Polymorphism of amyloid β peptide in different environments: Implications for membrane insertion and pore formation

Soft Matter

Volumn 7, Issue 11, 2011, Pages 5267-5273

  Arce, Fernando Terán ^a   Jang, Hyunbum ^b   Ramachandran, Srinivasan ^a   Landon, Preston B ^a   Nussinov, Ruth ^b,c   Lal, Ratnesh ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA SAN DIEGO   (United States)

^b SAIC FREDERICK INC   (United States)

^c TEL AVIV UNIVERSITY   (Israel)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALZHEIMER'S DISEASE; CONFORMATIONAL STATE; DOWN'S SYNDROME; FIBRILLAR STRUCTURES; GLOBULAR STRUCTURE; GRAPHITE SURFACES; IN-VITRO; IN-VIVO; MEMBRANE INSERTION; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; PHYSICOCHEMICAL PROPERTY; POLYMORPHIC STRUCTURE; PORE FORMATION; ROOM TEMPERATURE; STRUCTURAL MOTIFS; U-SHAPED;

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; HYDROPHOBICITY; LIPID BILAYERS; MICA; MOLECULAR DYNAMICS; NEURODEGENERATIVE DISEASES; PEPTIDES; TOXIC MATERIALS;

GLYCOPROTEINS;

EID: 79957527414     PISSN: 1744683X     EISSN: 17446848     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1sm05162h     Document Type: Article

References (52)

1. D. J. Selkoe Nat. Cell Biol. 2004 6 1054 1061
2. G. Thinakaran E. H. Koo J. Biol. Chem. 2008 283 29615 29619
3. M. Lalowski A. Golabek C. A. Lemere D. J. Selkoe H. M. Wisniewski R. C. Beavis B. Frangione T. Wisniewski J. Biol. Chem. 1996 271 33623 33631
4. H. Jang F. T. Arce S. Ramachandran R. Capone R. Azimova B. L. Kagan R. Nussinov R. Lal Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 6538 6543
5. D. Voet and J. G. Voet, Biochemistry, Wiley, Hoboken, NJ, 3rd edn, 2004
6. J. Kyte R. F. Doolittle J. Mol. Biol. 1982 157 105 132
7. L. Zhang J. Zhong L. X. Huang L. J. Wang Y. K. Hong Y. L. Sha J. Phys. Chem. B 2008 112 8950 8954
8. J. Zheng H. Jang B. Ma C. J. Tsai R. Nussinov Biophys. J. 2007 93 3046 3057
9. T. Kowalewski D. M. Holtzman Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 3688 3693
10. C. M. Dobson Nature 2003 426 884 890
11. H. Lin R. Bhatia R. Lal FASEB J. 2001 15 2433 2444
12. H. W. Querfurth F. M. LaFerla N. Engl. J. Med. 2010 362 329 344
13. A. Quist I. Doudevski H. Lin R. Azimova D. Ng B. Frangione B. Kagan J. Ghiso R. Lal Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 10427 10432
14. R. Kayed A. Pensalfini L. Margol Y. Sokolov F. Sarsoza E. Head J. Hall C. Glabe J. Biol. Chem. 2009 284 4230 4237
15. H. A. Lashuel D. Hartley B. M. Petre T. Walz P. T. Lansbury, Jr Nature 2002 418 291
16. C. G. Glabe J. Biol. Chem. 2008 283 29639 29643
17. A. Schmechel H. Zentgraf S. Scheuermann G. Fritz R. Pipkorn J. Reed K. Beyreuther T. A. Bayer G. Multhaup J. Biol. Chem. 2003 278 35317 35324
18. S. M. Butterfield H. A. Lashuel Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 5628 5654
19. K. E. Marshall L. C. Serpell Soft Matter 2010 6 2110 2114
20. Y. Miller B. Ma R. Nussinov Chem. Rev. 2010 110 4820 4838
21. R. Nelson M. R. Sawaya M. Balbirnie A. O. Madsen C. Riekel R. Grothe D. Eisenberg Nature 2005 435 773 778
22. T. Luhrs C. Ritter M. Adrian D. Riek-Loher B. Bohrmann H. Dobeli D. Schubert R. Riek Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 17342 17347
23. A. T. Petkova W. M. Yau R. Tycko Biochemistry 2006 45 498 512
24. B. Ma R. Nussinov Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 14126 14131
25. N. Ferguson J. Becker H. Tidow S. Tremmel T. D. Sharpe G. Krause J. Flinders M. Petrovich J. Berriman H. Oschkinat A. R. Fersht Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 16248 16253
26. K. Iwata T. Fujiwara Y. Matsuki H. Akutsu S. Takahashi H. Naiki Y. Goto Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 18119 18124
27. A. T. Petkova R. D. Leapman Z. Guo W.-M. Yau M. P. Mattson R. Tycko Science 2005 307 262 265
28. H. Jang F. T. Arce S. Ramachandran R. Capone R. Lal R. Nussinov J. Phys. Chem. B 2010 114 9445 9451
29. H. Jang F. T. Arce R. Capone S. Ramachandran R. Lal R. Nussinov Biophys. J. 2009 97 3029 3037
30. H. Jang J. Zheng R. Nussinov Biophys. J. 2007 93 1938 1949
31. H. Jang F. T. Arce S. Ramachandran R. Capone R. Lal R. Nussinov J. Mol. Biol. 2010 404 917 934
32. H. Jang J. Zheng R. Lal R. Nussinov Trends Biochem. Sci. 2008 33 91 100
33. Y. Miller B. Y. Ma R. Nussinov Biophys. J. 2009 97 1168 1177
34. Y. Miller B. Y. Ma R. Nussinov Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 9490 9495
35. Y. Miller B. Y. Ma C. J. Tsai R. Nussinov Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 14128 14133
36. E. M. Bryant R. S. Bowman J. S. Buckley J. Pet. Sci. Eng. 2006 52 244 252
37. A. K. Helmy E. A. Ferreiro S. G. de Bussetti Appl. Surf. Sci. 2007 253 4966 4969
38. M. E. Schrader J. Phys. Chem. 1980 84 2774 2779
39. C. Spagnoli K. Loos A. Ulman M. K. Cowman J. Am. Chem. Soc. 2003 125 7124 7128
40. T. Werder J. H. Walther R. L. Jaffe T. Halicioglu P. Koumoutsakos J. Phys. Chem. B 2003 107 1345 1352
41. A. A. Adamson, Physical Chemistry of Surfaces, Wiley, New York, fifth edn, 1990
42. K. Koshiyama T. Yano T. Kodama Phys. Rev. Lett. 2010 105 018105
43. B. R. Brooks R. E. Bruccoleri B. D. Olafson D. J. States S. Swaminathan M. Karplus J. Comput. Chem. 1983 4 187 217
44. J. C. Phillips R. Braun W. Wang J. Gumbart E. Tajkhorshid E. Villa C. Chipot R. D. Skeel L. Kale K. Schulten J. Comput. Chem. 2005 26 1781 1802
45. J. D. Harper C. M. Lieber P. T. Lansbury Chem. Biol. 1997 4 951 959
46. C. Ionescu-Zanetti R. Khurana J. R. Gillespie J. S. Petrick L. C. Trabachino L. J. Minert S. A. Carter A. L. Fink Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 13175 13179
47. M. S. Z. Kellermayer A. Karsai M. Benke K. Soos B. Penke Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 141 144
48. T. Ban D. Hamada K. Hasegawa H. Naiki Y. Goto J. Biol. Chem. 2003 278 16462 16465
49. M. Arimon I. Diez-Perez M. J. Kogan N. Durany E. Giralt F. Sanz X. Fernandez-Busquets FASEB J. 2005 19 1344
50. J. Pronchik X. L. He J. T. Giurleo D. S. Talaga J. Am. Chem. Soc. 2010 132 9797 9803
51. C. M. Yip J. McLaurin Biophys. J. 2001 80 1359 1371
52. A. V. Kajava U. Baxa A. C. Steven FASEB J. 2010 24 1311 1319