Molecular interactions of Alzheimer amyloid-β oligomers with neutral and negatively charged lipid bilayers

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 15, Issue 23, 2013, Pages 8878-8889

  Yu, Xiang ^a   Wang, Qiuming ^a   Pan, Qingfen ^b   Zhou, Feimeng ^c   Zheng, Jie ^a  

^a University of Akron   (United States)

^b GEORGIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^c CALIFORNIA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

1 PALMITOYL 2 OLEOYLGLYCERO 3 PHOSPHOGLYCEROL; 1-PALMITOYL-2-OLEOYLGLYCERO-3-PHOSPHOGLYCEROL; 1-PALMITOYL-2-OLEOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; 2 OLEOYL 1 PALMITOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; AMYLOID BETA PROTEIN; AMYLOID BETA PROTEIN (17 42); AMYLOID BETA-PROTEIN (17-42); CALCIUM; PEPTIDE FRAGMENT; PHOSPHATIDYLCHOLINE; PHOSPHATIDYLGLYCEROL;

ALZHEIMER DISEASE; AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CHEMISTRY; HUMAN; LIPID BILAYER; METABOLISM; MOLECULAR DYNAMICS; MOLECULAR GENETICS; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE;

ALZHEIMER DISEASE; AMINO ACID SEQUENCE; AMYLOID BETA-PEPTIDES; CALCIUM; HUMANS; LIPID BILAYERS; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PEPTIDE FRAGMENTS; PHOSPHATIDYLCHOLINES; PHOSPHATIDYLGLYCEROLS; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY;

EID: 84878034291     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3cp44448a     Document Type: Article

References (90)

1. J. D. Buxbaum E. H. Koo P. Greengard Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1993 90 9195 9198
2. H. Lin R. Bhatia R. Lal FASEB J. 2001 15 2433 2444
3. Y. Miller B. Ma R. Nussinov Chem. Rev. 2010 110 4820 4838
4. M. Bucciantini E. Giannoni F. Chiti F. Baroni L. Formigli J. Zurdo N. Taddei G. Ramponi C. M. Dobson M. Stefani Nature 2002 416 507 511
5. J. C. Stroud C. Liu P. K. Teng D. Eisenberg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012 109 7717 7722
6. M. D. Kirkitadze G. Bitan D. B. Teplow J. Neurosci. Res. 2002 69 567 577
7. C. Haass D. J. Selkoe Nature 1998 391 339 340
8. C. Haass EMBO J. 2004 23 483 488
9. M. S. Wolfe W. M. Xia B. L. Ostaszewski T. S. Diehl W. T. Kimberly D. J. Selkoe Nature 1999 398 513 517
10. H. Steiner M. Kostka H. Romig G. Basset B. Pesold J. Hardy A. Capell L. Meyn M. L. Grim R. Baumeister K. Fechteler C. Haass Nat. Cell Biol. 2000 2 848 851
11. X. A. Alvarez J. J. Miguel-Hidalgo L. Fernández-Novoa R. Cacabelos Methods Find. Exp. Clin. Pharmacol. 1997 19 471 479
12. A. R. Koudinov N. V. Koudinova T. T. Berezov Biochem. Mol. Biol. Int. 1996 38 747 752
13. R. Liu C. McAllister Y. Lyubchenko M. R. Sierks J. Neurosci. Res. 2004 75 162 171
14. N. G. N. Milton J. R. Harris Micron 2009 40 800 810
15. M. Sakono T. Zako FEBS J. 2010 277 1348 1358
16. G. M. Shankar B. L. Bloodgood M. Townsend D. M. Walsh D. J. Selkoe B. L. Sabatini J. Neurosci. 2007 27 2866 2875
17. S. M. Butterfield H. A. Lashuel Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 5628 5654
18. H. Jang F. T. Arce S. Ramachandran R. Capone R. Azimova B. L. Kagan R. Nussinov R. Lal Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 6538 6543
19. R. Bhatia H. A. I. Lin R. Lal FASEB J. 2000 14 1233 1243
20. A. Quist I. Doudevski H. Lin R. Azimova D. Ng B. Frangione B. Kagan J. Ghiso R. Lal Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 10427 10432
21. R. Lal H. Lin A. P. Quist Biochim. Biophys. Acta Biomembr. 2007 1768 1966 1975
22. L. Connelly H. Jang F. Teran Arce R. Capone S. A. Kotler S. Ramachandran B. L. Kagan R. Nussinov R. Lal J. Phys. Chem. B 2012 116 1728 1735
23. T. A. Mirzabekov M.-c. Lin B. L. Kagan J. Biol. Chem. 1996 271 1988 1992
24. J. Zhao Y. Luo H. Jang X. Yu G. Wei R. Nussinov J. Zheng Biochim. Biophys. Acta Biomembr. 2012 1818 3121 3130
25. M. Mustata R. Capone H. Jang F. T. Arce S. Ramachandran R. Lal R. Nussinov J. Am. Chem. Soc. 2009 131 14938 14945
26. H. Jang F. T. Arce S. Ramachandran R. Capone R. Lal R. Nussinov J. Phys. Chem. B 2010 114 9445 9451
27. Y. Sokolov J. A. Kozak R. Kayed A. Chanturiya C. Glabe J. E. Hall J. Gen. Physiol. 2006 128 637 647
28. S. Dante T. Hauß A. Brandt N. A. Dencher J. Mol. Biol. 2008 376 393 404
29. R. Kayed Y. Sokolov B. Edmonds T. M. McIntire S. C. Milton J. E. Hall C. G. Glabe J. Biol. Chem. 2004 279 46363 46366
30. D. Eliezer J. Gen. Physiol. 2006 128 631 633
31. R. Capone F. Quiroz P. Prangkio I. Saluja A. Sauer M. Bautista R. Turner J. Yang M. Mayer Neurotoxic. Res. 2009 16 1 13
32. E. Y. Chi C. Ege A. Winans J. Majewski G. H. Wu K. Kjaer K. Y. C. Lee Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2008 72 1 24
33. C. Ege K. Y. C. Lee Biophys. J. 2004 87 1732 1740
34. Y. V. Sokolov R. Kayed A. Kozak B. Edmonds T. M. McIntire S. Milton M. Cahalan C. G. Glabe J. E. Hall Biophys. J. 2004 86 382a 382a
35. D. Eliezer J. Gen. Physiol. 2006 128 631 633
36. J. McLaurin A. Chakrabartty Eur. J. Biochem. 1997 245 355 363
37. M. D. Martinez-Senac J. Villalain J. C. Gomez-Fernandez Eur. J. Biochem. 1999 265 744 753
38. E. Maltseva A. Kerth A. Blume H. Mohwald G. Brezesinski ChemBioChem 2005 6 1817 1824
39. C. Ege K. Y. C. Lee Biophys. J. 2004 87 1732 1740
40. H. Jang J. Zheng R. Nussinov Biophys. J. 2007 93 1938 1949
41. H. Jang J. Zheng R. Lal R. Nussinov Trends Biochem. Sci. 2008 33 91 100
42. H. Jang F. Teran Arce S. Ramachandran R. Capone R. Lal R. Nussinov J. Phys. Chem. B 2010 114 9445 9451
43. H. Jang F. T. Arce S. Ramachandran R. Capone R. Azimova B. L. Kagan R. Nussinov R. Lal Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 6538 6543
44. R. Capone H. Jang S. A. Kotler B. L. Kagan R. Nussinov R. Lal Biochemistry 2012 51 776 785
45. Z. Chang Y. Luo Y. Zhang G. Wei J. Phys. Chem. B 2010 115 1165 1174
46. C. H. Davis M. L. Berkowitz Biophys. J. 2009 96 785 797
47. C. H. Davis M. L. Berkowitz J. Phys. Chem. B 2009 113 14480 14486
48. C. H. Davis M. L. Berkowitz Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2010 78 2533 2545
49. J. A. Lemkul D. R. Bevan Arch. Biochem. Biophys. 2008 470 54 63
50. J. A. Lemkul D. R. Bevan FEBS J. 2009 276 3060 3075
51. J. A. Lemkul D. R. Bevan Protein Sci. 2011 20 1530 1545
52. F. Tofoleanu N. V. Buchete J. Mol. Biol. 2012 421 572 586
53. F. Tofoleanu N.-V. Buchete Prion 2012 6 339 345
54. X. Yu J. Zheng J. Mol. Biol. 2012 421 561 571
55. L. Qiu C. Buie A. Reay M. W. Vaughn K. H. Cheng J. Phys. Chem. B 2011 115 9795 9812
56. J. Zheng B. Ma Y. Chang R. Nussinov Front. Biosci. 2008 13 3919 3930
57. J. Zheng H. Jang B. Ma C.-J. Tsai R. Nussinov Biophys. J. 2007 93 3046 3057
58. J. Zheng H. Jang B. Ma R. Nussinov J. Phys. Chem. B 2008 112 6856 6865
59. J. Zheng X. Yu J. Wang J.-C. Yang Q. Wang J. Phys. Chem. B 2010 114 463 470
60. X. Yu J. Zheng PLoS One 2011 6 e20575
61. T. Luhrs C. Ritter M. Adrian D. Riek-Loher B. Bohrmann H. Dobeli D. Schubert R. Riek Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 17342 17347
62. F. T. Arce H. Jang S. Ramachandran P. B. Landon R. Nussinov R. Lal Soft Matter 2011 7 5267 5273
63. L. S. Higgins G. M. Murphy L. S. Forno R. Catalano B. Cordell Am. J. Pathol. 1996 149 585 596
64. W. Wei D. D. Norton X. Wang J. W. Kusiak Brain 2002 125 2036 2043
65. M. Lalowski A. Golabek C. A. Lemere D. J. Selkoe H. M. Wisniewski R. C. Beavis B. Frangione T. Wisniewski J. Biol. Chem. 1996 271 33623 33631
66. G. Bitan M. D. Kirkitadze A. Lomakin S. S. Vollers G. B. Benedek D. B. Teplow Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 330 335
67. B. Urbanc L. Cruz S. Yun S. V. Buldyrev G. Bitan D. B. Teplow H. E. Stanley Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 17345 17350
68. S. Jo T. Kim W. Im PLoS One 2007 2 880
69. S. Jo J. B. Lim J. B. Klauda W. Im Biophys. J. 2009 97 50 58
70. B. J. Litman E. N. Lewis I. W. Levin Biochemistry 1991 30 313 319
71. L. Kale R. Skeel M. Bhandarkar R. Brunner A. Gursoy N. Krawetz J. Phillips A. Shinozaki K. Varadarajan K. Schulten J. Comput. Phys. 1999 151 283 312
72. A. D. MacKerell D. Bashford M. Bellott R. L. Dunbrack J. D. Evanseck M. J. Field S. Fischer J. Gao H. Guo S. Ha D. Joseph-McCarthy L. Kuchnir K. Kuczera F. T. K. Lau C. Mattos S. Michnick T. Ngo D. T. Nguyen B. Prodhom W. E. Reiher B. Roux M. Schlenkrich J. C. Smith R. Stote J. Straub M. Watanabe J. Wiorkiewicz-Kuczera D. Yin M. Karplus J. Phys. Chem. B 1998 102 3586 3616
73. E. Y. Chi C. Ege A. Winans J. Majewski G. Wu K. Kjaer K. Y. C. Lee Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2008 72 1 24
74. P. T. Wong J. A. Schauerte K. C. Wisser H. Ding E. L. Lee D. G. Steel A. Gafni J. Mol. Biol. 2009 386 81 96
75. N.-V. Buchete R. Tycko G. Hummer J. Mol. Biol. 2005 353 804 821
76. N.-V. Buchete G. Hummer Biophys. J. 2007 92 3032 3039
77. K. Ono M. M. Condron D. B. Teplow Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2009 106 14745 14750
78. F. Tofoleanu N.-V. Buchete J. Mol. Biol. 2012 421 572 586
79. J. Zhao Q. Wang G. Liang J. Zheng Langmuir 2011 27 14876 14887
80. Q. Wang C. Zhao J. Zhao J. Wang J.-C. Yang X. Yu J. Zheng Langmuir 2010 26 3308 3316
81. Q. Wang N. Shah J. Zhao C. Wang C. Zhao L. Liu L. Li F. Zhou J. Zheng Phys. Chem. Chem. Phys. 2011 13 15200 15210
82. Q. Wang J. Zhao X. Yu C. Zhao L. Li J. Zheng Langmuir 2010 26 12722 12732
83. R. Kayed Y. Sokolov B. Edmonds T. M. McIntire S. C. Milton J. E. Hall C. G. Glabe J. Biol. Chem. 2004 279 46363 46366
84. G. Valincius F. Heinrich R. Budvytyte D. J. Vanderah D. J. McGillivray Y. Sokolov J. E. Hall M. Losche Biophys. J. 2008 95 4845 4861
85. P. T. Wong J. A. Schauerte K. C. Wisser H. Ding E. L. Lee D. G. Steel A. Gafni J. Mol. Biol. 2009 386 81 96
86. E. Terzi G. Holzemann J. Seelig Biochemistry 1997 36 14845 14852
87. M. Bokvist F. Lindstrom A. Watts G. Grobner J. Mol. Biol. 2004 335 1039 1049
88. M. S. Lin H. M. Chiu F. J. Fan H. T. Tsai S. S. S. Wang Y. Chang W. Y. Chen Colloids Surf., B 2007 58 231 236
89. F. Lindstrom M. Bokvist T. Sparrman G. Grobner Phys. Chem. Chem. Phys. 2002 4 5524 5530
90. A. M. Isaacs D. B. Senn M. L. Yuan J. P. Shine B. A. Yankner J. Biol. Chem. 2006 281 27916 27923