Chemical genomics-based target identification and validation of anti-angiogenic agents

Current Medicinal Chemistry

Volumn 10, Issue 9, 2003, Pages 717-726

  Kwon, Ho Jeong ^a  

^a Sejong University   (South Korea)

Author keywords

Angiogenesis; Anti angiogenic agents; Chemical genomics; Histone deacetylase; hsp90; Methionine aminopeptidase II; Target identification and validation

Indexed keywords

ANGIOGENESIS INHIBITOR; ANTINEOPLASTIC AGENT; APICULAREN A; AZASPIRENE; BETULIC ACID; CINNAMIC ACID DERIVATIVE; CURCUMIN; DEPUDECIN; EPOXOMICIN; EPOXYQUINOL A; FR 901228; FUMAGILLIN; FUMAGILLOL CHLOROACETYLCARBAMATE; HISTONE DEACETYLASE; HISTONE DEACETYLASE INHIBITOR; IMMUNOPHILIN; RADICICOL; TACROLIMUS; THALIDOMIDE; TRAPOXIN; TRICHOSTATIN A; TUMOR SUPPRESSOR PROTEIN; UNCLASSIFIED DRUG;

ANGIOGENESIS; CANCER CELL; CELL TRANSPORT; DRUG ACTIVITY; DRUG DESIGN; DRUG RESEARCH; DRUG STRUCTURE; DRUG TARGETING; GENE EXPRESSION REGULATION; GENE FUNCTION; GENETIC ANALYSIS; GENETIC SCREENING; GENOMICS; GROWTH INHIBITION; GROWTH REGULATION; HUMAN; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN DEGRADATION; PROTEIN INTERACTION; PROTEIN TARGETING; REVIEW; TUMOR GROWTH; VALIDATION PROCESS;

ANGIOGENESIS INHIBITORS; CYCLOHEXANES; DRUG DELIVERY SYSTEMS; DRUG DESIGN; GENOMICS; HISTONE DEACETYLASES; HSP90 HEAT-SHOCK PROTEINS; HUMANS; LACTONES; MACROLIDES; RESEARCH; SESQUITERPENES;

EID: 0037265614     PISSN: 09298673     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.2174/0929867033457755     Document Type: Review

References (78)

1. Schreiber, S.L. Bioorg. Med. Chem. 1998, 6, 1127.
2. Crews, C.M.; Splittgerber, U. Trends Biochem. Sci. 1999, 24, 317.
3. Stockwell, B.R. Trends Biotechnol. 2000, 18, 449.
4. Harding, M.W.; Galat, A.; Uehling, D.E.; Schreiber, S.L. Nature 1989, 341, 758.
5. Liu, J.; Farmer, J.D. Jr.; Lane, W.S.; Friedman, J.; Weissman, I.; Schreiber, S.L. Cell 1991, 66, 807.
6. Folkman, J.; Shing, Y. J. Biol. Chem. 1992, 267, 10931.
7. Hanahan, D.; Folkman, J. Cell 1996, 86, 353.
8. Koha, E.C.; Alessandro, R.; Spoonster, J.; Wersto, R.P.; Liotta, L.A. Cell Biol. 1995, 92, 1307.
9. Moscatelli, D.; Rifkin, D.B. Biochem. Biophys. Acta 1998, 945, 67.
10. Weidner, N. N. Engl. J. Med. 1991, 324, 1.
11. Cherrington, J.M.; Strawn, L.M.; Shawver, L.K. Adv. Cancer Res. 2000, 79, 1.
12. Yip, D.; Ahmad, A.; Karapetis, C.S.; Hawkins, C.A.; Harper, P.G. Invest. New Drugs 1999, 17, 387.
13. Sun, L.; McMahon, G. Drug Discovery Today 2000, 5, 344.
14. Ingber, D.; Fujita, T.; Kishimoto, S.; Sudo, K.; Kanamaru, T.; Brem, H.; Folkman, J. Nature 1990, 348, 555.
15. Oikawa, T.; Ito, H.; Ashino, M.; Toi, T.; Morita, I.; Murota, S. Eur. J. Pharmacol. 1993, 241, 221.
16. Kwon, H.J.; Kim, M.S.; Kim, M.J.; Nakajima, H.; Kim, K.W. Int. J. Cancer 2002, 97, 290.
17. Shim, J.S.; Kim, D.H.; Jung,.H.J.; Kim, J.H.; Lim, D.; Lee, S.K.; Kim, K.W.; Ahn, J.W.; Yoo, J.S.; Rho, J.R.; Shin, J.; Kwon, H.J. Bioorg. Med. Chem. 2002, 10, 2439.
18. Kwon, H.J.; Shim, J.S.; Kim, J.H.; Cho, H.Y.; Yum, Y.N.; Kim, S.H.; Yoo, J. Jpn. J. Cancer Res. 2002, 93, 417.
19. Kumar, S.; Witzig, T.E.; Rajkumar, S.V. J. Cell Mol. Med. 2002, 6, 160.
20. Oikawa, T.; Hasegawa, M.; Shimamura, M.; Ashino, H.; Murota, S.; Morita, I. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1991, 181, 1070.
21. Kwon, H.J.; Kim, D.H.; Shim, J.S.; Ahn, J.W. J. Microbiol. Biotechnol. 2002, 12, 702.
22. Kakeya, H.; Onose, R.; Koshino, H.; Yoshida, A.; Kobayashi, K.; Kageyama, S.; Osada, H. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 3496.
23. Asami, Y.; Kakeya, H.; Onose, R.; Yoshida, A.; Matsuzaki, H.; Osada, H. Org. Lett. 2002, 4, 2845.
24. Marui, S.; Itoh, F.; Kozai, Y.; Sudo, K.; Kishimoto, S. Chem. Pharm. Bull. 1992, 40, 96.
25. Abe, J.; Zhou, W.; Takuwa, N.; Taguchi, J.; Kurokawa, K.; Kumada, M.; Takuwa, Y. Cancer Res. 1994, 54, 3407.
26. Sin, N.; Meng, L.; Wang, M.Q.W.; Wen, J.J.; Bornmann, W.G.; Crews, C.M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997, 94, 6099.
27. Griffith, E.C.; Su, Z.; Turk, B.E.; Chen, S.; Chang, Y.H.; Wu, Z.; Biemann, K.; Liu, J.O. Chem. Biol. 1997, 4, 461.
28. Liu, S.; Widom, J.; Kemp, C.W.; Crews, C.M.; Clardy, J. Science 1998, 282, 1324.
29. Han, C.K.; Ahn, S.K.; Choi, N.S.; Hong, R.K.; Moon, S.K.; Chun, H.S.; Lee, S.J.; Kim, J.W.; Hong, C.I.; Kim, D.; Yoon, J.H.; No, K.T. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2000, 10, 39.
30. Delmotte, P.; Delmotte-Plaquee, J. Nature 1953, 171, 344.
31. Kwon, H.J.; Yoshida, M.; Abe, K.; Horinouchi, S.; Beppu, T. Biosci. Biotech. Biochem. 1992, 56, 538.
32. Kwon, H.J.; Yoshida, M.; Fukui, Y.; Horinouchi, S.; Beppu, T. Cancer Res. 1992, 52, 6926.
33. Zhao, J.F.; Nakano, H.; Sharma, S. Oncogene 1995, 11, 161.
34. Kwon, H.J.; Yoshida, M.; Muroya, K.; Hattori, S.; Nishida, E.; Fukui, Y.; Beppu, T.; Horinouchi, S. J. Biochem. 1995, 118, 221.
35. Soga, S.; Kozawa, T.; Narumi, H.; Akinaga, S.; Irie, K.; Matsumoto, K.; Sharma, S.V.; Nakano, H.; Mizukami, T.; Hara, M. J. Biol. Chem. 1998, 273, 822.
36. Ki, S.W.; Kasahara, K.; Kwon, H.J.; Eishima, J.; Takesako, K.; Cooper, J.A.; Yoshida, M.; Horinouchi, S. J. Antibiot. (Tokyo) 1998, 51, 936.
37. Soga, S.; Neckers, L.M.; Schulte, T.W.; Shiotsu, Y.; Akasaka, K.; Narumi, H.; Agatsuma, T.; Ikuina, Y.; Murakata, C.; Tamaoki, T. Cancer Res. 1999, 59, 2931.
38. Whitesell, L.; Mimnaugh, E.G.; De, C.B.; Myers, C.E.; Neckers, L.M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 8324.
39. Schulte, T.W.; Akinaga, S.; Soga, S.; Sullivan, W.; Stensgard, B.; Toft, D.; Neckers, L.M. Cell Stress Chaperones 1998, 3, 100.
40. Sharma, S.V.; Agatsuma, T.; Nakano, H. Oncogene 1998, 16, 2639.
41. Roe, S.M.; Prodromou, C.; O'Brien, R.; Ladbury, J.E.; Piper, P.W.; Pearl, L.H. J. Med. Chem. 1999, 42, 260.
42. Ki, S.W.; Ishigami, K.; Kitahara, T.; Kasahara, K.; Yoshida, M.; Horinouchi, S. J. Biol. Chem. 2000, 275, 39231.
43. Isaacs, J.S.; Jung, Y.J.; Mimnaugh, E.G.; Martinez, A.; Cuttitta, F.; Neckers, L.M. J. Biol. Chem. 2002, 277, 29936.
44. Hur, E.; Kim, H.H.; Choi, S.M.; Kim, J.H.; Yim, S.; Kwon, H.J.; Choi, Y.; Kim, D.K.; Lee, M.O.; Park, H. Mol. Pharmacol. 2002, 62, 975.
45. Prodromou, C.; Roe, S.M.; O'Brien, R.; Ladbury, J.E.; Piper, P.W.; Pearl, L.H. Cell 1997, 90, 65.
46. Grenert, J.P.; Sullivan, W.P.; Fadden, P.; Haystead, T.A.; Clark, J.; Mimnaugh, E.; Krutzsch, H.; Ochel, H.J.; Schulte, T.W.; Sausville, E.; Neckers, L.M.; Toft, D.O. J. Biol. Chem. 1997, 272, 23843.
47. Roe, S.M.; Prodromou, C.; O'Brien, R.; Ladbury, J.E.; Piper, P.W.; Pearl, L.H. J. Med. Chem. 1999, 42, 260.
48. Kuo, M.H.; Allis, C.D. Bioeassays 1998, 20, 615.
49. Hassig, C.; Schreiber, S. Curr. Opin. Chem. Biol. 1997, 1, 300.
50. Marks, P.A.; Rifkind, R.A. Annu. Rev. Biochem. 1978, 47, 419.
51. Petrij, F.; Giles, R.H.; Dauwerse, H.G.; Saris, J.J.; Hennekam, R.C.; Masuno, M.; Tommerup, N.; van Ommen, G.J.; Goodman, R.H.; Peters, D.J. Nature 1995, 376, 348.
52. Pandolfi, P. P. Oncogene 2001, 20, 3116.
53. Dhordain, P.; Lin, R.J.; Quief, S.; Lantoine, D.; Kerckaert, J.P.; Evans, R.M.; Albagli, O. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 4645.
54. Choi, J.H.; Kwon, H.J.; Yoon, B.I.; Kim, J.H.; Han, S.U.; Joo, H.J.; Kim, D.Y. Jpn. J. Cancer Res. 2001, 92, 1300.
55. Hoshikawa, Y.; Kwon, H.J.; Yoshida, M.; Horinouchi, S.; Beppu, T. Exp. Cell Res. 1994, 214, 189.
56. Van Lint, C.; Emiliani, S.; Verdin, E. Gene Expr. 1996, 5, 245.
57. Saito, A.; Yamashita, T.; Mariko, Y.; Nosaka, Y.; Tsuchiya, K.; Ando, T. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 4592.
58. Kim, M.S.; Kwon, H.J.; Lee, Y.M.; Baek, J.H.; Jang, J.E.; Lee, S.W.; Moon, E.J.; Kim, H.S.; Chung, H.Y.; Kim, C.W.; Kim, K.W. Nat. Med 2001, 7, 437.
59. Deroanne, C.F.; Bonjean, K.; Servotte, S.; Devy, L.; Colige, A.; Clausse, N.; Blacher, S.; Verdin, E.; Foidart, J.M.; Nusgens, B.V.; Castronovo, V. Oncogene 2002, 21, 427.
60. Otoguro, K.; Oiwa, R.; Iwai, Y.; Tanaka, H.; Omura, S. J. Antibiot. (Tokyo) 1988, 41, 461.
61. Yoshida, M.; Kijima, M.; Akita, M.; Beppu, T. J. Biol. Chem. 1990, 265, 17174.
62. Ueda, H.; Nakajima, H.; Hori, Y.; Goto, T.; Okuhara, M. Biosci. Biotechnol. Biochem. 1994, 58, 1579.
63. Sugita, K.; Yoshida, H.; Matsumoto, M.; Matsutani, S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1992, 182, 379.
64. Kwon, H.J.; Owa, T.; Hassig, C.A.; Shimada, J.; Schreiber, S.L. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1998, 95, 3356.
65. Taunton, J.; Hassig, C.A.; Schreiber, S.L. Science 1996, 272, 408.
66. Allfrey, V.G.; Faulkner, R.; Mirsky, A.E. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1964, 51, 786.
67. Finnin, M.S.; Donigian, J.R.; Cohen, A.; Richon, V.M.; Rifkind, R.A.; Marks, P.A.; Pavletich, N.P. Nature 1999, 401, 188.
68. Wittich, S.; Scherf, H.; Xie, C.; Brosch, G.; Loidl, P.; Gerhauser, C.; Jung. M. J. Med. Chem. 2002, 45, 3296.
69. Sternson, S.M.; Wong, J.C.; Grozinger, C.M.; Schreiber, S.L. Org. Lett. 2001, 3, 4239.
70. Mai, A.; Massa, S.; Ragno, R.; Esposito, M.; Sbardella, G.; Nocca, G.; Scatena, R.; Jesacher, F.; Loidl, P.; Brosch, G. J. Med. Chem. 2002, 45, 1778.
71. Marks, P.A.; Richon, V.M.; Rifkind, R.A. J. Natl. Cancer Inst. 2000, 92, 1210.
72. Yoshida, M.; Furumai. R.; Nishiyama, M.; Komatsu, Y.; Nishino, N.; Horinouchi, S. Cancer Chemother. Pharmacol. 2001, 48, S20.
73. Jung, M. Curr. Med. Chem. 2001, 8, 1505.
74. Furumai, R.; Matsuyama, A.; Kobashi, N.; Lee, K.H.; Nishiyama, M.; Nakajima, H.; Tanaka, A.; Komatsu, Y.; Nishino, N.; Yoshida, M.; Horinouchi, S. Cancer Res. 2002, 62, 4916.
75. Meng, L.; Kwok, B.H.; Sin, N.; Crews, C.M. Cancer Res. 1999, 59, 2798.
76. Marton, M.J.; DeRisi, J.L.; Bennett, H.A.; Iyer, V.R.; Meyer, M.R.; Roberts, C.J.; Stoughton, R.; Burchard, J.; Slade, D.; Dai, H.; Bassett, D.E. Jr.; Hartwell, L.H.; Brown, P.O.; Friend, S.H. Nat. Med. 1998, 4, 1293.
77. Mariadason, J.M.; Corner, G.A.; Augenlicht, L.H. Cancer Res. 2000, 60, 4561.
78. Clarke, P.A.; Hostein, I.; Banerji, U.; Stefano, F.D.; Maloney, A.; Walton, M.; Judson, I.; Workman, P. Oncogene 2000, 19, 4125.