 137.
265. (b) Renugopalakrishnan, V.; Rapaka, R. S.; Collette, T. W.; Carreira, L. A.; Bhatnagar, R. S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1985, 26, 1029.
266. (c) O'Leary, T. J.; Ross, P. D.; Lieber, M. R.; Levin, I. W. Biophys. J. 1986, 49, 795.
267. (d) Erard, M.; Lakhdar-Ghazal, F.; Amalric, F. Eur. J. Biochem. 1990, 191, 19.
268. Hseu, T. H.; Chang, H. Biochim. Biophys. Acta 1980, 624, 340.
269. Fox, J. A.; Tu, A. T.; Hruby, V. J.; Mosberg, H. I. Arch. Biochem. Biophys. 1981, 211, 628.
270. Lord, R. C. Appl. Spectrosc. 1977, 31, 187.
271. Lagant, P.; Vergoten, G.; Fleury, G.; Loucheux-Lefebvre, M. H. Int. J. Pept. Protein Res. 1984, 24, 543.
272. (a) Ianoul, A.; Boyden, M. N.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 7433.
273. (b) Asher, S. A.; Ianoul, A.; Mix, G.; Boyden, M. N.; Karnoup, A.; Diem, M.; Schweitzer-Stenner, R. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11775.
274. (a) Zheng, S.; Tu, A. T.; Renugopalakrishnan, V.; Strawich, E.; Glimcher, M. J. Biopolymers 1987, 10, 1809.
275. (b) Holtz, J. S.; Lednev, I. K.; Ashner, S. A. Biopolymers 2000, 57, 55.
276. (c) Pande, J.; Pande, C.; Gilg, D.; Vasak, M.; Callender, R.; Kagi, J. H. Biochemistry 1986, 25, 5526.
277. (d) Saudek, V.; Atkinson, R. A.; Lepage, P.; Pelton, J. T. Eur. J. Biochem. 1991, 202, 329.
278. (a) Renugopalakrishnan, V.; Zheng, S.; Tu, A. T.; Damle, S. P. Biopolymers 1989, 28, 1935.
279. (b) Williams, R. W.; Weaver, J. L. J. Biol. Chem. 1990, 265, 2505.
280. (c) Sargent, D.; Benevides, J. M.; Yu, M. H.; King, J.; Thomas, G. J., Jr. J. Mol. Biol. 1988, 199, 491.
281. (d) Areas, E. P.; Giglio, J. R.; Arantes, E. C.; Kawano, Y. Biochim. Biophys. Acta 1987, 915, 292.
282. (a) Williams, R. W.; Beeler, T. J. J. Biol. Chem. 1986, 261, 12408.
283. (b) Vogel, H.; Jahnig, F. J. Mol. Biol. 1986, 190, 191.
284. (c) DeGrazia, H.; Harman, J. G.; Tan, G. S.; Wartell, R. M. Biochemistry 1990, 29, 3557.
285. (d) Aslanian, D.; Grof, P.; Galzi, J.-L.; Changeux, J.-P. Biochim. Biophys. Acta 1993, 1148, 291.
286. (a) Bandekar, J.; Krimm, S. Int. J. Pept. Protein Res. 1985, 26, 158.
287. (b) Bandekar, J. Vibr. Spectrosc. 1993, 5, 143.
288. Schweitzer-Stenner, R.; Eker, F.; Huang, Q.; Griebenow, K. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9628.
289. (a) Vass, E.; Holly, S.; Majer, Zs.; Samu, J.; Laczkó, I.; Hollósi, M. J. Mol. Struct. 1997, 408/409, 47.
290. (b) Vass, E.; Samu, J.; Majer, Zs.; Hollósi, M. J. Mol. Struct. 1997, 408/409, 207.
291. (c) Vass, E.; Holly, S.; Hollósi, M. Mikrochim. Acta [Suppl.] 1997, 14, 239.
292. Shaw, R. A.; Mantsch, H. H.; Chowdhry, B. Z. Can. J. Chem. 1993, 71, 1334.
293. Shaw, R. A.; Mantsch, H. H.; Chowdhry, B. Z. Int. J. Macromol. 1994, 16, 143.
294. (a) Pavone, V.; Lombardi, A.; D'Auria, G.; Saviano, M.; Nastri, F.; Paolillo, L.; Di Blasio, B.; Pedone, C. Biopolymers 1992, 32, 173.
295. (b) Tamaki, M.; Akabori, S., Muramatsu, I. Biopolymers 1996, 39, 129.
296. Spatola, A. F.; Anwer, M. K.; Rockwell, A. L.; Gierasch, L. M. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 825.
297. Di Blasio, B.; Lombardi, A.; D'Auria, G.; Saviano, M.; Isernia, C.; Maglio, O.; Paolillo, L.; Pedone, C.; Pavone, V. Biopolymers 1993, 33, 621.
298. Rich, D. H.; Kawai, M.; Jasensky, R. D. Int. J. Pept. Protein Res. 1983, 21, 35.
299. (a) Majer, Zs.; Vass, E.; Malesevic, M.; Sewald, N.; Hollósi, M. Proceedings of the 8th International Conference on Circular Dichroism, Sendai, Japan, September 23-28, 2001; Poster P46.
300. (b) Vass, E.; Majer, Zs.; Sewald, N.; Hollósi, M. Proceedings of the XXVI European Congress on Molecular Spectroscopy, Villeneuve d'Ascq, France, September 1-6, 2002; Poster P1.7.
301. (c) Pálfi, V. K.; Gáspári, Z.; Vass, E.; Perczel, A. J. Pept. Sci. 2002. 8 (Suppl.), S197.
302. Li, N.; Kendrick, B. S.; Manning, M. C.; Carpenter, J. F.; Duman, J. G. Arch. Biochem. Biophys. 1998, 360, 25.
303. (a) Clark, A. H.; Saunderson, D. H. P.; Suggett, A. Int. J. Pept. Res. 1981, 17, 353.
304. (b) Casal, H. L.; Köhler, Y.; Mantsch, H. H. Biochim. Biophys. Acta 1988, 957, 11.
305. (c) Yang, P. W.; Mantsch, H. H.; Arrondo, J. L. R.; Saint-Girons, I.; Guillou, Y,; Cohen. G. N.; Bǎrzu, O. Biochemistry 1987, 26, 2706.
306. Drewes, J. A.; Rowlen, K. L. Biophys. J. 1993, 65, 985.
307. Yang, J.; Christianson, L. A.; Gellman, S. Org. Lett. D 1999, 1, 11.
308. (a) Barron, L. D.; Hecht, L.; Wilson, G. Biochemistry 1997, 36, 13143.
309. (b) Barron, L. D.; Hecht, L.; Blanch, E. W.; Bell, A. F. Progr. Biophys. Mol. Biol. 2000, 73, 1.
310. Gante, J. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1994, 33, 1699.
311. Kajtar, M.; Hollósi, M.; Kajtaŕ J,; Majer, Zs.; Kövér, K, E. Tetrahedron 1986, 42, 3931.
312. (b) Majer, Sz.; Zewdu, M.; Hollósi, M.; Seprödi, J.; Vadász, Zs.; Teplán, I. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1988, 150, 1017.
313. (a) Hollósi, M.; Majer, Zs.; Zewdu, M.; Ruff, F.; Kajtár, M.; Kövér, K. E. Tetrahedron 1988, 44, 195.
314. (b) Hollósi, M.; Kollát, E.; Kajtár, J.; Kajtár, M.; Fasman, G. D. Biopolymers 1990, 30, 1061.
315. (c) Hollósi, M.; Zewdu, M.; Kollát, E.; Majer, Zs.; Kajtár, M.; Batta, G.; Kövér, K.; Sándor, P. Int. J. Pept. Protein Res. 1990, 36, 173.
316. (d) Czugler, M.; Kálmán, A.; Kajtár-Peredy, M.; Kolĺt, E.; Kajtár, J.; Majer, Zs.; Farkas, O.; Hollósi, M. Tetrahedron 1993, 49, 6661.
317. (e) Shaw, R. A.; Kollát, E.; Hollósi, M.; Mantsch, H. H. Spectrochim. Acta, Part A 1995, 51, 1399.
318. (a) Moretto, A.; Peggion, C.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C.; Piazza, C.; Kaptein, B.; Broxterman, Q. B .; Ruiz, I.; Díaz-de-Villegas, M. D.; Galvez, J. A.; Cativiela, C. J. Pept. Res. 2000, 56, 283.
319. (a) Pispisa, B.; Mazzuca, C.; Palleschi, A.; Stella, L.; Venanzi, M.; Formaggio F.; Polese, A.; Toniolo, C. Biopolym. (Pept. Sci.) 2000, 55, 425.
320. (a) Gatos, M.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C.; Bonora, G. M.; Benedetti, Z.; Di Blasio, B.; Iacovino, R.; Santini, A.; Saviano, M.; Kamphuis, J. J. Pept. Sci. 1997, 3, 110
321. (b) Moretto, V.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Bonora, G. M.; Toniolo, C.; Benedetti, E.; Santini, A.; Saviano, M.; Di Blasio, B. ; Pedone, C. J. Pept. Sci. 1996, 2, 14.
322. (c) Gatos, M.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Valle, G.; Toniolo, C.; Bonora, G. M.; Saviano, M.; Iacovino, R.; Menchise, V.; Galdiero, S.; Pedone, C.; Benedetti, E. J. Pept. Sci. 1997, 3, 367.
323. (d) Saviano, M.; Iacovino, R.; Menchise, V.; Benedetti, E.; Bonora, G. M.; Gatos, M.; Graci, L.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C. Biopolymers 2000, 53, 200.
324. (e) Moretto, A.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C.; Saviano, M.; Iacovino, R.; Vitala, R.M.; Benedetti, E. J. Pept. Res. 2001, 57, 307.
325. (a) Bianco, A.; Bertolini, T.; Crisma, M.; Valle, G.; Toniolo, C.; Maggini, M.; Scorrano, G.; Prato, M. J. Pept. Res. 1997, 50, 159.
326. (b) Rossi, P.; Felluga, F.; Tecilla, P.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Toniolo, C.; Scrimin, P. Biopolymers 2000, 55, 496.
327. (a) Rzeszotarska, B.; Karolak-Wojciechowska, J.; Broda, M. A.; Galdecki, Z.; Trezwinska, B.; Koziol, A. E. Int. J. Pept. Protein Res. 1994, 44, 313.
328. (b) Pietrzynski, G.; Rzeszotarska, B.; Ciszak, E.; Losowski, M. Pol. J. Chem. 1994, 68, 1014.
329. Pietrzynski, G.; Rzesrotarska, B.; Cizsak, E.; Lisowski, M.; Kubica, Z.; Boussard, G. Int. J. Pept. Protein Res. 1996, 48, 347.
330. Broda, M. A.; Rzeszotarska, B.; Smelka, L.; Rospenk, M. J. Pept. Res. 1997, 50, 342.
331. Lee, H.-J.; Ahn, I.-A.; Ro, S.; Choi, K.-H.; Choi, Y.-S.; Lee. K.-B. J. Pept., Res. 2000, 56, 36.
332. Torrini, I.; Nalli, M.; Paglialunga Paradisi M.; Pagani Zecchini, G.; Lucente, G.; Spisani, S. J. Pept. Res. 2001, 58, 56.
333. Chung, Y. J.; Huck, B. R.; Christianson, K. A.; Stanger, H. E.; Krauthäuser, S.; Powell, D. R.; Gellman, S. H. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3995.
334. Christianson, L. A.; Lucero, M. J.; Appella, D. H.; Klein, D. A.; Gellman, S. H. J. Comput. Chem. 2000, 21, 763.
335. Martinek, T. A.; Tóth, G. K.; Vass, E.; Hollósi, M.; Fülöp, F. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2002, 41, 1718.
336. Nafie, L. A.; Freedman, T. B. Enantiomer 1998, 3, 283.
337. Dukor, R. K.; Nafie, L. A. In Encyclopedia of Analytical Chemistry; Meyers, R. A., Ed.; John Wiley & Sons: Chiscester, U.K., 2000; pp 1-15.
338. Nafie, L. A. Annu. Rev. Phys. Chem. 1997, 48, 357.
339. Nafie, L. A. Appl. Spectrosc. 1996, 50, 14A.
340. Hug, W. In Raman Spectroscopy; Lascombe, J., Huong, P. V., Eds.; John Wiley & Sons: New York, 1982; pp 3-12.
341. Nafie, L. A.; Cheng, J. C.; Stephens, P. J. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 3842.
342. (a) Keiderling, T. A. In Circular Dichroism. Principles and Applications; Berova, N., Nakanishi, K., Woody, R. W., Eds.; Wiley-VCH: New York, 2000; pp 621-666.
343. (b) Hilario, J.; Kubelka, J.; Syud, A. F.; Gellman, S. H.; Keiderling, T. A. Biopolymers 2002, 67, 233.
344. (c) Baello, B. I.; Pancoska, P.; Keiderling, T. A. Anal. Biochem. 1997, 250, 212.
345. Yoder, G.; Polese, A.; Silva, R. A. G. D.; Formaggio, F.; Crisma, M.; Broxterman, Q. B.; Kamphuis, J.; Toniolo, C.; Keiderling, T. A. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 10278.
346. Dukor, R. K.; Keiderling, T. A. Biopolymers 1991, 31, 1747.
347. Wyssbrod, H. R.; Diem, M. Biopolymers 1992, 31, 1237.
348. Xie, P.; Zhou, Q.; Diem, M. Faraday Discuss. 1994, 99, 233.
349. Lee, O.; Roberts, G. H.; Diem, M. Biopolymers 1989, 28, 1759.
350. Ito, H. Biospectroscopy 1996, 2, 17.
351. Baumruk, V.; Pancoska, P.; Keiderling, T. A. J. Mol. Biol. 1996, 259, 774.
352. Barron, L. D.; Hecht, L. InCircular Dichroism. Principles and Applications; Berova, N., Nakanishi, K., Woody, R. W., Eds.; Wiley-VCH; New York, 2000, pp 667-701.
353. Smyth, E.; Syme, C. D.; Blanch, E. D.; Hecht, L.; Vašák, M.; Barron, L. D. Biopolymers 2001, 58, 138.
354. Blanch, E. W.; Hecht, L.; Barron, L. D. Protein Sci. 1999, 8, 1362.
355. (a) Donate, L. E.; Rufino, S. D.; Canard, L. H. J.; Blundell, T. L. Protein Sci. 1996, 5, 2600.
356. (b) Geetha, V.; Munson, P. J. Protein Sci. 1997, 6, 2538.
357. (a) Blanch, E. W.; Robinson, D. J.; Hecht, L.; Syme, C. D.; Nielsen, K.; Barron, L. D. J. Gen. Virol. 2002, 83, 241.
358. (b) Blanch, E. W.; Hecht, L.; Syme, C. D.; Volpetti, V.; Lomonossoff, G. P.; Nielsen, K.; Barron, L. D. J. Gen. Virol. 2002, 83, 2593.
359. (c) Blanch, E. W.; Hecht, L.; Day, L. A.; Pederson, D. M.; Barron; L. D. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 4863.
360. (a) Barron, L. D.; Blanch, E. W.; Hecht, L. Adv. Protein Chem. 2002, 62, 51.
361. (b) Syme, C. D.; Blanch, E. W.; Holt, C.; Jakes, R.; Goedert, M.; Hecht, L.; Barron, L. D. Eur. J. Biochem. 2002, 269, 148.
362. Blanch, E. W.; Morozova-Roche, L. A.; Cochran, D. A. E.; Doig, A. J.; Hecht, L.; Barron, L. D. J. Mol. Biol. 2000, 301, 553.
363. Miyazawa, M.; Inouye, K.; Hayakawa, T.; Kyogoku, Y.; Sugeta, H. Appl. Spectrosc. 1996, 50, 644.
364. Zhao, C. X.; Polayarapu,P. L.; Das, C.; Balaram, P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 8228.
365. Zuk, W. M.; Freedman, T. B.; Nafie, L. A. Biopolymers 1989, 28, 2025.
366. Xie, P.; Zhou, Q.; Diem, M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9502.
367. (a) Ludlam, C. F. C.; Sonar, S.; Lee, C. P.; Coleman, M.; Herzfeld, J.; Rajbhanary, U. L.; Rothschild, K. J. Biochemistry 1995, 34, 2.
368. (b) Ludman, C. F. C.; Arkin, I. T.; Liu, X.; Rothman, M. S.; Rath, P.; Aimoto, S. O.; Engelman, D. M.; Rothschild, K. J. Biophys. J. 1996, 70, 1728.
369. Zscherp, C.; Barth, A. Biochemistry 2001, 40, 1875.
370. Cepus, V.; Ulbrich, C.; Allin, C.; Trouiller, A.; Gerwert, K. Methods Enzymol. 1998, 291, 223.
371. Jongh, H. H. J.; Goormaghtigh, E.; Ruysschaert, J.-M. Biochemistry 1997, 36, 13603.
372. Hamm, P.; Lim, M.; DeGrado W. F.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 2036.
373. Noda, I. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8116.
374. Szabó, Z.; Klement, É.; Jost, K.; Zarándi, M.; Soós, K.; Penke, B. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999, 120, 885.
375. Murayama, K.; Ozaki, Y. Biopolymers. 2002, 67, 394.
376. Fabian, H.; Mantsch, H. H.; Schultz, C. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 13153.
377. Fringeli, U. P. Chimia 1992, 46, 200.
378. Goormaghtigh, E.; Raussens, V.; Ruysschaert, J. M. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1422, 105.
379. Tamm, L.; Tatulian, S. A. Biochemistry 1993, 32, 7720.
380. Smith, S. O.; Jonas, R.; Braiman, M. Biochemistry 1994, 33, 6334.
381. Nabet, A.; Boggs, J.; Pézolet, M. Biochemistry 1994, 33, 14792.
382. Dluhy, R. A.; Stephens, S. M.; Widayati, S.; Williams, A. D. Spectrochim. Acta, Part A 1995, 51, 1413.
383. Flach, C. R.; Brauner, J. W.; Taylor, J. W.; Baldwin, R. C.; Mendelsohn, R. Biophys. J. 1994, 67, 402.
384. Cornut, I.; Desbat, B.; Turlet, J. M.; Dufourcq, J. Biophys. J. 1996, 70, 305.